研究者基本情報

• 博士（薬学）, 金沢大学, 2007年03月

• https://researchmap.jp/NIG

• https://jglobal.jst.go.jp/detail?JGLOBAL_ID=201301091549171830

• 201301091549171830

• 核の配置
• 細胞質流動
• 初期発生
• モータータンパク質
• 細胞骨格
• オルガネラ
• 線虫C. elegans

• ライフサイエンス, 細胞生物学
• ライフサイエンス, 発生生物学

• 修士課程, 総合化学院
• 博士課程, 総合化学院

研究活動情報

• Tetraploid Caenorhabditis elegans embryos exhibit enhanced tolerance to osmotic stress
  Yuiko Oyama; Misako Ohama; Namu Yamada; Nozomi Suzuki; Kenji Kimura; Yuki Hara
  Journal of Cell Science, 139, 10, The Company of Biologists, 2026年05月15日, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, ABSTRACT
  
  Polyploidy is a widespread phenomenon in development and evolution and is frequently associated with altered cellular physiology and developmental robustness. However, how genome doubling influences an embryonic robustness to environmental stress remains poorly understood. Here, we investigated developmental traits and osmotic responses in tetraploid Caenorhabditis elegans embryos. Tetraploid animals exhibited increased body and tissue sizes and produced larger embryos than diploids, accompanied by moderately delayed development and partial embryonic arrest. When exposed to a range of osmotic environments, both diploid and tetraploid embryos swelled or shrank in response to external osmolarity. Strikingly, tetraploid embryos at the early stage maintained normal cell division across a broader range of osmotic conditions than diploids. Quantitative analyses further revealed that tetraploid embryos exhibited reduced cytoplasmic mass density, primarily reflecting lower protein concentration, while lipid and RNA levels remain unaffected. These compositional differences likely buffer cellular size fluctuations and underlie the enhanced osmotic tolerance of tetraploid embryos. Together, our findings demonstrate that genome doubling reshapes embryonic cellular physiology in a non-proportional manner to ploidy, thereby enhancing robustness during early development.
• Mechanics of oogenesis: Lessons from C. elegans germline cysts
  Kenji Kimura; Fumio Motegi
  Seminars in Cell and Developmental Biology, 175, 103644, 2025年08月, ［査読有り］, ［招待有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Ribosomal protein mutation suppresses gonadal leader cell migration defects in mig-17/ADAMTS mutants in Caenorhabditis elegans.
  Kim HS; Mitsuzumi K.; Kondo S.; Yamaoka R.; Ihara S.; Otsuka H.; Yoshikata C.; Kubota Y.; Tomohiro T.; Fujiwara T.; Kimura K.; Motegi F.; Shibata Y.; Takahashi M.; Nishiwaki K.
  Scientific Reports, 15, 1, 26435, 2025年07月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Visualization and Analyses of Cytoplasmic Streaming in C. elegans Zygotes
  Kenji Kimura; Fumio Motegi
  Methods in Molecular Biology, 2872, 131, 139, Springer US, 2024年12月01日, ［査読有り］, ［招待有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語
• Endogenous chondroitin extends the lifespan and healthspan in C. elegans.
  Shibata Y; Tanaka Y; Sasakura H; Morioka Y; Sassa T; Fujii S; Mitsuzumi K; Ikeno M; Kubota Y; Kimura K; Toyoda H; Takeuchi K; Nishiwaki K
  Scientific Reports, 14, 1, 2024年02月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Repulsive guidance molecule acts in axon branching in Caenorhabditis elegans.
  Tsutsui K; Kim HS; Yoshikata C; Kimura K; Kubota Y; Shibata Y; Tian C; Liu J; Nishiwaki K
