秋田 晋吾 (アキタ シンゴ)
水産科学研究院 海洋生物資源科学部門 海洋共生学分野 | 助教 |
Last Updated :2025/04/25
■研究者基本情報
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研究者番号
- 80828195
J-Global ID
■経歴
経歴
学歴
委員歴
■研究活動情報
受賞
- 2023年03月, 日本藻類学会, 第26回日本藻類学会論文賞
Yoshino Hara;Yui Otake;Shingo Akita;Tomokazu Yamazaki;Fumio Takahashi;Shinya Yoshikawa;Satoshi Shimada - 2021年12月, 国際藻類学会, 国際藻類学会論文賞
Molecular phylogeny and biogeography of Ecklonia spp. (Laminariales, Phaeophyceae) in Japan revealed taxonomic revision of E. kurome and E. stolonifera
Shingo Akita;Kazuki Hashimoto;Takeaki Hanyuda;Hiroshi Kawai - 2021年03月, 日本藻類学会, 日本藻類学会研究奨励賞
秋田晋吾 - 2013年04月, 21st International Seaweed Symposium, 21st International Seaweed Symposium(poster, 2nd prize)
Phenology of annual kelp Eckloniopsis forest on a Diadema barren in Uchiura Bay, Central Pacific Coast of Honshu, Japan
秋田晋吾;小林美樹;山田博一;伊藤円;藤田大介, 国際学会・会議・シンポジウム等の賞
論文
- Critical taxonomic revision of Korean Dictyoteae describing three new species and honoring Haenyeo culture
Christophe Vieira, Jeong Chan Kang, Manon Daudinet, Shingo Akita, Myung Sook Kim
Journal of Phycology, 2025年04月05日, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Genetic structure of Saccharina japonica in Japan and evaluation of a potential mitochondrial region for identification of geographic origin
Kenta Chizaki, Chikara Kawagoe, Keiko Ito, Hiroyuki Mizuta, Yuya Yoshida, Toshiki Uji, Daisuke Fujita, Shingo Akita
Journal of Applied Phycology, 37, 659, 672, 2025年02月, [査読有り], [最終著者, 責任著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), 46988525 - Concise review of the brown algal genus <i>Padina</i> (Dictyotaceae): knowledge in biodiversity, biogeography, potential and scope future research for Vietnam
Linh Manh Nguyen, Shingo Akita, Luong Van Cao, Anh Thi Mai Nguyen, Quang Van Pham, Hung Manh Vu, The Duc Nguyen, Vy Xuan Nguyen, Quan Van Nguyen, Christophe Vieira
Vietnam Journal of Marine Science and Technology, 24, 4, 399, 418, Publishing House for Science and Technology, Vietnam Academy of Science and Technology (Publications), 2024年12月10日, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), The review critically examines the brown algal genus Padina (family Dictyotaceae), emphasizing its biodiversity, distribution, and potential applications, particularly in Vietnam. Globally, Padina species inhabit tropical and temperate coastal ecosystems, playing crucial ecological roles in primary production and as habitats for marine organisms. In Vietnam, nine species of Padina have been documented, yet their taxonomic diversity and applications remain underexplored. This synthesis highlights the morphological traits, ecological significance, and geographic distribution of Padina in Vietnam, with a focus on its potential in pharmaceuticals, nutraceuticals, cosmeceuticals, and bioremediation. Biochemical analyses reveal bioactive compounds such as terpenoids, polyphenols, and fucoidans, which demonstrate antioxidant, antimicrobial, and anti-inflammatory activities. These properties underscore Padina’s potential for natural product development in pharmaceutical and cosmetic industries. Despite this promise, research in Vietnam has predominantly centered on taxonomic and ecological aspects, with limited studies on biochemical and economic applications. The review identifies critical gaps in understanding species boundaries, phylogenetic relationships, and ecological roles. It advocates for advanced morphological and molecular studies, including molecular barcoding, to uncover cryptic diversity and resolve taxonomic ambiguities. Future research directions include exploring Padina’s reproductive biology, dispersal mechanisms, and responses to environmental stressors such as climate change. Additionally, investigations into its ecological roles, particularly as bioindicators of environmental health and agents for pollution mitigation, are essential. Addressing these gaps will enhance knowledge of Padina biodiversity and support the sustainable management and utilization of this valuable marine resource in Vietnam. - Evolutionary genomics of the emergence of brown algae as key components of coastal ecosystems
France Denoeud, Olivier Godfroy, Corinne Cruaud, Svenja Heesch, Zofia Nehr, Nachida Tadrent, Arnaud Couloux, Loraine Brillet-Guéguen, Ludovic Delage, Dean Mckeown, Taizo Motomura, Duncan Sussfeld, Xiao Fan, Lisa Mazéas, Nicolas Terrapon, Josué Barrera-Redondo, Romy Petroll, Lauric Reynes, Seok-Wan Choi, Jihoon Jo, Kavitha Uthanumallian, Kenny Bogaert, Céline Duc, Pélagie Ratchinski, Agnieszka Lipinska, Benjamin Noel, Eleanor A. Murphy, Martin Lohr, Ananya Khatei, Pauline Hamon-Giraud, Christophe Vieira, Komlan Avia, Svea Sanja Akerfors, Shingo Akita, Yacine Badis, Tristan Barbeyron, Arnaud Belcour, Wahiba Berrabah, Samuel Blanquart, Ahlem Bouguerba-Collin, Trevor Bringloe, Rose Ann Cattolico, Alexandre Cormier, Helena Cruz de Carvalho, Romain Dallet, Olivier De Clerck, Ahmed Debit, Erwan Denis, Christophe Destombe, Erica Dinatale, Simon Dittami, Elodie Drula, Sylvain Faugeron, Jeanne Got, Louis Graf, Agnès Groisillier, Marie-Laure Guillemin, Lars Harms, William John Hatchett, Bernard Henrissat, Galice Hoarau, Chloé Jollivet, Alexander Jueterbock, Ehsan Kayal, Andrew H. Knoll, Kazuhiro Kogame, Arthur Le Bars, Catherine Leblanc, Line Le Gall, Ronja Ley, Xi Liu, Steven T. LoDuca, Pascal Jean Lopez, Philippe Lopez, Eric Manirakiza, Karine Massau, Stéphane Mauger, Laetitia Mest, Gurvan Michel, Catia Monteiro, Chikako Nagasato, Delphine Nègre, Eric Pelletier, Naomi Phillips, Philippe Potin, Stefan A. Rensing, Ellyn Rousselot, Sylvie Rousvoal, Declan Schroeder, Delphine Scornet, Anne Siegel, Leila Tirichine, Thierry Tonon, Klaus Valentin, Heroen Verbruggen, Florian Weinberger, Glen Wheeler, Hiroshi Kawai, Akira F. Peters, Hwan Su Yoon, Cécile Hervé, Naihao Ye, Eric Bapteste, Myriam Valero, Gabriel V. Markov, Erwan Corre, Susana M. Coelho, Patrick Wincker, Jean-Marc Aury, J. Mark Cock
