Researcher Database

Naoki Osada
Faculty of Information Science and Technology Bioengineering and Bioinformatics Bioinformatics
Associate Professor

Researcher Profile and Settings

Affiliation

  • Faculty of Information Science and Technology Bioengineering and Bioinformatics Bioinformatics

Job Title

  • Associate Professor

Research funding number

  • 70416270

ORCID ID

J-Global ID

Research Interests

  • 遺伝子重複   遺伝子発現調節   再編   カニクイザル   CXCL1L   ケモカイン   偽遺伝子   ゲノム進化   翻訳   CXCL1   グノム   種分化   生態学   霊長類   進化   遺伝学   遺伝子交流   

Research Areas

  • Life sciences / Systems genomics
  • Life sciences / Genomics
  • Life sciences / Biodiversity and systematics
  • Life sciences / Evolutionary biology

Academic & Professional Experience

  • 2019/04 - Today  Hokkaido University大学院情報科学研究院准教授
  • 2017/09 - Today  Hokkaido University国際連携研究教育局准教授
  • 2012/05 - Today  放射線医科学総合研究所客員研究員
  • 2015/04 - 2019/03  Hokkaido UniversityGraduate School of Information Science and Technology准教授
  • 2010/01 - 2015/03  National Institute of Genetics, SOKENDAI助教
  • 2011/12 - 2011/12  台湾国立成功大学客員助理教授
  • 2009/01 - 2009/12  台湾国立成功大学兼任助理教授
  • 2005/04 - 2009/12  独立行政法人医薬基盤研究所研究員
  • 2004/10 - 2005/03  国立感染症研究所研究官
  • 2003/03 - 2004/10  シカゴ大学リサーチアソシエイト
  • 東京大学特別研究員

Education

  • 1997/04 - 2002/03  東京大学大学院
  • 1993/04 - 1997/03  University of Tokyo

Association Memberships

  • THE SOCIETY OF BIOSOPHIA STUDIES   JAPANESE SOCIETY FOR BIOINFORMATICS   日本人類学会   日本分子生物学会   日本霊長類学会   日本進化学会   日本遺伝学会   

