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田中 啓之 (タナカ ヒロユキ)
| 水産科学研究院 海洋応用生命科学部門 海洋生物工学分野 | 助教 |
研究活動情報
■ 論文- Nonmuscular Troponin-I is required for gastrulation in sea urchin embryos.
Mai Kamata; Yuri Taniguchi; Junko Yaguchi; Hiroyuki Tanaka; Shunsuke Yaguchi
Developmental dynamics, 253, 624, 658, 2024年, [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), BACKGROUND: Gastrulation is one of the most important events in our lives (Barresi and Gilbert, 2020, Developmental Biology, 12th ed.). The molecular mechanisms of gastrulation in multicellular organisms are not yet fully understood, since many molecular, physical, and chemical factors are involved in the event. RESULTS: Here, we found that one of muscle components, Troponin-I (TnI), is expressed in future gut cells, which are not muscular cells at all, and regulates gastrulation in embryos of a sea urchin, Hemicentrotus pulcherrimus. When we block the function of TnI, the invagination was inhibited in spite that the gut-cell specifier gene is normally expressed. In addition, blocking myosin activity also induced incomplete gastrulation. CONCLUSION: These results strongly suggested that TnI regulates nonmuscular actin-myosin interactions during sea urchin gastrulation. So far, Troponin system is treated as specific only for muscle components, especially for striated muscle, but our data clearly show that TnI is involved in nonmuscular event. It is also reported that recent sensitive gene expression analysis revealed that Troponin genes are expressed in nonmuscular tissues in mammals (Ono et al., Sci Data, 2017;4:170105). These evidences propose the new evolutionary and functional scenario of the involvement of Troponin system in nonmuscular cell behaviors using actin-myosin system in bilaterians including human being. - Effects of omecamtiv mecarbil on the contractile properties of skinned porcine left atrial and ventricular muscles
Tomohiro Nakanishi; Kotaro Oyama; Hiroyuki Tanaka; Fuyu Kobirumaki-Shimozawa; Shuya Ishii; Takako Terui; Shin’ichi Ishiwata; Norio Fukuda
Frontiers in Physiology, 13, Frontiers Media SA, 2022年08月23日, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), Omecamtiv mecarbil (OM) is a novel inotropic agent for heart failure with systolic dysfunction. OM prolongs the actomyosin attachment duration, which enhances thin filament cooperative activation and accordingly promotes the binding of neighboring myosin to actin. In the present study, we investigated the effects of OM on the steady-state contractile properties in skinned porcine left ventricular (PLV) and atrial (PLA) muscles. OM increased Ca2+ sensitivity in a concentration-dependent manner in PLV, by left shifting the mid-point (pCa50) of the force-pCa curve (ΔpCa50) by ∼0.16 and ∼0.33 pCa units at 0.5 and 1.0 μM, respectively. The Ca2+-sensitizing effect was likewise observed in PLA, but less pronounced with ΔpCa50 values of ∼0.08 and ∼0.22 pCa units at 0.5 and 1.0 μM, respectively. The Ca2+-sensitizing effect of OM (1.0 μM) was attenuated under enhanced thin filament cooperative activation in both PLV and PLA; this attenuation occurred directly via treatment with fast skeletal troponin (ΔpCa50: ∼0.16 and ∼0.10 pCa units in PLV and PLA, respectively) and indirectly by increasing the number of strongly bound cross-bridges in the presence of 3 mM MgADP (ΔpCa50: ∼0.21 and ∼0.08 pCa units in PLV and PLA, respectively). It is likely that this attenuation of the Ca2+-sensitizing effect of OM is due to a decrease in the number of “recruitable” cross-bridges that can potentially produce active force. When cross-bridge detachment was accelerated in the presence of 20 mM inorganic phosphate, the Ca2+-sensitizing effect of OM (1.0 μM) was markedly decreased in both types of preparations (ΔpCa50: ∼0.09 and ∼0.03 pCa units in PLV and PLA, respectively). The present findings suggest that the positive inotropy of OM is more markedly exerted in the ventricle than in the atrium, which results from the strongly bound cross-bridge-dependent allosteric activation of thin filaments. - The effect of alkaline pretreatment on the biochemical characteristics and fibril-forming abilities of types I and II collagen extracted from bester sturgeon by-products.
