Spatial Segregation of Adult Aquatic Insects From the Water Surface to the Riparian Canopy in a Lowland River
T. Nakagawa, J. N. Negishi, S. Yamashita, M. K. Alam, J. Wu
Freshwater Biology, 70, 12, Wiley, 2025年12月19日
研究論文（学術雑誌）, ABSTRACT

Knowledge of how aquatic insects use riparian zones can inform the conservation and management of both rivers and riparian zones. This study reports the habitat use and spatial segregation of winged EPT (Ephemeroptera, Plecoptera, Trichoptera) adults in the river channel and riparian zone of the gravel‐bed Satsunai River in Hokkaido, northern Japan.

Adult insects were caught using sticky and Malaise traps in the summer of 2019 and 2020. The relative use of forest‐covered and gravel‐covered riparian zones and their edge habitats was examined in relation to above‐water space. Furthermore, the habitat use of the natural forest‐covered riparian zone in two dimensions (i.e., lateral and vertical over 104 and 18 m, respectively) was measured.

Ephemeroptera were largely captured above the river channel and showed no preference for forest‐covered or gravel‐covered riparian habitats. In contrast, Plecoptera were caught primarily in the forest‐covered riparian zone. Capture of Trichoptera was moderately higher along the edge of the forest‐covered riparian zone, representing an intermediate response.

We identified clear spatial segregation of EPT taxa in lateral and vertical dimensions. Most individuals were caught > 5 m above the ground in forest strata and < 30 m from the channel laterally. At the family level, Plecoptera taxa (Nemouridae and Chloroperlidae) occurred at the medium and lowest height in the vertical dimension. In particular, the numerically dominant Plecoptera family, Chloroperlidae, was most frequently found near the ground (< 5 m height), and was also distributed furthest from the stream (40 m). Other Trichoptera families such as Philopotamidae were found within relatively short distances from the channel.

Riparian zones can provide preferable habitat for some EPT adults, with their structural and microclimatic diversity influencing taxon‐specific two‐dimensional distributions. Identification of taxa with high abundance, ease of observation, and laterally extensive use of riparian zones as a useful candidate indicator, in our case Chloroperlidae, could enable the assessment of ecosystem status in the river–riparian continuum and its responses to landscape changes in gravel‐bed river corridors.

Flood-induced sediment deposition drives rapid invertebrate colonization of the hyporheic zone in a point bar
Junjiro Negishi
Limnology, 26, 3, 407, 416, Springer Science and Business Media LLC, 2025年04月18日, ［査読有り］, ［筆頭著者］
研究論文（学術雑誌）

Positive Feedback on Climate Warming by Stream Microbial Decomposers Indicated by a Global Space‐For‐Time Substitution Study
Javier Pérez, Luz Boyero, Richard G. Pearson, Mark O. Gessner, Alan Tonin, Naiara López‐Rojo, Juan Rubio‐Ríos, Francisco Correa‐Araneda, Alberto Alonso, Aydeé Cornejo, Ricardo J. Albariño, Sankarappan Anbalagan, Leon A. Barmuta, Andrew J. Boulton, Francis J. Burdon, Adriano Caliman, Marcos Callisto, Ian C. Campbell, Bradley J. Cardinale, Luciana S. Carneiro, J. Jesús Casas, Ana M. Chará‐Serna, Eric Chauvet, Checo Colón‐Gaud, Aaron M. Davis, Elvira de Eyto, Monika Degebrodt, María E. Díaz, Michael M. Douglas, Andrea C. Encalada, Ricardo Figueroa, Alexander S. Flecker, Tadeusz Fleituch, André Frainer, Erica A. García, Gabriela García, Pavel E. García, Paul S. Giller, Jesús E. Gómez, Jose F. Gonçalves, Manuel A. S. Graça, Robert O. Hall, Neusa Hamada, Luiz U. Hepp, Cang Hui, Daichi Imazawa, Tomoya Iwata, Edson S. A. Junior, Andrea Landeira‐Dabarca, María Leal, Kaisa Lehosmaa, Charles M. M'Erimba, Richard Marchant, Renato T. Martins, Frank O. Masese, Megan Maul, Brendan G. McKie, Adriana O. Medeiros, Jen A. Middleton, Timo Muotka, Junjiro N. Negishi, Alonso Ramírez, Renan S. Rezende, John S. Richardson, José Rincón, Claudia Serrano, Angela R. Shaffer, Fran Sheldon, Christopher M. Swan, Nathalie S. D. Tenkiano, Scott D. Tiegs, Janine R. Tolod, Michael Vernasky, Elizabeth W. Wanderi, Anne Watson, Catherine M. Yule
Global Change Biology, 31, 4, Wiley, 2025年04月05日, ［査読有り］
研究論文（学術雑誌）, ABSTRACT

Decomposition of plant litter is a key ecological process in streams, whose contribution to the global carbon cycle is large relative to their extent on Earth. We examined the mechanisms underlying the temperature sensitivity (TS) of instream decomposition and forecast effects of climate warming on this process. Comparing data from 41 globally distributed sites, we assessed the TS of microbial and total decomposition using litter of nine plant species combined in six mixtures. Microbial decomposition conformed to the metabolic theory of ecology and its TS was consistently higher than that of total decomposition, which was higher than found previously. Litter quality influenced the difference between microbial and total decomposition, with total decomposition of more recalcitrant litter being more sensitive to temperature. Our projections suggest that (i) warming will enhance the microbial contribution to decomposition, increasing CO₂ outgassing and intensifying the warming trend, especially in colder regions; and (ii) riparian species composition will have a major influence on this process.

Hydrological Connectivity and Local Environment Alternately Drive Spatial Structure of Floodplain Aquatic Community Across Seasons
Hiromi Uno, Shunsuke Utsumi, Kentaro Morita, Osamu Kishida, Md. Khorshed Alam, Junjiro Negishi
Ecology and Evolution, 15, 2, Wiley, 2025年02月24日
研究論文（学術雑誌）, ABSTRACT

Seasonal changes in the environment often strongly influence biological communities. In environmental transition zones, or ecotones, the environment fluctuates over time between two different types of environments and the seasonal change is more pronounced. Although emphasis has been placed on the spatial variation of biota along environmental gradients, seasonal change has not been well studied despite the seasonal nature of many ecotones. In this study, we investigated seasonal shifts in aquatic community structures of floodplain waterbodies characterised as transitions between lotic and lentic environments, and further investigated the biological processes behind the shift. We observed a clear seasonal shift of community structure in floodplain waterbodies. From the spring snowmelt season to the summer low flow season, the aquatic community structure was largely driven by the hydrological connectivity to the river, represented as the timing of the lotic–lentic transition during the seasonal flood recession. In contrast, after a few months of summer low flow period, the effect weakened over time, and the communities were structured based more on the basis of the local environment. The seasonal shift was largely explained by the change in amphibian and aquatic insect larvae, the main members of the floodplain aquatic assemblage, which metamorphose and emerge from the water during the summer period and then redistribute in different ways more strongly influenced by local environmental factors such as water body size, temperature and dissolved oxygen levels. Given that biota in ecotones occupy the habitat for a limited time due to the severe environmental fluctuations, such seasonal changes as we observed in this study may be widespread in ecotones. Landscape and local environmental conditions could alternately shape community structures in different seasons. Further attention to the temporal aspects of community structure is needed for community studies and for conservation.

The influences of anthropogenic modification after the Great East Japan Earthquake on ground insects and their relationship with vegetation
Hinata Okoshi, Hajime Matsushima, Junjiro N. Negishi, Masahiro Ohara, Yoshihiko Hirabuki, Takahide Kurosawa, Haruko Ueno
Coastal Engineering Journal, 67, 63, 80, 2025年01月02日, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Effects of polluted groundwater on chum salmon (Oncorhynchus keta) survival and body size
Shohei Yamashita, Junjiro N. Negishi, Tomohiro Nakagawa, Nozomi Aruga, Kazuhiro Toyoda, Futoshi Nakamura
Environmental Pollution, 125101, 125101, Elsevier BV, 2024年10月
研究論文（学術雑誌）

Human activities shape global patterns of decomposition rates in rivers
S. D. Tiegs, K. A. Capps, D. M. Costello, J. P. Schmidt, C. J. Patrick, J. J. Follstad Shah, C. J. LeRoy, Vicenç Acuña, Ricardo Albariño, Daniel C. Allen, Cecilia Alonso, Patricio Andino, Clay Arango, Jukka Aroviita, Marcus V.M. Barbosa, Leon A. Barmuta, Colden Baxter, Brent Bellinger, Luz Boyero, Lyubov Bragina, Lee E. Brown, Andreas Bruder, Denise A. Bruesewitz, Francis Burdon, Marcos Callisto, Antonio Camacho, Cristina Canhoto, María M. Castillo, Eric Chauvet, Joanne Clapcott, Fanny Colas, Checo Colón-Gaud, Julien Cornut, Verónica Crespo-Pérez, Wyatt F. Cross, Joseph Culp, Michael Danger, Olivier Dangles, Elvira de Eyto, Alison M. Derry, Veronica Díaz Villanueva, Michael M. Douglas, Arturo Elosegi, Andrea C. Encalada, Sally Entrekin, Rodrigo Espinosa, Verónica Ferreira, Carmen Ferriol, Kyla M. Flanagan, Alexander S. Flecker, Tadeusz Fleituch, André Frainer, Nikolai Friberg, Paul C. Frost, Erica A. Garcia, Liliana García-Lago, Pavel Ernesto García Soto, Mark O. Gessner, Sudeep Ghate, Darren P. Giling, Alan Gilmer, José Francisco Gonçalves, Rosario Karina Gonzales, Manuel A.S. Graça, Mike Grace, Natalie A. Griffiths, Hans-Peter Grossart, François Guérold, Vlad Gulis, Pablo E. Gutiérrez-Fonseca, Luiz U. Hepp, Scott Higgins, Takuo Hishi, Joseph Huddart, John Hudson, Moss Imberger, Carlos Iñiguez-Armijos, Mark W. Isken, Tomoya Iwata, David J. Janetski, Andrea E. Kirkwood, Aaron A. Koning, Sarian Kosten, Kevin A. Kuehn, Hjalmar Laudon, Peter R. Leavitt, Aurea L Lemes da Silva, Shawn Leroux, Peter J. Lisi, Richard MacKenzie, Amy M. Marcarelli, Frank O. Masese, Peter B. McIntyre, Brendan G. McKie, Adriana Medeiros, Kristian Meissner, Marko Miliša, Shailendra Mishra, Yo Miyake, Ashley Moerke, Shorok Mombrikotb, Rob Mooney, Timothy Moulton, Timo Muotka, Junjiro Negishi, Vinicius Neres-Lima, Mika L. Nieminen, Jorge Nimptsch, Jakub Ondruch, Riku Paavola, Isabel Pardo, Edwin T.H.M. Peeters, Jesus Pozo, Aaron Prussian, Estefania Quenta, Brian Reid, John S. Richardson, Anna Rigosi, José Rincón, Geta Risnoveanu, Christopher T. Robinson, Lorena Rodríguez-Gallego, Todd V. Royer, James A. Rusak, Anna C. Santamans, Géza B. Selmeczy, Gelas Simiyu, Agnija Skuja, Jerzy Smykla, Ryan Sponseller, Kandikere R. Sridhar, Aaron Stoler, Christopher M. Swan, Franco Teixeira de Mello, Jonathan D. Tonkin, Sari Uusheimo, Allison M. Veach, Sirje Vilbaste, Lena B.-M. Vought, Chiao-Ping Wang, Jackson R. Webster, Paul B. Wilson, Stefan Woelfl, Guy Woodward, Marguerite A. Xenopoulos, Adam G. Yates, Chihiro Yoshimura, Catherine M. Yule, Yixin Zhang, Jacob A. Zwart
Science, 384, 6701, 1191, 1195, American Association for the Advancement of Science (AAAS), 2024年06月14日
研究論文（学術雑誌）, Rivers and streams contribute to global carbon cycling by decomposing immense quantities of terrestrial plant matter. However, decomposition rates are highly variable and large-scale patterns and drivers of this process remain poorly understood. Using a cellulose-based assay to reflect the primary constituent of plant detritus, we generated a predictive model (81% variance explained) for cellulose decomposition rates across 514 globally distributed streams. A large number of variables were important for predicting decomposition, highlighting the complexity of this process at the global scale. Predicted cellulose decomposition rates, when combined with genus-level litter quality attributes, explain published leaf litter decomposition rates with high accuracy (70% variance explained). Our global map provides estimates of rates across vast understudied areas of Earth and reveals rapid decomposition across continental-scale areas dominated by human activities.