  Scientific Reports, 11, 1, 22370, 22370, 2021年11月, ［査読有り］, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Repulsive guidance molecules (RGMs) are evolutionarily conserved proteins implicated in repulsive axon guidance. Here we report the function of the Caenorhabditis elegans ortholog DRAG-1 in axon branching. The axons of hermaphrodite-specific neurons (HSNs) extend dorsal branches at the region abutting the vulval muscles. The drag-1 mutants exhibited defects in HSN axon branching in addition to a small body size phenotype. DRAG-1 expression in the hypodermal cells was required for the branching of the axons. Although DRAG-1 is normally expressed in the ventral hypodermis excepting the vulval region, its ectopic expression in vulval precursor cells was sufficient to induce the branching. The C-terminal glycosylphosphatidylinositol anchor of DRAG-1 was important for its function, suggesting that DRAG-1 should be anchored to the cell surface. Genetic analyses suggested that the membrane receptor UNC-40 acts in the same pathway with DRAG-1 in HSN branching. We propose that DRAG-1 expressed in the ventral hypodermis signals via the UNC-40 receptor expressed in HSNs to elicit branching activity of HSN axons.
• Fluid flow dynamics in cellular patterning
  Kenji Kimura; Fumio Motegi
  Seminars in Cell & Developmental Biology, 2021年07月, ［査読有り］, ［責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Cytoplasmic streaming drifts the polarity cue and enables posteriorization of the Caenorhabditis elegans zygote at the side opposite of sperm entry
  Kenji Kimura; Akatsuki Kimura
  Molecular Biology of the Cell, 31, 16, 1765, 1773, American Society for Cell Biology (ASCB), 2020年07月21日, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, The polarity cue moves before polarity establishment through a stochastic cytoplasmic streaming in C. elegans zygotes.
• Endoplasmic-reticulum-mediated microtubule alignment governs cytoplasmic streaming
  Kenji Kimura; Alexandre Mamane; Tohru Sasaki; Kohta Sato; Jun Takagi; Ritsuya Niwayama; Lars Hufnagel; Yuta Shimamoto; Jean-Francois Joanny; Seiichi Uchida; Akatsuki Kimura
  Nature Cell Biology, 19, 4, 399, 406, 2017年04月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Rab6 is required for the exocytosis of cortical granules and the recruitment of separase to the granules during the oocyte-to-embryo transition in Caenorhabditis elegans
  Kenji Kimura; Akatsuki Kimura
  Journal of Cell Science, 125, 23, 5897, 5905, 2012年12月01日, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Localized accumulation of tubulin during semi-open mitosis in the Caenorhabditis elegans embryo
  Hanako Hayashi; Kenji Kimura; Akatsuki Kimura
  Molecular Biology of the Cell, 23, 9, 1688, 1699, 2012年05月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• A novel mechanism of microtubule length-dependent force to pull centrosomes toward the cell center
  Kenji Kimura; Akatsuki Kimura
  BioArchitecture, 1, 2, 74, 79, Landes Bioscience, 2011年03月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Intracellular organelles mediate cytoplasmic pulling force for centrosome centration in the Caenorhabditis elegans early embryo
  Kenji Kimura; Akatsuki Kimura
  Proc Natl Acad Sci U S A., 108, 1, 137, 142, 2011年01月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Knockdown of mitochondrial heat shock protein 70 promotes progeria-like phenotypes in Calenorhabditis elegans
  Kenji Kimura; Nozomu Tanaka; Nobuhiro Nakamura; Syuichi Takano; Shoji Ohkuma
  Journal of Biological Chemistry, 282, 8, 5910, 5918, 2007年02月, ［査読有り］, ［筆頭著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）

• 線虫の極性形成における“バタフライ効果”
  木村 健二; 木村 暁, 生物物理, 61, 4, 248, 250, 2021年08月, ［査読有り］, ［招待有り］, ［筆頭著者］
  Biophysical Society of Japan, 日本語
• 細胞質流動が自発的に流れの方向をそろえるしくみ、逆転させるしくみ
  木村健二; 高木潤; 庭山律哉; 島本勇太; 内田誠一; 木村暁, 実験医学, 35, 13, 2250, 2253, 2017年08月, ［招待有り］
  日本語, 記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）
• 細胞質流動の発生および逆転は小胞体のネットワークにより支配される
  木村 健二, ライフサイエンス新着論文レビュー, 2017年04月, ［招待有り］
  日本語, 記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）
• 細胞表層の流動によるアクチン線維の整列と細胞質分裂
  木村 暁; 木村 健二, 実験医学, 35, 8, 1323, 4, 2017年, ［招待有り］
  日本語, 書評論文,書評,文献紹介等
• 核はどのようにして細胞の中心を見つけるのか？
  谷本博一; 木村健二; 木村暁, 生物物理, 56, 327, 271, 274, 2016年, ［査読有り］
  