Research Activities

Published Papers

Books etc

Conference Activities & Talks

  • 霊長類種間における遺伝子浸透様式の解析  [Not invited]
    長田直樹
    ヤポネシアゲノム若手研究集会  2019/01
  • ゲノムからたどる人類進化の歴史  [Invited]
    長田直樹
    名古屋大学遺伝子実験施設公開セミナー「ゲノム解析が見える化する生命の成り立ち」  2018/12
  • 性による移住率の偏りをゲノムデータから推定する  [Invited]
    長田直樹
    日本人類学会大会公開シンポジウム:DNAからみたヒトの進化  2018/10  静岡県三島市
  • 旧世界ザルゲノムに存在する内在性サルレトロウィルス(SERV)配列の探索と分子系統解析  [Not invited]
    池田昌輝, 里村和浩, 関塚剛史, 花田賢太郎, 遠藤俊徳, 長田直樹
    第90回日本遺伝学会  2018/09
  • Dissecting genetic and epigenetic gene expression regulatory variations in diploid organisms  [Invited]
    Naoki Osada
    14th Japanese-German Frontiers of Science Symposium  2018/09
  • ゲノム進化解析ソフトウェアの使い方  [Not invited]
    長田直樹
    第2回木村資生記念進化学セミナー  2018/09
  • 集団遺伝学とゲノム進化学  [Invited]
    長田直樹
    第11回生物学基礎論研究会特別講演  2017/09
  • 環境変動と集団サイズ変動の関係を考える  [Not invited]
    Naoki Osada
    日本列島(ヤポネシア)人のゲノム歴史学  2017/08
  • Quantifying genetic and epigenetic control of gene expression in Drosophila and mice  [Invited]
    Naoki Osada
    The 5th international symposium “Frontier Science in Ecology, Genetics and Genomics”  2017/03
  • 集団遺伝学データ解析  [Invited]
    長田直樹
    ゲノム多様性データの統計解析ワークショップ  2016/12
  • Genomics of non-human primates: application to biomedical studies  [Invited]
    Naoki Osada
    2016 HU/SNU joint symposium  2016/11
  • Population genomics of non-human primates: a case of Mauritian cynomolgus macaques (Macaca fascicularis)  [Not invited]
    Naoki Osada, Soichi Sakurai
    5th Asian Primate Symposium  2016/10
  • An impact of population bottleneck on genomes: a case of Mauritian cynomolgus macaques (Macaca fascicularis)  [Invited]
    Naoki Osada
    13th Japanese-German Frontiers of Science Symposium  2016/10
  • 集団遺伝学データ解析  [Not invited]
    長田直樹
    ゲノム多様性データの統計解析ワークショップ  2015/12  総合研究大学院大学葉山キャンパス
  • Genetic architecture of gene expression variation in fruit flies  [Not invited]
    Naoki Osada
    12th Japanese-German Frontiers of Science Symposium  2015/10
  • モーリシャス島産カニクイザルの全ゲノムシークエンス解析  [Not invited]
    長田直樹, Hettiarachchi Nilmini, Babarinde Isaac Adeyemi, 斎藤成也, Blancher Antoine
    第31回日本霊長類学会大会  2015/07
  • Effect of strong population bottleneck on genomes: a case of Mauritian cynomolgus macaques  [Not invited]
    Naoki Osada
    遺伝研研究集会「ビッグデータ時代の分子進化」  2015/06
  • 集団遺伝学データ解析:ABCのABC  [Not invited]
    長田直樹
    ゲノム多様性データの統計解析ワークショップ  2014/12
  • Challenge of population genomics in non-model organisms  [Not invited]
    長田直樹
    Frontiers in Genomic Research  2014/12
  • 木村先生の研究に関連した、私の二つの研究トピック: 優性度による選択圧の違いと補完的進化  [Not invited]
    長田直樹
    木村資生博士生誕90周年記念シンポジウム  2014/11
  • Compensatory Evolution  [Not invited]
    長田直樹
    EvoDevo・PopGenの融合アプローチから明らかになる適応進化の新局面  2014/10
  • 日本遺伝学会奨励賞受賞講演「ゲノム情報と進化理論の統合による進化機構の解明」  [Not invited]
    長田直樹
    第86回日本遺伝学会大会  2014/09
  • Allele-specific gene expression among Drosophila melanogaster hybrid lines revealed abundant cis-regulatory mutations  [Not invited]
    長田直樹
    国立遺伝学研究所研究会:ゲノム進化分野におけるビッグデータ情報解析の新展開  2014/03
  • Finding evidence for weak compensatory evolution  [Not invited]
    Naoki Osada, Hiroshi Akashi
    SMBE Satellite Meeting/NIG International Workshop: The Causes of Genome Evolution  2014/03
  • 帰無モデルとしての中立説と歴史推定  [Not invited]
    長田直樹
    統計数理研究所研究集会:ゲノム多様性のデータ解析  2013/12
  • Dissecting regulatory mechanisms of transcriptome variation in Drosophila melanogaster  [Not invited]
