研究活動情報

• Genetic introgression among charr species in the Shiretoko Peninsula, Japan.
  Tetsuya Ozawa; Takashi Kanbe; Tetsu Yatsuyanagi; Hitoshi Araki
  Journal of fish biology, 2026年07月02日, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Introgressive hybridization is an important source of genetic variation and a driver of evolutionary diversification in fishes. On the Shiretoko Peninsula, a UNESCO World Natural Heritage site in northern Japan, the Southern Asian Dolly Varden Salvelinus curilus (SADV) is the only charr species present in most rivers. However, previous studies have suggested that some SADV individuals possess mitochondrial DNA (mtDNA) from the White-spotted charr Salvelinus leucomaenis, implying historical introgression. To quantify and map this introgression, we estimated the proportion of non-SADV mtDNA (%noSADV) across 40 rivers using environmental DNA (eDNA) metabarcoding. Because White-spotted charr were absent from the study rivers, %noSADV could be interpreted as reflecting mitochondrial introgression within SADV populations. Indeed, %noSADV estimates from eDNA concentrations were strongly correlated with those from conventional catch surveys in 10 rivers (r = 0.96), supporting the reliability of the eDNA-based estimates. In addition, a minor proportion of Salvelinus eDNA was assigned to Salvelinus malma, a charr species that does not occur in Japan. Tissue-based analysis confirmed that some SADV individuals indeed carried S. malma mtDNA, suggesting an additional, independent introgression event. Across the 40 rivers, %noSADV ranged 0%-97.2%, including 0%-0.47% assigned to S. malma mtDNA. Generalized linear models indicated significant positive associations between %noSADV assigned to S. leucomaenis and both latitude and forest coverage. These findings demonstrate that (1) results from mtDNA-based analyses of taxa in which genetic introgression occurs frequently should be interpreted with caution and (2) in cases where one of the donor species is absent, eDNA metabarcoding can be a useful tool for estimating the population-level proportion of introgression over broad spatial scales and uncovering hidden evolutionary legacies in freshwater fishes. This approach provides valuable insights for evolutionary ecology and conservation genetics, especially for rare fish species in regions where conventional, tissue-based surveys are logistically constrained.
• Large-scale environmental DNA survey reveals niche axes of a regional coastal fish community
  Yutaka Osada; Masaki Miya; Hitoshi Araki; Hideyuki Doi; Akihide Kasai; Reiji Masuda; Toshifumi Minamoto; Satoquo Seino; Teruhiko Takahara; Satoshi Yamamoto; Hiroki Yamanaka; Mitsuhiro Aizu-Hirano; Keiichi Fukaya; Takehiko Fukuchi; Ryo O. Gotoh; Masakazu Hori; Midori Iida; Tomohito Imaizumi; Tadashi Kajita; Takashi Kanbe; Tanaka Kenta; Yumi Kobayashi; Tomohiko Matsuura; Hiroki Mizumoto; Hiroyuki Motomura; Hiroaki Murakami; Kenji Nohara; Shin-ichiro Oka; Tetsuya Sado; Hiroshi Senou; Koichi Shibukawa; Tomoki Sunobe; Hiroshi Takahashi; Koji Takayama; Katsuhiko Tanaka; Hisashi Yamakawa; Satoru Yokoyama; Seokjin Yoon; Michio Kondoh
  SCIENTIFIC REPORTS, 16, 1, 2026年02月16日
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Exploring the Dynamics of Environmental DNA: Effects of Early Developmental Stage and Physiological State in Chum Salmon
  Masayuki K. Sakata; Takashi Kanbe; Shunpei Sato; Hitoshi Araki
  Environmental DNA, 2025年06月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Loss of Photoperiodic Control of Juvenile-Hormone Signaling Pathway Underlying the Evolution of Obligate Parthenogenesis in the Pea Aphid.