Cell, Elsevier BV, 2024年11月, [査読有り]
研究論文(学術雑誌) - Life cycle and molecular phylogeny of Vaucheria piloboloides (Vaucheriales, Xanthophyceae) from Sado Island, Japan
Masakazu Hoshino, Satoru Tadokoro, Shingo Akita, Shinya Uwai
Phycological Research, 72, 258, 265, 2024年09月, [査読有り]
英語 - Of sea, rivers and symbiosis: Diversity, systematics, biogeography and evolution of the deeply diverging florideophycean order Hildenbrandiales (Rhodophyta)
Christophe Vieira, Cody Brooks, Shingo Akita, Myung Sook Kim, Gary W. Saunders
Molecular Phylogenetics and Evolution, 108106, 108106, Elsevier BV, 2024年05月, [査読有り]
英語, 研究論文(国際会議プロシーディングス) - 神奈川県城ヶ島地先の中根に生息する サザエ Turbo sazae の着生海藻
丁 聿昊, 芳山 拓, 秋田 晋吾, 藤田 大介
藻類, 71, 3, 157, 164, 2023年11月10日, [査読有り], [責任著者]
日本語, 研究論文(学術雑誌) - Phenology of Codium cylindricum (Ulvophyceae, Bryopsidales) on the central Pacific coast of Japan
Minoru Miyadai, Shingo Akita, Daisuke Fujita
Botanica Marina, 65, 337, 345, 2022年10月26日, [査読有り], [責任著者]
研究論文(学術雑誌), 11993067 - Gene expression of a canopy‐forming kelp, Eisenia bicyclis ( Laminariales, Phaeophyceae ), under high temperature stress
Yoshino Hara, Yui Otake, Shingo Akita, Tomokazu Yamazaki, Fumio Takahashi, Shinya Yoshikawa, Satoshi Shimada
Phycological Research, 70, 4, 203, 211, 2022年07月13日, [査読有り]
研究論文(学術雑誌), To understand the high temperature stress acclimation of a canopy-forming kelp, RNA-seq analysis was performed on cultured Eisenia bicyclis (Kjellman) Setchell (Laminariales, Phaeophyceae), a major component species of kelp forests along the coast of Japan. We established a culture strain from a population at the northernmost distribution limit of this species and measured photosystem II activity in young sporophytes. We found that photosystem II activity was lower at 25°C than at 5–15°C, thus, comparative RNA-seq analysis was conducted between cultivated young thalli of E. bicyclis at 15°C and 25°C. Comparison with the expression genes revealed 277 up-regulated genes and 327 down-regulated genes at 25°C. The most up-regulated gene was 3-ketoacyl-CoA thiolase, which is related to fatty acid degradation. This enzyme has been reported to positively regulate abscisic acid (ABA) signaling in Arabidopsis thaliana (Brassicaceae). In addition, heat shock proteins, ATP synthase, NADH-dehydrogenase, and L-ascorbate peroxidase were up-regulated. The most down-regulated gene was taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA. Genes related to fatty acid metabolism, photosynthesis, and synthesis of cell wall components were down-regulated. These results suggest that E. bicyclis may counteract high temperature stress by up-regulating genes involved in protein stabilization, energy production and antioxidant processes. Conversely, photosynthesis and other metabolic processes may be damaged due to the inability to withstand high temperature stress. - Phylogeography of a canopy‐forming kelp, Eisenia bicyclis (Laminariales, Phaeophyceae), based on a genome‐wide sequencing analysis
Kanako Chimura, Shingo Akita, Takaya Iwasaki, Atsushi J. Nagano, Satoshi Shimada
Journal of Phycology, 58, 2, 318, 329, Wiley, 2022年01月09日, [査読有り], [責任著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Analyses of phylogeographic patterns and genetic diversity provide fundamental information for the management and conservation of species. However, little is published about these patterns in Japanese kelp species. In this study, we conducted phylogeographic analyses of a canopy-forming kelp, Eisenia bicyclis, based on genome-wide SNPs identified by ddRAD-seq. We obtained 1,299 SNPs for 76 samples from nine localities across the distribution. STRUCTURE, NeighborNet, and discriminant analysis of principal components consistently showed high genetic differentiation among the Eastern Pacific, Central Pacific, and Sea of Japan coastal regions. Relatively strong gene flow was detected only within populations in the Eastern Pacific and in the Sea of Japan. Genetic diversity and genetic uniqueness were high in the Central Pacific and low in the Sea of Japan. These results suggest that there were at least three independent refugia corresponding to the three regions during the Last Glacial Maximum (LGM). Furthermore, relatively larger populations in the Central Pacific and smaller populations in the Sea of Japan have been maintained in the demographic history from before the LGM to the present. These phylogeographic histories were supported by an Approximate Bayesian Computation analysis. From a conservation genetics perspective, the loss of southern populations in the Central Pacific would greatly reduce the total genetic diversity of the species. Southern populations in the Sea of Japan, which have relatively low genetic diversity, may be highly vulnerable to environmental change, such as heat waves and increased feeding. Therefore, careful monitoring and conservation are needed in the two regions. - Restoration of Ecklonia radicosa bed on a long-left concrete block dominated by Diadema sea urchins
Shingo Akita, Hirokazu Yamada, Madoka Ito, Daisuke Fujita
Algal Resources, 14, 2, 49, 58, 2022年01月, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者], [国内誌]
英語 - Providing a phylogenetic framework for trait-based analyses in brown algae: phylogenomic tree inferred from 32 nuclear protein-coding sequences
Shingo Akita, Christophe Vieira, Takeaki Hanyuda, Florence Rousseau, Corinne Cruaud, Arnaud Couloux, Svenja Heesch, J. Mark Cock, Hiroshi Kawai
Molecular Phylogenetics and Evolution, 168, 107408, 107408, Elsevier BV, 2022年01月, [査読有り], [筆頭著者], [国際共著], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - First record of the genus Hildenbrandia (Florideophyceae: Hildenbrandiales) from French Polynesia and description of H. tahitiensis sp. nov
Christophe Vieira, Shingo Akita, Yi Sun Kim, Satoshi Shimada, Hiroshi Kawai, Mayalen Zubia
