2021年08月, 日本哺乳類学会, 2021年度日本哺乳類学会論文賞　　　　　　　　　　　　　　　
Introduction and expansion history of the masked palm civet, Paguma larvata, in Japan, revealed by mitochondrial DNA control region and cytochrome b analysis. Mammal Study 45 (3): 243-251, 2020.
Endo, Y;Lin, L.K;Yamazaki, K;Pei, K.J.C;Chang, S.W;Chen, Y.J;Ochiai, K;Yachimori, S;Anezaki, T;Kaneko, Y;Masuda, R

2019年, 日本哺乳類学会, 2019年度日本哺乳類学会賞　　　　　　　　　　　　　　　
「分子系統進化学に基づく哺乳類の生物地理学への寄与」
増田 隆一, 「分子系統進化学に基づく哺乳類の生物地理学への寄与」

2019年, 日本動物学会, 2019年度日本動物学会賞　　　　　　　　　　　　　　　
「北ユーラシアにおける大型哺乳類・鳥類の遺伝的多様性と動物地理学的歴史の解明」
増田 隆一, 「北ユーラシアにおける大型哺乳類・鳥類の遺伝的多様性と動物地理学的歴史の解明」

2002年, 日本動物学会, 2002年度日本動物学会論文賞(Zoological Science Award）　　　　　　　　　　　　　　　
Ancient DNA analysis of brown bear (Ursus arctos) remains from the archeological site of Rebun Island, Hokkaido, Japan. Zoological Science 18: 741-751, 2021.
Masuda, R;Amano, T;Ono, H, Masuda, R., Amano, T., and Ono, H. (2001) Ancient DNA analysis of brown bear (Ursus arctos) remains from the archeological site of Rebun Island, Hokkaido, Japan. Zoological Science 18: 741-751., 日本国

Molecular Phylogeographic Variation in the Siberian Weasel (Mustela sibirica) in Asia, Including Japan, Examined by ddRAD-Seq Analysis
Kentaro Tsuchihashi, Yu Endo, Alexei V. Abramov, Kazuo Suzuki, Satoshi Suzuki, Liang-Kong Lin, Shuuji Yachimori, Koji Yamazaki, Yayoi Kaneko, Shigeki Watanabe, Sanghoon Han, Atsushi Nagano, Yoshinori Nishita, Ryuichi Masuda
Zoological Science, 42, 5, 463, 470, Zoological Society of Japan, 2025年09月24日, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Copy number variation in the amylase gene (AMY) in the brown bear (Ursus arctos), based on whole genome resequencing data
Naoko Kotani, Yu Endo, Naoki Osada, Tsutomu Mano, Alexei V. Abramov, Ryuichi Masuda
Zoological Science, 42, 4, 366, 373, Zoological Society of Japan, 2025年07月14日, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeography of Mustela eversmanii and M. putorius (Carnivora: Mustelidae) throughout continental Eurasia, based on mitochondrial control-region sequences
Reita Watanabe, Yoshinori Nishita, Alexei V. Abramov, Stanislava Peeva, Evgeniy Raichev, Ryuichi Masuda
Mammal Research, 70, 309, 316, Springer Science and Business Media LLC, 2025年05月15日, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Identification of mammal species preyed upon by urban foxes (Vulpes vulpes) in Sapporo, Japan, determined by fecal DNA analysis
Daiki Waga, Yosuke Amaike, Nariaki Nonaka, Ryuichi Masuda
Journal of Veterinary Medical Science, 87, 8, 960, 965, Japanese Society of Veterinary Science, 2025年, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Diversity of MHC class II DRB alleles and mitochondrial DNA in northern and eastern European pine marten, Martes martes (Mammalia: Mustelidae)
Yoshinori Nishita, Risto Väinölä, Alexei V Abramov, Ryuichi Masuda
Biological Journal of the Linnean Society, 143, 1, 1, 13, Oxford University Press (OUP), 2024年, ［査読有り］, ［最終著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Abstract

Four mitochondrial phylogroups are distinguished in the European pine marten (Martes martes), two of which, FNR1/2, are shared with the more easterly sister species, the sable (Martes zibellina). Here, we found that the phylogroup frequencies differed markedly between the southern Finland and western Russia populations in the eastern part of the range of Martes martes, suggesting differential introgression from M. zibellina in these regions. We also examined the diversity of a protein-coding gene, MHC class II DRB, in these two Martes species. We detected 16 functional Martes martes DRB alleles (Mama-DRBs), including several codons that seem to have undergone positive selection, and eight presumed pseudogenes (Mama-DRB*PSs); some alleles/pseudogenes were geographically widespread and others restricted. In a broader carnivoran DRB tree, all Mama-DRBs grouped within a mustelid clade, four in a basal group comprising alleles from early-diverged species and the others in a derived group containing alleles from more recently diverged species. Many alleles showed trans-species polymorphism, suggesting that Mama-DRBs have evolved under pathogen-driven balancing selection. Three of six Mama-DRBs and one of four pseudogenes shared with Martes zibellina were restricted to the FNR1/2 mitochondrial DNA phylogroups, pointing to the possibility that genetic introgression from Martes zibellina might have contributed to Mama-DRB diversity and thus adaptability.

Phylogeography of the stone marten (Martes foina: Mustelidae: Mammalia) in Eurasia, based on a mitochondrial DNA analysis
Hiroya Ishii, Yosuke Amaike, Yoshinori Nishita, Alexei V. Abramov, Ryuichi Masuda
Mammal Research, 68, 3, 375, 381, Springer Science and Business Media LLC, 2023年04月27日, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Comparison of microsatellite and the MHC class II DRB locus diversity in raccoon dogs (Nyctereutes procyonoides) between Finland and Japan
Yuri Sugiyama, Yoshinori Nishita, Yosuke Amaike, Antti Oksanen, Antti Lavikainen, Ryuichi Masuda
Annales Zoologici Fennici, 60, 1, 57, 71, Finnish Zoological and Botanical Publishing Board, 2023年04月03日, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeography of the Altai weasel (Carnivora: Mustelidae: Mustela altaica) based on an analysis of mitochondrial control-region haplotypes
Nodoka Suzuki, Alexei V Abramov, Yosuke Amaike, Yoshinori Nishita, Ryuichi Masuda
Biological Journal of the Linnean Society, 138, 3, 274, 281, Oxford University Press (OUP), 2023年02月15日, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Abstract

The phylogeography of the Altai weasel (Mustela altaica) based on mitochondrial control-region sequences was investigated using samples from individuals obtained widely across the species range, including Central Asia, Tibet and southern Siberia. Thirty-four haplotypes were identified among 53 individuals from 32 localities. A maximum-likelihood phylogenetic tree for haplotypes showed two major clades, clades I and II. Clade I contained haplotypes from northern Eurasia, including the continental Far East, Altai Mountains and eastern Kazakhstan. Clade II comprised two subclades: group IIa, with haplotypes from around the Pamir Mountains, and the poorly supported group IIb, with haplotypes from the Tibetan Plateau. High haplotype diversity and low nucleotide diversity for clade I suggest that the range of M. altaica expanded over a relatively short period in northern Eurasia. High haplotype and nucleotide diversity for clade II indicate a longer-term, more stable population resulting from geographical isolation of individuals on the Tibetan Plateau by surrounding mountain ranges. Our study suggests that the ancestral population of M. altaica migrated into Tibet from the outside and has diversified in Tibet, seemingly not supporting the ‘out-of-Tibet’ hypothesis; however, we could not completely refute this hypothesis because an individual having a group IIb haplotype was detected in Mongolia.

Diversity of mitochondrial D‐loop haplotypes from ancient Thracian horses in Bulgaria
Yoshinori Nishita, Yosuke Amaike, Nikolai Spassov, Latinka Hristova, Dimitar Kostov, Diyana Vladova, Stanislava Peeva, Evgeniy Raichev, Radka Vlaeva, Ryuichi Masuda
Animal Science Journal, 94, 1, e13810, Wiley, 2023年01月, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Diversity of the MHC class II DRB gene in the wolverine (Carnivora: Mustelidae: Gulo gulo) in Finland
Yuri Sugiyama, Yoshinori Nishita, Gerhardus M. J. Lansink, Katja Holmala, Jouni Aspi, Ryuichi Masuda
PLOS ONE, 17, 5, e0267609, 2022年05月, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic diversity and phylogeography of urban hedgehogs (Erinaceus europaeus) around Helsinki, Finland, revealed by mitochondrial DNA and microsatellite analyses
Momoko Osaka, Kirsi Pynnönen-Oudman, Antti Lavikainen, Yosuke Amaike, Yoshinori Nishita, Ryuichi Masuda
Mammal Research, 67, 1, 99, 107, Springer Science and Business Media LLC, 2022年01月, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Population genetic structure and diversity of the East Balkan Swine (Sus scrofa) in Bulgaria, revealed by mitochondrial DNA and microsatellite analyses
Keita Ishikawa, Radostina Doneva, Evgeniy G. Raichev, Stanislava Peeva, Valentin D. Doichev, Yosuke Amaike, Yoshinori Nishita, Yayoi Kaneko, Ryuichi Masuda
Animal Science Journal, 92, 1, e13630, Wiley, 2021年09月, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Demographic history of the brown bear (Ursus arctos) on Hokkaido Island, Japan, based on whole-genomic sequence analysis
Yu Endo, Naoki Osada, Tsutomu Mano, Ryuichi Masuda
Genome Biology and Evolution, evab195, Oxford University Press (OUP), 2021年08月19日, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）,
Previous studies of the brown bear (Ursus arctos) on Hokkaido Island, Japan, have detected three geographically distinct subpopulations representing different mitochondrial lineages and shown that gene flow between subpopulations has occurred due to male-biased dispersal. In this study, we determined whole-genomic sequences for six Hokkaido brown bears and analyzed these data along with previously published genomic sequences of 17 brown bears from other parts of the world. We found that the Hokkaido population is genetically distinct from the other populations, keeping genetic diversity higher than the endangered populations in Western Europe but lower than most populations on the continents. A reconstruction of historical demography showed no increase in population size for the Hokkaido population during the Eemian interglacial period (130,000–114,000 years ago). In a phylogenetic analysis of the autosomal data, the Hokkaido population formed a clade distinct from North American and European populations, showing that it has maintained genetic diversity independently from continental populations following geographical isolation on the island. This autosomal genetic similarity contrasts with the geographically separate mitochondrial lineages on Hokkaido and indicates the occurrence of male-driven gene flow between subpopulations.

Evolution of MHC class I genes in Japanese and Russian raccoon dogs, Nyctereutes procyonoides (Carnivora: Canidae)
Aye Mee F. Bartocillo, Yoshinori Nishita, Alexei V. Abramov, Ryuichi Masuda
Mammal Research, 66, 2, 371, 383, Springer Science and Business Media LLC, 2021年03月15日, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogenetic relationships of ancient brown bears (Ursus arctos) on Sakhalin Island, revealed by APLP and PCR-direct sequencing analyses of mitochondrial DNA
Kaito Mizumachi, Sergei V. Gorbunov, Alexander A. Vasilevski, Tetsuya Amano, Hiroko Ono, Pavel A. Kosintsev, Daisuke Hirata, Yoshinori Nishita, Ryuichi Masuda
Mammal Research, 66, 1, 95, 102, Springer Science and Business Media LLC, 2021年01月, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic diversity and evolution of the MHC class II DRB gene in the Japanese marten, Martes melampus (Carnivora: Mustelidae)
Sho Hosotani, Yoshinori Nishita, Ryuichi Masuda
Mammal Research, 65, 3, 573, 582, Springer Science and Business Media LLC, 2020年07月, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Introduction and Expansion History of the Masked Palm Civet, Paguma larvata, in Japan, Revealed by Mitochondrial DNA Control Region and Cytochrome b Analysis
Yu Endo, Liang-Kong Lin, Koji Yamazaki, Kurtis Jai-Chyi Pei, Shih-Wei Chang, Yen-Jean Chen, Keiji Ochiai, Shuuji Yachimori, Tomoko Anezaki, Yayoi Kaneko, Ryuichi Masuda
Mammal Study, 45, 3, 243, 243, Mammalogical Society of Japan, 2020年06月26日, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Mitochondrial haplogrouping of the ancient brown bears (Ursus arctos) in Bulgaria, revealed by the APLP method
Mizumachi, K., Spassov, N., Kostov D., Raichev E.G., Peeva S., Hirata D., Nishita Y., Kaneko Y., Masuda R.
Mammal Research, 65, 2, 413, 421, 2020年04月, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Holocene changes in the distributions of Asian and European badgers (Carnivora: Mustelidae: Meles) inferred from ancient DNA analysis
Kinoshita E., Kosintsev P.A., Abramov A.V., Solovyev V.A., Saveljev A.P., Nishita Y., Masuda R.
Biological Journal of the Linnean Society, 129, 3, 594, 602, 2020年03月, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際共著］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeography of the Siberian weasel (Mustela sibirica), based on a mitochondrial DNA analysis
Ishikawa, K, Abramov, A.V, Amaike, Y, Nishita, Y, Masuda, R
Biological Journal of the Linnean Society, 129, 3, 587, 593, 2020年03月, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeography and population history of the least weasel (Mustela nivalis) in the Palearctic based on multilocus analysis
Sato, T., Abramov, A.V., Raichev, E.G., Kosintsev, P.A., Väinölä, R., Murakami, T., Kaneko, Y., Masuda, R.
Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research, 58, 1, 408, 426, Hindawi Limited, 2020年02月, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Molecular evolution of MHC class II DRB exon 2 in Japanese and Russian raccoon dogs, Nyctereutes procyonoides (Carnivora: Canidae)
Bartocillo, A.M, Nishita, Y, Abramov, A.V, Masuda, R
Biological Journal of the Linnean Society, 129, 1, 61, 73, 2020年01月, ［査読有り］, ［最終著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Variation in pancreatic amylase gene copy number among Eurasian badgers (Carnivora, Mustelidae, Meles) and its relationship to diet
S. Abduriyim, Y. Nishita, A. V. Abramov, V. A. Solovyev, A. P. Saveljev, P. A. Kosintsev, A. P. Kryukov, E. Raichev, R. Väinölä, Y. Kaneko, R. Masuda
Journal of Zoology, 308, 28, 36, 2019年05月, ［査読有り］

Evolution of MHC class I genes in Eurasian badgers, genus Meles (Carnivora, Mustelidae).
Shamshidin Abduriyim, Yoshinori Nishita, Pavel A Kosintsev, Evgeniy Raichev, Risto Väinölä, Alexey P Kryukov, Alexei V Abramov, Yayoi Kaneko, Ryuichi Masuda
Heredity, 122, 2, 205, 218, 2019年02月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, Because of their role in immune defense against pathogens, major histocompatibility complex (MHC) genes are useful in evolutionary studies on how wild vertebrates adapt to their environments. We investigated the molecular evolution of MHC class I (MHCI) genes in four closely related species of Eurasian badgers, genus Meles. All four species of badgers showed similarly high variation in MHCI sequences compared to other Carnivora. We identified 7-21 putatively functional MHCI sequences in each of the badger species, and 2-7 sequences per individual, indicating the existence of 1-4 loci. MHCI exon 2 and 3 sequences encoding domains α1 and α2 exhibited different clade topologies in phylogenetic networks. Non-synonymous nucleotide substitutions at codons for antigen-binding sites exceeded synonymous substitutions for domain α1 but not for domain α2, suggesting that the domains α1 and α2 likely had different evolutionary histories in these species. Positive selection and recombination seem to have shaped the variation in domain α2, whereas positive selection was dominant in shaping the variation in domain α1. In the separate phylogenetic analyses for exon 2, exon 3, and intron 2, each showed three clades of Meles alleles, with rampant trans-species polymorphism, indicative of the long-term maintenance of ancestral MHCI polymorphism by balancing selection.

Genetic diversity of MHC class II DRB alleles in the marbled polecat, Vormela peregusna, in Bulgaria
Nishita Yoshinori, Spassov Nikolai, Peeva Stanislava, Raichev Evgeniy G, Kaneko Yayoi, Masuda Ryuichi
ETHOLOGY ECOLOGY & EVOLUTION, 31, 1, 59, 72, 2019年01月02日, ［査読有り］

Sexual dimorphism of craniological characters in the Altai weasel Mustela altaica (Carnivora, Mustelidae)
Andrey Yu Puzachenko, Ryuichi Masuda, Alexei V. Abramov
Russian Journal of Theriology, 18, 12, 19, 2019年01月, ［査読有り］

Sex-biased natal dispersal in Hokkaido brown bears revealed through mitochondrial DNA analysis
Shirane Yuri, Shimozuru Michito, Yamanaka Masami, Tsuruga Hifumi, Hirano Saiko, Nagano Natsuo, Moriwaki Jun, Nakanishi Masanao, Ishinazaka Tsuyoshi, Nose Takane, Kasai Shinsuke, Shirayanagi Masataka, Masuda Yasushi, Fujimoto Yasushi, Osada Masahiro, Akaishi Masao, Mano Tsutomu, Masuda Ryuichi, Sashika Mariko, Tsubota Toshio
EUROPEAN JOURNAL OF WILDLIFE RESEARCH, 64, 6, 65, 2018年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic Diversity of MHC Class II DRB1 Exon 2 in the Red Fox (Vulpes vulpes) on Hokkaido, Japan.
Yosuke Amaike, Yoshinori Nishita, Kohji Uraguchi, Ryuichi Masuda
Zoological Science, 35, 5, 402, 410, 2018年10月, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際誌］
英語, To assess the genetic diversity of the red fox (Vulpes vulpes) population on Hokkaido Island, northern Japan, we examined genotypes of exon 2 of the major histocompatibility complex (MHC) class II DRB1 gene for 232 individuals and identified 17 novel alleles. The subpopulation in the Southern area was genetically differentiated from those in all other areas on Hokkaido, suggesting isolation in southern Hokkaido. In addition, the Southern subpopulation is lower in genetic diversity than the other subpopulations, possibly resulting from purifying selection and/or a recent bottleneck. The non-synonymous substitutions exceeded the synonymous substitutions for codons encoding antigen-binding sites (ABSs) in exon 2, indicating that the red fox DRB1 alleles have evolved under positive selection. In a Bayesian phylogenetic tree, although most of the DRB1 alleles from the Hokkaido red fox were contained within a red fox-like canid (Vulpes) clade, some belonged to another canid clade. This means trans-species polymorphism maintained by balancing selection. Our results showed the local variability and the presence of selection on the MHC gene in this population, which contributes to the understanding of the historical background and the molecular evolution.

Low genetic diversity in an isolated red fox (Vulpes vulpes) population on Mt. Hakodate, Japan, revealed by microsatellite analyses of fecal samples
Amaike Yosuke, Murakami Takahiro, Masuda Ryuichi
MAMMAL STUDY, 43, 3, 141, 152, 2018年09月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic diversity of MHC class II DRB alleles in the continental and Japanese populations of the sable Martes zibellina (Mustelidae, Carnivora, Mammalia)
Yoshinori Nishita, Alexei V. Abramov, Takahiro Murakami, Ryuichi Masuda
Mammal Research, 63, 3, 369, 378, 2018年07月01日, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeography of continental and island populations of Blakiston’s fish-owl (Bubo blakistoni) in northeastern Asia
Omote, K, Surmach, S.G, Kohyama, T.I, Takenaka, T, Nishida, C, Masuda, R
Journal of Raptor Research, 52, 1, 31, 41, Ornithological Societies of North America, 2018年03月01日, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Low genetic variation in the MHC class II DRB gene and MHC-linked microsatellites in endangered island populations of the leopard cat (Prionailurus bengalensis) in Japan.
Toshinori Saka, Yoshinori Nishita, Ryuichi Masuda
Immunogenetics, 70, 2, 115, 124, 2018年02月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Isolated populations of the leopard cat (Prionailurus bengalensis) on Tsushima and Iriomote islands in Japan are classified as subspecies P. b. euptilurus and P. b. iriomotensis, respectively. Because both populations have decreased to roughly 100, an understanding of their genetic diversity is essential for conservation. We genotyped MHC class II DRB exon 2 and MHC-linked microsatellite loci to evaluate the diversity of MHC genes in the Tsushima and Iriomote cat populations. We detected ten and four DRB alleles in these populations, respectively. A phylogenetic analysis showed DRB alleles from both populations to be closely related to those in other felid DRB lineages, indicating trans-species polymorphism. The MHC-linked microsatellites were more polymorphic in the Tsushima than in the Iriomote population. The MHC diversity of both leopard cat populations is much lower than in the domestic cat populations on these islands, probably due to inbreeding associated with founder effects, geographical isolation, or genetic drift. Our results predict low resistance of the two endangered populations to new pathogens introduced to the islands.

