Feb. 2024, 日本分析化学会北海道支部, 北海道分析化学奨励賞　　　　　　　　　　　　　　　

Monitoring Sexually Transmitted Infection-Associated Pathogens in Municipal Wastewater in Japan
Made Sandhyana Angga, Vu Duc Canh, Yuki Nakaya, Hisashi Satoh, Hiroyuki Katayama, Masaaki Kitajima
ACS ES&T Water, 5, 12, 7437, 7444, American Chemical Society (ACS), 11 Nov. 2025, [Peer-reviewed]
Scientific journal

Characterizing the Settlement of Activated Sludge Based on AI-Assisted Analysis of Moving and Still Images
Yuki Nakaya, Kai Sugino, Shota Ishizaki, Reiko Hirano, Shuhei Noda, Shinobu Moniwa, Yukio Hiraoka, Hisashi Satoh
ACS ES&T Water, 08 Aug. 2025, [Peer-reviewed], [Lead author, Corresponding author]
Scientific journal

Solid-phase fluorescence excitation-emission matrix spectroscopy of soil, fulvic acid fractions, and clay mineral complexes: Evidence from red shift of fluorescence maxima associated with aggregation
Yuki Nakaya, Takashi Hirose, Ryuichi Tamori, Nobuhide Fujitake, Satoru Nakashima, Hiroshi Yamamura, Hisashi Satoh
Environmental Research, Aug. 2025, [Peer-reviewed], [Lead author, Corresponding author]
Scientific journal

Effects of snowmelt runoff on bacterial communities and antimicrobial resistance gene concentrations in an urban river in a cold climate region
Mohomed N. M. Shayan, Takeshiro Onodera, Reiko Hirano, Kyohei Kuroda, Takashi Narihiro, Yuki Nakaya, Hisashi Satoh
Environmental Science and Pollution Research, Springer Science and Business Media LLC, 05 Mar. 2025, [Peer-reviewed]
Scientific journal

Quantification of morphological characteristics and filamentous bacteria in activated-sludge flocs through quantitative image-analysis techniques incorporating image-processing software and U-Net deep-learning framework
Uthpala Kaushalya, Yuki Nakaya, Shota Ishizaki, Kai Sugino, Reiko Hirano, Hisashi Satoh
Journal of Water Process Engineering, Jan. 2025, [Peer-reviewed], [Corresponding author]
English, Scientific journal

Development of an internal two-stage upflow anaerobic reactor integrating biostimulation strategies to enhance the degradation of aromatic compounds in wastewater from purified terephthalic acid and dimethyl terephthalate manufacturing processes
Kyohei Kuroda, Maho Takai, Takeo Sekiguchi, Tomoya Ikarashi, Hazuki Kurashita, Meri Nakajima, Masaru K. Nobu, Masashi Hatamoto, Takashi Yamaguchi, Yuki Nakaya, Hisashi Satoh, Masahito Yamauchi, Masayoshi Yamada, Takashi Narihiro
Water Research, 121762, 121762, Elsevier BV, May 2024, [Peer-reviewed]
Scientific journal

Physicochemical parameters affecting the adhesion of ciprofloxacin-resistant Escherichia coli to activated sludge
Yuki Nakaya, Natsumi Nagahashi, Reiko Hirano, Yusuke Ishizuka, Hisashi Satoh
Water Science & Technology, 01 May 2024, [Peer-reviewed], [Lead author, Corresponding author]
Scientific journal

Solid-phase fluorescence: Reproducibility and comparison with the solution states
Yuki Nakaya, Ayaka Tomita, Hiroshi Yamamura
Talanta, Apr. 2024, [Peer-reviewed], [Lead author, Corresponding author]
Scientific journal

Growth of the Nitrosomonas europaea cells in the biofilm and planktonic growth mode: Responses of extracellular polymeric substances production and transcriptome
Mamoru Oshiki, Takahiro Saito, Yuki Nakaya, Hisashi Satoh, Satoshi Okabe
Journal of Bioscience and Bioengineering, Elsevier BV, Nov. 2023, [Peer-reviewed]
Scientific journal

A simple and rapid method for detecting fecal pollution in urban rivers by measuring the intrinsic β-D-glucuronidase activity of Escherichia coli
Mohomed N.M. Shayan, Yuna Tanaka, Reiko Hirano, Yuki Nakaya, Hisashi Satoh
Water Research, 246, 120689, 120689, Elsevier BV, Nov. 2023, [Peer-reviewed]
Scientific journal

Analysis of Unamplified 16S rRNA of Ammonia-Oxidizing Bacteria in Activated Sludge by Spectrophotometry Using Gold Nanoprobes
Meri Nakajima, Reiko Hirano, Yuki Nakaya, Hisashi Satoh
ACS ES&T Water, American Chemical Society (ACS), 23 Aug. 2023, [Peer-reviewed]
Scientific journal

Tracing morphological characteristics of activated sludge flocs by using a digital microscope and their effects on sludge dewatering and settling
Yuki Nakaya, Jinming Jia, Hisashi Satoh
Environmental Technology, 45, 4042, 4052, Informa UK Limited, 04 Aug. 2023, [Peer-reviewed], [Lead author]
Scientific journal

Quantification of organic fluorophores in absorbing media by solid-phase fluorescence excitation–emission matrix (SPF-EEM) spectroscopy of modeled mixtures containing bovine serum albumin (BSA) and colorants
Yuki Nakaya, Ayaka Tomita, Kosuke Ochiai, Hiroshi Yamamura
Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy, 285, 121885, 121885, Elsevier {BV}, Jan. 2023, [Peer-reviewed], [Lead author, Corresponding author]
English, Scientific journal