Journal of Asia-Pacific Biodiversity, 14, 4, 607, 612, Elsevier BV, 2021年07月, [査読有り], [国際共著], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Molecular evidence for naturally occurring intra- and inter-generic hybridization in the genus Ecklonia (Laminariales, Phaeophyceae)
Shingo Akita, Keiichiro Koiwai, Tatsuya Ishikawa, Takashi Sakamoto, Taku Yoshimura, Setsuo Kiyomoto, Kaiji Nanri, You Tamayama-Kato, Akira Kurashima, Takeaki Hanyuda, Satoshi Shimada, Hiroshi Kawai, Daisuke Fujita
Phycologia, 60, 2, 170, 179, Informa UK Limited, 2021年03月04日, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Reports of naturally occurring hybridization between species and genera in Laminariales are limited. Hybrids are mostly identified based on morphological evidence, which is often inadequate to distinguish hybrids from other unusual kelp morphological variants. In the present study, we found morphologically atypical Ecklonia (Ec.), which were suspected of being hybrids between Ec. radicosa (Ecr) and Ec. cava subsp. stolonifera (Eccs) (IKI 09-23) or between Ecr and Eisenia (Ei.) nipponica (Ein) (OWS 07-13), in two localities in Japan. To verify the existence of naturally occurring hybrids in Ec., we determined their maternal ancestry by mtDNA genotyping and assigned the putative hybrids to four categories (F-1, F-2 and backcross to parental species) based on microsatellite markers. The morphologically atypical specimens were defined as: F-1 generation of Ecr male x Eccs female (IKI 12, IKI 15-17 and IKI 19-22), Ecr female x Eccs male (IKI 11), or Ecr male x Ein female (OWS 07 and OWS 10-13), with relatively high posterior probabilities (>0.700). The remaining specimens were non-hybrids (Eccs: IKI 09, IKI 10 and IKI 13; Ecr: IKI 18), F-1 or backcrosses to Ecr (IKI 14, IKI 23 and OWS 08) and F-1, F-2 or backcrosses to Ecr (OWS 09). Our results provide strong genetic evidence for the existence of intra- and inter-generic hybrids of Ecklonia in the field., 27024358 - Hildenbrandia (Hildenbrandiales, Florideophyceae) from Japan and taxonomic lumping of H. jigongshanensis and H. japananensis
Christophe Vieira, Shingo Akita, Shinya Uwai, Takeaki Hanyuda, Satoshi Shimada, Hiroshi Kawai
Phycological Research, 69, 3, 166, 170, Wiley, 2021年02月17日, [査読有り], [責任著者], [国際誌]
研究論文(学術雑誌) - 応用藻類学者にむけた分子系統学解析入門
秋田晋吾, 羽生田岳昭, 嶌田 智
Algal resources, 13, 2, 27, 31, 2020年12月, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者]
日本語 - ddRAD-seq解析を用いた日本沿岸の紅藻マクサの系統地理学的解析
千村佳那子, 岩崎貴也, 永野 淳, 秋田晋吾, 嶌田智
Algal Resources, 20, 13, 117, 122, 2020年12月, [査読有り]
日本語 - 紅藻アマノリ類2種における遊離アミノ酸量と培養塩濃度条件との関係
瀬戸彩映里, 秋田晋吾, 横山雄彦, 菊池則雄, 嶌田智
Algal Resources, 13, 2, 103, 106, 2020年12月, [査読有り]
日本語, 研究論文(学術雑誌) - 異なる地域に生育する褐藻アラメの高水温耐性
大竹佑衣, 嶌田智, 秋田晋吾
Algal Resources, 13, 2, 85, 89, 2020年12月, [査読有り]
日本語, 研究論文(学術雑誌) - DNA metabarcoding analysis of macroalgal seed banks on shell surface of the limpet Niveotectura pallida
Shingo Akita, Hiroki Murasawa, Mitsuki Kondo, Yoshihito Takano, Yoko Kawakami, Satoshi Nagai, Daisuke Fujita
European Journal of Phycology, 55, 4, 467, 477, Informa UK Limited, 2020年10月01日, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), In macroalgal restoration on urchin barren coasts, understanding the variability in microscopic stages of canopy-forming macroalgae such as kelps and fucoids is critical to reduce restoration effort (i.e. sea urchin removal). In the present study, we used epilithic macroalgae present on the limpetNiveotectura pallidato determine the macroalgal seed bank along a depth gradient of habitats (surf, turf, barren and sandy zones). We collected a total of 46 limpets in two seasons (summer: August and winter: December) and from four zones at Sashiga-hama on the north-east coast of northern Honshu, Japan. The attached organisms on the limpet shells were brushed off and identified using a plastid-encodedrbcL gene and high throughput sequencing (HTS) based DNA metabarcoding. The original data set consisted of 432 macroalgal and 224 microalgal operational taxonomic units (OTUs). For macroalgae, 37, 190 and 205 OTUs were assigned to Ulvophyceae, Phaeophyceae and Rhodophyta, respectively. For canopy-forming macroalgal OTUs, Agaraceae, Alariaceae, Lessoniaceae, Laminariaceae and Sargassaceae were detected. In summer, the OTU was significantly richest in the sandy zone (77.0 +/- 15.2 OTUs), but the difference among zones was less conspicuous in winter, ranging from 52.8 +/- 16.4 to 64.3 +/- 13.2 OTUs. The Shannon-Wiener diversity index showed similar patterns. The laminarialean and sargassacean OTUs were significantly the richest in the sandy zone during summer (p< 0.001). In light of these results, macroalgal restoration (i.e. through sea urchin removal) should be initiated in summer and the sandy zone should be preferentially targeted. - The macroalgal culture collection in Kobe University (KU-MACC) and a comprehensive molecular phylogeny of macroalgae based on the culture strains
Hiroshi Kawai, Takeaki Hanyuda, Shingo Akita, Shinya Uwai
Applied Phycology, 1, 8, Informa UK Limited, 2020年08月06日, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Phenology of the edible red alga Eucheuma serra (J. Agardh) J. Agardh in northern Taiwan
Boryuan Chen, Yang Lu, Shingo Akita, Daisuke Fujita
Aquaculture Science, 68, 2, 121, 128, 2020年07月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Molecular phylogeny and biogeography of Ecklonia spp. (Laminariales, Phaeophyceae) in Japan revealed taxonomic revision of E. kurome and E. stolonifera
Shingo Akita, Kazuki Hashimoto, Takeaki Hanyuda, Hiroshi Kawai
Phycologia, 59, 4, 330, 339, Informa UK Limited, 2020年05月26日, [査読有り], [筆頭著者]
研究論文(学術雑誌) - Variation in “bank of microscopic forms” in urchin barren coast: detection using DNA metabarcoding based on high-throughput sequencing
Shingo Akita, Hiroki Murasawa, Yoshihito Takano, Yoko Kawakami, Daisuke Fujita, Satoshi Nagai
Journal of Applied Phycology, Springer Science and Business Media {LLC}, 2020年05月22日, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者]