Hybridization between the European and Asian badgers (Meles, Carnivora) in the Volga-Kama region, revealed by analyses of maternally, paternally and biparentally inherited genes
Emi Kinoshita, Alexei V. Abramov, Vyacheslav A. Soloviev, Alexander P. Saveljev, Yoshinori Nishita, Yayoi Kaneko, Ryuichi Masuda
Mammalian Biology, 94, 140, 148, Elsevier GmbH, 2018年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Cranial variation in the siberian weasel mustela sibirica (Carnivora, mustelidae) and its possible taxonomic implications
Alexei V. Abramov, Andrey Yu. Puzachenko, Ryuichi Masuda
Zoological Studies, 57, : 14, 2018年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Duplication and Variation in the Major Histocompatibility Complex Genes in Blakiston's Fish Owl, Bubo blakistoni
Keita Omote, Tetsuo I. Kohyama, Chizuko Nishida, Keisuke Saito, Satoshi Fujimoto, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 34, 6, 484, 489, 2017年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Paternal phylogeographic structure of the brown bear (Ursus arctos) in northeastern Asia and the effect of male-mediated gene flow to insular populations
Daisuke Hirata, Tsutomu Mano, Alexei V. Abramov, Gennady F. Baryshnikov, Pavel A. Kosintsev, Koichi Murata, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL LETTERS, 3, 21, 2017年11月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Diversity and evolution of MHC class II DRB gene in the Eurasian badger genus Meles (Mammalia: Mustelidae)
Shamshidin Abduriyim, Yoshinori Nishita, Pavel A. Kosintsev, Evgeniy Raichev, Risto Vainola, Alexey P. Kryukov, Alexei V. Abramov, Yayoi Kaneko, Ryuichi Masuda
BIOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, 122, 2, 258, 273, 2017年10月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Food niche segregation between sympatric golden jackals and red foxes in central Bulgaria
H. Tsunoda, E. G. Raichev, C. Newman, R. Masuda, D. M. Georgiev, Y. Kaneko
JOURNAL OF ZOOLOGY, 303, 1, 64, 71, 2017年09月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic variation of major histocompatibility complex genes in the endangered red-crowned crane
Takuya Akiyama, Tetsuo I. Kohyama, Chizuko Nishida, Manabu Onuma, Kunikazu Momose, Ryuichi Masuda
IMMUNOGENETICS, 69, 7, 451, 462, 2017年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Low Genetic Variation of Red-crowned Cranes on Hokkaido Island, Japan, Over the Hundred Years
Takuya Akiyama, Kunikazu Momose, Manabu Onuma, Fumio Matsumoto, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 34, 3, 211, 216, 2017年06月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Diversity of MHC class II DRB alleles in the Eurasian population of the least weasel, Mustela nivalis (Mustelidae: Mammalia)
Yoshinori Nishita, Pavel A. Kosintsev, Voitto Haukisalmi, Risto Vainola, Evgeniy G. Raichev, Takahiro Murakami, Alexei V. Abramov, Yayoi Kaneko, Ryuichi Masuda
BIOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, 121, 1, 28, 37, 2017年05月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A Comparison of Visual and Genetic Techniques for Identifying Japanese Marten Scats - Enabling Diet Examination in Relation to Seasonal Food Availability in a Sub-alpine Area of Japan
Masumi Hisano, Lisa Hoshino, Shouko Kamada, Ryuichi Masuda, Chris Newman, Yayoi Kaneko
ZOOLOGICAL SCIENCE, 34, 2, 137, 146, 2017年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular phylogeny of Eurasian badgers (Meles) around the distribution boundaries, revealed by analyses of mitochondrial DNA and Y-chromosomal genes
Emi Kinoshita, Pavel A. Kosintsev, Evgeniy G. Raichev, Voitto K. Haukisalmi, Alexey P. Kryukov, Oystein Wiig, Alexei V. Abramov, Yayoi Kaneko, Ryuichi Masuda
BIOCHEMICAL SYSTEMATICS AND ECOLOGY, 71, 121, 130, 2017年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Population genetic structure of the urban fox in Sapporo, northern Japan
Y. Kato, Y. Amaike, T. Tomioka, T. Oishi, K. Uraguchi, R. Masuda
JOURNAL OF ZOOLOGY, 301, 2, 118, 124, 2017年02月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Comparative phylogeography of the endemic Japanese weasel (Mustela itatsi) and the continental Siberian weasel (Mustela sibirica) revealed by complete mitochondrial genome sequences
Mohammed A. Shalabi, Alexei V. Abramov, Pavel A. Kosintsev, Liang-Kong Lin, Sang-Hoon Han, Shigeki Watanabe, Koji Yamazaki, Yayoi Kaneko, Ryuichi Masuda
BIOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, 120, 2, 333, 348, 2017年02月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular phylogenetic status of the Bulgarian marbled polecat (Vormela peregusna, Mustelidae, Carnivora), revealed by Y chromosomal genes and mitochondrial DNA sequences
Kaito Mizumachi, Yoshinori Nishita, Nikolai Spassov, Evgeniy G. Raichev, Stanislava Peeva, Yayoi Kaneko, Ryuichi Masuda
BIOCHEMICAL SYSTEMATICS AND ECOLOGY, 70, 99, 107, 2017年02月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Sexual dimorphism in body parameters of the golden jackal Canis aureus L., 1758 (Carnivora, Canidae) in the Sarnena Sredna Gora Mountain and Thracian Plain (Bulgaria)
Raichev, E, Peeva, S, Masuda, R, Kaneko, Y, Tsunoda, H, Georgiev, D, Georgiev, D
Trakia Journal of Sciences, 15, 135, 140, 2017年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Gene duplication and concerted evolution of mitochondrial DNA in crane species
Takuya Akiyama, Chizuko Nishida, Kunikazu Momose, Manabu Onuma, Kazutoshi Takami, Ryuichi Masuda
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 106, 158, 163, 2017年01月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Population Structure of the Raccoon Dog on the Grounds of the Imperial Palace, Tokyo, Revealed by Microsatellite Analysis of Fecal DNA
Wataru Saito, Yosuke Amaike, Takako Sako, Yayoi Kaneko, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 33, 5, 485, 490, 2016年10月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Ancient DNA analysis of marmot tooth remains from the Shamanka II and Lokomotiv-Raisovet cemeteries near Lake Baikal: Species identification and genealogical characteristics
Ryuichi Masuda, Robert J. Losey, Vladimir I. Bazaliiskii, Bair Badmaev
QUATERNARY INTERNATIONAL, 419, 133, 139, 2016年10月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Comparing the summer diet of stone martens (Martes foina) in urban and natural habitats in Central Bulgaria
M. Hisano, E. G. Raichev, S. Peeva, H. Tsunoda, C. Newman, R. Masuda, D. M. Georgiev, Y. Kaneko
ETHOLOGY ECOLOGY & EVOLUTION, 28, 3, 295, 311, 2016年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeography of the Eurasian red squirrel (Sciurus vulgaris orientis) on the boreal island of Hokkaido, Japan
Maiko Noda, Tatsuo Oshida, Alexei V. Abramov, Galina Baranova, Gennady Baryshinikov, Hideo Ichikawa, Ryuichi Masuda
JOURNAL OF NATURAL HISTORY, 50, 11-12, 771, 786, 2016年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic variation of the MHC class II DRB genes in the Japanese weasel, Mustela itatsi, endemic to Japan, compared with the Siberian weasel, Mustela sibirica
Y. Nishita, A. V. Abramov, P. A. Kosintsev, L. -K. Lin, S. Watanabe, K. Yamazaki, Y. Kaneko, R. Masuda
TISSUE ANTIGENS, 86, 6, 431, 442, 2015年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Geographical variation in skull morphology in the Hokkaido population of the red fox, Vulpes vulpes
Yosuke Amaike, Takuya Oishi, Kohji Uraguchi, Alexei V. Abramov, Ryuichi Masuda
MAMMAL STUDY, 40, 4, 245, 256, 2015年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Isolation and characterization of major histocompatibility complex class II B genes in cranes
Tetsuo I. Kohyama, Takuya Akiyama, Chizuko Nishida, Kazutoshi Takami, Manabu Onuma, Kunikazu Momose, Ryuichi Masuda
IMMUNOGENETICS, 67, 11-12, 705, 710, 2015年11月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

The illegal exploitation of hog badgers (Arctonyx collaris) in China: genetic evidence exposes regional population impacts
Wenwen Chen, Chris Newman, Zhijin Liu, Yayoi Kaneko, Keita Omote, Ryuichi Masuda, Christina D. Buesching, David W. Macdonald, Zongqiang Xie, Youbing Zhou
CONSERVATION GENETICS RESOURCES, 7, 3, 697, 704, 2015年09月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Mitochondrial DNA analysis of Jomon dogs from the Kamikuroiwa Rock Shelter site in Shikoku and the Higashimyo site in Kyushu, Japan
Ryuichi Masuda, Takao Sato
ANTHROPOLOGICAL SCIENCE, 123, 2, 95, 98, 2015年08月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic variation of the East Balkan Swine (Sus scrofa) in Bulgaria, revealed by mitochondrial DNA and Y chromosomal DNA
D. Hirata, V. D. Doichev, E. G. Raichev, N. A. Palova, J. L. Nakev, Y. M. Yordanov, Y. Kaneko, R. Masuda
ANIMAL GENETICS, 46, 2, 209, 212, 2015年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Recent fragmentation of the endangered Blakiston’s fish owl (Bubo blakistoni) population on Hokkaido Island, northern Japan, revealed by mitochondrial DNA and microsatellite analyses
Omote, K, Nishida, C, Takenaka, T, Saito, K, Shimura, R, Fujimoto, S, Sato, T, Masuda, R
Zoological Letters, 1, 16, 2015年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Spatial and temporal variation at major histocompatibility complex class IIB genes in the endangered Blakiston’s fish owl
Kohyama, T.I, Omote, K, Nishida, C, Takenaka, T, Saito, K, Fujimoto, S, Masuda, R
Zoological Letters, 1, 13, 2015年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Effectiveness of noninvasive DNA analysis to reveal isolated-forest use by the sable Martes zibellina on eastern Hokkaido, Japan
Tomoko Nagai, Takahiro Murakami, Ryuichi Masuda
MAMMAL STUDY, 39, 2, 99, 104, 2014年06月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

The socio-spatial dynamics of the Japanese badger (Meles anakuma)
Yayoi Kaneko, Em Kanda, Sara Tashima, Ryuich Masuda, Christopher Newman, David W. Macdonald
JOURNAL OF MAMMALOGY, 95, 2, 290, 300, 2014年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Temporal change in the spatial genetic structure of a sika deer population with an expanding distribution range over a 15-year period
Wei Ou, Satomi Takekawa, Toshiya Yamada, Chisato Terada, Hiroyuki Uno, Junco Nagata, Ryuichi Masuda, Koichi Kaji, Takashi Saitoh
POPULATION ECOLOGY, 56, 2, 311, 325, 2014年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Mitochondrial DNA haplogrouping of the brown bear, Ursus arctos (Carnivora: Ursidae) in Asia, based on a newly developed APLP analysis
Daisuke Hirata, Alexei V. Abramov, Gennady F. Baryshnikov, Ryuichi Masuda
BIOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, 111, 3, 627, 635, 2014年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Notes on autumn-winter stomach contents of the stone marten (Martes foina) in the Balkan Mountains, Central Bulgaria　　　　　　　　　　　　　　　
Hisano, M, Raichev, E, Peeva, S, Georgiev, D, Tsunoda, H, Masuda, R, Kaneko, Y
Zoo Notes, 56, 1, 6, 2014年, ［査読有り］

Multiple origins of the Japanese marten Martes melampus introduced into Hokkaido Island, Japan, revealed by microsatellite analysis
Shouko Kamada, Takahiro Murakami, Ryuichi Masuda
MAMMAL STUDY, 38, 4, 261, 267, 2013年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Winter diet of the stone marten (Martes foina) in central Bulgaria
Hisano Masumi, Raichev Evgeniy G, Tsunoda Hiroshi, Masuda Ryuichi, Kaneko Yayoi
MAMMAL STUDY, 38, 4, 293, 298, 2013年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular Phylogeography of the Brown Bear (Ursus arctos) in Northeastern Asia Based on Analyses of Complete Mitochondrial DNA Sequences
Daisuke Hirata, Tsutomu Mano, Alexei V. Abramov, Gennady F. Baryshnikov, Pavel A. Kosintsev, Alexandr A. Vorobiev, Evgeny G. Raichev, Hiroshi Tsunoda, Yayoi Kaneko, Koichi Murata, Daisuke Fukui, Ryuichi Masuda
MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, 30, 7, 1644, 1652, 2013年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

The reliance of the golden jackal (canis aureus) on anthropogenic foods in winter in central bulgaria
Evgeniy G. Raichev, Hiroshi Tsunoda, Chris Newman, Ryuichi Masuda, Dian M. Georgiev, Yayoi Kaneko
Mammal Study, 38, 1, 19, 27, 2013年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Limited phylogenetic distribution of a long tandem-repeat cluster in the mitochondrial control region in Bubo (Aves, Strigidae) and cluster variation in Blakiston's fish owl (Bubo blakistoni)
Keita Omote, Chizuko Nishida, Matthew H. Dick, Ryuichi Masuda
Molecular Phylogenetics and Evolution, 66, 3, 889, 897, 2013年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Preliminary study on microsatellite and mitochondrial DNA variation of the stone marten Martes foina in Bulgaria
Tomoko Nagai, Evgeniy G. Raichev, Hiroshi Tsunoda, Yayoi Kaneko, Ryuichi Masuda
MAMMAL STUDY, 37, 4, 353, 358, 2012年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic variation and population structure of the sable Martes zibellina on eastern Hokkaido, Japan, revealed by microsatellite analysis
Tomoko Nagai, Takahiro Murakami, Ryuichi Masuda
MAMMAL STUDY, 37, 4, 323, 330, 2012年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic Distinctness and Variation in the Tsushima Islands Population of the Japanese Marten, Martes melampus (Carnivora: Mustelidae), Revealed by Microsatellite Analysis
Shouko Kamada, Shusaku Moteki, Minoru Baba, Keiji Ochiai, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 29, 12, 827, 833, 2012年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular phylogeography of the Japanese weasel, Mustela itatsi (Carnivora: Mustelidae), endemic to the Japanese islands, revealed by mitochondrial DNA analysis
Ryuichi Masuda, Naoko Kurose, Shigeki Watanabe, Alexei V. Abramov, Sang-Hoon Han, Liang-Kong Lin, Tatsuo Oshida
BIOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, 107, 2, 307, 321, 2012年10月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Population genetic structure of the Japanese large-footed bat (Myotis macrodactylus) along three rivers on Hokkaido Island, northern Japan
Fumiya Kobayashi, Dai Fukui, Eisuke Kojima, Ryuichi Masuda
MAMMAL STUDY, 37, 3, 227, 235, 2012年09月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic population structure of the masked palm civet Paguma larvata, (Carnivora: Viverridae) in Japan, revealed from analysis of newly identified compound microsatellites
Tomo Inoue, Yayoi Kaneko, Koji Yamazaki, Tomoko Anezaki, Shuuji Yachimori, Keiji Ochiai, Liang-Kong Lin, Kurtis Jai-Chyi Pei, Yen-Jean Chen, Shih-Wei Chang, Ryuichi Masuda
CONSERVATION GENETICS, 13, 4, 1095, 1107, 2012年08月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Temporal Changes of Genetic Population Structure and Diversity in the Endangered Blakiston's Fish Owl (Bubo blakistoni) on Hokkaido Island, Japan, Revealed by Microsatellite Analysis
Keita Omote, Chizuko Nishida, Takeshi Takenaka, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 29, 5, 299, 304, 2012年05月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Comparative Molecular Phylogeny and Evolution of Sex Chromosome DNA Sequences in the Family Canidae (Mammalia: Carnivora)
Ayako Tsubouchi, Daisuke Fukui, Miya Ueda, Kazumi Tada, Shouji Toyoshima, Kazutoshi Takami, Tsunenori Tsujimoto, Kohji Uraguchi, Evgeniy Raichev, Yayoi Kaneko, Hiroshi Tsunoda, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 29, 3, 151, 161, 2012年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Loss of Genetic Diversity Means Loss of Geological Information: The Endangered Japanese Crayfish Exhibits Remarkable Historical Footprints
Itsuro Koizumi, Nisikawa Usio, Tadashi Kawai, Noriko Azuma, Ryuichi Masuda
PLOS ONE, 7, 3, 2012年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Systematics and phylogeography of the steppe whiskered bat Myotis aurascens Kuzyakin, 1935 (Chiroptera, Vespertilionidae)
Katerina Tsytsulina, Matthew H. Dick, Kishio Maeda, Ryuichi Masuda
Russian Journal of Theriology, 11, 1, 1, 20, K M K Scientific Press Ltd, 2012年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic features of ancient West Siberian people of the Middle Ages, revealed by mitochondrial DNA haplogroup analysis
Takehiro Sato, Dmitry Razhev, Tetsuya Amano, Ryuichi Masuda
JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 56, 8, 602, 608, 2011年08月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Preliminary study on migration pattern of the Tibetan antelope (Pantholops hodgsonii) based on satellite tracking
Hoshino Buho, Z. Jiang, C. Liu, T. Yoshida, Halik Mahamut, M. Kaneko, M. Asakawa, M. Motokawa, K. Kaji, X. Wu, N. Otaishi, Sumiya Ganzorig, R. Masuda
ADVANCES IN SPACE RESEARCH, 48, 1, 43, 48, 2011年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeographic Sympatry and Isolation of the Eurasian Badgers (Meles, Mustelidae, Carnivora): Implications for an Alternative Analysis Using Maternally as well as Paternally Inherited Genes
Sara Tashima, Yayoi Kaneko, Tomoko Anezaki, Minoru Baba, Shuuji Yachimori, Alexei V. Abramov, Alexander P. Saveljev, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 28, 4, 293, 303, 2011年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genotype frequencies of the ABCC11 gene in 2000-3000-year-old human bones from the Epi-Jomon and Jomon sites in Hokkaido, Japan
Hisako Kazuta, Takehiro Sato, Yukio Dodo, Hirofumi Matsumura, Tetsuya Amano, Hajime Ishida, Ryuichi Masuda
ANTHROPOLOGICAL SCIENCE, 119, 1, 81, 86, 2011年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Identification and molecular variations of CAN-SINEs from the ZFY gene final intron of the Eurasian badgers (genus Meles)
Sara Tashima, Yayoi Kaneko, Tomoko Anezaki, Minoru Baba, Shuuji Yachimori, Alexei V. Abramov, Alexander P. Saveljev, Ryuichi Masuda
MAMMAL STUDY, 36, 1, 41, 48, 2011年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Population Structures of the Red Fox (Vulpes vulpes) on the Hokkaido Island, Japan, Revealed by Microsatellite Analysis
Takuya Oishi, Kohji Uraguchi, Kenichi Takahashi, Ryuichi Masuda
JOURNAL OF HEREDITY, 102, 1, 38, 46, 2011年01月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Geographical Variations of the Skull in the Red Fox Vulpes vulpes on the Japanese Islands: An Exception to Bergmann's rule
Takuya Oishi, Kohji Uraguchi, Alexei V. Abramov, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 27, 12, 939, 945, 2010年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic diversity within the Japanese badgers (Meles anakuma), as revealed by microsatellite analysis
Sara Tashima, Yayoi Kaneko, Tomoko Anezaki, Minoru Baba, Shuuji Yachimori, Ryuichi Masuda
MAMMAL STUDY, 35, 4, 221, 226, 2010年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Allelic diversity of the MHC class II DRB genes in brown bears (Ursus arctos) and a comparison of DRB sequences within the family Ursidae
N. Goda, T. Mano, P. Kosintsev, A. Vorobiev, R. Masuda
TISSUE ANTIGENS, 76, 5, 404, 410, 2010年11月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Polymorphisms and allele frequencies of the ABO blood group gene among the Jomon, Epi-Jomon and Okhotsk people in Hokkaido, northern Japan, revealed by ancient DNA analysis
Takehiro Sato, Hisako Kazuta, Tetsuya Amano, Hiroko Ono, Hajime Ishida, Haruto Kodera, Hirofumi Matsumura, Minoru Yoneda, Yukio Dodo, Ryuichi Masuda
JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 55, 10, 691, 696, 2010年10月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Mitochondrial DNA control region variations in the sable Martes zibellina of Hokkaido Island and the Eurasian Continent, compared with the Japanese marten M. melampus
Tomo Inoue, Takahiro Murakami, Alexei V. Abramov, Ryuiehi Masuda
MAMMAL STUDY, 35, 3, 145, 155, 2010年09月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Non-invasive genetic identification of the red fox Vulpes vulpes in the Shiretoko National Park, eastern Hokkaido, Japan
Takuya Oishi, Kohji Uraguchi, Ryuichi Masuda
MAMMAL STUDY, 35, 3, 201, 207, 2010年09月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Origins and Founder Effects on the Japanese Masked Palm Civet Paguma larvata (Viverridae, Carnivora), Revealed from a Comparison with its Molecular Phylogeography in Taiwan
Ryuichi Masuda, Liang-Kong Lin, Kurtis Jai-Chyi Pei, Yen-Jean Chen, Shih-Wei Chang, Yayoi Kaneko, Koji Yamazaki, Tomoko Anezaki, Shuuji Yachimori, Tatsuo Oshida
ZOOLOGICAL SCIENCE, 27, 6, 499, 505, 2010年06月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular phylogeny and evolution of sex-chromosomal genes and SINE sequences in the family Mustelidae
Chiemi Yamada, Ryuichi Masuda
MAMMAL STUDY, 35, 1, 17, 30, 2010年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Sex Determination and Individual Identification of American Minks (Neovison vison) on Hokkaido, Northern Japan, by Fecal DNA Analysis
Yukari Shimatani, Tsuyoshi Takeshita, Shirow Tatsuzawa, Tohru Ikeda, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 27, 3, 243, 247, 2010年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic variation and population structure of the feral American mink (Neovison vison) in Nagano, Japan, revealed by microsatellite analysis
Yukari Shimatani, Yuko Fukue, Ryosuke Kishimoto, Ryuichi Masuda
MAMMAL STUDY, 35, 1, 1, 7, 2010年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Mitochondrial DNA haplogrouping of the Okhotsk people based on analysis of ancient DNA: an intermediate of gene flow from the continental Sakhalin people to the Ainu
Takehiro Sato, Tetsuya Amano, Hiroko Ono, Hajime Ishida, Haruto Kodera, Hirofumi Matsumura, Minoru Yoneda, Ryuichi Masuda
ANTHROPOLOGICAL SCIENCE, 117, 3, 171, 180, 2009年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeography of the Japanese giant flying squirrel, Petaurista leucogenys (Rodentia: Sciuridae): implication of glacial refugia in an arboreal small mammal in the Japanese Islands
Tatsuo Oshida, Ryuichi Masuda, Koichi Ikeda
BIOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY, 98, 1, 47, 60, 2009年09月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic Diversity of the MHC Class-II DQA Gene in Brown Bears (Ursus arctos) on Hokkaido, Northern Japan
Naoki Goda, Tsutomu Mano, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 26, 8, 530, 535, 2009年08月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Allele frequencies of the ABCC11 gene for earwax phenotypes among ancient populations of Hokkaido, Japan
Takehiro Sato, Tetsuya Amano, Hiroko Ono, Hajime Ishida, Haruto Kodera, Hirofumi Matsumura, Minoru Yoneda, Ryuichi Masuda
JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 54, 7, 409, 413, 2009年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Unequal rates of Y chromosome gene divergence during speciation of the family Ursidae
Shigeki Nakagome, Jill Pecon-Slattery, Ryuichi Masuda
MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, 25, 7, 1344, 1356, 2008年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic Identification of Mammalian Carnivore Species in the Kushiro Wetland, Eastern Hokkaido, Japan, by Analysis of Fecal DNA
Yukari Shimatani, Tsuyoshi Takeshita, Shirow Tatsuzawa, Tohru Ikeda, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 25, 7, 714, 720, 2008年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular diversity and phylogeography of the Asian leopard cat, Felis bengalensis, inferred from mitochondrial and Y-chromosomal DNA sequences
Tsutomu Tamada, Boripat Siriaroonrat, Vellayan Subramaniam, Masaharu Hamachi, Liang-Kong Lin, Tatsuo Oshida, Worawut Rerkamnuaychoke, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 25, 2, 154, 163, 2008年02月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular phylogeny and taxonomy of the genus Mustela (Mustelidae, Carnivora), inferred from mitochondrial DNA sequences: New perspectives on phylogenetic status of the back-striped weasel and American mink
Naoko Kurose, Alexei V. Abramov, Ryuichi Masuda
Mammal Study, 33, 1, 25, 33, 2008年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic variations of the masked palm civet Paguma larvata, inferred from mitochondrial cytochrome b sequences
Ryuichi Masuda, Yayoi Kaneko, Boripat Siriaroonrat, Vellayan Subramaniam, Masaharu Hamachi
Mammal Study, 33, 1, 19, 24, 2008年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Origins and genetic features of the Okhotsk people, revealed by ancient mitochondrial DNA analysis
Takehiro Sato, Tetsuya Amano, Hiroko Ono, Hajime Ishida, Haruto Kodera, Hirofumi Matsumura, Minoru Yoneda, Ryuichi Masuda
JOURNAL OF HUMAN GENETICS, 52, 7, 618, 627, 2007年06月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic structure changes of expanding sika deer (Cervus nippon) populations in central and western Hokkaido, revealed by mitochondrial DNA analysis
Nabata, D, Kaji, K, Nagata, J, Masuda, R
Mammal Study, 32, 17, 22, 2007年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Ancient DNA analysis of brown bear skulls from a ritual rock shelter site of the Ainu culture at Bihue, central Hokkaido, Japan
Ryuichi Masuda, Toshiyuki Tamura, Osamu Takahashi
ANTHROPOLOGICAL SCIENCE, 114, 3, 211, 215, 2006年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Fecal DNA analysis for identifying species and sex of sympatric carnivores: A noninvasive method for conservation on the Tsushima islands, Japan
N Kurose, R Masuda, M Tatara
JOURNAL OF HEREDITY, 96, 6, 688, 697, 2005年11月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Comparative phylogeography between the ermine Mustela erminea and the least weasel M-nivalis of Palaearctic and Nearctic regions, based on analysis of mitochondrial DNA control region sequences
N Kurose, AV Abramov, R Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 22, 10, 1069, 1078, 2005年10月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic diversity in domestic cats Felis catus of the Tsushima Islands, based on mitochondrial DNA cytochrome b and control region nucleotide sequences
Tsutomu Tamada, Naoko Kurosel, Ryuichi Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 22, 6, 627, 633, 2005年06月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeography of the Russian flying squirrel (Pteromys volans): implication of refugia theory in arboreal small mammal of Eurasia
T Oshida, A Abramov, H Yanagawa, R Masuda
MOLECULAR ECOLOGY, 14, 4, 1191, 1196, 2005年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A note on karyotypes of Sorex caecutiens (Mammalia, Insectivora) from Cheju Island, Korea
O Tatsuo, S Ohdachi, SH Han, R Masuda
CARYOLOGIA, 58, 1, 52, 55, 2005年01月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogenetic position of the small Kashmir flying squirrel, Hylopetes fimbriatus ( Eoglaucomys fimbriatus), in the subfamily Pteromyinae
T Oshida, CM Shafique, S Barkati, M Yasuda, NA Hussein, H Endo, H Yanagawa, R Masuda
CANADIAN JOURNAL OF ZOOLOGY-REVUE CANADIENNE DE ZOOLOGIE, 82, 8, 1336, 1342, 2004年08月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular phylogenetics of Crocidura shrews (insectivora) in east and central Asia
SD Ohdachi, MA Iwasa, VA Nesterenko, H Abe, R Masuda, W Haberl
JOURNAL OF MAMMALOGY, 85, 3, 396, 403, 2004年06月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Bottleneck effects on the sika deer Cervus nippon population in Hokkaido, revealed by ancient DNA analysis
D Nabata, R Masuda, O Takahashi, J Nagata
ZOOLOGICAL SCIENCE, 21, 4, 473, 481, 2004年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Taxonomic differentiation of Ursus arctos (Carnivora, Ursidae) from south Okhotsk Sea islands on the basis of morphometrical analysis of skull and teeth.
Baryshnikov, G.F, Mano, T, Masuda, R
Russian Journal of Theriology, 3, 77, 88, 2004年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A preliminary study on molecular phylogeny of giant flying squirrels, genus Petaurista (Rodentia, Sciuridae) based on mitochondrial cytochrome b gene sequences.
Oshida, T, Shafique, C.M, Barkati, S, Fujita, Y, Lin, L.-K, Masuda R
Russian Journal of Theriology, 3, 15, 24, 2004年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A preliminary study on the genetic diversity of small populations of two flying squirrel species from Pakistan (Hylopetes fimbriatus and Petaurista petaurista albiventer), based on mitochondrial DNA control region sequences.
Oshida, T, Shafique, C.M, Barkati, S, Masuda R
Mammal Study, 29, 1, 21, 26, 日本哺乳類学会, 2004年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）, We undertook a preliminary investigation on the population genetics of two flying squirrel species (Hylopetes fimbriatus and Petaurista petaurista albiventer) that are endemic to the northwestern Himalayan range. These species are distributed sympatrically, share similar ecological characteristics, and are confined to the Himalayan moist temperate forests ranging from 1350 to 3050 m elevation. To elucidate the genetic variability of small populations of these species, we determined the complete mitochondrial DNA control region sequence of H. fimbriatus (1109 bp) and P. petaurista albiventer (1051–1052 bp), collected at the Ayubia National Park of northern Pakistan. Haplotype and nucleotide diversities and average number of nucleotide differences among haplotypes of H. fimbriatus were similar to those of P. petaurista albiventer. However, transversional substitutions among haplotypes of H. fimbriatus were significantly greater than that of P. petaurista albiventer. This latter difference may have arisen from climatic changes during recent Pleistocene glaciations that differentially affected the distribution patterns of these two species. For instance, H. fimbriatus, which is more adaptive to colder and drier habitats, may have maintained a larger population base in the northwestern Himalayan range than P. petaurista albiventer. Alternatively, H. fimbriatus might have colonized the northwestern parts of the Himalayas earlier than P. petaurista albiventer, and may have had a longer evolutionary period to adapt to the cool mesic climate of this region.