Dawei Meng; Hiroyuki Tanaka; Taishi Kobayashi; Hirosuke Hatayama; Xi Zhang; Kazuhiro Ura; Shunji Yunoki; Yasuaki Takagi
International journal of biological macromolecules, 131, 572, 580, 2019年06月15日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Non-mammalian collagens have attracted increasing attention for industrial and biomedical use. We have therefore evaluated extraction conditions and the biochemical properties of collagens from aquacultured sturgeon. Pepsin-soluble type I and type II collagen were respectively extracted from the skin and notochord of bester sturgeon by-products, with yields of 63.9 ± 0.19% and 35.5 ± 0.68%. Collagen extraction efficiency was improved by an alkaline pretreatment of the skin and notochord (fewer extraction cycles were required), but the final yields decreased to 56.2 ± 0.84% for type I and 31.8 ± 1.13% for type II. Alkaline pretreatment did not affect the thermal stability or triple-helical structure of both types of collagen. Types I and II collagen formed re-assembled fibril structures in vitro, under different conditions. Alkaline pretreatment slowed down the formation of type I collagen fibrils and specifically inhibited the formation of thick fibril-bundle structures. In contrast, alkaline pretreatment did not change type II collagen fibril formation. In conclusion, alkaline pretreatment of sturgeon skin and notochord is an effective method to accelerate collagen extraction process of types I and II collagen without changing their biochemical properties. However, it decreases the yield of both collagens and specifically changes the fibril-forming ability of type I collagen. - Smooth muscle-like Ca2+-regulation of actin–myosin interaction in adult jellyfish striated muscle
Hiroyuki Tanaka; Shiori Ishimaru; Yasuhiro Nagatsuka; Keisuke Ohashi
Scientific Reports, 8, 1, 7776, Springer Science and Business Media LLC, 2018年12月, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Cnidaria is an animal phylum, whose members probably have the most ancestral musculature. We prepared and characterized, for the first time to our knowledge, native actomyosin from the striated myoepithelium of the adult moon jelly Aurelia sp. The actomyosin contained myosin, paramyosin-like protein, Ser/Thr-kinase, actin, and two isoforms of tropomyosin, but not troponin, which is known to activate contraction dependent on intracellular Ca2+ signaling in almost all striated muscles of bilaterians. Notably, the myosin comprised striated muscle-type heavy chain and smooth muscle-type regulatory light chains. In the presence of Ca2+, the Mg-ATPase activity of actomyosin was stimulated and Ser21 of the regulatory light chain was concomitantly phosphorylated by the addition of calmodulin and myosin light chain kinase prepared from chicken smooth muscle. Collectively, these results suggest that, similar to smooth muscle, the contraction of jellyfish striated muscle is regulated by Ca2+-dependent phosphorylation of the myosin light chain. - Troponin-I is present as an essential component of muscles in echinoderm larvae
Shunsuke Yaguchi; Junko Yaguchi; Hiroyuki Tanaka
SCIENTIFIC REPORTS, 7, 43563, 2017年03月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Ca2+-binding properties and regulatory roles of lobster troponin C sites II and IV
Hiroyuki Tanaka; Hiroki Takahashi; Takao Ojima
FEBS LETTERS, 587, 16, 2612, 2616, 2013年08月, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Structure of the Ca(2+)-saturated C-terminal domain of scallop troponin C in complex with a troponin I fragment.
加藤 有介; Fumiaki Yumoto; Hiroyuki Tanaka; Takuya Miyakawa; Yumiko Miyauchi; Daijiro Takeshita; Yoriko Sawano; Takao Ojima; Iwao Ohtsuki; Masaru Tanokura
Biological Chemistry, 394, 1, 55, 68, 2013年01月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Different Ca2+-sensitivities between the EF-hands of T- and L-plastins.
Takuya Miyakawa; Hiroto Shinomiya; Fumiaki Yumoto; Yumiko Miyauchi; Hiroyuki Tanaka; Takao Ojima; Yusuke S. Kato; Masaru Tanokura
Biochemical and Biophysical Research Communications, 429, 3-4, 137, 141, 3-4, 2012年12月14日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Purification and biochemical characterization of a cellulase from the digestive organs of the short-spined sea urchin Strongylocentrotus intermedius
Syuto Hasegawa; Kazuhiro Ura; Hiroyuki Tanaka; Takao Ojima; Yasuaki Takagi
FISHERIES SCIENCE, 78, 5, 1107, 1115, 2012年09月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - cDNA cloning of an alginate lyase from a marine gastropod Aplysia kurodai and assessment of catalytically important residues of this enzyme
Mohammad Matiur Rahman; Akira Inoue; Hiroyuki Tanaka; Takao Ojima
BIOCHIMIE, 93, 10, 1720, 1730, 2011年10月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - cDNA cloning and bacterial expression of an endo-β-1,4-mannanase, AkMan, from Aplysia kurodai.
