田村 友和 (タムラ トモカズ)
医学研究院 病理系部門 微生物学免疫学分野 | 講師 |
One Healthリサーチセンター | 講師 |
創成研究機構ワクチン研究開発拠点 | 講師 |
高等教育推進機構 | 講師 |
Last Updated :2024/12/07
■研究者基本情報
Researchmap個人ページ
J-Global ID
■経歴
経歴
- 2024年04月 - 現在
国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 難病・免疫ゲノム研究センター, 客員研究員, 日本国 - 2024年01月 - 現在
北海道大学, One Health リサーチセンター, 講師, 日本国 - 2024年01月 - 現在
北海道大学, 創成研究機構ワクチン開発拠点, 講師, 日本国 - 2024年01月 - 現在
北海道大学, 大学院医学院, 講師, 日本国 - 2024年01月 - 現在
北海道大学, 医学部, 講師, 日本国 - 2024年01月 - 現在
北海道大学, 大学院医学研究院, 講師, 日本国 - 2023年10月 - 現在
九州大学, 医学部, 非常勤講師, 日本国 - 2023年05月 - 現在
北海道大学, 遺伝子病制御研究所, ビジティングフェロー, 日本国 - 2022年12月 - 現在
北海道大学, 人獣共通感染症国際共同研究所, 客員研究員 - 2024年01月 - 2024年03月
北海道大学, 高等教育推進機構, 講師, 日本国 - 2023年10月 - 2023年12月
北海道大学, One Health リサーチセンター, 助教, 日本国 - 2023年04月 - 2023年12月
北海道大学, 高等教育推進機構, 助教 - 2023年04月 - 2023年12月
北海道大学, 創成研究機構ワクチン開発拠点, 助教 - 2022年01月 - 2023年12月
北海道大学, 医学部, 助教, 日本国 - 2022年01月 - 2023年12月
北海道大学, 大学院医学研究院, 助教, 日本国 - 2021年01月 - 2023年12月
北海道大学, 大学院医学院, 助教, 日本国 - 2020年10月 - 2022年09月
ボストン大学, 医学校, 客員研究員, アメリカ合衆国 - 2020年02月 - 2021年12月
独立行政法人日本学術振興会, 海外特別研究員 - 2019年08月 - 2021年12月
ニュージャージー州立ラトガース大学, 医学校, 客員研究員, アメリカ合衆国 - 2019年03月 - 2021年12月
プリンストン大学, 分子生物学部, ポストドクトラルリサーチフェロー, アメリカ合衆国 - 2016年04月 - 2019年03月
独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員PD, 日本国 - 2015年10月 - 2019年03月
大阪大学, 微生物病研究所 感染機構研究部門, 学振特別研究員, 日本国 - 2015年10月 - 2016年03月
独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員PD, 日本国 - 2013年04月 - 2015年09月
独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員DC1, 日本国 - 2014年08月 - 2014年08月
国際獣疫事務局東南アジア事務局, 研修生(出向), タイ王国 - 2013年10月 - 2013年12月
スイス国立ウイルス学・免疫学研究所, 客員研究員, スイス連邦
■研究活動情報
受賞
- 2024年10月, 公益財団法人日本農学会, 第23回日本農学進歩賞
プラス鎖RNAウイルス感染症の病態解析及び制御法に関する研究
田村友和 - 2024年09月, 第10回北大・部局横断シンポジウム実行委員会, 第10回北海道大学部局横断シンポジウム研究助成採択・奨励賞
非侵襲性にウイルスの生体での感染動態を高感度に解析できる実験基盤の開発
田村友和 - 2024年07月, 公益財団法人日本感染症医薬品協会, 第26回日本感染症医薬品協会奨励賞
免疫不全患者における抗コロナウイルス薬剤耐性株出現の分子機構と新規治療戦略の樹立に向けた基盤研究
田村友和 - 2024年03月, 日本ウイルス学会, 2024年度日本ウイルス学会杉浦奨励賞
プラス鎖RNAウイルスの病原性と組織指向性に関する研究
田村友和 - 2024年03月, 北海道大学大学院医学研究院・大学院医学院・医学部医学科, 令和5年度北海道大学大学院医学研究院・大学院医学院・医学部医学科「優秀論文賞」
Virological characteristics of the SARS-CoV-2 XBB variant derived from recombination of two Omicron subvariants
田村友和 - 2023年10月, 第9回北大・部局横断シンポジウム実行委員会, 第9回北海道大学部局横断シンポジウム研究助成採択・銅賞
フラビウイルスの感染細胞から分泌されるウイルス性糖タンパク質NS1の性状解析
田村友和, 43745011 - 2022年10月, 日本実験動物医学会・日本獣医学会, 第19回前島賞(2022-2023年度日本獣医学会学術集会優秀発表賞)
ヒト胎児肺を移植したヒト免疫マウスの作製とCOVID-19の病態解析への応用
田村友和 - 2021年, HCV2021 Organizing Committee, Young Investigator Grant
Tomokazu Tamura - 2021年, Pathogens, Pathogens 2021 Travel Awards
Tomokazu Tamura - 2018年12月, 上原記念生命科学財団, 平成30年度 海外留学助成リサーチフェローシップ
田村友和 - 2018年09月, 日本獣医学会, 2018-2019年度獣医学奨励賞(第89号)
フラビウイルス科ウイルスの病原性と宿主特異性に関する研究
田村友和 - 2017年, American Society for Virology, Postdoctoral Fellow travel grant
Tomokazu Tamura - 2016年10月, HCV2016 Organizing Committee, HCV2016 Fellowship
Tomokazu Tamura - 2016年09月, 日本獣医学会, JVMS優秀論文賞
Analysis of a pair of END+ and END− viruses derived from the same bovine viral diarrhea virus stock reveals the amino acid determinants in Npro responsible for inhibition of type I interferon production
Takashi Kozasa, Yuri Abe, Kazuya Mitsuhashi, Tomokazu Tamura, Hiroshi Aoki, Masatoshi Ishimaru, Shigeyuki Nakamura, Masatoshi Okamatsu, Hiroshi Kida, Yoshihiro Sakoda - 2015年11月, トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会, 第22回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会研究奨励賞
田村友和 - 2015年06月, The 7th International Symposium on Emerging and Re-emerging Pig Diseases 2015 Organizing Committee, Student Award
Tomokazu Tamura - 2014年09月, 北海道大学博士課程教育リーディングプログラム, Best Oral Presentation Award, The 2nd Sapporo Summer Senior for One Health
Tomokazu Tamura - 2014年09月, 日本獣医学会微生物学分科会, 第5回日本獣医学会微生物学分科会若手奨励賞
田村友和 - 2013年05月, 日本学生支援機構, 平成24年度特に優れた業績による奨学金返還免除(全額)
田村友和
論文
- A micro-disc-based multiplex method for monitoring emerging SARS-CoV-2 variants using the molecular diagnostic tool Intelli-OVI
Md Belal Hossain, Yoshikazu Uchiyama, Samiul Alam Rajib, Akhinur Rahman, Mitsuyoshi Takatori, Benjy Jek Yang Tan, Kenji Sugata, Mami Nagashima, Mamiyo Kawakami, Hitoshi Ito, Ryota Kumagai, Kenji Sadamasu, Yasuhiro Ogi, Tatsuya Kawaguchi, Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Masahiro Ono, Kazuhisa Yoshimura, Yorifumi Satou
Communications Medicine, 4, 1, Springer Science and Business Media LLC, 2024年08月09日, [査読有り]
研究論文(学術雑誌) - Virological characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron EG.5.1 variant
Shuhei Tsujino, Sayaka Deguchi, Tomo Nomai, Miguel Padilla-Blanco, Arnon Plianchaisuk, Lei Wang, MST Monira Begum, Keiya Uriu, Keita Mizuma, Naganori Na, Isshu Kojima, Tomoya Tsubo, Jingshu Li, Yasufumi Matsumura, Miki Nagao, Yoshitaka Oda, Masumi Tsuda, Yuki Anraku, Shunsuke Kita, Hisano Yajima, Kaori Sasaki-Taba, Ziyi Guo, Alfredo A Hinay Jr, Kumiko Yoshimatsu, Yuki Yamamoto, Tetsuharu Nagamoto, Hiroyuki Asakura, Mami Nagashima, Kenji Sadamasu, Kazuhisa Yoshimura, Hesham Nasser, Michael Jonatha, Olivia Putri, Yoonjin Kim, Luo Chen, Rigel Suzuki, Tomokazu Tamura, Katsumi Maenak, The Genotype to, Phenotype Japan, Japan) Consortium, Takashi Irie, Keita Matsun, Shinya Tanaka, Jumpei Ito, Terumasa Ikeda, Kazuo Takayama, Jiri Zahradnik, Takao Hashiguchi, Takasuke Fukuhar, Kei Sato
Microbiology and Immunology, 2024年06月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Virological characteristics of a SARS-CoV-2-related bat coronavirus, BANAL-20-236
Shigeru Fujita, Arnon Plianchaisuk, Sayaka Deguchi, Hayato Ito, Naganori Nao, Lei Wang, Hesham Nasser, Tomokazu Tamura, Izumi Kimura, Yukie Kashima, Rigel Suzuki, Saori Suzuki, Izumi Kida, Masumi Tsuda, Yoshitaka Oda, Rina Hashimoto, Yukio Watanabe, Keiya Uriu, Daichi Yamasoba, Ziyi Guo, Alfredo A Hinay Jr, Yusuke Kosugi, Luo Chen, Lin Pan, Yu Kaku, Hin Chu, Flora Donati, Sarah Temmam, Marc Eloi, Yuki Yamamoto, Tetsuharu Nagamoto, Hiroyuki Asakura, Mami Nagashima, Kenji Sadamasu, Kazuhisa Yoshimura, Yutaka Suzuki, The Genotype to Phenotype Japan, Japan) Consortium, Jumpei Ito, Terumasa Ikeda, Shinya Tanaka, Keita Matsuno, Takasuke Fukuhara, Kazuo Takayama, Kei Sato
eBioMedicine, 2024年05月19日, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌) - Generation of recombinant viruses directly from clinical specimens of COVID-19 patients
Hirotaka Yamamoto, Tomokazu Tamura, Takaya Ichikawa, Yudai Taguchi, Kento Mori, Satoshi Oguri, Rigel Suzuki, Saori Suzuki, Takanori Teshima, Takasuke Fukuhara
Journal of Clinical Microbiology, 2024年05月17日, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), 44405723 - Akaluc bioluminescence offers superior sensitivity to track in vivo dynamics of SARS-CoV-2 infection
Tomokazu Tamura, Hayato Ito, Shiho Torii, Lei Wang, Rigel Suzuki, Shuhei Tsujino, Akifumi Kamiyama, Yoshitaka Oda, Masumi Tsuda, Yuhei Morioka, Saori Suzuki, Kotaro Shirakawa, Kei Sato, Kumiko Yoshimatsu, Yoshiharu Matsuura, Satoshi Iwano, Shinya Tanaka, Takasuke Fukuhara
iScience, 109647, 109647, Elsevier BV, 2024年05月17日, [査読有り], [筆頭著者]
研究論文(学術雑誌), 44405723 - Involvement of SARS-CoV-2 accessory proteins in immunopathogenesis
Hayato Ito, Tomokazu Tamura, Lei Wang, Kento Mori, Masumi Tsuda, Rigel Suzuki, Saori Suzuki, Kumiko Yoshimatsu, Shinya Tanaka, Takasuke Fukuhara
Microbiology and Immunology, 2024年05月16日, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), 43966839 - Virological characteristics of the SARS-CoV-2 BA.2.86 variant.
Tomokazu Tamura, Keita Mizuma, Hesham Nasser, Sayaka Deguchi, Miguel Padilla-Blanco, Yoshitaka Oda, Keiya Uriu, Jarel E M Tolentino, Shuhei Tsujino, Rigel Suzuki, Isshu Kojima, Naganori Nao, Ryo Shimizu, Lei Wang, Masumi Tsuda, Michael Jonathan, Yusuke Kosugi, Ziyi Guo, Alfredo A Hinay Jr, Olivia Putri, Yoonjin Kim, Yuri L Tanaka, Hiroyuki Asakura, Mami Nagashima, Kenji Sadamasu, Kazuhisa Yoshimura, Akatsuki Saito, Jumpei Ito, Takashi Irie, Shinya Tanaka, Jiri Zahradnik, Terumasa Ikeda, Kazuo Takayama, Keita Matsuno, Takasuke Fukuhara, Kei Sato
Cell host & microbe, 32, 2, 170, 180, 2024年02月14日, [査読有り], [筆頭著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), In late 2023, several SARS-CoV-2 XBB descendants, notably EG.5.1, were predominant worldwide. However, a distinct SARS-CoV-2 lineage, the BA.2.86 variant, also emerged. BA.2.86 is phylogenetically distinct from other Omicron sublineages, accumulating over 30 amino acid mutations in its spike protein. Here, we examined the virological characteristics of the BA.2.86 variant. Our epidemic dynamics modeling suggested that the relative reproduction number of BA.2.86 is significantly higher than that of EG.5.1. Additionally, four clinically available antivirals were effective against BA.2.86. Although the fusogenicity of BA.2.86 spike is similar to that of the parental BA.2 spike, the intrinsic pathogenicity of BA.2.86 in hamsters was significantly lower than that of BA.2. Since the growth kinetics of BA.2.86 are significantly lower than those of BA.2 both in vitro and in vivo, the attenuated pathogenicity of BA.2.86 is likely due to its decreased replication capacity. These findings uncover the features of BA.2.86, providing insights for control and treatment. - A rapid and versatile reverse genetics approach for generating recombinant positive-strand RNA viruses that use IRES-mediated translation.
Tomokazu Tamura, Hirotaka Yamamoto, Saho Ogino, Yuhei Morioka, Shuhei Tsujino, Rigel Suzuki, Takahiro Hiono, Saori Suzuki, Norikazu Isoda, Yoshihiro Sakoda, Takasuke Fukuhara
Journal of virology, e0163823, 2024年02月14日, [査読有り], [筆頭著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Reverse genetics systems have played a central role in developing recombinant viruses for a wide spectrum of virus research. The circular polymerase extension reaction (CPER) method has been applied to studying positive-strand RNA viruses, allowing researchers to bypass molecular cloning of viral cDNA clones and thus leading to the rapid generation of recombinant viruses. However, thus far, the CPER protocol has only been established using cap-dependent RNA viruses. Here, we demonstrate that a modified version of the CPER method can be successfully applied to positive-strand RNA viruses that use cap-independent, internal ribosomal entry site (IRES)-mediated translation. As a proof-of-concept, we employed mammalian viruses with different types (classes I, II, and III) of IRES to optimize the CPER method. Using the hepatitis C virus (HCV, class III), we found that inclusion in the CPER assembly of an RNA polymerase I promoter and terminator, instead of those from polymerase II, allowed greater viral production. This approach was also successful in generating recombinant bovine viral diarrhea virus (class III) following transfection of MDBK/293T co-cultures to overcome low transfection efficiency. In addition, we successfully generated the recombinant viruses from clinical specimens. Our modified CPER could be used for producing hepatitis A virus (HAV, type I) as well as de novo generation of encephalomyocarditis virus (type II). Finally, we generated recombinant HCV and HAV reporter viruses that exhibited replication comparable to that of the wild-type parental viruses. The recombinant HAV reporter virus helped evaluate antivirals. Taking the findings together, this study offers methodological advances in virology.IMPORTANCEThe lack of versatility of reverse genetics systems remains a bottleneck in viral research. Especially when (re-)emerging viruses reach pandemic levels, rapid characterization and establishment of effective countermeasures using recombinant viruses are beneficial in disease control. Indeed, numerous studies have attempted to establish and improve the methods. The circular polymerase extension reaction (CPER) method has overcome major obstacles in generating recombinant viruses. However, this method has not yet been examined for positive-strand RNA viruses that use cap-independent, internal ribosome entry site-mediated translation. Here, we engineered a suitable gene cassette to expand the CPER method for all positive-strand RNA viruses. Furthermore, we overcame the difficulty of generating recombinant viruses because of low transfection efficiency. Using this modified method, we also successfully generated reporter viruses and recombinant viruses from a field sample without virus isolation. Taking these findings together, our adapted methodology is an innovative technology that could help advance virologic research. - The development of a rapid, high-throughput neutralization assay using a SARS-CoV-2 reporter.
Rigel Suzuki, Akifumi Kamiyama, Hayato Ito, Keita Kawashiro, Takahiro Tomiyama, Tomokazu Tamura, Saori Suzuki, Tomoharu Yoshizumi, Kiyohiko Hotta, Takasuke Fukuhara
Journal of virological methods, 326, 114894, 114894, 2024年02月13日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Many methods have been developed to measure the neutralizing capacity of antibodies to SARS-CoV-2. However, these methods are low throughput and can be difficult to quickly modify in response to emerging variants. Therefore, an experimental system for rapid and easy measurement of the neutralizing capacity of antibodies against various variants is needed. In this study, we developed an experimental system that can efficiently measure the neutralizing capacity of sera by using a GFP-carrying recombinant SARS-CoV-2 with spike proteins of multiple variants (B.1.1, BA.5, or XBB.1.5). For all 3 recombinant chimeric genomes generated, neutralizing antibody titers determined by measuring GFP fluorescence intensity correlated significantly with those calculated from viral RNA levels measured by RT-qPCR in the supernatant of infected cells. Furthermore, neutralizing antibody titers determined by visually assessing GFP fluorescence using microscopy were also significantly correlated with those determined by RT-qPCR. By using this high-throughput method, it is now possible to quickly and easily determine the neutralizing capacity of antibodies against SARS-CoV-2 variants. - Virological characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron XBB.1.5 variant.
Tomokazu Tamura, Takashi Irie, Sayaka Deguchi, Hisano Yajima, Masumi Tsuda, Hesham Nasser, Keita Mizuma, Arnon Plianchaisuk, Saori Suzuki, Keiya Uriu, Mst Monira Begum, Ryo Shimizu, Michael Jonathan, Rigel Suzuki, Takashi Kondo, Hayato Ito, Akifumi Kamiyama, Kumiko Yoshimatsu, Maya Shofa, Rina Hashimoto, Yuki Anraku, Kanako Terakado Kimura, Shunsuke Kita, Jiei Sasaki, Kaori Sasaki-Tabata, Katsumi Maenaka, Naganori Nao, Lei Wang, Yoshitaka Oda, Terumasa Ikeda, Akatsuki Saito, Keita Matsuno, Jumpei Ito, Shinya Tanaka, Kei Sato, Takao Hashiguchi, Kazuo Takayama, Takasuke Fukuhara
Nature communications, 15, 1, 1176, 1176, 2024年02月08日, [査読有り], [筆頭著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Circulation of SARS-CoV-2 Omicron XBB has resulted in the emergence of XBB.1.5, a new Variant of Interest. Our phylogenetic analysis suggests that XBB.1.5 evolved from XBB.1 by acquiring the S486P spike (S) mutation, subsequent to the acquisition of a nonsense mutation in ORF8. Neutralization assays showed similar abilities of immune escape between XBB.1.5 and XBB.1. We determine the structural basis for the interaction between human ACE2 and the S protein of XBB.1.5, showing similar overall structures between the S proteins of XBB.1 and XBB.1.5. We provide the intrinsic pathogenicity of XBB.1 and XBB.1.5 in hamsters. Importantly, we find that the ORF8 nonsense mutation of XBB.1.5 resulted in impairment of MHC suppression. In vivo experiments using recombinant viruses reveal that the XBB.1.5 mutations are involved with reduced virulence of XBB.1.5. Together, our study identifies the two viral functions defined the difference between XBB.1 and XBB.1.5. - Determination of the factors responsible for the tropism of SARS-CoV-2-related bat coronaviruses to Rhinolophus bat ACE2
Shigeru Fujita, Yusuke Kosugi, Izumi Kimura, Kenzo Tokunaga, Jumpei Ito, Kei Sato, Keita Matsuno, Naganori Nao, Hirofumi Sawa, Shinya Tanaka, Masumi Tsuda, Lei Wang, Yoshikata Oda, Zannatul Ferdous, Kenji Shishido, Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Rigel Suzuki, Saori Suzuki, Hayato Ito, Yu Kaku, Naoko Misawa, Arnon Plianchaisuk, Ziyi Guo, Alfredo A. Hinay, Keiya Uriu, Jarel Elgin M. Tolentino, Luo Chen, Lin Pan, Mai Suganami, Mika Chiba, Ryo Yoshimura, Kyoko Yasuda, Keiko Iida, Naomi Ohsumi, Adam P. Strange, Shiho Tanaka, Kazuhisa Yoshimura, Kenji Sadamasu, Mami Nagashima, Hiroyuki Asakura, Isao Yoshida, So Nakagawa, Akifumi Takaori-Kondo, Kayoko Nagata, Ryosuke Nomura, Yoshihito Horisawa, Yusuke Tashiro, Yugo Kawai, Kazuo Takayama, Rina Hashimoto, Sayaka Deguchi, Yukio Watanabe, Ayaka Sakamoto, Naoko Yasuhara, Takao Hashiguchi, Tateki Suzuki, Kanako Kimura, Jiei Sasaki, Yukari Nakajima, Hisano Yajima, Takashi Irie, Ryoko Kawabata, Kaori Tabata, Terumasa Ikeda, Hesham Nasser, Ryo Shimizu, M. S. T. Monira Begum, Michael Jonathan, Yuka Mugita, Otowa Takahashi, Kimiko Ichihara, Chihiro Motozono, Takamasa Ueno, Mako Toyoda, Akatsuki Saito, Maya Shofa, Yuki Shibatani, Tomoko Nishiuchi, Kotaro Shirakawa
Journal of Virology, 97, 10, American Society for Microbiology, 2023年10月31日, [査読有り]
研究論文(学術雑誌), ABSTRACT
Differences in host angiotensin converting enzyme 2 (ACE2) genes may affect the host range of SARS-CoV-2-related coronaviruses (SC2r-CoVs) and further determine the tropism of host ACE2 for the infection receptor. However, the factor(s) responsible for determining the host tropism of SC2r-CoVs, which may in part be determined by the tropism of host ACE2 usage, remains unclear. Here, we use the pseudoviruses with the spike proteins of two Laotian SC2r-CoVs, BANAL-20-236 and BANAL-20-52, and the cells expressing ACE2 proteins of eight different Rhinolophus bat species to show that these two spikes have different tropisms for Rhinolophus bat ACE2. Through structural analysis and cell culture experiments, we demonstrate that this tropism is determined by residue 493 of the spike and residues 31 and 35 of ACE2. Our results suggest that SC2r-CoVs exhibit differential ACE2 tropism, which may be driven by adaptation to different Rhinolophus bat ACE2 proteins.