A preliminary note on banded karyotypes of the short-tailed shrew Blarina brevicauda (Mammalia, Insectivora)
T Oshida, SD Ohdachi, R Masuda
CARYOLOGIA, 56, 4, 447, 451, 2003年10月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogenetic relationships among deer in China derived from mitochondrial DNA cytochrome b sequences
M Li, HB Tamate, FW Wei, XM Wang, R Masuda, HL Sheng, N Ohtaishi
ACTA THERIOLOGICA, 48, 2, 207, 219, 2003年06月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method for mtDNA typing in Hokkaido brown bear (Ursus arctos yesoensis)
Y Satoh, T Mano, H Tsuruga, R Masuda, T Matsuhashi, M Onuma, M Suzuki, N Ohtaishi
JAPANESE JOURNAL OF VETERINARY RESEARCH, 50, 4, 195, 199, 2003年02月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular phylogeography of the red deer (Cervus elaphus) populations in Xinjiang of China: Comparison with other Asian, European, and North American populations
H Mahmut, R Masuda, M Onuma, M Takahashi, J Nagata, M Suzuki, N Ohtaishi
ZOOLOGICAL SCIENCE, 19, 4, 485, 495, 2002年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Higher polymorphism of mitochondrial DNA repetitive sequences within the golden eagle (Aquila chrysaetos).
Masuda, R, Noro, M, Nishida-Umehara, C, Yamazaki, T
Japanese Journal of Zoo and Wildlife Medicine, 7, 75, 80, 2002年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Low genetic diversity in Japanese populations of the Eurasian badger Meles meles (Mustelidae, Carnivora) revealed by mitochondrial cytochrome b gene sequences
N Kurose, Y Kaneko, AV Abramov, B Siriaroonrat, R Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 18, 8, 1145, 1151, 2001年11月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogenetic relationships among worldwide populations of the brown bear Ursus arctos
T Matsuhashi, R Masuda, T Mano, K Murata, A Aiurzaniin
ZOOLOGICAL SCIENCE, 18, 8, 1137, 1143, 2001年11月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A preliminary study of the genetic diversity of Xinjiang Tarim red deer (Cervus elaphus yarkandensis) using the microsatellite DNA method
H Mahmut, S Ganzorig, M Onuma, R Masuda, M Suzuki, N Ohtaishi
JAPANESE JOURNAL OF VETERINARY RESEARCH, 49, 3, 231, 237, 2001年11月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Intraspecific phylogeny and geographical variation of six species of northeastern Asiatic Sorex shrews based on the mitochondrial cytochrome b sequences
S Ohdachi, NE Dokuchaev, M Hasegawa, R Masuda
MOLECULAR ECOLOGY, 10, 9, 2199, 2213, 2001年09月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Ancient DNA analysis of brown bear (Ursus arctos) remains from the archeological site of Rebun Island, Hokkaido, Japan
R Masuda, T Amano, H Ono
ZOOLOGICAL SCIENCE, 18, 5, 741, 751, 2001年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular phylogeny of five squirrel species of the genus Callosciurus (Mammalia, Rodentia) inferred from cytochrome b gene sequences
T Oshida, M Yasuda, H Endo, NA Hussein, R Masuda
MAMMALIA, 65, 4, 473, 482, 2001年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A preliminary note on the phylogenetic position of the lesser giant flying squirrel Petaurista elegans, inferred from mitochondrial cytochrome b gene sequence
Oshida, T, Fujita, Y, Lin, L.K, Masuda, R
Mammal Study, 26, 2, 149, 152, 日本哺乳類学会, 2001年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeography of the Japanese giant flying squirrel, Petaurista leucogenys, based on mitochondrial DNA control region sequences
T Oshida, K Ikeda, K Yamada, R Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 18, 1, 107, 114, 2001年01月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Karyological differentiation between two closely related mustelids, the Japanese weasel Mustela itatsi and the Siberian weasel M-sibirica
N Kurose, R Masuda, T Aoi, S Watanabe
CARYOLOGIA, 53, 3-4, 269, 275, 2000年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Intrageneric diversity of the cytochrome b gene and phylogeny of Eurasian species of the genus Mustela (Mustelidae, Carnivora)
N Kurose, AV Abramov, R Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 17, 5, 673, 679, 2000年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogenetic relationships among six flying squirrel genera, inferred from mitochondrial cytochrome b gene sequences
T Oshida, LK Lin, H Yanagawa, H Endo, R Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 17, 4, 485, 489, 2000年05月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeny and zoogeography of six squirrel species of the genus Sciurus (Mammalia, rodentia), inferred from cytochrome b gene sequences
T Oshida, R Masuda
ZOOLOGICAL SCIENCE, 17, 3, 405, 409, 2000年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogenetic relationships among Asian species of Petaurista (Rodentia, Sciuridae), inferred from mitochondrial cytochrome b gene sequences
T Oshida, LK Lin, R Masuda, MC Yoshida
ZOOLOGICAL SCIENCE, 17, 1, 123, 128, 2000年01月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeographic variation in two mustelines, the least weasel Mustela nivalis and the ermine M-erminea of Japan, based on mitochondrial DNA control region sequences
N Kurose, R Masuda, MC Yoshida
ZOOLOGICAL SCIENCE, 16, 6, 971, 977, 1999年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Two genetically distinct lineages of the sika deer, Cervus nippon, in Japanese islands: Comparison of mitochondrial D-loop region sequences
J Nagata, R Masuda, HB Tamate, S Hamasaki, K Ochiai, M Asada, S Tatsuzawa, K Suda, H Tado, MC Yoshida
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 13, 3, 511, 519, 1999年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Intraspecific variation of mitochondrial cytochrome b gene sequences of the Japanese marten Martes melampus and the sable Martes zibellina (Mustelidae, Carnivora, Mammalia) in Japan
N Kurose, R Masuda, B Siriaroonrat, MC Yoshida
ZOOLOGICAL SCIENCE, 16, 4, 693, 700, 1999年08月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Microevolution of the mitochondrial DNA control region in the Japanese brown bear (Ursus arctos) population
T Matsuhashi, R Masuda, T Mano, MC Yoshida
MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, 16, 5, 676, 684, 1999年05月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Activities and status of the Elephant Concervation Center of Lawpang, Thailand.
Lungka, G, Siriaroonrat, B, Kangwanpong, D, Masuda, R
Japanese Journal of Zoo and Wildlife Medicine, 4, 39, 43, 1999年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A survey report on wild elephants at Huay Poo Ling, Mae Hong Son Province, Thailand with notes on their status
Siriaroonrat, B, Angkawanish, T, Kangwanpong, D, Masuda, R
Japanese Journal of Zoo and Wildlife Medicine, 4, 65, 71, 1999年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genetic variation and population structure of the Japanese sika deer (Cervus nippon) in Hokkaido Island, based on mitochondrial D-loop sequences
J Nagata, R Masuda, K Kaji, M Kaneko, MC Yoshida
MOLECULAR ECOLOGY, 7, 7, 871, 877, 1998年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Sexing of carcass remains of the Sika deer (Cervus nippon) using PCR amplification of the Sry gene
M Takahashi, R Masuda, H Uno, M Yokoyama, M Suzuki, MC Yoshida, N Ohtaishi
JOURNAL OF VETERINARY MEDICAL SCIENCE, 60, 6, 713, 716, 1998年06月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular phylogenetic inference of the woolly mammoth Mammuthus primigenius, based on complete sequences of mitochondrial cytochrome b and 12S ribosomal RNA genes
M Noro, R Masuda, IA Dubrovo, MC Yoshida, M Kato
JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION, 46, 3, 314, 326, 1998年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Microsatellite DNA variations of the sika deer, Cervus nippon, in Hokkaido and Chiba
NAGATA J, MASUDA R, KAJI K, OCHIAI K, ASADA M, YOSHIDA M C
Mammal Study, 23, 2, 95, 101, 日本哺乳類学会, 1998年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）, To study genetic diversity of populations of the sika deer, Cervus nippon, in Hokkaido, polymorphism of three microsatellite loci (OarFCB193, BOVIRBP and INRA040) were examined and compared with that of the population of Chiba Prefecture in the Japanese main island (Honshu). The microsatellite genotype frequency significantly well agreed with the Hardy-Weinberg expectation at each locus of each population except for INRA040 of the Chiba population. Average observed heterozygosity (Ho=0.21±0.11) of the Hokkaido population was relatively smaller than that of the Chiba population (Ho=0.23±0.09). Moreover, observed heterozygosities of OarFCB193 and BOVIRBP of the Hokkaido population were lower than that of the Chiba population, and the number of alleles observed at each locus was smaller in the Hokkaido population than in the Chiba population. These results indicate a lower genetic diversity in the Hokkaido population, resulting from their historical bottleneck(s) previously reported. The present study provides information of useful microsatellite markers and gives an insight for better understanding population genetics of the Japanese sika deer.

Genetic characteristics of endangered Japanese golden eagles (Aquila chrysaetos japonica) based on mitochondrial DNA D-loop sequences and karyotypes
R Masuda, M Noro, N Kurose, C Nishida-Umehara, H Takechi, T Yamazaki, M Kosuge, MC Yoshida
ZOO BIOLOGY, 17, 2, 111, 121, 1998年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogenetic status of brown bears Ursus arctos of Asia: A preliminary result inferred from mitochondrial DNA control region sequences
R Masuda, K Murata, A Aiurzaniin, MC Yoshida
HEREDITAS, 128, 3, 277, 280, 1998年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Biogeographical history of northeastern Asiatic soricine shrews (Insectivora, Mammalia)
S Ohdachi, R Masuda, H Abe, NE Dokuchaev
RESEARCHES ON POPULATION ECOLOGY, 39, 2, 157, 162, 1997年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogeny of Eurasian soricine shrews (Insectivora, Mammalia) inferred from the mitochondrial cytochrome b gene sequences
S Ohdachi, R Masuda, H Abe, J Adachi, NE Dokuchaev, Haukisalmi, V, MC Yoshida
ZOOLOGICAL SCIENCE, 14, 3, 527, 532, 1997年06月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Gender determination of the Linne's two-toed sloth (Choloepus didactylus) using SRY amplified from hair
K Murata, R Masuda
JOURNAL OF VETERINARY MEDICAL SCIENCE, 58, 12, 1157, 1159, 1996年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular phylogeny of mitochondrial cytochrome b and 125 rRNA sequences in the Felidae: Ocelot and domestic cat lineages
R Masuda, JV Lopez, JP Slattery, N Yuhki, SJ OBrien
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 6, 3, 351, 365, 1996年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Phylogenetic relationships among Japanese species of the family sciuridae (Mammalia, Rodentia), inferred from nucleotide sequences of mitochondrial 12S ribosomal RNA genes
T Oshida, R Masuda, MC Yoshida
ZOOLOGICAL SCIENCE, 13, 4, 615, 620, 1996年08月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Two Japanese Wildcats, the Tsushima Cat and the Iriomote Cat, Show the Same Mitochondrial DNA Lineage as the Leopard Cat Felis bengalensis
Ryuichi Masuda, Michihiro C. Yoshida
Zoological Science, 12, 5, 655, 659, 1995年10月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Nucleotide sequences of the cytochrome b and the 12S rRNA genes in the Japanese sika deer
Nagata, J, Masuda, R, Yoshida, M
Journal of the Mammalogical Society of Japan, 20, 1, 1, 8, 一般社団法人 日本哺乳類学会, 1995年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Partial sequences for the mitochondrial cytochrome b gene (367 bases) and 12S ribosomal RNA (rRNA) gene (301 bases) of the Japanese sika deer Cervus nippon from three localities (Shiretoko in Hokkaido, Mt. Goyo in Iwate Prefecture, and Tsushima Island in Nagasaki Prefecture) were determined by using direct sequencing of single-stranded DNAs amplified by polymerase chain reaction. Molecular phylogenetic trees, based on nucleotide sequences of both genes, showed that the sika deer was clearly separated from the pronghorn and the cow. Among the sika deer sampled, individuals from Shiretoko and Mt. Goyo shared identical sequences for each gene, indicating the close relationship between these two sika deer. Our results also indicated that the sika deer on Tsushima Island are distantly related to those of Shiretoko and Mt. Goyo. This is the first report of the mitochondrial DNA sequences of the sika deer.