ZAHURA Umme Afsari; RAHMAN Mohammad Matiur; INOUE Akira; TANAKA Hiroyuki; OJIMA Takao
Comparative Biochemistry and Physiology (part B), 159, 4, 227, 235, 2011年08月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Proteomic analysis of inviable salmonid hybrids between female masu salmon Oncorhynchus masou masou and male rainbow trout Oncorhynchus mykiss during early embryogenesis
L. Zheng; H. Tanaka; S. Abe
JOURNAL OF FISH BIOLOGY, 78, 5, 1508, 1528, 2011年05月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Isolation and characterization of two alginate lyase isozymes, AkAly28 and AkAly33, from the common sea hare Aplysia kurodai
Mohammad Matiur Rahman; Akira Inoue; Hiroyuki Tanaka; Takao Ojima
COMPARATIVE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY B-BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY, 157, 4, 317, 325, 2010年12月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - An endo-beta-1,4-mannanase, AkMan, from the common sea hare Aplysia kurodai
Umme Afsari Zahura; Mohammad Matiur Rahman; Akira Inoue; Hiroyuki Tanaka; Takao Ojima
COMPARATIVE BIOCHEMISTRY AND PHYSIOLOGY B-BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY, 157, 1, 137, 143, 2010年09月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Protein kinase A-dependent modulation of Ca2+ sensitivity in cardiac and fast skeletal muscles after reconstitution with cardiac troponin
Douchi Matsuba; Takako Terui; Jin O-Uchi; Hiroyuki Tanaka; Takao Ojima; Iwao Ohtsuki; Shin' ichi Ishiwata; Satoshi Kurihara; Norio Fukuda
JOURNAL OF GENERAL PHYSIOLOGY, 133, 6, 571, 581, 2009年06月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Comparative study on general properties of alginate lyases from some marine gastropod mollusks
Mami Hata; Yuya Kumagai; Mohammad Matiur Rahman; Satoru Chiba; Hiroyuki Tanaka; Akira Inoue; Takao Ojima
FISHERIES SCIENCE, 75, 3, 755, 763, 2009年05月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Preparation of beta-1,3-glucanase from scallop mid-gut gland drips and its use for production of novel heterooligosaccharides
Yuya Kumagai; Akira Inoue; Hiroyuki Tanaka; Takao Ojima
FISHERIES SCIENCE, 74, 5, 1127, 1136, 2008年10月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Structure-function relationships of molluscan troponin T revealed by limited proteolysis
Hiroyuki Tanaka; Hisoka Suzuki; Iwao Ohtsuki; Takao Ojima
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS, 1784, 7-8, 1037, 1042, 2008年07月, [査読有り], [筆頭著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Spectroscopic and ITC study of the conformational change upon Ca2+-binding in TnC C-lobe and TnI peptide complex from Akazara scallop striated muscle