IMPORTANCE
The efficiency of infection receptor use is the first step in determining the species tropism of viruses. After the coronavirus disease 2019 pandemic, a number of SARS-CoV-2-related coronaviruses (SC2r-CoVs) were identified in Rhinolophus bats, and some of them can use human angiotensin converting enzyme 2 (ACE2) for the infection receptor without acquiring additional mutations. This means that the potential of certain SC2r-CoVs to cause spillover from bats to humans is "off-the-shelf." However, both SC2r-CoVs and Rhinolophus bat species are highly diversified, and the host tropism of SC2r-CoVs remains unclear. Here, we focus on two Laotian SC2r-CoVs, BANAL-20-236 and BANAL-20-52, and determine how the tropism of SC2r-CoVs to Rhinolophus bat ACE2 is determined at the amino acid resolution level. - Prolonged shedding of viable SARS‐CoV‐2 in immunocompromised patients with haematological malignancies: A prospective study
Takaya Ichikawa, Tomokazu Tamura, Mutsumi Takahata, Takashi Ishio, Makoto Ibata, Ikumi Kasahara, Koichiro Minauchi, Satoshi Yamamoto, Takanori Teshima, Takasuke Fukuhara
British Journal of Haematology, 204, 3, 815, 820, Wiley, 2023年10月05日, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), Summary
Prolonged SARS‐CoV‐2 infection in immunocompromised individuals has been scattered, but the details remain unclear. We conducted a prospective study with 26 COVID‐19 patients with haematological malignancies to determine viral shedding kinetics and characteristics. We obtained nasopharyngeal swabs from the patients 21–28 days post‐onset for a PCR test and performed virus isolation from the PCR‐positive samples. A viable virus was detected in five patients (19.2%), all of whom had malignant lymphoma. Those patients had significantly lower CD4+ T‐cell counts than the PCR‐negative patients. A comparison of previous chemotherapy showed that anti‐CD20 antibodies and bendamustine may be risk factors for prolonged viral shedding. - Multiple mutations of SARS-CoV-2 Omicron BA.2 variant orchestrate its virological characteristics.
Izumi Kimura, Daichi Yamasoba, Hesham Nasser, Hayato Ito, Jiri Zahradnik, Jiaqi Wu, Shigeru Fujita, Keiya Uriu, Jiei Sasaki, Tomokazu Tamura, Rigel Suzuki, Sayaka Deguchi, Arnon Plianchaisuk, Kumiko Yoshimatsu, Yasuhiro Kazuma, Shuya Mitoma, Gideon Schreiber, Hiroyuki Asakura, Mami Nagashima, Kenji Sadamasu, Kazuhisa Yoshimura, Akifumi Takaori-Kondo, Jumpei Ito, Kotaro Shirakawa, Kazuo Takayama, Takashi Irie, Takao Hashiguchi, So Nakagawa, Takasuke Fukuhara, Akatsuki Saito, Terumasa Ikeda, Kei Sato
Journal of virology, e0101123, 2023年10月05日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Previous studies on the Omicron BA.2 variant suggested that the virological characteristics of BA.2 are determined by the mutations in at least two different regions of the viral genome: in the BA.2 spike gene (enhancing viral fusogenicity and intrinsic pathogenicity) and the non-spike region of the BA.2 genome (leading to intrinsic pathogenicity attenuation). However, the mutations modulating the BA.2 virological properties remain elusive. In this study, we demonstrated that the L371F substitution in the BA.2 spike protein confers greater fusogenicity and intrinsic pathogenicity. Furthermore, we revealed that multiple mutations downstream of the spike gene in the BA.2 genome are responsible for attenuating intrinsic viral pathogenicity and replication capacity. As mutations in the SARS-CoV-2 variant spike proteins could modulate certain virological properties, such as immune evasion and infectivity, most studies have previously focused on spike protein mutations. Our results underpin the importance of non-spike protein-related mutations in SARS-CoV-2 variants. IMPORTANCE Most studies investigating the characteristics of emerging SARS-CoV-2 variants have been focusing on mutations in the spike proteins that affect viral infectivity, fusogenicity, and pathogenicity. However, few studies have addressed how naturally occurring mutations in the non-spike regions of the SARS-CoV-2 genome impact virological properties. In this study, we proved that multiple SARS-CoV-2 Omicron BA.2 mutations, one in the spike protein and another downstream of the spike gene, orchestrally characterize this variant, shedding light on the importance of Omicron BA.2 mutations out of the spike protein. - Safety and immunogenicity of SARS-CoV-2 self-amplifying RNA vaccine expressing an anchored RBD: A randomized, observer-blind phase 1 study
Wataru Akahata, Takashi Sekida, Takuto Nogimori, Hirotaka Ode, Tomokazu Tamura, Kaoru Kono, Yoko Kazami, Ayaka Washizaki, Yuji Masuta, Rigel Suzuki, Kenta Matsuda, Mai Komori, Amber L. Morey, Keiko Ishimoto, Misako Nakata, Tomoko Hasunuma, Takasuke Fukuhara, Yasumasa Iwatani, Takuya Yamamoto, Jonathan F. Smith, Nobuaki Sato
Cell Reports Medicine, 4, 8, 101134, 101134, Elsevier BV, 2023年08月, [査読有り]
研究論文(学術雑誌) - Comparative pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron subvariants including BA.1, BA.2, and BA.5.
Tomokazu Tamura, Daichi Yamasoba, Yoshitaka Oda, Jumpei Ito, Tomoko Kamasaki, Naganori Nao, Rina Hashimoto, Yoichiro Fujioka, Rigel Suzuki, Lei Wang, Hayato Ito, Yukie Kashima, Izumi Kimura, Mai Kishimoto, Masumi Tsuda, Hirofumi Sawa, Kumiko Yoshimatsu, Yuki Yamamoto, Tetsuharu Nagamoto, Jun Kanamune, Yutaka Suzuki, Yusuke Ohba, Isao Yokota, Keita Matsuno, Kazuo Takayama, Shinya Tanaka, Kei Sato, Takasuke Fukuhara
Communications biology, 6, 1, 772, 772, NATURE PORTFOLIO, 2023年07月24日, [査読有り], [筆頭著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), The unremitting emergence of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) variants necessitates ongoing control measures. Given its rapid spread, the new Omicron subvariant BA.5 requires urgent characterization. Here, we comprehensively analyzed BA.5 with the other Omicron variants BA.1, BA.2, and ancestral B.1.1. Although in vitro growth kinetics of BA.5 was comparable among the Omicron subvariants, BA.5 was much more fusogenic than BA.1 and BA.2. Airway-on-a-chip analysis showed that, among Omicron subvariants, BA.5 had enhanced ability to disrupt the respiratory epithelial and endothelial barriers. Furthermore, in our hamster model, in vivo pathogenicity of BA.5 was slightly higher than that of the other Omicron variants and less than that of ancestral B.1.1. Notably, BA.5 gains efficient virus spread compared with BA.1 and BA.2, leading to prompt immune responses. Our findings suggest that BA.5 has low pathogenicity compared with the ancestral strain but enhanced virus spread /inflammation compared with earlier Omicron subvariants. - Impact of imprinted immunity induced by mRNA vaccination in an experimental animal model.
Shigeru Fujita, Keiya Uriu, Lin Pan, Naganori Nao, Koshiro Tabata, Mai Kishimoto, Yukari Itakura, Hirofumi Sawa, Izumi Kida, Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Jumpei Ito, Keita Matsuno, Kei Sato
The Journal of infectious diseases, OXFORD UNIV PRESS INC, 2023年06月27日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), The emergence of SARS-CoV-2 Omicron variants has led to concerns that ancestral SARS-CoV-2-based vaccines may not be effective against newly emerging Omicron subvariants. The concept of "imprinted immunity" suggests that individuals vaccinated with ancestral virus-based vaccines may not develop effective immunity against newly emerging Omicron subvariants, such as BQ.1.1 and XBB.1. Here, we investigated this possibility using hamsters. While natural infection induced effective antiviral immunity, breakthrough infections in hamsters with BQ.1.1 and XBB.1 Omicron subvariants after receiving the 3-dose mRNA-LNP vaccine resulted in only faintly induced humoral immunity, supporting the possibility of imprinted immunity. - saRNA vaccine expressing membrane-anchored RBD elicits broad and durable immunity against SARS-CoV-2 variants of concern.
Mai Komori, Takuto Nogimori, Amber L Morey, Takashi Sekida, Keiko Ishimoto, Matthew R Hassett, Yuji Masuta, Hirotaka Ode, Tomokazu Tamura, Rigel Suzuki, Jeff Alexander, Yasutoshi Kido, Kenta Matsuda, Takasuke Fukuhara, Yasumasa Iwatani, Takuya Yamamoto, Jonathan F Smith, Wataru Akahata
Nature communications, 14, 1, 2810, 2810, 2023年05月19日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Several vaccines have been widely used to counteract the global pandemic caused by SARS-CoV-2. However, due to the rapid emergence of SARS-CoV-2 variants of concern (VOCs), further development of vaccines that confer broad and longer-lasting protection against emerging VOCs are needed. Here, we report the immunological characteristics of a self-amplifying RNA (saRNA) vaccine expressing the SARS-CoV-2 Spike (S) receptor binding domain (RBD), which is membrane-anchored by fusing with an N-terminal signal sequence and a C-terminal transmembrane domain (RBD-TM). Immunization with saRNA RBD-TM delivered in lipid nanoparticles (LNP) efficiently induces T-cell and B-cell responses in non-human primates (NHPs). In addition, immunized hamsters and NHPs are protected against SARS-CoV-2 challenge. Importantly, RBD-specific antibodies against VOCs are maintained for at least 12 months in NHPs. These findings suggest that this saRNA platform expressing RBD-TM will be a useful vaccine candidate inducing durable immunity against emerging SARS-CoV-2 strains. - Virological characteristics of the SARS-CoV-2 XBB variant derived from recombination of two Omicron subvariants.
Tomokazu Tamura, Jumpei Ito, Keiya Uriu, Jiri Zahradnik, Izumi Kida, Yuki Anraku, Hesham Nasser, Maya Shofa, Yoshitaka Oda, Spyros Lytras, Naganori Nao, Yukari Itakura, Sayaka Deguchi, Rigel Suzuki, Lei Wang, Mst Monira Begum, Shunsuke Kita, Hisano Yajima, Jiei Sasaki, Kaori Sasaki-Tabata, Ryo Shimizu, Masumi Tsuda, Yusuke Kosugi, Shigeru Fujita, Lin Pan, Daniel Sauter, Kumiko Yoshimatsu, Saori Suzuki, Hiroyuki Asakura, Mami Nagashima, Kenji Sadamasu, Kazuhisa Yoshimura, Yuki Yamamoto, Tetsuharu Nagamoto, Gideon Schreiber, Katsumi Maenaka, Takao Hashiguchi, Terumasa Ikeda, Takasuke Fukuhara, Akatsuki Saito, Shinya Tanaka, Keita Matsuno, Kazuo Takayama, Kei Sato
Nature communications, 14, 1, 2800, 2800, NATURE PORTFOLIO, 2023年05月16日, [査読有り], [筆頭著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), In late 2022, SARS-CoV-2 Omicron subvariants have become highly diversified, and XBB is spreading rapidly around the world. Our phylogenetic analyses suggested that XBB emerged through the recombination of two cocirculating BA.2 lineages, BJ.1 and BM.1.1.1 (a progeny of BA.2.75), during the summer of 2022. XBB.1 is the variant most profoundly resistant to BA.2/5 breakthrough infection sera to date and is more fusogenic than BA.2.75. The recombination breakpoint is located in the receptor-binding domain of spike, and each region of the recombinant spike confers immune evasion and increases fusogenicity. We further provide the structural basis for the interaction between XBB.1 spike and human ACE2. Finally, the intrinsic pathogenicity of XBB.1 in male hamsters is comparable to or even lower than that of BA.2.75. Our multiscale investigation provides evidence suggesting that XBB is the first observed SARS-CoV-2 variant to increase its fitness through recombination rather than substitutions. - Convergent evolution of SARS-CoV-2 Omicron subvariants leading to the emergence of BQ.1.1 variant.
Jumpei Ito, Rigel Suzuki, Keiya Uriu, Yukari Itakura, Jiri Zahradnik, Kanako Terakado Kimura, Sayaka Deguchi, Lei Wang, Spyros Lytras, Tomokazu Tamura, Izumi Kida, Hesham Nasser, Maya Shofa, Mst Monira Begum, Masumi Tsuda, Yoshitaka Oda, Tateki Suzuki, Jiei Sasaki, Kaori Sasaki-Tabata, Shigeru Fujita, Kumiko Yoshimatsu, Hayato Ito, Naganori Nao, Hiroyuki Asakura, Mami Nagashima, Kenji Sadamasu, Kazuhisa Yoshimura, Yuki Yamamoto, Tetsuharu Nagamoto, Jin Kuramochi, Gideon Schreiber, Akatsuki Saito, Keita Matsuno, Kazuo Takayama, Takao Hashiguchi, Shinya Tanaka, Takasuke Fukuhara, Terumasa Ikeda, Kei Sato
Nature communications, 14, 1, 2671, 2671, NATURE PORTFOLIO, 2023年05月11日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), In late 2022, various Omicron subvariants emerged and cocirculated worldwide. These variants convergently acquired amino acid substitutions at critical residues in the spike protein, including residues R346, K444, L452, N460, and F486. Here, we characterize the convergent evolution of Omicron subvariants and the properties of one recent lineage of concern, BQ.1.1. Our phylogenetic analysis suggests that these five substitutions are recurrently acquired, particularly in younger Omicron lineages. Epidemic dynamics modelling suggests that the five substitutions increase viral fitness, and a large proportion of the fitness variation within Omicron lineages can be explained by these substitutions. Compared to BA.5, BQ.1.1 evades breakthrough BA.2 and BA.5 infection sera more efficiently, as demonstrated by neutralization assays. The pathogenicity of BQ.1.1 in hamsters is lower than that of BA.5. Our multiscale investigations illuminate the evolutionary rules governing the convergent evolution for known Omicron lineages as of 2022. - Evaluation of Broad Anti-Coronavirus Activity of Autophagy-Related Compounds Using Human Airway Organoids.
Rina Hashimoto, Tomokazu Tamura, Yukio Watanabe, Ayaka Sakamoto, Naoko Yasuhara, Hayato Ito, Masahiro Nakano, Hiromitsu Fuse, Akira Ohta, Takeshi Noda, Yasufumi Matsumura, Miki Nagao, Takuya Yamamoto, Takasuke Fukuhara, Kazuo Takayama
Molecular pharmaceutics, 20, 4, 2276, 2287, AMER CHEMICAL SOC, 2023年04月03日, [査読有り], [筆頭著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), To deal with the broad spectrum of coronaviruses, including severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), that threaten human health, it is essential to not only drugs develop that target viral proteins but also consider drugs that target host proteins/cellular processes to protect them from being hijacked for viral infection and replication. To this end, it has been reported that autophagy is deeply involved in coronavirus infection. In this study, we used airway organoids to screen a chemical library of autophagic modulators to identify compounds that could potentially be used to fight against infections by a broad range of coronaviruses. Among the 80 autophagy-related compounds tested, cycloheximide and thapsigargin reduced SARS-CoV-2 infection efficiency in a dose-dependent manner. Cycloheximide treatment reduced the infection efficiency of not only six SARS-CoV-2 variants but also human coronavirus (HCoV)-229E and HCoV-OC43. Cycloheximide treatment also reversed viral infection-induced innate immune responses. However, even low-dose (1 μM) cycloheximide treatment altered the expression profile of ribosomal RNAs; thus, side effects such as inhibition of protein synthesis in host cells must be considered. These results suggest that cycloheximide has broad-spectrum anti-coronavirus activity in vitro and warrants further investigation. - A third dose of the BNT162b2 mRNA vaccine sufficiently improves the neutralizing activity against SARS-CoV-2 variants in liver transplant recipients.
Takahiro Tomiyama, Rigel Suzuki, Noboru Harada, Tomokazu Tamura, Katsuya Toshida, Yukiko- Kosai-Fujimoto, Takahiro Tomino, Shohei Yoshiya, Yoshihiro Nagao, Kazuki Takeishi, Shinji Itoh, Nobuhiro Kobayashi, Hayato Ito, Sachiyo Yoshio, Tatsuya Kanto, Tomoharu Yoshizumi, Takasuke Fukuhara
Frontiers in cellular and infection microbiology, 13, 1197349, 1197349, FRONTIERS MEDIA SA, 2023年, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), INTRODUCTION: We examined the neutralizing antibody production efficiency of the second and third severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) vaccine doses (2nd- and 3rd-dose) and neutralizing activity on mutant strains, including, the Ancestral, Beta and Omicron strains using green fluorescent protein-carrying recombinant SARS-CoV-2, in living-donor liver transplantation (LDLT) recipients. METHODS: The patients who were administered vaccines other than Pfizer- BioNTechBNT162b2 and who had coronavirus disease 2019 in this study period were excluded. We enrolled 154 LDLT recipients and 50 healthy controls. RESULT: The median time were 21 days (between 1st and 2nd vaccination) and 244 days (between 2nd and 3rd vaccination). The median neutralizing antibody titer after 2nd-dose was lower in LDLT recipients than in controls (0.46 vs 1.00, P<0.0001). All controls had SARS-CoV-2 neutralizing antibodies, whereas 39 LDLT recipients (25.3%) had no neutralizing antibodies after 2nd-dose; age at vaccination, presence of ascites, multiple immunosuppressive treatments, and mycophenolate mofetil treatment were significant risk factors for nonresponder. The neutralizing activities of recipient sera were approximately 3-fold and 5-fold lower than those of control sera against the Ancestral and Beta strains, respectively. The median antibody titer after 3rd-dose was not significantly different between recipients and controls (1.02 vs 1.22, p=0.0758); only 5% recipients was non-responder. The neutralizing activity after third dose to Omicron strains were enhanced and had no significant difference between two groups. CONCLUSION: Only the 2nd-dose was not sufficiently effective in recipients; however, 3rd-dose had sufficient neutralizing activity against the mutant strain and was as effective as that in healthy controls. - Generation and characterization of genetically and antigenically diverse infectious clones of dengue virus serotypes 1-4.
Tomokazu Tamura, Jiayu Zhang, Vrinda Madan, Abhishek Biswas, Michael P. Schwoerer, Thomas R. Cafiero, Brigitte L. Heller, Wei Wang, Alexander Ploss
Emerging microbes & infections, 11, 1, 227, 239, TAYLOR & FRANCIS LTD, 2022年12月01日, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), Dengue is caused by four genetically distinct viral serotypes, dengue virus (DENV) 1-4. Following transmission by Aedes mosquitoes, DENV can cause a broad spectrum of clinically apparent disease ranging from febrile illness to dengue hemorrhagic fever and dengue shock syndrome. Progress in the understanding of different dengue serotypes and their impacts on specific host-virus interactions has been hampered by the scarcity of tools that adequately reflect their antigenic and genetic diversity. To bridge this gap, we created and characterized infectious clones of DENV1-4 originating from South America, Africa, and Southeast Asia. Analysis of whole viral genome sequences of five DENV isolates from each of the four serotypes confirmed their broad genetic and antigenic diversity. Using a modified circular polymerase extension reaction (CPER), we generated de novo viruses from these isolates. The resultant clones replicated robustly in human and insect cells at levels similar to those of the parental strains. To investigate in vivo properties of these genetically diverse isolates, representative viruses from each DENV serotype were administered to NOD Rag1-/-, IL2rgnull Flk2-/- (NRGF) mice, engrafted with components of a human immune system. All DENV strains tested resulted in viremia in humanized mice and induced cellular and IgM immune responses. Collectively, we describe here a workflow for rapidly generating de novo infectious clones of DENV - and conceivably other RNA viruses. The infectious clones described here are a valuable resource for reverse genetic studies and for characterizing host responses to DENV in vitro and in vivo. - Monitoring fusion kinetics of viral and target cell membranes in living cells using a SARS-CoV-2 spike-protein-mediated membrane fusion assay
Hesham Nasser, Ryo Shimizu, Jumpei Ito, Akatsuki Saito, Kei Sato, Terumasa Ikeda, Keita Matsuno, Naganori Nao, Hirofumi Sawa, Mai Kishimoto, Shinya Tanaka, Masumi Tsuda, Lei Wang, Yoshikata Oda, Marie Kato, Zannatul Ferdous, Hiromi Mouri, Kenji Shishido, Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Rigel Suzuki, Hayato Ito, Daichi Yamasoba, Izumi Kimura, Naoko Misawa, Keiya Uriu, Yusuke Kosugi, Shigeru Fujita, Mai Suganami, Mika Chiba, Ryo Yoshimura, So Nakagawa, Jiaqi Wu, Akifumi Takaori-Kondo, Kotaro Shirakawa, Kayoko Nagata, Yasuhiro Kazuma, Ryosuke Nomura, Yoshihito Horisawa, Yusuke Tashiro, Yugo Kawai, Takashi Irie, Ryoko Kawabata, MST Monira Begum, Otowa Takahashi, Kimiko Ichihara, Takamasa Ueno, Chihiro Motozono, Mako Toyoda, Yuri L. Tanaka, Erika P. Butlertanaka, Maya Shofa, Kazuo Takayama, Rina Hashimoto, Sayaka Deguchi, Takao Hashiguchi, Tateki Suzuki, Kanako Kimura, Jiei Sasaki, Yukari Nakajima, Kaori Tabata
STAR Protocols, 3, 4, 101773, 101773, Elsevier BV, 2022年12月, [査読有り]
研究論文(学術雑誌) - Virological characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75 variant.
Akatsuki Saito, Tomokazu Tamura, Jiri Zahradnik, Sayaka Deguchi, Koshiro Tabata, Yuki Anraku, Izumi Kimura, Jumpei Ito, Daichi Yamasoba, Hesham Nasser, Mako Toyoda, Kayoko Nagata, Keiya Uriu, Yusuke Kosugi, Shigeru Fujita, Maya Shofa, Mst Monira Begum, Ryo Shimizu, Yoshitaka Oda, Rigel Suzuki, Hayato Ito, Naganori Nao, Lei Wang, Masumi Tsuda, Kumiko Yoshimatsu, Jin Kuramochi, Shunsuke Kita, Kaori Sasaki-Tabata, Hideo Fukuhara, Katsumi Maenaka, Yuki Yamamoto, Tetsuharu Nagamoto, Hiroyuki Asakura, Mami Nagashima, Kenji Sadamasu, Kazuhisa Yoshimura, Takamasa Ueno, Gideon Schreiber, Akifumi Takaori-Kondo, Kotaro Shirakawa, Hirofumi Sawa, Takashi Irie, Takao Hashiguchi, Kazuo Takayama, Keita Matsuno, Shinya Tanaka, Terumasa Ikeda, Takasuke Fukuhara, Kei Sato
Cell host & microbe, 30, 11, 1540, 1555, CELL PRESS, 2022年11月09日, [査読有り], [筆頭著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), The SARS-CoV-2 Omicron BA.2.75 variant emerged in May 2022. BA.2.75 is a BA.2 descendant but is phylogenetically distinct from BA.5, the currently predominant BA.2 descendant. Here, we show that BA.2.75 has a greater effective reproduction number and different immunogenicity profile than BA.5. We determined the sensitivity of BA.2.75 to vaccinee and convalescent sera as well as a panel of clinically available antiviral drugs and antibodies. Antiviral drugs largely retained potency, but antibody sensitivity varied depending on several key BA.2.75-specific substitutions. The BA.2.75 spike exhibited a profoundly higher affinity for its human receptor, ACE2. Additionally, the fusogenicity, growth efficiency in human alveolar epithelial cells, and intrinsic pathogenicity in hamsters of BA.2.75 were greater than those of BA.2. Our multilevel investigations suggest that BA.2.75 acquired virological properties independent of BA.5, and the potential risk of BA.2.75 to global health is greater than that of BA.5. - Smoking enhances the expression of angiotensin-converting enzyme 2 involved in the efficiency of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infection.