A MOLECULAR PHYLOGENY OF THE FAMILY MUSTELIDAE (MAMMALIA, CARNIVORA), BASED ON COMPARISON OF MITOCHONDRIAL CYTOCHROME-B NUCLEOTIDE-SEQUENCES
R MASUDA, MC YOSHIDA
ZOOLOGICAL SCIENCE, 11, 4, 605, 612, 1994年08月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

MOLECULAR PHYLOGENETIC STATUS OF THE IRIOMOTE CAT FELIS-IRIOMOTENSIS, INFERRED FROM MITOCHONDRIAL-DNA SEQUENCE-ANALYSIS
R MASUDA, MC YOSHIDA, F SHINYASHIKI, G BANDO
ZOOLOGICAL SCIENCE, 11, 4, 597, 604, 1994年08月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

NUMT, A RECENT TRANSFER AND TANDEM AMPLIFICATION OF MITOCHONDRIAL-DNA TO THE NUCLEAR GENOME OF THE DOMESTIC CAT
JV LOPEZ, N YUHKI, R MASUDA, W MODI, SJ OBRIEN
JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION, 39, 2, 174, 190, 1994年08月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Nucleotide sequence variation of cytochrome b genes in three species of weasels Mustela itatsi, Mustela sibirica, and Mustela nivalis, detected by improved PCR product-direct sequencing technique
Masuda, R, Yoshida, M
Journal of the Mammalogical Society of Japan, 19, 1, 33, 43, 1994年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

MOLECULAR-CLONING, CHROMOSOMAL ASSIGNMENT, AND NUCLEOTIDE-SEQUENCE OF THE FELINE HOMEOBOX HOX3A
R MASUDA, N YUHKI, SJ OBRIEN
GENOMICS, 11, 4, 1007, 1013, 1991年12月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

CYTOCHROME-P-450 AND CHROMOSOME-DAMAGE BY CYCLOPHOSPHAMIDE IN LEC STRAIN RATS PREDISPOSED TO HEREDITARY HEPATITIS AND LIVER-CANCER
R MASUDA, S ABE, MC YOSHIDA, M SASAKI, T SUGIYAMA, N TANIGUCHI
MUTATION RESEARCH, 244, 4, 309, 316, 1990年08月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

GENE-EXPRESSION OF PLACENTAL GLUTATHIONE S-TRANSFERASE IN HEREDITARY HEPATITIS AND SPONTANEOUS HEPATOCARCINOGENESIS OF LEC STRAIN RATS
R MASUDA, MC YOSHIDA, M SASAKI
JAPANESE JOURNAL OF CANCER RESEARCH, 80, 11, 1024, 1027, 1989年11月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

ELEVATION OF SERUM ALPHA-FETOPROTEIN AND PROLIFERATION OF OVAL CELLS IN THE LIVERS OF LEC RATS
H TAKAHASHI, M OYAMADA, Y FUJIMOTO, MI SATOH, A HATTORI, K DEMPO, M MORI, T TANAKA, H WATABE, R MASUDA, MC YOSHIDA
JAPANESE JOURNAL OF CANCER RESEARCH, 79, 7, 821, 827, 1988年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

HIGH SUSCEPTIBILITY TO HEPATOCELLULAR-CARCINOMA DEVELOPMENT IN LEC RATS WITH HEREDITARY HEPATITIS
R MASUDA, MC YOSHIDA, M SASAKI, K DEMPO, M MORI
JAPANESE JOURNAL OF CANCER RESEARCH, 79, 7, 828, 835, 1988年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

HEREDITARY HEPATITIS OF LEC RATS IS CONTROLLED BY A SINGLE AUTOSOMAL RECESSIVE GENE
R MASUDA, MC YOSHIDA, M SASAKI, K DEMPO, M MORI
LABORATORY ANIMALS, 22, 2, 166, 169, 1988年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A TRANSPLANTABLE CELL-LINE DERIVED FROM SPONTANEOUS HEPATOCELLULAR-CARCINOMA OF THE HEREDITARY HEPATITIS LEC RAT
R MASUDA, MC YOSHIDA, M SASAKI, K DEMPO, M MORI
JAPANESE JOURNAL OF CANCER RESEARCH, 79, 2, 250, 254, 1988年02月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

SPONTANEOUS OCCURRENCE OF PLACENTAL GLUTATHIONE S-TRANSFERASE-POSITIVE FOCI IN THE LIVERS OF LEC RATS
M OYAMADA, K DEMPO, Y FUJIMOTO, H TAKAHASHI, MI SATOH, M MORI, R MASUDA, MC YOSHIDA, K SATOH, K SATO
JAPANESE JOURNAL OF CANCER RESEARCH, 79, 1, 5, 8, 1988年01月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Hepatoma-associated alterations of serum α₁-antitrypsin in hereditary hepatitis LEC rats as a new animal model of liver disease
Masuda, R, Sugiyama, T, Taniguchi, N, Yoshida, M.C, Sasaki, M
International Journal of Biochemistry, 20, 10, 1171, &, 1988年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

NEW MUTATION CAUSING HEREDITARY HEPATITIS IN THE LABORATORY RAT
MC YOSHIDA, R MASUDA, M SASAKI, N TAKEICHI, H KOBAYASHI, K DEMPO, M MORI
JOURNAL OF HEREDITY, 78, 6, 361, 365, 1987年11月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

LOCALIZATION OF THE GENE FOR GLUTATHIONE-S-TRANSFERASE P ON RAT CHROMOSOME-1 AT BAND Q43
R MASUDA, MC YOSHIDA, M SASAKI, A OKUDA, M SAKAI, M MURAMATSU
JAPANESE JOURNAL OF CANCER RESEARCH, 77, 11, 1055, 1058, 1986年11月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

クマと日本人 ―― 相次ぐ被害にどう対処すべきか？ 共生の文化からひもとく　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 月刊「中央公論」, 2026年, 1月号, 168, 175, 2026年01月, ［招待有り］, ［筆頭著者］
日本語

ヒグマの遺伝と移動の歴史 ー 北半球でのはるかなる旅　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 生物の科学 遺伝, 79, 1, 18, 25, 2025年01月, ［招待有り］, ［筆頭著者］
日本語, 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

クマの生物学 ー 進化から文化まで　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 生物の科学 遺伝, 79, 1, 12, 17, 2025年01月, ［招待有り］, ［筆頭著者］
日本語, 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

本の執筆と読書のはざまにて　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 東京大学出版会 UP, 53, 618, 44, 48, 2024年04月, ［招待有り］
日本語, 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

動物地理学の世界へようこそ！　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 子どもの本棚, 658, 38, 39, 2023年08月, ［招待有り］, ［筆頭著者］
日本語, 書評論文,書評,文献紹介等

石狩低地帯と北海道の動物地理的特徴　　　　　　　　　　　　　　　
増田 隆一, 北海道の自然（北海道自然保護協会会誌）, 60, 11, 18, 2022年02月, ［査読有り］, ［招待有り］, ［筆頭著者］
記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

哺乳類学の最前線で活躍するにはどうしたらよいか
増田隆一, 哺乳類科学, 60, 2, 377, 384, 2020年08月, ［招待有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国内誌］
日本語, 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

生物系統地理学と地質学からせまる日本列島の生物多様性の起源 哺乳類の系統地理を探る~ヒグマの移動史
増田隆一, 生物科学, 70, 1, 25‐30, 2019年01月, ［査読有り］
日本語, 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

シマフクロウ保護の課題 シマフクロウの遺伝的多様性と未来への展望
増田隆一, 野鳥, 83, 7, 6‐9, 2018年08月, ［招待有り］
日本語

遺伝子が解き明かす北海道の生物地理　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, ビオヒストリー, 30, 12, 15, 2018年, ［招待有り］
日本語

ハクビシンの起源をたどる
増田隆一, 東京大学出版会 UP, 46, 539, 25, 30, 2017年09月, ［招待有り］
東京大学出版会, 日本語, 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

ヒグマの遺伝的多様性と移動の歴史　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 北海道自然保護協会誌 NC Hokkaido, 173, 12, 13, 2017年08月, ［招待有り］
日本語

都市における食肉目動物研究
斎藤昌幸, 斎藤昌幸, 金子弥生, 増田隆一, 園田陽一, 保坂哲朗, 哺乳類科学, 57, 1, 157‐158(J‐STAGE), 2017年
日本語

Meles anakuma
Kaneko, Y, Masuda, R, Abramov, A. V, The IUCN Red List of Threatened Species 2016-2, -, -, 2016年, ［査読有り］
英語

ミトコンドリアDNAからみた縄文犬　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 東名遺跡群IV – 東名遺跡群総括報告 第1分冊【堆積層・遺構編】（佐賀市教育委員会）, 167, 168, 2016年, ［招待有り］
日本語

夏期講演会DNAからみたヒグマの系譜—世界に発信！考古学と分子系統学のコラボレーション　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 北海道立埋蔵文化財センター年報, 17, 38, 45, 2016年, ［招待有り］
日本語

動物の進化をひもとく 〜 都会でくらす動物たちの遺伝的多様性　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, どうぶつと動物園, Autumn, 32-33, (Vol.68: 194-195), 2016年, ［招待有り］
日本語

Martes melampus
Abramov, A. V, Kaneko, Y, Masuda, R, The IUCN Red List of Threatened Species 2016-2, -, -, 2015年
英語

DNAから見たヒグマの進化と歴史　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, モーリー (Hokkaido Nature Magazine MALLY), 35, 8, 11, 2014年, ［招待有り］
日本語

遺伝的特徴から見たオホーツク人——大陸と北海道の間の交流
増田隆一, 北海道大学総合博物館研究報告, 6, 103, 108, 2013年
Previous studies by our group have been summarized in this paper. To understand the genetic status of the Okhotsk people who lived in the southern coastal regions of the Okhotsk Sea between the fifth and twelfth centuries, nucleotide polymorphisms in hypervariable regions I and II (HVR I and HVR II) and the coding regions of mitochondrial DNA (mtDNA) were investigated. MtDNA haplogroups of the Okhotsk people examined were classified according to mtDNA lineages previously reported in northeastern Asians. The comparison of mtDNA haplogroup frequencies between the Okhotsk people and other Asian populations revealed that the genetic structures of the Okhotsk people are similar to those of populations currently living around the lower regions of the Amur River and the Ainu in Hokkaido. These results support our previous study on molecular phylogeny of only HVR I sequences in mtDNA (Sato et al. 2007), and strongly show that the Okhotsk people could have originated around lower regions of the Amur River and played the role of intermediate for gene flow from the continental-Sakhalin people to the Ainu (Sato et al. 2009a). To study further the genetic characteristics of the ancient people around Hokkaido, allele frequencies of the adenosine triphosphate-binding cassette sub-family C11 (ABCC11) gene, which determines the earwax phenotypes (dry or wet type), were analyzed. Interestingly, one homozygote for the 27-bp deletion in the ABCC11 gene was found first in the Epi-Jomon. Exact tests of people differentiation (including the previously reported data on modern people) showed that allele frequencies of the ABCC11 gene between the Jomon people and Ainu were significantly different statistically, whereas those between the Jomon and Epi- Jomon and those between the Epi-Jomon and Ainu were not significantly different. These results suggest that the Epi-Jomon people in Hokkaido were genetically affected by the Okhotsk people who possessed high frequency of allele A (recessive dry allele) of the ABCC11 locus (Sato et al. 2009b; Kazuta et al. 2011). On temporal genetic changes in ancient people of Hokkaido, the result of the ABCC11 analysis supports mtDNA haplogrouping., 北海道大学総合博物館 = Hokkaido University Museum, 日本語

アイヌ民族とオホーツク文化人集団　　　　　　　　　　　　　　　
石田肇, 増田隆一, 季刊考古学, 118, 85, 87, 2012年
日本語

遺伝子の流れから見たオホーツク文化人と北海道への影響　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 新しいアイヌ史の構築 プロジェクト報告書2012：新しいアイヌ史の構築 先史編 古代編 中世編（北海道大学アイヌ・先住民研究センター）, 32, 36, 2012年, ［招待有り］
日本語

トコロチャシ跡遺跡オホーツク地点出土ヒグマ骨のミトコンドリアDNA分析　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 坂絵利, トコロチャシ跡遺跡 オホーツク地点，東京大学大学院人文社会系研究科考古学研究室・常呂実習施設編, 360, 366, 2012年, ［招待有り］
日本語

日本のハクビシンは台湾からやってきた〜遺伝子から探る起源と多様性
増田隆一, どうぶつと動物園, 63, 26, 29, 2011年, ［招待有り］
日本語

Mammal Studyへ投稿しよう〜世界へ発信するあなたの哺乳類研究
増田隆一, 哺乳類科学, 51, 1, 205, 205, 2011年
The Mammal Society of Japan, 日本語

北海道野幌森林公園におけるクロテンMartes zibellinaの生息記録
阿部豪, 平川浩文, 増田隆一, 佐鹿万里子, 中井真理子, 島田健一郎, 哺乳類科学, 51, 2, 321-325 (J-STAGE), 325, 2011年, ［査読有り］
北海道の野幌森林公園で実施したテン類の生息状況調査において，2006年5月と2007年7月，2008年5月の計3回にわたってテン属Martesを確認した．このうち，2007年7月の捕獲個体に関しては，画像やDNAの試料がなかったため種判定ができなかったが，それ以外の2個体については，それぞれ画像判定とミトコンドリアDNAによる種判定の結果からクロテンMartes zibellinaであることが確認された．また，体サイズから2008年5月に回収した死体は約1ヶ月齢の幼獣と推定された．野幌森林公園においてクロテンの生息が確認された公式な記録は2004年11月の自動撮影記録のみであり，実際にDNA分析によりその生息が確認されたのは今回が初めてのことである．また，クロテンの幼獣個体が確認されたことにより，同公園内においてクロテンが自然繁殖している可能性が示唆された．
, 日本哺乳類学会, 日本語

ハクビシンの多様性科学
増田隆一, 哺乳類科学, 51, 1, 188-191 (J-STAGE), 191, 2011年
The Mammal Society of Japan, 日本語

分子系統地理から見た日本と台湾の食肉類（日本台湾共同国際シンポジウム記録）　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 哺乳類科学, 50, 217, 219, 2010年, ［招待有り］
日本語

Asiatic wild cat (Felis silvestris ornata) is no more a ‘Least Concern’ species in Xinjiang, China
Abdukadir, A, Khan B, Masuda, R, Ohdachi, S, Pakistan Journal of Wildlife, 1, 2, 57, 63, 2010年, ［査読有り］
Asiatic wild cat, Felis silvestris ornata, once regarded as least concern is declining rapidly in its natural habitat in the Xinjiang desert region of China mainly because of excessive hunting for pelt trade followed by shrinkage of its habitat due to cultivation, oil and gas exploration and excessive use of pesticides. Prior to 1950, it was the most abundant felid in Xingjian dwelling along all major river basin systems and Taklimakan desert but later it got confined to three regions of southern Xinjiang only viz., Bayingolin Mongol Autonomous Oblast, Aksu and Hotan. Despite several expeditions, correct distribution and status of this illusive cat was unknown. This review article is an update on current status, distribution, ecological behavior, conservationand habitat characteristics of Asiatic wild cat in Xinjiang arid region of China. Specimen collected from various parts of Xinjiang exhibit varied phenotypic characters. It has protruding morphological features like many other desert animals. It has dense and soft hairs on the forelimb pads like other felids but rarely behaves nocturnally, adjusting its movement with seasonal variation and food availability. Tarim hare, Lepus yarkandensis, is the primary source of food followed by gerbil, jerboa, birds, fish and lizards. Literature and the statistics both reveal that it's remnant population is declining fast limiting it to only a few fragmented habitats in the lower reaches of Hotan, Yarkand, Tarim, Qarqan, Niya and Keriya river basins, rendering it no more a least concern species at least in China. Therefore, adequate policy decisions and concrete conservation actions are required to halt and eventually reverse the declining population of the cat and its deteriorating habitat in Xinjiang., Pakistan Wildlife Foundation, 英語

タヌキとキツネの多様性科学
増田隆一, 福江佑子, 谷地森秀二, 浦口宏二, 哺乳類科学, 49, 1, 137, 141, 2009年06月
The Mammal Society of Japan, 日本語

ハクビシンはどこから来たか〜ハクビシンの遺伝的変異
増田隆一, どうぶつと動物園, 61, 22, 25, 2009年, ［招待有り］
日本語

"Mammal Study”に研究論文を発表するにはどうしたらよいか？
増田隆一, 哺乳類科学, 49, 1, 157, 157, 2009年
The Mammal Society of Japan, 日本語

食肉目の遺伝子分析を目的としたサンプリング法,遺伝子分析技術,遺伝情報の解析法および研究事例
増田隆一, 嶋谷ゆかり, 大石琢也, 合田直樹, 田島沙羅, 佐藤丈寛, 哺乳類科学, 49, 2, 283-302 (J-STAGE), 302, 2009年
日本哺乳類学会, 日本語

Bird and mammal specimens in the Swedish Museum of Natural History originating from Hokkaido University: Bergman’s collection and a specimen gifted from Professor Saburo Hatta　　　　　　　　　　　　　　　
Masuda, R, Sato, T, Grönwall, O, Kato, M, Bulletin of Botanic Garden Hokkaido University, 8, 1, 8, 2008年, ［査読有り］
英語

エゾヒグマの自然史とヒトの文化の変遷　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, Bears Japan (日本クマネットワークニュースレター), 7, 93, 95, 2007年, ［招待有り］
日本語

ヒグマとエゾシカ　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 沙流川歴史館年報, 7, 19, 35, 2006年, ［招待有り］
日本語

Molecular Phylogeny and Genetics: The Status of Brown Bears in Japan, Biology　　　　　　　　　　　　　　　
Masuda, R, Understanding Asian Bears to Secure Their Future (compiled by Japan Bear Network), 114, 2006年, ［招待有り］
英語

クマのDNAが語るオホーツク人の交流　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 日本文化財科学会会報, 49, 16, 21, 2005年, ［招待有り］
日本語

古代DNA分析から見る北方文化の起源と変遷
増田隆一, 歴史読本, 49, 12, 233, 235, 2004年, ［招待有り］
新人物往来社, 日本語

Molecular phylogeny of whiskered bats (Myotis, Vespretilionidae, Chiroptera) in Palaearctic region　　　　　　　　　　　　　　　
Tsytsulina, K, Masuda, R, Proceedings of International Symposium on “Dawn of a New Natural History – Integration of Geoscience and Biodiversity Studies", 85, 89, 2004年
英語

中国新彊ウイグル自治区に分布する哺乳類の現況と保全
マハムト・ハリク, 増田隆一, アブリミト・アブダカディル, 大泰司紀之, 哺乳類科学, 43, 1, 1, 17, 2003年
中国西部のチベット高原から新疆ウイグル自治区（以後，新疆とよぶ）にかけての一帯は，旧北区産哺乳類の進化の舞台であり，現代の哺乳類群集の形成や進化の要因を解明する際の鍵となる地域である．新疆の動物群集は，チベット高原の隆起に伴う古テチス海の退行，中央アジアの乾燥化，氷河期の気候の影響などにより南北および東西の地域に地理的に隔離された．新生代（第三紀後期から特に第四紀初頭）における激しい自然環境の変化により，徐々に現在のような動物小区画の構成および生態地理的分布様式が形成された．多様な自然環境を有す新疆には7目23科136種程の哺乳類が分布している．新疆では，1980年から自然保護区制度が導入され，現在20ヶ所の自然保護区が作られている．従来の哺乳類研究には，牧畜業ならびに病原体に関係のある齧歯類に関して比較的多くの蓄積がある．しかし，近年人為的な活動が哺乳類の生息環境に影響を及ぼし，その生息域の減少と分断化が進行しているため，希少哺乳類の保護が緊急の課題となっている．特に，その起源，系統進化的歴史，形態的·生態的特徴ならびに種内の遺伝的多様性などを明らかにし，その生物学的情報に基づいた保護管理と生息地保全を施策することが必要である．, 日本哺乳類学会, 日本語

青苗砂丘遺跡から発掘されたヒグマ遺存体のDNA分析　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 奥尻町青苗砂丘遺跡２（北海道立埋蔵文化財センター）, 74, 77, 2003年, ［招待有り］
日本語

遺伝子から探るヒグマの渡来史と古代文化との関係
増田隆一, 東北学, 7, 7, 170, 182, 2002年, ［招待有り］
東北芸術工科大学東北文化研究センタ-, 日本語

Ancient DNA analysis of brown bear remains from the Kafukai site on Rebun Island, Hokkaido: On the origin of "bear-sending ceremony" from the Okhotsk Culture　　　　　　　　　　　　　　　
Masuda, R, Amano, T, Ono, H, Report of the 5th Open Symposium of the Hokkaido University Museum: Okhotsk Culture -- Formation, Metamorphosis and Ending, 154, 159, 2002年
英語

動物学と古代DNA分析 – マンモスとヒグマ考古遺物の遺伝子解析 --　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 歴博, 115, 9, 13, 2002年, ［招待有り］
日本語

古代DNA分析による礼文島香深井A遺跡出土ヒグマ遺存体の起源-- オホーツク文化における飼育型クマ送り儀礼の成立と異文化交流 --
増田隆一, 天野哲也, 小野裕子, 動物考古学, 19, 19, 1, 14, 2002年
動物考古学研究会, 日本語

生物地理学,分子生物学と出会う 生物地理学の新展開 ヒグマは三度,北海道に渡って来た
増田隆一, 生物の科学 遺伝, 56, 2, 47, 52, 2002年, ［招待有り］
裳華房, 日本語

環オホーツク海地域におけるヒグマの遺伝的多様性、古環境の変遷およびクマ送り文化の考察　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 天野哲也, 日本人と日本文化・その起源をさぐる, 15, 8, 2001年, ［招待有り］
日本語

遥かなる新彊シルクロードと動物調査談　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, Arctic Circle (北海道立北方民族博物館友の会・季刊誌), 38, 12, 14, 2001年, ［招待有り］
日本語