Native fish assemblages in natural lakes across Japan: Endemism deterioration lasting centuries
Bingguo Dai, Shin ichiro S. Matsuzaki, Junjiro N. Negishi, Zhijun Xia, Md Khorshed Alam, Zhongguan Jiang
Diversity and Distributions, 30, 6, 2024年06月
研究論文（学術雑誌）

Redescription of Utaperla orientalis (Plecoptera, Chroloperlidae) from Hokkaido: the first record of a Utaperla stonefly in Japan
Gyo Yoshinari, Kazuhisa Inada, Masaki Takenaka, Koji Tojo, Junjiro N. Negishi
Limnology, 2024年
研究論文（学術雑誌）

Tributary mitigates river discontinuity by dam depending on the distance from dam to the tributary confluence
Izumi Katano, Hideyuki Doi, Junjiro N. Negishi, Tomoko Minagawa, Yuichi Kayaba
River Research and Applications, 1, 14, 2023年11月, ［査読有り］
英語

Habitat aging and degradation in terrestrialized floodplains: a need to rejuvenate processes for sustaining freshwater mussel populations
Shigeya Nagayama, Morihiro Harada, Junjiro N. Negishi, Jyun-ichi Kitamura, Terutaka Mori, Seiichi Mori
Restoration Ecology, 2023年10月25日, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Recruitment status and host-fish-limitation threats to endangered freshwater pearl mussel (Margaritifera laevis) in eastern Hokkaido, northern Japan
Kazuki Miura, Nobuo Ishiyama, Junjiro N. Negishi, Keita Kawajiri, Hokuto Izumi, Daisetsu Ito, Futoshi Nakamura
Cold Spring Harbor Laboratory, 2023年05月22日
Abstract

Recruitment failure is a major threat to freshwater mussel (Order Unionoida) populations worldwide. Assessments of the recruitment status and determining the bottleneck factors of mussel recruitment are crucial for preventing future declines in mussel populations. In this study, we investigated the recruitment status (i.e., size structure and the proportion of juveniles within a population) of the endangered freshwater pearl musselMargaritifera laevisin 22 rivers in eastern Hokkaido, northern Japan. We also quantified the density of the host fishOncorhynchus masou masouand examined the relationship between the proportion of juveniles and host-fish density to assess host-limitation threats toM. laevisrecruitment. Our assessments showed that 13 (59.1%) rivers had no signs of recent recruitment within 10 years, with a low mean proportion of juveniles (mean:0.02 [range:0.00–0.09] fraction), indicating that these populations are threatened by sustained recruitment failure. The proportion of juveniles was positively associated with host-fish density, suggesting that host-fish limitation could be a bottleneck factor forM. laevisrecruitment. These results highlight the urgent need for prompt conservation measures, including the enhancement of host-fish availability, to sustainM. laevispopulations in the study region.

Geology‐Climate Interactions are Key Determinants of Climate‐Change Refugia in Japanese Mountain Streams
Nobuo Ishiyama, Masanao Sueyoshi, Jorge García Molinos, Kenta Iwasaki, Junjiro N. Negishi, Itsuro Koizumi, Shigeya Nagayama, Akiko Nagasaka, Yu Nagasaka, Futoshi Nakamura
The Bulletin of the Ecological Society of America, Wiley, 2023年03月15日
研究論文（学術雑誌）

Underlying geology and climate interactively shape climate change refugia in mountain streams
Nobuo Ishiyama, Masanao Sueyoshi, Jorge García Molinos, Kenta Iwasaki, Junjiro N. Negishi, Itsuro Koizumi, Shigeya Nagayama, Akiko Nagasaka, Yu Nagasaka, Futoshi Nakamura
Ecological Monographs, 93, 2, Wiley, 2023年02月16日
研究論文（学術雑誌）

Non-native fish species expand tacitly but rapidly toward upstream oxbow lakes along the longitudinal gradient
Bingguo Dai, Junjiro N. Negishi, Kazuya Fujii, Md Khorshed Alam, Zhongguan Jiang
NeoBiota, 85, 101, 123, 2023年
研究論文（学術雑誌）

Application of eDNA methods to evaluate abundance and reproduction of winter-breeding freshwater mussels (Buldowskia iwakawai) in the Ishikari River floodplain
J. Wu, J. N. Negishi, H. Izumi, T. Kanbe, H. Mizumoto, H. Araki
Hydrobiologia, 2023年
研究論文（学術雑誌）

Contrasting seasonality of 137Cs concentrations in two stream animals that share a trophic niche
Masaru Sakai, Yumiko Ishii, Hideki Tsuji, Asuka Tanaka, Jaeick Jo, Junjiro N. Negishi, Seiji Hayashi
Environmental Pollution, 315, 120474, 120474, Elsevier BV, 2022年12月
研究論文（学術雑誌）

Three years in the dark: life history and trophic traits of the hyporheic stonefly, Alloperla ishikariana Kohno, 1953 (Plecoptera, Chloroperlidae)
J. N. Negishi, M. K. Alam, M. A. T. M. T. Rahman, R. Kawanishi, H. Uno, G. Yoshinari, K. Tojo
Hydrobiologia, 849, 19, 4203, 4219, Springer Science and Business Media LLC, 2022年11月
研究論文（学術雑誌）

Catchment geology preconditions spatio-temporal heterogeneity of ecosystem functioning in forested headwater streams
Janine Rodulfo Tolod, Junjiro N. Negishi, Nobuo Ishiyama, Md. Khorshed Alam, Mirza A. T. M. Tanvir Rahman, Pongpet Pongsivapai, Yiyang Gao, Masanao Sueyoshi, Futoshi Nakamura
Hydrobiologia, 2022年09月07日
研究論文（学術雑誌）

Disturbance legacy of a 100-year flood event: large wood accelerates plant diversity resilience on gravel-bed rivers
Kei Uchida, Azumi Okazaki, Takumi Akasaka, Junjiro N. Negishi, Futoshi Nakamura
Journal of Environmental Management, 317, 115467, 115467, Elsevier BV, 2022年09月
研究論文（学術雑誌）

Effects of sediment replenishment on riverbed environments and macroinvertebrate assemblages downstream of a dam
Izumi Katano, Junjiro N. Negishi, Tomoko Minagawa, Hideyuki Doi, Yôichi Kawaguchi, Yuichi Kayaba
Scientific Reports, 11, 1, 7525, 7525, 2021年12月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Impacts of detritivore diversity loss on instream decomposition are greatest in the tropics
Luz Boyero, Naiara López-Rojo, Alan M. Tonin, Javier Pérez, Francisco Correa-Araneda, Richard G. Pearson, Jaime Bosch, Ricardo J. Albariño, Sankarappan Anbalagan, Leon A. Barmuta, Ana Basaguren, Francis J. Burdon, Adriano Caliman, Marcos Callisto, Adolfo R. Calor, Ian C. Campbell, Bradley J. Cardinale, J. Jesús Casas, Ana M. Chará-Serna, Eric Chauvet, Szymon Ciapała, Checo Colón-Gaud, Aydeé Cornejo, Aaron M. Davis, Monika Degebrodt, Emerson S. Dias, María E. Díaz, Michael M. Douglas, Andrea C. Encalada, Ricardo Figueroa, Alexander S. Flecker, Tadeusz Fleituch, Erica A. García, Gabriela García, Pavel E. García, Mark O. Gessner, Jesús E. Gómez, Sergio Gómez, Jose F. Gonçalves, Manuel A.S. Graça, Daniel C. Gwinn, Robert O. Hall, Neusa Hamada, Cang Hui, Daichi Imazawa, Tomoya Iwata, Samuel K. Kariuki, Andrea Landeira-Dabarca, Kelsey Laymon, María Leal, Richard Marchant, Renato T. Martins, Frank O. Masese, Megan Maul, Brendan G. McKie, Adriana O. Medeiros, Charles M.M’ Erimba, Jen A. Middleton, Silvia Monroy, Timo Muotka, Junjiro N. Negishi, Alonso Ramírez, John S. Richardson, José Rincón, Juan Rubio-Ríos, Gisele M. dos Santos, Romain Sarremejane, Fran Sheldon, Augustine Sitati, Nathalie S.D. Tenkiano, Scott D. Tiegs, Janine R. Tolod, Michael Venarsky, Anne Watson, Catherine M. Yule
Nature Communications, 12, 1, 3700, 3700, 2021年12月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Exceptional color preferences for flying adult aquatic insects
Junjiro N. Negishi, Tomohiro Nakagawa, Futoshi Nakamura
Aquatic Ecology, 56, 1, 325, 330, 2021年10月13日, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

The effects of endangered freshwater pearl mussels on channel morphology and flow in a low-gradient sandy river
Kazuki Miura, Nozomi Watanabe, Yuuka Takagi, Nobuo Ishiyama, Junjiro N. Negishi
Hydrobiologia, Springer Science and Business Media LLC, 2021年10月05日, ［査読有り］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Multiple stressors and recruitment failure of long-lived endangered freshwater mussels with a complex life cycle
Kazuki Miura, Nobuo Ishiyama, Junjiro N. Negishi, Daisetsu Ito, Keita Kawajiri, Hokuto Izumi, Takahiro Inoue, Masahiro Nakaoka, Futoshi Nakamura
Cold Spring Harbor Laboratory, 2021年09月23日
Multiple stressors can interactively affect the population of organisms; however, the process by which they affect recruitment efficiency remains unclear for empirical populations. Recruitment efficiency can be regulated at multiple stages of life, particularly in organisms with complex life cycles. Understanding the interactive effects of multiple stressors on recruitment efficiency and determining the bottleneck life stages is imperative for species conservation.

The proportion of <20-year-old juveniles of the endangered freshwater pearl mussel Margaritifera togakushiensis, which has an obligate parasitic larval stage, was investigated in 24 rivers from eastern Hokkaido, northern Japan to reveal the influence of nutrients, fine sediment, and their combined effects on juvenile recruitment efficiency. The following indices for recruitment at adult, parasitic, and post-parasitic juvenile stages were obtained from 11 of these rivers: gravid female density, glochidia density (the number of glochidia infections per stream area), and juvenile survival rate. This study explored the bottleneck stages of recruitment efficiency and the interactive effects of the two stressors on these stages.

Twenty-four population status assessments determined that the proportion of juveniles ranged from 0.00 to 0.53, and juveniles were absent from four rivers. The results showed that the parasitic and post-parasitic juvenile stages were bottlenecks for recruitment efficiency. Juvenile survival rates had a more significant positive effect on recruitment efficiency in rivers with a high glochidia density. Juvenile survival rate was decreased by the synergistic interaction of nutrients and fine sediment, although factors limiting glochidia density were not found.

The nutrient concentration of rivers in the study region was well explained by the proportion of agricultural land cover and urban areas in the watersheds, but no relationship was detected between fine sediment abundance and land use.