  Asano Ishikawa; Hiroki Gotoh; Kota Ogawa; Takashi Kanbe; Shin-Ichi Akimoto; Toru Miura
  Zoological science, 42, 2, 186, 195, 2025年04月, ［査読有り］, ［国内誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Phenotypic plasticity, the ability of organisms to change their phenotype depending on external stimuli, enables their survival in fluctuating environments. An extreme example is polyphenism, in which a single genotype produces discrete phenotypes in response to external cues. However, under persistent environmental conditions, natural selection would favor reduced plasticity. This study focused on the loss of reproductive polyphenism and revealed the underlying mechanism in the pea aphid Acyrthosiphon pisum. Although most populations exhibit reproductive polyphenism, known as cyclical parthenogenesis, with a seasonal shift between parthenogenesis and sexual reproduction, some exhibit obligate parthenogenesis. To investigate the potential role of changes in the environmental sensitivity of the juvenile hormone (JH) pathway during this evolutionary shift, we analyzed the expression of genes involved in JH synthesis and degradation. We found that five of seven JH-related genes exhibited photoperiodic responses in one cyclical-parthenogenetic strain, whereas none of them responded to photoperiod in the two obligate-parthenogenetic strains. Notably, CYP15A and JHEH genes, which are involved in the final step of JH synthesis and in the initiation of JH degradation, respectively, showed strong photoperiodic responses in the cyclical-parthenogenetic strain but showed no responses in the obligate-parthenogenetic strains. Acetone treatment induces male production in obligate-parthenogenetic strains, suggesting that the developmental pathway for male production remains functional in these strains. These results suggest that the loss of the photoperiodic response in both JH synthesis and degradation pathways is a key mechanism underlying the elimination of the sexual phase, resulting in the loss of reproductive polyphenism in aphids.
• Human activity-associated establishment of invasive mink population estimated using environmental DNA
  Toshihiro Takaba; Masayuki K. Sakata; Takashi Kanbe; Takashi Mitsuzuka; Shouko Inoue; Hiroki Mizumoto; Takahiro Nobetsu; Hitoshi Araki
  Biological Invasions, Springer Science and Business Media LLC, 2024年07月31日, ［査読有り］
  研究論文（学術雑誌）
• Environmental DNA unveils deep phylogeographic structure of a freshwater fish
  Tetsu Yatsuyanagi; Takashi Kanbe; Kazuya Fujii; Shouko Inoue; Hitoshi Araki
  Molecular Ecology, Wiley, 2024年04月, ［査読有り］
  研究論文（学術雑誌）, Abstract
  
  Phylogeography bears an important part in ecology and evolution. However, current phylogeographic studies are largely constrained by limited numbers of individual samples. Using an environmental DNA (eDNA) assay for phylogeographic analyses, this study provides detailed information regarding the history of Siberian stone loach Barbatula toni, a primary freshwater fish across the whole range of Hokkaido, Japan. Based on an eDNA metabarcoding on 293 river water samples, we detected eDNA from B. toni in 189 rivers. A total of 51 samples, representing the entire island, were then selected from the B. toni eDNA‐positive sample set for the subsequent analyses. To elucidate the phylogeographic structure of B. toni, newly developed eDNA metabarcoding primers (Barba‐cytb‐F/R) were applied to these samples, specifically targeting their haplotypic variation in cytochrome b. After a bioinformatic processing to mitigate haplotypic false positives, a total of 50 eDNA haplotypes were identified. Two regionally restricted, genetically distinct lineages of the species were revealed as a result of phylogeographic analyses on the haplotypes and tissue‐derived DNA from B. toni. According to a molecular clock analysis, they have been genetically isolated for at least 1.5 million years, suggesting their ancient origin and colonisation of Hokkaido, presumably in the glacial periods. These results demonstrate how freshwater fishes can alter their distributions over evolutionary timescales and how eDNA assay can deepen our understanding of phylogeography.