エゾヒグマの渡来史を探る：遺伝子からのアプローチ　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, Bears Japan (日本クマネットワークニュースレター), 2, 55, 56, 2001年, ［招待有り］
日本語

Molecular phylogeographic patterns and migration history of brown bear (Ursus arctos) populations around Okhotsk Sea　　　　　　　　　　　　　　　
Masuda, R, Proceeding of the 16th International Symposium on Okhotsk Sea & Sea Ice, 255, 261, 2001年
英語

分子海洋学 分子生態学と海洋学の接点 ヒグマの遺伝的多様化と北海道への渡来
増田隆一, 月刊海洋, 32, 4, 214, 218, 2000年04月, ［招待有り］
日本語

Genetic diversity and biogeographic history of the Japanese population of the brown bear (Ursus arctos)　　　　　　　　　　　　　　　
Masuda, R, Report of IIAS International Symposium on Biodiversity (International Institute for Advanced Studies), 33, 41, 2000年, ［招待有り］
英語

The taxonomic status of Moschus moschiferus anhuiensis　　　　　　　　　　　　　　　
Li, M, Li, Y, Sheng, H, Tamate, H, Masuda, R, Nagata, J, Ohtaishi, N, Chinese Science Bulletin, 44, 719, 723, 1999年
英語, 速報，短報，研究ノート等（学術雑誌）

ブラキストン線(津軽海峡)に関する食肉類の生物地理と遺伝的特徴
増田隆一, 哺乳類科学, 39, 2, 351, 358, 1999年
The Mammal Society of Japan, 日本語

中国新疆シルクロード周辺に分布するヤマネコ類:特にステップヤマネコFelis silvestris ornataの生息状況について
増田隆一, ABDUKADIR A, HALIK M, 大舘智志, 高橋学察, 哺乳類科学, 39, 2, 307, 321, 1999年
日本哺乳類学会, 日本語

ツシマヤマネコの過去・現在・未来　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, とらやまの森(環境省対馬野生生物保護センター発行誌), 4, 4, 5, 1999年, ［招待有り］
日本語

ＤＮＡから探るヒグマの渡来ルート
増田隆一, 北海道の自然, 37, 17, 20, 1999年, ［招待有り］
日本語

遺伝子から検証する哺乳類のブラキストン線
増田隆一, 哺乳類科学, 39, 323, 328, 1999年
日本語

イエネコ・ヤマネコの過去・未来　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, Biohistory 生命誌, 21, 12, 13, 1998年, ［招待有り］
日本語

Molecular genetic study on diversity and evolution of mammals in Asia　　　　　　　　　　　　　　　
Masuda, R, Environmental Conservation and Land Use Management of Wetland Ecosystem in Southeast Asia: Annual Report and Proceedings for International Workshop, Core University Program between Hokkaido University, Japan and R & D Center of Biology, LIPI, 64, 66, 1998年
英語

日本の哺乳類 種名検討編 日本産食肉目の種名の検討
増田隆一, 茂原信生, 哺乳類科学, 37, 1, 87, 93, 1997年10月
The Mammal Society of Japan, 日本語

動物園でのDNA利用--できること、できないこと--　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 村田浩一, どうぶつと動物園, 49, 182, 187, 1997年, ［招待有り］
日本語

陸橋とヒトと生物の渡来 遺伝子からみたイリオモテヤマネコとツシマヤマネコの渡来と進化起源
増田隆一, 地学雑誌, 105, 3, 354, 363, 1996年06月, ［招待有り］
学術雑誌目次速報データベース由来, 日本語

イリオモテヤマネコおよびツシマヤマネコの系統進化
増田隆一, 生物の科学 遺伝, 50, 3, 11, 12, 1996年03月, ［招待有り］
日本語

測量をカガクする 動物の近縁度はどうやってはかるのか
増田隆一, 化学, 51, 2, 74, 76, 1996年02月, ［招待有り］
化学同人, 日本語

遺伝子からみたネコ類の近縁関係　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, どうぶつと動物園, 48, 112, 115, 1996年, ［招待有り］
日本語

ラッコ新生仔の胎盤および臍帯DNAからのSRY遺伝子検出による性判別
村田浩一, 滝導博, 増田隆一, 動物園水族館雑誌, 38, 2, 48, 51, 1996年, ［査読有り］
日本動物園水族館協会, 日本語

遺伝子から見た動物の進化 --イタチ科の分子系統--　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 山と博物館, 40, 11, 2, 3, 1995年, ［招待有り］
日本語

食肉類におけるミトコンドリアDNAの塩基配列解析:PCR法の活用と分子系統への応用 イリオモテヤマネコおよびイタチ科を中心にして
増田隆一, 哺乳類科学, 34, 1, 81, 89, 1994年10月, ［査読有り］
The Mammal Society of Japan, 日本語

肝炎ラットＬＥＣの遺伝子の探索　　　　　　　　　　　　　　　
吉田廸弘, 小野教夫, 増田隆一, アニテックス, 6, 128, 130, 1994年, ［招待有り］
日本語

米国留学記　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 北海道分子生物学研究会会報, 25, 4, 6, 1992年, ［招待有り］
日本語

米国NCI留学記　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, SHINKA, 2, 2, 37, 38, 1992年, ［招待有り］
日本語

肝炎・肝がん自然発症モデル:LECラット
増田隆一, Biomedica, 6, 7, 734, 738, 1991年06月, ［招待有り］
日本語

遺伝性肝炎ラット(LEC)における細胞性免疫機構の検討
幸田弘信, 上出利光, 伝法公磨, 森道夫, 菊地浩吉, 増田隆一, 吉田廸弘, 関谷千尋, 医学のあゆみ, 144, 6, 569, 570, 1988年02月, ［査読有り］
日本語

遺伝性肝炎ラットにみられる肝病変の病理
伝法公麿, 小山田正人, 藤本佳範, 高橋秀俊, 佐藤睦, 服部淳夫, 森道夫, 増田隆一, 吉田廸弘, Journal of Toxicologic Pathology, 1, 1, 53, 60, 1988年, ［査読有り］
Recently a new mutant causing hereditary hepatitis was established from non-inbred Long-Evans rats. Hepatitis with severe jaundice appears spontaneously in rats 4 months after birth. Some affected rats die of submassive hepatic necrosis, while others survive for a long life. Liver cancers appear in these long survived rats. The hereditary hepatitis rats thus provide an animal model useful for the basic and clinical studies of hepatitis and liver cancer., JAPANESE SOCIETY OF TOXICOLOGIC PATHOLOGY, 英語

遺伝性肝炎(LEC)ラットに出現する巨大肝細胞の核DNAの解析
藤本佳範, 小山田正人, 服部淳夫, 高橋秀俊, 佐藤昌明, 伝法公磨, 森道夫, 増田隆一, 肝臓, 29, 7, 967, 968, 1988年, ［査読有り］
英語

第４章 ヒグマのゲノム解析と動物地理的歴史　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, ヤポネシアの動植物ゲノム, pp. 56-72
朝倉書店, 2025年08月, 9784254177930, ［分担執筆］

ヒトとヒグマ 〜 狩猟からクマ送り儀礼まで
増田隆一
岩波新書, 2025年03月, 9784004320593, 日本語, ［単著］

うんこの世界 〜 細菌とわたしたちの深い関係　　　　　　　　　　　　　　　
晶文社, 2024年10月, 9784794974426, ［監修］

Phylogeography of the brown bear (Ursus arctos) and bear-human relationships in the Far East, including Hokkaido Island, Japan　　　　　　　　　　　　　　　
Ryuichi Masuda, Phylogeographic History of Plants and Animals Coexisting with Humans in Asia, pp. 27-41
Springer, 2024年, ［分担執筆］

ハクビシンの不思議 〜 どこから来て、どこへ行くのか　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
東京大学出版会, 2024年01月, 9784130639583, ［単著］

はじめての動物地理学 〜 なぜ北海道にヒグマで、本州はツキノワグマなの？（岩波ジュニアスタートブックス）　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
岩波書店, 2022年10月, 9784000272476, ［単著］

知られざる食肉目動物の多様な世界 〜東欧と日本〜　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一, 金子弥生
中西出版, 2022年09月, 9784891154165, ［共編者(共編著者)］

日本野鳥の会のとっておきの野鳥の授業（分担執筆）　　　　　　　　　　　　　　　
山と溪谷社, 2021年12月, 9784635063098, 215, 196-203, 日本語, 学術書, ［分担執筆］

うんち学入門 〜 生き物にとって「排泄物」とは何か　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
講談社ブルーバックス, 2021年10月, 9784065170144, 240, 日本語, ［単著］

ヒグマ学への招待 〜 自然と文化で考える　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
北海道大学出版会, 2020年03月, 9784832974159, 一般書・啓蒙書, ［編者(編著者)］

ユーラシア動物紀行　　　　　　　　　　　　　　　
増田 隆一
岩波新書, 2019年01月, 9784004317579, ［単著］

日本の食肉類 〜 生態系の頂点に立つ哺乳類　　　　　　　　　　　　　　　
増田 隆一
東京大学出版会, 2018年08月, 9784130602372, ［編者(編著者)］

動物学の百科事典（分担執筆）　　　　　　　　　　　　　　　
丸善, 2018年, 9784621303092, 日本語, 事典・辞書, ［分担執筆］

Biodiversity Conservation Using Umbrella Species: Blakiston's Fish Owl and the Red-crowned Crane (Ecological Research Monographs)（分担執筆）　　　　　　　　　　　　　　　
Springer-Verlag, 2018年, 9811072027, 英語, 学術書, ［分担執筆］

哺乳類の生物地理学
増田 隆一
東京大学出版会, 2017年06月, 9784130602525, ［単著］

生物学
高畑 雅一, 増田 隆一, 北田 一博
医学書院, 2013年02月, 9784260031882, 日本語, 教科書・概説・概論, ［共著］

The Wild Mammals of Japan（分担執筆）　　　　　　　　　　　　　　　
Shoukadoh, 2009年, 4879746266, 英語, ［分担執筆］

地球と生命の進化学―新・自然史科学 1（分担執筆）
北海道大学出版会, 2008年, 4832981838, 272, ［分担執筆］

アイヌのクマ送りの世界（分担執筆）
同成社, 2007年, 9784886213907, 日本語, ［分担執筆］

ヒグマ学入門 : 自然史・文化・現代社会
天野 哲也, 増田 隆一, 間野 勉
北海道大学出版会, 2006年10月, 4832973916, ［共編者(共編著者)］

シラッチセの民族考古学 : 漁川源流域におけるヒグマ猟と"送り"儀礼に関する調査・研究（分担執筆）
六一書房, 2006年, 4947743379, 日本語, ［分担執筆］

動物地理の自然史 : 分布と多様性の進化学
増田 隆一, 阿部 永
北海道大学出版会, 2005年05月, 4832981013, 288, 日本語, 学術書, ［共編者(共編著者)］

保全遺伝学（分担執筆）　　　　　　　　　　　　　　　
東京大学出版会, 2003年, 9784130602136, 日本語, 学術書, ［分担執筆］

琉球弧の成立と生物の渡来（分担執筆）　　　　　　　　　　　　　　　
沖縄タイムス社, 2002年, 487127151X, 日本語, 学術書, ［分担執筆］

希少猛禽類保護の現状と新しい調査法（分担執筆）　　　　　　　　　　　　　　　
技術情報協会, 2001年, 4906317375, 日本語, 学術書, ［分担執筆］

地球・人間・環境シリーズ 環境保全・創出のための生態工学（分担執筆）　　　　　　　　　　　　　　　
丸善, 1999年, 462104639X, 日本語, 学術書, ［分担執筆］

動物の自然史（分担執筆）　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学図書刊行会, 1995年, 9784832996014, 日本語, 学術書, ［分担執筆］

The LEC Rat （分担執筆）　　　　　　　　　　　　　　　
Springer-Verlag, 1991年, 9784431681557, 英語, 学術書, ［分担執筆］

DNAから見たヒグマの進化と歴史　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
UHB大学一般教養講座, 2024年05月21日, 日本語, 口頭発表（招待・特別）
［招待講演］

うんち学入門 ー 生き物にとって「排泄物」とは何か　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
公益財団法人日本下水道新技術機構・設立30周年記念式典記念講演, 2023年03月13日, 日本語, 口頭発表（招待・特別）
東京, 日本国, ［招待講演］, ［国内会議］

ヒグマ学とうんち学 〜 動物の進化と多様性を探る 〜　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
第46回湧別町民大学（湧別町民大学実行委員会主催）, 2022年11月24日, 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
［招待講演］

うんち学入門 生き物にとって「排泄物」とは何か　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
第20回消化管先進画像診断研究会（GAIA）特別講演（オンライン）, 2022年09月17日, 消化管先進画像診断研究会, 日本語, 口頭発表（招待・特別）
オンライン（三重大学）, 日本国, ［招待講演］, ［国内会議］

ブルガリアの哺乳類、自然、文化　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
自由集会 ワークショップ『知られざる食肉目動物の世界 〜 東欧と日本』、日本哺乳類学会2022年度大会（オンライン）, 2022年08月29日, 日本哺乳類学会, 日本語, シンポジウム・ワークショップパネル（公募）
オンライン（三重大学）, 日本国, ［招待講演］, ［国内会議］

うんち学への招待　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
北海道 to the future プロジェクト presents 北海道大学・HBC（北海道放送）子どもSDGs大学, 2022年08月09日, 北海道大学、北海道放送（HBC）, 日本語, 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
2022年08月09日 - 2022年08月10日, 札幌, 日本国, ［招待講演］

フィンランドと「ユーラシア動物紀行」　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
第5回フィンランドディ（北海道大学欧州ヘルシンキオフィス主催）, 2021年12月05日, 口頭発表（招待・特別）
［招待講演］

石狩低地帯とヒグマ・キタキツネの集団遺伝的特徴　　　　　　　　　　　　　　　
増田 隆一
自然保護大学：石狩低地帯の成り立ちとその生物学的意義, 2021年11月13日, 口頭発表（招待・特別）
2021年11月13日, ［招待講演］

全道と札幌都市部におけるキツネの集団遺伝構造　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
特別講演：北海道のキツネ，日本寄生虫学会・日本衛生動物学会第67回北日本支部合同大会, 2021年10月02日, 日本寄生虫学会北日本支部, 日本語, 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
旭川, 日本国, ［招待講演］, ［国内会議］

Phylogeography of brown bears in the northern hemisphere　　　　　　　　　　　　　　　
Ryuichi Masuda
ILCAA Joint Research Project--Studies in Asian and African Geolinguistics--The 3rd Meeting, 2021年09月04日, ILCAA Joint Research Project, 英語, 口頭発表（招待・特別）
日本国, ［招待講演］, ［国内会議］

動物地理学研究と自然史博物館　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
「シンポジウム：国立沖縄自然史博物館の設立は万人のため」，第92回日本動物学会米子大会, 2021年09月03日, 日本動物学会, 日本語, シンポジウム・ワークショップパネル（公募）
米子（オンライン）, 日本国, ［招待講演］, ［国内会議］

はじめに 日本のネコ研究　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
自由集会“ワークショップ「日本のネコ研究最前線」”．日本哺乳類学会2021年度大会, 2021年08月30日, 日本哺乳類学会, 日本語, シンポジウム・ワークショップパネル（公募）
厚木（オンライン）, 日本国, ［招待講演］, ［国内会議］

哺乳類の生物地理学研究から学んできたこと　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
日本哺乳類学会2019年度学会賞受賞記念講演 日本哺乳類学会2021年度大会, 2021年08月29日, 日本哺乳類学会, 日本語, 口頭発表（招待・特別）
厚木（オンライン）, 日本国, ［招待講演］, ［国内会議］

ひぐま学への招待　　　　　　　　　　　　　　　
増田隆一
第29回先端科学移動大学（道民カレッジ）, 2020年11月14日, 日本語, 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
2020年11月14日, ［招待講演］

哺乳類食肉目の種多様性と生物地理的歴史　　　　　　　　　　　　　　　
増田 隆一
第65回日本生態学会・シンポジウム「系統地理学と地質学からせまる日本列島の生物多様性形成史」, 2018年03月16日, 日本語, シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
［招待講演］, ［国内会議］

Molecular phylogeography of mustelid species endemic to the Japanese islands and closely related species　　　　　　　　　　　　　　　
MASUDA Ryuichi
Symposium “Diversity among Mustelidae: evolution, genetics, socio-ecology inform conservation in Asia and Far East”: 12th International Mammalogical Congress (IMC12), 2017年07月14日, 英語, シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
［招待講演］, ［国際会議］

ヒグマの遺伝的多様性と移動の歴史　　　　　　　　　　　　　　　
増田 隆一
北海道自然保護協会講演会, 2017年05月20日, 日本語, 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
［招待講演］, ［国内会議］

ヒグマの多様性と北海道への渡来の歴史　　　　　　　　　　　　　　　
増田 隆一
第23回氷海の民シンポジウム（第32回北方圏国際シンポジウム市民公開講座）（道民カレッジ連携講座）, 2017年02月20日, 日本語, 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
［招待講演］, ［国内会議］

動物の進化をひもとく〜都会に暮らす動物たちの遺伝的多様性〜　　　　　　　　　　　　　　　
増田 隆一
井の頭自然文化園開園記念日講演会, 2016年05月22日, 日本語, 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
［招待講演］, ［国内会議］

Collaborations of biogeographic studies between Japan and Finland　　　　　　　　　　　　　　　
MASUDA Ryuichi
The Annual ACF (Alumni Club of Finland) General Assembly and the All Alumni Meeting “Academic Links between Finland and Japan”, 2015年10月15日, 英語, 口頭発表（招待・特別）
［招待講演］, ［国際会議］

Founder effects on the Japanese populations of the masked palm civet Paguma larvata, revealed by molecular phylogeny and population genetics　　　　　　　　　　　　　　　
MASUDA Ryuichi
Symposium “Genetics on Isolated Populations”, 5th International Wildlife Management Congress 2015, 2015年07月28日, 英語, シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
［招待講演］, ［国際会議］

Historical changes of genetic diversity in the Blakiston's fish owl and red crowned crane populations on Hokkaido　　　　　　　　　　　　　　　
MASUDA Ryuichi
Symposium “Biodiversity conservation using Blakiston's fish owl and red crowned crane as umbrella species”, 5th International Wildlife Management Congress 2015, 2015年07月27日, 英語, シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
［招待講演］, ［国際会議］

DNAからみたヒグマの系譜：世界へ発信 考古学と分子系統学のコラボレーション　　　　　　　　　　　　　　　
増田 隆一
北海道立埋蔵文化財センター・夏期講演会, 2015年06月06日, 日本語, 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
［招待講演］, ［国内会議］

シマフクロウとタンチョウにおける遺伝的多様性の歴史と将来　　　　　　　　　　　　　　　
増田 隆一
市民向けシンポジウム「シマフクロウ・タンチョウを指標とした生物多様性保全 北海道の過去・現在・未来」, 2015年02月11日, 日本語, 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
［招待講演］, ［国内会議］

生命科学　　　　　　　　　　　　　　　
藤女子大学（非常勤講師）
2025年04月 - 現在

生物科学・生命科学　　　　　　　　　　　　　　　
藤女子大学（非常勤講師）
2012年04月 - 2019年06月

集中講義「動物系統進化学」　　　　　　　　　　　　　　　
岐阜大学 応用生物科学部（非常勤講師）
2012年12月

集中講義「哺乳類の分子系統進化と生態遺伝学の最前線」　　　　　　　　　　　　　　　
名古屋大学 大学院理学研究科（非常勤講師）
2011年06月

特別講義　　　　　　　　　　　　　　　
静岡県立大学 大学院生活健康科学研究科（非常勤講師）
2009年06月

新自然史科学特別講義〜地球と生命の自然史　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学 大学院共通科目

多様性生物学概論　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学 大学院理学院自然史科学専攻

多様性生物学研究法　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学 大学院理学院自然史科学専攻

動物系統分類学実習　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学 理学部生物科学科

多様性生物学 II　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学 理学部生物科学科

多様性生物学 I　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学 理学部生物科学科

環境と人間 ヒグマ学入門　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学 全学教育

生物学 II　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学 全学教育

多様性生物学特論 I　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学 大学院理学院自然史科学専攻

系統進化学　　　　　　　　　　　　　　　
北海道大学 理学部生物科学科

日本列島に棲息したオオヤマネコに関する学際的調査・研究
科学研究費助成事業
2021年04月01日 - 2025年03月31日
佐藤 孝雄, 澤田 純明, 澤浦 亮平, 米田 穣, 河村 愛, 鈴木 敏彦, 増田 隆一
本年度の研究成果は以下の2点に纏められる。
(1) 8月に青森県東通村尻労安部洞窟において補足的な発掘調査を行い、オオヤマネコ遺体に更なる追加資料を得た。同成果については、12月に開催された青森県遺跡報告会で発表した。
(2) 総合研究大学院大学総合進化科学センターの寺井洋平博士の協力を得て、青森県東通村尻労安部洞窟、岩手県陸前高田市獺沢貝塚、千葉県印西市馬場遺跡第5地点、福井県若狭町鳥浜貝塚、愛媛県上黒岩岩陰、鹿児島県いちき串木野市来貝塚から出土したオオヤマネコ遺体のゲノム解析に着手した。はじめに、上記6遺跡のオオヤマネコ遺体から採取した全サンプルについて、少量の配列を決定したところ、尻労安部洞窟、馬場遺跡第５地点のサンプルに含まれる同種DNA比率がそれぞれ16.3%、9.4%と同種のDNA比率がことのほか高率に遺存していることが確認された。そこで、まず同2サンプルについて、大量配列決定を試み、それらを既報の現生オオヤマネコ属のデータに加え、最尤法による系統樹を作成した。その結果、尻労安部洞窟のサンプルがユーラシア大陸のオオヤマネコ集団の単系統の基部に結合されたのに対し、馬場遺跡第5地点のサンプルはカナダオオヤマネコやボブキャットなど北米の近縁種も含むより単系統の基部に結合され、縄文時代、本州には少なくも2系統のオオヤマネコが生息していたことが明らかとなった。これまで、オオヤマネコは最終氷期にマンモス動物群の一構成種として、日本列島に到来したと考えられてきたきたが、上記の結果は、列島における同種のポピュレーション・ヒストリーが従来考えられていた以上に複雑であったことを物語る。次年度以降、さらに西日本に位置する鳥浜貝塚、上黒岩岩陰、市来貝塚の出土遺体から得られたサンプルの解析が進めば、国内外から注目される古生物学的成果を発表できることを期待できる。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 慶應義塾大学, 23K20533

