研究者データベース

塚本 卓(ツカモト タカシ)
先端生命科学研究院 生命機能科学研究部門 生物情報解析科学研究分野
助教

基本情報

所属

  • 先端生命科学研究院 生命機能科学研究部門 生物情報解析科学研究分野

職名

    助教

学位

  • 博士(生命科学) (北海道大学)

ホームページURL

科研費研究者番号

  • 30744271

ORCID ID

  • 0000-0002-6348-6664

研究キーワード

  • 過渡吸収分光   膜輸送   膜タンパク質   レチナール蛋白質   生物物理学   光生物   

研究分野

  • 生物科学 / 生物物理学 / 光遺伝学
  • 生体分子科学 / 生物分子化学
  • 生物科学 / 生物物理学 / 光生物

職歴

  • 2017年04月 - 現在  北海道大学大学院先端生命科学研究院助教
  • 2014年07月 - 2017年03月  岡山大学大学院医歯薬学総合研究科助教
  • 2014年04月 - 2014年06月  岡山大学大学院医歯薬学総合研究科研究員
  • 2013年04月 - 2014年03月  名古屋大学大学院理学研究科生命理学専攻研究員
  • 2010年09月 - 2010年11月  国立研究開発法人 物質・材料研究機構インターンシップ研究員

学歴

  • 2010年04月 - 2013年03月   北海道大学   大学院生命科学院
  • 2008年04月 - 2010年03月   北海道大学   大学院生命科学院
  • 2004年04月 - 2008年03月   北海道大学   理学部   生物科学科(高分子機能学)