• Co-occurrence patterns of endangered Sakhalin taimen and introduced rainbow trout in Hokkaido, Japan, inferred by environmental DNA metabarcoding
  Takashi Kanbe; Hiroki Mizumoto; Takashi Mitsuzuka; Nobuyoshi Nakajima; Hitoshi Araki
  Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems, 33, 12, 1492, 1500, 2023年12月, ［査読有り］
  研究論文（学術雑誌）
• Application of eDNA methods to evaluate abundance and reproduction of winter-breeding freshwater mussels (Buldowskia iwakawai) in the Ishikari River floodplain
  J. Wu; J. N. Negishi; H. Izumi; T. Kanbe; H. Mizumoto; H. Araki
  Hydrobiologia, 2023年, ［査読有り］
  研究論文（学術雑誌）
• 北海道の渓流魚を対象とした治山ダムの改良効果の検証：長期モニタリングによる検証と環境 DNA の活用可能性
  速水 将人; 石山 信雄; 水本 寛基; 神戸 崇; 下田 和孝; 三坂 尚行; 卜部 浩一; 長坂 晶子; 長坂 有; 小野 理; 荒木 仁志; 中嶋 信美; 福島 路生
  応用生態工学, 24, 1, 61, 73, 応用生態工学会, 2021年07月28日, ［査読有り］
  日本語, 河川上流域に多数設置された治山ダムは，渓流や森林の荒廃を防ぐ重要な役割を果たす一方で，渓流魚の河川内の自由な移動を阻害している．こうした状況に鑑み，河川生態系の保全を目的とした改良事業（魚道の設置，堤体の切り下げ）が国内の多くの治山ダムで実施されている．本研究では，北海道 3 河川に設置された治山ダムを対象に，魚道設置と切り下げによるダム改良工事が，その上下流の渓流魚類相に与える影響について，改良工事前後で行われた採捕調査によって検証した．同時に，ダム改良後の採捕結果と環境 DNA メタバーコーディングによる魚類相推定結果を比較し，治山ダム改良事業における環境 DNA メタバーコーディングを用いた魚類相推定の有効性を検討した．採捕調査の結果，治山ダムの改良事業によって，遡河回遊魚であるアメマスとサクラマスのダム上流への移動を可能にし，10 年後においても効果が確認された．環境 DNA メタバーコーディングでは，採捕された全 9 種に加え，採捕では確認されなか ったニジマスの計 10 種が検出され，治山ダム上下流に設定した各調査地点における遡河回遊魚のアメマス・サクラマスや，ハナカジカの採捕結果との一致率は 70-90 ％であった．環境 DNA メタバーコーディングを治山ダム改良事業に適用する場合，評価対象魚種の特性や過去の採捕記録を考慮する必要はあるものの，改良前の治山ダムにおける魚類の遡上阻害の推定や，改良後の河川の魚類相・生息状況の推定に有効であることが示唆された．但し，治山ダムの切り下げを例にとると，遡上阻害の改善効果が維持される期間は工法によって異なる可能性もあり，正確な評価には様々な河川・工法を対象としたさらなる研究の蓄積が必要である．
• Efficient PCR Amplification Protocol of Nuclear Microsatellites for Exuviae-Derived DNA of Cicada, Yezoterpnosia nigricosta
  Keisuke Yumoto; Takashi Kanbe; Yoko Saito; Shingo Kaneko; Yoshiaki Tsuda
  Frontiers in Insect Science, 1, Frontiers Media SA, 2021年07月05日, ［査読有り］
  研究論文（学術雑誌）, Although insect exuviae-based genetics is challenging, it can be a valuable method for obtaining reliable DNA resources by non-invasive sampling. This approach is especially effective when the target species is endangered/endemic or when sampling the adult is difficult. One example is cicadas, which during molt leave their exoskeletons on tree trunks, making them easily collectable. While cicada exuviae-derived DNA has previously been employed for mitochondrial DNA sequencing, this study aimed to develop a reliable method for the PCR amplification of nuclear microsatellite loci from cicada exuviae derived DNA for application in molecular ecology, conservation and population genetics. Five different PCR amplification protocols were performed, and the fragment patterns compared with those obtained using DNA extracted from adult individuals. Moreover, the relationship between the freshness of the exuviae and genotyping success was evaluated. TaKaRa LA Taq provided the best performance in the PCR amplification of DNA isolated from cicada exuviae and the electropherogram showed a clear fragment pattern that was equivalent to that obtained from the DNA extracted from the adult individual. This result suggests that cicada exuviae-derived DNA can be amplified by PCR and that multiple independent loci of nuclear DNA microsatellite markers can be easily genotyped. This study demonstrates that fresh cicada exuviae provide high quality DNA, which can be used for microsatellite genotyping. The methods developed in this study are applicable not only for cicada but other insect species for which exuviae are available. Thus, this study can make a significant contribution to insect sciences.
