研究者基本情報

• 農学博士, 北海道大学

• https://researchmap.jp/read0166892

• https://jglobal.jst.go.jp/detail?JGLOBAL_ID=200901021558279031
• http://www.agr.hokudai.ac.jp/biseibutsu/

• 200901021558279031

• 応用微生物学
• Microbial Biotechnology
• Microbial Physiology
• Applied Microbiology

• ライフサイエンス, 応用微生物学

研究活動情報

• 2019年09月, 公益財団法人 秋山記念生命科学振興財団, 2019年度秋山財団賞
  腸内細菌叢の制御における胆汁酸の役割に関する微生物生理学的研究
  横田 篤
• 2019年07月, 日本乳酸菌学会, 日本乳酸菌学会賞
  乳酸菌・ビフィズス菌・腸内細菌と胆汁酸の相互作用に関する総合的研究
  横田 篤
• 2012年10月, 公益社団法人 日本生物工学会, 生物工学功績賞
  有用物質生産菌の中枢代謝強化に関する基盤研究
  横田 篤
• 1996年03月, 公益社団法人 日本農芸化学会, 農芸化学奨励賞
  エネルギー代謝変異による有用微生物の育種に関する研究
  横田 篤

• A unique tetrasaccharide-containing anchor glycolipid of lipoteichoic acid is commonly found in Lactobacillus gasseri and Lactobacillus paragasseri.
  Tsukasa Shiraishi; Ryosuke Kutomi; Yamaha Sato; Akihito Endo; Satoru Fukiya; Satoshi Takahashi; Atsushi Yokota; Shin-Ichi Yokota
  Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 89, 9, 1382, 1390, 2025年08月23日, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Lipoteichoic acid (LTA) is a cell surface molecule with physiologically important roles in Gram-positive bacteria. Previously, we identified a novel tetrasaccharide-containing anchor glycolipid in the Lactobacillus gasseri JCM 1131T LTA. However, it is unclear whether this tetrasaccharide-containing anchor glycolipid structure is characteristic of JCM 1131T alone or is commonly found in other L. gasseri-related isolates. Lactobacillus paragasseri has been proposed as a new species, separated from the L. gasseri. In the present study, we characterized the chemical structures of LTA from 2 strains of L. gasseri and 4 strains of L. paragasseri. All 6 strains shared a polymer comprising repeating units of glycerophosphate with partial D-alanine substitutions, as well as L. gasseri JCM 1131T. Anchor glycolipid structure suggested that all strains shared a tetrasaccharide-containing glyceroglycolipid with 2 and 3 acyl groups. Focusing on LTA from L. gasseri and L. paragasseri species, a tetrasaccharide-containing anchor glycolipid is a specific feature.
• Bile acid is a responsible host factor for high-fat diet-induced gut microbiota alterations in rats: proof of the "bile acid hypothesis".
  Masamichi Watanabe; Yuki Fujita; Masahito Hagio; Satoshi Ishizuka; Yoshitoshi Ogura; Tetsuya Hayashi; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota
  Bioscience of microbiota, food and health, 44, 2, 110, 121, 2025年, ［国内誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, High-fat diet (HFD)-induced alterations in gut microbiota may be associated with host pathophysiology, prompting increased interest in elucidating their causal relationships. However, the mechanisms by which HFDs induce these alterations require further clarification. Our previous study using cholic acid (CA)-fed rats suggested that bile acid drives the HFD-induced microbiota alterations as a host factor, a concept termed the "bile acid hypothesis". We analyzed the alterations in the cecal microbiota and bile acid composition in HFD-fed rats and compared the results with those of rats on a CA-supplemented diet. In both cases, the concentrations of total bile acids, including highly bactericidal deoxycholic acid (DCA), increased, concomitant with the increases in the Firmicutes (Bacillota)/Bacteroidetes (Bacteroidota) ratio. Operational taxonomic units (OTUs), accounting for 63.39% of the cecal microbiota of control rats, showed a significant correlation with the total bile acid concentration in HFD-fed rats. A DCA sensitivity test conducted in Firmicutes isolates, corresponding to the predominant OTUs from the HFD-fed rats, exhibited significantly higher DCA resistance compared with Bacteroidetes. The top 12 most abundant OTUs of Firmicutes and Bacteroidetes showing positive or negative correlations with the total bile acid concentration were selected from the HFD-fed rats, and their dynamics were compared with those in the CA-fed rats. Of the 24 OTUs, 18, which constituted 48.28% of the cecal population in the control rats, were altered in the same direction (increase or decrease) in the HFD- and CA-supplemented diet groups. Therefore, approximately half of the cecal populations in the control rats were affected by bile acids, substantiating the bile acid hypothesis microbiologically and quantitatively.
• Improved fermentative gamma-aminobutyric acid production from glucose by the inactivation of respiratory chain components NDH-I and Cytbo₃ in Escherichia coli.
  Hiroki Wakahara; Takuya Mizokoshi; Kotaro Yamagami; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Tomoya Maeda
  Journal of bioscience and bioengineering, 2024年09月07日, ［国内誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Gamma-aminobutyric acid (GABA), which is synthesized from l-glutamic acid via glutamate decarboxylase (Gad), is used as food, supplements, and biodegradable plastics. Our previous study demonstrated an Escherichia coli mutant (ΔΔ) strain, lacking type I NADH dehydrogenase (NDH-I) and cytochrome bo3 oxidase (Cytbo3), produced 7 g/L glutamic acid on MS1 glucose-minimal medium. In this study, the ΔΔ strain was used for improving GABA production. A plasmid (pMBL19-gadB') expressing a mutated E. coli GadB (Glu89Gln/Δ452-466), retaining activity at neutral pH, was introduced into the ΔΔ strain and its parent strain (W1485). The ΔΔ strain carrying pMBL19-gadB' exhibited a twofold increase in GABA production compared to the W1485 strain carrying pMBL19-gadB'. Deleting the C-terminal (Δ471-511) of GadC antiporter in the ΔΔ strain further improved GABA yield by 1.5 g/L when cultured in MS1 glucose-minimal medium. On the other hand, a large amount of glutamic acid produced by the ΔΔ strain was not fully converted to GABA, likely due to the inhibition of GadB activity by the accumulation of acetic acid. Although there is room for improvement, these results indicate the efficacy of the ΔNDH-IΔCytbo3 double mutation in augmenting GABA production.
• Contributions of the anaplerotic reaction enzymes pyruvate carboxylase and phosphoenolpyruvate carboxylase to l-lysine production in Corynebacterium glutamicum.
  Akinobu Shinmori; Zhen Guo; Tomoya Maeda; Satoru Fukiya; Masaru Wada; Atsushi Yokota
  Journal of bioscience and bioengineering, 2024年06月27日, ［国内誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Anaplerotic reactions catalyzed by pyruvate carboxylase (PC) and phosphoenolpyruvate carboxylase (PEPC) have important roles in the production of l-lysine to replenish oxaloacetic acid (OAA) in Corynebacterium glutamicum. However, the relative contributions of these enzymes to l-lysine production in C. glutamicum are not fully understood. In this study, using a parent strain (P) carrying a feedback inhibition-resistant aspartokinase with the T311I mutation, we constructed a PC gene-deleted mutant strain (PΔPC) and a PEPC gene-deleted mutant strain (PΔPEPC). Although the growth of both mutant strains was comparable to the growth of strain P, the maximum l-lysine production in strains PΔPC and PΔPEPC decreased by 14% and 49%, respectively, indicating that PEPC strongly contributed to OAA supply. l-Lysine production in strain PΔPC slightly decreased during the logarithmic phase, while production during the early stationary phase was comparable to production in strain P. By contrast, strain PΔPEPC produced l-lysine in an amount comparable to the production of strain P during the logarithmic phase; l-lysine production after the early stationary phase was completely stopped in strain PΔPEPC. These results indicate that OAA is supplied by both PC and PEPC during the logarithmic phase, while only PEPC can continuously supply OAA after the logarithmic phase.
• Synthesis and quantification of short-chain fatty acid esters of hydroxy fatty acids in rat intestinal contents and fecal samples by LC-MS/MS
  Siddabasave Gowda B. Gowda; Fengjue Hou; Divyavani Gowda; Hitoshi Chiba; Kentaro Kawakami; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Shu-Ping Hui
  Analytica Chimica Acta, 1288, 342145, 342145, Elsevier BV, 2024年02月
  研究論文（学術雑誌）
• Development of an improved colonization system for human-derived Bifidobacterium longum subsp. longum in conventional mice through the feeding of raffinose or 1-kestose.