研究論文(学術雑誌) - Finding of regeneration in a large number of wounded receptacles in Sargassum ringgoldianum (Phaeophyceae, Fucales)
Shunro Yamano, Shingo Akita, Yuhi Hayakawa, Daisuke Fujita
Phycological Research, 68, 2, 183, 186, Wiley, 2020年04月, [査読有り], [責任著者]
研究論文(学術雑誌) - A multigene molecular phylogeny of Eisenia reveals evidence for a new species, Eisenia nipponica (Laminariales), from Japan
Kawai Hiroshi, Akita Shingo, Hashimoto Kazuki, Hanyuda Takeaki
EUROPEAN JOURNAL OF PHYCOLOGY, 55, 2, 234, 241, TAYLOR & FRANCIS LTD, 2020年01月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), Recently, synonymizing Eisenia with Ecklonia was suggested based on a molecular phylogeny using the rbcL gene and ITS1-5.8S rDNA sequences. However, in a multigene molecular phylogeny based on mitochondrial cox1, cox3 genes and the atp8-16S rDNA region, as well as the plastid atpB, psaA, psbA and rbcL genes, Ecklonia spp. formed a monophyletic clade supported by high statistical values, and Eisenia spp. showed monophyly depending on analytical methods. The Japanese Eisenia species that used to be identified as Eisenia arborea (E. arborea sensu Arasaki) was shown to be genetically distant from E. arborea from the NE Pacific and E. bicyclis from Japan. Eisenia spp. were morphologically distinct in having a split meristematic zone in the mature thallus forming a dorsi-ventral blade with false branches. Therefore, we propose reinstatement of Eisenia as an independent genus and describe a new species, Eisenia nipponica (= E. arborea sensu Arasaki) from Japan. E. nipponica is distributed on the Pacific Coast of central Honshu, having a separate geographic range from E. bicyclis, which is distributed on the Pacific coast of eastern Honshu and the Sea of Japan coast of north-western Honshu and northern Kyushu. - Rapid detection of macroalgal seed bank on cobbles: application of DNA metabarcoding using next-generation sequencing
Shingo Akita, Yoshihito Takano, Satoshi Nagai, Hisami Kuwahara, Rumiko Kajihara, Akifumi S. Tanabe, Daisuke Fujita
Journal of Applied Phycology, 31, 4, 2743, 2753, Springer Science and Business Media {LLC}, 2019年08月12日, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者]
研究論文(学術雑誌) - Is the red alga Meristotheca papulosa annual?―Monitoring of tagged thalli at Banda, Tateyama, Central Pacific coast of Japan―
Boryuan Chen, Shingo Akita, Akita Uehara, Daisuke Fujita
Aquaculture Science, 67, 1, 49‐56, 2019年03月, [査読有り]
英語 - Seasonal changes in taxon richness and abundance of mobile invertebrates inhabiting holdfast of annual kelp Ecklonia radicosa (Phaeophyceae, Lessoniaceae) at the central Pacific coast of Japan
Shingo Akita, Hirokazu Yamada, Madoka Ito, Daisuke Fujita
Phycological Research, 67, 51, 58, Wiley, 2019年01月, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者]
研究論文(学術雑誌) - Development of 11 Ecklonia radicosa (Phaeophyceae, Laminariales) SSRs markers using next-generation sequencing and intra-genus amplification analysis
Shingo Akita, Keiichiro Koiwai, Takeaki Hanyuda, Syou Kato, Reiko Nozaki, Tsubasa Uchino, Takashi Sakamoto, Hidehiro Kondo, Ikuo Hirono, Daisuke Fujita
Journal of Applied Phycology, 30, 3, 2111, 2115, Springer Netherlands, 2018年06月01日, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), Polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers of Ecklonia radicosa were developed using Illumina MiSeq next-generation sequencing (NGS) analysis. In total, 3112 SSRs (di- to hexanucleotide motifs repeated more than six times) were identified from 61.5-Mb assembled genomic DNA using MISA perl script. Among the SSRs, di- (853 loci, 27.4%) and trinucleotides (1813 loci, 58.3%) were dominant, while tetra- (172 loci, 5.5%), penta- (175 loci, 5.6%), and hexanucleotides (99 loci, 3.2%) were not common. After specific amplification and polymorphic tests of 75 selected loci (tri- to hexanucleotide motifs repeated more than eight times), 11 SSR markers (Eradic01–11) were successfully developed. The range of the number of alleles, observed heterozygosity, and expected heterozygosity in the 11 markers was 3–13, 0.200–0.683, and 0.258–0.864, respectively. Polymorphic information content (PIC) analysis indicated that eight markers (Eradic01, 02, 04, 05, 06, 08, 09, and 11) were highly informative (PIC >
0.5) and the other three were reasonably informative (0.5 <
PIC <
0.25). In addition, intra-genus amplification was obtained in all markers except for Eradic02, 08, and 11. These markers could help to reveal the genetic diversity and population structure of E. radicosa., 27024358 - Phenology of Chondracanthus tenellus (Rhodophyta) in the central Pacific coast of Honshu, Japan
Yuhi Hayakawa, Kenta Kawata, Kazuma Machida, Shunro Yamano, Shingo Akita, Daisuke Fujita
JOURNAL OF APPLIED PHYCOLOGY, 29, 5, 2547, 2556, SPRINGER, 2017年12月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), This study reports variations in thallus size, density, and reproductive phenology in a natural population of underutilized seaweed, Chondracanthus tenellus, at Tateyama in the Pacific coast of Japan from August 2014 to October 2016. Growth was monitored by measuring the length and weight of thalli. In addition, a number of thalli fouled by spirobids, coralline, and/or fleshy epiphyte and/or grazing marks were also recorded from February 2015 to October 2016. Density was monitored by counting the number of clumps along a subtidal fixed line of 30 m long (3-4 m in depth). Reproductive efforts were evaluated by counting the number of cystocarps per thallus and carpospores per cystocarp. Average thallus length sharply dropped in October and gradually increased from November to record the maximum length (73.5 +/- 2.7 mm) in April 2016. After the season, thalli were damaged by epiphytic algae, spirobids, and bite marks with increase in temperature. It was suggested that high temperature and low nutrition in summer probably induce weakening of thallus and promote fouling by spirobids and epiphyte which accelerate depletion of C. tenellus together with herbivorous animals. Although the population showed a large gametophytic dominance, carposporic gametophytes were found in August to September and May to July with the highest value (20.6%) in September. Maturation of gametophytes probably was induced by long day length or a transition from short to long day. Number of carpospores per cystocarp was 72 +/- 15 x 103 in January. Considering the size and cleanliness of thallus, it is preferable to harvest in April. - Use of fertilized molten slags to create Sargassum forests in subtropical shallow waters