Highly sensitive and homogeneous detection of unamplified RNA based on the light scattering properties of gold nanoparticle probes
Hisashi Satoh, Meri Nakajima, Reiko Hirano, Yuki Nakaya
Biosensors and Bioelectronics: X, 12, 100249, 100249, Elsevier {BV}, Dec. 2022, [Peer-reviewed]
English, Scientific journal

Elucidation of the biodegradation pathways of bis(2-hydroxyethyl) terephthalate and dimethyl terephthalate under anaerobic conditions revealed by enrichment culture and microbiome analysis
Kyohei Kuroda, Takashi Narihiro, Yuki Nakaya, Taro Q.P. Noguchi, Ryota Maeda, Masaru K. Nobu, Yuki Ohnishi, Yasuhiro Kumaki, Tomoyasu Aizawa, Hisashi Satoh
Chemical Engineering Journal, 450, 137916, 137916, Dec. 2022, [Peer-reviewed]
English, Scientific journal

Separate determination of arsenite and arsenate in groundwater samples by simple analytical methods
Koji Matsunaga, Yuki Nakaya, Hisashi Satoh
Water Supply, 22, 10, 7635, 7642, {IWA} Publishing, 01 Oct. 2022, [Peer-reviewed]
English, Scientific journal, Abstract

We investigated the interaction of As(III) with As(III)-binding DNA aptamers (Ars-3). The binding of Ars-3 to As(III) was investigated using an Ars-3 sequence and a few control DNA sequences. As a result, we conclude that Ars-3 cannot bind As(III) and As(III) can adsorb onto gold nanoparticles with selectivity. However, the As(III) concentration could be determined by a simple As(III) analysis method using Ars-3, and we measured the As(III) and As(V) concentrations separately in As(III)/As(V) mixed samples in ultrapure water and groundwater using a simple analytical method for As(III) and As(V), respectively. As(III) in the sample was measured by a simple As(III) analytical method using DNA aptamers and gold nanoparticles, and As(V) in the sample was measured by a simple As(V) analysis method using cerium oxide nanoparticles and fluorescence-labeled DNA. We can measure As(III) and As(V) concentrations in ultrapure water and groundwater in the simple analytical method for As(III) and As(V), separately.

Gas Cell Infrared and Attenuated Total Reflection Infrared Spectroscopic Studies for Organic-Inorganic Interactions in Adsorption of Fulvic Acid on the Goethite Surface Generating Carbon Dioxide.
Yuki Nakaya
Applied spectroscopy, 75, 9, 1114, 1123, SAGE Publications, 18 Feb. 2021, [Peer-reviewed], [Lead author]
Scientific journal, The generation of carbon dioxide (CO₂) from Nordic fulvic acid (FA) solution in the presence of goethite (α-FeOOH) was observed in FA–goethite interaction experiments at 25–80 ℃. CO₂ generation processes observed by gas cell infrared (IR) spectroscopy indicated two steps: the zeroth order slower CO₂ generation from FA solution commonly occurring in the heating experiments of the FA in the presence and absence of goethite (activation energy: 16–19 kJ mol^–1), and the first order faster CO₂ generation from FA solution with goethite (activation energy: 14 kJ mol^–1). This CO₂ generation from FA is possibly related to redox reactions between FA and goethite. In situ attenuated total reflection infrared (ATR-IR) spectroscopic measurements indicated rapid increases with time in IR bands due to COOH and COO^– of FA on the goethite surface. These are considered to be due to adsorption of FA on the goethite surface possibly driven by electrostatic attraction between the positively charged goethite surface and negatively charged deprotonated carboxylates (COO^–) in FA. Changes in concentration of the FA adsorbed on the goethite surface were well reproduced by the second order reaction model giving an activation energy around 13 kJ mol^–1. This process was faster than the CO₂ generation and was not its rate-determining step. The CO₂ generation from FA solution with goethite is faster than the experimental thermal decoloration of stable structures of Nordic FA in our previous report possibly due to partial degradations of redox-sensitive labile structures in FA.

Three dimensional excitation-emission matrix fluorescence spectroscopy of typical Japanese soil powders
Yuki Nakaya, Satoru Nakashima, Mihoko Moriizumi, Masahiro Oguchi, Shinsuke Kashiwagi, Nobuyuki Naka
SPECTROCHIMICA ACTA PART A-MOLECULAR AND BIOMOLECULAR SPECTROSCOPY, 233, Jun. 2020, [Peer-reviewed], [Lead author, Corresponding author]
English, Scientific journal

Evaluation of kinetic competition among formation and degradation processes of dissolved humic-like substances based on hydrothermal reactions measured by ultraviolet-visible spectroscopy
Yuki Nakaya, Satoru Nakashima, Takahiro Otsuka
GEOCHEMICAL JOURNAL, 53, 6, 407, 414, 2019, [Peer-reviewed], [Lead author]
English, Scientific journal

Spectroscopic Study of Effects of Goethite Surfaces on the Simulated Maillard Reaction Forming Humic-like Substances
Yuki Nakaya, Katsuya Okada, Yudai Ikuno, Satoru Nakashima
e-Journal of Surface Science and Nanotechnology, 16, 411, 418, 06 Oct. 2018, [Peer-reviewed], [Lead author]
English, Scientific journal