  Mina Shimada; Youhei Kawase; Kei Sonoyama; Yoshitoshi Ogura; Tetsuya Hayashi; Atsushi Yokota; Satoru Fukiya
  Bioscience of microbiota, food and health, 43, 2, 110, 119, 2024年, ［国内誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, How bifidobacteria colonize and survive in the intestine is not fully understood. The administration of bifidobacteria to conventional mice can be used to evaluate their ability to colonize the intestine in the presence of endogenous gut microbiota. However, human-derived bifidobacteria do not readily colonize the intestines of conventional mice, and although colonization by Bifidobacterium breve UCC2003 has been achieved, the viability of such populations requires improvement. Therefore, we aimed to establish a colonization system with human-derived bifidobacteria of high viability in conventional mice using Bifidobacterium longum subsp. longum 105-A. Lactose, raffinose, and 1-kestose were identified as the preferred carbohydrate sources for the growth of this strain in culture. The administration of B. longum 105-A to conventional BALB/c mice fed these carbohydrates showed that diets containing 6% (w/w) raffinose or 1-kestose facilitated colonization with >108 colony-forming units/g feces for 2 weeks. The population of this strain was more stable in the raffinose-fed group than in the 1-kestose-fed group. The ingestion of these prebiotics had a greater impact on the composition of the microbiota than the administration of B. longum 105-A. The ingestion of these prebiotics also increased the fecal concentrations of organic acids, which was indicative of greater intestinal fermentation. Collectively, we established a colonization system for B. longum 105-A with high viability in conventional mice by feeding the mice raffinose or 1-kestose. This system should be useful for elucidation of the mechanisms of colonization and survival of bifidobacteria in the intestines in the presence of the endogenous gut microbiota.
• Bifidobacterium longum subsp.longumにおける1-Kestose代謝メカニズムの解明
  難波 有希; 倉持 碧海; 山口 颯人; 吉田 佳鼓; 後藤 恭宏; 門田 吉弘; 栃尾 巧; 小椋 義俊; 林 哲也; 前田 智也; 横田 篤; 吹谷 智
  日本乳酸菌学会誌, 33, 2, 120, 120, 日本乳酸菌学会, 2022年06月
  日本語
• 腸内での二次胆汁酸生成と腸内細菌叢変化・疾病の誘導
  吹谷 智; 横田 篤; 石塚 敏
  機能性食品と薬理栄養, 15, 4, 229, 234, (株)インフォノーツパブリッシング, 2022年02月, ［招待有り］
  日本語, 研究論文（学術雑誌）
• Diversification of a Fucosyllactose Transporter within the Genus Bifidobacterium.
  Miriam N Ojima; Yuya Asao; Aruto Nakajima; Toshihiko Katoh; Motomitsu Kitaoka; Aina Gotoh; Junko Hirose; Tadasu Urashima; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Maher Abou Hachem; Mikiyasu Sakanaka; Takane Katayama
  Applied and environmental microbiology, 88, 2, e0143721, 2022年01月25日, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Human milk oligosaccharides (HMOs), which are natural bifidogenic prebiotics, were recently commercialized to fortify formula milk. However, HMO assimilation phenotypes of bifidobacteria vary by species and strain, which has not been fully linked to strain genotype. We have recently shown that specialized uptake systems, particularly for the internalization of major HMOs (fucosyllactose [FL]), are associated with the formation of a Bifidobacterium-rich gut microbial community. Phylogenetic analysis revealed that FL transporters have diversified into two clades harboring four clusters within the Bifidobacterium genus, but the underpinning functional diversity associated with this divergence remains underexplored. In this study, we examined the HMO consumption phenotypes of two bifidobacterial species, Bifidobacterium catenulatum subsp. kashiwanohense and Bifidobacterium pseudocatenulatum, both of which possess FL-binding proteins that belong to phylogenetic clusters with unknown specificities. Growth assays, heterologous gene expression experiments, and HMO consumption analyses showed that the FL transporter type from B. catenulatum subsp. kashiwanohense JCM 15439T conferred a novel HMO uptake pattern that includes complex fucosylated HMOs (lacto-N-fucopentaose II and lacto-N-difucohexaose I/II). Further genomic landscape analyses of FL transporter-positive bifidobacterial strains revealed that the H-antigen- or Lewis antigen-specific fucosidase gene(s) and FL transporter specificities were largely aligned. These results suggest that bifidobacteria have acquired FL transporters along with the corresponding gene sets necessary to utilize the imported HMOs. Our results provide insight into the species- and strain-dependent adaptation strategies of bifidobacteria in HMO-rich environments. IMPORTANCE The gut of breastfed infants is generally dominated by health-promoting bifidobacteria. Human milk oligosaccharides (HMOs) from breast milk selectively promote the growth of specific taxa such as bifidobacteria, thus forming an HMO-mediated host-microbe symbiosis. While the coevolution of humans and bifidobacteria has been proposed, the underpinning adaptive strategies employed by bifidobacteria require further research. Here, we analyzed the divergence of the critical fucosyllactose (FL) HMO transporter within Bifidobacterium. We have shown that the diversification of the solute-binding proteins of the FL transporter led to uptake specificities of fucosylated sugars ranging from simple trisaccharides to complex hexasaccharides. This transporter and the congruent acquisition of the necessary intracellular enzymes allow bifidobacteria to consume different types of HMOs in a predictable and strain-dependent manner. These findings explain the adaptation and proliferation of bifidobacteria in the competitive and HMO-rich infant gut environment and enable accurate specificity annotation of transporters from metagenomic data.
• Comparative Genomic and Physiological Analysis against Clostridium scindens Reveals Eubacterium sp. c-25 as an Atypical Deoxycholic Acid Producer of the Human Gut Microbiota.
  Isaiah Song; Yasuhiro Gotoh; Yoshitoshi Ogura; Tetsuya Hayashi; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota
  Microorganisms, 9, 11, 2021年10月29日, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, The human gut houses bile acid 7α-dehydroxylating bacteria that produce secondary bile acids such as deoxycholic acid (DCA) from host-derived bile acids through enzymes encoded by the bai operon. While recent metagenomic studies suggest that these bacteria are highly diverse and abundant, very few DCA producers have been identified. Here, we investigated the physiology and determined the complete genome sequence of Eubacterium sp. c-25, a DCA producer that was isolated from human feces in the 1980s. Culture experiments showed a preference for neutral to slightly alkaline pH in both growth and DCA production. Genomic analyses revealed that c-25 is phylogenetically distinct from known DCA producers and possesses a multi-cluster arrangement of predicted bile-acid inducible (bai) genes that is considerably different from the typical bai operon structure. This arrangement is also found in other intestinal bacterial species, possibly indicative of unconfirmed 7α-dehydroxylation capabilities. Functionality of the predicted bai genes was supported by the induced expression of baiB, baiCD, and baiH in the presence of cholic acid substrate. Taken together, Eubacterium sp. c-25 is an atypical DCA producer with a novel bai gene cluster structure that may represent an unexplored genotype of DCA producers in the human gut.
• Bifidobacterium longum subsp.longumにおける1-Kestose代謝メカニズムの解明
  難波 有希; 山口 颯人; 吉田 佳鼓; 後藤 恭宏; 門田 吉弘; 栃尾 巧; 小椋 義俊; 林 哲也; 横田 篤; 吹谷 智
  日本生物工学会大会講演要旨集, 2021年, 230, 230, (公社)日本生物工学会, 2021年10月
  日本語
• Dietary raffinose ameliorates hepatic lipid accumulation induced by cholic acid via modulation of enterohepatic bile acid circulation in rats.
  Kenta Maegawa; Haruka Koyama; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Koichiro Ueda; Satoshi Ishizuka
  The British journal of nutrition, 127, 11, 1, 10, 2021年07月14日, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Enterohepatic circulation of 12α-hydroxylated (12αOH) bile acid (BA) is enhanced depending on the energy intake in high-fat diet-fed rats. Such BA metabolism can be reproduced using a diet supplemented with cholic acid (CA), which also induces simple steatosis, without inflammation and fibrosis, accompanied by some other symptoms that are frequently observed in the condition of non-alcoholic fatty liver in rats. We investigated whether supplementation of the diet with raffinose (Raf) improves hepatic lipid accumulation induced by the CA-fed condition in rats. After acclimation to the AIN-93-based control diet, male Wistar rats were fed diets supplemented with a combination of Raf (30 g/kg diet) and/or CA (0·5 g/kg diet) for 4 weeks. Dietary Raf normalised hepatic TAG levels (two-way ANOVA P < 0·001 for CA, P = 0·02 for Raf and P = 0·004 for interaction) in the CA-supplemented diet-fed rats. Dietary Raf supplementation reduced hepatic 12αOH BA concentration (two-way ANOVA P < 0·001 for CA, P = 0·003 for Raf and P = 0·03 for interaction). The concentration of 12αOH BA was reduced in the aortic and portal plasma. Raf supplementation increased acetic acid concentration in the caecal contents (two-way ANOVA P = 0·001 as a main effect). Multiple regression analysis revealed that concentrations of aortic 12αOH BA and caecal acetic acid could serve as predictors of hepatic TAG concentration (R2 = 0·55, P < 0·001). However, Raf did not decrease the secondary 12αOH BA concentration in the caecal contents as well as the transaminase activity in the CA diet-fed rats. These results imply that dietary Raf normalises hepatic lipid accumulation via suppression of enterohepatic 12αOH BA circulation.