  The various molecules and organelles in a eukaryotic cell are suitably positioned within the cell to carry out their functions at the appropriate time. This intracellular positioning is accomplished through interplay among the active transport mechanisms, intracellular fluctuations, and physical properties of the components inside the cell. Here, we review the recent advances in research on how the nucleus moves toward, and maintains its position at, the geometrical center of the cell. This question has attracted researchers from various fields, and is a good subject for interdisciplinary collaboration.

  , 一般社団法人 日本生物物理学会, 日本語, 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
• アクチンの細胞内流動が細胞の移動速度と直進性の共役関係をもたらす
  木村 健二, 細胞工学（別冊バイオ論文解説）, 54, 2015年, ［招待有り］
  日本語, 書評論文,書評,文献紹介等
• 細胞分裂の力学的理解
  木村健二; 木村暁, 細胞工学, 32, 3, 280, 284, 2013年02月, ［招待有り］
  日本語, 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
• An organelle tug-of-war model for centrosome centering in the C. elegans early embryo
  Kenji Kimura; Akatsuki Kimura, GENES & GENETIC SYSTEMS, 84, 6, 487, 487, 2009年12月
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

• The polarity cue moves with two types of cytoplasmic streaming in the C. elegans zygote
  木村 健二
  第43会日本分子生物学会年会, 2020年12月03日, 英語, シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  ［招待講演］
• 線虫受精卵における微小管とアクトミオシンに依存した二種類の細胞質流動が及ぼす細胞極性への影響
  木村 健二
  第91回日本生化学会大会, 2018年09月24日, 日本語, シンポジウム・ワークショップパネル（指名）
  ［招待講演］, ［国内会議］
• Cytoplasmic streaming controls organelle positioning during the oocyte-to-embryo transition in the C. elegans zygote
  木村 健二
  第70回日本細胞生物学会, 2018年06月07日, 日本語, 口頭発表（一般）
  ［国内会議］
• 細胞の中の流れ・細胞質流動はどのようにして起こるのか？
  木村健二
  山口大学セミナー・第7回IoLコロキウム―特別講演会―, 2017年12月20日, 日本語, 公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等
  ［招待講演］
• 受精を合図として生じる細胞質流動の発生メカニズムとその役割の解析
  木村健二
  第69回日本細胞生物学会大会, 2017年06月15日, 日本語, 口頭発表（一般）
  ［国内会議］
• The mechanism of the alignment of cortical microtubules that generates cytoplasmic streaming in the C. elegans zygote.
  木村 健二
  第39回日本分子生物学会年会, 2016年12月01日, 英語, シンポジウム・ワークショップパネル（公募）
  ［国内会議］
• キネシン依存の線虫細胞質流動のメカニズム
  木村 健二
  第6回分子モーター討論会, 2016年07月24日, 日本語, 口頭発表（招待・特別）
  ［招待講演］, ［国内会議］
• 表層微小管によって駆動される線虫の減数分裂期細胞質流動〜植物細胞との相違
  木村 健二
  植物細胞骨格研究会, 2015年11月27日, 日本語, 口頭発表（招待・特別）
  ［招待講演］, ［国内会議］
• 線虫減数分裂期の細胞質流動は「微小管の整列による集団的な力の発生」と「流動による微小管の整列の促進」間の正のフィードバックにより自発的に生成する
  木村 健二
  第67回日本細胞生物学会大会, 2015年07月02日, 日本語, シンポジウム・ワークショップパネル（公募）
  ［国内会議］
• Quantitative analysis of microtubule orientation and organelle movements during meiotic cytoplasmic streaming in C. elegans early embryos
  Kenji Kimura
  C. elegans Development, Cell Biology and Gene Expression Meeting in association with The 6th Asia-Pacific C. elegans Meeting, 2014年07月15日, 英語, 口頭発表（一般）
  ［国際会議］
• 減数分裂期細胞質流動：線虫胚における自己組織化による流れ
  木村 健二
  第36回日本分子生物学会, 2013年12月04日, 日本語, 口頭発表（一般）
  ［国内会議］
• Quantitative Analysis of Intracellular Organelle Movements during Cytoplasmic Streaming in C. elegans Early Embryos.
  Kimura, K; Sasaki, T; Niwayama, R; Uchida, S; Kimura, A
  The 10th NIBB-EMBL Symposium 2013 –Quantitative Bioimaging, 2013年03月17日, ポスター発表