    Naoki Osada
    Seminar at Academia Sinica  2013/11
  • Dissecting regulatory mechanisms of transcriptome variation in Drosophila melanogaster  [Not invited]
    Naoki Osada
    ISEGB2013  2013/11
  • 霊長類のゲノム進化  [Not invited]
    長田直樹
    日本人類学会大会  2013/11
  • キイロショウジョウバエにおける集団内でのcisおよびtrans遺伝子発現変異の定量  [Not invited]
    長田直樹, 宮城竜太郎, 高橋文
    日本遺伝学会大会  2013/09
  • Finding the factors of reduced genetic diversity on X chromosomes of Macaca fascicularis  [Not invited]
    Naoki Osada, Shigeki Nakagome, Shuhei Mano, Yosuke Kameoka, Ichiro Takahashi, Keiji Terao
    SMBE2013  2013/07
  • Finding evidence for weak compensatory evolution  [Not invited]
    長田直樹
    NIG Collaborative Workshop: Evolution of Junk DNAs  2013/06
  • ヒトゲノムの進化における自然選択と遺伝的浮動の役割  [Not invited]
    長田直樹
    インシリコ・メガバンク研究会  2013/05
  • Evolution of rice photoperiod genes  [Not invited]
    長田直樹
    NIG collaborative research meeting: Evolutionary Genetics and Proteomics of Natural Resources in Asia  2013/02
  • Ecological and Evolutionary Genomics of non-model organisms in Asia  [Not invited]
    長田直樹
    CKJ meeting: Genomics, Proteomics, and Bioinformatics with the Asian Perspective  2012/12
  • 実験用霊長類のゲノムとその多様性  [Not invited]
    長田直樹
    霊長類医科学研究フォーラム  2012/11
  • 霊長類でのX染色体と常染色体との遺伝的多様性の比について  [Not invited]
    長田直樹
    日本人類学会大会  2012/11
  • ゲノムの分岐パターンから探る-歴史,種分化,適応  [Not invited]
    長田直樹
    みちのく進化生物セミナー  2012/10
  • Genetic diversity of humans and nonhuman primates and its evolutionary implications  [Not invited]
    Naoki Osada
    Seminar at Academia Sinica  2012/09
  • Inference of population history from genomic data  [Not invited]
    Naoki Osada
    Arabidopsis symposium  2012/09
  • ゲノム情報を用いた集団の歴史の推定:霊長類や植物の例  [Not invited]
    長田直樹
    統計数理研究所研究集会:生物集団に関する遺伝データと集団遺伝学  2012/08
  • Compensatory Evolution between Mitochondrial and Nuclear Genomes  [Not invited]
    Naoki Osada
    Okazaki Biological Conference 8 (OBC8)  2012/03
  • Inference of natural selection by stratifying individual genome sequences  [Not invited]
    長田直樹
    国立遺伝学研究所研究会:ゲノム多様性研究における革新的な知的発見のための戦略~次世代シーケンサーを用いたゲノム多様性研究における今後の課題~  2012/03
  • Genetic diversity and population history of macaque monkeys  [Not invited]
    Naoki Osada
    Genomic Conservation and Diversity of Organisms: Beyond the NGS time of Life Science  2011/12
  • Inference of population history using a single genome data  [Not invited]
    長田直樹
    日本分子生物学会年会  2011/12
  • 多座位データを用いたゲノムヒストリーの推定  [Not invited]
    長田直樹
    統計数理研究所共同利用重点型研究による研究集会:ゲノムの多様性,進化,疾患に関わる話題についての講演  2011/12
  • メタゲノム解析とその応用  [Not invited]
    長田直樹
    メタゲノム解析を利用した下水道情報網基盤構築に関する研究集会  2011/11
  • 機能喪失とCpGサイトの崩壊による旧世界ザルCYP1A2遺伝子の高い遺伝的多様性  [Not invited]
    長田直樹, 宇野泰広
    日本遺伝学会大会  2011/09
  • Compensatory evolution between mitochondrial and nuclear genomes: evidence from primate respiratory chain complex genes  [Not invited]
    Naoki Osada
    SMBE2011  2011/07
  • Compensatory Evolution between Mitochondrial and Nuclear Genomes: Evidence from Primate Respiratory Chain Complex Genes  [Not invited]
    Naoki Osada
    Seminar at National Taiwan University  2011/07
  • 霊長類の中のヒト:ゲノム多様性の種間比較  [Not invited]
    長田直樹
    遺伝研共同研究集会:ヒト形質のゲノム発掘による新しい進化人類学の創成  2011/07
  • ヒトの遺伝的多様性―進化生物学的視点から  [Not invited]
    長田直樹
    日本赤十字第6回学術講演会  2011/06
  • Compensatory Evolution between Mitochondrial and Nuclear Genomes: Evidence from Primate Respiratory Chain Complex Genes  [Not invited]