Daisuke Fujita, Rai Ma, Shingo Akita, Miki Kobayashi, Yuhi Hayakawa, Toshihiro Miyatani, Yuji Seki, Yasuhiro Yamahira
JOURNAL OF APPLIED PHYCOLOGY, 29, 5, 2667, 2674, SPRINGER, 2017年12月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), Recently, a solid fertilizer with condensed nutrients was manufactured using molten slag from municipal solid waste and dried cow dung. This novel substratum was used for the afforestation of Sargassum alternato-pinnatum Yamada in the subtropical Amami Ohshima Island since 2010. Seedlings were attached to discoidal, fertilized, molten slag (DFMS) blocks by hanging fertile thalli within a cage unit (4 m(3)), deployed at a depth of 4-5 m from March to April. The attached germlings grew rapidly from November and thalli of a total length of > 1 m filled the cage by the next reproductive period the following year. Water temperature varied between 17.6 and 31.9 A degrees C in 2013-2014; the water was oligotrophic (i.e., nitrogen-deficient). To measure the nutrients liberated from the DFMS blocks (28 x 5 cm; diameter x width), a batch experiment (N = 3) was undertaken using 15-L seawater plastic containers with weekly water exchange. High concentrations of NH4-N (16.3-90.0 mu mol L-1) and SiO2-Si (5.9-256.9 mu mol L-1) exuded out of the blocks for a period of 3 months and lower concentrations exuded for another 3 months, even after the block was dried for 7 months. To clarify the fertilizer effects of exudates from the DFMS blocks on algae, S. alternato-pinnatum juveniles (0.7 g) were cultured in 300-mL flasks for 1 month. The juveniles produced new leaves and increased in weight in both enriched seawater and control treatments, but the color of the thallus was darker than normal. To visualize the effects more clearly, introduction of the yellowed (nitrogen-starved) thalli of the red alga, Chondracanthus intermedius, was useful because the color of its thallus turns red under enriched conditions. - 静岡県沼津市平沢地先におけるアントクメのフロロタンニン含量 : 藻体部位による違いと季節変化
秋田 晋吾, 山田 博一, 伊藤 円, 藤田 大介
藻類 = The Japanese journal of phycology, 65, 2, 91, 95, 日本藻類学会, 2017年07月, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者]
日本語 - A New Marine Tube-Dwelling Diatom Parlibellus latirostris (Bacillariophyceae) from Japan (創刊100周年記念号)
鈴木 秀和, 宮内 麻由美, 秋田 晋吾, 南雲 保, 田中 次郎
植物研究雑誌 = The journal of Japanese botany, 91, 0, 355, 363, ツムラ, 2016年12月, [査読有り]
英語 - Sorus formation on the holdfast haptera of the kelp Ecklonia radicosa (Phaeophyceae, Laminariales)
Shingo Akita, Hirokazu Yamada, Madoka Ito, Michael H. Graham, Daisuke Fujita
BOTANICA MARINA, 59, 6, 433, 438, WALTER DE GRUYTER GMBH, 2016年12月, [査読有り], [筆頭著者, 責任著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), Kelps usually form sori on their vegetative blades or sporophylls, and occasionally on stipes, with a notable exception being the primitive kelp Aureophycus aleuticus (Aureophycaceae), which forms sori on its discoid (haptera-free) holdfast. Here we reveal sorus formation on the holdfast (and blade and stipe) of the warm temperate annual kelp Ecklonia radicosa (Lessoniaceae), whose holdfast is formed by haptera, as is typical of the Laminariales. Surprisingly, hapteral sori continued to release zoospores until December, following blade loss in October. Such production of sori on holdfasts may be advantageous for surviving higher water temperatures and grazing pressure in warm temperate waters. - 磯焼け対策 静岡県のガンガゼ優占域におけるガラモ場の回復と拡大―瀬切りと中層網の利用―
山田博一, 伊藤円, 秋田晋吾, 藤田大介
月刊海洋, 47, 7, 323, 328, 2015年07月01日
日本語 - Phenology of annual kelp Eckloniopsis (Phaeophyceae, Laminariales) forest on a Diadema barren in Uchiura Bay, Central Pacific Coast of Honshu, Japan
Shingo Akita, Hirokazu Yamada, Madoka Ito, Miki Kobayashi, Daisuke Fujita
JOURNAL OF APPLIED PHYCOLOGY, 26, 2, 1141, 1148, SPRINGER, 2014年04月, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), On the southern coast of Uchiura Bay, central Pacific, Japan, Diadema barrens have expanded since the 1980s but Eckloniopsis radicosa (annual kelp endemic to Japan) has remained in deeper waters (> 10 m in depth). Phenology of the kelp was studied on isolated boulders from December 2011 for a year. Young sporophytes appeared in December and rapid growth from April brought the maximum blade length (83.3 +/- 13.9 cm) and width (56.8 +/- 12.7 cm) and standing crop (7.4 kg m(-2)) in May and June, respectively. Sorus formation began in June and spore release occurred from July to September. Blade length decreased from August and disappeared in November though holdfast remained. The unique holdfast-like spiny ball was found to provide habitats for mobile animals; its forests have an important role to maintain the biodiversity on barrens. During the period, water temperature was between 14.6 and 27.8 A degrees C, salinity was stable around 34-35 aEuro degrees, and nutrients were never depleted. Tolerance to large and frequent fluctuation of water temperature (7 A degrees C in a day), rapid growth in winter to spring, and occurrence on limited boulders in soft substrata may be the reasons for the success in the maintenance of its forest in Diadema barrens. - Are there any top-down controls in Diadema barrens in the warm temperate Pacific coasts of Japan?