日本列島に棲息したオオヤマネコに関する学際的調査・研究
科学研究費助成事業
2021年04月01日 - 2025年03月31日
佐藤 孝雄, 澤田 純明, 澤浦 亮平, 米田 穣, 河村 愛, 鈴木 敏彦, 増田 隆一
2021年度の研究実績は以下の通りとなる。(1) 茨城県つくば市上境旭台貝塚、千葉県印西市馬場遺跡第5地点、神奈川県横須賀市吉井第一貝塚、鹿児島県いちき串木野市市来貝塚から出土したオオヤマネコ遺体群を所蔵機関より借用、肉眼による観察と計測、高精細撮影を実施し、マイクロCTによる三次元データを取得。それぞれ精巧なキャストを製作した。(2) うち上境旭台貝塚出の右大腿骨、馬場遺跡第5地点の左右側頭骨鼓室部、市来貝塚の左橈骨1点からは、所蔵機関の許諾を得て、必要な試料を採取し、放射性炭素年代測定、安定同位体比による食性解析、aDNAによる系統地理解析も進めた。既に得られた14C年代の測定結果から、上境旭台の遺体は縄文時代後期、馬場遺跡第 5地点、市来貝塚の遺体は縄文時代晩期の資料であることが確認された。数値年代を踏まえ、縄文時代晩期までオオヤマネコが本州から九州に至る広範囲な地域に生息していたことを明らかにし得た意義は大きい。(3) 新型コロナウイルスの感染拡大を受け、新たに同種遺体を得るべく夏季に予定していた青森県下北郡東通村尻労地区での発掘調査は中止せざるを得なかったが、次年度の実施を目指すべく、関係機関との交渉を進めた。(4) 8月にはオンラインで開催された日本哺乳類学会2021年度大会で、「絶滅した日本オオヤマネコの学際的調査・研究」という題目で口頭発表を行い、本研究プロジェクトで計画されている調査・研究の計画とその意義を説明した。(5)本研究プロジェクトの成果を海外発信すべく、 ICAZ(International Council for Archaeozoology)の大会に参加、発表を行うための準備も進めた。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 慶應義塾大学, 21H00613

都市空間を利用するキタキツネの生態遺伝学的特徴とエキノコックス伝播要因の解明
科学研究費助成事業
2021年04月01日 - 2024年03月31日
天池 庸介, 増田 隆一, 佐々木 瑞希, 中尾 稔
今年度は、北海道旭川市を主な調査地とし、①キタキツネ（以下、キツネ）の糞便調査、②キツネの生体調査、③野ネズミ調査を実施した。当該地域におけるキツネとエキノコックスに関する基本的情報が不足していることから、まずは分布情報や感染状況の把握に努めた。キツネ糞便調査（①）では、都市公園、河川敷および郊外の山林等にて、キツネの標本採集調査を実施し、各地点から糞を採集した。また、冬期の積雪時には、糞と同じく非侵襲的遺伝サンプルである尿や毛のサンプルも採取し、同様に遺伝子型決定が可能であることを確認した。今年度採集したサンプルは、309個（尿や毛も含む）である。昨年度の予備調査時に採集したサンプル86個（尿や毛も含む）とあわせると、合計395個となり、その個数は集団遺伝解析を行う上で十分な数と考えられる。糞の種判定の結果、高頻度でキツネに特異的なDNAが検出され、札幌市の都市ギツネと同様に、中心部を含む市街地の広範囲にキツネが分布していることが確認された。さらに、集団遺伝構造解析の結果、旭川集団は複数の遺伝集団に分けられ、それらは混在していることが明らかとなった。また、糞由来DNAを用いたエキノコックス検査を行ったところ、一部のサンプルでエキノコックスのDNAが検出され、市内におけるキツネのエキノコックス感染も確認された。キツネの生体調査（②）では、自動撮影カメラを用いてキツネの出没状況を調査したところ、予備調査時と同様に市内の都市公園においてキツネの定着を確認した。野ネズミ調査（③）では、市内の都市公園において、春から晩秋まで捕獲調査を行い、野ネズミのエキノコックス感染を検査したところ、春には感染は確認されなかったが、初夏に感染が確認され、その後秋にかけて感染率が増加するといった感染率の季節性が見られた。
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 21K06343

動植物ゲノム配列解析にもとづくヤポネシアへのヒトの移動の推定
科学研究費助成事業
2018年06月29日 - 2023年03月31日
鈴木 仁, 遠藤 俊徳, 坂井 寛章, 増田 隆一, 伊藤 剛
本年度は以下の6つの研究を遂行した。研究1:野生ハツカネズミ98個体の全核ゲノムデータを活用し、毛色関連遺伝子Asip (180 kb)およびMc1r (250 kb)に対する系譜学的解析を行った。先史時代、適応的な毛色変異が新規に移入した地域においてそれぞれ定着したことが示された。研究2: マダガスカルのハツカネズミ集団の全核ゲノム解析はアジア南部に展開する亜種M. m. castaneusの寄与、さらには先史時代の航海術を有したオーストロネシア語を繰る農耕民の関与を示唆した。研究3:クマネズミのmtDNA遺伝子変異の解析は、約5千年前に海洋域を含んだ南中国と東南アジアで急激な多様化が生じたことを示唆した。研究4：核ゲノムSNPを用いた集団解析および、15の代表的な栽培化遺伝子の系統解析から、ヤポネシアの栽培イネの集団構造を明らかにした。古い品種であると示唆された古代米（赤米）１系統のゲノム構成は、古いジャポニカ型アリルおよびインディカ由来のアリルからなることが明らかとなった。また、葉緑体ゲノムを用いた解析から、日本のジャポニカ品種は2500年前以降に有効集団サイズの増大が始まったことが示唆された。研究5：岡山県南方(済生会)および滋賀県粟津湖底の遺跡由来のヒョウタン標本(弥生時代中期頃)に関し、在来種を加えて核ゲノムのSNP解析に基づき、日本列島へのヒョウタンの移入経緯を推察した。研究6:解析した北海道のヒグマの全ゲノム情報と既報の海外ヒグマの全ゲノム情報を比較解析することにより，北海道ヒグマでは遺伝的多様性は低いが絶滅が危惧されているヨーロッパの個体群よりは多様性が高いこと、北米やヨーロッパのヒグマ集団とは明瞭に異なること、最終間氷期以前より大陸集団と異なる集団動態を経験していること、北海道ヒグマのミトコンドリアDNAの3系統集団間で交流があることが明らかとなった。
日本学術振興会, 新学術領域研究(研究領域提案型), 北海道大学, 18H05508

遺伝学と形態学的アプローチによる北ユーラシアにおける食肉類の多様性と進化の解明　　　　　　　　　　　　　　　
二国間交流事業・共同研究ロシア
2019年04月 - 2021年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

千島アイヌの起源と経済史に関する考古学的研究
科学研究費助成事業
2015年04月01日 - 2020年03月31日
高瀬 克範, 内山 幸子, 手塚 薫, 江田 真毅, 増田 隆一
千島列島の先住民である千島アイヌの起源地は，南サハリンもしくは南千島である可能性が高いことを考古学的な検討を通して明らかにした。また，千島アイヌは，15世紀に成立した当初，千島列島ではなく南カムチャツカを本拠地としていたが，18世紀初頭にカムチャツカの利用をほぼ停止し，千島列島に本拠地を移したことも明らかにした。千島列島ではもともとカムチャツカ起源の陸獣を多量に利用していたわけではなく海洋資源に大きく依存していたため，カムチャツカ撤退以後も千島列島内の経済に大きな変化は生じていなかったことが，動物骨の検討から予測された。
日本学術振興会, 基盤研究(A), 北海道大学, 15H01899

ブルガリアの生物地理とトラキア文化の起源に関する分子系統・動物考古学的研究　　　　　　　　　　　　　　　
二国間交流事業・オープンパートナーシップ共同研究（ブルガリア）
2017年04月 - 2019年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

ユーラシア中央部・南部でのヒグマ多様性変遷の探求と北海道ヒグマ三系統の起源解明　　　　　　　　　　　　　　　
基盤研究(B)（一般）
2015年04月 - 2019年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

経済的利用により劣化した東アジアおよびロシア極東地域の食肉目個体群の復元技術開発
科学研究費助成事業
2014年04月01日 - 2018年03月31日
金子 弥生, 増田 隆一, 角田 裕志, 西田 義憲, 上遠 岳彦, 聶 海松, 斎藤 昌幸, 久野 真純, 神田 剛, 谷地森 秀二, 小菅 園子, 細川 睦
アジアの野生動物の保全達成には、科学的根拠と動物と人間の関わりの具体的な情報蓄積が必要である。本研究では、環境選好性や人間との関わりの程度の異なる中型食肉目5種（ユーラシアアナグマMeles spp.など）を、食肉目群集の生息地保護のための指標種とした。遺伝子分析より、ロシアのアナグマ2種の分布境界における交雑や、イタチ属の平衡進化が明らかになった。また行動生態面では、匂い成分分析の有用性、人為活動とイヌ科動物の影響によるイタチ科2種の活動の変化が明らかになった。イタチ科動物の地域個体群保全のためには、開発等による生息環境改変の直接的影響の評価と共に、競合種との種間相互作用も考慮すべきである。
日本学術振興会, 基盤研究(A), 東京農工大学, 26257404

北方ユーラシアにおける食肉類の遺伝的多様性および形態的多様性の比較研究　　　　　　　　　　　　　　　
二国間交流事業・共同研究ロシア
2016年04月 - 2018年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

マリタ遺跡のヴィーナス像に関する年代研究
科学研究費助成事業
2013年04月01日 - 2017年03月31日
吉田 邦夫, 國木田 大, 佐藤 孝雄, 加藤 博文, 増田 隆一
バイカル・シベリアのマリタ遺跡は、マンモスの牙から作られたヴィーナスや鳥などの彫像が出土した著名な遺跡である。1928年以来、たびたび発掘されてきたが、出土物の層位が明確になっていない場合が多い。2013年、2014年に日ロ共同発掘調査を行い、層準が明確な資料を得た。また。ロシア国立歴史博物館・エルミタージュ国立美術館・イルクーツク国立大学に収蔵されている資料から年代測定用試料を採取した。これら、小児骨、ヴィーナス像を含む70試料を超える、主として骨試料について、年代値・炭素窒素安定同位体比を得た。同遺跡における複数の地質学的層序と文化層、自然環境とその年代についての重要な知見を得た。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 東京大学, 25300037

アイヌ民族文化の形成過程の解明に向けた総合的研究
科学研究費助成事業
2012年10月31日 - 2016年03月31日
加藤 博文, 石田 肇, 吉田 邦夫, 佐藤 孝雄, 米延 仁志, ハドソン マーク, 米田 穰, 安達 登, 増田 隆一, 木山 克彦, 江田 真毅, 岡田 真弓, 長沼 正樹, 長沼 正樹, 深瀬 均, 木山 克彦, 江田 真毅, 岡田 真弓
本研究では、アイヌの集団的・文化的形成過程において海洋狩猟民文化の強い影響が社会文化伝統にも、集団的にも、存在したことを示唆する豊富な資料を提供することができた。浜中２遺跡の調査では、海獣儀礼の伝統が先行する先史文化から連続して継承、発展されアイヌ文化の中へ取り込まれていくことが考古学的に提示された。
集団的な系統性については、先行研究で示唆されていたオホーツク文化の関与を補強する資料を得ることができた。提示されたアイヌ民族の集団形成性の複雑さは、集団のアイデンティティの形成過程や変遷についても、社会・経済・政治的文脈での検討の必要性を示唆している。今後も得られた資料の調査研究を進めていく。
日本学術振興会, 基盤研究(A), 北海道大学, 24242030

琉球列島ジュゴン個体群保全のための基礎生物学的研究
科学研究費助成事業
2012年04月01日 - 2016年03月31日
大泰司 紀之, 増田 隆一, 中郡 翔太郎, 須藤 健二, 太子 夕佳
本研究の目的である琉球列島ジュゴン復元対策として得た結論は；（１）沖縄島に常住する3～4頭について、詳しく調査を行ない、その保全対策を充実させる。（２）フィリピンルソン島北部の沿岸と島嶼についてフィリピンと共同調査・共同保全を行い、増加個体が八重山諸島に分散してくるのを待つ。しかしそれらによる個体群回復や分布復元の可能性は乏しいと言わざるをえない。（３）マレーシアなどのジュゴンが数百頭レベルで常住している地域において、捕獲個体による人工繁殖を行う。その成功を待って、西表島に佐渡のトキの場合のようにジュゴン保護センターを設置し、増やした個体を適地を選んで放す。
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 24570017

ウラル地方と北海道での古代から現代へのヒグマの系統地理、形態、文化変遷の比較研究　　　　　　　　　　　　　　　
二国間交流事業・共同研究ロシア
2014年04月 - 2016年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

絶滅危惧種シマフクロウの遺伝的多様性評価と遺伝子資源保存の基盤形成　　　　　　　　　　　　　　　
基盤研究(B)（一般）
2011年04月 - 2015年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

北海道および北方域の希少種・固有集団の進化起源と多様性に関する保全遺伝学的研究　　　　　　　　　　　　　　　
2015年度研究助成（一般助成）
2015年
増田 隆一
秋山記念生命科学振興財団, 研究代表者, 競争的資金

経済的利用により劣化した中国希少食肉目個体群の復元技術の開発
科学研究費助成事業
2010年04月01日 - 2014年03月31日
金子 弥生, 増田 隆一
近年、中国南部をとりまく問題点は山積している。特記すべき内容として、人間活動による食肉目個体群の密猟による衰退が生じている。アジア東部の文化的独自性、特に食肉目動物の食料や伝統薬として利用は他地域にはみられない。本研究では、生態調査と並行して人間による野生動物の利用状況を調査した。その結果、広州の大規模野生動物市場へ国内外から密輸された動物が集積され、また自然保護区などの各野生動物の生態や分布などの生態的基礎情報が古いことが、密輸取り締まりの強化実行の大きな障害となっていた。今後、定期的にフィールドワークとデータ更新を行うとともに取り組みも必要である。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 東京農工大学, 22405003

ツシマヤマネコをモデルとした糞からの生物多様性情報の抽出と種保全への展開　　　　　　　　　　　　　　　
挑戦的萌芽研究
2011年04月 - 2013年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

日本列島の南と北でヒト集団の生活誌と系統の多様性を探る
科学研究費助成事業
2010年 - 2012年
石田 肇, 弦本 敏行, 分部 哲秋, 増田 隆一, 米田 穣, 太田 博樹, 深瀬 均
オホーツク文化人集団は 55 歳以上で亡くなる個体がかなり多い。オホーツク文化集団は、船上の活動などが腰椎の関節症性変化発症に関与した。久米島近世集団は、男女とも腰椎の関節症の頻度が高い。四肢では、オホーツク文化人骨では肘関節、膝関節で高い傾向を示した。沖縄縄文時代人は、目と目の間が平たいという特徴がある。成人男性の平均身長が約 153cm と、南低北高の傾向がみえる。北東アジア人の大腿骨骨体上部の形状が扁平形状であることを示した。四肢骨 Fst は頭蓋や歯の値より 2-3 倍大きい。SNP の解析により、アイヌ人と琉球人は一つのクラスターをなし、アイヌ・琉球同系説を支持した。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 琉球大学, 22370087

環オホーツク海地域における前近代交易網の発達と諸民族形成史の研究
科学研究費助成事業
2009年 - 2012年
天野 哲也, 小嶋 芳孝, 関口 明, 浪川 健治, 菊池 俊彦, 石田 肇, 佐々木 史郎, 増田 隆一, 中村 和之, 小野 裕子, 三宅 俊彦, 松枝 大治, 赤沼 英男, 中村 和之
古代中世に環オホーツク海の諸集団は,交易を梃子にして,技術の改良や領域の明確化など生産体制を強化し,民族的な形成を進行させ,近代国家の政治的支配が及ぶに至って,国家に包摂・分断され変容を遂げた。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 21401023

ユーラシア北東部における後期旧石器時代人の適応行動に関する総合的研究
科学研究費助成事業
2008年 - 2012年
佐藤 孝雄, 加藤 博文, 吉田 邦夫, 増田 隆一, 石田 肇, 鈴木 建治, 國木田 大, 阿部 祥人
最終氷期最寒冷期(LGM)に先立つ東シベリアの古環境と更新世人類集団の適応行動を解明すべく、イルクーツクの北北西約 150km に位置する Bol'shoj Naryn 遺跡で発掘調査を重ねた。その結果、凡そ 30,000 年前から 25,000 年前にかけてバイカル湖以北に展開した更新世人類集団は、概して森林ステップが広がる LGM より温暖・湿潤な環境下で、ウマやバイソンを主要な狩猟対象としていたことが明らかとなった。
日本学術振興会, 基盤研究(A), 慶應義塾大学, 21251009

琉球列島ジュゴン個体群保全のための個体群解析
科学研究費助成事業
2010年 - 2011年
小倉 剛, 大泰司 紀之, 増田 隆一
現在,我が国のジュゴンは沖縄島北部の東海岸を中心に目視情報が報告されているが,その生息数は非常に限られておりその保全が求められている.しかしながら,琉球列島のジュゴンに関する知見は少なくより効果的な保全対策を検討するための科学的知見はほとんど存在しない.本種のように広い生息範囲を有する海生哺乳類の個体群構造・動態および個体群間の関係を推察する上で,形態学的変異や遺伝情報を利用した解析は有効な方法のひとつである.しかし,琉球列島のジュゴンに関しては,これまで個体群解析は行われておらず,その個体群構成,遺伝的多様度などに関する知見は非常に乏しい.そこで本研究では,琉球列島内の新城島において保存されているジュゴンの頭骨を用い形態学および分子系統学的検討を行い琉球列島および周辺のジュゴン個体群間の関係性と遺伝学的特性を明らかにするとすることを目的とした.
本年度は初年度で実行した琉球列島個体群のmtDNA分析および頭骨形態における地理的変異の解析のための形態学的調査を継続し行った.
mtDNA分析では,コントロール領域の多様性が比較的高い領域において330塩基対の塩基配列を決定し,54個体から5つのハプロタイプを得た.これまで琉球列島のジュゴン個体群からこれほどまとまった標本数を用いての塩基配列決定の報告はなく,本研究にて得られた大きな成果である.
また,頭骨における形態学的研究では,本年度はオーストラリアにおいて117個体の頭骨の計測を行った.本年度と昨年度の調査結果を照らし合わせジュゴンの頭骨形態における地理的変異の解析した結果,アジアとオーストラリアの個体群間の吻部に関して地理的な変異が検出された.
今後これらのデータのさらなる解析および調査の継続により琉球列島内外を含めた個体群間の交流の一端を明らかとすることができると考えられる.
日本学術振興会, 基盤研究(C), 琉球大学, 22570023

チベット高原横断鉄道による野生動物への影響に関する研究
科学研究費助成事業
2007年 - 2010年
星野 仏方, 本川 雅治, 鈴木 正嗣, 大泰司 紀之, 増田 隆一, 梶 光一, 金子 正美, 武田 雅哉, 浅川 満彦, 亀山 哲, 吉田 剛司, 伊吾田 宏正, 姜 兆文, 呉 暁民, 劉 楚光, 崔 慶虎
本研究は2006年7月に開通した中国・青海省のゴルムト市とチベットのラサを結ぶ青海-チベット横断鉄道によるチベット高原に生息する大型哺乳類のチルー(Tibetan antelope or Chiru (Pantholops hodgsonii))、及び小型の哺乳類野生動物への影響を4年間に亘って調査と研究を行った。この研究により明らかにしたことは:(A)鉄道の影響に関して、(1)本研究では世界で初めてチルー9頭にARGOSシステムを装着し、追跡を始めた。メスチルーは季節移動時に鉄道に設置したアンダー・オーバーパス合計33箇所の中で最も使われているのはチュマル河(楚瑪爾河)のアンダーパスより南、五道梁駅より北に位置する全長200mの比較的小さなアンダーパスであるWu-Bei(五北:N35°15';E93°09';標高4597m)であり、その他に良く使われているのはチュマル河橋のアンダーパスである;(2)メスチルーは越冬地?繁殖地に向かう途中、約1カ月半"徘徊"して鉄道を渡る;繁殖から越冬地に戻る途中約1カ月"徘徊"していることが分かった。(B)生息地利用に関して、(3)チルーのメイン繁殖地は4,900m～5,100mに位置するホフシル(可可西里)中央部のHuiten Nur(中国名はZhuonai Hu)周辺の平坦地である;(4)越冬地はチベット、新疆、青海省に分散されている;(5)越冬地より中継地、また中継地より繁殖地の方が一年中を通して餌資源が豊富(衛星植生指数値が3倍以上高い)であるため、チルーは長距離を渡り、ホフシルを目指していた。これは今までチルーの繁殖に関する数々の"ナゾ"の一つになっている「チルーは何故環境条件が厳しいホフシル(Huiten Nur)を選んで子育てをしている」ことが解けたことになる。(C)鉄道沿線に生息する小型哺乳類動物と鳥類の一部の種の構成、分布、形態、食性、寄生虫、行動に関する情報が得られ、鉄道との関係を明らかにした。
日本学術振興会, 基盤研究(A), 酪農学園大学, 19255005