This study suggests that nutrient management at a catchment scale can be effective for re-establishing the recruitment of M. togakushiensis, particularly in rivers with a high content of fine sediments. The results also emphasise the importance of considering both parasitic and post-parasitic juvenile stages of mussels to maximise the positive effects of stressor mitigation.

Testing local adaptations of affiliate freshwater pearl mussel, Margaritifera laevis, to its host fish, Oncorhynchus masou masou
Hitoshi Kitaichi, Junjiro N. Negishi, Daisetsu Ito, Kazuki Miura, Hirokazu Urabe
Ecological Research, 36, 5, 803, 814, 2021年09月, ［査読有り］, ［責任著者］
研究論文（学術雑誌）

Seasonal variations of Cs-137 concentration in freshwater charr through uptake and metabolism in 1-2 years after the Fukushima accident
Kengo Okada, Masaru Sakai, Takashi Gomi, Aimu Iwamoto, Junjiro N. Negishi, Masanori Nunokawa
ECOLOGICAL RESEARCH, 2021年09月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Lateral and longitudinal flight dispersals of a stonefly, Alloperla ishikariana (Plecoptera, Chloroperlidae), from the hyporheic zone in a gravel-bed river in Japan
Mirza A. T. M. Tanvir Rahman, Junjiro N. Negishi, Md. Khorshed Alam, Gao Yiyang, Janine Rodulfo Tolod, Pongpet Pongsivapai
LIMNOLOGICA, 89, 2021年07月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Additive effects of sediment and nutrient on leaf litter decomposition and macroinvertebrates in hyporheic zone
Md Khorshed Alam, Junjiro N. Negishi, Pongpet Pongsivapai, Shohei Yamashita, Tomohiro Nakagawa
Water (Switzerland), 13, 10, 2021年05月02日, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Estimates of resource transfer via winged adult insects from the hyporheic zone in a gravel-bed river
Mirza A. T. M. Tanvir Rahman, Junjiro N. Negishi, Takumi Akasaka, Futoshi Nakamura
ECOLOGY AND EVOLUTION, 11, 9, 4656, 4669, 2021年05月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Latitude dictates plant diversity effects on instream decomposition
Luz Boyero, Javier Pérez, Naiara López-Rojo, Alan M. Tonin, Francisco Correa-Araneda, Richard G. Pearson, Jaime Bosch, Ricardo J. Albariño, Sankarappan Anbalagan, Leon A. Barmuta, Leah Beesley, Francis J. Burdon, Adriano Caliman, Marcos Callisto, Ian C. Campbell, Bradley J. Cardinale, J. Jesús Casas, Ana M. Chará-Serna, Szymon Ciapała, Eric Chauvet, Checo Colón-Gaud, Aydeé Cornejo, Aaron M. Davis, Monika Degebrodt, Emerson S. Dias, María E. Díaz, Michael M. Douglas, Arturo Elosegi, Andrea C. Encalada, Elvira De Eyto, Ricardo Figueroa, Alexander S. Flecker, Tadeusz Fleituch, André Frainer, Juliana S. França, Erica A. García, Gabriela García, Pavel García, Mark O. Gessner, Paul S. Giller, Jesús E. Gómez, Sergio Gómez, Jose F. Gonçalves, Manuel A.S. Graça, Robert O. Hall, Neusa Hamada, Luiz U. Hepp, Cang Hui, Daichi Imazawa, Tomoya Iwata, Edson S.A. Junior, Samuel Kariuki, Andrea Landeira-Dabarca, María Leal, Kaisa Lehosmaa, Charles M’Erimba, Richard Marchant, Renato T. Martins, Frank O. Masese, Megan Camden, Brendan G. McKie, Adriana O. Medeiros, Jen A. Middleton, Timo Muotka, Junjiro N. Negishi, Jesús Pozo, Alonso Ramírez, Renan S. Rezende, John S. Richardson, José Rincón, Juan Rubio-Ríos, Claudia Serrano, Angela R. Shaffer, Fran Sheldon, Christopher M. Swan, Nathalie S.D. Tenkiano, Scott D. Tiegs, Janine R. Tolod, Michael Vernasky, Anne Watson, Mourine J. Yegon, Catherine M. Yule
Science Advances, 7, 13, 2021年03月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Morphometry-Driven Divergence in Decadal Changes of Sediment Property in Floodplain Water Bodies
Pongpet Pongsivapai, Junjiro N. Negishi, Hokuto Izumi, Paolo A. Garrido, Kanta Kuramochi
WATER, 13, 4, 2021年02月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Stable isotope ratios of emergent adult aquatic insects can be used as indicators of water pollution in the hyporheic food web
Md Khorshed Alam, Junjiro N. Negishi, Mirza A.T.M.Tanvir Rahman, Janine Rodulfo Tolod
Ecological Indicators, 118, 2020年11月, ［責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Restoration of the shifting mosaic of floodplain forests under a flow regime altered by a dam
Futoshi Nakamura, Yasuharu Watanabe, Junjiro Negishi, Takumi Akasaka, Yuki Yabuhara, Akira Terui, Satoshi Yamanaka, Miwa Konno
Ecological Engineering, 157, 2020年10月01日, ［査読有り］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

石狩川氾濫原水域におけるイシガイ目二枚貝の生息分布と生活史特性
泉北斗, 根岸淳二郎, 三浦一輝, 伊藤大雪, PONGSIVAPAI Pongpet
応用生態工学, 23, 1, 1, 20, 2020年09月28日, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際共著］, ［国内誌］
研究論文（学術雑誌）

Contribution of small isolated habitats in creating refuges from biological invasions along a geomorphological gradient of floodplain waterbodies
Nobuo Ishiyama, Kazuki Miura, Satoshi Yamanaka, Junjiro N. Negishi, Futoshi Nakamura
Journal of Applied Ecology, 57, 3, 548, 558, 2020年03月01日, ［査読有り］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Estimating native and invasive crayfish distributions in relation to culvert barriers with environmental DNA
Kousuke Ikeda, Hideyuki Doi, Shigeharu Terui, Atsuko Kato, Takashi Mitsuzuka, Tadashi Kawai, Junjiro N. Negishi
Freshwater Science, 38, 3, 629, 641, 2019年09月01日, ［査読有り］, ［最終著者］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Simple nonlethal identification criteria for two endangered freshwater pearl mussels, Margaritifera laevis and Margaritifera togakushiensis, in Hokkaido, northern Japan
Kazuki Miura, Nobuo Ishiyama, Keita Kawajiri, Keisuke Atsumi, Michikusa Tachibana, Yu Nagasaka, Yoshiyasu Machida, Gao Yiyang, Junjiro N. Negishi, Itsuro Koizumi, Futoshi Nakamura
Ecological Research, 34, 5, 667, 677, 2019年09月01日, ［査読有り］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Coupled benthic-hyporheic responses of macroinvertebrates to surface water pollution in a gravel-bed river
Junjiro N. Negishi, Aiko Hibino, Kazuki Miura, Ryota Kawanishi, Nozomi Watanabe, Kazuhiro Toyoda
FRESHWATER SCIENCE, 38, 3, 591, 604, 2019年09月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

High resilience of aquatic community to a 100-year flood in a gravel-bed river
Junjiro N. Negishi, Akira Terui, Badrun Nessa, Kazuki Miura, Takeaki Oiso, Keizo Sumitomo, Tomoko Kyuka, Mitsuaki Yonemoto, Futoshi Nakamura
LANDSCAPE AND ECOLOGICAL ENGINEERING, 15, 2, 143, 154, 2019年04月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Ecological resilience of ecosystems to human impacts: resilience of plants and animals
Junko Morimoto, Junjiro Negishi
Landscape and Ecological Engineering, 15, 2, 131, 132, 2019年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Research priorities for freshwater mussel conservation assessment
Noé Ferreira-Rodríguez, Yoshihiro B. Akiyama, Olga V. Aksenova, Rafael Araujo, M. Christopher Barnhart, Yulia V. Bespalaya, Arthur E. Bogan, Ivan N. Bolotov, Prem B. Budha, Cristhian Clavijo, Susan J. Clearwater, Gustavo Darrigran, Van Tu Do, Karel Douda, Elsa Froufe, Clemens Gumpinger, Lennart Henrikson, Chris L. Humphrey, Nathan A. Johnson, Olga Klishko, Michael W. Klunzinger, Satit Kovitvadhi, Uthaiwan Kovitvadhi, Jasna Lajtner, Manuel Lopes-Lima, Evelyn A. Moorkens, Shigeya Nagayama, Karl-Otto Nagel, Mitsunori Nakano, Junjiro N. Negishi, Paz Ondina, Panu Oulasvirta, Vincent Prié, Nicoletta Riccardi, Mudīte Rudzīte, Fran Sheldon, Ronaldo Sousa, David L. Strayer, Motoi Takeuchi, Jouni Taskinen, Amilcar Teixeira, Jeremy S. Tiemann, Maria Urbańska, Simone Varandas, Maxim V. Vinarski, Barry J. Wicklow, Tadeusz Zając, Caryn C. Vaughn
Biological Conservation, 231, 77, 87, Elsevier BV, 2019年03月, ［査読有り］
研究論文（学術雑誌）

北海道における希少淡水二枚貝カワシンジュガイ属2 種（Margaritifera laevis, Margaritifera togakushiensis）の河川区間での生息の重複　　　　　　　　　　　　　　　
三浦 一輝, 石山 信雄, 川尻 啓太, 渥美 圭佑, 長坂 有, 折戸 聖, 町田 善康, 臼井 平, Gao Yiyang, 能瀬 晴菜, 根岸 淳二郎, 中村 太士
保全生態学研究, 24, 1, 39, 48, 2019年02月, ［査読有り］

Global patterns and drivers of ecosystem functioning in rivers and riparian zones
Scott D. Tiegs, David M. Costello, Mark W. Isken, Guy Woodward, Peter B. McIntyre, Mark O. Gessner, Eric Chauvet, Natalie A. Griffiths, Alex S. Flecker, Vicenc Acuna, Ricardo Albarino, Daniel C. Allen, Cecilia Alonso, Patricio Andino, Clay Arango, Jukka Aroviita, Marcus V. M. Barbosa, Leon A. Barmuta, Colden V. Baxter, Thomas D. C. Bell, Brent Bellinger, Luz Boyero, Lee E. Brown, Andreas Bruder, Denise A. Bruesewitz, Francis J. Burdon, Marcos Callisto, Cristina Canhoto, Krista A. Capps, Maria M. Castillo, Joanne Clapcott, Fanny Colas, Checo Colon-Gaud, Julien Cornut, Veronica Crespo-Perez, Wyatt F. Cross, Joseph M. Culp, Michael Danger, Olivier Dangles, Elvira de Eyto, Alison M. Derry, Veronica Diaz Villanueva, Michael M. Douglas, Arturo Elosegi, Andrea C. Encalada, Sally Entrekin, Rodrigo Espinosa, Diana Ethaiya, Veronica Ferreira, Carmen Ferriol, Kyla M. Flanagan, Tadeusz Fleituch, Jennifer J. Follstad Shah, Andre Frainer, Nikolai Friberg, Paul C. Frost, Erica A. Garcia, Liliana Garcia Lago, Pavel Ernesto Garcia Soto, Sudeep Ghate, Darren P. Giling, Alan Gilmer, Jose Francisco Goncalves, Rosario Karina Gonzales, Manuel A. S. Graca, Mike Grace, Hans-Peter Grossart, Francois Guerold, Vlad Gulis, Luiz U. Hepp, Scott Higgins, Takuo Hishi, Joseph Huddart, John Hudson, Samantha Imberger, Carlos Iniguez-Armijos, Tomoya Iwata, David J. Janetski, Eleanor Jennings, Andrea E. Kirkwood, Aaron A. Koning, Sarian Kosten, Kevin A. Kuehn, Hjalmar Laudon, Peter R. Leavitt, Aurea L. Lemes da Silva, Shawn J. Leroux, Carri J. Leroy, Peter J. Lisi, Richard MacKenzie, Amy M. Marcarelli, Frank O. Masese, Brendan G. Mckie, Adriana Oliveira Medeiros, Kristian Meissner, Marko Milisa, Shailendra Mishra, Yo Miyake, Ashley Moerke, Shorok Mombrikotb, Rob Mooney, Tim Moulton, Timo Muotka, Junjiro N. Negishi, Vinicius Neres-Lima, Mika L. Nieminen, Jorge Nimptsch, Jakub Ondruch, Riku Paavola, Isabel Pardo, Christopher J. Patrick, Edwin T. H. M. Peeters, Jesus Pozo, Catherine Pringle, Aaron Prussian, Estefania Quenta, Antonio Quesada, Brian Reid, John S. Richardson, Anna Rigosi, Jose Rincon, Geta Risnoveanu, Christopher T. Robinson, Lorena Rodriguez-Gallego, Todd V. Royer, James A. Rusak, Anna C. Santamans, Geza B. Selmeczy, Gelas Simiyu, Agnija Skuja, Jerzy Smykla, Kandikere R. Sridhar, Ryan Sponseller, Aaron Stoler, Christopher M. Swan, David Szlag, Franco Teixeira-de Mello, Jonathan D. Tonkin, Sari Uusheimo, Allison M. Veach, Sirje Vilbaste, Lena B. M. Vought, Chiao-Ping Wang, Jackson R. Webster, Paul B. Wilson, Stefan Woelfl, Marguerite A. Xenopoulos, Adam G. Yates, Chihiro Yoshimura, Catherine M. Yule, Yixin X. Zhang, Jacob A. Zwart
SCIENCE ADVANCES, 5, 1, eaav0486, 2019年01月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Chestnut goby, Gymnogobius castaneus (O’Shaughnessy 1875), as a suitable host of Anemina arcaeformis (Heude 1877) in floodplain water bodies, Hokkaido, Northern Japan
Junjiro N. Negishi, Kazuki Miura, Hokuto Izumi, Yutaka Negishi
Limnology, 19, 3, 343, 354, Springer Science and Business Media LLC, 2018年08月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
研究論文（学術雑誌）