所属学協会

  • 日本生物物理学会   日本蛋白質科学会   日本核磁気共鳴学会   

研究活動情報

論文

講演・口頭発表等

  • 塩濃度に依存したアニオンチャネルロドプシンの光化学的性質の変化  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会北海道支部例会 2018年03月
  • Light-driven Cl- transport mechanism of Nonlabens marinus rhodopsin-3 studied by static and time-resolved spectroscopy  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第55回年会 2017年09月
  • 好熱性バクテリアのレチナールタンパク質:発見と物性解析のこれまでとこれから  [招待講演]
    塚本 卓
    第54回日本生化学会北海道支部例会 2017年07月
  • Structural basis for high thermal stability and efficient optogenetic function of thermophilic rhodopsin  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第54回年会 2016年11月
  • Cl--pumping photoreaction of a bacterial halide-ion pumping rhodopsin with an archaeal-type TSA motif  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第54回年会 2016年11月
  • 微生物型ロドプシンの光応答性と応用技術への展開  [招待講演]
    塚本 卓
    新学術領域研究「人工光合成」若手育成シンポジウム〜生物から学び、応用する光反応〜 2016年11月
  • 微生物型ロドプシンの安定化機構の解明と光操作への展開  [通常講演]
    塚本 卓
    CREST「ファイバーレス光遺伝学による高次脳機能を支える本脳機能の解明」第1回ワークショップ 2016年11月
  • 高度好熱菌Thermus thermophilus 由来サーモフィリックロドプシンの物性研究  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会中四国支部講演会 2016年05月
  • 時間分解吸収分光法で膜タンパク質の反応中間体をとらえる  [通常講演]
    塚本 卓
    第2回創薬標的膜タンパク質の移ろいを“み(見・診・覧)る”研究会 2015年10月
  • X-ray Crystal Structure of TR: Implications for High Thermal Stability and High-Performance Optogenetic Availability  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第53回年会 2015年09月
  • カロテノイドを光捕集系とするレチナールタンパク質の創成と展開  [通常講演]
    塚本 卓
    新学術研究「人工光合成」第4回合同班会議 2015年06月
  • Structural and Functional Characterization of Thermophilic Rhodopsin  [通常講演]
    塚本 卓
    新学術研究「柔らかな分子系」第8回ワークショップ「やわらか光受容分子の理解と利用に迫るブレインストーミング研究会」 2015年01月
  • 高度高熱菌由来光受容膜タンパク質ロドプシンの機能・構造研究  [通常講演]
    塚本 卓
    第1回創薬標的膜タンパク質の移ろいを“み(見・診・覧)る”研究会 2014年11月
  • Physicochemical Characterization of a Light-Driven Proton Pump from an Extreme Thermophile  [通常講演]
    塚本 卓
    16th International Conference on Retinal Proteins 2014年10月
  • Temperature-Dependent Irreversible Structural Transition of Thermophilic Rhodopsin  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第52回年会 2014年09月
  • 骨芽細胞膜タンパク質IFITM5の分子機構:翻訳後修飾,相互作用,および細胞機能  [通常講演]
    塚本 卓
    分子・物質合成プラットフォーム平成25年度シンポジウム 2014年03月
  • 生理的温度条件下における高度好熱菌由来ロドプシン・TRの物性に関する研究  [通常講演]
    塚本 卓
    分子研研究会「ロドプシン研究の故きを温ねて新しきを知る」 2013年11月
  • Thermophilic rhodopsin: The first light-driven proton pump from an extreme thermophile  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第51回年会 2013年10月
  • 高度好熱菌Thermus thermophilus由来微生物型ロドプシンの分光学的解析  [通常講演]
    塚本 卓
    2012年度生物物理学会中部支部講演会 2013年02月
  • Homo-trimeric structure of Gloeobacter rhodopsin is regulated by the protonation state of Asp121, a counterion of the protonated Schiff base  [通常講演]
    塚本 卓
    15th International Conference on Retinal Proteins 2012年10月
  • Homotrimeric assembly of a cyanobacterial ion-pump Gloeobacter rhodopsin  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第50回年会 2012年09月
  • DDM可溶化系におけるGloeobacter rhodopsinの多量体形成に関する研究  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会2011年度北海道支部例会 2012年03月
  • Study of the oligomeric assembly of Gloeobacter rhodopsin in DDM solution  [通常講演]
    塚本 卓
    9th Japan-Korea Bilateral Symposium on Biological NMR 2012年03月
  • The role of cysteines in the first transmembrane domain of IFITM5 for the intermolecular interaction with FKBP11  [通常講演]
    塚本 卓
    第34回日本分子生物学会年会 2011年12月
  • Role of Ser171 for the stabilization of NpHR trimer  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第49回年会 2011年09月
  • Trimerization of halorhodopsin by the aromatic-interemolecular interaction and its functional modulation in detergent system  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第48回年会 2010年09月
  • Trimer formation of N. pharaonis halorhodopsin is stabilized by the intermolecular interaction among Phe150 residues and leads to functional modulation in detergent solution  [通常講演]
    塚本 卓
    14th International Conference on Retinal Proteins 2010年08月
  • Expression, purification and characterization of osteoblast-specific membrane protein IFITM5 in detergent solubilized system  [通常講演]
    塚本 卓
    第10回日本蛋白質科学会年会 2010年06月
  • 膜タンパク質IFITM5の立体構造研究;溶液NMR法による立体構造解析に向けた試料調製  [通常講演]
    塚本 卓
    第48回NMR討論会 2009年11月
  • ハロロドプシンNpHRの三量体構造はF150残基の対称性によって安定化される  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第47回年会 2009年10月
  • Structural study of IFITM5, a human double transmembrane protein; sample preparation for NMR analysis  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第47回年会 2009年10月
  • Structural study of halorhodopsin: What makes its trimeric assembly stable in the DDM-solubilized system?  [通常講演]
    塚本 卓
    7th Japan-Korea Bilateral Symposium on Biological NMR 2009年07月
  • Molecular dynamics of photo-excited halorhodopsin in the monomer and trimer states  [通常講演]
    塚本 卓
    Hokkaido University – Mahidol University Joint Symposium 2009年05月
  • Molecular interaction and functional modulation of light-driven anion pump - halorhodopsin  [通常講演]
    塚本 卓
    第9回日本蛋白質科学会年会 2009年05月
  • Molecular dynamics of photo-excited halorhodopsin in the monomer and trimer states  [通常講演]
    塚本 卓
    揺らぎと生体機能第2回公開シンポジウム 2009年03月
  • Is the photoactivity of halorhodopsin modulated by the assembly of homotrimer?” 3P-097  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第46回年会 2008年12月
  • Trimer assembly of Natronomonas pharaonis halorhodopsin, NpHR, in lipid bilayer and detergent  [通常講演]
    塚本 卓
    13th International Conference on Retinal Proteins 2008年06月
  • ハロロドプシン三量体の界面活性剤中での解離  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第45回年会 2007年12月
  • Anion Concentration Dependency on the Photocycle of PsuACR1: Implications for the Impairment of its Fast Channel Function.  [通常講演]
    塚本 卓
    18th International Conference on Retinal Proteins 2018年09月
  • Substrate anion concentration significantly affects the fast channel function of Proteomonas sulcata anion channelrhodopsin-1  [通常講演]
    塚本 卓
    日本生物物理学会第56回年会 2018年09月
  • Photochemical Properties of Microbial Rhodopsin Pumps and Channels  [招待講演]
    塚本 卓
    APSBMS 2018 Annual Meeting 2018年07月