• Primary 12α-Hydroxylated Bile Acids Lower Hepatic Iron Concentration in Rats.
  Shota Hori; Minako Satake; Ohji Kohmoto; Ryo Takagi; Kazufumi Okada; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Satoshi Ishizuka
  The Journal of nutrition, 151, 3, 523, 530, 2021年03月11日, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, BACKGROUND: Primary 12α-hydroxylated bile acids (12αOH BAs) enhance intestinal iron uptake due to their ability ex vivo to chelate iron. However, no information is available on their role in vivo, especially in the liver. OBJECTIVES: To investigate the effects and mechanisms of primary 12αOH BAs on hepatic iron concentration in vivo. METHODS: Male Wistar King A Hokkaido male rats (WKAH/HkmSlc) rats aged 4-5 weeks were fed a control diet or a diet with cholic acid (CA; 0.5 g/kg diet), the primary 12αOH BA, for 2 weeks (Study 1) or 13 weeks (Study 2). In Study 3, rats fed the same diets were given drinking water either alone or containing vancomycin (200 mg/L) for 6 weeks. The variables measured included food intake (Studies 1-3), bile acid profiles (Studies 1 and 3), hepatic iron concentration (Studies 1-3), fecal iron excretion (Studies 1 and 2), iron-related liver gene expression (Studies 2 and 3), and plasma iron-related factors (Studies 2 and 3). RESULTS: In Study 1, CA feed reduced the hepatic iron concentration (-16%; P = 0.005) without changing food intake or fecal iron excretion. In Study 2, we found a significant increase in the aortic plasma concentration of lipocalin 2 (LCN2; +65%; P < 0.001), an iron-trafficking protein. In Study 3, we observed no effect of vancomycin treatment on the CA-induced reduction of hepatic iron concentration (-32%; P < 0.001), accompanied by increased plasma LCN2 concentration (+72%; P = 0.003), in the CA-fed rats despite a drastic reduction in the secondary 12αOH BA concentration (-94%; P < 0.001) in the aortic plasma. CONCLUSIONS: Primary 12αOH BAs reduced the hepatic iron concentration in rats. LCN2 may be responsible for the hepatic iron-lowering effect of primary 12αOH BAs by transporting iron out of the liver.
• Next-generation prebiotic promotes selective growth of bifidobacteria, suppressing Clostridioides difficile
  Rika Hirano; Mikiyasu Sakanaka; Kazuto Yoshimi; Naohisa Sugimoto; Syogo Eguchi; Yuko Yamauchi; Misaki Nara; Shingo Maeda; Yuta Ami; Aina Gotoh; Takane Katayama; Noriho Iida; Tamotsu Kato; Hiroshi Ohno; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Mamoru Nishimoto; Motomitsu Kitaoka; Hiroyuki Nakai; Shin Kurihara
  Gut Microbes, 13, 1, Informa UK Limited, 2021年01月01日
  研究論文（学術雑誌）
• Methionine utilization by bifidobacteria: possible existence of a reverse transsulfuration pathway.
  Masaru Wada; Satoru Fukiya; Azusa Suzuki; Nanae Matsumoto; Miki Matsuo; Atsushi Yokota
  Bioscience of microbiota, food and health, 40, 1, 80, 83, 2021年, ［国内誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Although bifidobacteria are already widely used as beneficial microbes with health-promoting effects, their amino acid utilization and metabolism are not yet fully understood. Knowledge about the metabolism of sulfur-containing amino acids in bifidobacteria is especially limited. In this study, we tested the methionine utilization ability of several bifidobacterial strains when it was the sole available sulfur source. Although bifidobacteria have long been predominantly considered to be cysteine auxotrophs, we showed that this is not necessarily the case.
• 12α-Hydroxylated bile acid induces hepatic steatosis with dysbiosis in rats
  Ja Young Lee; Hidehisa Shimizu; Masahito Hagio; Satoru Fukiya; Masamichi Watanabe; Yasutake Tanaka; Ga Hyun Joe; Hitoshi Iwaya; Reika Yoshitsugu; Keidai Kikuchi; Misaki Tsuji; Nanako Baba; Takuma Nose; Koji Tada; Taketo Hanai; Shota Hori; Akari Takeuchi; Yumiko Furukawa; Bungo Shirouchi; Masao Sato; Tadasuke Ooka; Yoshitoshi Ogura; Tetsuya Hayashi; Atsushi Yokota; Satoshi Ishizuka
  Biochimica et Biophysica Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids, 1865, 12, 2020年12月
  研究論文（学術雑誌）
• Chemical Labeling Assisted Detection and Identification of Short Chain Fatty Acid Esters of Hydroxy Fatty Acid in Rat Colon and Cecum Contents
  Siddabasave Gowda B. Gowda; Divyavani Gowda; Chongsheng Liang; Yonghan Li; Kentaro Kawakami; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Hitoshi Chiba; Shu-Ping Hui
  Metabolites, 10, 10, 398, 398, MDPI AG, 2020年10月08日
  研究論文（学術雑誌）, Branched fatty acid esters of hydroxy fatty acids (FAHFAs) are novel endogenous lipids with important physiological functions in mammals. We previously identified a new type of FAHFAs, named short-chain fatty acid esterified hydroxy fatty acids (SFAHFAs), with acetyl or propyl esters of hydroxy fatty acids of carbon chains, C ≥ 20. However, sensitive determination of SFAHFAs is still a challenge, due to their high structural similarity and low abundance in biological samples. This study employs one-step chemical derivatization following total lipid extraction using 2-dimethylaminoethylamine (DMED) for enhanced detection of SFAHFAs. The labeled extracts were subjected to ultrahigh performance liquid chromatography coupled to linear ion trap quadrupole-Orbitrap mass spectrometry (UHPLC/LTQ-Orbitrap MS). Our results demonstrated that the detection sensitivities of SFAHFAs increased after DMED labeling, and is highly helpful in discovering six additional novel SFAHFAs in the cecum and colon contents of WKAH/HKmSlc rats fed with normal and high-fat diet (HFD). The identified DMED labeled SFAHFAs were characterized by their detailed MS/MS analysis, and their plausible fragmentation patterns were proposed. The concentrations of SFAHFAs were significantly reduced in the cecum of HFD group compared to the control. Hence, the proposed method could be a promising tool to apply for the enhanced detection of SFAHFAs in various biological matrices, which in turn facilitate the understanding of their sources, and physiological functions of these novel lipids.
• Identification of short‐chain fatty acid esters of hydroxy fatty acids (SFAHFAs) in a murine model by nontargeted analysis using ultra‐high‐performance liquid chromatography/linear ion trap quadrupole‐Orbitrap mass spectrometry
  Siddabasave Gowda B. Gowda; Chongsheng Liang; Divyavani Gowda; Fengjue Hou; Kentaro Kawakami; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Hitoshi Chiba; Shu‐Ping Hui
  Rapid Communications in Mass Spectrometry, 34, 17, Wiley, 2020年09月15日
  研究論文（学術雑誌）
• Association between 12α-hydroxylated bile acids and hepatic steatosis in rats fed a high-fat diet.