Rigel Suzuki, Yuki Ono, Koji Noshita, Kwang Su Kim, Hayato Ito, Yuhei Morioka, Tomokazu Tamura, Daisuke Okuzaki, Tetsuzo Tagawa, Tomoyoshi Takenaka, Tomoharu Yoshizumi, Teppei Shimamura, Shingo Iwami, Takasuke Fukuhara
Microbiology and immunology, 67, 1, 22, 31, WILEY, 2022年10月18日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Smoking is one of the risk factors most closely related to the severity of coronavirus disease 2019 (COVID-19). However, the relationship between smoking history and severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infectivity is unknown. In this study, we evaluated the ACE2 expression level in the lungs of current smokers, ex-smokers, and nonsmokers. The ACE2 expression level of ex-smokers who smoked cigarettes until recently (cessation period shorter than 6 months) was higher than that of nonsmokers and ex-smokers with a long history of nonsmoking (cessation period longer than 6 months). We also showed that the efficiency of SARS-CoV-2 infection was enhanced in a manner dependent on the angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) expression level. Using RNA-seq analysis on the lungs of smokers, we identified that the expression of inflammatory signaling genes was correlated with ACE2 expression. Notably, with increasing duration of smoking cessation among ex-smokers, not only ACE2 expression level but also the expression levels of inflammatory signaling genes decreased. These results indicated that smoking enhances the expression levels of ACE2 and inflammatory signaling genes. Our data suggest that the efficiency of SARS-CoV-2 infection is enhanced by smoking-mediated upregulation of ACE2 expression level. - Virological characteristics of the SARS-CoV-2 Omicron BA.2 subvariants including BA.4 and BA.5
Izumi Kimura, Daichi Yamasoba, Tomokazu Tamura, Naganori Nao, Tateki Suzuki, Yoshitaka Oda, Shuya Mitoma, Jumpei Ito, Hesham Nasser, Jiri Zahradnik, Keiya Uriu, Shigeru Fujita, Yusuke Kosugi, Lei Wang, Masumi Tsuda, Mai Kishimoto, Hayato Ito, Rigel Suzuki, Ryo Shimizu, M.S.T. Monira Begum, Kumiko Yoshimatsu, Kanako Terakado Kimura, Jiei Sasaki, Kaori Sasaki-Tabata, Yuki Yamamoto, Tetsuharu Nagamoto, Jun Kanamune, Kouji Kobiyama, Hiroyuki Asakura, Mami Nagashima, Kenji Sadamasu, Kazuhisa Yoshimura, Kotaro Shirakawa, Akifumi Takaori-Kondo, Jin Kuramochi, Gideon Schreiber, Ken J. Ishii, Takao Hashiguchi, Terumasa Ikeda, Akatsuki Saito, Takasuke Fukuhara, Shinya Tanaka, Keita Matsuno, Kei Sato
Cell, 185, 21, 3992, +, Elsevier BV, 2022年09月, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), After the global spread of the SARS-CoV-2 Omicron BA.2, some BA.2 subvariants, including BA.2.9.1, BA.2.11, BA.2.12.1, BA.4, and BA.5, emerged in multiple countries. Our statistical analysis showed that the effective reproduction numbers of these BA.2 subvariants are greater than that of the original BA.2. Neutralization experiments revealed that the immunity induced by BA.1/2 infections is less effective against BA.4/5. Cell culture experiments showed that BA.2.12.1 and BA.4/5 replicate more efficiently in human alveolar epithelial cells than BA.2, and particularly, BA.4/5 is more fusogenic than BA.2. We further provided the structure of the BA.4/5 spike receptor-binding domain that binds to human ACE2 and considered how the substitutions in the BA.4/5 spike play roles in ACE2 binding and immune evasion. Moreover, experiments using hamsters suggested that BA.4/5 is more pathogenic than BA.2. Our multiscale investigations suggest that the risk of BA.2 subvariants, particularly BA.4/5, to global health is greater than that of original BA.2. - Secretory glycoprotein NS1 plays a crucial role in the particle formation of flaviviruses.
Tomokazu Tamura, Shiho Torii, Kentaro Kajiwara, Itsuki Anzai, Yoichiro Fujioka, Kisho Noda, Shuhei Taguwa, Yuhei Morioka, Rigel Suzuki, Yuzy Fauzyah, Chikako Ono, Yusuke Ohba, Masato Okada, Takasuke Fukuhara, Yoshiharu Matsuura
PLoS pathogens, 18, 6, e1010593, PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 2022年06月03日, [査読有り], [筆頭著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Flaviviruses, which are globally distributed and cause a spectrum of potentially severe illnesses, pose a major threat to public health. Although Flaviviridae viruses, including flaviviruses, possess similar genome structures, only the flaviviruses encode the non-structural protein NS1, which resides in the endoplasmic reticulum (ER) and is secreted from cells after oligomerization. The ER-resident NS1 is known to be involved in viral genome replication, but the essential roles of secretory NS1 in the virus life cycle are not fully understood. Here we characterized the roles of secretory NS1 in the particle formation of flaviviruses. We first identified an amino acid residue essential for the NS1 secretion but not for viral genome replication by using protein-protein interaction network analyses and mutagenesis scanning. By using the recombinant flaviviruses carrying the identified NS1 mutation, we clarified that the mutant flaviviruses employed viral genome replication. We then constructed a recombinant NS1 with the identified mutation and demonstrated by physicochemical assays that the mutant NS1 was unable to form a proper oligomer or associate with liposomes. Finally, we showed that the functions of NS1 that were lost by the identified mutation could be compensated for by the in trans-expression of Erns of pestiviruses and host exchangeable apolipoproteins, which participate in the infectious particle formation of pestiviruses and hepaciviruses in the family Flaviviridae, respectively. Collectively, our study suggests that secretory NS1 plays a role in the particle formation of flaviviruses through its interaction with the lipid membrane. - Susceptibility of herons (family: Ardeidae) to clade 2.3.2.1 H5N1 subtype high pathogenicity avian influenza virus.
Kosuke Soda, Yukiko Tomioka, Tatsufumi Usui, Yukiko Uno, Yasuko Nagai, Hiroshi Ito, Takahiro Hiono, Tomokazu Tamura, Masatoshi Okamatsu, Masahiro Kajihara, Naganori Nao, Yoshihiro Sakoda, Ayato Takada, Toshihiro Ito
Avian pathology : journal of the W.V.P.A, 51, 2, 146, 153, TAYLOR & FRANCIS LTD, 2022年04月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), The pathogenicity of the H5 subtype high pathogenicity avian influenza viruses (HPAIVs) in Ardeidae bird species has not been investigated yet, despite the increasing infections reported. Therefore, the present study aimed to examine the susceptibility of the Ardeidae species, which had already been reported to be susceptible to HPAIVs, to a clade 2.3.2.1 H5N1 HPAIV. Juvenile herons (four grey herons, one intermediate egret, two little egrets, and three black-crowned night herons) were intranasally inoculated with 106 50% egg infectious dose of the virus and observed for 10 days. Two of the four grey herons showed lethargy and conjunctivitis; among them, one died at 6 days post-inoculation (dpi). The viruses were transmitted to the other two cohoused naïve grey herons. Some little egrets and black-crowned night herons showing neurological disorders died at 4-5 dpi; these birds mainly shed the virus via the oral route. The viruses predominantly replicated in the brains of birds that died of infection. Seroconversion was observed in most surviving birds, except some black-crowned night herons. These results demonstrate that most Ardeidae species are susceptible to H5 HPAIVs, sometimes with lethal effects. Herons are mostly colonial and often share habitats with Anseriformes, natural hosts of influenza A viruses; therefore, the risks of cluster infection and contribution to viral dissemination should be continuously evaluated. RESEARCH HIGHLIGHTSClade 2.3.2.1 H5N1 HPAIV causes lethal infections in Ardeidae sp.Viruses are transmitted among grey herons.Some herons with HPAIV showed conjunctivitis or neurological symptoms.HPAIV systemically replicated in herons tissues. - Attenuated fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron variant
Rigel Suzuki, Daichi Yamasoba, Izumi Kimura, Lei Wang, Mai Kishimoto, Jumpei Ito, Yuhei Morioka, Naganori Nao, Hesham Nasser, Keiya Uriu, Yusuke Kosugi, Masumi Tsuda, Yasuko Orba, Michihito Sasaki, Ryo Shimizu, Ryoko Kawabata, Kumiko Yoshimatsu, Hiroyuki Asakura, Mami Nagashima, Kenji Sadamasu, Kazuhisa Yoshimura, Mai Suganami, Akiko Oide, Mika Chiba, Hayato Ito, Tomokazu Tamura, Kana Tsushima, Haruko Kubo, Zannatul Ferdous, Hiromi Mouri, Miki Iida, Keiko Kasahara, Koshiro Tabata, Mariko Ishizuka, Asako Shigeno, Kenzo Tokunaga, Seiya Ozono, Isao Yoshida, So Nakagawa, Jiaqi Wu, Miyoko Takahashi, Atsushi Kaneda, Motoaki Seki, Ryoji Fujiki, Bahityar Rahmutulla Nawai, Yutaka Suzuki, Yukie Kashima, Kazumi Abe, Kiyomi Imamura, Kotaro Shirakawa, Akifumi Takaori-Kondo, Yasuhiro Kazuma, Ryosuke Nomura, Yoshihito Horisawa, Kayoko Nagata, Yugo Kawai, Yohei Yanagida, Yusuke Tashiro, Otowa Takahashi, Kazuko Kitazato, Haruyo Hasebe, Chihiro Motozono, Mako Toyoda, Toong Seng Tan, Isaac Ngare, Takamasa Ueno, Akatsuki Saito, Erika P. Butlertanaka, Yuri L. Tanaka, Nanami Morizako, Hirofumi Sawa, Terumasa Ikeda, Takashi Irie, Keita Matsuno, Shinya Tanaka, Takasuke Fukuhara, Kei Sato
Nature, 603, 7902, 700, 705, Springer Science and Business Media LLC, 2022年03月24日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Abstract
The emergence of the Omicron variant of SARS-CoV-2 is an urgent global health concern1. In this study, our statistical modelling suggests that Omicron has spread more rapidly than the Delta variant in several countries including South Africa. Cell culture experiments showed Omicron to be less fusogenic than Delta and than an ancestral strain of SARS-CoV-2. Although the spike (S) protein of Delta is efficiently cleaved into two subunits, which facilitates cell–cell fusion2,3, the Omicron S protein was less efficiently cleaved compared to the S proteins of Delta and ancestral SARS-CoV-2. Furthermore, in a hamster model, Omicron showed decreased lung infectivity and was less pathogenic compared to Delta and ancestral SARS-CoV-2. Our multiscale investigations reveal the virological characteristics of Omicron, including rapid growth in the human population, lower fusogenicity and attenuated pathogenicity. - Photochemical Identification of Auxiliary Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Host Entry Factors Using mu Map
Saori Suzuki, Jacob B Geri, Steve D Knutson, Harris Bell-Temin, Tomokazu Tamura, David F Fernández, Gabrielle H Love, Nicholas A Till, Brigitte L Heller, Jinchao Guo, David W C MacMillan, Alexander Ploss
Journal of the American Chemical Society, 144, 36, 16604, 16611, AMER CHEMICAL SOC, 2022年, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), the infectious agent of the COVID-19 pandemic, remains a global medical problem. Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) was identified as the primary viral entry receptor, and transmembrane serine protease 2 primes the spike protein for membrane fusion. However, ACE2 expression is generally low and variable across tissues, suggesting that auxiliary receptors facilitate viral entry. Identifying these factors is critical for understanding SARS-Cov-2 pathophysiology and developing new countermeasures. However, profiling host-virus interactomes involves extensive genetic screening or complex computational predictions. Here, we leverage the photocatalytic proximity labeling platform mu Map to rapidly profile the spike interactome in human cells and identify eight novel candidate receptors. We systemically validate their functionality in SARS-CoV-2 pseudoviral uptake assays with both Wuhan and Delta spike variants and show that dual expression of ACE2 with either neuropilin-2, ephrin receptor A7, solute carrier family 6 member 15, or myelin and lymphocyte protein 2 significantly enhances viral uptake. Collectively, our data show that SARS-CoV-2 synergistically engages several host factors for cell entry and establishes mu Map as a powerful tool for rapidly interrogating host-virus interactomes. - Humanized mice reveal a macrophage-enriched gene signature defining human lung tissue protection during SARS-CoV-2 infection
Devin J Kenney, Aoife K O'Connell, Jacquelyn Turcinovic, Paige Montanaro, Ryan M Hekman, Tomokazu Tamura, Andrew R Berneshawi, Thomas R Cafiero, Salam Al Abdullatif, Benjamin Blum, Stanley I Goldstein, Brigitte L Heller, Hans P Gertje, Esther Bulli, Alexander J Trachtenberg, Elizabeth Chavez, Evans Tuekam Nono, Catherine Morrison, Anna E Tseng, Amira Sheikh, Susanna Kurnick, Kyle Grosz, Markus Bosmann, Maria Ericsson, Bertra, d R Huber, Mohsan Saeed, Alejandro B Balazs, Kevin P Francis, Alexander Klose, Neal Paragas, Joshua D Campbell, John H Connor, Andrew Emili, Nicholas A Crossland, Alexander Ploss, Florian Douam
Cell Reports, 39, 3, CELL PRESS, 2022年, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), The human immunological mechanisms defining the clinical outcome of SARS-CoV-2 infection remain elusive. This knowledge gap is mostly driven by the lack of appropriate experimental platforms recapitulating human immune responses in a controlled human lung environment. Here, we report a mouse model (i.e., HNFL mice) co-engrafted with human fetal lung xenografts (fLX) and a myeloid-enhanced human immune system to identify cellular and molecular correlates of lung protection during SARS-CoV-2 infection. Unlike mice solely engrafted with human fLX, HNFL mice are protected against infection, severe inflammation, and histopathological phenotypes. Lung tissue protection from infection and severe histopathology associates with macrophage infiltration and differentiation and the upregulation of a macrophage-enriched signature composed of 11 specific genes mainly associated with the type I interferon signaling pathway. Our work highlights the HNFL model as a transformative platform to investigate, in controlled experimental settings, human myeloid immune mechanisms governing lung tissue protection during SARS-CoV-2 infection. - DsRNA Sequencing for RNA Virus Surveillance Using Human Clinical Samples.
Takuma Izumi, Yuhei Morioka, Syun-Ichi Urayama, Daisuke Motooka, Tomokazu Tamura, Takahiro Kawagishi, Yuta Kanai, Takeshi Kobayashi, Chikako Ono, Akinari Morinaga, Takahiro Tomiyama, Norifumi Iseda, Yukiko Kosai, Shoichi Inokuchi, Shota Nakamura, Tomohisa Tanaka, Kohji Moriishi, Hiroaki Kariwa, Tomoharu Yoshizumi, Masaki Mori, Yoshiharu Matsuura, Takasuke Fukuhara
Viruses, 13, 7, MDPI, 2021年07月06日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Although viruses infect various organs and are associated with diseases, there may be many unidentified pathogenic viruses. The recent development of next-generation sequencing technologies has facilitated the establishment of an environmental viral metagenomic approach targeting the intracellular viral genome. However, an efficient method for the detection of a viral genome derived from an RNA virus in animal or human samples has not been established. Here, we established a method for the efficient detection of RNA viruses in human clinical samples. We then tested the efficiency of the method compared to other conventional methods by using tissue samples collected from 57 recipients of living donor liver transplantations performed between June 2017 and February 2019 at Kyushu University Hospital. The viral read ratio in human clinical samples was higher by the new method than by the other conventional methods. In addition, the new method correctly identified viral RNA from liver tissues infected with hepatitis C virus. This new technique will be an effective tool for intracellular RNA virus surveillance in human clinical samples and may be useful for the detection of new RNA viruses associated with diseases. - SARS-CoV-2 requires cholesterol for viral entry and pathological syncytia formation
David W Sanders, Chanelle C Jumper, Paul J Ackerman, Dan Bracha, Anita Donlic, Hahn Kim, Devin Kenney, Ivan Castello-Serrano, Saori Suzuki, Tomokazu Tamura, Alexander H Tavares, Mohsan Saeed, Alex S Holehouse, Alexander Ploss, Ilya Levental, Florian Douam, Robert F Padera, Bruce D Levy, Clifford P Brangwynne
eLife, 10, eLife Sciences Publications, Ltd, 2021年04月23日, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), Many enveloped viruses induce multinucleated cells (syncytia), reflective of membrane fusion events caused by the same machinery that underlies viral entry. These syncytia are thought to facilitate replication and evasion of the host immune response. Here, we report that co-culture of human cells expressing the receptor ACE2 with cells expressing SARS-CoV-2 spike, results in synapse-like intercellular contacts that initiate cell-cell fusion, producing syncytia resembling those we identify in lungs of COVID-19 patients. To assess the mechanism of spike/ACE2-driven membrane fusion, we developed a microscopy-based, cell-cell fusion assay to screen ~6000 drugs and >30 spike variants. Together with quantitative cell biology approaches, the screen reveals an essential role for biophysical aspects of the membrane, particularly cholesterol-rich regions, in spike-mediated fusion, which extends to replication-competent SARS-CoV-2 isolates. Our findings potentially provide a molecular basis for positive outcomes reported in COVID-19 patients taking statins and suggest new strategies for therapeutics targeting the membrane of SARS-CoV-2 and other fusogenic viruses. - Development of a High-Throughput Serum Neutralization Test Using Recombinant Pestiviruses Possessing a Small Reporter Tag.
Madoka Tetsuo, Keita Matsuno, Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Taksoo Kim, Masatoshi Okamatsu, Norbert Tautz, Yoshiharu Matsuura, Yoshihiro Sakoda
Pathogens (Basel, Switzerland), 9, 3, MDPI, 2020年03月04日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), A serum neutralization test (SNT) is an essential method for the serological diagnosis of pestivirus infections, including classical swine fever, because of the cross reactivity of antibodies against pestiviruses and the non-quantitative properties of antibodies in an enzyme-linked immunosorbent assay. In conventional SNTs, an immunoperoxidase assay or observation of cytopathic effect after incubation for 3 to 7 days is needed to determine the SNT titer, which requires labor-intensive or time-consuming procedures. Therefore, a new SNT, based on the luciferase system and using classical swine fever virus, bovine viral diarrhea virus, and border disease virus possessing the 11-amino-acid subunit derived from NanoLuc luciferase was developed and evaluated; this approach enabled the rapid and easy determination of the SNT titer using a luminometer. In the new method, SNT titers can be determined tentatively at 2 days post-infection (dpi) and are comparable to those obtained by conventional SNTs at 3 or 4 dpi. In conclusion, the luciferase-based SNT can replace conventional SNTs as a high-throughput antibody test for pestivirus infections. - Rimonabant suppresses RNA transcription of hepatitis B virus by inhibiting hepatocyte nuclear factor 4α
Asuka Sato, Chikako Ono, Tomokazu Tamura, Hiroyuki Mori, Takuma Izumi, Shiho Torii, Yuzy Fauzyah, Takuya Yamamoto, Yuhei Morioka, Daisuke Okuzaki, Takasuke Fukuhara, Yoshiharu Matsuura
Microbiology and Immunology, 64, 5, 345, 355, Wiley, 2020年02月25日, [査読有り]
研究論文(学術雑誌), Abstract
Chronic infection with hepatitis B virus (HBV) sometime induces lethal cirrhosis and hepatocellular carcinoma. Although nucleot(s)ide analogs are used as main treatment for HBV infection, the emergence of the drug‐resistant viruses has become a problem. To discover novel antivirals with low side effects and low risk of emergence of resistant viruses, screening for anti‐HBV compounds was performed with compound libraries of inhibitors targeting G‐protein‐coupled receptors (GPCRs). HepG2‐hNTCP C4 cells infected with HBV were treated with various GPCR inhibitors and harvested at 14 day postinfection for quantification of core protein in the first screening or relaxed circular DNA in the second screening. Finally, we identified a cannabinoid receptor 1 inhibitor, rimonabant, as a candidate showing anti‐HBV effect. In HepG2‐hNTCP C4 cells, treatment with rimonabant suppressed HBV propagation at the viral RNA transcription step but had no effect on entry or covalently closed circular DNA level. The values of half maximal inhibitory concentration, half maximal effective concentration, and selectivity index of rimonabant in primary human hepatocyte (PHH) are 2.77 μm, 40.4 μm, and 14.6, respectively. Transcriptome analysis of rimonabant‐treated primary hepatocytes by RNA sequencing revealed that the transcriptional activity of hepatocyte nuclear factor 4α (HNF4α), which is known to stimulate viral RNA synthesis, was depressed. By treatment of PHH with rimonabant, the expression level of HNF4α protein and the production of the messenger RNAs (mRNAs) of downstream factors promoted by HNF4α were reduced while the amount of HNF4α mRNA was not altered. These results suggest that treatment with rimonabant suppresses HBV propagation through the inhibition of HNF4α activity. - A cloned classical swine fever virus derived from the vaccine strain GPE- causes cytopathic effect in CPK-NS cells via type-I interferon-dependent necroptosis.