Fumiaki Yumoto; Hiroyuki Tanaka; Koji Nagata; Yumiko Miyauchi; Takuya Miyakawa; Takao Ojima; Masaru Tanokura
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 369, 1, 109, 114, 2008年04月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Isolation and primary structure of a cellulase from the Japanese sea urchin Strongylocentrotus nudus
Yukiko Nishida; Ken-ichi Suzuki; Yuya Kumagai; Hiroyuki Tanaka; Akira Inoue; Takao Ojima
BIOCHIMIE, 89, 8, 1002, 1011, 2007年08月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Crystallization and preliminary X-ray analysis of the Ca2+-bound C-terminal lobe of troponin C in complex with a troponin I-derived peptide fragment from Akazara scallop
Fumiaki Yumoto; Koji Nagata; Yumiko Miyauchi; Takao Ojima; Hiroyuki Tanaka; Kiyoyoshi Nishita; Iwao Ohtsuki; Masaru Tanokura
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, 63, 535, 537, 2007年06月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Drastic Ca2+ sensitization of myofilament associated with a small structural change in troponin I in inherited restrictive cardiomyopathy
F Yumoto; QW Lu; S Morimoto; H Tanaka; N Kono; K Nagata; T Qjima; F Takahashi-Yanaga; Y Miwa; T Sasaguri; K Nishita; M Tanokura; Ohtsuki, I
BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, 338, 3, 1519, 1526, 2005年12月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Comparative studies on the functional roles of N- and C-terminal regions of molluskan and vertebrate troponin-I
Hiroyuki Tanaka; Yuhei Takeya; Teppei Doi; Fumiaki Yumoto; Masaru Tanokura; Iwao Ohtsuki; Kiyoyoshi Nishita; Takao Ojima
FEBS Journal, 272, 17, 4475, 4486, 2005年09月, [査読有り], [筆頭著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Functional importance of Ca2+-deficient N-terminal lobe of molluscan troponin C in troponin regulation
T Doi; A Satoh; H Tanaka; A Inoue; F Yumoto; M Tanokura; Obtsuki, I; K Nishita; T Ojima
ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 436, 1, 83, 90, 2005年04月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Cloning and sequencing of cDNAs encoding walleye pollack α-skeletal actin isoforms
Tanaka Hiroyuki; Maezawa Yuichi; Ojima Takao; NISHITA KIYOYOSHI
Fisheries science : FS, 70, 1, 198, 200, 2004年02月, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Amino acid sequence of phospholipase A(2) from the pyloric ceca of starfish Asterina pectinifera
H Kishimura; T Ojima; H Tanaka; K Hayashi; K Nishita