  Shota Hori; Takayuki Abe; Dong Geun Lee; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Nao Aso; Bungo Shirouchi; Masao Sato; Satoshi Ishizuka
  The Journal of nutritional biochemistry, 83, 108412, 108412, 2020年05月20日, ［査読有り］, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, High-fat (HF) diet induces hepatic steatosis that is a risk factor for noncommunicable diseases such as obesity, type 2 diabetes and cardiovascular disease. Previously, we found that HF feeding in rats increases the excretion of fecal bile acids (BAs), specifically 12α-hydroxylated (12αOH) BAs. Although the liver is the metabolic center in our body, the association between hepatic steatosis and 12αOH BAs in HF-fed rats is unclear. Thus, we investigated extensively BA composition in HF-fed rats and evaluated the association between hepatic steatosis and 12αOH BAs. Acclimated male inbred WKAH/HkmSlc rats were divided into two groups and fed either control or HF diet for 8 weeks. Feeding HF diet increased hepatic triglyceride and total cholesterol concentrations, which correlated positively with 12αOH BAs concentrations but not with non-12αOH BAs in the feces, portal plasma and liver. Accompanied by the increase in 12αOH BAs, the rats fed HF diet showed increased fat absorption and higher mRNA expression of liver Cidea. The enhancement of 12αOH BA secretion may contribute to hepatic steatosis by the promotion of dietary fat absorption and hepatic Cidea mRNA expression. The increase in 12αOH BAs was associated with enhanced liver cholesterol 7α-hydroxylase (Cyp7a1) and sterol 12α-hydroxylase (Cyp8b1) mRNA expression. There was a significant increase in 7α-hydroxycholesterol, a precursor of BAs, in the liver of HF-fed rats. Altogether, these data suggest that the HF diet increases preferentially 12αOH BAs synthesis by utilizing the accumulated hepatic cholesterol and enhancing mRNA expression of Cyp7a1 and Cyp8b1 in the liver.
• Application of Recombinase-Based In Vivo Expression Technology to Bifidobacterium longum subsp. longum for Identification of Genes Induced in the Gastrointestinal Tract of Mice.
  Hiroka Koguchi; Natsumi Ishigami; Mikiyasu Sakanaka; Kako Yoshida; Sayaka Hiratou; Mina Shimada; Satoru Fukiya; Kei Sonoyama; Atsushi Yokota
  Microorganisms, 8, 3, 2020年03月13日, ［査読有り］, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Bifidobacteria are one of the major components in human gut microbiota and well-known as beneficial microbes. However, clarification of commensal mechanisms of bifidobacteria in the intestines is still ongoing, especially in the presence of the gut microbiota. Here, we applied recombinase-based in vivo expression technology (R-IVET) using the bacteriophage P1 Cre/loxP system to Bifidobacterium longum subsp. longum 105-A (B. longum 105-A) to identify genes that are specifically expressed in the gastrointestinal tract of conventionally raised mice. Oral administration of the genomic DNA library of B. longum 105-A to conventionally raised mice resulted in the identification of 73 in vivo-induced genes. Four out of seven tested genes were verified in vivo-specific induction at least in the cecum by quantitative reverse transcription PCR. Although there is still room for improvement of the system, our findings can contribute to expanding our understanding of the commensal behavior of B. longum in the gut ecosystem.
• Untargeted lipidomic analysis of plasma from high fat diet-induced obese rats using UHPLC- linear trap quadrupole -Orbitrap MS.
  Siddabasave Gowda B Gowda; Zi-Jun Gao; Zhen Chen; Takayuki Abe; Shota Hori; Satoru Fukiya; Satoshi Ishizuka; Atsushi Yokota; Hitoshi Chiba; Shu-Ping Hui
  Analytical sciences : the international journal of the Japan Society for Analytical Chemistry, 2020年01月17日, ［査読有り］, ［国内誌］
  英語
• Administration of Cholic Acid Inhibits Equol Production from Daidzein in Mice.
  Hiroko Yoshioka; Masamichi Watanabe; Fumio Nanba; Toshio Suzuki; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Toshiya Toda
  Journal of nutritional science and vitaminology, 66, 6, 571, 576, 2020年, ［国内誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Equol (Eq) is a metabolite of soy isoflavone daidzein (De) produced by the intestinal microbiota. The clinical effectiveness of soy isoflavone is considered to depend on the individual ability of Eq production. Previous studies have demonstrated that habitual dietary patterns may influence the production of Eq. For example, high Eq producers consumed less fat as a percentage of energy than low Eq producers. However, the inhibitory factors of Eq production are unknown. Recently, it was reported that bile acids induced by high-fat diet consumption may be a host-related factor controlling the composition of the intestinal microbiota. In this study, we investigated the effect of cholic acid (CA) administration, a mimic of the microbiota altered by a high-fat diet, on Eq production in mice. CA administration significantly decreased the levels of the De metabolites Eq, dihydrodaidzein, and O-desmethylangolensin in the serum of mice. However, CA administration did not affect the total molar concentration of De and its metabolites. Moreover, CA administration increased the levels of secondary bile acids, particularly deoxycholic acid (DCA), which has strong antibacterial activity in the cecum contents of mice. Thus, CA administration may increase the levels of DCA, a secondary bile acid, resulting in inhibition of Eq production. These findings may help to reveal the factors inhibiting Eq production and enhance the clinical effectiveness of isoflavone intake.
• Evolutionary adaptation in fucosyllactose uptake systems supports bifidobacteria-infant symbiosis.
  Mikiyasu Sakanaka; Morten Ejby Hansen; Aina Gotoh; Toshihiko Katoh; Keisuke Yoshida; Toshitaka Odamaki; Hiroyuki Yachi; Yuta Sugiyama; Shin Kurihara; Junko Hirose; Tadasu Urashima; Jin-Zhong Xiao; Motomitsu Kitaoka; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Leila Lo Leggio; Maher Abou Hachem; Takane Katayama
  Science advances, 5, 8, eaaw7696, 2019年08月, ［査読有り］, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, The human gut microbiota established during infancy has persistent effects on health. In vitro studies have suggested that human milk oligosaccharides (HMOs) in breast milk promote the formation of a bifidobacteria-rich microbiota in infant guts; however, the underlying molecular mechanism remains elusive. Here, we characterized two functionally distinct but overlapping fucosyllactose transporters (FL transporter-1 and -2) from Bifidobacterium longum subspecies infantis. Fecal DNA and HMO consumption analyses, combined with deposited metagenome data mining, revealed that FL transporter-2 is primarily associated with the bifidobacteria-rich microbiota formation in breast-fed infant guts. Structural analyses of the solute-binding protein (SBP) of FL transporter-2 complexed with 2'-fucosyllactose and 3-fucosyllactose, together with phylogenetic analysis of SBP homologs of both FL transporters, highlight a unique adaptation strategy of Bifidobacterium to HMOs, in which the gain-of-function mutations enable FL transporter-2 to efficiently capture major fucosylated HMOs. Our results provide a molecular insight into HMO-mediated symbiosis and coevolution between bifidobacteria and humans.
• The membrane phospholipid cardiolipin plays a pivotal role in bile acid adaptation by Lactobacillus gasseri JCM1131T.
  Shinji Kato; Haruhi Tobe; Hiroki Matsubara; Mariko Sawada; Yasuko Sasaki; Satoru Fukiya; Naoki Morita; Atsushi Yokota
  Biochimica et biophysica acta. Molecular and cell biology of lipids, 1864, 3, 403, 412, 2019年03月, ［査読有り］, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Bile acids exhibit strong antimicrobial activity as natural detergents, and are involved in lipid digestion and absorption. We investigated the mechanism of bile acid adaptation in Lactobacillus gasseri JCM1131T. Exposure to sublethal concentrations of cholic acid (CA), a major bile acid in humans, resulted in development of resistance to otherwise-lethal concentrations of CA by this intestinal lactic acid bacterium. As this adaptation was accompanied by decreased cell-membrane damage, we analyzed the membrane lipid composition of L. gasseri. Although there was no difference in the proportions of glycolipids (~70%) and phospholipids (~20%), adaptation resulted in an increased abundance of long-sugar-chain glycolipids and a 100% increase in cardiolipin (CL) content (to ~50% of phospholipids) at the expense of phosphatidylglycerol (PG). In model vesicles, the resistance of PG vesicles to solubilization by CA increased with increasing CL/PG ratio. Deletion of the two putative CL synthase genes, the products of which are responsible for CL synthesis from PG, decreased the CL content of the mutants, but did not affect their ability to adapt to CA. Exposure to CA restored the CL content of the two single-deletion mutants, likely due to the activities of the remaining CL synthase. In contrast, the CL content of the double-deletion mutant was not restored, and the lipid composition was modified such that PG predominated (~45% of total lipids) at the expense of glycolipids. Therefore, CL plays important roles in bile acid resistance and maintenance of the membrane lipid composition in L. gasseri.
• Ingestion of difructose anhydride III partially suppresses the deconjugation and 7α-dehydroxylation of bile acids in rats fed with a cholic acid-supplemented diet.