Yukari Itakura, Keita Matsuno, Asako Ito, Markus Gerber, Matthias Liniger, Yuri Fujimoto, Tomokazu Tamura, Ken-Ichiro Kameyama, Masatoshi Okamatsu, Nicolas Ruggli, Hiroshi Kida, Yoshihiro Sakoda
Virus research, 276, 197809, 197809, ELSEVIER, 2020年01月15日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Classical swine fever viruses (CSFVs) do typically not show cytopathic effect (CPE) in cell culture, while some strains such as vaccine strain the GPE- induce CPE in the swine kidney-derived CPK-NS cell line cultured in serum-free medium. These latter strains commonly lack Npro-mediated inhibition of type-I interferon (IFN) induction. In order to explore the molecular mechanisms of GPE--induced CPE, we analyzed the cellular pathways involved. In CPK-NS cells infected with the attenuated-vaccine-derived vGPE- strain, both, apoptosis and necroptosis were induced. Necroptosis was type-I IFN-dependent and critical for visible CPE. In contrast, the parental virulent vALD-A76 strain did not induce any of these pathways nor CPE. We used reverse genetics to investigate which viral factors regulate these cell-death pathways. Interestingly, a mutant vGPE- in which the Npro function was restored to inhibit type-I IFN induction did not induce necroptosis nor CPE but still induced apoptosis, while an Npro-mutant vALD-A76 incapable of inhibiting type-I IFN production induced necroptosis and CPE. Although Erns of CSFV is reportedly involved in controlling apoptosis, apoptosis induction by vGPE- or apoptosis inhibition by vALD-A76 were independent of the unique amino acid difference found in Erns of these two strains. Altogether, these results demonstrate that type-I IFN-dependent necroptosis related to non-functional Npro is the main mechanism for CPE induction by vGPE-, and that viral factor(s) other than Erns may induce or inhibit apoptosis in vGPE- or vALD-A76 infected CPK-NS cells, respectively. - Characterization of human pegivirus infection in liver transplantation recipients
Takuma Izumi, Kazuhito Sakata, Daisuke Okuzaki, Shoichi Inokuchi, Tomokazu Tamura, Daisuke Motooka, Shota Nakamura, Chikako Ono, Masahiro Shimokawa, Yoshiharu Matsuura, Masaki Mori, Takasuke Fukuhara, Tomoharu Yoshizumi
Journal of Medical Virology, 91, 12, 2093, 2100, WILEY, 2019年12月01日, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), © 2019 Wiley Periodicals, Inc. Approximately 2% of healthy persons are infected with human pegivirus (HPgV). HPgV is transmitted via vertical, sexual, and blood-borne routes. Recently, the association of HPgV infection with the risk of lymphoma was reported. Here, we examined the prevalence of chronic HPgV infection in liver transplantation (LT) recipients and patients with hepatectomy and the influence of HPgV infection after LT on clinical and perioperative factors. We enrolled 313 LT recipients and 187 patients with hepatectomy who received care at the Kyusyu University Hospital between May 1997 and September 2017. Of the 313 recipients and 187 patients enrolled in this study, 44 recipients (14.1%) and 2 patients (1.1%) had HPgV viremia, respectively. There was no significant association between HPgV infection and LT outcomes. Interestingly, one recipient was infected with HPgV during the peritransplant period, which was likely transmitted via blood transfusion because HPgV RNA was detected from the blood bag transfused to the recipient during LT. We reviewed the available literature on the prevalence HPgV infections in other organ-transplanted patients and whether they impacted clinical outcomes. They also had the higher prevalence of HPgV infection, while it appears to be of low or no consequences. In addition, HPgV infection induced the upregulation of interferon-stimulated gene (ISG) expression in peripheral blood mononuclear cells. LT recipients had higher HPgV viremia compared to patients with hepatectomy. Although HPgV infection was not associated with LT-related outcomes, it induced ISG expression in recipients. - In vivo dynamics of reporter Flaviviridae viruses.
Tamura T, Igarashi M, Enkhbold B, Suzuki T, Okamatsu M, Ono C, Mori H, Izumi T, Sato A, Fauzyah Y, Okamoto T, Sakoda Y, Fukuhara T, Matsuura Y
Journal of virology, 93, 22, AMER SOC MICROBIOLOGY, 2019年11月15日, [査読有り], [筆頭著者], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Recombinant viruses possessing reporter proteins have been generated for virus research. In the case of the family Flaviviridae, we recently generated recombinant viruses, including the hepatitis C virus of the genus Hepacivirus, Japanese encephalitis virus (JEV) of the genus Flavivirus, and bovine viral diarrhea virus of the genus Pestivirus; all three viruses possess an 11-amino-acid subunit derived from NanoLuc luciferase (HiBiT). Here, we further developed the recombinant viruses and investigated their utility in vivo Recombinant viruses harboring HiBiT in the E, NS1, or NS3 protein constructed based on the predicted secondary structure, solvent-accessible surface area, and root mean square fluctuation of the proteins exhibited comparable replication to that of the wild-type virus in vitro The recombinant JEV carrying HiBiT in the NS1 protein exhibited propagation in mice comparable to that of the parental virus, and propagation of the recombinant was monitored by the luciferase activity. In addition, the recombinants of classical swine fever virus (CSFV) possessing HiBiT in the Erns or E2 protein also showed propagation comparable to that of the wild-type virus. The recombinant CSFV carrying HiBiT in Erns exhibited similar replication to the parental CSFV in pigs, and detection of viral propagation of this recombinant by luciferase activity was higher than that by quantitative PCR (qPCR). Taken together, these results demonstrated that the reporter Flaviviridae viruses generated herein are powerful tools for elucidating the viral life cycle and pathogeneses and provide a robust platform for the development of novel antivirals.IMPORTANCEIn vivo applications of reporter viruses are necessary to understand viral pathogenesis and provide a robust platform for antiviral development. In developing such applications, determination of an ideal locus to accommodate foreign genes is important, because insertion of foreign genes into irrelevant loci can disrupt the protein functions required for viral replication. Here, we investigated the criteria to determine ideal insertion sites of foreign genes from the protein structure of viral proteins. The recombinant viruses generated by our criteria exhibited propagation comparable to that of parental viruses in vivo Our proteomic approach based on the flexibility profile of viral proteins may provide a useful tool for constructing reporter viruses, including Flaviviridae viruses. - Induction of selective autophagy in cells replicating hepatitis C virus genome.
Hiroyuki Mori, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Tomokazu Tamura, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Masami Wada, Toru Okamoto, Takeshi Noda, Tamotsu Yoshimori, Yoshiharu Matsuura
The Journal of general virology, 99, 12, 1643, 1657, MICROBIOLOGY SOC, 2018年12月, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Hepatitis C virus (HCV) infection is known to induce autophagy, but the mechanism of autophagy induced by HCV remains controversial. Here, we investigated the characteristics of autophagy induced by HCV infection. First, to examine the involvement of autophagy-related gene (ATG) proteins in HCV-induced LC3 lipidation, we established ATG5, ATG13 or ATG14 knockout (KO) Huh7.5.1 cell lines and confirmed that the accumulation of lipidated LC3 was induced in an ATG13- and ATG14-independent manner. On the other hand, HCV infectivity was not influenced by deficiencies in these genes. We also confirmed that LC3-positive dots were co-localized with ubiquitinated aggregates, and deficiency of ATG5 or ATG14 enhanced the accumulation of ubiquitinated aggregates compared to that in the restored cells, suggesting that HCV infection induces ATG5- and ATG14-dependent selective autophagy. Moreover, LC3-positive ubiquitinated aggregates accumulated near the site of the replication complex. We further examined autophagy flux in cells replicating HCV RNA using bafilomycin or E64d, and found that the increase of LC3 lipidation by treatment with bafilomycin or E64d was impaired in HCV-replicating cells, suggesting that autophagy flux is inhibited by the progress of HCV infection. Our present study suggests that (1) HCV RNA replication induces selective autophagy and (2) the progress of HCV infection impairs autophagy flux. - Characterization of recombinant Flaviviridae viruses possessing a small reporter Tag
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Takuro Uchida, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Toru Okamoto, Takeshi Kurosu, Yin Xiang Setoh, Michio Imamura, Norbert Tautz, Yoshihiro Sakoda, Alexander A. Khromykh, Kazuaki Chayama, Yoshiharu Matsuura
Journal of Virology, 92, 2, American Society for Microbiology, 2018年01月01日, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), The family Flaviviridae consists of four genera, Flavivirus, Pestivirus, Pegivirus, and Hepacivirus, and comprises important pathogens of human and animals. Although the construction of recombinant viruses carrying reporter genes encoding fluorescent and bioluminescent proteins has been reported, the stable insertion of foreign genes into viral genomes retaining infectivity remains difficult. Here, we applied the 11-amino-acid subunit derived from NanoLuc luciferase to the engineering of the Flaviviridae viruses and then examined the biological characteristics of the viruses. We successfully generated recombinant viruses carrying the split-luciferase gene, including dengue virus, Japanese encephalitis virus, hepatitis C virus (HCV), and bovine viral diarrhea virus. The stability of the viruses was confirmed by five rounds of serial passages in the respective susceptible cell lines. The propagation of the recombinant luciferase viruses in each cell line was comparable to that of the parental viruses. By using a purified counterpart luciferase protein, this split-luciferase assay can be applicable in various cell lines, even when it is difficult to transduce the counterpart gene. The efficacy of antiviral reagents against the recombinant viruses could be monitored by the reduction of luciferase expression, which was correlated with that of viral RNA, and the recombinant HCV was also useful to examine viral dynamics in vivo. Taken together, our findings indicate that the recombinant Flaviviridae viruses possessing the split NanoLuc luciferase gene generated here provide powerful tools to understand viral life cycle and pathogenesis and a robust platform to develop novel antivirals against Flaviviridae viruses. - Involvement of other miRNA on the propagation of HCV in miR-1-deficient cells
Chikako Ono, Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Toru Okamoto, Kazuaki Chayama, Kazuhiko Koike, Yoshiharu Matsuura
2017年10月
英語, 研究論文(その他学術会議資料等) - Characterization of selective autophagy induced by infection with hepatitis C virus
Hiroyuki Mori, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Tomokazu Tamura, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Masami Wada, Toru Okamoto, Takeshi Noda, Tamotsu Yoshimori, Yoshiharu Matsuura
2017年09月
英語, 研究論文(国際会議プロシーディングス) - Engineering of Small Reporter-Tagged Flaviviridae Viruses Applicable to Antiviral Screening and in vivo Dynamics
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Akatuski Saito, Takuro Uchida, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Toru Okamoto, Takeshi Kurosu, Norbert Tautz, Yoshihiro Sakoda, Tatuso Shioda, Kazuaki Chayama, Yoshiharu Matsuura
2017年09月
英語, 研究論文(国際会議プロシーディングス) - Viral secretory proteins Erns and NS1 play comparable roles with apolipoproteins in the infectious particle formation of Flaviviridae
Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Mai Shiokawa, Chikako Ono, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Asuka Sato, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Yoshiharu Matsuura
2017年06月, [査読有り]
英語, 研究論文(国際会議プロシーディングス) - Roles of miR-574-5p and miR-504-3p on the propagation of HCV in miR-122-deficient cells
Chikako Ono, Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Toru Okamoto, Kazuhiko Koike, Yoshiharu Matsuura
2017年06月, [査読有り]
英語, 研究論文(国際会議プロシーディングス) - Characterization of selective autophagy induced by HCV RNA replication
Hiroyuki Mori, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Tomokazu Tamura, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Masami Wada, Takeshi Noda, Tamotsu Yoshimori, Yoshiharu Matsuura
2017年06月, [査読有り]
英語, 研究論文(国際会議プロシーディングス) - Host-derived apolipoproteins play comparable roles with viral secretory proteins E-rns and NS1 in the infectious particle formation of Flaviviridae
Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Chikako Ono, Mai Shiokawa, Hiroyuki Mori, Kentaro Uemura, Satomi Yamamoto, Takeshi Kurihara, Toru Okamoto, Ryosuke Suzuki, Kentaro Yoshii, Takeshi Kurosu, Manabu Igarashi, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Yoshiharu Matsuura
PLOS PATHOGENS, 13, 6, e1006475, PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 2017年06月, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), Amphipathic alpha-helices of exchangeable apolipoproteins have shown to play crucial roles in the formation of infectious hepatitis C virus (HCV) particles through the interaction with viral particles. Among the Flaviviridae members, pestivirus and flavivirus possess a viral structural protein E-rns or a non-structural protein 1 (NS1) as secretory glycoproteins, respectively, while Hepacivirus including HCV has no secretory glycoprotein. In case of pestivirus replication, the C-terminal long amphipathic alpha-helices of E-rns are important for anchoring to viral membrane. Here we show that host-derived apolipoproteins play functional roles similar to those of virally encoded E-rns and NS1 in the formation of infectious particles. We examined whether E-rns and NS1 could compensate for the role of apolipoproteins in particle formation of HCV in apolipoprotein B (ApoB) and ApoE double-knockout Huh7 (BE-KO), and nonhepatic 293T cells. We found that exogenous expression of either E-rns or NS1 rescued infectious particle formation of HCV in the BE-KO and 293T cells. In addition, expression of apolipoproteins or NS1 partially rescued the production of infectious pestivirus particles in cells upon electroporation with an E-rns-deleted non-infectious RNA. As with exchangeable apolipoproteins, the C-terminal amphipathic alpha-helices of E-rns play the functional roles in the formation of infectious HCV or pestivirus particles. These results strongly suggest that the host-and virus-derived secretory glycoproteins have overlapping roles in the viral life cycle of Flaviviridae, especially in the maturation of infectious particles, while E-rns and NS1 also participate in replication complex formation and viral entry, respectively. Considering the abundant hepatic expression and liver-specific propagation of these apolipoproteins, HCV might have evolved to utilize them in the formation of infectious particles through deletion of a secretory viral glycoprotein gene. - Genetic and virulence characterization of classical swine fever viruses isolated in Mongolia from 2007 to 2015
Bazarragchaa Enkhbold, Munkhduuren Shatar, Shiho Wakamori, Tomokazu Tamura, Takahiro Hiono, Keita Matsuno, Masatoshi Okamatsu, Takashi Umemura, Batchuluun Damdinjav, Yoshihiro Sakoda
VIRUS GENES, 53, 3, 418, 425, SPRINGER, 2017年06月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), Classical swine fever (CSF), a highly contagious viral disease affecting domestic and wild pigs in many developing countries, is now considered endemic in Mongolia, with 14 recent outbreaks in 2007, 2008, 2011, 2012, 2014, and 2015. For the first time, CSF viruses isolated from these 14 outbreaks were analyzed to assess their molecular epidemiology and pathogenicity in pigs. Based on the nucleotide sequences of their 5'-untranslated region, isolates were phylogenetically classified as either sub-genotypes 2.1b or 2.2, and the 2014 and 2015 isolates, which were classified as 2.1b, were closely related to isolates from China and Korea. In addition, at least three different viruses classified as 2.1b circulated in Mongolia. Experimental infection of the representative isolate in 2014 demonstrated moderate pathogenicity in 4-week-old pigs, with relatively mild clinical signs. Understanding the diversity of circulating CSF viruses gleans insight into disease dynamics and evolution, and may inform the design of effective CSF control strategies in Mongolia. - Characterization of miR-122-independent propagation of HCV
Chikako Ono, Takasuke Fukuhara, Daisuke Motooka, Shota Nakamura, Daisuke Okuzaki, Satomi Yamamoto, Tomokazu Tamura, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Kentaro Uemura, Yuzy Fauzyah, Takeshi Kurihara, Takahiro Suda, Akira Nishio, Su Su Hmwe, Toru Okamoto, Tomohide Tatsumi, Tetsuo Takehara, Kazuaki Chayama, Takaji Wakita, Kazuhiko Koike, Yoshiharu Matsuura
PLoS Pathogens, 13, 5, PUBLIC LIBRARY SCIENCE, 2017年05月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), © 2017 Ono et al. miR-122, a liver-specific microRNA, is one of the determinants for liver tropism of hepatitis C virus (HCV) infection. Although miR-122 is required for efficient propagation of HCV, we have previously shown that HCV replicates at a low rate in miR-122-deficient cells, suggesting that HCV-RNA is capable of propagating in an miR-122-independent manner. We herein investigated the roles of miR-122 in both the replication of HCV-RNA and the production of infectious particles by using miR-122-knockout Huh7 (Huh7-122KO) cells. A slight increase of intracellular HCV-RNA levels and infectious titers in the culture supernatants was observed in Huh7-122KO cells upon infection with HCV. Moreover, after serial passages of HCV in miR-122-knockout Huh7.5.1 cells, we obtained an adaptive mutant, HCV122KO, possessing G28A substitution in the 5’UTR of the HCV genotype 2a JFH1 genome, and this mutant may help to enhance replication complex formation, a possibility supported by polysome analysis. We also found the introduction of adaptive mutation around miR-122 binding site in the genotype 1b/2a chimeric virus, which originally had an adenine at the nucleotide position 29. HCV122KOexhibited efficient RNA replication in miR-122-knockout cells and non-hepatic cells without exogenous expression of miR-122. Competition assay revealed that the G28A mutant was dominant in the absence of miR-122, but its effects were equivalent to those of the wild type in the presence of miR-122, suggesting that the G28A mutation does not confer an advantage for propagation in miR-122-rich hepatocytes. These observations may explain the clinical finding that the positive rate of G28A mutation was higher in miR-122-deficient PBMCs than in the patient serum, which mainly included the hepatocyte-derived virus from HCV-genotype-2a patients. These results suggest that the emergence of HCV mutants that can propagate in non-hepatic cells in an miR-122-independent manner may participate in the induction of extrahepatic manifestations in chronic hepatitis C patients. - Quasispecies of Hepatitis C Virus Participate in Cell-Specific Infectivity.
Takasuke Fukuhara, Satomi Yamamoto, Chikako Ono, Shota Nakamura, Daisuke Motooka, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Asuka Sato, Tomokazu Tamura, Takashi Motomura, Toru Okamoto, Michio Imamura, Toru Ikegami, Tomoharu Yoshizumi, Yuji Soejima, Yoshihiko Maehara, Kazuaki Chayama, Yoshiharu Matsuura
Scientific reports, 7, 45228, 45228, NATURE PUBLISHING GROUP, 2017年03月22日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), It is well documented that a variety of viral quasispecies are found in the patients with chronic infection of hepatitis C virus (HCV). However, the significance of quasispecies in the specific infectivity to individual cell types remains unknown. In the present study, we analyzed the role of quasispecies of the genotype 2a clone, JFH1 (HCVcc), in specific infectivity to the hepatic cell lines, Huh7.5.1 and Hep3B. HCV RNA was electroporated into Huh7.5.1 cells and Hep3B/miR-122 cells expressing miR-122 at a high level. Then, we adapted the viruses to Huh7 and Hep3B/miR-122 cells by serial passages and termed the resulting viruses HCVcc/Huh7 and HCVcc/Hep3B, respectively. Interestingly, a higher viral load was obtained in the homologous combination of HCVcc/Huh7 in Huh7.5.1 cells or HCVcc/Hep3B in Hep3B/miR-122 cells compared with the heterologous combination. By using a reverse genetics system and deep sequence analysis, we identified several adaptive mutations involved in the high affinity for each cell line, suggesting that quasispecies of HCV participate in cell-specific infectivity. - Non-canonical LC3 lipidation induced by HCV inhibits autophagic flux
Hiroyuki Mori, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Tomokazu Tamura, Satomi Yamamoto, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Masami Wada, Takeshi Noda, Tamotsu Yoshimori, Yoshiharu Matsuura
2016年10月, [査読有り]
英語, 研究論文(その他学術会議資料等) - Double nicking by Cas9-Nickase with pair sgRNAs cleaves HBV genome
Takeshi Kurihara, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Tomokazu Tamura, Toru Okamoto, Yoshiharu Matsuura
2016年10月, [査読有り]
英語, 研究論文(その他学術会議資料等) - The roles of secretory glycoproteins in viral particle formation in family Flaviviridae
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Mai Shiokawa, Chikako Ono, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Toru Okamoto, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Yoshiharu Matsuura
2016年10月, [査読有り]
英語, 研究論文(その他学術会議資料等) - Viral secretory glycoproteins of Flaviviridae virus have similar roles with apolipoproteins on the formation of infectious HCV particles
Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Mai Shiokawa, Chikako Ono, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Yoshiharu Matsuura
2016年10月, [査読有り]
英語, 研究論文(その他学術会議資料等) - Human Cathelicidin Compensates for the Role of Apolipoproteins in Hepatitis C Virus Infectious Particle Formation
Francesc Puig-Basagoiti, Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Chikako Ono, Kentaro Uemura, Yukako Kawachi, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Toru Okamoto, Hideki Aizaki, Yoshiharu Matsuura
JOURNAL OF VIROLOGY, 90, 19, 8464, 8477, AMER SOC MICROBIOLOGY, 2016年10月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), Exchangeable apolipoproteins (ApoA, -C, and -E) have been shown to redundantly participate in the formation of infectious hepatitis C virus (HCV) particles during the assembly process, although their precise role in the viral life cycle is not well understood. Recently, it was shown that the exogenous expression of only short sequences containing amphipathic alpha-helices from various apolipoproteins is sufficient to restore the formation of infectious HCV particles in ApoB and ApoE double-gene-knockout Huh7 (BE-KO) cells. In this study, through the expression of a small library of human secretory proteins containing amphipathic alpha-helix structures, we identified the human cathelicidin antimicrobial peptide (CAMP), the only known member of the cathelicidin family of antimicrobial peptides (AMPs) in humans and expressed mainly in bone marrow and leukocytes. We showed that CAMP is able to rescue HCV infectious particle formation in BE-KO cells. In addition, we revealed that the LL-37 domain in CAMP containing amphipathic alpha-helices is crucial for the compensation of infectivity in BE-KO cells, and the expression of CAMP in nonhepatic 293T cells expressing claudin 1 and microRNA miR-122 confers complete propagation of HCV. These results suggest the possibility of extrahepatic propagation of HCV in cells with low-level or no expression of apolipoproteins but expressing secretory proteins containing amphipathic alpha-helices such as CAMP.
IMPORTANCE
Various exchangeable apolipoproteins play a pivotal role in the formation of infectious HCV during the assembly of viral particles, and amphipathic alpha-helix motifs in the apolipoproteins have been shown to be a key factor. To the best of our knowledge, we have identified for the first time the human cathelicidin CAMP as a cellular protein that can compensate for the role of apolipoproteins in the life cycle of HCV. We have also identified the domain in CAMP that contains amphipathic alpha-helices crucial for compensation and show that the expression of CAMP in nonhepatic cells expressing claudin 1 and miR-122 confers complete propagation of HCV. We speculate that low levels of HCV propagation might be possible in extrahepatic tissues expressing secretory proteins containing amphipathic alpha-helices without the expression of apolipoproteins. - Is the optimal pH for membrane fusion in host cells by avian influenza viruses related to host range and pathogenicity?