FISHERIES SCIENCE, 66, 1, 104, 109, 2000年02月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Amino Acid Sequence of Troponin-I from Akazara Scallop Striated Adductor Muscle
Tanaka Hiroyuki; Ojima Takao; Nishita Kiyoyoshi
The journal of biochemistry, 124, 2, 304, 310, 1998年08月01日, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Amino Acid Sequence of C-Terminal 17 kDa CNBr-Fragment of Akazara Scallop Troponin-I
OJIMA Takao; TANAKA Hiroyuki; NISHITA Kyoyoshi
The journal of biochemistry, 117, 1, 158, 162, 1995年01月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Cloning and sequence of a cDNA encoding akazara scallop troponin C
Ojima, T., Tanaka, H., and Nishita, K.
Arch. Biochem. Biophys., 311, 2, 272, 276, 1994年06月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Amino acid sequence of troponin C from scallop striated adductor muscle.
K. Nishita; H. Tanaka; T. Ojima
Journal of Biological Chemistry, 269, 5, 3464, 3468, 1994年02月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - ウバガイ斧足筋の新160kDaアクチン結合タンパク質の精製と性質〔英文〕
千葉 智; 尾島 孝男; 田中 啓之; 西田 清義
日本水産学会誌, 59, 10, 1783, 1791, 1993年, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Cyanogen bromide fragments of Akazara scallop Mr 52,000 troponin-I.
Ojima Takao; Tanaka Hiroyuki; Nishita Kiyoyoshi
The Journal of Biochemistry, 108, 4, 519, 521, 1990年10月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌)
- Comparative study on general properties of alginate lyases from some marine gastropod mollusks
畑 舞美; 熊谷 祐也; RAHMAN Mohammad Matiur; 千葉 智; 田中 啓之; 井上 晶; 尾島 孝男, 日本水産學會誌 = Bulletin of the Japanese Society of Scientific Fisheries, 76, 4, 580, 580, 2010年07月15日
日本語 - エゾアワビ肝膵臓におけるアルギン酸代謝に関する研究
木本雄太; 熊谷祐也; 澤辺智雄; 田中啓之; 井上晶; 尾島孝男, 日本水産学会大会講演要旨集, 2010, 2010年 - 1P149 アカザラガイ・トロポニンIの阻害部位が収縮調節において果たす役割(筋肉(筋蛋白・収縮)))
田中 啓之; 大槻 磐男; 尾島 孝男, 生物物理, 45, 1, S69, 2005年10月19日
日本生物物理学会, 日本語 - 2P149 アカザラガイ・トロポニンTのN末端側およびC末端側領域の機能解析(筋肉(筋蛋白・収縮)))
鈴木 潜; 田中 啓之; 大槻 磐男; 尾島 孝男, 生物物理, 45, 1, S157, 2005年10月19日
日本生物物理学会, 日本語
- 教えて!クラゲのほんと : 世界一のクラゲ水族館が答える100の質問
鶴岡市立加茂水族館, もっと知りたい「クラゲの筋肉」, 57ページ
緑書房, 2024年11月, 9784868110088, 183p, 日本語, 45168664, [分担執筆]
■ 所属学協会
■ Works(作品等)
■ 共同研究・競争的資金等の研究課題
- 刺胞動物の筋収縮調節機構の解明
科学研究費助成事業
2019年04月01日 - 2024年03月31日
田中 啓之
ミズクラゲ横紋筋から精製したミオシンの画分に少量含まれていることが確認された新規カルシウムイオン結合タンパク質、AaCBPを認識する抗体を精製した。また、ミズクラゲ横紋筋アクトミオシンの構成成分であるものの、機能が不明なパラミオシン様タンパク質について、C末端断片を大腸菌発現させ、ウサギに免疫して抗血清を作製した。これらの抗体を用いて、ウェスタンブロッティングや免疫染色を行い、これらのタンパク質の発現解析を行った。また、ミズクラゲのポリプや成体の下傘、上傘、口腕など各種の組織・部位からのRT-PCRによる発現解析も行った。それらの結果、これらのタンパク質はいずれも横紋筋を含む組織に特異的に発現しており、横紋筋に特有の形態形成、収縮や収縮の調節等に関与している可能性が示された。特に、AaCBPに関しては、サルコメア構造の中でもミオシンフィラメントの部位に存在することが明らかとなった。また、横紋筋から抽出・精製した天然アクトミオシンには、AaCBPが結合していること、そしてそれは、天然アクトミオシンにキモトリプシンを作用させてミオシンの重鎖が切断されると遊離することも示された。以上の結果から、AaCBPはミオシンに結合して機能するタンパク質であると考えられ、筋細胞への刺激伝達時に細胞内で濃度が上昇するカルシウムイオンを結合して、情報をミオシンに伝達し、アクチン-ミオシン相互作用を促進して筋収縮を引き起こすという、筋収縮調節機構の存在が示唆された。