氷河期から現代にいたるシベリア・日本哺乳類相の系統地理と移動史の比較研究　　　　　　　　　　　　　　　
二国間交流事業・共同研究ロシア
2007年04月 - 2009年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

更新世の動物遺存体の古代ゲノム解析法の開発と系統地理学研究の新しい展開　　　　　　　　　　　　　　　
科研費・萌芽研究
2007年04月 - 2009年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

古代DNA分析を導入したシベリア・マンモス動物群から現代動物相の多様性変遷の解明　　　　　　　　　　　　　　　
科研費・基盤研究(B) (海外学術調査)
2005年04月 - 2009年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

古代ＤＮＡ分析を導入したエゾシカ集団の系統地理の変遷と多様性成立機構の解明　　　　　　　　　　　　　　　
科研費・基盤研究(B) (一般)
2003年04月 - 2007年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

中世日本列島北部-サハリンにおける民族の形成過程の解明-市場経済圏拡大の観点から-
科学研究費助成事業
2007年 - 2007年
天野 哲也, 増田 隆一, 深澤 百合子, 右代 啓視
列島北部-サハリン-アムール下流域における中世社会・民族形成の過程を、東アジア的枠組みの中で解明することを試みた。とくに古代[オホーツク文化・擦文文化]と中世[アイヌ文化]をつなぐ試み(そのプロセスの把握と動因の解明)を中心的な課題とした。
自家製品である木器木製品については、品目・比率ともに擦文文化期からアイヌ文化期に連続的な変化を遂げること、またアイヌ文化の指標となる鉄鍋については14世紀半ば以降、能登半島の産地(中居など)からもたらされた可能性が大きいことを推定できた。
これに加えて、このような「物質の内地化」を可能にした生産体制(集落・領域の構造と形態)と集団の交流の解明にもとりくみ、アイヌ文化形成の最初期、津軽地方では、北海道アイヌに特徴的な世帯毎の分散的領域形成が展開しなかったこと、さらに道北地方の擦文文化期に防御性施設がすでに建設されたことを確認できた。そしてアイヌ民族に6%前後みとめられるY1ハプロタイプは、北海道に進出したオホーツク集団が続縄文集団と接触する過程でもたらされた可能性が高いことを推定できた。
日本学術振興会, 北海道大学, 19900101

オホーツク文化人骨の再発見と総合的研究
科学研究費助成事業
2006年 - 2007年
石田 肇, 百々 幸雄, 天野 哲也, 埴原 恒彦, 松村 博文, 増田 隆一, 米田 穣
オホーツク文化人骨の形態解析とDNA分析の結果、北東アジア、とくにアムール川流域を起源としていること、mtDNAのハプログループYは、アムール川下流域集団の祖先からオホーツク文化人を経由してアイヌへともたらされたことが示唆された。また、食生活では栄養段階の高い大型魚類や海生ほ乳類を主要なタンパク質として多く利用していたことが示された。変形性関節症の頻度分布からも、生業との関連性が示唆された。アイヌ民族のイオマンテ型儀礼は続縄文文化・オホーツク文化にまでさかのぼる可能性が大きいことを示した。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 琉球大学, 18370099

中世日本列島北部・サハリンにおける民族の形成過程の解明ー市場経済圏拡大の観点から
科学研究費助成事業
2003年 - 2007年
天野 哲也, 増田 隆一, 深沢 百合子, 右代 啓視, 浪川 健治
今年度は,(1)アイヌ文化・社会の定義の再検討と(2)オホーツク文化の担い手・集団の解明を中心に取り組んだ。
前者では,鉄鍋や鉄鋼製品,木製品,ガラス玉について収集・分析を進めた。鉄鍋については14世紀半ば以降の製作地として能登仲居が推定できた。厚真町モイ遺跡のアイヌ期住居の年代査定では13世紀以降の中世と近世の2時期を抽出できた。ガラス玉では,北海道への4つの流入ルートが押さえられた。木製品では4367点の資料を206種の分類体系にまとめ分析した結果,中世と近世の間に大きな飛躍が捉えられた。
一方,鉄器の普及に関しては,北海道と東北では擦文期後半に格差があることが判明した。地域間関係では,交易活動の活発化に伴って成立した擦文地域集団が中世アイヌに引き継がれ,日本海北部集団はサハリンアイヌの母体となったとの見方が出された。道北のチャシは古代に遡る可能性が指摘され,サハリンと北海道をつなぐ機能が想定されている。土器の中間的属性分析の結果から,道央と道南が擦文土器成立当初から比較的疎遠な関係であったことが捉えられた。他方,浜大樹2遺跡の竪穴住居祉の14C年代では10C後半〜11C前半となり,道東部太平洋側への擦文文化の波及という点で注目される。
オホーツク文化の担い手・集団の解明については,7月に「国際シンポジウム骨から探るオホーツク人の生活とルーツ」を実施した。特に,形態小変異の解析からオホーツク人の道北・道東2グループの地域的・集団的違いが指摘され,古代DNA分析から,オホーツク人がニヴフやウリチに近縁であることが示された。考古学では,道東部と道北部のオホーツク集団が,成立当初からの文化的違いを背景にした複数集団により成立した可能性が指摘された。
クマ送り儀礼に関する研究では,動物学,植物学,昆虫学,民族学,考古学,日本史学,文学,自然保護の専門家からなる『ヒグマ学入門』を上梓した。
日本学術振興会, 特定領域研究, 北海道大学, 15068201

中央アジアおよびザバイカルにおけるヒグマ集団の分子系統地理と進化起源の探索　　　　　　　　　　　　　　　
科研費・基盤研究(B) (海外学術調査)
2002年04月 - 2005年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

北海道・環オホーツク海地域におけるヒグマ集団の遺伝的多様性の起源と成立機構の解明　　　　　　　　　　　　　　　
科研費・基盤研究(C)
2001年04月 - 2003年03月
増田 隆一
日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金

東アジア・東南アジア産哺乳全種の現況と多様性保全方法・必要な調査の検討
科学研究費助成事業
2003年 - 2003年
大泰司 紀之, 齊藤 隆, 増田 隆一, 鈴木 正嗣, 金子 正美, 大舘 智志
本年度はSARSの伝染のために中国・東南アジアへの入国が7月まで制限された。7月になってこれらの地域に入域解禁となってから出張計画を立案せねばならなくなったため、目的とする各国に行って資料を集め、専門家と打ち合わせることが困難となった。このため現地での打合せを実施したのは、これまで十分な連絡を取ることのできなかったモンゴル及び、広大な面積を占める中国のみとなった。
それを補うために、ロシア共和国については哺乳類学会に参加のため来日した専門家や日本滞在中のロシア人研究者と打合せた。また中国ではこれまで調査の乏しいタリム盆地と海南島について、他の目的で調査を行った折に哺乳類相についても調べた。
現地で十分な打合せが行えなかったために、東アジア地域の哺乳類相に関する文献を集め、全哺乳類についてリストにするとともに、最終目標としている種毎の分布域や保全の目標などについてメモを作成した。
このリストとメモに基づいて、主としてe-メイルにより各国の各分類群の専門家と打ち合わせ、それぞれにレポート作成を依頼し、2005年のIMC-9においてとりまとめを行う。
環境変化については、中国の専門機関を訪ね、衛生画像の解析方法について検討を行った。その結果、とりわけ砂漠化などによる近年の植生の変化が著しいことが明らかとなり、対象とする全域について植生の変遷を明らかにすることが可能となった。
以上により、対照地域の環境変化とあわせて、哺乳類の分布域の変化と保全対策を提示する予定である。
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 15631010

食される野生動物肉の微生物汚染調査と産地を特定する遺伝学的モニタリング手法の開発
科学研究費助成事業
2001年 - 2003年
石黒 直隆, 神崎 伸夫, 増田 隆一, 牧野 壮一, 上原 静
本研究の目的は、古くから日本で食されているイノシシ、シカ、クマの動物肉の微生物汚染を調査すると共に、こうした動物肉の産地を特定できる遺伝的な手法を開発することであった。平成13年〜15年の3年間の間に以下の成果を得ることができ、7報の学術論文として公表した。以下に得られた成果を記述する。
1)食される動物肉の微生物汚染:本州で最も広く食されているイノシシ肉について一般細菌数、大腸菌数、サルモネラ、O157等を調査した。今回調査した46サンプルではサルモネラおよびO157は検出されなかったが、一般大腸菌数は1.4x10^3〜1.1x10^6で、大腸菌数は10〜10^3であり、市販のブタ肉より一般的に少なかった。
2)産地を特定する遺伝的なモニタリング手法の開発:日本各地で生息するイノシシ、シカ、クマの地方集団についてミトコンドリアDNA(mtDNA)多型情報が集まるにつれ、mtDNAの遺伝子マップが検討されつつある。本研究でも西日本で多く食されるイノシシについて、かなり詳しいmtDNA遺伝子マップを完成した。ニホンイノシシは全体的にはJ1〜J18の18型に型別されるが、J10,J12,J15は九州から近畿・中国地方に広く生息する集団であるのに比べ、J1やJ5などは中部地方から関東地方にかけて分布する集団であることが明らかになった。また、家畜ブタのmtDNAや核DNAの情報も蓄積されつつあり、市販肉がイノブタ肉か?イノシシ肉か?を遺伝的に分類することが可能となった。これによりイノシシ肉を遺伝的に同定し、表示の信頼性をチェックする手法が開発できた。
3)シカのプリオン病(曼性消耗疾患:CWD)のプリオン検査:シカ肉が食されているが、シカのCWDについての情報が不足し、シカ肉に関して不安が広まったことから、平成14年度と平成15年度の2年間で130頭のシカについてウエスタンブロット解析を行った。検査の結果は全て陰性であった。CWDに関しては今後とも検査を持続する必要があろう。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 帯広畜産大学, 13556047

分子系統解析による日本在来動物種の起源・進化および渡来時期の解明
科学研究費助成事業
2000年 - 2000年
増田 隆一, 天野 哲也
北方民族の文化として知られるクマ送り儀礼の起源は、北海道およびサハリン南部を中心としたオホーツク文化期(紀元後6〜12世紀)の遺跡から発掘されるヒグマ遺存体にさかのぼることができる。本研究では、北海道礼文島におけるオホーツク文化期の香深井遺跡から発掘されたヒグマ考古資料(主に頭骨)の産地を同定することを目的として、ミトコンドリアDNAを指標とした古代DNAの分子系統分析を行った。現在、ヒグマは礼文島に自然分布していないので、香深井遺跡のヒグマは礼文島以外の地域から文化の交流とともに持ちこまれたものと思われる。これまでに解読することができた礼文島古代ヒグマの遺伝情報を北海道本島における現生ヒグマ集団のDNAデータと照らし合わせた結果、礼文島古代ヒグマのDNAには北海道の道央-道北型および道南型の2系列が存在することが明らかになった。これは、礼文島古代ヒグマが少なくとも道北地方および道南地域から持ち込まれたことを示している。さらに、形態的データと比較すると、道南型DNAをもつ礼文島古代ヒグマはすべて秋に死亡した1歳未満の仔グマであった。それに対して、道央-道北型の礼文島古代ヒグマの多くは春に死亡した3歳以上の成獣であった。道南型DNAをもつ仔グマはおそらく春グマ猟で捕獲され、当時の道南地方の続縄文人、または、道北地方のオホーツク人によって半年余り飼育されたと考えられる。礼文島古代ヒグマにおける道南型DNAの発見は、仔グマ・ギフトを伴うクマ送り儀礼が、従来強調されてきた集団内だけでなく、異集団間の絆を強める機能をも果たしたことを示唆している。
日本学術振興会, 特定領域研究(A), 北海道大学, 12012201

絶滅危惧動物の遺伝的多様性評価法と遺伝子資源の保存に有効な分子生物学的技術の開発
科学研究費助成事業
1998年 - 2000年
増田 隆一, 梅原 千鶴子, 押田 龍夫, 大舘 智志
3年間の本研究により以下の成果が得られた。
(1)絶滅危惧種ニホンイヌワシの捕獲個体および動物園飼育個体について、ミトコンドリアDNA(mtDNA)コントロール領域の分子系統解析を行った結果、日本における地域変異は小さいことが明らかとなった。さらに、日本産、韓国産および中国産との間でも遺伝的相違が低く、広い行動範囲をもつイヌワシの日本列島と大陸間での遺伝的交流を示唆している。この成果は、動物園におけるニホンイヌワシの繁殖計画の基礎データとなっている。また、コントロール領域内にイヌワシ特異的な繰返配列を見い出し、その比較は個体識別に有用であった。
(2)北海道ヒグマ集団において3つのmtDNA系列を見出し、その地理的分布は道南、道央-道北、道東に明瞭に分かれた。分子系統学的には、道南集団はチベット集団と近縁で、道央-道北集団は環オホーツク海周辺の集団と極めて近縁であった。北海道における3系列は異なるルートまたは時期を経て渡来した可能性がある。さらに、コントロール領域内にヒグマ特異的な繰返配列を見出し、個体間で変異が高いこと、ヘテロプラズミーの状態で存在することを明らかにした。このデータは、世界レベルでのヒグマの種・遺伝子資源の保全を考えるうえで重要な情報となる。
(3)北海道のエゾシカ集団において見い出した3系列の分布パターンはヒグマのように明瞭ではなかった。一方、明治時代の大雪によって絶滅の危機に瀕したエゾシカは、冬の避難所である針葉樹林帯に沿って個体数を増加させたことが示唆された。さらに、マイクロサテライト分析により、集団の遺伝的多様性が低下していることを明らかにした。
(4)日本固有種ニホンイタチ、ムササビ、モモンガなどについての分子系統データに基づき、日本列島の生物地理と系統進化を考察した。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 10556074

中国高原・シルクロードに分布する希少ヤマネコ類と大型ネコ類の分子系統進化学的研究
科学研究費助成事業
1998年 - 2000年
増田 隆一, 大泰司 紀之, 大舘 智志, 陳 化鵬, 胡 綿矗, 王 小明, ABDUKADIR Ab
本研究では多様な自然環境を有する中国新彊ウイグル自治区においてヤマネコ類およびそれらが捕食する小型哺乳類の生息・分布調査を行った。3回にわたるフィールド調査を行い、新彊のほぼ全域を踏査した。タリム盆地(新彊南部)では、シルクロード周辺域(天山南路、西域南道)およびタクラマカン砂漠において、ステップヤマネコが生息する自然環境を調査し、この種がおかれている現状を把握した。特に、シルクロード周辺域ではヤマネコが好んで捕食するヤルカンドノウサギの分布密度が高く、ヤマネコの個体数も多いことが推定された。ジュンガル盆地(新彊北部)では、マヌルネコの糞および足跡を発見した。その生息地において小型哺乳類の捕獲調査を行い、オオスナネズミならびにトビネズミ類など乾燥地帯に適応したげっ歯類を捕獲することができた。さらに、標高2千メートルを超える天山山脈において調査を行い、オオヤマネコやユキヒョウなど大型ネコ科の生息地の自然環境を調査した。また、高山地帯に生息するげっ歯類の捕獲調査を行い、盆地内の砂漠とは異なる哺乳類相を確認した。中国側共同研究者を北海道大学へ招聘し、調査成果の議論を行うとともに、日本側研究者が開発したDNA分析技術を伝授した。日本側研究者は、アジア大陸に生息するネコ科のミトコンドリアDNAの遺伝子増幅法の分析技術を確立し、塩基配列の解読および分子系統進化学的解析を進めた。新彊の生態系においてヤマネコ類と競合する食肉目イタチ科についても遺伝子分析を開始し、分子系統学的成果を挙げた。以上の研究成果は、中央アジアの乾燥気候・高地に生息する哺乳類相の進化学的研究をさらに発展させていく基礎データおよび調査経験となった。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 10041149

分子系統解析による日本在来動物種の起源・進化および渡来時期の解明
科学研究費助成事業
1999年 - 1999年
増田 隆一, 天野 哲也
日本産固有種を含む哺乳類の遺伝的な地域変異を分析し、日本列島と大陸における陸橋・海峡の形成史および古環境の変動と比較検討することにより、日本列島における生物地理的歴史を考察することが目的である。本年度は、エゾヒグマ、ニホンジカ、イイズナ、オコジョ、ホンドテン、クロテンを分析対象とした。その結果、動物種毎に独自の渡来の歴史をもっていることが明らかとなった。特に、北海道のエゾヒグマ集団において、ミトコンドリアDNA(mtDNA)のコントロール領域およびチトクロームb遺伝子の塩基配列の分子系統解析により、北海道には3つの遺伝的集団が存在し、それらは道南地方、道北―道央地方、道東地方に分かれて分布することを突き止めた。分子時計により、これら3集団の分岐年代は約30万年以上前と推定され、各々がユーラシア大陸で分岐した後、異なるルートまたは異なる時代に陸橋を経て北海道へ渡来したものと考えられた。大陸産ヒグマ集団と比較することにより、北海道集団の遺伝的特徴は世界のヒグマの分布拡散の歴史を解明する上で重要なポイントになることが示唆された。また、ニホンジカ集団について、mtDNAコントロール領域の分子系統解析を行った結果、北海道―本州集団および九州(その周辺島嶼を含む)集団という大きな2つのグループに分類することができた。その境界は中国地方にあると推定されるが、詳細は現在調査中である。津軽海峡(ブラキストン線)をはさんだ東北地方と北海道との間の遺伝距離は小さく、日本列島全域の個体群を比較した場合、両者は北海道―本州集団に含まれた。今後は他の動物種についても分析を進め、日本列島における哺乳類の生物地理的歴史と日本列島周辺の陸橋・海峡形成史や古環境の変動との関係を明らかにして行く予定である。さらに、上記の現生種のDNA情報をもとに、考古試料の分析も進めていく。
日本学術振興会, 特定領域研究(A), 北海道大学, 11112202

日本列島に生息する二ホンジカの起源と種分化過程の解明
科学研究費助成事業
1997年 - 1998年
大泰司 紀之, 増田 隆一, 玉手 英利
ニホンジカ(Cervus nippon)は、わが国の森林生態系における最も優勢な一次消費者として重要な地位を占めている。本種の系統進化について、分子系統学と形態学の両面から解明を試みた結果、次の点が明らかになった。
日本産ニホンジカはミトコンドリアDNA分析により、中国地方以南西の、四国・九州・対馬・五島列島・屋久島の南西集団と、中国地方以北東の本州・北海道の北東集団に分けられる。中国地方のニホンジカは、広島県・山口県・島根県の個体群が南西集団、兵庫県以西が北東集団に属する。
北海道産亜種;エゾシカは、狩猟および1879年の大雪の影響により、主に3つの集団(阿寒集団・大雪集団・日高集団)を残して一時は絶滅寸前にまで激減した。エゾシカについてD-loop領域の塩基配列の多型を検出した結果、6つのハプロタイプに分けられ、上記3つの集団が針葉樹林帯を経由して分布域を全道に拡大したと考えられた。
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 09839002

イリオモテヤマネコ・ツシマヤマネコの起源・進化の探索と集団内多様性の分子系統解析
科学研究費助成事業
1997年 - 1998年
増田 隆一
本研究の目的は、ミトコンドリアDNAおよび高多型性DNAマーカーを用いて、イリオモテヤマネコ・ツシマヤマネコ集団がこれまでにたどってきた進化の過程と両者の集団内多様度を理解することであった。2年間の計画において、以下の成果が得られた。
(1) ミトコンドリアDNAのなかでも進化速度が速いといわれるD-loop領域を分析した。イリオモテヤマネコに適合するPCRプライマーをデザインし、PCRダイレクトシーケンス法により塩基配列を解読した結果、イリオモテヤマネコ集団内では個体変異が全くみられなかった。
(2) 高多型的マーカーであるマイクロサテライトDNA領域の多型分析により、イリオモテヤマネコ集団およびツシマヤマネコ集団の遺伝的多様性が極度に低下していることが示唆された。この多様性低下は、両集団が島に隔離されていた期間(各々、約20万年、10万年)に起こった遺伝的浮動または近親交配によりもたらされた可能性がある。
(3) 別の高多型的DNAマーカーである主要組織適合遺伝子複合体(MHC)ClassIIのDRB遺伝子について、遺伝子増幅法(PCR)によって対立遺伝子の検出を試みた。PCR産物をクローニングし、塩基配列を決定した結果、イリオモテヤマネコ、ツシマヤマネコ、ベンガルヤマネコから複数の対立遺伝子が得られた。現在、塩基配列の分子系統学的解析を継続している。
(4) 環境庁対馬野生生物保護センターとの研究協力体制を整えると共に、同センターの展示室においてヤマネコのDNA分析に関する展示を行い、研究成果を一般に公開した。
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 09640820