Masatoshi Okamatsu, Yurie Motohashi, Takahiro Hiono, Tomokazu Tamura, Kazuki Nagaya, Keita Matsuno, Yoshihiro Sakoda, Hiroshi Kida
ARCHIVES OF VIROLOGY, 161, 8, 2235, 2242, SPRINGER WIEN, 2016年08月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), Influenza viruses isolated from wild ducks do not replicate in chickens. This fact is not explained solely by the receptor specificity of the hemagglutinin (HA) from such viruses for target host cells. To investigate this restriction in host range, the fusion activities of HA molecules from duck and chicken influenza viruses were examined. Influenza viruses A/duck/Mongolia/54/2001 (H5N2) (Dk/MNG) and A/chicken/Ibaraki/1/2005 (H5N2) (Ck/IBR), which replicate only in their primary hosts, were used. The optimal pH for membrane fusion of Ck/IBR was 5.9, higher than that of Dk/MNG at 4.9. To assess the relationship between the optimal pH for fusion and the host range of avian influenza viruses, the optimal pH for fusion of 55 influenza virus strains isolated from ducks and chickens was examined. No correlation was found between the host range and optimal pH for membrane fusion by the viruses, and this finding applied also to the H5N1 highly pathogenic avian influenza viruses. The optimal pH for membrane fusion for avian influenza viruses was shown to not necessarily be correlated with their host range or pathogenicity in ducks and chickens. - HUMAN CATHELICIDIN CAN COMPENSATE THE ROLE OF APOLIPOPROTEINS IN THE FORMATION OF INFECTIOUS HCV PARTICLES
Tomokazu Tamura, Francesc Puig-Basagoiti, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Toru Okamoto, Yoshiharu Matsuura
2016年06月, [査読有り]
英語, 研究論文(国際会議プロシーディングス) - VLDLR HAS A REDUNDANT ROLE WITH SR-B1 AND LDLR IN THE ENTRY OF LIPIDASSOCIATED HCV
Takasuke Fukuhara, Satomi Yamamoto, Chikako Ono, Tomokazu Tamura, Hiroyuki Mori, Yukako Kawachi, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Yoshiharu Matsuura
2016年06月, [査読有り]
英語, 研究論文(国際会議プロシーディングス) - Genetic and antigenic characterization of bovine viral diarrhea viruses isolated from cattle in Hokkaido, Japan
Yuri Abe, Tomokazu Tamura, Shiho Torii, Shiho Wakamori, Makoto Nagai, Kazuya Mitsuhashi, Junki Mine, Yuri Fujimoto, Naofumi Nagashima, Fumi Yoshino, Yukihiko Sugita, Takushi Nomura, Masatoshi Okamatsu, Hiroshi Kida, Yoshihiro Sakoda
JOURNAL OF VETERINARY MEDICAL SCIENCE, 78, 1, 61, 70, JAPAN SOC VET SCI, 2016年01月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), In our previous study, we genetically analyzed bovine viral diarrhea viruses (BVDVs) isolated from 2000 to 2006 in Japan and reported that subgenotype 1b viruses were predominant. In the present study, 766 BVDVs isolated from 2006 to 2014 in Hokkaido, Japan, were genetically analyzed to understand recent epidemics. Phylogenetic analysis based on nucleotide sequences of the 5'-untranslated region of viral genome revealed that 766 isolates were classified as genotype 1 (BVDV-1; 544 isolates) and genotype 2 (BVDV-2; 222). BVDV-1 isolates were further divided into BVDV-la (93), 1b (371) and 1c (80) subgenotypes, and all BVDV-2 isolates were grouped into BVDV-2a subgenotype (222). Further comparative analysis was performed with BVDV-1a, 1b and 2a viruses isolated from 2001 to 2014. Phylogenetic analysis based on nucleotide sequences of the viral glycoprotein E2 gene, a major target of neutralizing antibodies, revealed that BVDV-1a, 1b and 2a isolates were further classified into several clusters. Cross-neutralization tests showed that BVDV-1b isolates were antigenically different from BVDV-1a isolates, and almost BVDV-1a, 1b and 2a isolates were antigenically similar among each subgenotype and each E2 cluster. Taken together, BVDV-1b viruses are still predominant, and BVDV-2a viruses have increased recently in Hokkaido, Japan. Field isolates of BVDV-1a, 1b and 2a show genetic diversity on the E2 gene with antigenic conservation among each subgenotype during the last 14 years. - Apolipoproteins and viral secretory glycoproteins participate in the infectious particle formation of Flaviviridae
Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Mai Shiokawa, Chikako Ono, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Toru Okamoto, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Yoshiharu Matsuura
2015年11月, [査読有り]
英語, 研究論文(その他学術会議資料等) - Host or virus derived secretory membrane binding proteins are involved in formation of infectious Flavivirus particles
Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Mai Shiokawa, Chikako Ono, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Puig-Basagoiti Francesc, Toru Okamoto, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Yoshiharu Matsuura
2015年11月, [査読有り]
英語, 研究論文(その他学術会議資料等) - Intracellular membrane association of classical swine fever virus NS4B is critical for viral RNA replication
Tomokazu Tamura, Nicolas Ruggli, Masatoshi Okamatsu, Keita Matsuno, Yoshihiro Sakoda
2015年11月, [査読有り]
日本語, 研究論文(その他学術会議資料等) - Intracellular membrane association of the N-terminal domain of classical swine fever virus NS4B determines viral genome replication and virulence
Tomokazu Tamura, Nicolas Ruggli, Naofumi Nagashima, Masatoshi Okamatsu, Manabu Igarashi, Junki Mine, Martin A. Hofmann, Matthias Liniger, Artur Summerfield, Hiroshi Kida, Yoshihiro Sakoda
JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY, 96, 9, 2623, 2635, SOC GENERAL MICROBIOLOGY, 2015年09月, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), Classical swine fever virus (CSFV) causes a highly contagious disease in pigs that can range from a severe haemorrhagic fever to a nearly unapparent disease, depending on the virulence of the virus strain. Little is known about the viral molecular determinants of CSFV virulence. The nonstructural protein NS4B is essential for viral replication. However, the roles of CSFV NS4B in viral genome replication and pathogenesis have not yet been elucidated. NS4B of the GPE(-) vaccine strain and of the highly virulent Eystrup strain differ by a total of seven amino acid residues, two of which are located in the predicted trans-membrane domains of NS4B and were described previously to relate to virulence, and five residues clustering in the N-terminal part. In the present study, we examined the potential role of these five amino acids in modulating genome replication and determining pathogenicity in pigs. A chimeric low virulent GPE(-)-derived virus carrying the complete Eystrup NS4B showed enhanced pathogenicity in pigs. The in vitro replication efficiency of the NS4B chimeric GPE- replicon was significantly higher than that of the replicon carrying only the two Eystrup-specific amino acids in NS4B. In silico and in vitro data suggest that the N-terminal part of NS4B forms an amphipathic a-helix structure. The N-terminal NS4B with these five amino acid residues is associated with the intracellular membranes. Taken together, this is the first gain-of-function study showing that the N-terminal domain of NS4B can determine CSFV genome replication in cell culture and viral pathogenicity in pigs. - Genetic and antigenic characterization of H5 and H7 influenza viruses isolated from migratory water birds in Hokkaido, Japan and Mongolia from 2010 to 2014
Takahiro Hiono, Ayako Ohkawara, Kohei Ogasawara, Masatoshi Okamatsu, Tomokazu Tamura, Duc-Huy Chu, Mizuho Suzuki, Saya Kuribayashi, Shintaro Shichinohe, Ayato Takada, Hirohito Ogawa, Reiko Yoshida, Hiroko Miyamoto, Naganori Nao, Wakako Furuyama, Junki Maruyama, Nao Eguchi, Gerelmaa Ulziibat, Bazarragchaa Enkhbold, Munkhduuren Shatar, Tserenjav Jargalsaikhan, Selenge Byambadorj, Batchuluun Damdinjav, Yoshihiro Sakoda, Hiroshi Kida
VIRUS GENES, 51, 1, 57, 68, SPRINGER, 2015年08月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), Migratory water birds are the natural reservoir of influenza A viruses. H5 and H7 influenza viruses are isolated over the world and also circulate among poultry in Asia. In 2010, two H5N1 highly pathogenic avian influenza viruses (HPAIVs) were isolated from fecal samples of water birds on the flyway of migration from Siberia, Russia to the south in Hokkaido, Japan. H7N9 viruses are sporadically isolated from humans and circulate in poultry in China. To monitor whether these viruses have spread in the wild bird population, we conducted virological surveillance of avian influenza in migratory water birds in autumn from 2010 to 2014. A total of 8103 fecal samples from migratory water birds were collected in Japan and Mongolia, and 350 influenza viruses including 13 H5 and 19 H7 influenza viruses were isolated. A phylogenetic analysis revealed that all isolates are genetically closely related to viruses circulating among wild water birds. The results of the antigenic analysis indicated that the antigenicity of viruses in wild water birds is highly stable despite their nucleotide sequence diversity but is distinct from that of HPAIVs recently isolated in Asia. The present results suggest that HPAIVs and Chinese H7N9 viruses were not predominantly circulating in migratory water birds; however, continued monitoring of H5 and H7 influenza viruses both in domestic and wild birds is recommended for the control of avian influenza. - The N-terminal domain of N-pro of classical swine fever virus determines its stability and regulates type I IFN production
Junki Mine, Tomokazu Tamura, Kazuya Mitsuhashi, Masatoshi Okamatsu, Sujira Parchariyanon, Wasana Pinyochon, Nicolas Ruggli, Jon-Duri Tratschin, Hiroshi Kida, Yoshihiro Sakoda
JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY, 96, 7, 1746, 1756, SOC GENERAL MICROBIOLOGY, 2015年07月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), The viral protein N-pro is unique to the genus Pestivirus within the family Flaviviridae. After autocatalytic cleavage from the nascent polyprotein, N-pro suppresses type I IFN (IFN-alpha/beta) induction by mediating proteasomal degradation of IFN regulatory factor 3 (IRF-3). Previous studies found that the N-pro-mediated IRF-3 degradation was dependent of a TRASH domain in the C-terminal half of N-pro coordinating zinc by means of the amino acid residues 0112, 0134, D136 and C138. Interestingly, four classical swine fever virus (CSFV) isolates obtained from diseased pigs in Thailand in 1993 and 1998 did not suppress IFN-alpha/beta induction despite the presence of an intact TRASH domain. Through systematic analyses, it was found that an amino acid mutation at position 40 or mutations at positions 17 and 61 in the N-terminal half of N-pro of these four isolates were related to the lack of IRF-3-degrading activity. restoring a histidine at position 40 or both a proline at position 17 and a lysine at position 61 based on the sequence of a functional N-pro contributed to higher stability of the reconstructed N-pro compared with the N-pro from the Thai isolate. This led to enhanced interaction of N-pro with IRF-3 along with its degradation by the proteasome. The results of the present study revealed that amino acid residues in the N-terminal domain of N-pro are involved in the stability of N-pro, in interaction of N-pro with IRF-3 and subsequent degradation of IRF-3, leading to downregulation of IFN-alpha/beta production. - VIRAL GENETIC DETERMINANTS OF CLASSICAL SWINE FEVER VIRUS VIRULENCE
Tomokazu Tamura, Nicolas Ruggli, Naofumi Nagashima, Masatoshi Okamatsu, Martin A. Hofmann, Hiroshi Kida, Autur Summerfield, Yoshihiro Sakoda
2015年06月, [査読有り]
英語, 研究論文(国際会議プロシーディングス) - Analysis of a pair of END+ and END− viruses derived from the same bovine viral diarrhea virus stock reveals the amino acid determinants in Npro responsible for inhibition of type I interferon production
Kozasa T, Abe Y, Mitsuhashi K, Tamura T, Aoki H, Ishimaru M, Nakamura S, Okamatsu M, Kida H, Sakoda Y
Journal of Veterinary Medical Science, 77, 5, 511, 518, JAPAN SOC VET SCI, 2015年05月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), The Exaltation of Newcastle disease virus (END) phenomenon is induced by the inhibition of type I interferon in pestivirus-infected cells in vitro, via proteasomal degradation of cellular interferon regulatory factor (IRF)-3 with the property of the viral autoprotease protein N-pro. Reportedly, the amino acid residues in the zinc-binding TRASH motif of N-pro determine the difference in characteristics between END-phenomenon-positive (END) and END-phenomenon-negative (END-) classical swine fever viruses (CSFVs). However, the basic mechanism underlying this function in bovine viral diarrhea virus (BVDV) has not been elucidated from the genomic differences between END+ and END- viruses using reverse genetics till date. In the present study, comparison of complete genome sequences of a pair of END+ and END- viruses isolated from the same virus stock revealed that there were only four amino acid substitutions (D136G, I2623V, D3148G and D3502Y) between two viruses. Based on these differences, viruses with and without mutations at these positions were generated using reverse genetics. The END assay, measurements of induced type I interferon and IRF-3 detection in cells infected with these viruses revealed that the aspartic acid at position 136 in the zinc-binding TRASH motif of N-pro was required to inhibit the production of type I interferon via the degradation of cellular IRF-3, consistently with CSFV. - Pathogenicity of border disease virus FNK2012-1 strain isolated from a pig in the natural host, sheep
Tomokazu Tamura, Junki Mine, Shiho Torii, Yuri Fujimoto, Masatoshi Okamatsu, Yoshihiro Sakoda
JOURNAL OF VETERINARY MEDICAL SCIENCE, 77, 3, 341, 343, JAPAN SOC VET SCI, 2015年03月, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), A first isolation of border disease virus (BDV) in Japan was from a pig on a farm without keeping any ruminants. Our previous study showed that this BDV, termed the FNK2012-1 strain, replicated inefficiently in swine-derived cells compared with those of ruminant origin. Pigs inoculated with this virus showed neither clinical symptoms nor viremia. In this study, we evaluated the pathogenicity of the FNK2012-1 strain in sheep, its natural host. The inoculated sheep showed clinical symptoms and transient viremia. Seroconversion was observed in the inoculated sheep. These results suggest that the FNK2012-1 strain was introduced from sheep and has not yet adapted to swine. Therefore, surveillance of border disease in Japan is necessary among both the swine and ruminant populations. - Molecular, biological, and antigenic characterization of a Border disease virus isolated from a pig during classical swine fever surveillance in Japan
Makoto Nagai, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Takashi Kozasa, Kaho Tominaga-Teshima, Junki Mine, Yuri Abe, Tomokazu Tamura, Tsubasa Kobayashi, Kaoru Nishine, Kentaro Tateishi, Yudai Suzuki, Mai Fukuhara, Keitaro Ohmori, Reiko Todaka, Kazuhiko Katayama, Tetsuya Mizutani, Shigeyuki Nakamura, Hiroshi Kida, Junsuke Shirai
Journal of Veterinary Diagnostic Investigation, 26, 4, 547, 552, 4, 2014年07月, [査読有り]
英語, 研究論文(学術雑誌), In the current study, molecular, biological, and antigenic analyses were performed to characterize Border disease virus (BDV) strain FNK2012-1 isolated from a pig in 2012 in Japan. The complete genome comprises 12,327 nucleotides (nt), including a large open reading frame of 11,685 nt. Phylogenetic analysis revealed that FNK2012-1 was clustered into BDV genotype 1 with ovine strains. FNK2012-1 grew in porcine, bovine, and ovine primary cells and cell lines, but grew better in bovine and ovine cells than in porcine cells. Specific pathogen-free pigs inoculated with FNK2012-1 did not show any clinical signs. Noninoculated contact control pigs also did not show clinical signs and did not seroconvert. The results suggest that FNK2012-1 may be of ruminant origin and is poorly adapted to pigs. Such observations can provide important insights into evidence for infection and transmission of BDV, which may be of ruminant origin, among pigs. © 2014 The Author(s). - Npro of classical swine fever virus contributes to pathogenicity in pigs by preventing type i interferon induction at local replication sites
Tomokazu Tamura, Naofumi Nagashima, Nicolas Ruggli, Artur Summerfield, Hiroshi Kida, Yoshihiro Sakoda
Veterinary Research, 45, 1, 47, EDP Sciences, 2014年04月17日, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), Classical swine fever (CSF) caused by CSF virus (CSFV) is a highly contagious disease of pigs. The viral protein Npro of CSFV interferes with alpha- and beta-interferon (IFN-α/β) induction by promoting the degradation of interferon regulatory factor 3 (IRF3). During the establishment of the live attenuated CSF vaccine strain GPE-, Npro acquired a mutation that abolished its capacity to bind and degrade IRF3, rendering it unable to prevent IFN-α/β induction. In a previous study, we showed that the GPE- vaccine virus became pathogenic after forced serial passages in pigs, which was attributed to the amino acid substitutions T830A in the viral proteins E2 and V2475A and A2563V in NS4B. Interestingly, during the re-adaptation of the GPE- vaccine virus in pigs, the IRF3-degrading function of Npro was not recovered. Therefore, we examined whether restoring the ability of Npro to block IFN-α/β induction of both the avirulent and moderately virulent GPE--derived virus would enhance pathogenicity in pigs. Viruses carrying the N136D substitution in Npro regained the ability to degrade IRF3 and suppress IFN-α/β induction in vitro. In pigs, functional Npro significantly reduced the local IFN-α mRNA expression in lymphoid organs while it increased quantities of IFN-α/β in the circulation, and enhanced pathogenicity of the moderately virulent virus. In conclusion, the present study demonstrates that functional Npro influences the innate immune response at local sites of virus replication in pigs and contributes to pathogenicity of CSFV in synergy with viral replication. © 2014 Tamura et al.
licensee BioMed Central Ltd. - Characterization of H7N9 influenza A viruses isolated from humans.
Tokiko Watanabe, Maki Kiso, Satoshi Fukuyama, Noriko Nakajima, Masaki Imai, Shinya Yamada, Shin Murakami, Seiya Yamayoshi, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Yoshihiro Sakoda, Emi Takashita, Ryan McBride, Takeshi Noda, Masato Hatta, Hirotaka Imai, Dongming Zhao, Noriko Kishida, Masayuki Shirakura, Robert P de Vries, Shintaro Shichinohe, Masatoshi Okamatsu, Tomokazu Tamura, Yuriko Tomita, Naomi Fujimoto, Kazue Goto, Hiroaki Katsura, Eiryo Kawakami, Izumi Ishikawa, Shinji Watanabe, Mutsumi Ito, Yuko Sakai-Tagawa, Yukihiko Sugita, Ryuta Uraki, Reina Yamaji, Amie J Eisfeld, Gongxun Zhong, Shufang Fan, Jihui Ping, Eileen A Maher, Anthony Hanson, Yuko Uchida, Takehiko Saito, Makoto Ozawa, Gabriele Neumann, Hiroshi Kida, Takato Odagiri, James C Paulson, Hideki Hasegawa, Masato Tashiro, Yoshihiro Kawaoka
Nature, 501, 7468, 551, 5, NATURE PUBLISHING GROUP, 2013年09月26日, [査読有り], [国際誌]
英語, 研究論文(学術雑誌), Avian influenza A viruses rarely infect humans; however, when human infection and subsequent human-to-human transmission occurs, worldwide outbreaks (pandemics) can result. The recent sporadic infections of humans in China with a previously unrecognized avian influenza A virus of the H7N9 subtype (A(H7N9)) have caused concern owing to the appreciable case fatality rate associated with these infections (more than 25%), potential instances of human-to-human transmission, and the lack of pre-existing immunity among humans to viruses of this subtype. Here we characterize two early human A(H7N9) isolates, A/Anhui/1/2013 (H7N9) and A/Shanghai/1/2013 (H7N9); hereafter referred to as Anhui/1 and Shanghai/1, respectively. In mice, Anhui/1 and Shanghai/1 were more pathogenic than a control avian H7N9 virus (A/duck/Gunma/466/2011 (H7N9); Dk/GM466) and a representative pandemic 2009 H1N1 virus (A/California/4/2009 (H1N1pdm09); CA04). Anhui/1, Shanghai/1 and Dk/GM466 replicated well in the nasal turbinates of ferrets. In nonhuman primates, Anhui/1 and Dk/GM466 replicated efficiently in the upper and lower respiratory tracts, whereas the replicative ability of conventional human influenza viruses is typically restricted to the upper respiratory tract of infected primates. By contrast, Anhui/1 did not replicate well in miniature pigs after intranasal inoculation. Critically, Anhui/1 transmitted through respiratory droplets in one of three pairs of ferrets. Glycan arrays showed that Anhui/1, Shanghai/1 and A/Hangzhou/1/2013 (H7N9) (a third human A(H7N9) virus tested in this assay) bind to human virus-type receptors, a property that may be critical for virus transmissibility in ferrets. Anhui/1 was found to be less sensitive in mice to neuraminidase inhibitors than a pandemic H1N1 2009 virus, although both viruses were equally susceptible to an experimental antiviral polymerase inhibitor. The robust replicative ability in mice, ferrets and nonhuman primates and the limited transmissibility in ferrets of Anhui/1 suggest that A(H7N9) viruses have pandemic potential. - Selection of Classical Swine Fever Virus with Enhanced Pathogenicity Reveals Synergistic Virulence Determinants in E2 and NS4B
Tomokazu Tamura, Yoshihiro Sakoda, Fumi Yoshino, Takushi Nomura, Naoki Yamamoto, Yuka Sato, Masatoshi Okamatsu, Nicolas Ruggli, Hiroshi Kida
JOURNAL OF VIROLOGY, 86, 16, 8602, 8613, AMER SOC MICROBIOLOGY, 2012年08月, [査読有り], [筆頭著者]
英語, 研究論文(学術雑誌), Classical swine fever virus (CSFV) is the causative agent of classical swine fever (CSF), a highly contagious disease of pigs. There are numerous CSFV strains that differ in virulence, resulting in clinical disease with different degrees of severity. Low-virulent and moderately virulent isolates cause a mild and often chronic disease, while highly virulent isolates cause an acute and mostly lethal hemorrhagic fever. The live attenuated vaccine strain GPE(-) was produced by multiple passages of the virulent ALD strain in cells of swine, bovine, and guinea pig origin. With the aim of identifying the determinants responsible for the attenuation, the GPE- vaccine virus was readapted to pigs by serial passages of infected tonsil homogenates until prolonged viremia and typical signs of CSF were observed. The GPE(-)/P-11 virus isolated from the tonsils after the 11th passage in vivo had acquired 3 amino acid substitutions in E2 (T830A) and NS4B (V2475A and A2563V) compared with the virus before passages. Experimental infection of pigs with the mutants reconstructed by reverse genetics confirmed that these amino acid substitutions were responsible for the acquisition of pathogenicity. Studies in vitro indicated that the substitution in E2 influenced virus spreading and that the changes in NS4B enhanced the viral RNA replication. In conclusion, the present study identified residues in E2 and NS4B of CSFV that can act synergistically to influence virus replication efficiency in vitro and pathogenicity in pigs.