その他活動・業績

受賞

  • 2005年10月 北海道大学 北海道大学新渡戸賞
     
    受賞者: 塚本 卓

競争的資金等の研究課題

  • イオン輸送型ロドプシンのアミノ酸変異による輸送方式の変換とその分子機構の解明
    日本学術振興会:科学研究費補助金
    研究期間 : 2018年04月 -2020年03月 
    代表者 : 塚本 卓
  • 光駆動細胞内向きプロトン輸送タンパク質の分子機構の解明と応用技術
    ノーステック財団: 若手研究人材・ネットワーク育成補助金(ノースタレント補助金)
    研究期間 : 2017年06月 -2018年03月 
    代表者 : 塚本 卓
  • 高度好熱菌ロドプシンにおける構造安定性の追求(研究課題番号:15K18519)
    日本学術振興会:若手研究(B)
    研究期間 : 2015年04月 -2018年03月 
    代表者 : 塚本 卓
  • カロテノイド結合型ロドプシンの2光子吸収による活性化の可能性調査
    科学技術振興機構:戦略的創造研究推進事業・さきがけ 特定課題調査
    研究期間 : 2016年10月 -2017年03月 
    代表者 : 塚本 卓
  • 時間分解赤外分光法によるレチナールタンパク質の構造ダイナミクスの解析
    自然科学研究機構分子科学研究所:平成28年度自然科学研究機構分子科学研究所共同利用研究(前期)
    研究期間 : 2016年04月 -2016年09月 
    代表者 : 塚本 卓
  • 時間分解赤外分光法によるレチナールタンパク質の構造ダイナミクスの解析
    自然科学研究機構分子科学研究所:平成27年度自然科学研究機構分子科学研究所共同利用研究(後期)
    研究期間 : 2015年10月 -2016年03月 
    代表者 : 塚本 卓

大学運営

委員歴

  • 2018年01月 -2018年12月   一般社団法人 日本生物物理学会   分野別専門委員
  • 2017年01月 -2017年12月   一般社団法人 日本生物物理学会   分野別専門委員
  • 2015年01月 -2015年12月   一般社団法人 日本生物物理学会   分野別専門委員

社会貢献

  • ひらめき☆ときめきサイエンス
    期間 : 2017年08月08日 - 2017年08月08日
    役割 : 講師
    種別 : セミナー・ワークショップ
    主催者・発行元 : 日本学術振興会
    イベント・番組・新聞雑誌名 : ひらめき☆ときめきサイエンス
  • 高校生限定プログラム
    期間 : 2017年08月07日 - 2017年08月07日
    役割 : 講師
    種別 : セミナー・ワークショップ
    主催者・発行元 : 北海道大学
    イベント・番組・新聞雑誌名 : オープンキャンパス
  • 物理化学分野『色を感じる視覚のふしぎ』
    期間 : 2014年10月25日
    役割 : 講師
    種別 : 施設一般公開
    イベント・番組・新聞雑誌名 : リケジョへの誘い 岡大方式サイエンス・トライアル
  • 中高生理系選択支援事業『理系応援キャラバン隊』
    期間 : 2007年 - 2012年
    役割 : 講師
    種別 : 出前授業
    主催者・発行元 : 北海道大学女性研究者支援室
    イベント・番組・新聞雑誌名 : 中高生理系選択支援事業『理系応援キャラバン隊』
  • MISSION: 遺伝子コードを解読せよ!〜PCRと電気泳動で米の品種を特定する〜
    期間 : 2011年
    役割 : 講師
    種別 : 施設一般公開
    主催者・発行元 : 日本学術振興会
    イベント・番組・新聞雑誌名 : ひらめき☆ときめきサイエンス
  • タンパク質のイロいろ
    期間 : 2009年04月
    役割 : 講師
    種別 : サイエンスカフェ
    イベント・番組・新聞雑誌名 : 第7回北大大学院生によるサイエンスライブ
  • タンパク質のはなし―いのちを支えるかたちとはたらき
    期間 : 2009年01月
    役割 : 講師
    種別 : 講演会
    イベント・番組・新聞雑誌名 : 北海道大学平成遠友夜学校
  • 生命のミステリー 〜生命分子のかたちと働き〜『アトムの磁力でタンパク質を調べつくす!〜生物だって実は分子からできている〜』
    期間 : 2009年
    役割 : 講師
    種別 : 施設一般公開
    主催者・発行元 : 日本学術振興会
    イベント・番組・新聞雑誌名 : ひらめき☆ときめきサイエンス
  • 抗菌タンパク質リゾチームでバイ菌をやっつけろ!
    期間 : 2009年
    役割 : 講師
    種別 : 施設一般公開
    主催者・発行元 : 北海道大学
    イベント・番組・新聞雑誌名 : 北海道大学オープンキャンパス
  • 生命のミステリー 〜生き物のかたちと働き〜『アトムの磁力でタンパク質を調べつくす!〜生物だって実は分子からできている〜』
    期間 : 2008年
    役割 : 講師
    種別 : 施設一般公開
    主催者・発行元 : 日本学術振興会
    イベント・番組・新聞雑誌名 : ひらめき☆ときめきサイエンス
  • 抗菌タンパク質リゾチームでバイ菌をやっつけろ!
    期間 : 2008年
    役割 : 講師
    種別 : 施設一般公開
    主催者・発行元 : 北海道大学
    イベント・番組・新聞雑誌名 : 北海道大学オープンキャンパス


Copyright c MEDIA FUSION Co.,Ltd. All rights reserved.