Nondestructive Spectroscopic Tracing of Simulated Formation Processes of Humic-Like Substances Based on the Maillard Reaction
Yuki Nakaya
Applied Spectroscopy, 72, 8, 1189, 1198, SAGE Publications, Aug. 2018, [Peer-reviewed], [Lead author]
English, Scientific journal, The formation processes of humic-like substances have been simulated by heating a glycine and ribose mixed solution (0.1 mol L⁻¹) at 80 ℃ using the Maillard reaction. Ultraviolet–visible (UV–Vis), three-dimensional excitation emission spectroscopy and size exclusion liquid chromatography succeeded in quantitatively tracing increases of the products during the heating of glycine and ribose mixed solution (0.1 mol L⁻¹). Two-dimensional correlation spectroscopic analyses suggested that a band area around 280 nm ( UV₂₈₀) and 254 nm absorbance ( UV₂₅₄) can be used as measures of the formation of furfural-like intermediates and humic-like products, respectively. They were monitored using in situ UV–Vis spectroscopy with the original heatable liquid cell at 60–80 ℃. Kinetic analyses of the obtained data gave activation energies of 91.4–96.6 kJ mol⁻¹. These nondestructive measurements by an in situ spectroscopic method did not require any additional procedures including drying or extracting the solution and they can be effectively used for direct tracing of the reaction progress and/or decomposition.

In Situ IR Transmission Spectroscopic Observation and Kinetic Analyses of Initial Stage of the Maillard Reaction as a Simulated Formation Process of Humic Substances
Yuki Nakaya, Satoru Nakashima
Chemistry Letters, 45, 10, 1204, 1206, 05 Oct. 2016, [Peer-reviewed], [Lead author], [Domestic magazines]
English, Scientific journal

国際腐植物質学会 第22回国際会議（IHSS22）の報告　　　　　　　　　　　　　　　
中屋佑紀, Humic Substances Research, 20, 1, 39, 41, Nov. 2025, [Domestic magazines]
Japanese, Meeting report

Elucidation of aerobic p-toluic acid degradation mechanisms in a down-flow hanging sponge reactor by multiomics analysis
高井麻帆, 中屋佑紀, 佐藤久, 相沢智康, 大西裕季, 熊木康弘, 成廣隆, 黒田恭平, 日本水環境学会年会講演集, 58th, 2024

石狩川水系における水量・水質の両面を考慮した河川の流況特性
山田朋人, 佐藤久, 中屋佑紀, 一般財団法人北海道河川財団 研究所紀要（ⅩⅩⅩⅣ）, May 2023

特集 水環境分野における機械学習の活用「機械学習による活性汚泥フロック形態の認識」　　　　　　　　　　　　　　　
佐藤久, 中屋佑紀, 水環境学会誌, 2023年3月, 88, 91, Mar. 2023

金ナノ粒子プローブを用いた簡易核酸分析法の反応機構の検証
廣井楓夏, 三浦篤志, 黒田恭平, 成廣隆, 中屋佑紀, 佐藤久, 日本分析化学会年会講演要旨集(Web), 72nd, 2023

Development of rapid quantification techniques for methanogenic archaea and parasitic ultramicrobacteria using PCR-free gold nanoparticle probes
半田久純, 中島芽梨, 中屋佑紀, 佐藤久, 黒田恭平, 成廣隆, 日本水環境学会年会講演集, 57th, 2023

金ナノ粒子プローブを用いたメタン生成アーキアと寄生性超微小細菌の迅速定量
半田久純, 中島芽梨, 中屋佑紀, 佐藤久, 成廣隆, 黒田恭平, 下水道研究発表会講演集, 60th, 2023

特集 分析化学のSDGs「簡易水質分析」　　　　　　　　　　　　　　　
佐藤久, 中屋佑紀, ぶんせき, 2022, 1, 454, 459, Nov. 2022
Introduction scientific journal

家畜糞尿の嫌気性消化によるメタンガス生成効率の安定化に向けた メタボローム解析
中屋佑紀, 佐藤久, 公益財団法人岩谷直治記念財団 岩谷科学技術研究助成（研究報告書）2021年度, 21-4841, 2022

高い細菌吸着能を持つ高機能活性汚泥フロックの開発
中屋佑紀, 佐藤久, 公益財団法人JFE21世紀財団 2022年度 技術研究報告書, 2022

金ナノ粒子プローブを用いた下水中アンモニア酸化細菌数のモニタリング—第59回下水道研究発表会講演集
佐藤 久, 半田 久純, 中島 芽梨, 中屋 佑紀, 下水道研究発表会講演集, 59, 367, 369, 2022
日本下水道協会, Japanese

Practical report of problem posing in mathematics in the first-year fundamental education
Yuki Nakaya, 大阪大学高等教育研究, 9, 51, 57, Mar. 2021, [Peer-reviewed], [Lead author, Corresponding author]
Japanese, Introduction research institution

2D19 Expansion of Pre-college Distance Education
黒木和雄, 菅波昌広, 西脇純一, 中屋佑紀, 工学教育研究講演会講演論文集(Web), 2021, 2021

Two-dimensional correlation spectroscopy for simulated formation processes of humic substances
Nakaya Yuki, Nakashima Satoru, Moriizumi MIhoko, Abstracts of Annual Meeting of the Geochemical Society of Japan, 64, 276, 276, 2017

, GEOCHEMICAL SOCIETY OF JAPAN, Japanese

図説日本の温泉 : 170温泉サイエンス
日本温泉科学会, 5-3 汐の湯温泉 p.123
朝倉書店, 2020, 9784254160758, ix, 194p, 図版[4]p, Japanese, [Contributor]