  Lee DG; Hori S; Kohmoto O; Kitta S; Yoshida R; Tanaka Y; Shimizu H; Takahashi K; Nagura T; Uchino H; Fukiya S; Yokota A; Ishizuka S
  Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 83, 7, 1329, 1335, 2019年03月, ［査読有り］, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Difructose anhydride III (DFAIII) is a prebiotic involved in the reduction of secondary bile acids (BAs). We investigated whether DFAIII modulates BA metabolism, including enterohepatic circulation, in the rats fed with a diet supplemented with cholic acid (CA), one of the 12α-hydroxylated BAs. After acclimation, the rats were fed with a control diet or a diet supplemented with DFAIII. After 2 weeks, each group was further divided into two groups and was fed diet with or without CA supplementation at 0.5 g/kg diet. BA levels were analyzed in aortic and portal plasma, liver, intestinal content, and feces. As a result, DFAIII ingestion reduced the fecal deoxycholic acid level via the partial suppression of deconjugation and 7α-dehydroxylation of BAs following CA supplementation. These results suggest that DFAIII suppresses production of deoxycholic acid in conditions of high concentrations of 12α-hydroxylated BAs in enterohepatic circulation, such as obesity or excess energy intake. Abbreviation: BA: bile acid; BSH: bile salt hydrolase; CA: cholic acid; DCA: deoxycholic acid; DFAIII: difructose anhydride III; MCA: muricholic acid; MS: mass spectrometry; NCDs: non-communicable diseases; LC: liquid chromatography; SCFA: short-chain fatty acid; TCA: taurocholic acid; TCDCA: taurochenodeoxycholic acid; TDCA: taurodeoxycholic acid; TUDCA: tauroursodeoxychlic acid; TαMCA: tauro-α-muricholic acid; TβMCA: tauro-β-muricholic acid; TωMCA: tauro-ω-muricholic acid.
• Engineering of Corynebacterium glutamicum as a prototrophic pyruvate-producing strain: Characterization of a ramA-deficient mutant and its application for metabolic engineering.
  Kataoka N; Vangnai AS; Pongtharangkul T; Yakushi T; Wada M; Yokota A; Matsushita K
  Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 83, 2, 372, 380, 2019年02月, ［査読有り］, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, To construct a prototrophic Corynebacterium glutamicum strain that efficiently produces pyruvate from glucose, the effects of inactivating RamA, a global regulator responsible for activating the oxidative tricarboxylic acid (TCA) cycle, on glucose metabolism were investigated. ΔramA showed an increased specific glucose consumption rate, decreased growth, comparable pyruvate production, higher formation of lactate and acetate, and lower accumulation of succinate and 2-oxoglutarate compared to the wild type. A significant decrease in pyruvate dehydrogenase complex activity was observed for ΔramA, indicating reduced carbon flow to the TCA cycle in ΔramA. To create an efficient pyruvate producer, the ramA gene was deleted in a strain lacking the genes involved in all known lactate- and acetate-producing pathways. The resulting mutant produced 161 mM pyruvate from 222 mM glucose, which was significantly higher than that of the parent (89.3 mM; 1.80-fold).
• A Transposon Mutagenesis System for Bifidobacterium longum subsp. longum Based on an IS3 Family Insertion Sequence, ISBlo11.
  Mikiyasu Sakanaka; Shingo Nakakawaji; Shin Nakajima; Satoru Fukiya; Arisa Abe; Wataru Saburi; Haruhide Mori; Atsushi Yokota
  Applied and environmental microbiology, 84, 17, 2018年09月01日, ［査読有り］, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Bifidobacteria are a major component of the intestinal microbiota in humans, particularly breast-fed infants. Therefore, elucidation of the mechanisms by which these bacteria colonize the intestine is desired. One approach is transposon mutagenesis, a technique currently attracting much attention because, in combination with next-generation sequencing, it enables exhaustive identification of genes that contribute to microbial fitness. We now describe a transposon mutagenesis system for Bifidobacterium longum subsp. longum 105-A (JCM 31944) based on ISBlo11, a native IS3 family insertion sequence. To build this system, xylose-inducible or constitutive bifidobacterial promoters were tested to drive the expression of full-length or a truncated form at the N terminus of the ISBlo11 transposase. An artificial transposon plasmid, pBFS12, in which ISBlo11 terminal inverted repeats are separated by a 3-bp spacer, was also constructed to mimic the transposition intermediate of IS3 elements. The introduction of this plasmid into a strain expressing transposase resulted in the insertion of the plasmid with an efficiency of >103 CFU/μg DNA. The plasmid targets random 3- to 4-bp sequences, but with a preference for noncoding regions. This mutagenesis system also worked at least in B. longum NCC2705. Characterization of a transposon insertion mutant revealed that a putative α-glucosidase mediates palatinose and trehalose assimilation, demonstrating the suitability of transposon mutagenesis for loss-of-function analysis. We anticipate that this approach will accelerate functional genomic studies of B. longum subsp. longumIMPORTANCE Several hundred species of bacteria colonize the mammalian intestine. However, the genes that enable such bacteria to colonize and thrive in the intestine remain largely unexplored. Transposon mutagenesis, combined with next-generation sequencing, is a promising tool to comprehensively identify these genes but has so far been applied only to a small number of intestinal bacterial species. In this study, a transposon mutagenesis system was established for Bifidobacterium longum subsp. longum, a representative health-promoting Bifidobacterium species. The system enables the identification of genes that promote colonization and survival in the intestine and should help illuminate the physiology of this species.
• 乳酸桿菌の対数期に膜小胞上に局在するリポテイコ酸
  白石 宗; 横田 伸一; 佐藤 耶舞羽; 伊藤 利章; 吹谷 智; 山本 聡; 佐藤 豊孝; 横田 篤
  日本乳酸菌学会誌, 29, 2, 116, 116, 日本乳酸菌学会, 2018年07月
  日本語
• Lipoteichoic acids are embedded in cell walls during logarithmic phase, but exposed on membrane vesicles in Lactobacillus gasseri JCM 1131T
  T. Shiraishi; S. Yokota; Y. Sato; T. Ito; S. Fukiya; S. Yamamoto; T. Sato; A. Yokota
  Beneficial Microbes, 9, 4, 653, 662, Wageningen Academic Publishers, 2018年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Isolation of six novel 7-oxo- or urso-type secondary bile acid-producing bacteria from rat cecal contents
  Sarinya Tawthep; Satoru Fukiya; Ja-Young Lee; Masahito Hagio; Yoshitoshi Ogura; Tetsuya Hayashi; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 124, 5, 514, 522, 2017年11月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Bifidobacterium bifidum Extracellular Sialidase Enhances Adhesion to the Mucosal Surface and Supports Carbohydrate Assimilation
  Keita Nishiyama; Yuji Yamamoto; Makoto Sugiyama; Takashi Takaki; Tadasu Urashima; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Nobuhiko Okada; Takao Mukai
  MBIO, 8, 5, 2017年09月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Comprehensive evaluation of the bactericidal activities of free bile acids in the large intestine of humans and rodents
  Masamichi Watanabe; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF LIPID RESEARCH, 58, 6, 1143, 1152, 2017年06月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Lactobacillus gasseri種に共通する種特異的なリポテイコ酸の化学構造
  久富 亮佑; 白石 宗; 佐藤 耶舞羽; 森田 直樹; 吹谷 智; 佐藤 豊孝; 横田 篤; 横田 伸一
  日本乳酸菌学会誌, 28, 2, 123, 123, 日本乳酸菌学会, 2017年06月
  日本語
• Pyruvate dehydrogenase complex regulator (PdhR) gene deletion boosts glucose metabolism in Escherichia coli under oxygen-limited culture conditions
  Soya Maeda; Kumiko Shimizu; Chie Kihira; Yuki Iwabu; Ryuichi Kato; Makoto Sugimoto; Satoru Fukiya; Masaru Wada; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 123, 4, 437, 443, 2017年04月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Lactobacillus gasseri種に共通するリポテイコ酸の特異的構造
  久富 亮佑; 白石 宗; 佐藤 耶舞羽; 森田 直樹; 吹谷 智; 佐藤 豊孝; 横田 篤; 横田 伸一
  日本細菌学雑誌, 72, 1, 86, 86, 日本細菌学会, 2017年02月
  日本語
• Isolation and amino acid sequence of a dehydratase acting on d-erythro-3-hydroxyaspartate from Pseudomonas sp N99, and its application in the production of optically active 3-hydroxyaspartate
  Hiroyuki Nagano; Kana Shibano; Yu Matsumoto; Atsushi Yokota; Masaru Wada
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 81, 6, 1156, 1164, 2017年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Boosting Anaplerotic Reactions by Pyruvate Kinase Gene Deletion and Phosphoenolpyruvate Carboxylase Desensitization for Glutamic Acid and Lysine Production in Corynebacterium glutamicum
  Atsushi Yokota; Kazunori Sawada; Masaru Wada
  AMINO ACID FERMENTATION, 159, 181, 198, 2017年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Amino Acid Fermentation Preface
  Atsushi Yokota; Masato Ikeda
  AMINO ACID FERMENTATION, 159, V, VI, 2017年, ［査読有り］
  英語, 論文集(書籍)内論文
• 構造情報の蓄積から見えてきたリポテイコ酸の細菌種による構造多様性.