• Heat shock alters pea aphid– Buchnera interactions: negative allometry of gene densities
  Nousheen Parven; Izumi Yao; Takashi Kanbe; Shin‐ichi Akimoto
  Entomologia Experimentalis et Applicata, 169, 5, 462, 471, Wiley, 2021年05月, ［査読有り］
  研究論文（学術雑誌）
• Isolation and characterization of microsatellites from a cicada, Yezoterpnosia nigricosta (Hemiptera: Cicadidae), distributed in subarctic and cool temperate forests
  Takashi Kanbe; Keisuke Yumoto; Uchu Yamakawa; Souta Nakajima; Shingo Kaneko; Keiko Kitamura; Yoko Saito; Yoshiaki Tsuda
  GENES & GENETIC SYSTEMS, 95, 5, 269, 273, 2020年10月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Suppression of autumnal sexual morph production in spring by a seasonal timer in an aphid
  Naoki Matsuda; Takashi Kanbe; Jun Endo; Shin‐Ichi Akimoto; Hideharu Numata
  Physiological Entomology, 45, 2-3, 103, 109, Wiley, 2020年09月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Evaluation of an Environmental DNA Method as a Potential Tool for Monitoring Salmonid Fishes in the Wild
  Hitoshi Araki; Hiroki Mizumoto; Takashi Kanbe; Shunpei Sato
  Technical Report, 15, 164, 167, North Pacific Anadromous Fish Commission, 2019年12月
  研究論文（学術雑誌）
• Environmental DNA monitoring for short-term reproductive migration of endemic anadromous species, Shishamo smelt (Spirinchus lanceolatus)
  YATSUYANAGI Tetsu; ISHIDA Ryotaro; SAKATA Masayuki K; KANBE Takashi; MIZUMOTO Hiroki; KOBAYASHI Yumi; KAMADA Shoko; NAMBA Satoko; NII Hisaya; MINAMOTO Toshifumi; ARAKI Hitoshi
  Environmental DNA, (in press), 2, 130, 139, Wiley, 2019年11月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Spatiotemporal distribution of juvenile chum salmon in Otsuchi Bay, Iwate, Japan, inferred from environmental DNA
  Yuki Minegishi; Marty Kwok-Shing Wong; Takashi Kanbe; Hitoshi Araki; Tomomi Kashiwabara; Minoru Ijichi; Kazuhiro Kogure; Susumu Hyodo
  PLOS ONE, 14, 9, e0222052, 2019年09月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Ongoing localized extinctions of stream-dwelling white-spotted charr populations in small dammed-off habitats of Hokkaido Island, Japan