タンクモデルを参考にした小学校高学年向けの地下水学習の教材開発
岩井尚人, 山中康裕, 根岸淳二郎, 山田朋人
水利科学, 364, 5, 59, 80, 2018年08月, ［査読有り］
日本語, 地下水の持続可能な利用は，その保全にとって必要である。地下水を保全す る態度を育むために，小学校教育の中で地下水について学ぶ機会を作ることは，重要なことである。本研究では，小学校高学年生が地下水涵養に関する森 林の機能などの地下水に関する基本的知識を学べる教材を，タンクモデルを参 考にして開発した。教材は，3 段タンクで構成され，森林領域の下にある帯水 層に設置したスポンジが水を貯留し，その水は装置外へゆっくりと流出するよ うになっている。教材で表現したのは，森林は主要な地下水の涵養域であるこ と，地下水は地表水に比べて滞留時間が長いことの 2 つである。教材を用いた 散水実験では，3 段のタンクそれぞれからの流出ピークのタイムラグや滞留時 間の違いなど，上記 2 点を定量的に確認した。小学校等の教員13名を対象に実 施した教材の実演と，彼らに対する聞き取り調査では，多くの教員は，小学校 児童にとって，上記 2 点が分かりやすいと判断した。

Ecohydrological disturbances associated with roads: Current knowledge, research needs, and management concerns with reference to the tropics
Beverley C. Wemple, Trevor Browning, Alan D. Ziegler, Jorge Celi, Kwok Pan Sun Chun, Fernando Jaramillo, Nei K. Leite, Sorain J. Ramchunder, Junjiro N. Negishi, Ximena Palomeque, Derek Sawyer
Ecohydrology, 11, 3, 2018年04月01日, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Seasonal variation in food web-based transfer factors of radiocesium in white-spotted char (Salvelinus leucomaenis) from headwater streams
M. E. Haque, T. Gomi, M. Sakai, J. N. Negishi
Landscape and Ecological Engineering, 14, 1, 45, 53, Springer Science and Business Media LLC, 2018年01月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Assessment of a unionid freshwater mussel (Pronodularia japanensis) population in an agricultural channel during the 4 years following reintroduction
Kazuki Miura, Hokuto Izumi, Yuya Saito, Kaito Asato, Junjiro N. Negishi, Kazuo Ito, Akio Oomori
Landscape and Ecological Engineering, 14, 1, 157, 164, Springer Science and Business Media LLC, 2018年01月, ［査読有り］
研究論文（学術雑誌）

Throughfall at an Abandoned Skid Trail in a Tropical Rain Forest in Peninsular Malaysia
Shoji Noguchi, Junjiro N. Negishi, Zulkifli Yusop, Yoshiko Kosugi, Siti Aisah Shamsuddin, Makoto Tani
JARQ-JAPAN AGRICULTURAL RESEARCH QUARTERLY, 52, 1, 63, 75, 2018年, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Cesium-137 contamination of river food webs in a gradient of initial fallout deposition in Fukushima, Japan
J. N. Negishi, M. Sakai, K. Okada, A. Iwamoto, T. Gomi, K. Miura, M. Nunokawa, M. Ohhira
Landscape and Ecological Engineering, 14, 1, 55, 66, Springer Tokyo, 2018年01月01日, ［査読有り］, ［筆頭著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Stream Resource Gradients Drive Consumption Rates of Supplemental Prey in the Adjacent Riparian Zone
根岸淳二郎
Ecosystems, 21, 4, 772, 781, 2017年09月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Developing a food web-based transfer factor of radiocesium for fish, whitespotted char (Salvelinus leucomaenis) in headwater streams.
Md Enamul Haque, Takashi Gomi, Masaru Sakai, Junjiro N Negishi
Journal of environmental radioactivity, 172, 191, 200, 2017年06月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, We developed a food web-based transfer factor (TFweb) to study contaminant movements from multiple prey items to a predator based on the dietary contributions of prey items with their respective contamination levels. TFweb was used to evaluate the transfer of 137Cs into whitespotted char (Salvelinus leucomaenis) from the trophic structure of a stream-riparian ecosystem in headwater streams draining a Japanese cedar forest. We also examined the applicability of this method by comparing sites with different contamination levels but similar surrounding environments in Fukushima and Gunma. All samples were collected from August 2012 to May 2013. The dietary contributions from both aquatic and terrestrial prey items to whitespotted char were analyzed using stable carbon and nitrogen isotope ratios. 137Cs activity concentrations in char ranged from 704 to 6082 Bq kg-1-dry in Fukushima and from 193 to 618 Bq kg-1-dry in Gunma. Dominant prey taxa such as mayflies (Ephemera japonica), spider crickets (Rhaphidosphoridae gen. spp.), and freshwater crabs (Geothelphusa dehaani), each of them accounted for 3-12% of the fish diet, based on lower and upper estimates, respectively. TFweb ranged from 1.12 to 3.79 in Fukushima and from 1.30 to 4.30 in Gunma, which suggested bioaccumulation from prey items to predator. Widely used ecological parameters TFs by media-char and TTF by single prey-char showed high variability with both dilution and accumulation. TFweb is applicable for 137Cs transfer in predator-prey systems with complex food web structures of stream-riparian ecosystems.

Seasonal variations of food web-based transfer factor of radiocesium for white-spotted char in headwater streams
Haque ME, Gomi T, Sakai M, Negishi JN
Landscape and Ecological Engineering, 0, 00, 00, 2017年03月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Leaf litter patches in stream create overwintering habitats for Ezo brown frog (Rana pirica)
Miura Kazuki, Watanabe Nozomi, Negishi Junjiro N.
Limnology, 18, 1, 9, 16, Springer Japan, 2017年01月, ［査読有り］, ［最終著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Species-specific use of allochthonous resources by ground beetles (Carabidae) at a river-land interface
Akira Terui, Takumi Akasaka, Junjiro N. Negishi, Fumihiko Uemura, Futoshi Nakamura
ECOLOGICAL RESEARCH, 32, 1, 27, 35, 2017年01月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Fallout volume and litter type affect Cs-137 concentration difference in litter between forest and stream environments
Masaru Sakai, Takashi Gomi, Junjiro N. Negishi
JOURNAL OF ENVIRONMENTAL RADIOACTIVITY, 164, 169, 173, 2016年11月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Using environmental DNA to detect an endangered crayfish Cambaroides japonicus in streams
Kousuke Ikeda, Hideyuki Doi, Kazunori Tanaka, Tadashi Kawai, Junjiro N. Negishi
Conservation Genetics Resources, 8, 3, 231, 234, Springer Science and Business Media LLC, 2016年09月, ［査読有り］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Different cesium-137 transfers to forest and stream ecosystems
Masaru Sakai, Takashi Gomi, Junjiro N. Negishi, Aimu Iwamoto, Kengo Okada
ENVIRONMENTAL POLLUTION, 209, 46, 52, 2016年02月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Radiocesium leaching from contaminated litter in forest streams.
Masaru Sakai, Takashi Gomi, Risa S Naito, Junjiro N Negishi, Michiko Sasaki, Hiroto Toda, Masanori Nunokawa, Kaori Murase
Journal of environmental radioactivity, 144, 15, 20, 2015年06月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Imperiled freshwater mussels in drainage channels associated with rare agricultural landscape and diverse fish communities (Special Feature : Freshwater biodiversity in human-dominated landscapes)
Negishi J. N., Tamaoki H., Watanabe N., Nagayama S., Kume M., Kayaba Y., Kawase M.
Limnology, 15, 3, 237, 247, Springer, 2014年08月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Identification of landscape structures that predict the distribution of aquatic organisms has the potential to provide a practical management tool for species conservation in agricultural drainage channels. We tested the hypothesis that sites with imperiled freshwater mussels have distinct rural landscape structures and are characterized by the presence of diverse fish communities. In central Japan, the proportion of developed land use in surrounding areas was compared among sites with mussel populations (mussel sites) and randomly chosen sites (random sites) across multiple spatial scales (with a radius ranging from 100 to 3,000 m). Mussel sites were characterized by a much lower proportion of developed land (mean 5-18 %) compared with random sites (mean 32-35 %) at a scale of a parts per thousand currency sign300 m. The areas that met the landscape criteria for mussel sites across multiple scales constituted only 0.23 % of the area that was presumed to have suitable slope and elevation as a mussel habitat. Landscape metrics derived from mussel sites to locate unknown populations had a low predictability (16.7 %). Sites with mussels were located close to each other and had fish communities with higher taxonomic diversity than in sites without mussels. In addition, mussel taxonomic richness was a good predictor of fish community diversity. The quantitative measures of landscape structure may serve as a useful tool when prioritizing or identifying areas for conservation of mussels and fish if spatially autocorrelated distribution of habitat and other critical environmental factors such as habitat connectivity are also considered.