  岡崎, 国立遺伝学研究所以外との共同発表あり, ［国際会議］
• 線虫C. elegansの受精卵を再構築するオルガネラ動態の解析
  Kimura, K
  国立遺伝学研究所研究集会「生殖とオルガネラ：細胞質における遺伝情報の次世代への伝達・分配」, 2012年11月30日, 口頭発表（招待・特別）
  三島, ［招待講演］, ［国内会議］
• 線虫初期胚における 線虫初期胚におけるmeiotic細胞質流動の集団的な動きを生むメカニズム解析
  Kimura, K; Niwayama, R; Kimura, A
  定量生物学の会第５回年会, 2012年11月24日, ポスター発表
  東京, ［国内会議］
• The role of Rab6 in cortical granule exocytosis in C. elegans early embryos
  Kimura, K; Kimura, A
  5th East Asia C. elegans Meeting, 2012年06月27日, 口頭発表（一般）
  Taipei, ［国際会議］
• Quantification and mechanics of meiotic cytoplasmic streaming in C. elegans early embryos.
  Kimura, K; Niwayama, R; Kimura, A
  Joint Meeting of The 45th Annual Meeting of JSDB and The 64th Annual Meeting of JSCB Workshop, 2012年05月30日, 口頭発表（一般）
  神戸, ［国内会議］
• 線虫初期胚におけるmeiotic細胞質流動の駆動メカニズムと役割
  Kimura, K; Niwayama, R; Kimura, A
  定量生物学の会第４回年会, 2012年01月08日, ポスター発表
  名古屋, ［国内会議］
• 線虫C. elegansにおける中心体中央化のための中心体-オルガネラ間の相互引きモデル
  Kimura, K; Kimura, A
  第63回日本細胞生物学会大会ワークショップ2「細胞内輸送とオルガネラ」, 2011年06月27日, 口頭発表（一般）
  札幌, ［国内会議］
• Centrosome centration is driven by dynein-dependent movement of intracellular organelles along astral microtubules in C. elegans early embryos
  Kimura, K; Kimura, A
  18th International C. elegans Meeting, 2011年06月24日, ポスター発表
  Los Angeles, ［国際会議］
• Organelle movement by dynein generates microtubule pulling force for centrosome centration in C. elegans early embryo.
  Kimura, K
  4th East Asia C. elegans Meeting, 2010年07月13日, 口頭発表（一般）
  Tokyo, Japan, ［国際会議］
• 線虫C. elegansにおける中心体の中央配置機構
  Kimura, K
  第二回中心体研究会, 2010年06月26日, 口頭発表（一般）
  東京, ［国内会議］
• Dyein-dependent movement of intracellular organelles drives centrosome centration in C. elegans early embryo.
  Kimura, K
  C. elegans Development and Gene Expression, 2010年06月18日, 口頭発表（一般）
  Heidelberg, Germany, ［国際会議］
• 線虫初期胚における中心体中央配置機構としての中心体-オルガネラ間の綱引き移動モデル
  Kimura, K
  定量生物学の会第２回年会, 2010年01月10日, ポスター発表
  吹田市, ［国内会議］
• Centrosome centering requires dynein-dependent movement of intracellular organelles in C. elegans early embryo
  Kimura, K
  The 32nd Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan, 2009年12月09日, ポスター発表
  横浜, ［国内会議］
• A tug-of-war model for the centrosome centering in Caenorhabditis elegans early embryo
  Kimura, K
  The 17th International C. elegans Meeting, 2009年06月25日, 口頭発表（一般）
  Los Angeles, USA, ［国際会議］
• 線虫C.elegansの初期胚における微小管とモータータンパク質に依存した核-中心体複合体の中央配置機構の解析
  Kimura, K
  第8回核ダイナミクス研究会, 2009年06月19日, ポスター発表
  修善寺, ［国内会議］
• 線虫C. elegansの初期胚における微小管とモータータンパク質に依存した中心体の中央配置機構の解析
  Kimura, K
  定量生物学の会・遺伝研キャラバン, 2009年03月13日, ポスター発表
  三島, ［国内会議］
• 線虫C. elegansの初期胚における微小管とモータータンパク質に依存した中心体の中央配置機構の解析
  Kimura, K
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会 (BMB2008), 2008年12月09日, 口頭発表（一般）
  神戸, ［国内会議］
• A tug-of-war model for the centrosomal centration in C.elegans early embryo
  Kimura, K
  The 3rd East Asia C.elegans Meeting, 2008年04月18日, 口頭発表（一般）
  Shanghai, China, ［国際会議］
• 線虫C.elegansの初期胚における微小管に依存したオルガネラの配置
  Kimura, K
  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会(BMB2007), 2007年12月12日, ポスター発表
  横浜, ［国内会議］