    Naoki Osada
    Seminar at National Cheng-Kung University  2011/03
  • 人類集団における自然淘汰  [Not invited]
    長田直樹
    現生人類の拡散による遺伝子と文化の多様性創出に関する総合的研究  2011/03
  • Genetic analysis using multi-locus DNA sequence data for ecology and evolution research  [Not invited]
    長田直樹
    NIG Collaborative Research Meeting: Toward Next Generation Studies of Biodiversity and Bioresources  2010/11
  • ヒトの遺伝的多様性とゲノムにかかる自然選択について  [Not invited]
    長田直樹
    遺伝研共同研究集会:個人ゲノム時代におけるヒトゲノムDNA多型研究  2010/11
  • ミトコンドリア・核遺伝子間の弱有害補完モデル:霊長類COX遺伝子群の進化を例に  [Not invited]
    長田直樹, 明石裕
    日本遺伝学会大会  2010/08
  • マルチローカスデータを用いた進化生態学研究について  [Not invited]
    長田直樹
    日本進化学会大会  2010/08
  • Polymorphism, Divergence, and Speciation: Genomic Perspective  [Not invited]
    Naoki Osada
    Seminar at National Cheng-Kung University  2010/03
  • 実験用霊長類の種差・個体差について:ゲノム解析の視点から  [Not invited]
    長田直樹
    日本薬学会大会融合型シンポジウム  2010/03
  • カニクイザルのトランスクリプトーム解析  [Not invited]
    長田直樹
    国際生物多様性会議:霊長類のゲノム多様性研究  2010/03
  • 進化生物学への次世代シークエンサーの応用について  [Not invited]
    長田直樹
    国立遺伝学研究所研究集会:次世代シーケンサーを活用したゲノム多様性の研究  2010/01
  • カニクイザルcDNAライブラリーの解析とゲノム統合データベースの開発  [Not invited]
    長田直樹, 平田誠, 田沼玲子, 亀岡洋祐, 高橋一朗, 東濃篤範, 鈴木穣, 菅野純夫, 寺尾恵治, 楠田潤, 橋本雄之
    日本分子生物学会年会  2009/12
  • 有害な突然変異とその優性度の推定について:ヒト疾患遺伝子の解析  [Not invited]
    長田直樹
    日本遺伝学会大会  2009/09
  • Ecological adaptation and speciation: genomic perspective  [Not invited]
    Naoki Osada
    Eawag CEEB joint workshop: Beyond the gaps among ecology, evolution and biogeochemistry  2009/08
  • Analysis of gene duplication and conversion in the Drosophila melanogaster genome.  [Not invited]
    Naoki Osada, Hideki Innan
    JSPS Japan-Germany International Colloquium  2009/03
  • Polymorphism, Divergence, and Speciation: Genomic Perspective  [Not invited]
    長田直樹
    国立遺伝学研究所 Biological symposium  2009/03
  • カニクイザル骨髄・脾臓・膵臓由来cDNAライブラリーの解析  [Not invited]
    長田直樹, 亀岡洋祐, 平田誠, 田沼玲子, 鈴木穣, 菅野純夫, 高橋一朗
    日本分子生物学会年会  2008/12
  • ヒトゲノム中の塩基置換多型と疾患関連遺伝子について  [Not invited]
    長田直樹
    日本人類学会大会  2008/11
  • Deleterious Mutations and Human Diseases: Genomic Perspective  [Not invited]
    長田直樹
    日本進化学会大会  2008/08
  • ヒト疾患とほぼ中立説  [Not invited]
    長田直樹
    国立遺伝学研究所研究集会:中立進化論の現在  2008/07
  • 実験用マカク間における遺伝的分化と交雑についてのゲノム解析  [Not invited]
    長田直樹, 亀岡洋祐, 高橋一朗, 寺尾恵治
    日本霊長類学会大会  2008/07
  • Pattern of genetic admixture and differentiation between Macaca fascicularis and M. mulatta genome  [Not invited]
    Naoki Osada, Yosuke Kameoka, Ichiro Takahashi, Keiji Terao
    SMBE2008  2008/06
  • Primate speciation: genes and genome  [Not invited]
    Naoki Osada
    Seminar at National Taiwan University  2008/05
  • Primate speciation: genes and genome  [Not invited]
    Naoki Osada
    Seminar at National Cheng-Kung University  2008/05
  • カニクイザルcDNAライブラリーコレクションの拡充とその解析  [Not invited]
    長田直樹, 橋本雄之, 楠田潤, 亀岡洋祐, 田沼玲子, 平田誠, 高橋一朗
    日本分子生物学会年会  2007/12
  • 突然変異にかかる淘汰圧と遺伝子発現の関係について  [Not invited]
    長田直樹
    北海道大学バイオインフォマティクスセミナー  2007/10
  • ヒトゲノム中での遺伝子発現パターンと淘汰圧との関係について  [Not invited]
    長田直樹
    日本遺伝学会大会  2007/09
  • 遺伝子配列と発現パターンから見た霊長類進化  [Not invited]
    長田直樹
    京都大学霊長類研究所共同利用プログラム/京都大学グローバルCOEプログラム:霊長類ゲノムと脳・感覚研究の最前線  2007/07
  • カニクイザル由来cDNAデータベースの構築,アカゲザルとの比較解析  [Not invited]
    長田直樹, 橋本雄之, 平田誠, 田沼玲子, 亀岡洋祐, 楠田潤, 寺尾恵治, 高橋一朗
    日本霊長類学会大会  2007/07
  • 高等霊長類でのTMEM30C遺伝子転写の進化  [Not invited]