Freshwater biodiversity in human-dominated landscapes: introduction
Nisikawa Usio, Junjiro N. Negishi
LIMNOLOGY, 15, 3, 199, 200, 2014年08月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語

The Significance of Meander Restoration for the Hydrogeomorphology and Recovery of Wetland Organisms in the Kushiro River, a Lowland River in Japan
Futoshi Nakamura, Nobuo Ishiyama, Masanao Sueyoshi, Junjiro N. Negishi, Takumi Akasaka
Restoration Ecology, 22, 4, 544, 554, Wiley, 2014年07月, ［査読有り］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Terrestrialization alters organic matter dynamics and habitat quality for freshwater mussels (Unionoida) in floodplain backwaters
Junjiro N. Negishi, Kotaro Katsuki, Manabu Kume, Shigeya Nagayama, Yuichi Kayaba
Freshwater Biology, 59, 5, 1026, 1038, Wiley, 2014年05月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
研究論文（学術雑誌）

Geomorphic legacy controls macrophyte distribution within and across disconnected floodplain lakes
Junjiro N. Negishi, Masashi Soga, Nobuo Ishiyama, Noriyasu Suzuki, Teruaki Yuta, Masanao Sueyoshi, Chitose Yamazaki, Itsuro Koizumi, Shigeru Mizugaki, Kazufumi Hayashida, Masanori Nunokawa, Nobuhiko Yoshimura
Freshwater Biology, 59, 5, 942, 954, 2014年05月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Winter fish community structures across floodplain backwaters in a drought year
Kume Manabu, Negishi Junjiro N., Sagawa Shiro
Limnology, 15, 2, 109, 115, Springer Japan, 2014年04月, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

イシガイ類を指標生物としたセグメント 2 における氾濫原環境の評価手法の開発：木曽川を事例として
Shigeya NAGAYAMA, Morihiro HARADA, Yuichi KAYABA, Junjiro N. NEGISHI
応用生態工学, 17, 1, 29, 40, Ecology and Civil Engineering Society, 2014年, ［査読有り］, ［国内誌］
研究論文（学術雑誌）

Interaction between patch area and shape: lakes with different formation processes have contrasting area and shape effects on macrophyte diversity
Masashi Soga, Nobuo Ishiyama, Masanao Sueyoshi, Yuichi Yamaura, Kazufumi Hayashida, Itsuro Koizumi, Junjiro N. Negishi
LANDSCAPE AND ECOLOGICAL ENGINEERING, 10, 1, 55, 64, 2014年01月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Effects of biodiversity, habitat structure, and water quality on recreational use of rivers
Hideyuki Doi, Izumi Katano, Junjiro N. Negishi, Seiji Sanada, Yuichi Kayaba
Ecosphere, 4, 8, art102, art102, 2013年08月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Distribution of amphipods (Gammarus nipponensisUeno) among mountain headwater streams with different legacies of debris flow occurrence
Sohei Kobayashi, Takashi Gomi, Roy C. Sidle, Junjiro N. Negishi
Ecohydrology, 6, 1, 117, 124, Wiley, 2013年02月, ［査読有り］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Unionoid mussels as an indicator of fish communities : A conceptual framework and empirical evidence
Negishi J. N., Nagayama S., Kume M., Sagawa S., Kayaba Y., Yamanaka Y.
Ecological Indicators, 24, 127, 137, Elsevier, 2013年01月, ［査読有り］, ［筆頭著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, We tested the hypothesis that globally imperiled freshwater mussels (Order: Unionoida) can be used as an indicator of fish communities in lowland aquatic systems for relatively small geographic areas (i.e., <100 km2). The survey was conducted in 13 reaches within a network of agricultural drainage channels and in 9 floodplain backwaters in Central Japan. In each site, the fish community was examined on four seasonal occasions (spring to early summer, mid-summer, fall to early winter, and winter) and related to the mussel community. Total abundance, taxon richness, and diversity index were used to characterize fish communities. Mussel community variables predicted some aspects of fish communities, but such patterns were seasonally limited. In both systems, mussel community variables had no predictive power for the total abundance of fishes. In drainage channels, taxon richness of mussels was a good predictor of all fish community variables except for total abundance in early summer. In winter, mussel abundance predicted well the taxon richness of the fish community, while taxon richness predicted the diversity index of the fish community. In backwaters, mussel abundance was a good predictor of fish community variables except total abundance in mid-summer. A relatively minor portion (<23%) of fish-mussel relationships was attributable to direct commensalism between mussels and bitterlings. A conceptual framework was provided to help identify the mechanisms behind fish-mussel relationships. Our findings validated the use of mussels as an indicator of high-quality summer rearing habitats in backwaters and wintering and reproduction habitats of fishes in drainage channels.

Mussel responses to flood pulse frequency: the importance of local habitat
JUNJIRO N. NEGISHI, SHIRO SAGAWA, YUICHI KAYABA, SEIJI SANADA, MANABU KUME, TETSUYA MIYASHITA
Freshwater Biology, 57, 7, 1500, 1511, Wiley, 2012年07月, ［査読有り］, ［筆頭著者］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Using airborne scanning laser altimetry (LiDAR) to estimate surface connectivity of floodplain water bodies
J. N. Negishi, S. Sagawa, S. Sanada, M. Kume, T. Ohmori, T. Miyashita, Y. Kayaba
River Research and Applications, 28, 2, 258, 267, Wiley, 2012年02月, ［査読有り］, ［筆頭著者］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

応用生態工学的研究におけるプロセスベースアプローチ
根岸 淳二郎
応用生態工学, 15, 2, 235, 242, 応用生態工学会, 2012年, ［査読有り］, ［筆頭著者］, ［国内誌］
日本語, 研究論文（学術雑誌）

木曽川氾濫原水域における特定外来生物ヌートリア (Myocastor coypus) によるイシガイ科二枚貝類の食害　　　　　　　　　　　　　　　
久米 学, 小野田 幸生, 根岸 淳二郎, 佐川 志朗, 永山 滋也, 萱場 祐一
陸水生物学報, 27, 41, 47, 2012年, ［査読有り］
日本語, 研究論文（学術雑誌）

農業用の水路における季節と生活史段階に応じた魚類の生息場利用
永山 滋也, 根岸 淳二郎, 久米 学, 佐川 志朗, 塚原 幸治, 三輪 芳明, 萱場 祐一
応用生態工学, 15, 2, 147, 160, Ecology and Civil Engineering Society, 2012年, ［査読有り］, ［国際誌］
日本語, 氾濫原に依存した生活史を持つ魚類にとって農業用の水路は代替の生息場として機能している．それゆえ，季節や生活史段階に応じた魚類の水路利用や生息場特性を把握しておくことは，保全上重要である．そこで，本研究では，岐阜県関市の 4 地域において，灌漑期 2 期 (6 月，8 月) と非灌漑期 2 期 (9 月，2 月) にわたり，水涸れしない農業用の水路を対象として調査を行った．全調査期にわたる総採捕個体数に占める割合が 5 ％以上であった魚類を優占種と定義したところ，6 種が該当した．これらの体長頻度分布および個体数の季節変化から，水路はアブラボテ，カワムツ属，ドジョウ，ヨシノボリ類の稚魚期における成育場，それ以外の生活史段階を含む冬季の生息場 (越冬場) として利用されていることが示唆された．また，生活史段階を特定できなかったが，シマドジョウ類の成育場および冬季の生息場として，さらに，当歳魚を含む小型個体 (39 mm 以下) のオイカワの成育場および冬季の生息場として水路が利用されていることが示唆された．水路底が土砂の水路 (土砂区間) では，コンクリートの水路 (コンクリート区間) よりも，8 月を除く 3 調査期において魚類の総生息密度は有意に高く，種多様度は冬季においてのみ有意に高かった．また，水深，砂割合，小礫割合も，全調査期において土砂区間の方が有意に高かった．魚類の生息密度に影響を与える物理環境として，温暖な時期 (6 月，8 月，9 月) ついては，優占 種 6 種中 4 種に対して水路底の土砂 (シルト割合，砂割合，小礫割合) が検出され，それぞれ生息密度と正の関係を示した．土砂は魚類の生息場や産卵場の基質，餌資源の生息場基質となることから，水路底に土砂を持つ土砂区間はコンクリート区間より適した生息場であったと考えられる．寒冷な冬季 (2 月) になると生息場のシフトが見られ，4 魚種についてカバー率，1 魚種について水深が重要な物理環境として選ばれ，それぞれ生息密度と正の関係を示した．カバー率は，土砂区間に含まれる素掘りの土羽水路の区間で高く (25. 4％) ，コンクリート区間 (1. 2％) や柵渠 (6. 0％) では低かった．また，水深も土砂区間の方が大きかった．このことから，カバーや大きな水深 158 応用生態工学15 (2) , 2012 が魚類の冬季生息場として適しており，それが担保された土砂区間で魚類の生息密度や多様度が高くなったと考えられる．加えて，アブラボテの生息量は産卵期以外も含む 3 調査期において二枚貝の生息量と密接な正の関係にあることが示された．以上のことから，灌漑期と非灌漑期を通した魚類生息場として農業用の水路を捉える場合，水路底の土砂やカバーがセットで水路に存在することが必要であると結論される．このような水路としては，素掘りの土羽水路が理想的ではあるが，少なくとも柵渠 (側岸だけコンクリートや板で固定) とすることが望ましい．柵渠においても水際部の植生やえぐれによるカバーを確保するためには，土砂の堆積や維持に関わる水理条件を整えると同時に，堆積を許容する設計が必要である．

フロリダ州エバーグレイズ流域における流域再生プロジェクトと研究学習拠点
山下 慎吾, 根岸 淳二郎, 河口 洋一, 赤坂 卓美, 中村 知美, 島谷 幸宏, 中村 太士
流域圏学会誌, 1, 1, 19, 24, 流域圏学会, 2012年, ［査読有り］, ［招待有り］
日本語, 研究論文（学術雑誌）

Seasonally tracking vertical and horizontal distribution of unionid mussels (Pronodularia japanensis): implications for agricultural drainage management
Junjiro N. Negishi, Hideyuki Doi, Izumi Katano, Yuichi Kayaba
Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 21, 1, 49, 56, 2011年01月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Short-term responses of macroinvertebrate drift following experimental sediment flushing in a Japanese headwater channel
Takashi Gomi, Sohei Kobayashi, Junjiro N. Negishi, Fumitoshi Imaizumi
Landscape and Ecological Engineering, 6, 2, 257, 270, Springer Science and Business Media LLC, 2010年07月, ［査読有り］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Size-specific growth patterns and estimated longevity of the unionid mussel (Pronodularia japanensis)
Negishi Junjiro N., Kayaba Yuichi
Ecological research, 25, 2, 403, 411, Springer Japan, 2010年03月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Effects of handling and density on the growth of the unionid Mussel (Pronodularia japanensis)
NEGISHI JN
J N Am Benthol Soc, 28, 4, 821, 831, University of Chicago Press, 2009年12月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Host mussel utilization of the Itasenpara bitterling (Acheilognathus longipinnis) in the Moo River in Himi, Japan
Jyun-ichi Kitamura, Junjiro N. Negishi, Masaki Nishio, Shiro Sagawa, Jyun-ichi Akino, Shigeyuki Aoki
Ichthyological Research, 56, 3, 296, 300, Springer Science and Business Media LLC, 2009年07月, ［査読有り］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Changes in bedload transport rate associated with episodic sediment supply in a Japanese headwater channel
Fumitoshi Imaizumi, Takashi Gomi, Sohei Kobayashi, Junjiro N. Negishi
CATENA, 77, 3, 207, 215, Elsevier BV, 2009年06月, ［査読有り］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Longitudinal macroinvertebrate organization over contrasting discontinuities: effects of a dam and a tributary
Izumi Katano, Junjiro N. Negishi, Tomoko Minagawa, Hideyuki Doi, Yôichi Kawaguchi, Yuichi Kayaba
Journal of the North American Benthological Society, 28, 2, 331, 351, 2009年06月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Throughfall in an evergreen-dominated forest stand in northern Thailand: Comparison of mobile and stationary methods
Alan D. Ziegler, Thomas W. Giambelluca, Mike A. Nullet, Ross A. Sutherland, Chatchai Tantasarin, John B. Vogler, Junjiro N. Negishi
AGRICULTURAL AND FOREST METEOROLOGY, 149, 2, 373, 384, 2009年02月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A new method to measure substrate coherent strength of Stenopsyche marmorata
Masanori Nunokawa, Takashi Gomi, Junjiro N. Negishi, Osamu Nakahara
LANDSCAPE AND ECOLOGICAL ENGINEERING, 4, 2, 125, 131, 2008年11月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