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 19K06755 - 棘皮動物の筋収縮調節機構に関する研究
科学研究費助成事業
2012年04月01日 - 2016年03月31日
田中 啓之; 波多野 淳治; 森田 隆寛; 能登 公輝; 図司 秀樹; 服部 一輝
棘皮動物の筋肉はほとんどが平滑筋であり、その収縮は、他の動物の平滑筋のように、ミオシン軽鎖のCa2+依存的なリン酸化によって制御されると考えられてきた。本研究では、ウニの筋肉において、高等動物の横紋筋で知られるトロポニンによる制御機構も存在する可能性が示された。また、ウニのトロポニンの構造上の特徴から、脊椎動物のトロポニンとは異なる作動機構によって収縮が調節されると考えられた。
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 24580293 - 軟体動物の筋収縮調節と温度適応に関する研究
科学研究費助成事業
2008年 - 2011年
田中 啓之; 尾島 孝男
筋収縮を神経刺激に応じて制御するタンパク質であるトロポニン-トロポミオシンについて、軟体動物のものは古くから研究されてきた脊椎動物のものとは異なるメカニズムで作用することを明らかにした。また、このメカニズムが他の無脊椎動物にも存在する普遍的なものである可能性を示した。さらに、軟体動物が、特性の異なるトロポニンの様々な分子種を筋細胞内に作り出し、それが温度環境への適応や、種毎の生態の相違に関連している可能性も示した。
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 20580217 - アワビの海藻多糖代謝機構の解明
科学研究費助成事業
2007年 - 2010年
尾島 孝男; 井上 晶; 田中 啓之; 澤辺 智雄
アワビやアメフラシなどの食藻性腹足類は、アルギン酸やラミラナン、マンナン、キシラン、セルロースなどの海藻多糖を特異的に分解する酵素をもつ。これらの酵素によって分解された海藻多糖は、腹足類の解糖系やTCA回路により代謝される。本研究では、腹足類の海藻多糖代謝機構に関する理解を深めるために、消化液に含まれる一連の多糖代謝系酵素、特にアルギン酸、ラミナラン、マンナンの分解に関連する酵素の性状を解析した。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 19380117 - イガイ類の付着機構に関する生化学的研究
科学研究費助成事業
2003年 - 2005年
田中 啓之
イガイ類の付着は足から分泌されるタンパク質が硬化して形成される足糸によって行われる。この足糸タンパク質は、生合成から分泌に至るまでの間に細胞内で様々な翻訳後修飾を受けることが知られている。本研究では、翻訳後修飾に関わる酵素や分泌に関与するタンパク質を明らかにするため、足糸タンパク質と相互作用するタンパク質を、酵母Two-Hybrid systemを用いてスクリーニングすることにした。
函館湾においてイガイ類を採取し、まず、既報のPCR法によって種の同定を行った。その結果、採取した10個体はいずれもムラサキイガイであることを確認した。次に、そのうち1個体の足よりmRNAを分離してcDNAの合成を行った後、PCRによって2種類の足糸タンパク質(MGFP1およびMGFP2)をコードするcDNAの増幅を行った。MGFP1-cDNAの増幅産物については、様々なサイズを示したが、5'端側から分析した部分塩基配列はいずれも相同で、既報の配列にほぼ一致した。一方、MGFP2-cDNAの増幅産物についても、様々なサイズのものが得られ、同様に5'端側の相同性は高かったが、3'端側の繰り返し領域は、繰り返し単位の欠損や重複により、少なくとも3つの配列パターンに分類されることがわかった。さらに、これらのアイソフォームは異なる複数の遺伝子にコードされていることが示唆された。これらの結果は、MGFP2の基本構造が種を超えて保存されているとする既報の知見とは異なっていた。また、配列も既報のものとはアミノ酸配列レベルで約85%の相同性を示すに留まり、異なっていることがわかった。さらに、MGFP1およびMGFP2をコードするこれらのcDNAをBaitベクターにサブクローニングする一方、cDNAライブラリーをPreyベクターに構築して酵母Two-Hybrid systemによるスクリーニングの準備をした。
日本学術振興会, 若手研究(B), 北海道大学, 15780139 - 水産無脊椎動物セルラーゼの一次構造と起源に関する研究
科学研究費助成事業
2003年 - 2005年
尾島 孝男; 岸村 栄毅; 田中 啓之