    長田直樹
    日本進化学会大会  2006/08
  • Collection and analysis of primate disease-related homologs  [Not invited]
    Naoki Osada, Reiko Tanuma, Makoto Hirata, Ichirou Takahashi, Yousuke Kameoka, Katsuyuki Hashimoto, Jun Kusuda
    20th International congress of biochemistry and molecular biology and 11th FAOBMB congress  2006/06
  • Divergence between human and macaque beyond the protein evolution  [Not invited]
    Naoki Osada, Katsuyuki Hashimoto, Reiko Tanuma, Makoto Hirata, Jun Kusuda
    Human Genome Meeting 2006  2006/05
  • カニクイザルcDNAの解析とデータベース構築  [Not invited]
    長田直樹, 平田誠, 田沼玲子, 高橋一朗, 亀岡洋祐, 橋本雄之, 楠田潤
    日本分子生物学会年会  2005/12
  • カニクイザルcDNAデータベースの紹介と応用: ミトコンドリア蛋白で起こった正の淘汰  [Not invited]
    長田直樹
    日本遺伝学会大会  2005/09
  • ゲノムレベルでわかる霊長類進化  [Not invited]
    長田直樹
    遺伝研生命情報センターCIBセミナー  2005/06
  • Cynomolgus monkey cDNA libraries: Rate and Pattern of 5’UTR evolution in primates  [Not invited]
    Naoki Osada, Makoto Hirata, Reiko Tanuma, Jun Kusuda, Katsuyuki Hashimoto
    Human Genome Meeting 2005  2005/04
  • Rate and pattern of 5’ UTR evolution: comparative analysis between human and cynomolgus monkey  [Not invited]
    Naoki Osada, Makoto Hirata, Jun Kusuda, Reiko Tanuma, Katsuyuki Hashimoto
    International Workshop on Encoding Information in DNA Sequences  2005/02
  • 9. Gene expression of Drosophila melanogaster head with sexual isolation - cis-associated difference and pattern of sex, virginity and genotype  [Not invited]
    Naoki Osada
    日本分子生物学会年会  2004/12
  • Testing the mode of speciation with genomic data  [Not invited]
    Naoki Osada, Chung-I Wu
    Keystone symposia, Natural variation and quantitative genetics in model organism  2004/03
  • Prediction of novel human genes applying cDNA sequence of cynomolgus monkey brain  [Not invited]
    長田直樹長田直樹, 肥田宗友, 楠田潤, 田沼玲子, 平田誠, 平井百樹, 橋本雄之
    2002/12
  • Identification of human homologs for novel cynomolgus monkey cDNAs  [Not invited]
    Naoki Osada
    Gordon Research Conference: GENOMICS & STRUCTURAL/EVOLUTIONARY BIOINFORMATICS  2002/08
  • カニクイザル完全長cDNAの分離ーヒトゲノム配列での新規ヒト遺伝子同定および既知ヒト遺伝子との配列比較  [Not invited]
    長田直樹
    哺乳動物遺伝学研究会  2002/06
  • Isolation and sequence analysis of newly identified clones from full-length cynomolgus monkey brain cDNA library  [Not invited]
    長田直樹, 肥田宗友, 楠田潤, 田沼玲子, 伊関可奈子, 平田誠, 平井百樹, 数藤由美子, 橋本雄之
    日本人類学会大会  2001/08
  • Analysis of full-length cynomolgus monkey cDNA library from brain and isolation of unidentified clones  [Not invited]
    長田直樹, 肥田宗友, 楠田潤, 田沼玲子, 伊関可奈子, 平田誠, 平井百樹, 数藤由美子, 橋本雄之
    日本分子生物学会年会  2000/11
  • Isolation and analysis of unidentified mouse cDNA clones containing CpG islands  [Not invited]
    田直樹, 楠田潤, 田沼玲子, 伊藤亜紀子, 平田誠, 平井百樹, 橋本雄之
    日本分子生物学会年会  1999/11
  • DNA replication timing of human chromosome 11p15 analyzed by FISH  [Not invited]
    長田直樹, 笠井文生, 伊関可奈子, 楠田潤, 橋本雄之
    日本分子生物学会年会  1998/11
  • Analysis of DNA replication timing using FISH : A comparative study in primates  [Not invited]
    長田直樹, 笠井文生, 寺尾恵治, 森祐介, 早坂郁夫
    日本人類学会大会  1998/09
  • Analysis of DNA replication timing using FISH method  [Not invited]
    長田直樹, 平井百樹
    日本人類学会大会  1997/11
  • Population Genetics of Non-human Primates: How Are We Diverse?  [Not invited]
    Naoki Osada
    International Primatological Society Congress
  • 進化生物学への次世代シークエンサーの応用について  [Not invited]
    長田直樹
    国立遺伝学研究所研究集会:次世代シーケンサーを活用したゲノム多様性の研究