都市の“静脈”下水道が直面する危機：”血液検査“で老朽箇所を絞り込む
中屋佑紀
令和7年度 医工連携グローバル展開事業 第５回 ヘルステック・デバイス・フォーラム, 08 Aug. 2025, TOLIC、(株)イーハトーブ・スクエア、いわて産業振興センター, Nominated symposium
都市における上下水道の役割はそれぞれ動脈と静脈に例えられる。新型コロナウイルスの流行状況を下水中ウイルスRNA濃度から推定する下水サーベイランスは、まさしく都市の健康状態を“静脈血液検査”により把握しようとするものである。一方、今年1月に埼玉県八潮市で発生した道路陥没事故が示すように、下水道の老朽化が深刻化している。発表者らは下水管の老朽箇所から浸入する土砂成分を捉えることで下水道の老朽化状況を管内調査なしに把握する手法の開発に取り組んでおり、今回はその一部を紹介する。, [Invited], [Domestic Conference]

数学における作問課題を題材としたSoTL実践記
中屋佑紀
大阪大学FFP10周年記念シンポジウム「新しい時代の博士人材をどう育成するか？ ――プレFDを中心に――」, 22 Feb. 2024, 大阪大学 全学教育推進機構 教育学習支援部, Nominated symposium
[Invited]

固体・フロントフェイス励起蛍光マトリクス分光法による環境試料の分析　　　　　　　　　　　　　　　
中屋佑紀
九州分析化学若手の会 第36回若手研究講演会および第41回夏季セミナー, 28 Jul. 2023, Nominated symposium
28 Jul. 2023 - 29 Jul. 2023, [Invited]

物理学Ⅰ　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学（全学共通科目）
Apr. 2024 - Present

広域水環境工学特論　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学大学院工学院
Apr. 2022 - Present

公務員試験対策講座（国家公務員試験総合職工学の試験内容のうち水環境分野）　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学工学部
Mar. 2022 - Present

Science of Water, Environment, and Sanitation in the World　　　　　　　　　　　　　　　
Hokkaido University
Apr. 2021 - Present

環境工学実験Ⅰ　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学 工学部
Apr. 2021 - Present

フィールド科学特別講義（非常勤・集中講義）　　　　　　　　　　　　　　　
山口大学大学院創成科学研究科
Aug. 2025 - Aug. 2025

Experiment, Physics　　　　　　　　　　　　　　　
Osaka Institute of Technology
Apr. 2017 - Mar. 2020

Basic Mathematics 1　　　　　　　　　　　　　　　
Aino University
Apr. 2018 - Aug. 2019

Jan. 2024 - Present
International Humic Substances Society　　　　　　　　　　　　　　　

Jul. 2023 - Present
International Water Association　　　　　　　　　　　　　　　

Jan. 2023 - Present
土木学会　　　　　　　　　　　　　　　

Apr. 2022 - Present
日本分析化学会　　　　　　　　　　　　　　　

Apr. 2021 - Present
日本水環境学会　　　　　　　　　　　　　　　

Apr. 2017 - Present
The Geochemical Society of Japan　　　　　　　　　　　　　　　

Apr. 2015 - Present
Japanese Humic Substances Society　　　　　　　　　　　　　　　

Efficiency improvement and upgrading of small-scale wastewater treatment plants in rural areas by elucidating the unknown functions of bacteria and developing simple analytical methods
Grants-in-Aid for Scientific Research
01 Apr. 2025 - 31 Mar. 2028
中屋 佑紀
Japan Society for the Promotion of Science, Grant-in-Aid for Early-Career Scientists, Hokkaido University, 25K17712

天然有機物の非抽出・非破壊分析を可能にする固体EEM分光法の新規開拓
科学研究費助成事業
28 Jun. 2024 - 31 Mar. 2028
中屋 佑紀
日本学術振興会, 挑戦的研究(開拓), 北海道大学, 24K21328

Application of solid phase EEM for autonomous controlled membrane filtration system in drinking water treatment
Grants-in-Aid for Scientific Research
01 Apr. 2023 - 31 Mar. 2027
山村 寛, 角田 貴之, 中屋 佑紀
Japan Society for the Promotion of Science, Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Chuo University, 23K26237

Application of solid phase EEM for autonomous controlled membrane filtration system in drinking water treatment
Grants-in-Aid for Scientific Research
01 Apr. 2023 - 31 Mar. 2027
山村 寛, 角田 貴之, 中屋 佑紀
Japan Society for the Promotion of Science, Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Chuo University, 23H01543

老朽下水管調査の効率化を実現するEEM蛍光指紋法による下水水質分析受託事業の開拓　　　　　　　　　　　　　　　
2025 年度HSFC GAP ファンド(ステップ1)
Oct. 2025 - Sep. 2026
北海道未来創造スタートアップ育成相互支援ネットワーク（HSFC）, Principal investigator, Competitive research funding

下水管老朽箇所の特定のための下水中土壌成分検出法の開発　　　　　　　　　　　　　　　
2025年度ノーステック財団「研究開発助成事業」若手研究人材育成事業（若手研究人材・ネットワーク育成補助金（タレント補助金））
Aug. 2025 - Mar. 2026
公益財団法人北海道科学技術総合振興センター, Principal investigator, Competitive research funding

再生水を利用する都市河川における細菌再増殖の実態調査　　　　　　　　　　　　　　　
令和6年度 河川基金助成事業 若手研究者（一般的助成）
Apr. 2025 - Mar. 2026
公益財団法人 河川財団, Principal investigator, Competitive research funding

下水処理能力を左右する糸状菌を種類ごとに簡易に定量する深層学習ベースの画像解析技術の開発
第5回研究助成
Apr. 2025 - Mar. 2026
公益財団法人 萩原学術振興財団, Principal investigator, Competitive research funding