  白石宗; 横田伸一; 吹谷智; 横田篤
  日本乳酸菌学会誌, 28, 3, 177, 177, 2017年, ［招待有り］
  日本語, 研究論文（学術雑誌）
• Pyruvate kinase deletion as an effective phenotype to enhance lysine production in Corynebacterium glutamicum ATCC13032: Redirecting the carbon flow to a precursor metabolite
  Masaki Yanase; Tohru Aikoh; Kazunori Sawada; Kotaro Ogura; Takuya Hagiwara; Keita Imai; Masaru Wada; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 122, 2, 160, 167, 2016年08月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Effects of phosphoenolpyruvate carboxylase desensitization on glutamic acid production in Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
  Masaru Wada; Kazunori Sawada; Kotaro Ogura; Yuta Shimono; Takuya Hagiwara; Masakazu Sugimoto; Akiko Onuki; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 121, 2, 172, 177, 2016年02月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Structural diversity and biological significance of lipoteichoic acid in Gram-positive bacteria: focusing on beneficial probiotic lactic acid bacteria.
  Tsukasa Shiraishi; Shinichi Yokota; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota
  Bioscience of microbiota, food and health, 35, 4, 147, 161, 2016年, ［査読有り］, ［国内誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Bacterial cell surface molecules are at the forefront of host-bacterium interactions. Teichoic acids are observed only in Gram-positive bacteria, and they are one of the main cell surface components. Teichoic acids play important physiological roles and contribute to the bacterial interaction with their host. In particular, lipoteichoic acid (LTA) anchored to the cell membrane has attracted attention as a host immunomodulator. Chemical and biological characteristics of LTA from various bacteria have been described. However, most of the information concerns pathogenic bacteria, and information on beneficial bacteria, including probiotic lactic acid bacteria, is insufficient. LTA is structurally diverse. Strain-level structural diversity of LTA is suggested to underpin its immunomodulatory activities. Thus, the structural information on LTA in probiotics, in particular strain-associated diversity, is important for understanding its beneficial roles associated with the modulation of immune response. Continued accumulation of structural information is necessary to elucidate the detailed physiological roles and significance of LTA. In this review article, we summarize the current state of knowledge on LTA structure, in particular the structure of LTA from lactic acid bacteria. We also describe the significance of structural diversity and biological roles of LTA.
• Effect of pyruvate kinase gene deletion on the physiology of Corynebacterium glutamicum ATCC13032 under biotin-sufficient non-glutamate-producing conditions: Enhanced biomass production
  Kazunori Sawada; Masaru Wada; Takuya Hagiwara; Susumu Zen-in; Keita Imai; Atsushi Yokota
  Metabolic Engineering Communications, 2, 67, 75, Elsevier, 2015年12月01日, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Structural insights into the substrate stereospecificity of D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase from Delftia sp HT23: a useful enzyme for the synthesis of optically pure L-threo- and D-erythro-3-hydroxyaspartate
  Yu Matsumoto; Yoshiaki Yasutake; Yuki Takeda; Tomohiro Tamura; Atsushi Yokota; Masaru Wada
  APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 99, 17, 7137, 7150, 2015年09月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Activity of ERK regulates mucin 3 expression and is involved in undifferentiated Caco-2 cell death induced by 3-oxo-C-12-homoserine lactone
  Hidehisa Shimizu; Nanako Baba; Takuma Nose; Ryoko Taguchi; Shinya Tanaka; Ga-Hyun Joe; Hideaki Maseda; Nobuhiko Nomura; Masahito Hagio; Ja-Young Lee; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Satoshi Ishizuka; Hitoshi Miyazaki
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 79, 6, 937, 942, 2015年06月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Isolation and transposition properties of ISBlo11, an active insertion sequence belonging to the IS3 family, from Bifidobacterium longum 105-A
  Mikiyasu Sakanaka; Satoru Fukiya; Ryoko Kobayashi; Arisa Abe; Yosuke Hirayama; Yasunobu Kano; Atsushi Yokota
  FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, 362, 7, 2015年04月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Diet supplementation with cholic acid promotes intestinal epithelial proliferation in rats exposed to γ-radiation.
  Hagio M; Shimizu H; Joe GH; Takatsuki M; Shiwaku M; Xu H; Lee JY; Fujii N; Fukiya S; Hara H; Yokota A; Ishizuka S
  Toxicology Letters, 232, 1, 246, 252, 2015年01月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Complete Genome Sequence of Bifidobacterium longum 105-A, a Strain with High Transformation Efficiency.
  Yu Kanesaki; Hisayoshi Masutani; Mikiyasu Sakanaka; Yuh Shiwa; Takatomo Fujisawa; Yasukazu Nakamura; Atsushi Yokota; Satoru Fukiya; Tohru Suzuki; Hirofumi Yoshikawa
  Genome announcements, 2, 6, 2014年12月18日, ［査読有り］, ［国際誌］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Bifidobacterium longum 105-A shows high transformation efficiency and allows for the generation of gene knockout mutants through homologous recombination. Here, we report the complete genome sequence of strain 105-A. Genes encoding at least four putative restriction-modification systems were found in this genome, which might contribute to its transformation efficiency.
• Deoxycholic Acid Is Involved in the Proliferation and Migration of Vascular Smooth Muscle Cells
  Hidehisa Shimizu; Masahito Hagio; Hitoshi Iwaya; Ikuya Tsuneki; Ja-Young Lee; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Hitoshi Miyazaki; Hiroshi Hara; Satoshi Ishizuka
  JOURNAL OF NUTRITIONAL SCIENCE AND VITAMINOLOGY, 60, 6, 450, 454, 2014年12月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Functional analysis of bifidobacterial promoters in Bifidobacterium longum and Escherichia coli using the α-galactosidase gene as a reporter.
  Sakanaka M; Tamai S; Hirayama Y; Onodera A; Koguchi H; Kano Y; Yokota A; Fukiya S
  Journal of Bioscience and Bioengineering, 118, 5, 489, 495, 2014年11月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• The Combination of Functional Metagenomics and an Oil-Fed Enrichment Strategy Revealed the Phylogenetic Diversity of Lipolytic Bacteria Overlooked by the Cultivation-Based Method
  Takashi Narihiro; Aya Suzuki; Kazuaki Yoshimune; Tomoyuki Hori; Tamotsu Hoshino; Isao Yumoto; Atsushi Yokota; Nobutada Kimura; Yoichi Kamagata
  MICROBES AND ENVIRONMENTS, 29, 2, 154, 161, 2014年07月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Metabolic flux redirection from a central metabolic pathway toward a synthetic pathway using a metabolic toggle switch
  Yuki Soma; Keigo Tsuruno; Masaru Wada; Atsushi Yokota; Taizo Hanai
  METABOLIC ENGINEERING, 23, 175, 184, 2014年05月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Contribution of the 7β-hydroxysteroid dehydrogenase from Ruminococcus gnavus N53 to ursodeoxycholic acid formation in the human colon.
  Lee JY; Arai H; Nakamura Y; Fukiya S; Wada M; Yokota A
  Journal of Lipid Research, 54, 11, 3062, 3069, 2013年11月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase isolated from Delftia sp HT23
  Yu Matsumoto; Yoshiaki Yasutake; Yuki Takeda; Tomohiro Tamura; Atsushi Yokota; Masaru Wada
  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS, 69, Pt 10, 1131, 1134, 2013年10月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Lacto-N-biosidase Encoded by a Novel Gene of Bifidobacterium longum Subspecies longum Shows Unique Substrate Specificity and Requires a Designated Chaperone for Its Active Expression
  Haruko Sakurama; Masashi Kiyohara; Jun Wada; Yuji Honda; Masanori Yamaguchi; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Hisashi Ashida; Hidehiko Kumagai; Motomitsu Kitaoka; Kenji Yamamoto; Takane Katayama
  JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 288, 35, 25194, 25206, 2013年08月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Characterization of a Lactobacillus gasseri JCM 1131(T) Lipoteichoic Acid with a Novel Glycolipid Anchor Structure
  Tsukasa Shiraishi; Shin-ichi Yokota; Naoki Morita; Satoru Fukiya; Satoru Tomita; Naoto Tanaka; Sanae Okada; Atsushi Yokota
  APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 79, 10, 3315, 3318, 2013年05月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Development of a double-crossover markerless gene deletion system in Bifidobacterium longum: functional analysis of the α-galactosidase gene for raffinose assimilation.