軟体動物や棘皮動物に属する複数種類の水産無脊椎動物の消化組織から得た粗酵素のセルラーゼ活性(CMCase活性)を測定し、どのような生物にセルラーゼが分布しているかを調べた。それによれば、アワビ、ウニ、ホタテガイなど、食藻性無脊椎動物の多くがセルラーゼ有するが、肉食性の無脊椎動物のヒトデやエゾボラには顕著なセルラーゼ活性は認められないことが明らかになった。そこで、セルラーゼ活性が検出されたアワビ、ウニ、ホタテガイの消化液からセルラーゼを単離すると共に、それらのcDNAおよび構造遺伝子をクローニングし、構造および機能上の特徴を究明した。一次構造解析によれば、上記3種のセルラーゼはいずれも従来知られていたシロアリやザリガニなどの節足動物の酵素と40-50%のアミノ酸同一率を示し、glycoside hydrolase amily9(GHF9)に属することが明らかになった。一次構造に基づく系統解析によれば、これら無脊椎動物セルラーゼの遺伝子は共通の祖先遺伝子から分化したものと判断された。また、アワビのセルラーゼにはN末端にCarbohydrate-binding module(CBM)を持つアイソザイムが見出された。このようなCBMをN末端にもつ動物のGHF9セルラーゼは、アワビで初めて見つかったものである。また、セロオリゴ糖の分解能を調べた結果、アワビのセルラーゼは3糖を2糖と単糖に分解可能であるが、ウニとホタテガイのセルラーゼは4糖以上でないと分解できないことが分かった。また、アワビのセルラーゼは4糖を2分子の2糖に分解するが、ウニとホタテガイのセルラーゼは4糖を2分子の2糖に分解するだけでなく、3糖と単糖にも分解した。このように、同じGHF9セルラーゼであっても、無脊椎動物の間では作用特性に違いがあることが明らかになった。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 15380138 - 軟体動物アルギン酸リアーゼの起源と遺伝子構造に関する研究
科学研究費助成事業
2003年 - 2004年
尾島 孝男; 岸村 栄毅; 田中 啓之
本年度は、アワビ・エンド型アルギン酸リアーゼ(HdAly)の構造遺伝子を染色体DNAライブラリーからクローニングし、そのイントロンとエキソンの配置を解析した。構造遺伝子の塩基配列とcDNAの塩基配列とを比較した結果、HdAlyの構造遺伝子は2784bpから成り、2つのイントロンで分断された3つのエキソンから構成されることが明らかになった。イントロンの位置は5'-非翻訳領域内部および分泌シグナルと触媒部位の連結部位にそれぞれ存在していた。なお、HdAlyの触媒部位のコード領域は1つのエキソンから構成されていたが、これはHdAlyの構造遺伝子の起源が比較的新しいことを示すものと考えられる。一方、本年度はエゾアワビ消化液から新たにエキソ型のアルギン酸リアーゼHdAlexを単離した。HdAlexはSDS-PAGEで分子量約36,000の単一バンドを示し、poly(M)-blockを特異的に分解した。また、ポリマンヌロン酸分子の還元末端より2番目のグリコシド結合を切断することが明らかになった。次いでアワビ肝膵臓cDNAライブラリーからHdAlexのcDNAをクローン化し、その塩基配列を分析した。その結果、cDNAの翻訳領域822bpからHdAlex前駆体の273残基のアミノ酸配列が演繹された。さらに、HdAlexは翻訳後修飾により256アミノ酸残基から成る成熟体に変換されることが明らかになった。HdAlexのアミノ酸配列は、アワビのエンド型リアーゼHdAlyと67.2%、サザエのエンド型リアーゼと61.8%、およびクロレラウィルス・アルギン酸リアーゼ(CL2)と34.1%の相同性を示した。これらの結果より、エンド型とエキソ型のアルギン酸リアーゼ遺伝子が共通の祖先遺伝子から分化したことが強く示唆された。
日本学術振興会, 萌芽研究, 北海道大学, 15658061 - 有用資源魚筋タンパク質のアミノ酸配列解析
科学研究費助成事業
1998年 - 2001年
西田 清義; 田中 啓之; 尾島 孝男
本研究ではシロサケ、ホッケ、スケトウダラ、サバの普通筋、血合筋、心筋よりcDNAファージ・ライブラリーを構築し、ミオシン重鎖およびアクチンのcDNAクローニング、PCR、サーマル・サイクル法による塩基配列解析、オンライン・データベースによる各種解析を行い、以下の成果を得た。
1.シロサケ背筋に、2種類のミオシン重鎖cDNAクローンの存在が明らかになった。それらの塩基配列解析し、1種は10-12年度に、他の1種は11-13年度に、いずれも1937残基から成る全アミノ酸配列を決定した。両者は配列相同性が71%と低く、別遺伝子由来と判断された。2.シロサケ血合筋および心筋よりミオシン重鎖のそれぞれ246残基の部分アミノ酸配列を決定した。それらの配列およびデータベース検索の結果から、普通筋のクローンのうちの一つは、血合筋のクローンと同一であることが分かった(12-13年度)。3.ホッケ背筋より(1)普通筋タイプおよび(2)血合筋タイプのcDNAクローンを得たので、塩基配列を解析し、(1)については1931残基の全アミノ酸配列を決定し(平成12-13年度)、(2)については832残基の部分配列を決定した(同)。4.サバ背筋より普通筋タイプおよび血合筋タイプのcDNAクローン得たので、13年度にそれぞれについて245アミノ酸の部分配列を決定した。5.シロサケ背筋よりα-アクチンのcDNAクローンを得たので、その塩基配列を解析し、375残基の全アミノ酸配列を決定した(11年度)。6.スケトウダラおよびホッケの背筋より得たα-アクチンのcDNAクローンの塩基配列を解析し、375残基の全アミノ酸配列を決定した(同)。7.以上のミオシン重鎖およびアクチンの配列について、種々の観点より比較検討を行った。また、成果の一部について、2編を学術誌に投稿した。
日本学術振興会, 基盤研究(A), 北海道大学, 10306013 - 軟体動物トロポニンIのN端伸長領域の存在意義の研究
科学研究費助成事業
1999年 - 2000年
田中 啓之
1.ホタテガイ類TnIの一次構造と機能の相関の検討