AIを利用した画像分析に基づく下水処理活性汚泥の簡易迅速性能診断法の発展途上国への展開　　　　　　　　　　　　　　　
第１０回研究助成金
Dec. 2023 - Nov. 2025
公益財団法人ヒロセ財団, Principal investigator, Competitive research funding

オキシデーションディッチ法強靭化のための汚泥の主要な細菌機能解明と簡易分析の適用　　　　　　　　　　　　　　　
2024年度 下水道の防災・減災、強靱化と活用に関する研究等助成金
Nov. 2024 - Oct. 2025
公益信託下水道振興基金, Principal investigator, Competitive research funding

下水中溶存有機物・細菌に着目した水質分析による雨天時浸入水発生箇所と規模の推定　　　　　　　　　　　　　　　
2024年度研究助成
Oct. 2024 - Sep. 2025
一般財団法人建設物価調査会, Principal investigator, Competitive research funding

活性汚泥の沈降｢過程｣に着目した動画解析による終沈出水中SS濃度を決定づける新規ﾊﾟﾗﾒｰﾀｰの探索　　　　　　　　　　　　　　　
国内研究助成2024年度
Oct. 2024 - Sep. 2025
公益財団法人クリタ 水・環境科学振興財団, 萌芽的研究a, Principal investigator, Competitive research funding

Development of pathogen sensors based on the detection of host recognition molecules for the post-PCR era
Grants-in-Aid for Scientific Research
30 Jun. 2023 - 31 Mar. 2025
佐藤 久, 齋藤 伸吾, 中屋 佑紀
Japan Society for the Promotion of Science, Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory), Hokkaido University, 23K17767

Development of new water quality sensing technology for realization of sustainable small-scale water supply systems
Grants-in-Aid for Scientific Research
05 Apr. 2021 - 31 Mar. 2025
佐藤 久, 山田 俊郎, 山村 寛, 黒田 恭平, 齋藤 伸吾
Legionella pneumophilaと結合できるDNAアプタマーを選抜した。選抜は、ポリマー増強キャピラリー過渡的等速電気泳動法（PectI）を用いておこなった。PectIでは、微生物の細胞は移動の初期に過渡的等速電気泳動（tITP）の原理に基づき、狭い単一ピークとなる。tITP積層モードが完了した後プロセスはキャピラリーゾーン電気泳動（CZE）モードに移行し、PectIにおけるピークの分離を行う。分離された単一ピークは、泳動バッファー中に添加されたポリエチレンオキサイド（600,000）（PEO）の効果により、CZEモードの間ずっと維持される。このようにして特異的な結合親和性を有するDNAアプタマーを獲得できる。
今年度は新規のLegionella pneumophila結合DNAアプタマーについて、PectI選抜法によるシングルラウンド選抜と、類似配列群に分けるクラスタリング法とディープラーニングを用いた定量的処理に基づく大規模NGS解析によって選抜することができた。この選抜システムで獲得できたDNAアプタマーの配列は、先行研究における、従来のCell-SELEXで選抜されたDNAアプタマーと比較して低い解離定数および速度定数を持っており、平衡論的、反応速度論的にLegionella pneumophilaと高い結合能を持ったDNAアプタマーを獲得できた。すなわち、先行研究で選抜されたDNAアプタマーよりもLegionella pneumophilaと特異的に結合し、安定した複合体を形成するアプタマーであると考えられ、我々が目標としているバイオセンサーの開発に適したDNAアプタマーを選抜できたと言える。
Japan Society for the Promotion of Science, Grant-in-Aid for Scientific Research (A), Hokkaido University, 21H04568

積雪寒冷地域の大都市・札幌の水環境保全のための下水由来汚染の定量的観測　　　　　　　　　　　　　　　
公益財団法人大林財団 研究助成
Apr. 2024 - Mar. 2025
公益財団法人大林財団, Principal investigator, Competitive research funding

AI を活用した活性汚泥ズーム画像のディープラーニングによる物理的処理性能の迅速診断法の開発　　　　　　　　　　　　　　　
令和６年度(2024年度) 前田記念工学振興財団研究助成
Apr. 2024 - Mar. 2025
公益財団法人前田記念工学振興財団, Principal investigator, Competitive research funding

蛍光染色とスペクトル分析に基づく活性汚泥性能の推定手法の開発　　　　　　　　　　　　　　　
2023年度研究助成
Dec. 2023 - Nov. 2024
一般財団法人フソウ技術開発振興基金, Principal investigator

AI を活用した画像分析による下水処理活性汚泥の細菌吸着能力診断技術の開発　　　　　　　　　　　　　　　
2023年度（特別募集）研究助成金
Nov. 2023 - Oct. 2024
公益財団法人 天野工業技術研究所, Principal investigator