人間との共存をめざした絶滅危惧・希少動物の種保存に関する分子・集団遺伝学的研究
科学研究費助成事業
1997年 - 1997年
増田 隆一
本研究の目的は、野生動物集団における遺伝的多様性の評価法を確立すること、ならびに、人間活動によって絶滅の危機に瀕するに至った動物集団や個体数が激増した動物集団の遺伝的特徴と進化的背景を理解することである。本年は、1.個体数が過度に増加したエゾシカの集団構造、2.人畜への被害をもたらすヒグマの集団構造、3.在来種ニホンイタチと移入種シベリアイタチの遺伝的関係、について分析した。
1.北海道全域におけるエゾシカ集団について、ミトコンドリアDNAの中でも進化速度の速いD-loop領域の塩基配列を分析したところ、6つのタイプを検出することができた。その中でも3つのタイプの頻度が高く、それらの分布は北海道における三大針葉樹林帯の分布とほぼ一致する傾向がみられた。これは、明治時代に絶滅の危機に瀕したエゾシカ集団が、個体数を激増させていったこと(ボトルネック)を反映している。
2.ヒグマについては北海道内において3つの遺伝子系列を把握することができ、それらの分布パターンは北海道の広大な森林分布に一致していたが、エゾシカとは異なり、明瞭な分布境界が認められた。これはヒグマの行動範囲が森林地帯に強く依存していることを反映している。
3.シベリアイタチは、昭和初期に人間によりアジア大陸から持ち込まれたといわれ、北九州・関西などの西日本を中心に野生化(帰化)し、在来種ニホンイタチの生息地を撹乱している。そこで、ミトコンドリアDNAに基づく地域変異を分析し、両イタチを分類する判別法を確立した。さらに、移入種シベリアイタチの多様性の低さからボトルネック効果が示唆された。
日本学術振興会, 重点領域研究, 北海道大学, 09248202

遺伝子分析と形態計測に基づく中国産シカ類全種の起源・進化・系統の解明
科学研究費助成事業
1996年 - 1997年
大泰司 紀之, 梶 光一, 増田 隆一, 玉手 英利, HALIK Mahmut, 顧 濱源, 李 明, 王 小明, 徐 宏発, 盛 和林
本研究の目的は、中国産シカ類全種(約20種)について、分類および分布を明確にすること、および起源・進化・系統を解明することである。
分類について:これまで分布が不明確であったチベット自治区、新彊ウイグル自治区、および東北地方(大・小興安嶺山脈一帯)について、現地踏査により各種シカ類の分布を明確にした。とりわけアルタイ山脈と大興安嶺山脈のヘラジカ、および中国全域のアカシカ各亜種については、今回の調査によって初めてその分布の実際が明らかになった。
比較生態学的知見:アカシカのタリム亜種が砂漠に特殊化していることについて、形態および生態学的に明らかにした。
進化系統学的研究:シカ類各種・各亜種の地域個体群から得られた形態計測値およびDNA分析結果の検討を進めている。これまでに得られた結果は、種のレベルについては、古生物学および現生種の形態学的研究により得られた従来の分類とほぼ一致している。しかし原始的な種であるジャコウジカ、キョンおよびキバノロの分化が従来の説より早いこと、また亜種レベルの分類については再検討が必要であることなどが解ってきた。
調査結果のとりまとめ:クチロジカの新知見を含め、中国に分布するシカ類の概要については、1993年にDeer of Chinaとして本申請人らによりまとめられたが、今回得られた結果については、モノグラフDeer in China(仮題)としてシカ類の進化史を総合的にとりまとめる予定である。
日本学術振興会, 国際学術研究, 北海道大学, 08041131

イリオモテヤマネコ・ツシマヤマネコの進化起源の解明と種内変位の分子系統学的研究
科学研究費助成事業
1996年 - 1996年
増田 隆一
イリオモテヤマネコおよびツシマヤマネコについて,集団内の遺伝的多様性を評価することを試みた.9つのマイクロサテライト座位の対立遺伝子型を遺伝子増幅(PCR)法により検出・決定し,各対立遺伝子の頻度に基づいて集団の遺伝子多様度(ヘテロ接合度)を算出した.その結果,イリオモテヤマネコ集団およびツシマヤマネコ集団では対立遺伝子の種類数と頻度が少なく,特にイリオモテヤマネコ集団ではほとんど多型がみられなかった.それに対し,これらの日本産ヤマネコと遺伝的に近縁なアジア大陸産ベンガルヤマネコ集団内では遺伝子多様度が高かった.さらに,ミトコンドリアDNAの中でも進化速度の速いDループ領域について塩基配列を解析したところ,イリオモテヤマネコ集団内での個体差は検出されなかった.このようなイリオモテヤマネコ集団およびツシマヤマネコ集団における遺伝的多様性の低下は,彼らが西表島・対馬に地理的に隔離(分岐年代はそれぞれ今から約20万年,10万年前であることを昨年までに明らかにした)された後の近交化および遺伝的浮動によるものと考えられている.イリオモテヤマネコにおける極度の多様性の低下は,地理的隔離後の年月がより長いことによるものかもしれない.両島において今後起こり得る自然的・人為的環境変化および病原体の侵入に対して,集団が適応できるかどうかが懸念される.本研究の結果は,今後の両ヤマネコ集団の遺伝的多様性評価を継続すると共に,現在の島の自然環境を十分に保全していく重要性を示唆している.
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 08640877

PCRダイレクトシーケンス法の改良および絶滅種を含む哺乳類進化の分子系統学的解析
科学研究費助成事業
1996年 - 1996年
増田 隆一
本年は,3年間の研究計画の最終年度であり,以下の成果が得られた.
(1)シベリア永久凍士から発掘された約2万5千年前のマンモス組織から,DNA抽出と遺伝子増幅(PCR)に成功した.そして,ミトコンドリアDNAのチトクロームb遺伝子および12SリボソームRNA遺伝子の全領域について,塩基配列を決定することができた.また,現生のアフリカゾウならびにアジアゾウについても同様に塩基配列を決定した.これらの塩基配列に基づき,塩基置換および分子系統樹を検討したところ,上記のゾウ亜科3種はお互いに近いが,マンモスはアジアゾウよりもアフリカゾウにより近縁であることが示唆された.
(2)リス科齧歯類において,ムササビ・モモンガなど被膜をもったグループが単系統群であるかどうかを追及するため,ミトコンドリアDNAのチトクロームb遺伝子ならびに12SリボソームRNA遺伝子領域の分子系統学的解析を行った.その結果、両遺伝子の特徴は共に,被膜をもつムササビ・モモンガのグループが単系統であることを支持した.
(3)ニホンジカについて,D-loop領域の全塩基配列を決定し、その地理的変異を検討した.その結果,偶蹄類の中でもニホンジカに特異的な繰り返し配列を検出した.その繰り返し数はそれぞれの地域に特異的であった.さらに,塩基配列全体の比較により,北日本(北海道,本州を含む)グループと南日本(九州および周辺の島々を含む)グループの間に遺伝的分化があることが明らかになった.また,北海道のニホンジカ集団(エゾシカ)には,少なくとも6つのD-loopタイプが存在し,その分布パターンが北海道における植生と深く関与していることが示唆された.
日本学術振興会, 重点領域研究, 北海道大学, 08257201

人間との共存をめざした絶滅危惧・希少動物の種保存に関する分子・集団遺伝学的研究
科学研究費助成事業
1996年 - 1996年
増田 隆一
(1)絶滅危惧種イリオモテヤマネコおよびツシマヤマネコについて、マイクロサテライトDNAの遺伝子型を決定し、対立遺伝子の頻度から集団の遺伝子多様度(ヘテロ接合度)を算出した。その結果、調べた9種類のマイクロサテライトについて、イリオモテヤマネコ集団およびツシマヤマネコ集団では対立遺伝子の種類と頻度が小さく、特にイリオモテヤマネコ集団ではヘテロ接合度が0であった。それに対し、両ヤマネコと遺伝的に近縁な大陸産ベンガルヤマネコ集団内では遺伝的多様性が大きかった。日本の両ヤマネコ集団における遺伝的多様性の低下は、彼らが島に隔離された後の近交化と遺伝的浮動によるものと考えられるため、今後の環境変化(自然的、人為的)に対する適応力の低下が懸念される。よって本研究の結果は、今後も両ヤマネコ集団の多様性評価を継続すると共に、現在の島の自然環境を保全していく重要性を示唆している。(2)北海道において急増しているエゾシカ集団については、ミトコンドリアDNA D-loop領域の地域変異を検出した。さらに、マイクロサテライト分析により集団内の遺伝子多様度を評価した。マイクロサテライト分析の結果、本州ジカ集団に比べてエゾジカ集団の遺伝的多様性が低いことが明らかとなった。さらに6つのD-loopタイプを検出した。その中で、3つのタイプの頻度が高く、各々のタイプの分布は北海道における主な針葉樹林帯の分布とほぼ一致した。エゾジカは明治時代の大雪により絶滅寸前まで個体数が減少し、その後の保護対策により個体数が回復したことが報告されている。これと本研究結果を統合すると、少なくとも1度は激減した個体群が、冬期の避難所である針葉樹林帯に沿って個体数を回復しながら分布域を拡大し、保護対策(狩猟圧の低下)によって現在の個体数にまで激増したことが示唆された。
日本学術振興会, 重点領域研究, 北海道大学, 08255203

イリオモテヤマネコ・ツシマヤマネコの進化起源の解明と種内変異の分子系統学的研究
科学研究費助成事業
1995年 - 1995年
増田 隆一
イリオモテヤマネコおよびツシマヤマネコのネコ科における系統進化上の位置ならびに進化起源を明らかにするため、ミトコンドリアDNAのチトクロームb遺伝子および12SrRNA遺伝子の塩基配列を決定し、他のヤマネコ類を含むネコ科動物種と分子系統学的に比較解析した。その結果、両ヤマネコはアジア大陸に分布するベンガルヤマネコと遺伝的に極めて近縁であることが明らかとなった。
得られたチトクロームb領域の塩基配列データに基づいて計算したところ、イリオモテヤマネコ‐ベンガルヤマネコ間の分岐年代は約20万年前、ツシマヤマネコ‐ベンガルヤマネコ間の分岐年代は約10万年前と推定された。これらの分岐年代は各々、西表島を含む南西諸島、対馬がアジア大陸から分離した地質年代とほぼ一致した。これらの結果は、イリオモテヤマネコならびにツシマヤマネコが西表島ならびに対馬の島形成時に大陸産ベンガルヤマネコから地理的に隔離された集団であることを強く裏付けている。地理的隔離後、遺伝的浮動により特徴的な形質が各々ヤマネコ集団に固定したものと考えられる。
現在、ミトコンドリアDNAについて集団変異を検索中であるが、これまでに各集団内の個体変異は検出されていない。今後、さらに核DNAも含めて遺伝的多様度を分析していく予定である。
以上の成果については、平成7年度の日本動物学会において口頭発表し、学術専門誌に投稿発表した。
日本学術振興会, 奨励研究(A), 北海道大学, 07740650

PCRダイレクトシーケンス法の改良および絶滅種を含む哺乳類進化の分子系統学的解析--ミトコンドリアDNAおよび核内リボソームDNAの遺伝的分化
科学研究費助成事業
1995年 - 1995年
増田 隆一
(1)わが国に分布する2種のヤマネコの進化・起源を明らかにすることを目的とし、本年度はもう一方のヤマネコであるツシマヤマネコについて分子系統学的解析を行った。ミトコンドリアDNAの12SrRNA遺伝子およびチトクロームb遺伝子の部分領域について塩基配列を決定し、これまでに得られたイリオモテヤマネコならびに他のネコ科動物種のデータと比較解析した結果、ツシマヤマネコはイリオモテヤマネコおよびアジアに広く分布するベンガルヤマネコに極めて近縁であった。塩基置換から推定したツシマヤマネコとベンガルヤマネコの分岐年代は約10万年前と推定され、これは対馬がアジア大陸から分離した地質学的年代とほぼ一致した。以上の結果から、日本産ヤマネコ2者はベンガルヤマネコの地理的隔離集団であることが裏付けられた。
(2)ミトコンドリアDNA内のD-ループ領域の解析を行い、ニホンイタチとシベリアイタチの遺伝的分化が大きいことを確認した。また、屋久島、種子島などの島個体群を含め、ニホンイタチの地域変異を検出した。さらに、韓国から西日本に帰化したと考えられるシベリアイタチは、対馬在来のシベリアイタチよりもやはり韓国産に近縁であることが明らかとなった。
(3)リス科齧歯類において、特有の被膜構造をもつムササビおよびモモンガ類の進化が単系統かあるいは多系統であるかをミトコンドリアDNAの分子系統から検討している。アジアおよび北アメリカに分布する限られた種について、これまでに分析した限りでは、単系統が支持された。今後、さらに分析種数を追加し、ムササビ・モモンガ類の系統進化、ならびに飛躍行動を獲得するに至ったかれらの進化過程を考察する予定である。
日本学術振興会, 重点領域研究, 北海道大学, 07265201

人間との共存をめざした絶滅危惧・希少動物の種保存に関する分子・集団遺伝学的研究
科学研究費助成事業
1995年 - 1995年
増田 隆一
本年度は本研究の第1ステップとして、イリオモテヤマネコ、ツシマヤマネコ、エゾシカの進化遺伝学的分析を中心に行い、保護管理しようとしている動物種が進化上どのような位置にあるのかを理解することに努めた。
(1)イリオモテヤマネコ、ツシマヤマネコについて、各々の集団内におけるミトコンドリアDNA遺伝子(チトクロームb,12SrRNA)の個体変異はみられなかった。ネコ科全体の中で、両ヤマネコは、アジア大陸に広く分布するベンガルヤマネコと極めて近縁であることが明らかとなった。遺伝距離から算出した分岐年代は、イリオモテ-ベンガルヤマネコ間が約20万年前、ツシマ-ベンガルヤマネコ間が約10万年前であり、これらの年代は各々、南西諸島、対馬がアジア大陸から分かれた地質学的年代とほぼ一致した。この結果は、日本産の両ヤマネコの祖先が大陸産ベンガルヤマネコから地理的に隔離された集団であり、各々、島内において独自の進化を遂げながらもいまだに遺伝的に近縁であることを示している。また、両ヤマネコの個体数は各々100頭前後に減少しており、遺伝的にも集団内多様性の低下が示唆された。今後は、個体識別のできるような遺伝子マーカーを開発し、ヤマネコ集団内の変異を詳細に把握していく計画である。
(2)ミトコンドリアDNAにおいて最も変異の大きいD-ループ領域を調べたところ、エゾシカ集団の各個体を4つのタイプに分けることができた。その中で、1つのタイプが北海道の広域に分布していた。このような遺伝子タイプの偏りは、エゾシカ集団が明治時代の大雪と乱獲により個体数が極端に減少し(ボトルネック現象)、ごく最近になって急増したという記録を反映していると思われる。今後、さらに調査個体数と調査地域を拡大し、北海道全域におけるエゾシカの遺伝的特性と個体群の移動経路を分析していく計画である。
日本学術振興会, 重点領域研究, 北海道大学, 07263203

PCRダイレクトシーケンス法の改良および絶滅種を含む哺乳類進化の分子系統学的解析:ミトコンドリアDNAおよび核内リボソームDNAの遺伝的分化
科学研究費助成事業
1994年 - 1994年
増田 隆一
本年度の研究成果は以下の通りである。
1.DNA抽出法およびPCR法を改良・簡略化し、PCRダイレクトシーケンス法の改善化をはかった結果、明瞭なシーケンスデータをより迅速に得ることができるようになった。
2.ネコ科におけるイリオモテヤマネコの進化遺伝学的位置を探究するため、mtDNAの12SrRNA遺伝子およびチトクロームb遺伝子の部分領域について塩基配列を決定し比較解析した結果、イリオモテヤマネコはアジアに広く分布するベンガルヤマネコに極めて近縁であることが明らかになった。塩基置換から推定した両ヤマネコの分岐年代は約20万年前と推定され、これは琉球列島がアジア大陸から分離した地質学的年代とほぼ一致した。
3.日本産を中心とするイタチ科11種においてチトクロームb遺伝子領域の塩基配列を決定し、その系統種間関係を考慮することができた。その中でも、従来、同種(亜種)または別種と議論されてきたニホンイタチとシベリアイタチの間の遺伝的分化が各々の種内変異よりも大きいことが明らかになった。
4.ニホンジカにおける12SrRNA遺伝子およびチトクロームb遺伝子の部分領域ならびにD-loop全塩基配列を決定し、日本列島におけるニホンジカの進化を詳細に考察した。
5.シベリア永久凍土層から発掘された絶滅種マンモス組織(^<14>C年代測定により約9600年前のものと推定)からのDNA抽出とPCR増幅に成功し、チトクロームb、12SrRNAおよび16SrRNAの各遺伝子領域について塩基配列を決定することができた。現在、他のマンモス標本の分析も行いながら現生アジアゾウおよびアフリカゾウと比較し、マンモスの系統進化学的位置の解析を進めている。
日本学術振興会, 重点領域研究, 北海道大学, 06273201

ヒトゲノムのための顕微画像処理システムの開発
科学研究費助成事業
1992年 - 1993年
吉田 廸弘, 山田 道雄, 梅原 千鶴子, 増田 隆一, 阿部 周一
ゲノム解析において遺伝子マッピングは必須のものであり、その手法として蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)法が発展してきた。本研究課題はFISH法によるシグナル検出のための簡便法と染色体マッピングのためのシステム化を目的として下記の項目に重点をおき開発を進めた。
(1)FISH法によるマッピングのための画像処理システムの開発:FISH法によるハイブリッドシグナル検出をする上で、染色体上の微細な蛍光シグナル像を得るために高感度カメラによるシグナル取込とそれを解析するソフトの開発・改良を行った。
(2)複数遺伝子の同時マッピング法の開発:複数個の遺伝子をそれぞれ異なった蛍光色素で標識し、同一染色体標本に同時にin situハイブリダイゼーションを行うことにより、それらの遺伝子を同時に同一分裂中期像でマップすることが可能である。そのために蛍光フィルターの選択とそれぞれ色調の異なるシグナルの検出に要する画像解析のソフト開発に重点をおき実用性をめざした。
この申請課題を遂行中に微弱な蛍光シグナルの検出用の新たなCCDカメラが数社から販売されてきた。いずれも性能がよいが高価であり、操作が複雑なことで一般的ではない。ここではFISH法を広く普及させるという目的のために、従来使用している顕微鏡に比較的低価格の高感度カメラと市販のパーソナルコンピュータを組み合わせて染色体マッピング用の画像解析を行うシステムを開発したものであり一応の成功をみたものと思われる。
日本学術振興会, 試験研究(B), 北海道大学, 04557119

遺伝性肝炎発症LECラットを用いたウイルソン病解明へのアプローチ
科学研究費助成事業
1991年 - 1993年
吉田 廸弘, 梅原 千鶴子, 増田 隆一, 阿部 周一
肝炎発症LECラットの種々の症状がウイルソン病でみられる肝炎の所見と極めて高い類似性を示すことから,LECラットはウイルソン病(WD)のモデルとして注目されている。LECラットの肝炎遺伝子htsがWD遺伝子と相同性があるのかなど、LECラットからhtsを単離しLECラットの肝炎発症機構を解明するとともにWDの解明を目指した。
1)肝炎遺伝子htsとの連鎖分析を各染色体のミニサテライトDNAマーカー、ESD、RB1を用いて分析したが、いずれもhtsとの明確な連鎖が得られなかった。
2)セルロプラスミン(CP)活性低下についてLECラットのCP遺伝子を単離しその遺伝子構造を調べたが、CP活性低下をもたらす遺伝子変化は認められなかった。
3)極く最近WD遺伝子が単離されたので、この塩基配列をもとにプローブをつくり、baskcrossラットにおける連鎖分析を行った。その結果、WDはLECの肝炎のみならず、銅蓄積、CP活性低下のいずれともと連鎖しており、htsと同一と考えられる。これをもとに、ラットWD遺伝子の構造や機能を分析中である。
日本学術振興会, 一般研究(B), 北海道大学, 03454499

近交系ラットにおける高多型性DNAマーカーの開発ならびにリンケージ解析への応用
科学研究費助成事業
1992年 - 1992年
増田 隆一
日本学術振興会, 奨励研究(A), 北海道大学, 04858009

動物地理学入門ーーヒグマと多様な動物のはるかな旅　　　　　　　　　　　　　　　
2023年04月 - 2023年07月
講師
その他
道新文化センター

“クマ送りとヒグマ”．NHKカルチャー・オンデマンド教養シリーズ「日本列島人の起源と歴史 2021」（オンデマンド）　　　　　　　　　　　　　　　
2021年09月
講師
その他
NHK文化センター名古屋教室

"遺伝子・動物地理学からヒグマをみる" 「ヒグマを通してみる北海道の自然と歴史」　　　　　　　　　　　　　　　
2007年04月14日
講師
その他
道新文化センター

"ヒグマの進化" 「ヒグマ学入門I—ヒグマの生態」　　　　　　　　　　　　　　　
2005年06月07日
講師
その他
朝日カルチャーセンター