その他活動・業績
- 海外活動紹介 留学体験記
鈴木紗織, 田村友和, 日本ウイルス学会北海道支部会報, 54, 28, 32, 2023年03月, [招待有り]
日本語, 記事・総説・解説・論説等(その他) - ヒト化マウスモデルを用いることで明らかになった肺局所免疫細胞のSARS-CoV-2感染防御における役割
田村友和, 月刊臨床免疫・アレルギー科, 79, 6, 2023年, [査読有り], [招待有り] - 北海道で流行する牛ウイルス性下痢ウイルスの遺伝子解析
安部優里, 田村友和, 峯 淳貴, 鳥居志保, 藤本悠理, 迫田義博, 北海道獣医師会雑誌, 59, 49, 51, 2015年02月, [招待有り]
日本語, 記事・総説・解説・論説等(その他)
講演・口頭発表等
- 免疫不全患者における抗コロナウイルス薬剤耐性株出現の分子機構と新規治療戦略の樹立に向けた基盤研究
田村友和
メディカル・サイエンス セミナー, 2024年11月21日, 日本語, 公開講演,セミナー,チュートリアル,講習,講義等
2024年11月21日 - 2024年11月21日, [招待講演] - 様々なスパイクタンパク質に置換した C57BL/6 マウス馴化 SARS-CoV-2 の比較解析
鈴木 理滋, 辻野 修平, 王 磊, 伊藤 駿, 鈴木 紗織, 田村 友和, 直 亨則, 松野 啓太, 田中 伸哉, 福原 崇介
第71回日本ウイルス学会学術集会, 2024年11月04日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年11月05日 - 2024年11月06日 - B型肝炎ウイルス既感染の非B非C肝細胞癌におけるB型肝炎ウイルスの影響について
齋藤 智哉, 鈴木 理滋, Rhaman Akhinur, Rajib Alam Samiul, 小林 展大, 折茂 達也, 鈴木 紗織, 田村 友和, 佐藤 賢文, 武冨 紹信, 福原 崇介
第71回日本ウイルス学会学術集会, 2024年11月04日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年11月05日 - 2024年11月06日 - COPI 複合体による B 型肝炎ウイルス複製機構の解析
小杉 優女, 鈴木 理滋, 齋藤 智哉, 馬 媛, 梁 礼涵, 鈴木 紗織, 田村 友和, 福原 崇介
第71回日本ウイルス学会学術集会, 2024年11月04日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年11月05日 - 2024年11月06日 - NEDD4-binding protein 1 は HBV RNAs を分解することで HBV の複製を抑制する
鈴木 紗織, 小林 展大, 鈴木 理滋, 坂本 裕貴, 齋藤 智哉, 泉 琢磨, 野田 暉翔, 奥崎 大介, 鐘江 裕美, 林 佐奈衣, 田中 靖人, 松浦 善治, 竹内 理, 田村 友和, 武冨 紹信, 福原 崇介
第71回日本ウイルス学会学術集会, 2024年11月04日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年11月05日 - 2024年11月06日, [招待講演] - 新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)のアクセサリータンパク質の機能解析
伊藤 駿, 田村 友和, 王 磊, 森 健人, 津田 真寿美, 鈴木 理滋, 鈴木 紗織, 吉松 組子, 田中 伸哉, 福原 崇介
第71回日本ウイルス学会学術集会, 2024年11月06日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年11月04日 - 2024年11月06日 - 免疫不全患者における新型コロナウイルス感染症の 特性と課題
市川 貴也, 田村 友和, 鈴木 理滋, 川代 啓太, 冨山 貴央, 中森 靖, 高畑 むつみ, 吉永 則良, 柿木 康孝, 上山 晟史, 鈴木 紗織, 吉住 朋晴, 堀田 記世彦, 福原 崇介
第71回日本ウイルス学会学術集会, 2024年11月05日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年11月04日 - 2024年11月06日, 43966839 - プラス鎖 RNA ウイルスの病原性と組織指向性に関する研究
田村友和
第71回日本ウイルス学会学術集会, 2024年11月05日, 英語, 口頭発表(招待・特別)
2024年11月04日 - 2024年11月06日, 43704652, [招待講演] - RNAウイルス遺伝子に認めるGC含量の偏りの意義の解析
川原 祥穂, 田村 友和, 鈴木 理滋, 鈴木 紗織, 福原 崇介
第71回日本ウイルス学会学術集会, 2024年11月04日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年11月04日 - 2024年11月06日, 46053782 - 昆虫特異的フラビウイルスによる蚊媒介性フラビウイルスの増殖干渉効果
森 健人, 田村 友和, 鈴木 理滋, 鈴木 紗織, 大場 靖子, 福原 崇介
第71回日本ウイルス学会学術集会, 2024年11月04日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年11月04日 - 2024年11月06日 - HBV由来担癌マウスを用いたCas9-NickaseシステムによるHBxノックアウト効果の検討
鈴木紗織, 鳥居志保, 小林展大, 坂本裕貴, 鈴木理滋, 田村友和, 福原崇介
第167回日本獣医学会学術集会, 2024年09月12日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年09月10日 - 2024年09月13日 - 新型コロナウイルス感染症の持続感染動物モデルの開発
田村 友和, 市川 貴也, 辻野 修, 鈴木 理滋, 鈴木 紗織, 福原 崇介
第167回日本獣医学会学術集会, 2024年09月12日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年09月10日 - 2024年09月13日, 43966839 - CPERによる感染性脳炎フラビウイルスの作出
光永早紀, 田村友和, 原崇介, 下田 宙, 早坂大輔
第167回日本獣医学会学術集会, 2024年09月10日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年09月10日 - 2024年09月13日, 45809817 - ヒトオルガノイドおよびハムスターモデルを用いたSARS-CoV-2関連コウモリコロナウイルスであるBANAL-20-236のウイルス学的性状解析
藤田 滋, Arnon Plianchaisuk, 出口 清香, 伊藤 駿, 直 亨則, 王 磊, Hesham Nasser, 田村 友和, 木村 出海, 鹿島 幸恵, 鈴木 理滋, 鈴木 紗織, 紀田 泉, 津田 真寿美, 小田 義崇, 橋本 里菜, 渡邉 幸夫, 瓜生 慧也, 山岨 大智, 郭 子毅, Alfredo Jr. Hinay, 小杉 優介, 陳 犖, 潘 琳, 郭 悠, 山本 祐樹, 永元 哲治, 長島 真美, 浅倉 弘幸, 貞升 健志, 吉村 和久, 鈴木 穣, 伊東 潤平, 池田 輝政, 田中 伸哉, 松野 啓太, 福原 崇介, 高山 和雄, 佐藤 佳
2024年09月10日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年09月10日 - 2024年09月13日 - 高速リバースジェネティクス法を用いた組換え猫コロナウイルスの作出
紀田 泉, 田村 友和, 福原 崇介, 松野 啓太
第167回日本獣医学会学術集会, 2024年09月10日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年09月10日 - 2024年09月13日 - リバースジェネティクス技術を駆使した新興再興ウイルス感染症研究
福原 崇介, 田村 友和, 鈴木 紗織
第167回日本獣医学会学術集会, 2024年09月10日, 日本語, シンポジウム・ワークショップパネル(指名)
2024年09月10日 - 2024年09月12日, 44405723 - Establishment of a rapid PCR-based reverse genetics system for feline coronavirus
Izumi Kida, Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Keita Matsuno
The 12th SaSSOH Sapporo Summer Symposium for One Health, 2024年09月05日, 英語, ポスター発表
2024年09月04日 - 2024年09月05日 - Development of an AI model for predicting antigenic properties from amino acid sequence of dengue virus envelope protein
Kento Mori, Tomokazu Tamur, Rigel Suzuki, Saori Suzuki, Takasuke Fukuhara
The 12th SaSSOH Sapporo Summer Symposium for One Health, 2024年09月04日, 英語, 口頭発表(一般)
2024年09月04日 - 2024年09月05日 - 免疫抑制下の肝臓及び腎移植患者におけるSARS-CoV-2変異株に対するワクチン効果の解析
鈴木 理滋, 川代 啓太, 冨山 貴央, 田村 友和, 鈴木 紗織, 吉住 朋晴, 堀田 記世彦, 福原 崇介
第2回新型コロナウイルス研究集会, 2024年08月03日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年08月02日 - 2024年08月04日 - SARS-CoV-2感染におけるアクセサリータンパク質の影響
伊藤 駿, 田村 友和, 王 磊, 森 健人, 津田 真寿美, 鈴木 理滋, 鈴木 紗織, 吉松 組子, 田中 伸哉, 福原 崇介
第2回新型コロナウイルス研究集会, 2024年08月03日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年08月02日 - 2024年08月04日, 43966839 - 新型コロナウイルス感染症の患者検体からの組換えウイルスの作出
山本 紘嵩, 田村 友和, 市川 貴也, 田口 裕大, 森 健人, 小栗 聡, 鈴木 理滋, 鈴木 紗織, 豊嶋 崇徳, 福原 崇介
第2回新型コロナウイルス研究集会, 2024年08月03日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年08月02日 - 2024年08月04日, 43966839 - オミクロンJN.1系統の増殖性および病原性を規定する変異の解析
辻野 修平, 田村 友和, 高山 和雄, 佐藤 佳, 田中 伸哉, 松野 啓太, 福原 崇介
第2回新型コロナウイルス研究集会, 2024年08月03日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年08月02日 - 2024年08月04日, 43966839 - 免疫不全者におけるSARS-CoV-2の持続感染と薬剤耐性ウイルスの出現
市川 貴也, 田村 友和, 上山 晟史, 高畑 むつみ, 石 尾, 井端 淳, 笠原 郁美, 皆内 康一郎, 山本 聡, 福原 崇介
第2回新型コロナウイルス研究集会, 2024年08月03日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年08月02日 - 2024年08月04日, 43966839 - オミクロンXBB亜系統で認めたアミノ酸変異のウイルス学的意義の解析
田村友和, 入江 崇, 出口清香, 矢島久乃, 津田真寿美, Hesham Nasser, 水間奎太, Arnon Plianchaisuk, 木紗織, 瓜生慧也, MST Monira Begu, 清水 凌, Michael Jonath, 木理滋, 近藤 隆, 伊藤 駿, 上山晟史, 吉松組子, Maya Shof, 橋本里菜, 安楽佑樹, 木村香菜子, 喜多俊介, 佐々木慈英, 仲勝, 小田義崇, 池田輝政, 齊藤, 野啓, 中伸哉, 佐藤, 橋口隆生, 高山和雄, 福原崇介
第2回新型コロナウイルス研究集会, 2024年08月02日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年08月02日 - 2024年08月04日, 43966839 - 昆虫特異的フラビウイルスによる蚊媒介性フラビウイルスの増殖干渉効果
森 健人, 田村 友和, 鈴木 理滋, 鈴木 紗織, 大場 靖子, 福原 崇介
第57回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2024年07月15日
2024年07月14日 - 2024年07月15日 - B型肝炎ウイルスの複製を阻害する新規化合物の同定及び機能解析
馬 媛, Yuzy Fauzyah, 鈴木 理滋, 齋藤 智哉, 梁 礼涵, 小杉 優女, 鈴木 紗織, 田村, 友和, 小野 慎子, 松浦善治, 福原 崇介
第57回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2024年07月14日, 日本語
2024年07月14日 - 2024年07月15日 - HBc抗体陽性非ウイルス性肝細胞癌のHBVゲノム挿入部位の同定
梁 礼涵, 齋藤 智哉, 鈴木 理滋, Akhinur Rhaman, Samiul Alam Raji, 小杉 優女, 馬 媛, 鈴木 紗織, 田村 友和, 佐藤 賢文, 武冨 紹信, 福原 崇介
第57回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2024年07月14日, 日本語
2024年07月14日 - 2024年07月15日 - COPI複合体による B 型肝炎ウイルス複製機構の解析
小杉 優女, 鈴木 理滋, 齋藤 智哉, 馬 媛, 梁 礼涵, 鈴木 紗織, 田村 友和, 福原, 崇介
第57回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2024年07月14日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年07月14日 - 2024年07月15日 - 新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)のアクセサリータンパク質の機能解析
伊藤 駿, 田村 友和, 王 磊, 森 健人, 津田 真寿美, 鈴木 理滋, 鈴木 紗織, 吉松, 組子, 田中 伸哉, 福原 崇介
第57回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2024年07月14日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年07月14日 - 2024年07月15日, 43966839 - 新型コロナウイルス感染症の患者検体からの組換えウイルスの作出
山本 紘嵩, 田村 友和, 市川 貴也, 田口 裕大, 森 健人, 小栗 聡, 鈴木 理滋, 木 紗織, 豊嶋 崇徳, 福原 崇介
第57回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2024年07月14日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年07月14日 - 2024年07月15日, 44405723 - CPER による感染性脳炎フラビウイルスの作出
光永早紀, 田村友和, 福原崇介, 下田 宙, 早坂大輔
第 58 回日本脳炎ウイルス生態学研究会, 2024年06月28日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年06月28日 - 2024年06月29日 - Akaluc bioluminescence offers superior sensitivity to track in vivo dynamics of SARS-CoV-2 infection
Tomokazu Tamura, Hayato Ito, Shiho Torii, Lei Wang, Rigel Suzuki, Shuhei Tusjino, Akifumi Kamiyama, Yoshitaka Oda, Yuhei Morioka, Saori Suzuki, Kotaro Shirakawa, Kei Sato, Kumiko Yoshimatsu, Yoshiharu Matsuura, Satoshi Iwano, Shinya Tanaka, Takasuke Fukuhara
World Vaccine Congress Washington 2024, 2024年04月02日, 英語, ポスター発表
2024年04月02日 - 2024年04月05日, 44405723 - C型肝炎ウイルスのGC含量の意義の解明
田村友和, 森岡佑平, 茶山一彰, 松浦善治, 福原崇介
第12回肝炎ウイルス研修会, 2024年03月14日, 日本語, 口頭発表(一般)
2024年03月14日 - 2024年03月14日 - Potent antigen-specific T-cell responses by saRNA vaccine expressing membrane-anchored RBD against SARS-CoV-2
Takuto Nogimori, Mai Komori, Yuji Masuta, Hirotaka Ode, Tomokazu Tamura, Rigel Suzuki, Kenta Matsuda, Takasuke Fukuhara, Yasumasa Iwatani, Wataru Akahata, Takuya Yamamoto
第52回日本免疫学会学術集会, 2024年01月19日, 英語, ポスター発表
2024年01月17日 - 2024年01月19日 - An Experimental Platform for Dengue Research
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara
Joint International Tropical Medicine Meeting 2023, 2023年12月13日, 英語, シンポジウム・ワークショップパネル(指名)
2023年12月13日 - 2023年12月15日, 43704744, [招待講演] - 血液悪性腫瘍患者におけるSARS-CoV-2の持続感染に関する前向き研究.
市川 貴也, 田村 友和, 高畑 むつみ, 石尾 崇, 井端 淳, 笠原 郁美, 皆内 康一郎, 山本 聡, 福原 崇介
第85回日本血液学会学術集会, 2023年10月15日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年10月13日 - 2023年10月15日, 43704644 - SARS-CoV-2の細胞侵入に関わる宿主補助因子のmicroMap解析
鈴木紗織, Jacob Geri, Steve Knutson, Harris Bell-Temi, 鈴木理滋, 田村友和, 福原崇介, David Fernandez, Gabby Love, Beryl Li, Zhe Do ng, Nick Till, David W.C. MacMillan, Alexander Ploss
第9回北大・部局横断シンポジウム, 2023年10月11日, 日本語, ポスター発表
2023年10月11日 - 2023年10月11日 - 新型コロナウイルス オミクロン亜株のモデル動物ハムスターにおける病原性
田村 友和, 伊東 潤平, 鈴木 理滋, 直 亨則, 小田 義崇, 瓜生 慧也, 伊藤 駿, 王 磊, 紀田 泉, 板倉 友香里, 津田 真寿美, 鈴木 紗織, 松野 啓太, 田中 伸哉, 佐藤 佳, 福原 崇介
第70回日本ウイルス学会学術集会, 2023年09月28日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年09月26日 - 2023年09月28日 - 長波長の発光レポーターAkalucレポーターを利用した新型コロナウイルスの生体イメージング 技術の開発
伊藤 駿, 田村 友和, 鈴木 理滋, 鳥居 志保, 森岡 佑平, 白川 康太郎, 鈴木 紗織, 佐藤 佳, 松浦 善治, 岩野 智, 福原 崇介
第70回日本ウイルス学会学術集会, 2023年09月27日, 日本語, ポスター発表
2023年09月26日 - 2023年09月28日, 43704643 - レポーター遺伝子搭載新型コロナウイルスを用いたハイスループット中和試験法の開発
上山 晟史, 鈴木 理滋, 田村 友和, 鈴木 紗織, 福原 崇介
第70回日本ウイルス学会学術集会, 2023年09月27日, 日本語, ポスター発表
2023年09月26日 - 2023年09月28日 - 血液悪性腫瘍患者におけるSARS-CoV-2の持続感染に関する前向き研究
市川 貴也, 田村 友和, 高畑 むつみ, 石尾 崇, 井端 淳, 笠原 郁美, 皆内 康一郎, 山本 聡, 福原 崇介
第70回日本ウイルス学会学術集会, 2023年09月27日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年09月26日 - 2023年09月28日 - ハムスターモデルにおける SARS-CoV-2 mRNA ワ クチン接種による imprinted immunity の検証
藤田 滋, 瓜生 慧也, 潘 琳, 伊東 潤平, 直 亨則, 田畑 耕史郎, 岸本 麻衣, 板倉 友香里, 澤 洋文, 紀田 泉, 田村 友和, 福原 崇介, 松野 啓太, 佐藤 佳
第70回日本ウイルス学会学術集会, 2023年09月26日, 日本語, ポスター発表
2023年09月26日 - 2023年09月28日 - 新型コロナウイルス感染症の患者検体からの組換えウイルスの作出
山本 紘嵩, 田村 友和, 市川 貴也, 鈴木 紗織, 鈴木 理滋, 豊嶋 崇徳, 山本 聡, 福原 崇介
第70回日本ウイルス学会学術集会, 2023年09月26日, 日本語, ポスター発表
2023年09月26日 - 2023年09月28日 - 肝臓及び腎移植患者の免疫抑制下におけるSARS-CoV-2変異株に対するワクチン効果の検討
鈴木 理滋, 川代 啓太, 冨山 貴央, 田村 友和, 鈴木 紗織, 吉住 朋晴, 堀田 記世彦, 福原 崇介
第70回日本ウイルス学会学術集会, 2023年09月26日, 日本語, ポスター発表
2023年09月26日 - 2023年09月28日 - Cas9-Nickaseシステムを用いたHBxノックアウトによる肝がん形成の抑制
坂本 裕貴, 鳥居 志保, 小林 展大, 齋藤 智哉, 鈴木 紗織, 鈴木 理滋, 田村 友和, 福原 崇介
第70回日本ウイルス学会学術集会, 2023年09月26日, 日本語, ポスター発表
2023年09月26日 - 2023年09月28日 - 光触媒によるSARS-CoV2のエントリーに関わる宿主補助因子のスクリーニング解析
鈴木 紗織, Jacob Geri, Steve Knutson, Harris Bell-temin, 鈴木 理滋, 田村 友和, 福原 崇介, David Fernandez, Gabby Love, Beryl Li, Zhe Dong, Nick Till, David W.C. Macmillan, Alexander Ploss
第70回日本ウイルス学会学術集会, 2023年09月26日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年09月26日 - 2023年09月28日 - 新型コロナウイルスのマウスへの感染性を規定するスパイクタンパク質とACE2の責任アミノ酸の同定
近藤 隆, 鈴木 理滋, 川原 祥穂, 山谷 昂大, 鈴木 紗織, 田村 友和, 福原 崇介
第70回日本ウイルス学会学術集会, 2023年09月26日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年09月26日 - 2023年09月28日 - CPER による脳炎フラビウイルス感染性粒子の作出
光永早紀, 田村友和, 福原 崇介, 下田宙, 早坂大輔
第 29回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会, 2023年09月25日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年09月25日 - 2023年09月25日 - 牛ウイルス性下痢ウイルスの迅速な組換えウイルスの作出
田村友和, 荻野 紗帆, 日尾野 隆大, 鈴木 理滋, 鈴木 紗織, 磯田 典和, 迫田 義博, 福原 崇介
第166回日本獣医学会学術集会, 2023年09月05日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年09月05日 - 2023年09月08日, 43704658 - SARS-CoV2 の XBB 系統の性状解析
Saori Suzuki, Tomokazu Tamura, Rigel Suzuki, Takashi Kondo, Jumpei Ito, Naganori Nao, Yoshitaka Oda, Keiya Uriu, Lei Wang, Izumi Kida, Yukari Itakura, Masumi Tsuda, Keita Matsuno, Shinya Tanaka, Hayato Ito, The Genotype to Phenotype Japan Consortium, Kei Sato, Takasuke Fukuhara
第56回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2023年07月16日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年07月15日 - 2023年07月16日 - Cas9-Nickase 技術を用いた HBx ノックアウトによる肝がん形成への影響
鈴木 理滋, 坂本 裕貴, 鳥居 志保, 小林 展大, 齋藤 智哉, 鈴木 紗織, 田村 友和, 福原 崇 介
第56回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2023年07月16日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年07月15日 - 2023年07月16日 - 新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)感染の生体での非侵襲的ライブイメージング技術の開発
田村 友和, 伊藤 駿, 鈴木 理滋, 鳥居 志保, 森岡 佑平, 白川 康太郎, 鈴木 紗織, 佐藤 佳, 松浦 善治, 岩野 智, 福原 崇介
第56回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2023年07月16日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年07月15日 - 2023年07月16日, 43704643 - レポーター遺伝子搭載 新型コロナウイルスを用いたハイスループット中和試験法の開発
上山 晟史, 鈴木 理滋, 田村 友和, 鈴木 紗織, 福原 崇介
第56回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2023年07月15日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年07月15日 - 2023年07月16日 - Comparative characterization of SARS-CoV-2 Omicron subvariants including BA.1, BA.2, and BA.5
Tomokazu Tamura, Daichi Yamasoba, Yoshitaka Oda, Jumpei Ito, Tomoko Kamasaki, Naganori Nao, Rina Hashimoto, Yoichiro Fujioka, Rigel Suzuki, Lei Wang, Hayato Ito, Yukie Kashima, Izumi Kimura, Mai Kishimoto, Masumi Tsuda, Hirofumi Sawa, Kumiko Yoshimatsu, Tetsuharu Nagamoto, Jun Kanamune, Yutaka Suzuki, Yusuke Ohba, Isao Yokota, Keita Matsuno, Kazuo Takayama, Shinya Tanaka, Kei Sato, Takasuke Fukuhara
American Society for Virology 2023 Meeting, 2023年06月27日, 英語, 口頭発表(一般)
2023年06月23日 - 2023年06月28日, 43704729 - 数理モデルと分子動力学シミュレーションを用いたレムデシビル 耐性 SARS-CoV-2変異体の解析
鈴木 理滋, 鳥居 志保, キム カンス, 小関 準, 岩波 翔也, 藤田 泰久, ジョン ヨン ダ, 伊東 潤平, 田村 友和, 佐藤 佳, 松浦 善治, 島村 徹平, 岩見 真吾, 福原 崇介
第1回新型コロナウイルス研究集会, 2023年06月08日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年06月08日 - 2023年06月09日 - オミクロン BA.2のウイルス学的特徴を規定する変異の探索
瓜生 慧也, 木村 出海, 山岨 大智, Nasser Hesham, 伊藤 駿, Wu Jiaq, 藤田 滋, 佐々木 慈, 田村 友和, 鈴木 理滋, 出口 清香, The Genotype to Phenotype, Japan Consortium, 白川 康太郎, 高山 和雄, 入江 崇, 橋口 隆生, 中川 草, 福原 崇介, 齊藤 暁, 池田 輝
第1回新型コロナウイルス研究集会, 2023年06月08日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年06月08日 - 2023年06月09日 - 蛍光イメージングを用いた SARS-CoV-2宿主細胞 侵入機構の解析
藤岡 容一朗, 鬼塚 洋之進, 田村 友和, 柏木 彩花, 島田 琉海, 小澤 史弥, 吉田 藍子, 釜崎 とも子, 酒井 信明, 天野 麻穂, 福原 崇介, 大場 雄介
第1回新型コロナウイルス研究集会, 2023年06月08日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年06月08日 - 2023年06月09日, 43704643 - 新型コロナウイルス( SARS-CoV-2)感染の生体 でのライブイメージング技術の開発
田村 友和, 伊藤 駿, 鈴木 理滋, 鳥居 志保, 森岡 佑平, 鈴木 紗織, 松浦 善治, 岩野 智, 福原 崇介
第1回新型コロナウイルス研究集会, 2023年06月08日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年06月08日 - 2023年06月09日, 43704643 - 新型コロナウイルス( SARS-CoV-2)のマウスへの 感染性を規定する因子の解明
近藤 隆, 鈴木 理滋, 川原 祥穂, 田村 友和, 山谷 昂大, 鈴木 紗織, 福原 崇介
第1回新型コロナウイルス研究集会, 2023年06月08日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年06月08日 - 2023年06月09日 - COVID-19ワクチン効果の迅速評価技術の開発と免 疫抑制者血清を用いたその実証