Development and application of innovative monitoring technologies of microorganisms: Challenge to eradication of waterborne infectious diseases in Asia
Grants-in-Aid for Scientific Research
27 Oct. 2020 - 31 Mar. 2024
佐藤 久, 齋藤 伸吾, 山村 寛, 丁 青, 中屋 佑紀
本年度は、マイクロプレートリーダーを用いた簡易微生物測定法を開発した。測定手順は以下の通りである。市販の一般細菌用培地にサンプル水180μLを添加した。これを6ウェルマイクロプレートの各ウェルに添加した。マイクロプレートを37℃に設定したマイクロプレートリーダーにセットし、10分毎にウェルの波長630nmの吸光度を分析しながら24時間培養した。
一般細菌数の異なる2つのサンプルをn=5でマイクロプレートリーダーにより吸光度の経時変化を測定した。一般細菌数77 CFU/mLのサンプルでは、大体10から20時間で対数増殖によるサンプルの濁りが開始した。これに対し、15 CFU/mLのサンプルでは、10から40時間で対数増殖が見られた。n=5のとき、サンプル量は合わせて900 μLであり、平均すると1ウェルに入っている細菌数は2から3個である。必ずしも均等にウェルに入っているとは限らないため、0または1個しか細菌が存在しないウェルが生じると考えられる。これにより、細菌濃度が低いサンプルでは誤差が大きくなると考えられる。そこで、0から5時間で対数増殖が見られたら10点、5から10時間で対数増殖が見られたら9点という様にデータをスコア化し、細菌数と比較した。1~100CFU/mLにおいて、スコアと細菌数との間に相関関係が見られた。公定法では陰性であったにもかかわらず、本法で陽性だったサンプルも存在した。これは寒天培地上ではコロニーを作らないが、液体培地中では増殖する細菌種がいることが理由と考えられる。すなわち本法では、公定法では見落とす飲料水の細菌汚染をも検出できることが示唆された。
Japan Society for the Promotion of Science, Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B)), Hokkaido University, 20KK0090

下水処理場に簡易に導入できる動画解析に基づく活性汚泥沈降性の新規評価手法の開発　　　　　　　　　　　　　　　
2023年度ノーステック財団「研究開発助成事業」若手研究人材育成事業（若手研究人材・ネットワーク育成補助金（タレント補助金））
Aug. 2023 - Mar. 2024
公益財団法人北海道科学技術総合振興センター, Principal investigator, Competitive research funding

静止画像のディープラーニングによる認識を使った下水処理活性汚泥の性能の迅速診断システム開発の試み　　　　　　　　　　　　　　　
公益財団法人 萩原学術振興財団 第3回研究助成
Apr. 2023 - Mar. 2024
Principal investigator, Competitive research funding

北海道特有の気候に着目した融雪季河川水質の網羅的調査　　　　　　　　　　　　　　　
第37回（令和4年度）寿原記念財団研究助成
Apr. 2023 - Mar. 2024
Principal investigator, Competitive research funding

Development of highly sensitive pathogenic microbial sensors with nano-sized reaction fields
Grants-in-Aid for Scientific Research
09 Jul. 2021 - 31 Mar. 2023
佐藤 久
今年度は光導波路分光装置を用いて、下水を処理する活性汚泥中の硝化細菌（AOB）のRNA量を測定することに成功した。本手法ではAOBの16S rRNA（AOB-RNAと称す）と特異的に結合する2種類のDNA（プローブDNAと称す）を金ナノ粒子で修飾したAu-プローブと、活性汚泥から抽出したRNAをMgCl2を含むバッファー溶液に添加したものを試料とした。プローブDNAはAOB用のPCRプライマー（CTO189f A/B/CとRT1r）の塩基配列を参考に設計した。都市下水を処理する活性汚泥（A処理場またはB処理場）からRNAを抽出し、AOB-RNA濃度を上述のプライマーを用いて定量的逆転写PCR（RT-qPCR）により定量した。A処理場の活性汚泥またはNitrosomonas europaeaを添加した活性汚泥中のAOB-RNA濃度を測定した。活性汚泥から抽出したAOB-RNA濃度も、N. europaeaを添加した活性汚泥から抽出したAOB-RNA濃度（▲）も、RT-qPCRで測定した濃度と同程度であった。これより本手法では1.8×10の2乗から1.3×10の7乗 copies/μLの範囲で、RT-qPCRで定量した濃度に対する誤差27%から240%でAOB-RNAを定量可能であることがわかった。このように先行研究に比べて定量下限値が極めて低くなった理由として、全細菌とAOBでは使用するプローブDNAの塩基配列が異なりハイブリダイズした際の16S rRNAの立体構造や金ナノ粒子の位置関係が異なること、光導波路分光装置では金ナノ粒子の近接によってシグナル（散乱光）が増強されたことが考えられる。
Japan Society for the Promotion of Science, Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory), Hokkaido University, 21K18737

In-situ quantification of membrane foulants by Solid phase fluoresence excitation emission matrix
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
01 Apr. 2020 - 31 Mar. 2023
山村 寛, 中屋 佑紀, 丁 青
固体試料分析では，光源から入射する励起光のうち，固体試料中の色度成分に吸収されたり，散乱する光を除いた光量が有効照射量として試料に到達する．また，試料から放射された蛍光のうち，試料中で再吸収されたものを除いた光が有効蛍光量として検出される．このような，励起光の吸収・散乱および蛍光の再吸収が，固体試料の蛍光分析における，蛍光強度減衰（クエンチング）現象の主因とされる．BSAの蛍光強度は，濃度の増加に伴って，蛍光強度が飽和する対数増殖曲線を描いた．飽和曲線は，試料の色度によって異なり，色度が増加するほど，飽和蛍光強度が低下する傾向が観察された．これは，色度成分による励起光の吸収が蛍光強度に影響したものと推測する．
励起光の吸光度をK-M関数により算出した結果，蛍光強度とK-M関数（280 nm）の積が，質量%濃度に対して線形的な関係になることを発見した．これにより，蛍光強度とK-M関数の積から，任意成分の質量％濃度が推定可能になった．
K-M関数は，分光光度計を用いて測定した拡散反射率を利用したが，励起光の散乱は，蛍光測定時のレイリー散乱光にも同様に反映されると考える．着色粉末試料と酸化アルミニウム板のレイリー散乱光強度から拡散反射率を算出した結果，BSA濃度が20wt%以上において，図2と同様の線形関係が得られた．低濃度域では，レイリー散乱光の強度が低いため，散乱光の検出が難しかったものと考える．
以上の結果より，SPF-EEMのうち，蛍光強度とレイリー散乱を利用することで，簡易かつ高精度に，任意の固体蛍光物質を定量できる可能性が示された.
Japan Society for the Promotion of Science, Grant-in-Aid for Scientific Research (B), Chuo University, 20H02288