  Hirayama Y; Sakanaka M; Fukuma H; Murayama H; Kano Y; Fukiya S; Yokota A
  Applied and Environmental Microbiology, 78, 14, 4984, 4994, 2012年07月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Mechanism of increased respiration in an H+-ATPase-defective mutant of Corynebacterium glutamicum
  Kazunori Sawada; Yui Kato; Keita Imai; Liyuan Li; Masaru Wada; Kazunobu Matsushita; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 113, 4, 467, 473, 2012年04月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Alterations of glucose metabolism in Escherichia coli mutants defective in respiratory-chain enzymes
  Chie Kihira; Yukari Hayashi; Naoki Azuma; Sakiko Noda; Soya Maeda; Satoru Fukiya; Masaru Wada; Kazunobu Matsushita; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 158, 4, 215, 223, 2012年04月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Is bile acid a determinant of the gut microbiota on a high-fat diet?
  Atsushi Yokota; Satoru Fukiya; Tadasuke Ooka; Yoshitoshi Ogura; Tetsuya Hayashi; Satoshi Ishizuka
  Gut Microbes, 3, 5, 455, 459, Landes Bioscience, 2012年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Technological advances in bifidobacterial molecular genetics: application to functional genomics and medical treatments.
  Satoru Fukiya; Yosuke Hirayama; Mikiyasu Sakanaka; Yasunobu Kano; Atsushi Yokota
  Bioscience of microbiota, food and health, 31, 2, 15, 25, 2012年, ［査読有り］, ［国内誌］
  英語, Bifidobacteria are well known as beneficial intestinal bacteria that exert health-promoting effects in humans. In addition to physiological and immunological investigations, molecular genetic technologies have been developed and have recently started to be applied to clarify the molecular bases of host-Bifidobacterium interactions. These technologies include transformation technologies and Escherichia coli-Bifidobacterium shuttle vectors that enable heterologous gene expression. In this context, a plasmid artificial modification method that protects the introduced plasmid from the restriction system in host bifidobacteria has recently been developed to increase transformation efficiency. On the other hand, targeted gene inactivation systems, which are vital for functional genomics, seemed far from being practically applicable in bifidobacteria. However, remarkable progress in this technology has recently been achieved, enabling functional genomics in bifidobacteria. Integrated use of these molecular genetic technologies with omics-based analyses will surely boost characterization of the molecular basis underlying beneficial effects of bifidobacteria. Applications of recombinant bifidobacteria to medical treatments have also progressed.
• Bile Acid Is a Host Factor That Regulates the Composition of the Cecal Microbiota in Rats
  K. B. M. Saiful Islam; Satoru Fukiya; Masahito Hagio; Nobuyuki Fujii; Satoshi Ishizuka; Tadasuke Ooka; Yoshitoshi Ogura; Tetsuya Hayashi; Atsushi Yokota
  GASTROENTEROLOGY, 141, 5, 1773, 1781, 2011年11月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Purification, characterization and amino acid sequence of a novel enzyme, D-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase, from Delftia sp. HT23
  Takayuki Maeda; Yuki Takeda; Tomoko Murakami; Atsushi Yokota; Masaru Wada
  JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 148, 6, 705, 712, 2010年12月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Ingestion of Epilactose, a Non-digestible Disaccharide, Improves Postgastrectomy Osteopenia and Anemia in Rats through the Promotion of Intestinal Calcium and Iron Absorption
  Takuya Suzuki; Megumi Nishimukai; Aki Shinoki; Hidenori Taguchi; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Wataru Saburi; Takeshi Yamamoto; Hiroshi Hara; Hirokazu Matsui
  JOURNAL OF AGRICULTURAL AND FOOD CHEMISTRY, 58, 19, 10787, 10792, 2010年10月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Characterization of an insertion sequence-like element, ISBlo15, identified in a size-increased cryptic plasmid pBK283 in Bifidobacterium longum BK28
  Satoru Fukiya; Tomohiko Sugiyama; Yasunobu Kano; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 110, 2, 141, 146, 2010年08月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Metabolic changes in a pyruvate kinase gene deletion mutant of Corynebacterium glutamicum ATCC 13032
  Kazunori Sawada; Susumu Zen-in; Masaru Wada; Atsushi Yokota
  METABOLIC ENGINEERING, 12, 4, 401, 407, 2010年07月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• One-pot conversion of levan prepared from Serratia levanicum NN to difructose anhydride IV by Arthrobacter nicotinovorans levan fructotransferase
  Hiroto Kikuchi; Hiroaki Sakurai; Taizo Nagura; Tsutomu Aritsuka; Fusao Tomita; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 109, 3, 240, 243, 2010年03月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• The nondigestible disaccharide epilactose increases paracellular Ca absorption via rho-associated kinase- and myosin light chain kinase-dependent mechanisms in rat small intestines.
  Suzuki T; Nishimukai M; Takechi M; Taguchi H; Hamada S; Yokota A; Ito S; Hara H; Matsui H
  Journal of agricultural and food chemistry, 58, 3, 1927, 1932, 2010年02月, ［査読有り］
• Synbiotic promotion of epithelial proliferation by orally ingested encapsulated Bifidobacterium breve and raffinose in the small intestine of rats
  Satoshi Ishizuka; Ami Iwama; Achmad Dinoto; Akarat Suksomcheep; Kohshi Maeta; Takanori Kasai; Hiroshi Hara; Atsushi Yokota
  MOLECULAR NUTRITION & FOOD RESEARCH, 53, S62, S67, 2009年05月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• A novel membrane-anchored cytochrome c-550 of alkaliphilic Bacillus clarkii K24-1U: expression, molecular features and properties of redox potential
  Ogami, Shinichi; Hijikata, Shoichi; Tsukahara, Tamotsu; Mie, Yasuhiro; Matsuno, Toshihide; Morita, Naoki; Hara, Isao; Yamazaki, Koji; Inoue, Norio; Yokota, Atsushi; Hoshino, Tamotsu; Yoshimune, Kazuaki; Yumoto, Isao
  EXTREMOPHILES, 13, 3, 491, 504, 2009年05月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Gene cloning and expression of pyridoxal 5’-phosphate-dependent L-threo-3-hydroxyaspartate dehydratase from Pseudomonas sp. T62, and characterization of the recombinant enzyme
  Tomoko Murakami; Takayuki Maeda; Atsushi Yokota; Masaru Wada
  Journal of Biochemistry, 145, 5, 661, 668, 2009年05月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Conversion of cholic acid and chenodeoxycholic acid into their 7-oxo derivatives by Bacteroides intestinalis AM-1 isolated from human feces
  Satoru Fukiya; Miki Arata; Hiroko Kawashima; Daisuke Yoshida; Maki Kaneko; Kimiko Minamida; Jun Watanabe; Yoshio Ogura; Kiyohisa Uchida; Kikuji Itoh; Masaru Wada; Susumu Ito; Atsushi Yokota
  FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, 293, 2, 263, 270, 2009年04月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Industrial production of difructose anhydride III (DFA III) from crude inulin extracted from chicory roots using Arthrobacter sp H65-7 fructosyltransferase
  Hiroto Kikuchi; Masanao Inoue; Hidetoshi Saito; Hiroaki Sakurai; Tsutomu Aritsuka; Fusao Tomita; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 107, 3, 262, 265, 2009年03月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Identification of the Cellobiose 2-Epimerase Gene in the Genome of Bacteroides fragilis NCTC 9343
  Takeshi Senoura; Hidenori Taguchi; Shigeaki Ito; Shigeki Hamada; Hirokazu Matsui; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota; Jun Watanabe; Jun Wasaki; Susumu Ito
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 73, 2, 400, 406, 2009年02月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Enhanced Valine Production in Corynebacterium glutamicum with Defective H+-ATPase and C-Terminal Truncated Acetohydroxyacid Synthase
  Masaru Wada; Nowaki Hijikata; Ryo Aoki; Nobuchika Takesue; Atsushi Yokota
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 72, 11, 2959, 2965, 2008年11月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• [FISH-flow cytometry, a new tool for the analysis of intestinal microbiota].