Shingo Akita
CAHIERS DE BIOLOGIE MARINE, 54, 4, 615, 624, 2013年, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Predation on the black sea urchin, Diadema, by the striped beakfish, Oplegnathus fasciatus, has been witnessed by divers. The sea urchin is also used as bait to angle the fish in Japan. Surrounding the Izu peninsula, barrens caused by a high density of Diadema are restricted to the southern coast of Uchiura Bay in the northwest of the peninsula, while O. fasciatus is limited in population size and occurs only seasonally in this region. The possibility of a top-down control on Diadema by O. fasciatus is discussed by conducting field observations and feeding experiments in tanks in parallel with a review of the spatial and temporal distribution of these species. The fish O. fasciatus, the hermit Dardanus crassimanus, and the sea star Coscinasterias acutispina were found to feed on Diadema juveniles. Among them, O. fasciatus is the only species that can voraciously consume juveniles (>80 juveniles/day by only a single fish) and prey on larger sea urchins (when their long spines are partially removed). However, predation by fish may not be critical for Diadema populations because of the cryptic nature of sea urchin recruits, their effective armor (with long spines) in adults, variations in appetite among the fishes, and the seasonality and limited size of the fish at the study site.
その他活動・業績
- 函館市志海苔海岸に漂着した褐藻ツルアラメ
如澤 侑汰, 川越 力, 秋田 晋吾, 藻類, 72, 175, 176, 2024年11月, [査読有り], [最終著者, 責任著者]
日本語 - 神奈川県小網代干潟における絶滅危惧種紅藻アサクサノリの生育
菊地 則雄, 山田 和彦, 江良 弘光, 秋田 晋吾, 嶌田 智, 観音崎自然博物館研究報告 たたらはま, 24, 6, 11, 2020年12月 - カジメ類の分類学的再検討
秋田晋吾, 海藻資源, 45, 2020年 - 藻類学最前線 藻場の遺伝的多様性研究:現状と今後の展望
秋田晋吾, 藻類, 66, 3, 165‐168, 2018年11月, [査読有り], [招待有り], [筆頭著者, 最終著者, 責任著者]
日本語 - 磯根漁業に関する研究 5 回復したガラモ場の状況調査
山田博一, 伊藤円, 白井邦博, 藤田大介, 秋田晋吾, 佐々木昭, 飯田直樹, 静岡県水産技術研究所事業報告, 2014, 108, 2016年03月10日
日本語 - 地域の海藻食材(5)アントクメ
秋田晋吾, 藤田大介, 海藻資源, 34, 35, 36, 2015年08月, [招待有り] - 海中林復元に関する研究 1 ガラモ場生態系回復研究
山田博一, 伊藤円, 白井邦博, 藤田大介, 秋田晋吾, 飯田直樹, 佐々木昭, 静岡県水産技術研究所事業報告, 2013, 95, 96, 2015年06月30日
日本語 - 海中林復元に関する研究 1 ガラモ場生態系回復研究
山田博一, 海野幸雄, 伊藤円, 飯沼紀雄, 白井邦博, 藤田大介, 秋田晋吾, 山田照義, 佐々木昭, 静岡県水産技術研究所事業報告, 2012, 98, 99, 2014年03月01日
日本語
講演・口頭発表等
- 褐藻マコンブ配偶体の成熟誘導に関する研究
中澤 祐人, 鶴亀 里咲, 秋田 晋吾, 神尾 道也, 鈴木 秀和, 神谷 充伸
日本藻類学会第49 回大会, 2025年03月23日, 日本語, 口頭発表(一般) - マコンブとその変種における分類学的再検討
地崎 賢汰, 細山 裕生, 川越 力, 藤田 大介, 秋田 晋吾
日本藻類学会第49 回大会, 2025年03月23日, 日本語, 口頭発表(一般)
46988525 - 褐藻ネジモク類の腊葉標本を用いた系統解析
如澤 侑汰, 岩崎 貴也, 小亀 一弘, 北山 太樹, 島袋 寛盛, 嶌田 智, 白澤 健太, 秋田 晋吾
日本藻類学会第49 回大会, 2025年03月23日, 日本語, 口頭発表(一般) - 分布北限域のヒジキの季節消長
南口 蒼太, 如澤 侑汰, 日吉 海斗, 古里 匡志朗, 地崎 賢汰, 秋田 晋吾
2025年03月22日, 日本語, 口頭発表(一般) - 生石灰(CaO)を用いたウニ駆除が海藻に与える影響
八尾 風太, 古里 匡志朗, 秋田 晋吾
日本藻類学会第49 回大会, 2025年03月22日, 日本語, 口頭発表(一般) - マコンブとミツイシコンブにおける自然交雑個体の初報告
地崎 賢汰, 如澤 侑汰, 南口 蒼太, 秋田 晋吾
日本藻類学会第49 回大会, 2025年03月22日, 日本語, 口頭発表(一般)
46988525 - 北海道函館市戸井小安地先の囲い礁におけるウニ 除去による藻場回復の可能性
古里 匡志朗, 川越 力, 秋田 晋吾
日本藻類学会第49 回大会, 2025年03月22日, 日本語, 口頭発表(一般) - 天然コンブ藻場の回復を目指した取り組み