堆積物の非破壊分析と模擬実験との比較による腐植物質生成・分解過程の速度論的研究
科学研究費助成事業 若手研究
01 Apr. 2020 - 31 Mar. 2023
中屋 佑紀
腐植物質に関連する物質循環や環境汚染などの時間スケールは，腐植物質自身の生成や分解の時間スケールに関連していると考えられる．腐植物質の生成や分解には微生物・酵素の活動や，無機物との相互作用を伴う化学的な過程が含まれているが，本研究では特に化学的な過程に注目して模擬実験による速度論的追跡を行っている．
今年度は，腐植物質生成模擬過程の反応物としてのグリシン・リボース混合水溶液と鉄水酸化物ゲーサイトとの有機無機相互作用を，連続的な紫外可視分光測定によって調べた．グリシン・リボース混合水溶液のゲーサイト存在下での褐変過程を追跡したところ，褐変過程は１次反応速度式により近似でき，見かけの反応速度定数が得られた．これは，ゲーサイトを添加しない系での褐変過程に比べて早く進む反応であった．反応速度の温度依存性から活性化エネルギーを検討したところ，ゲーサイトが反応の活性化エネルギーを下げ褐変を促進させる触媒のように作用している可能性が示唆された．
一方，堆積物試料を非抽出で直接観測する方法として，固体三次元蛍光分光法を土壌試料に適用することを試みた．その結果，土壌の黒色度によって蛍光消光が起こっている可能性が示唆された．そこで，蛍光消光が発生する試料であっても蛍光物質の濃度を定量することができるような指標を検討するため，ウシ血清アルブミン（BSA）粉末に様々な濃度で顔料を添加した模擬蛍光試料での蛍光強度と拡散反射率を追跡した．その結果，蛍光極大強度と励起波長での吸光度の積が蛍光物質の濃度に比例する可能性が示唆され，これは土壌試料に対しても一部適用可能であった．
日本学術振興会, 若手研究, 大阪大学, 20K19958

石狩川水系における水量・水質の両面を考慮した河川の流況特性　　　　　　　　　　　　　　　
北海道河川財団令和4年度研究助成
Apr. 2022 - Mar. 2023
山田 朋人,佐藤 久,中屋 佑紀

H-NMR分光法による都市河川の有機物組成の縦断的調査　　　　　　　　　　　　　　　
令和4年度 河川基金助成事業 若手研究者（一般的助成）
Apr. 2022 - Mar. 2023
公益財団法人 河川財団, Principal investigator, Competitive research funding

「美しい都市河川を守る」～河川環境保全のための病原性・薬剤耐性遺伝子モニタリングに有用な有機物フィンガープリントの探索～　　　　　　　　　　　　　　　
研究助成
Apr. 2022 - Mar. 2023
公益財団法人大林財団, 北海道大学大学院工学研究院, Principal investigator, Competitive research funding

家畜糞尿の嫌気性消化によるメタンガス生成効率の安定化に向けたメタボローム解析　　　　　　　　　　　　　　　
第48回（2021年度）岩谷科学技術研究助成
Apr. 2022 - Mar. 2023
公益財団法人岩谷直治記念財団, 北海道大学大学院工学研究院, Principal investigator, Competitive research funding

⾼い細菌吸着能を持つ⾼機能活性汚泥フロックの開発　　　　　　　　　　　　　　　
2022年度技術研究助成
Jan. 2022 - Dec. 2022
公益財団法人JFE21世紀財団, 北海道大学大学院工学研究院, Principal investigator, Competitive research funding

細菌吸着能力に着目した高機能活性汚泥フロックの開発　　　　　　　　　　　　　　　
2021年度研究助成
Dec. 2021 - Nov. 2022
一般財団法人フソウ技術開発振興基金, 北海道大学大学院工学研究院, Principal investigator, Competitive research funding

その場分光観測による腐植物質生成模擬過程の速度論的追跡
科学研究費助成事業 特別研究員奨励費
25 Apr. 2018 - 31 Mar. 2020
中屋 佑紀
グリシン・リボース水溶液の褐変反応による腐植様物質の生成模擬過程の時間スケールを代表する指標として褐変過程の半増期を用い，高濃度・低濃度（ゲーサイト添加有・無）での結果をアーレニウスの式により低温へ外挿し，15℃での半増期を見積もると，最小で5年，最大で2000年程度となった．これは英虞湾水底堆積物の蛍光強度増加（腐植様物質増加に対応）の数十年の時間スケールと調和的であった．本研究で開発した水熱その場分光測定システムは様々な反応条件でのメイラード様反応に適用でき，腐植様物質生成時間スケールのより詳細な理解につながると考えられる．
一方，腐植物質などの有機物とゲーサイトなどの無機物が共存する系を直接観測する方法として，三次元蛍光分光法を土壌試料に適用することを試みた．粉体状態での蛍光分光測定ではアルカリ抽出などの前処理なく腐植化度を評価することができ，土壌や有機質廃棄物の分析での活用が広まりつつあるが，有機物の濃度が高い土壌・堆積物試料では，黒色の有機物による蛍光の再吸収が起こる可能性がある．そこで本研究では，全炭素・窒素量の異なる3種類の粉体土壌試料（黒ボク土，灰色低地土，黄色土），およびそれらのアルカリ抽出残渣，アルミナ・マグネタイト粉末による希釈試料を用意し，蛍光スペクトルおよび可視反射スペクトルを測定し，試料の黒色に由来する蛍光消光効果を検討した．
その結果，土壌の種類によって，アルカリ抽出による有機物減少やアルミナ希釈による試料の白色化により，蛍光強度が大きくなる場合と，蛍光強度が小さくなる場合の両方があることがわかった．このような試料のL*値（白さ）による蛍光強度の減少メカニズムを理解することは，土壌粉体の蛍光スペクトルを定量的に理解するうえで重要であり，さらなる検討が必要である．
日本学術振興会, 特別研究員奨励費, 大阪大学, 18J10249