MISC

  • ソフトウェア紹介1:FastQC
    長田直樹  Yaponesian  1-  (はる)  20  -21  2019/05  [Not refereed][Invited]
  • ヤポネシア人の歴史の解明が医学にもたらすもの
    長田直樹  実験医学  37-  926  -936  2019/04  [Not refereed][Not invited]
  • ソフトウェア紹介はじまります
    Naoki Osada  Yaponesian  0-  (0)  27  -28  2019/03  [Not refereed][Not invited]
  • 研究計画B03班の紹介
    Naoki Osada  Yaponesian  0-  (0)  16  -17  2019/03  [Not refereed][Not invited]
  • 古代ゲノムの解析手法(情報編)
    長田直樹  細胞工学  34-  1092  -1095  2015/11  [Not refereed][Invited]
  • Naoki Osada  Genes and Genetic Systems  90-  121  -122  2015/10  [Not refereed][Not invited]
  • 長田直樹  実験医学Webコラム  2015/08  [Not refereed][Invited]
  • 長田直樹  北海道大学大学院情報科学研究科ネットジャーナル  40-  2015/06  [Not refereed][Not invited]
  • 進化学者に聞く!学生からの10の質問
    長田直樹  日本進化学会ニュース  15-  (2)  6  -7  2014  [Not refereed][Not invited]
  • 有害な変異と偶然の効果―中立説とほぼ中立説
    長田直樹  遺伝  (5)  322  -326  2013/05  [Not refereed][Invited]
  • JCRB遺伝子バンク: 疾患研究と創薬にむけた遺伝子バンク
    長田直樹, 高橋一朗  細胞工学  26-  1307  -1308  2007  [Not refereed][Invited]
  • 第24回日本分子生物学会年会 The 24th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    長田直樹, 山下順範, 川崎勝己  バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry  60-  41  -42  2001  [Not refereed][Not invited]
  • 第23回日本分子生物学会年会 The 23th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan
    和地正明, 長田直樹, 山下康治  バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry  59-  40  -41  2000  [Not refereed][Not invited]

Awards & Honors

  • 2019/07 日本学術振興会 特別研究員等審査会専門委員(書面担当)の表彰
     
    受賞者: 長田直樹
  • 2014/09 Genetic Society of Japan The GSJ Award for Young Scientists
     ゲノム情報と進化理論の統合による進化機構の解明 
    受賞者: Naoki Osada
  • 2007/10 日本遺伝学会 ベストペーパー賞
     On the correlation between gene expression pattern and selection intensity in the human genome 
    受賞者: 長田直樹