秋田晋吾, 古里匡志朗, 水田浩之
海藻活用研究会シンポジウム, 2025年02月21日, 日本語, 口頭発表(招待・特別)
[招待講演] - Sustainable food production system based on regenerative fisheries
Shingo Akita
14th Joint International Symposium on Food Science and Technology, 2024年11月21日, 英語, 口頭発表(基調)
[招待講演] - 身近なようでほとんど知らない昆布の生物学・ 昆布博士への第一歩
農林水産省 食育イベント1.~昆布がよろコブと地球もよろコブ!昆布からサステナブルな未来を!~食育セミナー(北海道農政事務所管内), 2024年11月10日, 日本語, 公開講演,セミナー,チュートリアル,講習,講義等
[招待講演] - 函館港内第三防砂堤防における海藻相と過去の調査との比較
秋田 晋吾, 地崎 賢汰, 古里 匡志朗, 南口 蒼太, 如澤 侑汰, 細山 裕生, 日吉 海斗
日本藻類学会第 48 回大会, 2024年03月23日, 日本語 - 局所スケールの遺伝的プロフィールに基づく褐藻ヒジキの再生産様式の解明
南口 蒼太, 如澤 侑汰, 日吉 海斗, 秋田 晋吾
日本藻類学会第 48 回大会, 2024年03月22日, 日本語
43881958 - 北海道北斗市葛登支岬における紅藻ヒラムカデの形態の季節的変化
日吉 海斗, 如澤 侑汰, 南口 蒼太, 秋田 晋吾
日本藻類学会第 48 回大会, 2024年03月22日, 日本語 - 北海道北斗市葛登支岬におけるエゾノネジモクおよびヨレモクの形態の季節変化と差異
如澤 侑汰, 南口 蒼太, 日吉 海斗, 秋田 晋吾
日本藻類学会第 48 回大会, 2024年03月22日, 日本語
27024356 - 函館市戸井小安地先における持続的な藻場の造成と管理指標の検討
古里 匡志朗, 川越 力, 秋田 晋吾
日本藻類学会第 48 回大会, 2024年03月22日, 日本語 - 本邦沿岸におけるマコンブの遺伝的地域性および国内移入の検出
地崎 賢汰, 川越 力, 水田 浩之, 藤田 大介, 秋田 晋吾
日本藻類学会第 48 回大会, 2024年03月22日, 日本語
37112849 - 褐藻マコンブ配偶体の成熟誘導に関する研究
中澤 祐人, 鶴亀 里咲, 秋田 晋吾, 鈴木 秀和, 神谷 充伸
日本藻類学会第 48 回大会, 2024年03月22日, 日本語 - 日本沿岸のコンブ目海藻と近年の藻場の衰退
秋田晋吾, 古里匡志朗
2023 年度日本付着生物学会ミニシンポジウム, 2023年10月16日, 日本語, シンポジウム・ワークショップパネル(指名)
2023年10月16日 - 2023年10月16日, [招待講演] - Taxonomic study on canopy-forming laminarialean kelp species in Japan
Shingo Akita
1st Jeju International Island Symposium, 2023年08月30日, 英語, シンポジウム・ワークショップパネル(指名)
2023年08月30日 - 2023年09月01日, 37112849, [招待講演] - 北斗市葛登支岬の平磯におけるヒジキ Sargassum fusiforme の集団遺伝学的研究
南口 蒼太, 地崎 賢汰, 古里 匡志郎, 前田 菜津, 羽生田 岳昭, 秋田 晋吾
日本藻類学会第47回大会, 2023年03月21日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年03月20日 - 2023年03月23日 - 褐藻ホンダワラ類の分子系統解析
リチャードソン 萌, 島袋 寛盛, 秋田 晋吾, 羽生 田 岳昭, 嶌田 智
日本藻類学会第47回大会, 2023年03月22日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年03月20日 - 2023年03月22日 - ドローンを用いた常磐海域漁港におけるコンブ植生の確認
黒丸 駿太郎, 藤田 大介, 秋田 晋吾
日本藻類学会第47回大会, 2023年03月22日, 日本語, ポスター発表
2023年03月20日 - 2023年03月22日 - 函館市戸井小安地先の囲い礁におけるウニ除去に 伴う海藻植生変化とコンブ藻場回復の試み
古里 匡志朗, 川越 力, 秋田 晋吾
日本藻類学会第47回大会, 2023年03月22日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年03月20日 - 2023年03月22日 - マコンブ Saccharina japonica の南限個体群に着 目した系統地理学的解析
地崎 賢汰, 川越 力, 藤田 大介, 秋田 晋吾
日本藻類学会第47回大会, 2023年03月21日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年03月20日 - 2023年03月22日, 37112849 - 常磐沿岸におけるコンブの生育状況
藤田大介, 黒丸駿太郎, 地崎賢太, 秋田晋吾, 小杉知佳, 廣瀬 充, 藤田恒雄
日本水産学会第20回大会, 2022年12月 - 褐藻コンブ目の雌性配偶体の卵形成における至適光環境
鶴亀里咲, 秋田晋吾, 嶌田智
日本生態学会大会講演要旨(Web), 2022年
2022年 - 2022年 - 褐藻アラメの高水温耐性
大竹佑衣, 秋田晋吾, 秋田晋吾, 嶌田智
藻類, 2022年
2022年 - 2022年 - 褐藻アラメ属およびカジメ属の雌性配偶体の卵形成における至適光環境の共通性
鶴亀里咲, 秋田晋吾, 秋田晋吾, 嶌田智
藻類, 2022年
2022年 - 2022年 - 館山市坂田地先における褐藻トゲモクの季節的消長
竹内日向子, 秋田晋吾, 秋田晋吾, 嶌田智
藻類, 2022年
2022年 - 2022年 - 静岡県下田市志太ヶ浦におけるアラメ・カジメ藻場の長期変化,特に最近の顕著な藻場衰退について
倉島彰, 青木優和, 秋田晋吾, 神谷充伸, 坂西芳彦, 鈴木はるか, 田中次郎, 渡邉裕基
藻類, 2022年
2022年 - 2022年 - 褐藻の網羅的ゲノム解析プロジェクトPhaeoexplorerと32核シングルコピー遺伝子に基づく系統解析
川井浩史, 秋田晋吾, 秋田晋吾, VIEIRA C., 羽生田岳昭, ROUSSEAU F., CRUAUD C., COULOUX A., HEESCH S., COCK J. M.