• 受精に伴うキネシン活性制御機構とその生理的意義の解明
  科学研究費助成事業
  2024年04月01日 - 2027年03月31日
  木村 健二
  日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 24K09463
• 生殖細胞間の競合的な細胞質の獲得による生存競争の解明
  科学研究費助成事業
  2024年04月01日 - 2026年03月31日
  木村 健二
  日本学術振興会, 学術変革領域研究(A), 北海道大学, 24H01387
• 神経ペプチドによる細胞膜FoF1-ATP synthaseを介した器官形成機構
  科学研究費助成事業
  2022年04月01日 - 2025年03月31日
  西脇 清二; 木村 健二; 金 憲誠; 柴田 幸政
  日本学術振興会, 基盤研究(C), 関西学院大学, 22K06241
• オルガネラ間サイズネットワーク機構の実験的検証
  科学研究費助成事業
  2020年04月01日 - 2024年03月31日
  原 裕貴; 木村 健二; 久米 一規
  日本学術振興会, 基盤研究(B), 山口大学, 20H03253
• 細胞質流動が胚発生中のオルガネラ配置変化に及ぼす影響の解明
  科学研究費助成事業
  2019年04月01日 - 2022年03月31日
  木村 健二
  多くの動物の受精卵の中では、集団的な細胞質の流れ（細胞質流動）が生じることが知られている。細胞質流動には複数のタイプがあり、それぞれの流れが果たす役割の理解は未だ不十分である。本研究では、線虫の受精卵における流れる方向が確率的に変化する細胞質流動に注目し、その発生における影響を解析した。卵内に侵入した精子由来の核（精子核）の動きを調べたところ、細胞質流動により精子核が押し流されることが判明した。一部の精子核はその侵入点とは逆側まで流され、その結果として胚の前後軸極性が通常とは逆転することがわかった。今回の結果から細胞質流動の確率的なふるまいが細胞極性の決定に寄与することが明らかとなった。
  日本学術振興会, 基盤研究(C), 関西学院大学, 19K06681
• 核の細胞内配置を制御するメカニズムは細胞種ごとにどのような違いがあるのか？
  科学研究費助成事業
  2014年04月01日 - 2016年03月31日
  木村 健二
  本研究は細胞内における多様な核配置戦略を解明することを目的として、線虫C. elegansの受精卵と多核化した腸細胞における核の動態を解析した。これまではモータータンパク質・ダイニンが核配置の主要な制御因子として知られていた。今回、（１）卵に侵入した精子核が受精卵内で生じる細胞質流動を利用して適切な配置をとること、（２）多核化した腸細胞における核配置にはモータータンパク質・キネシンが関与する可能性が見出された。本研究により、新規な核の配置機構の存在が明らかになってきた。
  日本学術振興会, 若手研究(B), 国立遺伝学研究所, 26840072