伊藤 駿, 鈴木 理滋, 冨山 貴央, 田村 友和, 鈴木 紗織, 吉住 朋晴, 福原 崇介
第1回新型コロナウイルス研究集会, 2023年06月08日, 日本語, 口頭発表(一般)
2023年06月08日 - 2023年06月09日 - 数理モデルと分子動力学シミュレーションを用いたレムデシビル耐性 SARS- CoV-2変異株の解析
鈴木 理滋, 鳥居 志保, キム クァンス, 小関 準, 岩波 翔也, 藤田 泰久, チョン ヨン ダム, 田村 友和, 松浦 善治, 島村 徹平, 岩見 真吾, 福原 崇介
第69回日本ウイルス学会学術集会, 2022年11月14日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年11月13日 - 2022年11月15日 - フラビウイルスの粒子産生における分泌型 NS1タンパク質の役割
田村 友和, 鳥居 志保, 梶原 健太郎, 安齋 樹, 藤岡 容一朗, 野田 暉翔, 田鍬 修平, 森岡 佑平, 鈴木 理滋, Fauzyah Yuzy, 小野 慎子, 大場 雄介, 岡田 雅人, 福原 崇介, 松浦 善治
第69回日本ウイルス学会学術集会, 2022年11月14日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年11月13日 - 2022年11月15日 - SARS-CoV-2 BA.2株に由来する亜株の性状解析
木村 出海, 山岨 大智, 田村 友和, 直亨則, 伊 東 潤, 松野 啓, 洋, 福原 崇介, 佐藤 佳
第69回日本ウイルス学会学術集会, 2022年11月14日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年11月13日 - 2022年11月15日 - 高速リーバースジェネティクスのキャップ非依存性 +ssRNAウイルスへの応用
山本 紘嵩, 田村 友和, 伊藤 駿, 鈴木 理滋, 福原 崇介
第69回日本ウイルス学会学術集会, 2022年11月13日, 日本語
2022年11月13日 - 2022年11月15日 - 肝疾患患者の変異株に対するワクチン効果の評価系 の確立と免疫抑制の影響
伊藤 駿, 冨山 貴央, 鈴木 理滋, 田村 友和, 吉住朋晴, 福原 崇介
第69回日本ウイルス学会学術集会, 2022年11月13日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年11月13日 - 2022年11月15日 - HBV感染に関与する RNA結合タンパク質の同定と その機能解析
小林 展大, 齋藤 智哉, 鈴木 理滋, 田村 友和, 武冨 紹信, 福原 崇介
第69回日本ウイルス学会学術集会, 2022年11月13日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年11月13日 - 2022年11月15日 - IRES 依存+ssRNA ウイルスへのリバースジェネティクス法の高速化
田村 友和, 山本 紘嵩, 荻野 紗帆, 日尾野 隆大, 鈴木 理滋, 鈴木 紗織, 磯田 典和, 迫田 義博, 福原 崇介
第28回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会, 2022年11月12日, 日本語
2022年11月12日 - 2022年11月12日, 44405723 - フラビウイルスの粒子産生における分泌型NS1タンパク質の役割
田村 友和, 鳥居 志保, 梶原 健太郎, 安齋 樹, 藤岡 容一郎, 野田 暉翔, 田鍬 修平, 森岡 佑平, 鈴木 理滋, Yuzy Fauzyah, 小野 慎子, 大場 雄介, 岡田 雅人, 福原 崇介, 松浦 善治
第8回北大・部局横断シンポジウム, 2022年10月28日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年10月28日 - 2022年10月28日, 43704622 - Secretory glycoprotein NS1 plays a crucial role in the particle formation of flaviviruses
Tomokazu Tamura, Shiho Torii, Kentaro Kajiwara, Itsuki Anzai, Yoichiro Fujioka, Kisho Noda, Shuhei Taguwa, Yuhei Morioka, Rigel Suzuki, Yuzy Fauzyah, Chikako Ono, Yusuke Ohba, Masato Okada, Takasuke Fukuhara, Yoshiharu Matsuura
第20回あわじ感染と免疫国際フォーラム, 2022年09月08日, 英語, ポスター発表
2022年09月07日 - 2022年09月09日, 43704652 - ヒト胎児肺を移植したヒト免疫マウスの作製とCOVID-19 の病態解析への応用
田村友和, Devin Kenney, Aoife O’Connell, Jacquelyn Turcinovic, Paige Montanaro, Ryan Hekman、Andrew R. Berneshawi, Thomas R. Cafiero, Nicholas A. Crossland、Alexander Ploss、Florian Douam
第165回日本獣医学会学術集会, 2022年09月07日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年09月06日 - 2022年09月08日 - μMap技術を用いたSARS-CoV2のエントリーに関わる宿主補助因子の同定
鈴木 紗織, Geri Jacob, Knutson Steve, ell-Temin Harris, 田村 友和, Fernandez David, Lovett Gabby, Li Beryl, Dong Zhe, Till Nick, MacMillan David WC, Ploss Alexander
第165回日本獣医学会学術集会, 2022年09月06日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年09月06日 - 2022年09月08日 - HBV 感染に関与する RNA 結合タンパク質の同定とその機能解析
小林展大, 齋藤智哉, 鈴木理滋, 田村友和, 武冨紹信, 福原崇介
第55回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2022年07月03日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年07月02日 - 2022年07月03日 - 肝疾患患者の変異株に対するワクチン効果の評価系の確立と免疫抑制の影響
伊藤駿, 冨山貴央, 鈴木理滋, 田村友和, 吉住朋晴, 福原崇介
第55回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2022年07月03日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年07月02日 - 2022年07月03日 - 数理モデルと分子動力学シミュレーションを用いたレムデシビル耐性 SARS-CoV-2 変異株の解析
鈴木理滋, 鳥居志保, キム カンス, 小関準, 岩波翔也, 藤田泰久, ジョン ヨン ダム, 田村友和, 松浦善治, 島村徹平, 岩見慎吾, 福原崇介
第55回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2022年07月03日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年07月02日 - 2022年07月03日 - 高速リバースジェネティクス法の開発とその応用研究
福原崇介, 鈴木理滋, 田村友和
第55回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2022年07月03日, 日本語
2022年07月02日 - 2022年07月03日, [招待講演] - 高速リーバースジェネティックスのIRES依存 +ssRNAウイルスへの応用
田村 友和, 山本 紘嵩, 鈴木 理滋, 福原 崇介
第55回日本ウイルス学会北海道支部夏季シンポジウム, 2022年07月03日, 日本語, 口頭発表(一般)
2022年07月02日 - 2022年07月03日 - Generation of recombinant highly virulent classical swine fever virus strain possessing a luminescent HiBiT tag as a reporter
Tan Loc Huynh, Shizuka Hirose, Tasoo Kim, Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Yoshiharu Matsuura, Takahiro Hiono, Norikazu Isono, Yoshihiro Sakoda
第68回日本ウイルス学会学術集会, 2021年11月, 英語, 口頭発表(一般)
2021年11月16日 - 2021年11月18日 - Generation and characterization of genetically and antigenically diverse infectious clones of dengue virus serotypes 1-4
Tomokazu Tamura, Jiayu Zhang, Michael P. Schwoerer, Vrinda Madan, Thomas R. Cafiero, Abhishek Biswas, Brigitte L. Heller, Wei Wang, Alexander Ploss
第68回日本ウイルス学会学術集会, 2021年11月, 英語, ポスター発表
2021年11月16日 - 2021年11月18日, 43704720 - Utilization of humanized mice model for viral infectious diseases
Tomokazu Tamura
The 6th Japan-US Science Forum in Boston, 2021年11月06日, 英語, シンポジウム・ワークショップパネル(公募)
2021年11月06日 - 2021年11月06日 - Generation of recombinant highly virulent classical swine fever virus strain possessing a luminescent HiBiT tag as a reporter
Tan Loc Huynh, 廣瀬 静香, 金 琢洙, 田村 友和, 福原 崇介, 松浦 善治, 日尾野 隆大, 磯田 典和, 迫田 義博
第164回日本獣医学会学術集会, 2021年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2021年09月19日 - 2021年09月23日 - 改良型ヒト化マウスを用いたデング熱の病態評価
田村友和, Jiayu Zhang, Michael P. Schwoerer, Vrinda Madan, Thomas R. Cafiero, Abhishek Biswas, Brigitte L. Heller, Wei Wang, Alexander Ploss
第164回日本獣医学会学術集会, 2021年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2021年09月07日 - 2021年09月13日, 43704720 - A panel of humanized mouse models to investigate human immunological signatures defining lung histopathology during SARS-CoV-2 infection
D. J. Kenney, A. K. O'Connell, J. Turcinovic, P. Montanaro, R. N. Hekman, T. Tamura, A. Berneshawi, T. Cafiero, B. Heller, H. Gertje, E. Bulli, A. Trachtenberg, E. Chavez, S. Kurnick, K. Grosz, K. Francis, N. Paragas, M. bosmann, M. Ericsson, B. R. Huber, M. Saeed, J. Connor, A. Emili, N. Crossland, A. Ploss, F. Douam
American Society for Virology 2021 Meeting, 2021年07月, 英語, 口頭発表(一般)
2021年07月19日 - 2021年07月23日 - Generation and characterization of genetically and antigenically diverse infectious clones of dengue virus serotypes 1-4
Tomokazu Tamura, Jiayu Zhang, Michael P. Schwoerer, Vrinda Madan, Thomas R. Cafiero, Brigitte L. Heller, Wei Wang, Alexander Ploss
American Society for Virology 2021 Meeting, 2021年07月, 英語, 口頭発表(一般)
2021年07月19日 - 2021年07月23日, 43704720 - Generation and characterization of genetically and antigenically diverse infectious clones of dengue virus serotypes 1-4
Tomokazu Tamura, Jiayu Zhang, Michael P. Schwoerer, Vrinda Madan, Thomas R. Cafiero, Abhishek Biswas, Brigitte L. Heller, Wei Wang, Alexander Ploss
27th International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses, 2021年07月, 英語, 口頭発表(一般)
2021年07月06日 - 2021年07月09日, 43704720 - A panel of humanized mouse models to investigate human immunological signatures defining lung histopathology during SARS-CoV-2 infection
D. J. Kenney, A. K. O'Connell, J. Turcinovic, P. Montanaro, R. N. Hekman, T. Tamura, A. Berneshawi, T. Cafiero, B. Heller, H. Gertje, E. Bulli, A. Trachtenberg, E. Chavez, S. Kurnick, K. Grosz, K. Francis, N. Paragas, M. bosmann, M. Ericsson, B. R. Huber, M. Saeed, J. Connor, A. Emili, N. Crossland, A. Ploss, F. Douam
Schaller eSymposium, Center for Integrative Disease Research, 2021年, 英語, 口頭発表(一般)
2021年 - 2021年 - 肝臓移植レシピエントにおけるペギウイルス感染の特徴
泉 琢磨, 坂田 一仁, 奥崎 大介, 井口 昭一, 田村 友和, 元岡 大祐, 中村 昇太, 小野 慎子, 下川 雅弘, 松浦 善治, 森 正樹, 福原 崇介, 吉住 朋晴
第67回日本ウイルス学会学術集会, 2019年10月, 日本語, 口頭発表(一般)
2019年10月29日 - 2019年10月31日 - NS1蛋白質はフラビウイルスの感染性粒子形成に重要である
福原 崇介, 田村 友和, 鳥居 志保, 小野 慎子, 梶原 健太郎, 森岡 佑平, 山本 拓弥, ファウジャー, ユージー, 泉 琢磨, 迫田 義博, 松浦 善治
第67回日本ウイルス学会学術集会, 2019年10月, 日本語, 口頭発表(一般)
2019年10月29日 - 2019年10月31日 - 豚コレラウイルスワクチン株感染による細胞死誘導と細胞変性効果
板倉 友香里, 松野 啓太, 伊藤 麻子, 藤本 悠理, 田村 友和, 亀山 健一郎, 岡松 正敏, Ruggli Nicolas, 喜田 宏, 澤 洋文, 迫田 義博
第67回日本ウイルス学会学術集会, 2019年10月, 日本語, 口頭発表(一般)
2019年10月29日 - 2019年10月31日 - 高効率な非レトロRNAウイルス網羅探索手法FLDSのヒト臓器への適用
浦山 俊一, 田村 友和, 泉 琢磨, 中村 昇太, 元岡 大祐, 吉住 朋晴, 平井 美穂, 高木 善弘, 布浦 拓郎, 福原 崇介
第67回日本ウイルス学会学術集会, 2019年10月, 日本語, 口頭発表(一般)
2019年10月29日 - 2019年10月31日 - 発光タグHiBiTをレポーターとして用いた遺伝子組換えウイルスによる簡便なペスチウイルス抗体測定法の確立
哲翁まどか, 松野啓太, 田村友和, 福原崇介, 松浦善治, 岡松正敏, 迫田義博
第162回日本獣医学会学術集会, 2019年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2019年09月10日 - 2019年09月12日 - 新規レポーター遺伝子を搭載したフラビウイルス科ウイルスのin vivo応用
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Manabu Igarashi, Takuro Uchida, Bazarragchaa Enkhbold, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Toru Okamoto, Yoshihiro Sakoda, Kazuaki Chayama, Yoshiharu Matsuura
第66回日本ウイルス学会学術集会, 2018年10月, 英語, ポスター発表
2018年10月28日 - 2018年10月30日, 43704622 - フラビウイルスの非構造蛋白質NS1の機能解析
田村 友和, 福原 崇介, 小野 慎子, 森 寛行, 泉 琢磨, 佐藤 あすか, Yuzy Fauzyah, 岡本 徹, 松浦 善治
第25回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会, 2018年10月, 日本語, 口頭発表(一般)
2018年10月27日 - 2018年10月27日, 43704622 - フラビウイルス科ウイルスの病原性と宿主特異性に関する研究
田村友和
第161回日本獣医学会学術集会, 2018年09月, 日本語, 口頭発表(招待・特別)
2018年09月11日 - 2018年09月13日, 43704720, [招待講演] - In vivo propagation of recombinant Flaviviridae viruses possessing NanoLuc subunit
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Manabu Igarashi, Takuro Uchida, Bazarragchaa Enkhbold, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Toru Okamoto, Yoshihiro Sakoda, Kazuaki Chayama, Yoshiharu Matsuura
American Society for Virology 2018 Meeting, 2018年07月, 英語, 口頭発表(一般)
2018年07月14日 - 2018年07月18日, 43704622 - Involvement of other miRNA on the propagation of HCV in miR-122-defcient cells
Chikako Ono, Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Toru Okamoto, Kazuaki Chayama, Kazuhiko Koike, Yoshiharu Matsuura
第65回日本ウイルス学会学術集会, 2017年10月, 英語, 口頭発表(一般)
2017年10月24日 - 2017年10月26日 - Characterization of Selective Autophagy Induced by HCV RNA Replication
Hiroyuki Mori, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Tomokazu Tamura, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Masami Wada, Takeshi Noda, Tamotsu Yoshimori, Yoshiharu Matsuura
第65回日本ウイルス学会学術集会, 2017年10月, 英語, 口頭発表(一般)
2017年10月24日 - 2017年10月26日 - 新規レポーター遺伝子を搭載したフラビウイルス科ウイルスの作出とその応用
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Takuro Uchida, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Toru Okamoto, Takeshi Kurosu, Norbert Tautz, Yoshihiro Sakoda, Kazuaki Chayama, Yoshiharu Matsuura
第65回日本ウイルス学会学術集会, 2017年10月, 英語, 口頭発表(一般)
2017年10月24日 - 2017年10月26日, 43704622 - 新規レポーター遺伝子を搭載したフラビウイルス科ウイルスの作出とその応用
田村 友和, 福原 崇介, 内田 宅郎, 小野 慎子, 森 寛行, 佐藤 あすか, Yuzy Fauzyah岡本 徹, 黒須 剛, Yin, Xiang Setoh, 今村 道雄, Norbert Tautz, 迫田 義博, Alexander A. Khromyk, 茶山 一彰, 松浦 善治
第24回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会, 2017年10月, 日本語, 口頭発表(一般)
2017年10月23日 - 2017年10月23日, 43704622 - Engineering of Small Reporter-Tagged Flaviviridae Viruses Applicable to Antiviral Screening and in vivo Dynamics
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Akatuski Saito, Takuro Uchida, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Toru Okamoto, Takeshi Kurosu, Norbert Tautz, Yoshihiro Sakoda, Tatuso Shioda, Kazuaki Chayama, Yoshiharu Matsuura
24th International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses, 2017年09月, 英語, ポスター発表
2017年09月25日 - 2017年09月28日, 43704622 - Characterization of recombinant Flaviviridae viruses possessing a small reporter-tag
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Takuro Uchida, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Toru Okamoto, Takeshi Kurosu, Yin Xiang Setoh, Norbert Tautz, Yoshihiro Sakoda, Alexander A. Khromykh, Kazuaki Chayama, Yoshiharu Matsuura
The 16th Awaji International Forum on Infection and Immunity, 2017年09月, 英語, ポスター発表
2017年09月05日 - 2017年09月08日, 43704622 - 新規レポーター遺伝子を搭載したフラビウイルス科ウイルスの作出とその応用
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Takuro Uchida, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Toru Okamoto, Takeshi Kurosu, Yin Xiang Setoh, Norbert Tautz, Yoshihiro Sakoda, Alexander A. Khromykh, Kazuaki Chayama, Yoshiharu Matsuura
第5回関西ウイルスクラブ, 2017年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2017年09月02日 - 2017年09月02日 - Viral Secretory Glycoproteins of Pestivirus and Flavivirus Have Similar Roles with Exchangeable Apolipoproteins on the Formation of Infectious HCV Particles
Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Mai Shiokawa, Chikako Ono, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Toru Okamoto, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Yoshiharu Matsuura
24th International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses, 2017年06月, 英語, 口頭発表(一般)
2017年06月24日 - 2017年06月28日 - Roles of miR-574-5P and miR-504-3P on the Propagation of HCV in miR-122-Deficient Cells
Chikako Ono, Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Hiroyuki Mori, Asuka Sato, Yuzy Fauzyah, Toru Okamoto, Kazuhiko Koike, Yoshiharu Matsuura
American Society for Virology 2017 Meeting, 2017年06月, 英語, 口頭発表(一般)
2017年06月24日 - 2017年06月28日 - Characterization of Selective Autophagy Induced by HCV RNA Replication
Hiroyuki Mori, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Tomokazu Tamura, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Masami Wada, Takeshi Noda, Tamotsu Yoshimori, Yoshiharu Matsuura
American Society for Virology 2017 Meeting, 2017年06月, 英語, 口頭発表(一般)
2017年06月24日 - 2017年06月28日 - Viral Secretory Proteins Erns and NS1 Play Comparable Roles with Apolipoproteins in the Infectious Particle Formation of Flaviviridae
Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Mai Shiokawa, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Yoshiharu Matsuura
American Society for Virology 2017 Meeting, 2017年06月, 英語, 口頭発表(一般)
2017年06月24日 - 2017年06月28日, 43704622 - Characterization of Flaviviridae viruses possessing a reporter gene
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Toru Okamoto, Takeshi Kurosu, Norbert Tautz, Yoshihiro Sakoda, Yoshiharu Matsuura
American Society for Virology 2017 Meeting, 2017年06月, 英語, 口頭発表(一般)
2017年06月24日 - 2017年06月28日, 43704622 - 新規レポーター遺伝子を搭載したフラビウイルス科ウイルスの作出とその応用
田村友和
第14回ウイルス学キャンプ in 湯河原, 2017年06月, 日本語, 口頭発表(一般)
2017年06月05日 - 2017年06月06日, 43704622 - HCV感染に伴うLC3陽性凝集体形成はオートファジーを抑制する
Hiroyuki Mori, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Tomokazu Tamura, Satomi Yamamoto, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Masami Wada, Takeshi Noda, Tamotsu Yoshimori, Yoshiharu Matsuura
第64回日本ウイルス学会学術集会, 2016年10月, 日本語, 口頭発表(一般)
2016年10月23日 - 2016年10月25日 - HCVの粒子形成におけるアポリポタンパク質の機能はフラビウイルスやペスチウイルス由来の分泌性膜結合蛋白により代償される
Takasuke Fukuhara, Tomokazu Tamura, Mai Shiokawa, Chikako Ono, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Yoshiharu Matsuura
第64回日本ウイルス学会学術集会, 2016年10月, 日本語, 口頭発表(一般)
2016年10月23日 - 2016年10月25日 - Cas9-nickaseによるB型肝炎ウイルスの感染制御