  Kentaro Morita; Genki Sahashi; Masaki Miya; Shouko Kamada; Takashi Kanbe; Hitoshi Araki
  Hydrobiologia, 840, 1, 207, 213, 2019年09月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Establishing an environmental DNA method to detect and estimate the biomass of Sakhalin taimen, a critically endangered Asian salmonid
  Hiroki Mizumoto; Hirokazu Urabe; Takashi Kanbe; Michio Fukushima; Hitoshi Araki
  Limnology, 19, 2, 219, 227, 2018年04月01日, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• IV-5. Environmental DNA for salmonid studies
  Araki Hitoshi; Kanbe Takashi; Mizumoto Hiroki; Kamada Shoko; Sato Shunpei
  NIPPON SUISAN GAKKAISHI, 84, 5, 936, 936, 2018年, ［査読有り］
  日本語, 研究論文（学術雑誌）
• Transgenerational seasonal timer for suppression of sexual morph production in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum
  Naoki Matsuda; Takashi Kanbe; Shin-ichi Akimoto; Hideharu Numata
  JOURNAL OF INSECT PHYSIOLOGY, 101, 1, 6, 2017年08月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• A new species of Megoura (Hemiptera, Aphididae) from Japan
  Wonhoon Lee; Takashi Kanbe; Shin-ichi Akimoto
  ZOOKEYS, 417, 417, 37, 44, 2014年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Male-specific flight apparatus development in Acyrthosiphon pisum (Aphididae, Hemiptera, Insecta): comparison with female wing polyphenism
  Kota Ogawa; Asano Ishikawa; Takashi Kanbe; Shin-ichi Akimoto; Toru Miura
  ZOOMORPHOLOGY, 131, 3, 197, 207, 2012年09月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Unique haplotypes in ant-attended aphids and widespread haplotypes in non-attended aphids
  Izumi Yao; Takashi Kanbe
  ECOLOGY AND EVOLUTION, 2, 9, 2315, 2324, 2012年09月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Juvenile hormone titre and related gene expression during the change of reproductive modes in the pea aphid
  A. Ishikawa; K. Ogawa; H. Gotoh; T. K. Walsh; D. Tagu; J. A. Brisson; C. Rispe; S. Jaubert-Possamai; T. Kanbe; T. Tsubota; T. Shiotsuki; T. Miura
  INSECT MOLECULAR BIOLOGY, 21, 1, 49, 60, 2012年02月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• アブラムシの寄主レース分化と無性生殖集団の起源 (特集 アブラムシ生物学の新しい流れ)
  秋元 信一; 神戸 崇
  植物防疫, 66, 2, 71, 76, 日本植物防疫協会, 2012年02月