アカザラガイTnIのcDNAを鋳型として種々の領域をPCR増幅し、それらを発現ベクターに組み込んで大腸菌によるTnI断片発現系を構築した。現在、N端伸長領域を含む断片の発現には至っておらず、脊椎動物TnIと相同性を示すC端側の領域に含まれる残基130-292、残基130-252および残基231-292の領域について発現を行った。さらにこれらの領域に相当するウサギTnIの領域についても同様にして発現系を構築した。これらの断片のTnCとの結合能を比較した結果、残基231-292について、ウサギTnIではCa依存的な強い結合が認められるのに対し、アカザラガイTnIでは全く結合しないなどの大きな相異が認められた。従って、アカザラガイTnIの収縮調節における作用機構は脊椎動物TnIのそれとは異なっていることが示唆された。
2.N端伸長領域と相互作用する蛋白質の酵母Two-Hybrid systemによる検索
アカザラガイTnIのN端伸長領域にあたる残基1-129、脊椎動物TnIと相同性を示す残基130-292およびTnC結合部位である残基130-183の領域をコードするDNAを調製し、それらをpHybLex/Zeoベクターに組み込んで酵母EGY48(pSH18-34)を形質転換した。さらにそれらをpYESTrp2ベクターに構築したアカザラガイ横紋筋cDNAライブラリーで形質転換し、Leu非要求性およびLacZの発現を指標として、上述の領域と相互作用する蛋白質を検索した。その結果、残基130-292に関してはTnCおよびTnTが、残基130-183に関してはTnCが相互作用蛋白質として検出されるなど予想通りの結果が得られる一方で、N端伸長領域である残基1-129に関しては相互作用蛋白質を検出するには至らなかった。
日本学術振興会, 奨励研究(A), 北海道大学, 11760144 - 加工原料魚ミオシンのアミノ酸配列分析
科学研究費助成事業
1995年 - 1997年
西田 清義; 田中 啓之; 尾島 孝男
昨年までにcDNAクローニングによりスケトウダラ・ミオシンのHMM部分のアミノ酸配列(1-1287残基)を決定した。今年度はその演繹配列とミオシンの配列との相同性及び修飾アミノ酸の種類と存在位置について検討した。まず、すり身から調製した筋原繊維をキモトリプシンで消化してHMMを調製した後、尿素-アセトン処理で重鎖を分離した。これを化学的または酵素的に断片化し、BrCN断片6個、リジルエンドペプチダーゼ断片37個、アルギニルエンドペプチダーゼ断片14個、α-キモトリプシン断片6個、トリプシン断片5個を得た。それらの分析により725残基のアミノ酸配列を解明した後、cDNAから演繹した配列と比較した結果、355残基はS1領域(同領域の約43%)に、370残基はS2領域(同領域の約83%)に属していることが判明した。S1領域のペプチド断片が得にくい理由は不明であるが、消化や凝集しやすいためと考えられた。また、cDNAクローンから演繹した配列と発現ミオシンタンパク質の配列を比較した。さらに、ニワトリ骨格筋ミオシンで知られている35残基目のモノメチルリジン(Mml-35)の部位はスケトウダラミオシンでは非修飾リジンであり、その周辺のアミノ酸配列は各種骨格筋ミオシンと52〜57%の相同性を示した。また、550残基目にはトリメチルリジン(Tml-550)が存在し、その周辺の配列は他種ミオシンの配列と相同性が高かった(71-81%)。さらに、S2領域にある834Val-Tyr-Tyr-Lys-Ile-Lys839はβ-シート構造と予測され、コイやウサギの骨格筋ミオシンで予測されているα-ヘリックスとは異なっていた。ミオシン・タンパク質にはcDNAクローンとは配列が異なる2種のアイソフォームの存在が推定された。(なお、昨年度までに別途にLMM(1288-1937)の全アミノ酸配列も決定している。)
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 07456093 - ホタテガイ類トロポニンの一次構造決定と一次構造・機能相関の研究
科学研究費助成事業
1996年 - 1996年
田中 啓之
アカザラガイ横紋閉殻筋トロポニンの一次構造を決定することができた。このトロポニンIはアミノ酸292個からなり、端はアセチル化によってブロックされていた。分子量は34,678と計算され、従来SDS電気泳動法で見積もられてきた52,000に比べ小さいことがわかったが、これはこのトロポニンIがGluに非常に富んだ領域を持ち、電気泳動において異常な移動度を示すためであると推測された。アカザラガイトロポニンIの一次構造を既に一次構造が報告されている他種のトロポニンIのそれと比較すると、C端側の領域(残基134-292)が脊椎動物トロポニンIに対し26-30%、また節足動物トロポニンIに対し39%の相同性を示すことがわかった。特にこのC端側領域の中でも脊椎動物トロポニンIにおいてアクチンやトロポニンCとの結合部位と考えられている部位については他種トロポニンIとの相同性が高かった。一方、N端部分は脊椎動物骨格筋トロポニンIに比べて約130残基、また節足動物トロポニンIに比べて約50から110残基も突出しており、この突出したN端領域(残基1-133)はGluとArgに富んだ特異な配列からなっていた。また、配列データベースの検索により、このN端領域の中でも残基76-115の領域がトロポニンTやカルデスモンのトロポミオシン結合部位と相同性を示すことが検出され、トロポミオシンとの相互作用の機能を担っている可能性が示唆された。そこで、アカザラガイトロポニンIをCNBr消化しN端断片(残基1-129)とC端断片(残基158-292)を調製し、これらのトロポミオシン・アクチン複合体ととの結合性を超遠心共沈法によって検討したが、C端断片がトロポミオシン・アクチン複合体と結合する一方で、N端断片は結合せず、N端領域にトロポミオシンとの相互作用機能が存在することを証明するには至らなかった。
日本学術振興会, 奨励研究(A), 北海道大学, 08760194 - 水産生物タンパク質の構造、機能および発現の解析
競争的資金 - Structural, functional, and expressional analysis of protein in marine organisms
競争的資金