藻類, 2022年
2022年 - 2022年 - 海中林構成種の保全に向けた基礎研究
千村佳那子, 大竹佑衣, 秋田晋吾, 秋田晋吾, 嶌田智
藻類, 2022年
2022年 - 2022年 - 褐藻アラメ属,カジメ属の配偶体保存株の成熟誘導
鶴亀里咲, 秋田晋吾, 嶌田智
日本藻類学会第45回大会, 2021年03月15日
2021年03月14日 - 2021年03月16日 - NBRP藻類第4期2019年度の活動紹介
山口晴代, 鈴木重勝, 川井浩史, 羽生田岳昭, 秋田晋吾, 小亀一弘, 山口愛果, 河地正伸
日本藻類学会第44回大会, 2020年
2020年 - 2020年 - 日本産褐藻カジメ属における種間交雑体の発見
秋田晋吾, 秋田晋吾, 羽生田岳昭, 小祝敬一郎, 近藤秀裕, 廣野育生, 坂本崇, 清本節夫, 吉村拓, 加藤葉, 石川達也, 倉島彰, 藤田大介, 川井浩史
藻類, 2019年03月10日, 日本語
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担当経験のある科目_授業
- 潜水調査実習(分担)
北海道大学水産学部
2024年 - 現在 - 海洋生物資源科学実験(分担)
北海道大学水産学部
2023年 - 現在 - 海洋生物学I(分担)
北海道大学水産学部
2023年 - 現在 - 水産科学汎論 I(分担)
北海道大学大学院水産科学研究院
2022年 - 現在 - 環境と人間(分担)
北海道大学水産学部
2022年 - 現在 - 海洋生物科学実験(分担)
北海道大学水産学部
2022年 - 現在 - 水圏生物科学実習(分担)
北海道大学水産学部
2022年 - 現在 - 水産資源各論(分担)
北海道大学水産学部
2022年 - 現在 - 野外巡検(分担)
北海道大学水産学部
2022年 - 現在 - 海藻学(主担)
北海道大学水産学部
2022年 - 現在 - 水圏生物学(分担)
北海道大学水産学部
2022年 - 現在
共同研究・競争的資金等の研究課題
- 海藻マコンブ類の分類学的再検討および種内系統判定マーカーの開発
科学研究費助成事業
2024年04月01日 - 2027年03月31日
秋田 晋吾
日本学術振興会, 若手研究, 北海道大学, 24K17948 - 本州太平洋岸分布南限域におけるコンブの生態及び遺伝学的多様性の解明
科学研究費助成事業 基盤研究(C)
2022年04月 - 2025年03月
藤田 大介・秋田晋吾
日本学術振興会, 基盤研究(C), 東京海洋大学, 研究分担者, 22K05781 - 遺伝的多様性が藻場の維持機能に与える影響の解明
科学研究費助成事業 特別研究員奨励費
2020年04月24日 - 2023年03月31日
秋田 晋吾
今年度も感染症により臨海実験所の長期滞在による利用が制限されたため,実験室を主とした研究を進めることとした。前年度に単離し遺伝子型を決定したカジメの配偶体を使用して,掛け合わせる配偶体の個体数による配偶体の成熟率の違いを調べた。雄性配偶体1個体と雌性配偶体1個体と掛け合わせたものから雌雄の配偶体を4個体ずつにまで増やし,4つの実験区(♂1個体x ♀1個体,♂2個体x ♀2個体,♂3個体x ♀3個体,♂4個体x ♀4個体)を設けた。なお,実験には遺伝子型の異なる配偶体を使用し,成熟の有無については顕微鏡下で判断しやすい雌性配偶体の卵形成で評価した。雌雄の配偶体を混合した後,1週間後に卵形成の有無を各区30個体ずつ調べると,どの実験区においても卵を形成した雌性配偶体の割合は80%前後で,明確な差はないことがわかった。また,母藻による配偶体の生長速度についても調べるために,胞子体を6つ使用し,それぞれの配偶体の細胞数の変化を5日毎に計数した。その結果,どの胞子体に由来しても配偶体の細胞数は2から3個程度で,配偶体の生長速度についても親個体の違いがほとんど影響しないことがわかった。幼胞子体の生長を比較にむけて胞子体を培養している最中にあったが,就職に伴い本年度の半ばで特別研究員の資格を辞退することとなった。
日本学術振興会, 特別研究員奨励費, お茶の水女子大学, 20J01345 - 遺伝子多様度解析を用いたアントクメ個体群消滅危険性の予測
科学研究費助成事業 特別研究員奨励費
2015年04月24日 - 2018年03月31日
秋田 晋吾
本課題では,遺伝子多様度の高い個体群が環境変異や物理的撹乱に強いことに着目し,海藻類の個体群である藻場における遺伝子多様度を解明することで,磯焼けの発生リスクが高い個体群を検出できるか調べた。平成29年度は,平成27年度に採集した個体と平成28年度に開発したマイクロサテライトマーカーを用いて,1)集団遺伝解析および2)遺伝子多様度解析を行った。
1)集団遺伝解析
平成28年度に実施した系統地理解析の結果を検証するために,11個のマイクロサテライトマーカーを用いて集団遺伝解析を行った。その結果,アントクメの遺伝集団は九州西岸と太平洋岸の2グループ,もしくは,伊豆大島,平沢,仁科,早田浦,土佐清水,串木野,長島,野母崎,新三重および原島と嫦娥崎の10グループに分かれると推定された。この結果は前年度に実施した系統地理解析を支持し,各地の個体群は遺伝的に大きく離れており,本種の分散能力は低いことが示唆された。
2)遺伝子多様度解析
各地の個体群において,検出されたアレルの数(Na: 最小の個体群に補正),ヘテロ接合度の観察値(Ho)と期待値(He),近交係数(Fis)およびアレル共有度(Psaxy)を求めた。これらの指数のうち近交係数(Fis)は,嫦娥崎,原島,新三重,野母崎,串木野,土佐清水および仁科で低く,長島,早田浦,伊豆大島および平沢で高いことが確認された。各地の生育状況から,アントクメの個体群は,拡大(嫦娥崎,原島),安定(長島,早田浦,伊豆大島および平沢)および縮小(新三重,野母崎)の3段階に分けられ,Fisと比較すると,大きな変動を示す個体群でFisが低く,Fisは個体群の現状を示す指標となり得ることが示された。
日本学術振興会, 特別研究員奨励費, 東京海洋大学, 15J11734