Takeshi Kurihara, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Hiroyuki Mori, Tomokazu Tamura, Toru Okamoto, Yoshiharu Matsuura
第64回日本ウイルス学会学術集会, 2016年10月, 日本語, ポスター発表
2016年10月23日 - 2016年10月25日 - フラビウイルス科ウイルスの粒子産生における分泌性糖タンパク質の役割
Tomokazu Tamura, Takasuke Fukuhara, Mai Shiokawa, Chikako Ono, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Toru Okamoto, Hiroshi Aoki, Yoshihiro Sakoda, Yoshiharu Matsuura
第64回日本ウイルス学会学術集会, 2016年10月, 日本語, 口頭発表(一般)
2016年10月23日 - 2016年10月25日, 43704622 - フラビウイルス科ウイルスの粒子産生における分泌性糖タンパク質の役割
田村 友和, 福原 崇介, 塩川 舞, 小野 慎子, 山本 聡美, 森 寛行, 栗原 健, 岡本 徹, 青木 博史, 迫田 義博, 松浦 善治
第23回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会, 2016年10月, 日本語, 口頭発表(一般)
2016年10月22日 - 2016年10月22日, 43704622 - Human cathelicidin can compensate the role of apolipoproteins in the formation of infectious HCV particles
Tomokazu Tamura, Francesc Puig-Basagoiti, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Toru Okamoto, Yoshiharu Matsuura
23rd International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses, 2016年10月, 英語, 口頭発表(一般)
2016年10月11日 - 2016年10月16日, 43704622 - Non-canonical LC3 lipidation induced by hepatitis C virus inhibits autophagic flux
Hiroyuki Mori, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Tomokazu Tamura, Satomi Yamamoto, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Masami Wada, Takeshi Noda, Tamotsu Yoshimori, Yoshiharu Matsuura
23rd International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses, 2016年10月, 英語, 口頭発表(一般)
2016年10月11日 - 2016年10月15日 - VLDLR has a redundant role with SR-B1 and LDLR in the entry of lipid-associated HCV
Takasuke Fukuhara, Satomi Yamamoto, Chikako Ono, Tomokazu Tamura, Hiroyuki Mori, Yukako Kawachi, Kentaro Uemura, Toru Okamoto, Yoshiharu Matsuura
American Society for Virology 2016 Meeting, 2016年06月, 英語, 口頭発表(一般)
2016年06月18日 - 2016年06月22日 - Human cathelicidin can compensate the role of apolipoproteins in the formation of infectious HCV particles
Tomokazu Tamura, Francesc Puig-Basagoiti, Takasuke Fukuhara, Chikako Ono, Satomi Yamamoto, Hiroyuki Mori, Takeshi Kurihara, Toru Okamoto, Yoshiharu Matsuura
American Society for Virology 2016 Meeting, 2016年06月, 英語, 口頭発表(一般)
2016年06月18日 - 2016年06月22日, 43704622 - 豚コレラウイルスの病原性の分子基盤
田村友和, Nicolas Ruggli, 岡松正敏, 喜田宏, 迫田義博
第1回北大・部局横断シンポジウム, 2016年03月, 日本語, ポスター発表
2016年03月07日 - 2016年03月07日, 43704623 - Recovery of noncytopathogenic bovine viral diarrhea virus from cDNA constructs and characterization of the produced infectious particles
M. Shiokawa, H. Aoki, Y. Fujimoto, Y. Abe, T. Tamura, K. Nishine, J. Mine, A. Fukusho, H. Kida, Y. Sakoda
第63回日本ウイルス学会学術集会, 2015年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2015年11月22日 - 2015年11月24日 - Molecular mechanism of down-regulation of type I interferon by Npro related to the pathogenicity of classical swine fever virus in pigs
Y. Sakoda, J. Mine, T. Tamura, K. Mitsuhashi, M. Okamatsu, S. Parchariyanon, W. Pinyochon, N. Ruggli, JD. Tratschin, H. Kida
第63回日本ウイルス学会学術集会, 2015年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2015年11月22日 - 2015年11月24日 - Apolipoproteins and viral secretory glycoprotains participate in the infectious particle formation of Flaviviridae
T. Fukuhara, T. Tamura, M. Shiokawa, C. Ono, S. Yamamoto, T. Kurihara, T. Okamoto, H. Aoki, Y. Sakoda, Y. Matsuura
第63回日本ウイルス学会学術集会, 2015年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2015年11月22日 - 2015年11月24日 - Intracellular membrane association of the N-terminal domain of classical swine fever virus NS4B is critical for viral RNA replication
T. Tamura, N. Ruggli, K. Matsuno, M. Okamatsu, Y. Sakoda
第63回日本ウイルス学会学術集会, 2015年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2015年11月22日 - 2015年11月24日 - 牛ウイルス性下痢ウイルスの免疫抑制能の異なる準種を用いたウイルス動態の検討
塩川舞, 内山汐里, 安部優里, 藤本悠理, 田村友和, 迫田義博, 青木博史
第22回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会, 2015年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2015年11月21日 - 2015年11月21日 - フラビウイルス科に共通した小胞体膜結合因子を介した粒子産生機構の解析
福原崇介, 田村友和, 塩川舞, 小野慎子, 山本聡美, 森寛行, 栗原健, 岡本徹, 青木博史, 迫田義博, 松浦善治
第22回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会, 2015年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2015年11月21日 - 2015年11月21日 - 豚コレラウイルスの病原性発現の分子基盤
田村友和, Nicolas Ruggli, 長島尚史, 吉野史, 岡松正敏, 松野啓太, Artur Summerfield、Martin A. Hofmann, 喜田宏, 迫田義博
第22回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会, 2015年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2015年11月21日 - 2015年11月21日, 43704623 - Intracellular membrane association of classical swine fever virus NS4B determines viral genome replication and virulence
Tomokazu Tamura, Nicolas Ruggli, Naofumi Nagashima, Masatoshi Okamatsu, Artur Summerfield, Hiroshi Kida, Keita Matsuno, Yoshihiro Sakoda
The 3rd Sapporo Summer Seminar for One Health (SaSSOH), 2015年09月, 英語, ポスター発表
2015年09月16日 - 2015年09月17日 - 豚コレラウイルス非構造蛋白NS4BのN末端領域の機能解析
田村友和, Nicolas Ruggli, 松野啓太, 岡松正敏, 迫田義博
第158回日本獣医学会学術集会, 2015年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2015年09月07日 - 2015年09月09日 - 豚コレラウイルス非構造蛋白NS4Bの機能と病原性に及ぼす影響
田村友和, Nicolas Ruggli, 長島尚史, 岡松正敏, Artur Summerfield, 松野啓太, 喜田宏, 迫田義博
第49回夏季シンポジウム日本ウイルス学会北海道支部会, 2015年07月, 日本語, 口頭発表(一般)
2015年07月25日 - 2015年07月26日 - VIRAL GENETIC DETERMINANTS OF CLASSICAL SWINE FEVER VIRUS VIRULENCE
T. Tamura, N. Ruggli, N. Nagashima, M. Okamatsu, MA. Hofmann, H Kida, A. Summerfield, Y. Sakoda
The 7th International Symposium on Emerging and Re-emerging Pig Diseases 2015, 英語, ポスター発表
2015年06月21日 - 2015年06月24日, 43704623 - ブタから分離されたボーダー病ウイルスFNK2012-1株のヒツジに対する病原性
田村友和, 峯淳貴, 鳥居志保, 藤本悠理, 岡松正敏, 迫田義博
平成26年度日本獣医師会獣医学術学会年次大会 (岡山), 2015年02月, 日本語, 口頭発表(一般)
2015年02月13日 - 2015年02月15日, 43704623 - 豚コレラウイルス非構造蛋白NS4BのN末端両親媒性ヘリックスは豚に対する病原性に関与する
田村友和, Nicolas Ruggli, Matthias Liniger, 長島尚史, 峯淳貴, 岡松正敏, Martin A. Hofmann, Artur Summerfield, 喜田宏, 迫田義博
第62回日本ウイルス学会学術集会, 2014年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2014年11月10日 - 2014年11月12日 - 国内の豚コレラサーベイランスにおいて豚から分離されたボーダー病ウイルスの生物性状と遺伝子および抗原性解析
長井誠, 青木博史, 迫田義博, 小佐々隆志, 富永-手島香保, 峯淳貴, 安部優里, 田村友和, 小林羽, 西根薫, 立石健太郎, 鈴木遊大, 福原麻衣, 大森啓太郎, 戸田玲子, 片山和彦, 水谷哲也, 中村成幸, 喜田宏, 白井淳資
第21回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会, 2014年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2014年11月09日 - 2014年11月09日 - Genetic and antigenic characterization of bovine viral diarrhea (BVD) viruses recently isolated from cattle and evaluation of the effectiveness of a regional control program for BVD in Hokkaido, Japan
Y. Sakoda, H. Saino, T. Tamura, A. Usui, M. Tajima, J. Mine, Y. Abe, S. Torii, M. Okamatsu, H. Kida
Joint U.S. BVDV/ESVV Pestivirus Symposium, 2014年10月, 英語, ポスター発表
2014年10月14日 - 2014年10月15日 - N-terminal domain in NS4B of classical swine fever virus contributes to pathogenicity in pigs
Tomokazu Tamura, Nicolas Ruggli, Matthias Linger, Naofumi Nagashima, Junki Mine, Masatoshi Okamatsu, Martin A. Hofmann, Artur Summerfield, Hiroshi Kida, Yoshihiro Sakoda
The 2nd Sapporo Summer Seminar for One Health (SaSSOH), 2014年09月, 英語, 口頭発表(一般)
2014年09月24日 - 2014年09月25日, 43704623 - An N-terminal amphipathic helix in NS4B of classical swine fever virus contributes to pathogenicity in pigs by modulating the viral genome replication
T. Tamura, N. Ruggli, M. Liniger, N. Nagashima, J. Mine, M. Okamatsu, MA. Hofmann, A. Summerfield, H. Kida, Y. Sakoda
Joint U.S. BVDV/ESVV Pestivirus Symposium, 2014年09月, 英語, ポスター発表
2014年09月14日 - 2014年09月15日, 43704623 - 牛ウイルス性下痢ウイルス準種のcDNAクローン構築と自然免疫制御能の解析
塩川舞, 加藤あやの, 藤本悠理, 安部優里, 田村友和, 西根薫, 峯淳貴, 青木博史, 福所秋雄, 喜田宏, 迫田義博
第157回日本獣医学会学術集会, 2014年09月, (公社)日本獣医学会, 日本語, 口頭発表(一般)
2014年09月09日 - 2014年09月12日 - 豚コレラウイルスALD/A76株の病原性解析に用いる完全長cDNAクローンおよびレプリコンの作出
藤本悠理, 田村友和, 遠藤真由美, 吉野史, Nicolas Ruggli, 喜田宏, 迫田義博
第157回日本獣医学会学術集会, 2014年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2014年09月09日 - 2014年09月12日 - 豚コレラウイルス非構造蛋白NS4BのN末端領域は豚に対する病原性に関与する
田村友和, Nicolas Ruggli, 長島尚史, 峯淳貴, 岡松正敏, Artur Summerfield、Martin A. Hofmann, 喜田宏, 迫田義博
第157回日本獣医学会学術集会, 2014年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2014年09月09日 - 2014年09月12日, 43704623 - リーダーシップを考える
喜田宏, 田村友和, 岡川朋広
第157回日本獣医学会学術集会, 2014年09月09日, 日本語, シンポジウム・ワークショップパネル(指名)
2014年09月09日 - 2014年09月11日, [招待講演] - 牛ウイルス性下痢ウイルスの非構造蛋白Nproによる自然免疫抑制機構の解析
藤本悠理, 安部優里, 塩川舞, 田村友和, 青木博史, 峯淳貴, 喜田宏, 迫田義博
第48回夏季シンポジウム日本ウイルス学会北海道支部会, 2014年07月, 日本語, 口頭発表(一般)
2014年07月12日 - 2014年07月13日 - 豚コレラウイルス非構造蛋白Nproによる自然免疫抑制メカニズムの解析
峯淳貴, 三津橋和也, 田村友和, Nicolas Ruggli, 岡松正敏, 喜田宏, 迫田義博
第79回日本インターフェロン・サイトカイン学会学術集会, 2014年06月, 日本語, ポスター発表
2014年06月19日 - 2014年06月20日 - 豚コレラウイルス非構造蛋白Nproは局所感染臓器の自然免疫応答を抑制することで病原性発現に関与する
田村友和, 長島尚史, Nicolas Ruggli, Artur Summerfield, 岡松正敏, 喜田宏, 迫田義博
第79回日本インターフェロン・サイトカイン学会学術集会, 2014年06月, 日本語, ポスター発表
2014年06月19日 - 2014年06月20日, 43704623 - ボーダー病ウイルスFNK2012-1株の豚に対する病原性
峯淳貴, 安部優里, 田村友和, 岡松正敏, 迫田義博, 喜田宏
平成27年度日本獣医師会獣医学術学会年次大会 (千葉), 2014年02月, 日本語, 口頭発表(一般)
2014年02月21日 - 2014年02月23日 - N-terminal domain of the non-structural protein NS4B of classical swine fever virus is responsible for the pathogenicity in pigs
Tomokazu Tamura, Nicolas Ruggli, Naofumi Nagashima, Jyunki Mine, Artur Summerfield、Martin A. Hofmann, Hiroshi Kida, Yoshihiro Sakoda
第3回感染症若手フォーラム, 2014年02月, 英語, 口頭発表(一般)
2014年02月13日 - 2014年02月15日, 43704623 - Suppression of interferon-α/β induction by classical swine fever virus Npro contributes to pathogenicity in pigs
T. Tamura
Münchenwiler Meeting 2013, 2013年10月31日, 英語, 口頭発表(招待・特別)
2013年10月31日 - 2013年11月01日, 43704623, [招待講演] - The study on the role of the glycoprotein E2 for the pathogenesis of classical swine fever virus in pigs
T. Tamura, Y. Sakoda, M. Igarashi, N. Ruggli, K. Ito, M. Okamatsu, H. Kida
The 1st Sapporo Summer Seminar for One Health (SaSSOH), 2013年09月, 英語, ポスター発表
2013年09月25日 - 2013年09月26日, 43704623 - HoBi-likeペスチウイルス(牛ウイルス性下痢ウイルス 3 型)の検出法の検討
小佐々隆志, 青木博史, 亀山健一郎, 田村友和, 安部優里, 西根薫, 戸高玲子, 片山和彦, 水谷哲也, 白井淳資, 石丸雅敏, 中村成幸, 長井誠, 迫田義博
第156回日本獣医学会学術集会, 2013年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2013年09月20日 - 2013年09月22日 - 牛ウイルス性下痢ウイルスのcDNAクローンの作出と自然免疫抑制機能の解析
安部優里, 迫田義博, 三津橋和也, 田村友和, 小佐々隆志, 中村成幸, 喜田宏
第156回日本獣医学会学術集会, 2013年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2013年09月20日 - 2013年09月22日, 43704623 - 豚コレラウイルスの豚に対する病原性に関与するウイルス表面糖蛋白E2の機能解析
田村友和, 迫田義博, 五十嵐学, Nicolas Ruggli, 伊藤公人, 岡松正敏, 喜田宏
第47回夏季シンポジウム日本ウイルス学会北海道支部会, 2013年07月, 日本語, 口頭発表(一般)
2013年07月20日 - 2013年07月21日, 43704623 - 2010-11シーズンに国内の野鳥斃死体から分離されたH5N1高病原性鳥インフルエンザウイルスのカモ科およびサギ科鳥類に対する病原性と伝播能の解析
曽田公輔, 笛吹達史, 宇野有紀子, 永井泰子, 尾崎弘一, 伊藤啓史, 山本直樹, 田村友和, 日尾野隆大, 岡松正敏, 迫田義博, 高田礼人, 村瀬敏之, 山口剛士, 伊藤壽啓
第155回日本獣医学会学術集会, 2013年03月, 日本語, ポスター発表
2013年03月28日 - 2013年03月30日 - タイで分離されたEND陰性豚コレラウイルスの遺伝子と病原性の解析
迫田義博, 三津橋和也, 田村友和, 長島尚史, 岡松正敏, Nicolas Ruggli, Parchariyanon Sugira, Pinyochon Wasana, 喜田宏
第155回日本獣医学会学術集会, 2013年03月, 日本語, ポスター発表
2013年03月28日 - 2013年03月30日 - 北海道で分離された牛ウイルス性下痢ウイルスの遺伝子と抗原性の解析
安部優里, 迫田義博, 田村友和, 長井誠, 岡松正敏, 喜田宏
感染症若手フォーラム(北海道), 2013年03月, 日本語, 口頭発表(一般)
2013年02月28日 - 2013年03月02日 - 豚コレラウイルスの豚における増殖とサイトカイン応答
長島尚史, 迫田義博, 田村友和, 山本直樹, 岡松正敏, Nicolas Ruggli, 喜田宏
第60回日本ウイルス学会学術集会, 2012年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2012年11月13日 - 2012年11月15日 - 豚コレラウイルス非構造蛋白Nproのアミノ酸を置換したウイルスの感染に対する豚の自然免疫応答と病原性の解析
田村友和, 長島尚史, 山本直樹, 岡松正敏, Nicolas Ruggli, 迫田義博, 喜田宏
第60回日本ウイルス学会学術集会, 2012年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2012年11月13日 - 2012年11月15日 - The Npro, E2, and NS4B of classical swine fever virus synergistically play a role for the acquisition of pathogenicity in pigs
T. Tamura, Y. Sakoda, N. Nagashima, F. Yoshino, N. Yamamoto, M. Okamatsu, N. Ruggli, H. Kida
The 4th International Young Researcher Seminar in Zoonosis Control, 2012年09月, 英語, ポスター発表
2012年09月20日 - 2012年09月21日 - 北海道で分離された牛ウイルス性下痢ウイルス1aおよび1b亜型株の遺伝子と抗原性の解析
安部優里, 迫田義博, 三津橋和也, 田村友和, 長島尚史, 岡松正敏, 長井誠, 迫田義博
第154回日本獣医学会学術集会, 2012年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2012年09月14日 - 2012年09月16日 - 豚コレラウイルスの病原性に関与するアミノ酸置換が宿主のサイトカイン応答に及ぼす影響
長島尚史, 迫田義博, 田村友和, 栗林沙弥, 山本直樹, 岡松正敏, Nicolas Ruggli, 喜田宏
第153回日本獣医学会学術集会, 2012年03月, 日本語, ポスター発表
2012年03月27日 - 2012年03月29日 - 豚コレラ弱毒生ワクチン株の豚継代による病原性獲得
田村友和, 迫田義博, 吉野史, 野村拓志, 山本直樹, Nicolas Ruggli, 岡松正敏, 喜田宏
第18回トガ・フラビ・ペスチウイルス研究会, 2011年11月11日, 日本語, 口頭発表(一般)
2011年11月11日 - 2011年11月11日 - Enhancement of pathogenicity in pigs by mutation of N136D in Npro of classical swine fever virus by suppressing type Ⅰ interferon induction
Y. Sakoda, T. Tamura, N. Yamamoto, M. Okamatsu, N. Ruggli, H. Kida
The 8th International Pestivirus Symposium of the European Society for Veterinary Virology, 2011年09月, 英語, 口頭発表(一般)
2011年09月25日 - 2011年09月28日 - Acquisition of pathogenicity by serial passages of a live attenuated vaccine strain of classical swine fever virus in pigs
T. Tamura, Y. Sakoda, F. Yoshino, T. Nomura, N. Yamamoto, M. Okamatsu, N. Ruggli, H. Kida
The 8th International Pestivirus Symposium of the European Society for Veterinary Virology, 2011年09月, 英語, 口頭発表(一般)
2011年09月25日 - 2011年09月28日 - 豚コレラウイルス非構造蛋白Nproへのアミノ酸変異導入による自然免疫の抑制と豚に対する病原性の上昇
迫田義博, 田村友和, 長島尚史, 山本直樹, 岡松正敏, Nicolas Ruggli, 喜田宏
第152回日本獣医学会学術集会, 2011年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2011年09月19日 - 2011年09月21日 - 豚コレラ弱毒生ワクチン株の豚継代による病原性に与る因子の検索
田村友和, 迫田義博, 吉野史, 長島尚史, 山本直樹, 佐藤由佳, 岡松正敏, Nicolas Ruggli, 喜田宏
第152回日本獣医学会学術集会, 2011年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2011年09月19日 - 2011年09月21日 - Acquisition of pathogenicity by serial passages of live attenuated vaccine strain of classical swine fever virus in pigs
T. Tamura, Y. Sakoda, F. Yoshino, T. Nomura, N. Yamamoto, M. Okamatsu, N. Ruggli, H. Kida
第59回日本ウイルス学会学術集会・国際微生物学連合2011会議ウイルス学部門, 2011年09月, 英語, 口頭発表(一般)
2011年09月11日 - 2011年09月16日 - 豚コレラ弱毒生ワクチン株の豚継代による病原性獲得に関与するアミノ酸の同定
田村友和, 迫田義博, 吉野史, 野村拓志, 山本直樹, Nicolas Ruggli, 岡松正敏, 喜田宏
第151回日本獣医学会学術集会, 2011年03月30日, 日本語, ポスター発表
2011年04月01日 - 近年北海道で分離された牛ウイルス性下痢ウイルスの遺伝子と抗原性解析
迫田義博, 田村友和, 杉田征彦, 吉野史, 岡松正敏, 喜田宏
第58回日本ウイルス学会学術集会, 2010年11月, 日本語, ポスター発表
2010年11月07日 - 2010年11月09日 - 牛ウイルス性下痢ウイルス2b亜型 (BVDV-2b) 株の性状
田村友和, 迫田義博, 吉野史, 杉田征彦, 岡松正敏, 長井誠, 伊藤美加, 青木博史, 喜田宏
第58回日本ウイルス学会学術集会, 2010年11月, 日本語, 口頭発表(一般)
2010年11月07日 - 2010年11月09日 - 牛ウイルス性下痢ウイルス2b亜型 (BVDV-2b) 株の性状
田村友和, 迫田義博, 吉野史, 杉田征彦, 岡松正敏, 長井誠, 伊藤美加, 青木博史, 喜田宏
第150回日本獣医学会学術集会, 2010年09月, 日本語, 口頭発表(一般)
2010年09月16日 - 2010年09月18日 - 近年北海道で分離された牛ウイルス性下痢ウイルスの遺伝子解析
田村友和, 迫田義博, 杉田征彦, 吉野史, 岡松正敏, 喜田宏
第149回日本獣医学会学術集会, 2010年03月26日, 日本語, ポスター発表
2010年03月28日
担当経験のある科目_授業
- 医学総論
北海道大学大学院医学院
2022年04月 - 現在 - 基盤医学研究
北海道大学大学院医学院
2022年04月 - 現在 - 基本医学総論
北海道大学大学院医学院
2022年04月 - 現在 - 基本医学研究
北海道大学大学院医学院
2022年04月 - 現在 - 微生物・免疫学実習
北海道大学医学部医学科
2024年01月 - 2024年02月 - 系統医学 ウイルス学
九州大学医学部医学科
2023年10月 - 2023年12月 - 微生物学
北海道大学医学部医学科
2023年10月 - 2023年12月 - 微生物・免疫学実習
北海道大学医学部医学科
2022年10月 - 2023年02月 - 微生物学
北海道大学医学部医学科
2022年10月 - 2022年12月 - 微生物・免疫学実習
北海道大学医学部医学科
2022年01月 - 2022年02月