イシガイ目二枚貝の生態学的研究 : 現状と今後の課題
根岸 淳二郎, 萱場 祐一, 塚原 幸治, 三輪 芳明
日本生態学会誌, 58, 37, 50, 2008年10月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国内誌］

Contribution of intercepted subsurface flow to road runoff and sediment transport in a logging-disturbed tropical catchment
NEGISHI J.N.
Earth Surf. Process. Landforms, 33, 8, 1174, 1191, Wiley, 2008年07月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

指標・危急生物としてのイシガイ目二枚貝：生息環境の劣化プロセスと再生へのアプローチ
根岸淳二郎
応用生態工学, 11, 2, 195, 211, Ecology and Civil Engineering Society, 2008年, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国内誌］
研究論文（学術雑誌）

Persistence of road runoff generation in a logged catchment in Peninsular Malaysia
Alan D. Ziegler, Junjiro N. Negishi, Roy C. Sidle, Takashi Gomi, Shoji Noguchi, Abdul Rahim Nik
EARTH SURFACE PROCESSES AND LANDFORMS, 32, 13, 1947, 1970, 2007年11月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語

Stormflow generation involving pipe flow in a zero-order basin of Peninsular Malaysia
J. N. Negishi, S. Noguchi, R. C. Sidle, A. D. Ziegler, Abdul Rahim Nik
Hydrological Processes, 21, 6, 789, 806, Wiley, 2007年03月15日, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Impacts of logging disturbance on hillslope saturated hydraulic conductivity in a tropical forest in Peninsular Malaysia
Alan D. Ziegler, Junjiro N. Negishi, Roy C. Sidle, Shoji Noguchi, Abdul Rahim Nik
CATENA, 67, 2, 89, 104, 2006年10月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Potential influences of a net-spinning caddisfly (Trichoptera : Stenopsyche marmorata) on stream substratum stability in heterogeneous field environments
Akira Takao, Junjiro N. Negishi, Masanori Nunokawa, Takashi Gomi, Osamu Nakahara
JOURNAL OF THE NORTH AMERICAN BENTHOLOGICAL SOCIETY, 25, 3, 545, 555, 2006年09月, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Sediment and wood accumulations in humid tropical headwater streams: Effects of logging and riparian buffers
Takashi Gomi, Roy C. Sidle, Shoji Noguchi, Junjiro N. Negishi, Abdul Rahim Nik, Shozo Sasaki
Forest Ecology and Management, 224, 1-2, 166, 175, Elsevier BV, 2006年03月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Ecological roles of roadside fern (Dicranopteris curranii) on logging road recovery in Peninsular Malaysia: Preliminary results
J.N. Negishi, R.C. Sidle, S. Noguchi, Abdul Rahim Nik, R. Stanforth
Forest Ecology and Management, 224, 1-2, 176, 186, Elsevier BV, 2006年03月, ［査読有り］, ［筆頭著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

Erosion processes in steep terrain - Truths, myths, and uncertainties related to forest management in Southeast Asia
RC Sidle, AD Ziegler, JN Negishi, AR Nik, R Siew, F Turkelboom
FOREST ECOLOGY AND MANAGEMENT, 224, 1-2, 199, 225, 2006年03月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Reduction of Stream Sediment Concentration by a Riparian Buffer: Filtering of Road Runoff in Disturbed Headwater Basins of Montane Mainland Southeast Asia
Alan D. Ziegler, Junjiro Negishi, Roy C. Sidle, Pornchai Preechapanya, Ross A. Sutherland, Thomas W. Giambelluca, Sathaporn Jaiaree
Journal of Environmental Quality, 35, 1, 151, 162, Wiley, 2006年01月, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

An experimental test of the effects of food resources and hydraulic refuge on patch colonization by stream macroinvertebrates during spates.
Junjiro N Negishi, John S Richardson
The Journal of animal ecology, 75, 1, 118, 29, 2006年01月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, 1. The passive or active movement of organisms between habitat patches plays important roles in achieving ecosystem resilience to disturbance and long-term control of population levels. However, causal mechanisms of disturbance-induced movements of mobile biota across heterogeneous habitat patches at a relatively short time-scale are little understood. 2. We experimentally tested the effects of food resource values on macroinvertebrate colonization of hydraulic refugia from spates in a second-order creek. Experimental cages were colonized by macroinvertebrates with combinations of resource types (natural or polyester leaves), and extent of exposure to stream flow (exposed to or sheltered from current); one half of each set was collected before and after a spate. This experiment was repeated over three spates of varying magnitude and seasonal contexts. 3. Pre-spate colonization was consistently greater for the cages with natural leaves relative to artificial leaves regardless of the extent of flow exposure. Two autumn spates with relatively low and stable antecedent flow conditions caused large movements of organic matter and macroinvertebrates across the stream, showing community-level accumulations into hydraulically sheltered patches independent of food treatment. The smallest spate with high and variable antecedent flows during winter resulted in negligible responses, which we interpret to be a result of depletion of easily transportable organic matter and organisms. 4. Two detritivorous taxa, the mayfly Paraleptophlebia spp. and stonefly Despaxia augusta (Banks) were the most responsive to autumn spates, and had disproportionately higher colonization rates of cages when provided with natural leaves during the largest autumn spate. Preferential settlement in food-enriched hydraulic refugia was attributable to taxon-specific mobility related to efficient acquisition of detritus resource, whose availability varies spatially and temporally. 5. Our findings suggest (1) detritivorous macroinvertebrate colonization of hydraulic refugia can be influenced by hydraulic controls as well as food resource value, and (2) pre-spate environmental conditions in terms of resource distribution and availability may pre-condition organisms' susceptibility to spates and also affect refugium usage, at least in food-limited, detritus-based stream systems.

Detritus processing, ecosystem engineering and benthic diversity: a test of predator-omnivore interference
YX Zhang, JS Richardson, JN Negishi
JOURNAL OF ANIMAL ECOLOGY, 73, 4, 756, 766, 2004年07月, ［査読有り］, ［最終著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Impacts of marine-derived nutrients on stream ecosystem functioning.
Yixin Zhang, Junjiro N Negishi, John S Richardson, Renata Kolodziejczyk
Proceedings. Biological sciences, 270, 1529, 2117, 23, 2003年10月22日, ［査読有り］, ［国際共著］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Responses of organic matter and macroinvertebrates to placements of boulder clusters in a small stream of southwestern British Columbia, Canada
Junjiro N Negishi, John S Richardson
Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 60, 3, 247, 258, Canadian Science Publishing, 2003年03月01日, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）, Diversity and productivity of stream food webs are related to habitat heterogeneity and efficiency of energy retention. We tested the hypothesis that experimental boulder placements in a second-order stream would increase diversity and abundance of macroinvertebrates by restoring detrital retention and habitat heterogeneity. Two relatively natural, upstream, reference reaches and a downstream treatment reach with a relatively straight channel and less woody debris were studied for 3 months before and 1.2 years after the placement of six boulder clusters in the treatment reach. Mean velocity and its coefficient of variation increased in the treatment reach (140 and 115%, respectively), whereas the reference reaches remained relatively unchanged after the placements. Enhanced particulate organic matter storage (550%) was accompanied by increased total macroinvertebrate abundance (280%) in the treatment reach, converging with those of the reference reaches almost 1 year after the treatment. Detritivorous taxa numerically dominated the macroinvertebrate community, the total densities of which were best predicted by the fine fraction of organic matter biomass at microhabitat scale. However, the effect of boulder clusters on taxonomic richness was negligible. Our findings suggest that boulder clusters can be used at least as a short-term means to restore macroinvertebrate productivity in detritus-based stream systems.

Effects of channelisation on stream habitat in relation to a spate and flow refugia for macroinvertebrates in northern Japan
NEGISHI JN
Freshwat Biol, 47, 8, 1515, 1529, Wiley, 2002年08月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］, ［国際共著］, ［国際誌］
研究論文（学術雑誌）

山地氾濫原河川における魚類群集の時空間変動
小田郁実, 根岸淳二郎, 中路達郎, 中村太士, 石山信雄, 宇野裕美, 岩瀬晴夫, 渡辺恵三, 橋本有悟, 澤崎和也, 久富悠一朗, 石野有純, 南穂香, 植田和俊, 木戸結菜, 村上直史, 藤原弘昭, 久保山剛, 折戸聖, 藤井和也, 劒持嵩之, 井上創, 川尻啓太, 山田夏希, 川村敦, 坂井励, 原悠子, 中野信之, 応用生態工学会大会講演要旨集, 27th, 2024年

国内氾濫原生態系研究の俯瞰・分析
根岸淳二郎, 日本生態学会大会講演要旨(Web), 68th, 2021年

絶滅危惧種コガタカワシンジュガイの宿主アメマスへの局所適応に着目した保全策の検討
伊藤大雪, 三浦一輝, 市村政樹, 岸田治, 根岸淳二郎, 日本生態学会大会講演要旨(Web), 67th, 2020年

流域の水文特性が水生昆虫の羽化パターンに与える影響とその考察
西尾太希, 石山信雄, 根岸淳二郎, 森本淳子, 中村太士, 日本生態学会大会講演要旨(Web), 67th, 2020年

日本の氾濫原生態系研究
根岸淳二郎, 日本生態学会大会講演要旨(Web), 67th, 2020年

河川と水辺環境保全のための地下生物指標による生態系健全度評価
根岸淳二郎, 川西亮太, 宇野裕美, 東城幸治, 昆虫と自然, 55, 12, 2020年

氾濫原湖沼群におけるイシガイ目二枚貝(Unionoida)の生息環境の種特異性
泉北斗, 三浦一輝, 根岸淳二郎, 日本生態学会大会講演要旨(Web), 66th, 2019年

木曽川におけるイシガイ科二枚貝類生息環境の10年変化~生息場シフトの重要性と営力依存の限界~
永山滋也, 永山滋也, 根岸淳二郎, 原田守啓, 萱場祐一, 応用生態工学会研究発表会講演集, 23rd, 2019年

相補性解析を用いた石狩川旧川・湖沼群の保全優先度の設定
植村郁彦, 小本智幸, 熊木朋子, 根岸淳二郎, 応用生態工学会研究発表会講演集, 23rd, 2019年

イシカリミドリカワゲラ(Alloperla ishikariana)成虫の河川横断方向における分布
中川智裕, 根岸淳二郎, 中村太士, 応用生態工学会研究発表会講演集, 23rd, 2019年

ニホンザリガニの生息地を特徴付ける水位特性の解明
池田幸資, 土居秀幸, 加藤敦子, 三塚多佳志, 川井唯史, 根岸淳二郎, 土木学会年次学術講演会講演概要集(CD-ROM), 74th, 2019年

枝幸町内における淡水二枚貝コガタカワシンジュガイ（Margaritifera togakushiensis）の生息情報　　　　　　　　　　　　　　　
三浦一輝, 川尻啓太, 臼井平, 石山信雄, 秋山吉寛, 渥美佳佑, 根岸淳二郎, 中村太士, 枝幸研究, 9, 23, 29, 2018年03月

カワシンジュガイの宿主特異性は地域によって異なるか
北市仁, 三浦一輝, 伊藤大雪, 卜部浩一, 根岸淳二郎, 日本生態学会大会講演要旨(Web), 65th, 2018年

ダム下流域環境改善策の影響評価のアプローチと効果
根岸淳二郎, 応用生態工学会公開シンポジウム講演要旨集, 2018, 2018年

緩勾配河川における絶滅危惧二枚貝カワシンジュガイ属(Margaritifera spp.)による河川地形の変化
三浦一輝, 渡辺のぞみ, 根岸淳二郎, 応用生態工学会研究発表会講演集, 22nd, 2018年

木曽川河道内氾濫原における10年間の地形・二枚貝類の変化
永山滋也, 永山滋也, 根岸淳二郎, 原田守啓, 萱場祐一, 応用生態工学会研究発表会講演集, 22nd, 2018年