  日本語
• Collecting Records of Reesa vespulae (Coleoptera, Dermestidae) in Japan
  KITANO Takanobu; HIRANO Yukihiko; KANBE Takashi
  1, 2, 273, 274, 2011年12月31日
  英語
• Allelic and genotypic diversity in long-term asexual populations of the pea aphid, Acyrthosiphon pisum in comparison with sexual populations
  Takashi Kanbe; Shin-Ichi Akimoto
  MOLECULAR ECOLOGY, 18, 5, 801, 816, 2009年03月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）

• セミ科昆虫の遺伝構造と森林樹木の分布変遷との関係
  湯本 景将; 加藤 朱音; 田中 啓介; 神戸 崇; 小井土 凜々子; 海野 太一; 兼子 伸吾; 齊藤 陽子; Michael P Nobis; 津田 吉晃, 日本森林学会大会発表データベース, 133, 151, 2022年05月30日
  日本森林学会, 英語
• edna2021: The fourth annual meeting of The eDNA Society “Species distributions, and beyond”
  Hitoshi Araki; Takashi Kanbe; Hiroki Yamanaka; Yuki Minegishi; Noriyuki Koizumi, Environmental DNA, 4, 3, 487, 491, 2022年05月
  速報，短報，研究ノート等（学術雑誌）
• 地域～広域スケールでみるエゾハルゼミの生活史特性および遺伝構造
  湯本 景将; 神戸 崇; 加藤 朱音; 兼子 伸吾; 池田 紘士; 齊藤 陽子; Michael Nobis P.; 津田 吉晃, 日本森林学会大会発表データベース, 132, 145, 2021年05月24日
  生物種の分布域はこれまでの地史的・気候的イベントとそれに関連する種の進化史や生態学的特性などにより決定づけられる。近年の気候変動により、生態系で重要な役割を果たす昆虫の分布域も変化しており、遺伝的多様性や生態系への影響が懸念される。そこで本研究では気候変動が森林生態系に与える影響について森林性昆虫の視点から評価することを目的に、日本では冷温帯・山岳域に生息するエゾハルゼミ(Yezoterpnosia nigricosta)に着目した。まず、長野県上田市菅平高原で2018～2020年の5～7月にかけて3年間抜け殻を利用した生態調査を行い、本種の生活史特性および地域スケールの遺伝構造について評価した。また北海道から九州までサンプル採集を行い、本種が分布する冷温帯林との関係性を考慮しつつ、ミトコンドリアDNAおよび核DNAに基づいて広域スケールの遺伝構造も評価した。その結果、地域スケールでは年次集団間で遺伝的分化が示唆された。また広域スケールでは大きく2つのクラスターに分かれる遺伝構造をもち、西日本集団の遺伝的多様性が高かったことから、生息環境である冷温帯林と関係した分布変遷が示唆された。, 日本森林学会, 日本語
• 冷温帯森林性昆虫エゾハルゼミの生活史特性と遺伝的集団動態の解明
  湯本 景将; 神戸 崇; 加藤 朱音; 齊藤 陽子; 津田 吉晃, 日本森林学会大会発表データベース, 131, 623, 2020年05月25日
  近年、生息地の変化や気候変動などにより、生態系の基盤となる昆虫が劇的に減少しており(Sánchez‐Bayo and Wyckhuys 2019)、国土の約７割が森林である日本においても、森林生態系への影響が懸念される。しかし、森林性昆虫がこれまでどのように森林とともに歴史を歩み、気候変動が進行する今後どういう挙動を示すか、さらにそれが森林生態系にどのように影響するかは未だ不明である。そこで本研究では、気候変動影響評価を見据えた森林性昆虫と森林生態系との関係を解明することを目的に、環境指標生物であるセミ科昆虫の1種で、日本では冷温帯や山岳域の森林に生息するエゾハルゼミに着目した。まず、筑波大学山岳科学センター菅平高原実験所内で2018年および2019年の5月から7月にかけて2年間、生態調査および抜け殻DNAを用いたシーズン1週間ごとの遺伝的多様性の変動評価を行った。また北海道から九州まで疎であるが広域スケールの遺伝構造も評価した。これら結果に本種が分布する冷温帯林の分布変遷も考慮しながら、エゾハルゼミの生活史特性、遺伝構造や集団動態の歴史を評価し、森林生態系との関係について考察する。, 日本森林学会, 日本語