Research Grants & Projects

  • ヤポネシア人の人口推定を中心とした巨大データ解析
    文部科学省:新学術領域(研究領域提案型)
    Date (from‐to) : 2018/06 
    Author : 長田直樹
  • ゲノム配列を核としたヤポネシア人の起源と成立の解明
    文部科学省:新学術領域(研究領域提案型)
    Date (from‐to) : 2018/06 
    Author : 斎藤成也
  • 文部科学省:科学研究費補助金(基盤研究(C))
    Date (from‐to) : 2014/04 -2016/03 
    Author : 長田直樹
  • 霊長類ゲノムをモデルとした塩基配列進化の総合的研究
    文部科学省:科学研究費補助金(基盤研究(A))
    Date (from‐to) : 2014/04 -2016/03 
    Author : 斎藤成也
  • 文部科学省:科学研究費補助金(若手研究(A))
    Date (from‐to) : 2010 -2013 
    Author : 長田直樹
  • 文部科学省:新学術領域研究
    Date (from‐to) : 2011/04 
    Author : 高橋 文
  • 動物資源の安定供給に向けた繁殖および品質管理技術の高度化に関する研究
    厚生労働省:生物資源研究事業
    Date (from‐to) : 2007/05 -2010/03 
    Author : 寺尾恵治
  • 文部科学省:科学研究費補助金(基盤研究(C))
    Date (from‐to) : 2007 -2008 
    Author : 野見山尚之, 瀬戸山千秋, 長田直樹
     
    ケモカインファミリー遺伝子は進化速度が特に早い. そのメンバーであるカニクイザル特異的CXCL1L遺伝子は, mRNAは発現するにもかかわらず, タンパク質はほとんど合成しない. その翻訳抑制機構を解析し, ケモカイン遺伝子進化との関係において考察した.
  • 文部科学省:科学研究費補助金(若手研究(B))
    Date (from‐to) : 2007 -2008 
    Author : 長田直樹
     
    感染症などの医学研究、創薬などの薬学研究において、哺乳類実験動物、特に霊長類はヒトと遺伝的に非常に近く、重要な位置を占める.ところが、医薬学の実験にサル類の遺伝的多様性がどのような影響を及ぼすかは全くの未知数である.また、これらの実験用霊長類のなかにどれだけの種間・種内の遺伝的多様性があるのかもはっきりとはわかっていないのが現状である.これらを明らかにするため、マカク属の中でも実験用霊長類としてメジャーなアカゲザルとカニクイザルの個体より得られたDNAの多型解析を行った.その結果、1)カニクイザルの遺伝的多様性は現生人類よりも4-5倍高い値を示す、2)カニクイザルとアカゲザルでは、種がわかれた後に遺伝子交流があったかもしれない、3)薬剤代謝にかかわる遺伝子のいくつかは種間の遺伝子での分化度が非常に高い、ということが示された.

Educational Activities

Teaching Experience

  • Information Biology
    開講年度 : 2018
    課程区分 : 修士課程
    開講学部 : 情報科学研究科
    キーワード : バイオインフォマティクス、遺伝子とタンパク質、分子進化、遺伝子発現情報、生物学データベース
  • Bioengineering
    開講年度 : 2018
    課程区分 : 修士課程
    開講学部 : 情報科学研究科
    キーワード : 遺伝情報, genetic information, バイオインフォマティクス, bioinformatics, イメージング, imaging, 生体医工学, biomedical engineering, 細胞力学, cell mechanics
  • Inter-Graduate School Classes(General Subject):Inter-Disciplinary Sciences
    開講年度 : 2018
    課程区分 : 修士課程
    開講学部 : 大学院共通科目
  • Information Biology
    開講年度 : 2018
    課程区分 : 博士後期課程
    開講学部 : 情報科学研究科
    キーワード : バイオインフォマティクス、遺伝子とタンパク質、分子進化、遺伝子発現情報、生物学データベース
  • Bioengineering
    開講年度 : 2018
    課程区分 : 博士後期課程
    開講学部 : 情報科学研究科
    キーワード : 遺伝情報, genetic information, バイオインフォマティクス, bioinformatics, イメージング, imaging, 生体医工学, biomedical engineering, 細胞力学, cell mechanics
  • Bioinformatics and Data Analysis
    開講年度 : 2018
    課程区分 : 学士課程
    開講学部 : 工学部
    キーワード : 遺伝子,ゲノム,DNA,タンパク質,進化,データベース
  • Freshman Seminar
    開講年度 : 2018
    課程区分 : 学士課程
    開講学部 : 全学教育
    キーワード : 遺伝子診断、個別化医療、遺伝子治療、犯罪捜査、DNA鑑定、遺伝子組換え、ゲノム編集、クローン、デザイナーベイビー、人工生命、古代DNA
  • Exercise in Bioengineering and Bioinformatics Ⅱ
    開講年度 : 2018
    課程区分 : 学士課程
    開講学部 : 工学部
    キーワード : 数値計算法,シミュレーション,統計と検定,データベース,情報検索


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