環境DNAを用いたニホンザリガニ及びウチダザリガニの分布と河川横断構造物の及ぼす影響把握
池田幸資, 土居秀幸, 照井滋晴, 加藤敦子, 三塚多佳志, 川井唯史, 永野真理子, 根岸淳二郎, 土木学会年次学術講演会講演概要集(CD-ROM), 73rd, 2018年

環境DNAを用いたニホンザリガニ生息場の推定における季節影響
池田幸資, 土居秀幸, 田中一典, 川井唯史, 荒木仁志, 高原輝彦, 源利文, 鈴木透, 小泉逸郎, 根岸淳二郎, 土木学会年次学術講演会講演概要集(CD-ROM), 71st, ROMBUNNO.VII‐122, 2016年08月01日
日本語

扇状地湧水が河川河畔生態系へ及ぼす影響
宋媛媛, 根岸淳二郎, 日本陸水学会大会講演要旨集, 81st (Web), 2016年

農業用水路生息場保全における連続性の重要性:淡水二枚貝と宿主魚類の広域解析
根岸淳二郎, 玉置弘幸, 永山滋也, 渡辺のぞみ, 久米学, 萱場祐一, 日本生態学会大会講演要旨(Web), 61st, 2014年

宿主魚類の移動に影響する農業用水路の縦断的連続性とイシガイ科二枚貝の関係
永山滋也, 玉置弘幸, 根岸淳二郎, 久米学, 萱場祐一, 日本魚類学会年会講演要旨, 46th, 2013年

異なる河川底質におけるカワシンジュガイの生態的機能
高木優風花, 根岸淳二郎, 布川雅典, 久米学, 照井慧, 応用生態工学会研究発表会講演集, 17th, 2013年

寒冷な地域特性を活かした産官学発展の取り組み : 星野リゾートトマム・占冠村・北海道大学の三者が発展する連携へ
中村 一樹, 吉村 暢彦, 根岸 淳二郎, 寒地技術論文・報告集 寒地技術シンポジウム, 28, 370, 375, 2012年
北海道開発技術センター, 日本語

木曽川一時水域における希少魚イタセンパラの生息場所の物理環境特性
佐川志朗, 根岸淳二郎, 根岸淳二郎, 萱場祐一, 池谷幸樹, 久米学, 北村淳一, 北村淳一, 白江健造, 日本生態学会大会講演要旨集, 58th, 2011年

水枯れしない農業用水路における魚類の生息環境と利用実態
永山滋也, 根岸淳二郎, 久米学, 佐川志朗, 塚原幸治, 三輪芳明, 萱場祐一, 応用生態工学会研究発表会講演集, 15th, 2011年

木曽川におけるイタセンパラおよびタイリクバラタナゴの食物網解析
佐川志朗, 根岸淳二郎, 永山滋也, 久米学, 北村淳一, 池谷幸樹, 萱場祐一, 応用生態工学会研究発表会講演集, 15th, 2011年

陸水環境保全のための指標種としてのイシガイ類の有用性
根岸淳二郎, 大森徹治, 萱場祐一, 久米学, 佐川志朗, 真田誠至, 永山滋也, 宮下哲也, 日本生態学会大会講演要旨集, 57th, 2010年

異なる冠水頻度をもつ氾濫原水域における四季および出水前後を通した魚類群集構造の変化
永山滋也, 久米学, 根岸淳二郎, 佐川志朗, 宮下哲也, 萱場祐一, 応用生態工学会研究発表会講演集, 14th, 2010年

木曽川ワンド群におけるイタセンパラ生息場所の特徴と保全再生への一考察-繁殖ワンドと浮上稚魚微生息場所の環境特性に着目して-
佐川志朗, 根岸淳二郎, 根岸淳二郎, 萱場祐一, 池谷幸樹, 久米学, 北村淳一, 白江健造, 日本魚類学会年会講演要旨, 43rd, 2010年

産卵母貝の生きざまを理解する:イシガイ類の基礎から応用生態までの最新知見
根岸淳二郎, 根岸淳二郎, 佐川志朗, 萱場祐一, 久米学, 永山滋也, 日本魚類学会年会講演要旨, 43rd, 2010年

河川水辺域における生物の生息・利用状況と環境要因との関係
宮下哲也, 佐川志朗, 萱場祐一, 青木繁幸, 根岸淳二郎, 久米学, 日本生態学会大会講演要旨集, 56th, 2009年

淡水二枚貝(イシガイ類)の微生息環境,寿命,および移動
根岸淳二郎, 佐川志朗, 真田誠至, 萱場祐一, 久米学, 宮下哲也, 日本生態学会大会講演要旨集, 56th, 2009年

氾濫原の冠水パターンの変化とその生態的な影響--淡水性二枚貝の生息状況の観点から
根岸 淳二郎, 萱場 祐一, 佐川 志朗, 土木技術資料, 50, 11, 38, 41, 2008年11月
土木研究センター, 日本語

ダム下流における支川の効果を考える：供給土砂量の異なる２河川間の比較
片野 泉, 佐川 志朗, 真田 誠至, 土居 秀幸, 根岸 淳二郎, 皆川 朋子, 萱場 祐一, 日本陸水学会 講演要旨集, 73, 0, 84, 84, 2008年
日本陸水学会, 日本語

発電ダム廃止による自然流況の復活が本支流の生息魚類に与える影響
佐川 志朗, 山下 慎吾, 秋野 淳一, 真田 誠至, 根岸 淳二郎, 片野 泉, 皆川 朋子, 萱場 祐一, 日本陸水学会 講演要旨集, 73, 0, 210, 210, 2008年
日本陸水学会, 日本語

研究者から現場へ 河川改修によって失われるハビタット--河川改修で配慮すべき点
根岸 淳二郎, 河川, 63, 8, 84, 86, 2007年08月
日本河川協会, 日本語

支川流入がダム下流の河床環境と底生動物群集に与える影響：近畿8ダム河川間での比較
片野 泉, 土居 秀幸, 根岸 淳二郎, 皆川 朋子, 萱場 祐一, 日本陸水学会 講演要旨集, 72, 0, 129, 129, 2007年
日本陸水学会, 日本語

イシガイ類の生息場所環境解析
根岸 淳二郎, 萱場 祐一, 皆川 朋子, 片野 泉, 田代 喬, 日本陸水学会 講演要旨集, 71, 0, 31, 31, 2006年
日本陸水学会, 日本語

温暖化列島におけるコールドグリーンインフラ「湧水」の機能実証
科学研究費助成事業
2025年04月01日 - 2028年03月31日
根岸 淳二郎
日本学術振興会, 基盤研究(A), 北海道大学, 25H01191

湧水・非湧水河川の相互作用が生みだす動物群集動態と多様性維持機構の解明
科学研究費助成事業
2023年04月01日 - 2026年03月31日
境 優, 小泉 逸郎, 福島 慶太郎, 岩崎 健太, 根岸 淳二郎
湧水支川・非湧水河川の組み合わせのなかで、(1)「避難場所」として魚類が湧水支川に移入したとき、捕食等により無脊椎動物群集の単純化やバイオマスの減少が起こるかどうか、(2)「産卵場所」として魚類が湧水支川に移入したとき、卵や死体が無脊椎動物等に消費されるかどうか、(3)湧水支川への連結性が高いとき、魚類の個体群の存続性や種多様性が高いかどうかを検証するための調査を始動させた。
(1)では、魚類の避難行動が卓越すると考えられる夏・冬期を含めて底生無脊椎動物群集の構造・バイオマスの季節変化を定量的に追跡するための調査を開始した。(2)では、秋の産卵期を含めて上記野外調査と並行して炭素・窒素安定同位体比を測定するための試料採集を進めた。(3)では、関連するデータの収集と解析に着手した。これらの調査で収集された試料およびデータの処理を進めることによりそれぞれの仮説を検証するためのデータセットを得ることができる。湧水・非湧水河川で対照的に異なる物理・化学環境を把握するために、流量・温度・水質等についても観測・分析を進めている。以上の野外調査では、湧水・非湧水環境の相互作用に関わる一般性の高い知見を得るために、複数の調査地を対象として上述の調査項目について相補的に調査・観測を進めている。研究開始年度であるため、試料・データの収集が主要な研究目的ではあったものの、本研究に関連した論文発表や講演発表も本年度内に実施することができた。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 国立研究開発法人国立環境研究所, 23K26934

水圏と陸圏を音でつなぐ科学の創出
科学研究費助成事業
2022年06月30日 - 2025年03月31日
根岸 淳二郎, 先崎 理之
本研究は、流水性の水生昆虫の水圏（河川）と陸圏（河畔）間の飛翔移動に着目し、回帰移動方向決定において水生昆虫は河川流水音に依存するとの仮説を検証することを目的とする．本年度は、北海道東部札内川を集中調査地とした過去のデータと現地で採取された昆虫個体生体を用いながら、以下２つの項目を明らかにした．
第一に、河畔域において羽化トラップ（受動的捕獲型のマレーゼトラップおよび粘着型の粘着トラップ）を設置し、異なる季節でのサンプル回収・分析を行うとともに、既存データの整理を通して羽化個体の科レベルでの林内分布パターンを二次元（横断方向および垂直方向）定量化した．これにより、河川地下間隙域に特に依存度の高いカワゲラ目昆虫（イシカリミドリカワゲラ）が最も河川から離れた50m－100mの範囲に分布することが定量的に示された．複数種の水生昆虫成虫の河畔林生息状況を2次元で可視化した世界で初めての事例である．
第二に、音以外の環境条件を一定にした室内防音室において約5ｍの長さの実験ケージを繰り返し４で作成し、野外で捕獲した水生昆虫成虫（イシカリミドリカワゲラ）の河川音（野外で録音した実河川の流水音）への応答を実験的に検証した．一定明度環境下で3日程度の観測を繰り返した結果、統計的に有意に多数の個体が河川音源側に移動することを確認した．世界で初めて河川音が水生昆虫成虫の動態に影響を与えることを示した結果である．一方で、音源に移動しない個体も見られたことから、音が行動に対して絶対的な影響を与えるわけではない．
日本学術振興会, 挑戦的研究(萌芽), 北海道大学, 22K19194

見えない自然を守る～DNAによる河川地下フロンティア領域の可視化
科学研究費助成事業
2022年04月01日 - 2025年03月31日
根岸 淳二郎, 三浦 彩, 早川 裕弌, 渡辺 幸三, 三宅 洋
本年度は、北海道東部札内川にて集中調査地を設け、以下の4つの項目を明らかにした．
第一に、環境DNAを用いた間隙水域の生態系情報収集において、種から群集の把握へと技術の汎用性を高めた．間隙域のスペシャリストである種を4種特定し、トビケラ目の一種については、ミトコンドリアＤＮＡのＣＯ１領域のＤＮＡ配列に基づく種特異的プライマーを開発した．
第２に、間隙性の水生昆虫２種（カワゲラ目２種）に対してその食性を判別し、間隙域の食物網の影響構造を可視化するために体組織の炭素・窒素安定同位体比解析を行った．過去の計測から得られている２種の潜在的な餌資源（付着藻類、落葉リター、その他無脊椎動物種）の安定同位体比分析の値を考慮した混合モデルの結果からは２種の餌資源の差異は検出できなかった．
第３に、ダム下流河川環境復元のために実施されたフラッシュ放流の前後を含む複数の季節（夏季、秋季、春季）において採取した間隙動物相の群集解析および一部において同時採水した環境DNAのメタバーコーディング解析を引き続き実施した．浅い間隙域に生息する種が侵食・運搬される土砂と共に流下し再度定着する詳細な動態と過程を解明した．また、河川の大型水生無脊椎動物相の約20％程度が砂礫堆下間隙域の動物相により説明された．さらに、環境DNAのメタバーコーディング解析におけるプライマーの改良と最適条件設定を行い、無脊椎動物群集の全体像がより詳細に把握できるようになった．
第４に、歴史的な猛暑となった環境下で熱赤外センサーなどを搭載したUAVによる地形・水温測定を現場でのロガーによる直接水温計測と同時に行った．水温の微小変化と間隙域および河川地形の関係が、小スケール高時間解像度の連続データと広域スケール高空間解像度のスナップショットデータの両視点から得られた．
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 23K25041