• 長野県菅平高原におけるエゾハルゼミの生活史特性および遺伝構造の評価
  湯本 景将; 神戸 崇; 加藤 朱音; 山川 宇宙; 今井 亮介; 齊藤 陽子; 津田 吉晃, 日本森林学会大会発表データベース, 130, 423, 2019年05月27日
  森林生態系に対する温暖化影響予測の先行研究の多くは樹木を対象としており、樹木と深い関係にある森林性昆虫に着目した研究はほとんどない。しかし、森林生態系全体の過去から将来までの分布変遷および気候変動への適応を評価するためには、そこに生息する様々な生物種の集団動態を考慮する必要がある。特に、森林生態系の中で重要なニッチを占める森林性昆虫とその宿主(樹木)との関係を把握することは必須であると考えられる。そこで、本研究では森林性昆虫であり、樹木に強く依存して成長を行うセミの1種であるセミ科ハルゼミ属エゾハルゼミ(Terpnosia nigricosta)に着目した。エゾハルゼミの生活史特性および遺伝構造を評価するために、筑波大学山岳科学センター菅平高原実験所内で5月から7月にかけて出現パターンを調査し、また抜け殻を採取した。そして抜け殻からのDNA抽出およびPCR増幅法を確立し、マイクロサテライト遺伝子型データから、エゾハルゼミの遺伝的多様性を調査週ごと、抜け殻のついていた樹木ごとに比較し、さらに他地域集団との遺伝的分化についても調べた。これらからエゾハルゼミと樹木の関係性について考察する。, 日本森林学会, 日本語
• 環境DNAから探る,日本固有種シシャモの遡上と分布
  八柳哲; 神戸崇; 水本寛基; 小林由美; 坂田雅之; 源利文; 石田良太郎; 新居久也; 荒木仁志, 日本生態学会大会講演要旨(Web), 66th, 2019年
• 環境DNAを通して観る北海道の水圏生物
  荒木仁志; 神戸崇; 水本寛基; 鎌田祥子; 南波聡子; 宮正樹, 水産海洋研究, 81, 4, 307, 2017年11月10日
  日本語
• 環境DNAを通して観る,北の海の生物と多様性
  荒木仁志; 神戸崇; 水本寛基; 鎌田祥子; 南波聡子; 矢部衞; 大橋優季; 池田実; 峰岸有紀; 佐土哲也; 宮正樹, 日本魚類学会年会講演要旨, 50th, 139, 2017年09月14日
  日本語
• 環境DNAを用いた生物フロンティアの開拓
  荒木仁志; 神戸崇; 鎌田頌子; 宮正樹; 佐土哲也; 池田実; 佐藤行人; 峰岸有紀; 永野優季; 矢部衞, 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web), 18th, ROMBUNNO.O‐1E‐1 (WEB ONLY), 2016年08月25日
  日本語
• 環境DNA研究の実践と課題:生態学フロンティアへの挑戦
  荒木仁志; 神戸崇; 鎌田頌子; 源利文; 佐藤行人; 宮正樹, 日本生態学会大会講演要旨(Web), 63th, T20‐1 (WEB ONLY), 2016年
  日本語
• 北の海に未知なる生命と生物多様性を探る
  荒木仁志; 宮正樹; 池田実; 矢部衞; 永野優季; 神戸崇; 鎌田頌子; 佐土哲也; 峰岸有紀; 佐藤行人; 佐藤俊平; MASLENIKOV Katherine, 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web), 17th, ROMBUNNO.W6‐2 (WEB ONLY), 2015年08月20日
  日本語

• セミの脱皮殻を利用した非侵襲的なDNA採取法
  神戸 崇
  日本昆虫学会第78回大会, 2018年09月10日, 日本語, 口頭発表（一般）
  ［国内会議］
• 遺伝子解析におけるセミの脱皮殻の利用可能性
  神戸 崇
  日本応用動物昆虫学会・日本昆虫学会共催北海道支部大会, 2013年01月22日, 日本語, 口頭発表（一般）
  札幌市, ［国内会議］
• Evolution of asexuality in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum
  Kanbe T; Akimoto S
  第24回国際昆虫学会議, 2012年08月22日, 英語, 口頭発表（招待・特別）
  Daegu, KOREA, ［招待講演］, ［国際会議］
• 核遺伝子の解析から推定された無性生殖型アブラムシの起源
  神戸 崇; 秋元信一
  日本昆虫学会第71回大会, 2011年09月18日, 日本語, 口頭発表（一般）
  長野県松本市, ［国内会議］
• 無性生殖型エンドウヒゲナガアブラムシは交雑起源か―核遺伝子の解析から―
  神戸 崇
  日本アブラムシ研究会第1回研究集会, 2011年08月05日, 日本語, 口頭発表（招待・特別）
  愛知県岡崎市, ［招待講演］, ［国内会議］

• 2018年08月 - 現在