微生物の核酸検出方法、試薬組成物、試薬キット、測定システム、及びプログラム　　　　　　　　　　　　　　　
Patent right, 佐藤 久, 中屋 佑紀, 中島 芽梨, 半田 久純, 佐成 航太, 平野 麗子, 土井 和彦, 北條 渉, 岩渕 拓也, 酒井 博則
特願JP2024015385, 18 Apr. 2024

【高大接続】高校生への研究プレゼン指導　　　　　　　　　　　　　　　
Apr. 2017 - Apr. 2020
Lecturer
Seminar
大阪大学SEEDSプログラム
研究発表のためのプレゼンテーションセミナー（4月開催）

【高大接続】大阪大学ミニ・オープンキャンパスin福岡　　　　　　　　　　　　　　　
15 Jul. 2018
Lecturer
大阪大学 高等教育・入試研究開発センター
大阪大学ミニ・オープンキャンパスin福岡 https://chega.osaka-u.ac.jp/event/20180522974/

若手腐植物質研究者が今、聞きたい：質量分析への学際的アプローチ　　　　　　　　　　　　　　　
25 Oct. 2025 - 25 Oct. 2025
Planning etc, Panel chair etc
Academic society etc
日本腐植物質学会
岡山理科大学 50 周年記念館, 岡山理科大学で開催された日本腐植物質学会第41回講演会において企画講演「若手腐植物質研究者が今、聞きたい：質量分析への学際的アプローチ」の企画を神戸大学・木田森丸助教、京都工芸繊維大学・初雪助教と共同で行い、司会進行を行った。

シリーズ「生成AIの教育研究活動」① 演題「生成AIの教育研究活動①事例共有と問題提起」
28 May 2024
Others
Academic society etc
北海道大学大学院教育推進機構 高等教育研修センター、オープンエデュケーションセンター（共催）
講演者は無料で利用できるChatGPT-3。5 (Open AI)を、担当講義である「英語中級」や、研究室での学生指導、各種資料作成時の文章の言い換えなどに利用している。今回は、英語の講義において、重要単語のリストアップや文法の解説、英文の校正などにChatGPTを活用した例を紹介する。本講義では生成AIだけでなく様々な翻訳AIを活用することを推奨しているが、その狙い・想いや、実際に学生に指導したAI活用上の注意事項についても述べたい。

第29回衛生工学シンポジウム 企画セッション「ハカセになろう！」
04 Nov. 2022
Others
Competition etc
北海道大学

JSPS特別研究員申請セミナー「博士課程学生のキャリアにおける日本学術振興会特別研究員の意義」　　　　　　　　　　　　　　　
10 Mar. 2022
Others
Academic society etc
北海道大学大学院工学院

Jan. 2018 - Present
大阪大学若手FD研究会 会員

Mar. 2017 - Present
FFPアルムナイアカデミー会員
https://www.tlsc.osaka-u.ac.jp/ffp_alumni/

Jul. 2022 - Jul. 2025
大阪大学若手FD研究会 代表

Sep. 2024
全学教育科目に係る授業アンケートにおけるエクセレント・ティーチャーズ（令和５年度）
担当授業である「英語演習 中級：英語で学ぶ世界の水・環境・衛生の科学」のアンケート結果が理系・外国語演習区分において上位2件に該当したため、北海道大学高等教育推進機構により当該表彰を受けた。
https://www.high.hokudai.ac.jp/wp-content/uploads/2024/09/R5_exteachers.pdf

Jun. 2024
月刊下水道令和６年6月号 寄稿「活性汚泥の「顔」認証～機械学習による活性汚泥の画像診断の試み～」 月刊下水道, vol.47, No.7（2024年6月号）「明日につなぐ下水道研究」特集

Feb. 2024
北海道大学技術支援・設備共用コアステーション 研究支援人材広報誌Specialist４号 寄稿 SPECIALIST INTERVIEW 2「PET原料製造廃水処理リアクターの処理能力監視へのNMR法の適用 」
https://cosmos.gfc.hokudai.ac.jp/wp/wp-content/uploads/2024/03/SPECIALIST_vol4.pdf

Jan. 2024
月刊下水道令和６年１月号 寄稿「下水道機能拡張：公衆衛生情報収集システムとしての価値」 月刊下水道, vol.47, No.1（2024年１月号）「未来へのブレイクスルー ――若いパワーで切り拓け！」特集

Aug. 2022
Water quality analysis in rivers and water treatment facilities
https://www.eng.hokudai.ac.jp/engineering/e429/feature/feature02.php

Mar. 2020
FFP（未来の大学教員養成プログラム）特別座談会（インタビュー）
https://www.tlsc.osaka-u.ac.jp/ffp_voice/2020/03/ffp.html

Mar. 2017
大阪大学未来の大学教員養成プログラム 修了
https://www.tlsc.osaka-u.ac.jp/ffp/