見えない自然を守る～DNAによる河川地下フロンティア領域の可視化
科学研究費助成事業
2022年04月01日 - 2025年03月31日
根岸 淳二郎, 三浦 彩, 早川 裕弌, 渡辺 幸三, 三宅 洋
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 22H03787

防潮堤建設が及ぼす海浜性昆虫の種構成及び資源利用の変化
科学研究費助成事業
2021年04月01日 - 2024年03月31日
小林 憲生, 大原 昌宏, 根岸 淳二郎
海浜性昆虫は、海浜という限られた環境にのみ生息する。特に飛翔力を欠く種が多く知られる海浜性甲虫は、海浜環境への適応を考える上で格好の材料である。さらに、この海浜性甲虫群集は、波打ち際（微環境a）、湿った砂（微環境b）、乾燥した砂（微環境c）と、僅か20-30mの範囲内で種構成が変化していく。その上、種によっては生息微環境と餌の場所が異なり、微環境a-bを行き来する種、微環境b-cを移動する種など、複数の微環境を利用する場合も有る。その結果、防潮堤建設によって、上記のいずれかの環境が消失する、或いはこれら微環境a-b-cが分断され、様々な海浜性生物の存否に影響を及ぼす可能性がある。その一方、消滅を免れた種においては、餌資源を変更するなどが生じている可能性もある。
本研究では、海浜性昆虫（主として甲虫類）の詳細な生息場所の調査、及び食性に関する実験等を行い、海浜性昆虫が生息可能な条件を探索すると共に、食物網（Food-Web）を拡張させた、生息場所から餌までの資源利用に関する多次元的な「資源利用-Web」を作成し、防潮堤がもたらすWeb構造の“変化”の解明を目的とする。
初年度は東北地方太平洋側の中でも宮城県中心（宮城県荒浜、蒲生、由比ガ浜、北浜、野蒜）に調査・採集を行い、海浜性昆虫の生息状況を確認した。
また、現在は、餌資源利用の実態を明らかにするため、ハマヒョウタンゴミムシダマシ、ヒョウタンゴミムシ等を用い、食性選好性、生息微環境の選好性に関する室内実験を行っている最中である。
日本学術振興会, 基盤研究(C), 埼玉県立大学, 21K06309

海浜エコトーンの再生を目指した地域主体による「育てる防潮堤」の実証的提案
科学研究費助成事業
2019年04月01日 - 2023年03月31日
松島 肇, 島田 直明, 平吹 喜彦, 岡 浩平, 根岸 淳二郎
本年度は初年度に設置した防潮堤への覆砂試験のモニタリング調査の継続、および防潮堤の海側・陸側における植生調査とともに、防潮堤の生態系への影響把握指標として徘徊性昆虫の食物網への影響に着目し調査をおこなった。また、宮城県や岩手県における学校カリキュラムと連動した海浜植物群落の保全・再生への取り組みを宮城県気仙沼市立大谷小学校、北海道石狩市立浜益小学校、浜益中学校でも実施し、合わせてアンケート調査による環境意識の変化の定量化をおこなった。
防潮堤への覆砂試験では、植物群落の定着が促進されている様子が確認されたものの、防潮堤の上部については、季節風の影響で砂の移動が顕著に確認され、特に内陸側の堤体法面では冬から春にかけて上部の砂が植生ごとなくなり、その後夏から秋にかけて再び砂と植生に覆われる様子が確認された。これが安定化するかについては引き続き継続した調査が求められる。防潮堤より海側の植生については大きな変化は見られないが、陸側ではニセアカシアなどの外来木本が顕著に侵入している様子が確認できた。徘徊性昆虫としてオオハサミムシに着目し、体の安定同位体比を計測して防潮堤の海側と陸側で比較した結果、汀線から陸に向かっていくについれて海由来の同位体の寄与率が低下していく様子が確認できた。しかし、防潮堤の影響で大きく変化する様子はみられなかった。小中学生との海浜植物群落の保全・再生活動は継続することで知識・関心が高まることが確認された。６年目となる仙台市立岡田小学校では、児童が家族とともに自主的に海浜植物の種子を採取するなど、大きな進展が見られた。植物種の判別だけでなく、多くの児童が種子からどの海浜植物種の種子かを同定できるようになっていり、自主的に図鑑を作成するなど、関心の高まりが伺えた。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 19H02982

河川と水辺環境保全のための地下生物指標による生態系健全度・回復力評価
科学研究費助成事業
2018年04月01日 - 2021年03月31日
根岸 淳二郎, 東城 幸治, 宇野 裕美, 川西 亮太
河川地下の飽和間隙水域（間隙域）が河川・河畔生態系の食物網にエネルギーを供給する機能を解明することを目的とし、次の主に4つの成果を得た．間隙性水生昆虫を特定し、その他無脊椎動物を含む間隙域食物網を可視化した．特定した間隙性昆虫の定量化によりその羽化成虫の移動を介して河畔消費者へ供給される物質量を推定した．間隙性生物の洪水および栄養塩付加への応答を明らかにした．間隙性水生昆虫を用いた河川健全性評価手法の提案を行った．総じて、相対的に容易に捕獲・計測が可能である羽化成虫に着目して、河川と水辺環境保全のための地下生物指標による生態系健全度・回復力評価の技術および概念基盤を示した．
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 18H03408

資源利用変化と気候変動による水・土砂・森林レジーム変化と河川・水辺生態系の応答
科学研究費助成事業
2018年04月01日 - 2021年03月31日
中村 太士, 萱場 祐一, 山浦 悠一, 根岸 淳二郎
国土交通省が管理する109水系の管理区間を対象として樹林化の進行と河道内に形成された樹林地がどのような地被から転換されているかを分析した。具体的には、1㎞毎の地被状態を水面＋裸地、草地、樹林地、人工地に分類し、Ⅲ期（1990～1995年度）からⅤ期（2001年～2005年度）の2時期において1）河道面積が大きく変化せず、2）樹林地が5％以上増加した区間を抽出した。この結果、樹林化が進行した区間には、人工地の増大によって説明できる区間も多く、人為的な利用圧の低下（例、耕作放棄地）も樹林化に寄与していることが示唆された。
札内川中流域を対象に、水生昆虫羽化成虫による河畔域の森林植生利用と河川堤防に付随した多年草植生帯がその利用に及ぼす影響を定量化した。横断方向への飛翔距離や群集構造で評価した河畔域利用の程度は目レベルで明瞭に異なり、特に河床間隙域由来のカワゲラ目昆虫において森林植生の利用度が高かった。一方で、堤防の植生帯は、河川からの距離が水生昆虫の飛翔距離に対して十分に小さい場合に、生息場として利用されていた。河畔域の植生帯が、水生昆虫の成虫期の生息場として重要であることが示唆された。
火山性地質においては湧水成分が多くなり、非火山岩地質と比べると夏季においても低温が維持されることから、温暖化の影響を予測するために地質を加味した水温の分布を予測できるモデルを完成させた。
土地利用の変化が鳥類群集に与えた影響を北海道の石狩平野で推定した。各種資料から最近100年間の土地利用を再構築した。土地利用と鳥類各種の個体数の関係を統計モデルで記述し、過去の土地利用に当てはめた。その結果、この時期土地利用は森林が激減した一方で、畑は一時期増加したが水田に置き換わり減少していた。これに伴い、裸地性鳥類以外の湿地性、草地性、森林性鳥類は長期的に大きく個体数を減らしていたと推定された。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 18H03407

森林‐農地移行帯における放射性核種の移動・滞留と生態系濃縮の評価
科学研究費助成事業
2012年05月31日 - 2015年03月31日
五味 高志, 戸田 浩人, 木村 園子ドロテア, 渡邊 裕純, 浅野 友子, 水垣 滋, 布川 雅典, 根岸 淳二郎
森林－渓流生態系の構成物質では、林床落葉の放射性セシウム濃度が最も高く、福島原発事故によって放出された放射性物質の多くは、陸域に現存していた。流域のCs-137空間分布は、林相、微地形、立地などに影響されていた。森林土壌では、農地土壌と比べて有機物に吸着したCs-137が多かった。森林から渓流に供給されたリターは、溶脱によって放射性セシウムが流出し、CS-137濃度は林床の２５％程度であった。これに応じて、同じ栄養段階の生物では、林床に生息するものより渓流に生息する動物でCs-137濃度が高くなっていた。本研究結果から、有機物に付着したCs-137の長期的な観測の重要性を示唆できた。
日本学術振興会, 基盤研究(A), 東京農工大学, 24248058

自然河川、農業用水路、および湧水に注目した流域スケールの生物多様性維持機構の解明
科学研究費助成事業
2012年04月01日 - 2015年03月31日
根岸 淳二郎
第一に、絶滅危惧種であるイシガイ類二枚貝は下流河川との連続性が高い農業用水路に高い確率で生息し、同所的に豊かな魚類相の生息が確認された。また、そのような生息地は、開発地割合の低い景観構造を有する地域に存在した。第二に、河跡湖における水草種数は水草繁茂面積と正の相関を持ち、生息地の質は、人工的にショートカットされた水域で最も低かった。第三に、湧水河川には特徴的な水生昆虫相が確認され、流域スケールでの分類群多様性に貢献していた。これらより、地形や湧水に着目して景観スケールで流水環境をﾀｲﾌﾟ分けすることで効率的な水生生物多様性保全が行える可能性が示唆された。
日本学術振興会, 若手研究(B), 北海道大学, 24710269

生態系の連結性が生物多様性に与える影響とその再生手法に関する研究
科学研究費助成事業
2011年04月01日 - 2015年03月31日
中村 太士, 鈴木 透, 山浦 悠一, 森本 淳子, 永山 滋也, 根岸 淳二郎, 赤坂 卓美, 石山 信雄, 末吉 正尚, 曽我 昌史, 松林 順, 藪原 佑樹, 山中 聡, 先崎 理之
様々な生態系における「連結性」に注目し、その機能と再生方法を検討した。氾濫原や河川水域においては、水域間の連結性と魚類・水生昆虫の種および遺伝的多様性を検討した。その結果、連結性の高い水域において移動性の高い分類群の種数が高いこと、ならびに個体数および遺伝的多様性が影響を受ける距離が異なることが明らかになった。さらに、安定同位体を用いた食物網の解析から、明治以降の開発による景観の分断化が進み、ヒグマの食性が肉食から草食に大きく変化していることが明らかになった。蛇行復元による氾濫原の修復を試みた結果、水生動物の個体数、種多様性が増加したことが明らかになった。
日本学術振興会, 基盤研究(A), 北海道大学, 23248021

流域保全に向けた河川中流域における河床露盤化の実態把握と影響評価
科学研究費助成事業
2009年 - 2011年
根岸 淳二郎
木曽川中流域では河床低下の進行とともに本流域河床基質が砂礫から泥炭へ変化していた。水深20メートルを超える局所洗掘が見られ、泥炭基質が剥離すると下層に位置する浸食に対して脆弱な砂層が水平方向に大きく洗掘される可能性が示唆された。また、拡大しつつある泥炭基質はオオシロカゲロウ(Ephoron shigae)の主要な生息地であり、大量羽化を行う成熟個体の主要な発生起源として機能している可能性が示唆された。
日本学術振興会, 若手研究(B), 北海道大学, 21710247