  環境DNA学会
• 日本半翅類学会
• 日本進化学会
• 日本応用動物昆虫学会
• 日本昆虫学会

• みんなで調べた札幌市のセミ（リーフレット）
  札幌市, 神戸 崇; 佐野正和, 2012年10月, ［その他］
• 「チョウとガ」が超わかる本
  北海道大学総合博物館, 大原昌宏; 佐野正和; 神戸 崇, 2011年06月, ［その他］
• 昼行性のレピドプテラ・夜行性のレピドプテラ（ポスター）
  北海道大学総合博物館, 北海道大学総合博物館; 神戸 崇, 2011年, ［その他］

• 行動の可塑性を示すアリ随伴アブラムシのエピジェネティック制御機構
  科学研究費助成事業
  2026年04月01日 - 2030年03月31日
  八尾 泉; 神戸 崇
  日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 26K09415
• アブラムシにおける有性生殖系統・無性生殖系統共存域における進化動態
  科学研究費助成事業
  2019年04月01日 - 2023年03月31日
  秋元 信一; 神戸 崇
  令和３年度は，研究計画におけるクローン間の進化動態を探るために，制御された環境下でのクローン間の競争実験を行なった．有性生殖クローンと無性生殖クローンの共存地域においては，両クローン間の競争が同一植物上で生じると予測される．どのような条件下で，いずれのクローンが優勢となるのかを明らかにするためには，クローン間競争がどのように生じ，どのようなクローンが競争に勝利を納めるのかを明らかにする必要がある．
  ２クローンの増殖競争の実態を正確に把握するために，まず，寒天―切葉法を開発し，寒天上においたソラマメの葉上に２頭の異なるクローンの成虫を置くことによって，15日間の増殖を観察した．この実験では，クローンの識別が必須であるため、色彩突然変異（黄色）が生じたクローンとその元のクローン（緑色）を実験に供した．各クローンから１頭の成虫を用いた１頭区，同一クローンの２頭の成虫を含む２頭区，黄色と緑クローンから１頭ずつの成虫を含む混合区を準備し，毎日のアブラムシの増殖パターンを記録した．この結果，クローンは他のクローンを識別可能であり，自分自身のクローンと他クローンの密度を把握して，成長と産子のパターンを決めていることが明らかとなった．とりわけ，あるクローンが先に増殖すると，先手を取られたクローンは繁殖率を低下させることが明らかになった．
  有性生殖クローンと無性生殖クローンとが共存する地域では，早春に無性生殖クローンが先に繁殖を始める．このために，植物の質の良いスペースを無性生殖クローンが独占し，一方，卵から孵化した後に繁殖を開始する有性生殖クローンは増殖の遅れから，無性生殖クローンと共存した場合に圧倒的に不利となる．この結果，有性生殖クローンが生存可能となるためには，無性生殖クローンとは異なる株に寄生することが必要となると予測された．
  日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 19K06848
• 世代を超えて時間を測るアブラムシの季節タイマーの謎を解く
  科学研究費助成事業
  2017年06月30日 - 2020年03月31日
  沼田 英治; 神戸 崇
  エンドウヒゲナガアブラムシにおいて、短日による両性生殖虫の出現を抑制する季節タイマーは、世代数でなく日数を数えること、温度に依存するが日長には依存しないことがわかった。
  札幌と京都における自然の日長と温度での飼育により、季節タイマーには、温暖な春に起こり得る両性生殖虫の誘導を防ぐという生態的な意義があることが明らかになった。
  季節タイマーが切れた後に短日で育った個体では、季節タイマーが切れる前の個体や、切れた後に長日で育った個体と比べ、ヒストン修飾関連遺伝子の発現量が増加した。さらにオープンクロマチン領域の解析結果から、生殖多型の決定や季節タイマーにエピジェネティック修飾が関与すると考えられた。
  日本学術振興会, 挑戦的研究(萌芽), 京都大学, 17K19264
• セミの抜け殻から集団構造と大発生のメカニズムを探る
  科学研究費助成事業（若手研究(B)）
  2015年04月 - 2019年03月
  神戸 崇
  日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金
• エンドウヒゲナガアブラムシの無性生殖系統におけるMeselson Effectの検証
  グローバルCOE若手研究者公募研究助成
  2008年11月 - 2009年03月
  神戸 崇
  北海道大学グローバルCOEプログラム「統合フィールド環境科学の教育研究拠点形成」, 研究代表者, 競争的資金

• 2011年 - 2011年
  北海道大学総合博物館 企画展示「LEPDOPTERA 空を舞う昆虫たち チョウとガの世界」（7月2日～10月2日）
  展示制作