  Fukiya S; Yokota A
  Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society, 80, 5, 421, 425, 5, 2008年05月25日, ［査読有り］
  日本語
• Change of proteins in instant Chinese noodle by the fermentation of Lactobacillus plantarum NRIC 0380 affects the noodle quality
  Eriko Yahata; Yuki Sawatari; Hisashi Sugiyama; Akihiro Hanaoka; Atsushi Yokota; Hamo Saruyama
  Food Science and Technology Research, 14, 3, 285, 292, 2008年05月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Change of proteins in instant Chinese noodle by the fermentation of Lactobacillus plantarum NRIC 0380 affects the noodle quality
  Eriko Yahata; Yuki Sawatari; Hisashi Sugiyama; Akihiro Hanaoka; Atsushi Yokota; Haruo Saruyama
  FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY RESEARCH, 14, 3, 285, 292, 2008年05月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Distribution of L-azetidine-2-carboxylate N-acetyltransferase in yeast
  Masaru Wada; Kae Okabe; Michihiko Kataoka; Sakayu Shimizu; Atsushi Yokota; Hiroshi Takagi
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 72, 2, 582, 586, 2008年02月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Cytoplasmic proteome reference map for a glutamic acid-producing Corynebacterium glutamicum ATCC 14067
  Liyuan Li; Masaru Wada; Atsushi Yokota
  PROTEOMICS, 7, 23, 4317, 4322, 2007年12月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Alanine production in an H+-ATPase- and lactate dehydrogenase-defective mutant of Escherichia coli expressing alanine dehydrogenase
  Masaru Wada; Kotomi Narita; Atsushi Yokota
  APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 76, 4, 819, 825, 2007年09月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• A comparative proteomic approach to understand the adaptations of an H+-ATPase-defective mutant of Corynebacterium glutamicum ATCC14067 to energy deficiencies
  Liyuan Li; Masaru Wada; Atsushi Yokota
  PROTEOMICS, 7, 18, 3348, 3357, 2007年09月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Erratum: Diversity and mechanisms of alkali tolerance in lactobacilli (Applied and Environmental Microbiology (2007) 73,12, (3909-3915))
  Yuki Sawatari; Atsushi Yokota
  Applied and Environmental Microbiology, 73, 16, 5385, 2007年08月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Diversity and mechanisms of alkali tolerance in lactobacilli
  Yuki Sawatari; Atsushi Yokota
  APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 73, 12, 3909, 3915, 2007年06月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Yoghurt fermented by Lactobacillus delbrueckii subsp bulgaricus H+-ATPase-defective mutants exhibits enhanced viability of Bifidobacterium breve during storage.
  Martin Patrick Ongol; Yaki Sawatani; Yoshiko Ebina; Teruo Sone; Michiko Tanaka; Fusao Tomita; Atsushi Yokota; Kozo Asano
  INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD MICROBIOLOGY, 116, 3, 358, 366, 2007年05月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• FISH-フローサイトメトリーを用いた腸内細菌叢の迅速な分子生態学的解析
  ディノト アハマド; 吹谷 智; 横田 篤
  日本乳酸菌学会誌 = Journal of Japan Society for Lactic Acid Bacteria, 17, 2, 110, 117, 2006年12月01日
  英語
• Development of food grade media for the preparation of Lactobacillus plantarum starter culture
  Yuki Sawatari; Tomomi Hirano; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF GENERAL AND APPLIED MICROBIOLOGY, 52, 6, 349, 356, 2006年12月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Population dynamics of Bifidobacterium species in human feces during raffinose administration monitored by fluorescence in situ hybridization-flow cytometry
  Achmad Dinoto; Tatiana M. Marques; Kanta Sakamoto; Satoru Fukiya; Jun Watanabe; Susumu Ito; Atsushi Yokota
  APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 72, 12, 7739, 7747, 2006年12月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Alterations of cellular physiology in Escherichia coli in response to oxidative phosphorylation impaired by defective F-1-ATPase
  Sakiko Noda; Yuji Takezawa; Tomohiko Mizutani; Tomoaki Asakura; Eiichiro Nishiumi; Kazunori Onoe; Masaru Wada; Fusao Tomita; Kazunobu Matsushita; Atsushi Yokota
  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 188, 19, 6869, 6876, 2006年10月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Mechanism of growth inhibition by free bile acids in lactobacilli and bifidobacteria
  P Kurdi; K Kawanishi; K Mizutani; A Yokota
  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 188, 5, 1979, 1986, 2006年03月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Modulation of rat cecal microbiota by administration of raffinose and encapsulated Bifidobacterium breve
  A Dinoto; A Suksomcheep; S Ishizuka; H Kimura; S Hanada; Y Kamagata; K Asano; F Tomita; A Yokota
  APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 72, 1, 784, 792, 2006年01月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Development of fermented instant Chinese noodle using Lactobacillus plantarum
  Y Sawatari; H Sugiyama; Y Suzuki; A Hanaoka; K Saito; H Yamauchi; S Okada; A Yokota
  FOOD MICROBIOLOGY, 22, 6, 539, 546, 2005年12月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Development and assessment of a real-time PCR assay for rapid and sensitive detection of a novel thermotolerant bacterium, Lactobacillus thermotolerans, in chicken feces
  ASM Selim; P Boonkumklao; T Sone; A Assavanig; M Wada; A Yokota
  APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 71, 8, 4214, 4219, 2005年08月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Enhanced glutamic acid production by a H+-ATPase-defective mutant of Corynebacterium glutamicum
  R Aoki; M Wada; N Takesue; K Tanaka; A Yokota
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 69, 8, 1466, 1472, 2005年08月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Effects of Difructose Anhydride III (DFA III) Administration on Bile Acids and Growth of DFA III-Assimilating Bacterium Ruminococcus productus on Rat Intestine.
  Kimiko Minamida; Maki Kaneko; Midori Ohashi; I Nengah Sujaya; Teruo Sone; Masaru Wada; Atsushi Yokota; Hiroshi Hara; Kozo Asano; Fusao Tomita
  Journal of Bioscience and Bioengineering, 99, 6, 548, 554, The Society for Biotechnology, Japan, 2005年06月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, The growth of DFA III-assimilating bacteria in the intestines of rats fed 3% DFA III for 2 weeks was examined. Sixty-four percent of the DFA III intake had been assimilated on day 3 of ingestion, and almost all of the DFA III was assimilated at the end of the experiment. The DFA III-assimilating bacterium, Ruminococcus productus, in DFA III-fed rats was in the stationary state of 10⁸–10⁹ cells/g dry feces within a week from 10⁶ cells/g dry feces on day 1 of DFA III ingestion. The number of R. productus cells was associated with the amount of DFA III excreted in the feces. The acetic acid produced from DFA III by R. productus lowered the cecal pH to 5.8. In control-fed rats and DFA III-fed rats, 94% of secondary bile acids and 94% of primary bile acids, respectively, were accounted for in the total bile acids analyzed. DFA III ingestion increased the ratio of primary bile acids and changed the composition of fecal bile acids. In conclusion, R. productus assimilated DFA III, produced short chain fatty acids, and the cecal pH was lowered. The acidification of rat intestine perhaps inhibited secondary bile acid formation and decreased the ratio of secondary bile acids. Therefore, it is expected that DFA III may prevent colorectal cancer and be a new prebiotic candidate.
  
• Effects of difructose anhydride III (DFA III) administration on rat intestinal microbiota.
  Kimiko Minamida; Kazuki Shiga; I Nengah Sujaya; Teruo Sone; Atsushi Yokota; Hiroshi Hara; Kozo Asano; Fusao Tomita
  Journal of Bioscience and Bioengineering, 99, 3, 230, 236, The Society for Biotechnology, Japan, 2005年03月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, The effects of difructose anhydride III (di-D-fructofuranose-1,2′:2,3′-dianhydride; DFA III) administration (3% DFA III for 4 weeks) on rat intestinal microbiota were examined using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). According to DGGE profiles, the number of bacteria related to Bacteroides acidofaciens and uncultured bacteria within the Clostridium lituseburense group decreased, while that of bacteria related to Bacteroides vulgatus, Bacteroides uniformis and Ruminococcus productus increased in DFA III-fed rat cecum. In the cecal contents of DFA III-fed rats, a lowering of pH and an increase in short chain fatty acids (SCFAs), especially acetic acid, were observed. The DFA III-assimilating bacterium, Ruminococcus sp. M-1, was isolated from the cecal contents of DFA III-fed rats. The strain had 98% similarity with R. productus ATCC 27340^T (L76595), and mainly produced acetic acid. These results confirmed that the bacteria harmful to host health were not increased by DFA III administration. Moreover, DFA III stimulated the growth of Ruminococcus sp. M-1 producing acetic acid, which may alter the intestinal microbiota towards a healthier composition. It is expected that DFA III would be a new candidate as a prebiotic.
  
• 新規小麦粉発酵食品の開発:植物性乳酸菌を用いた発酵即席麺
  澤渡 優喜; 横田 篤
  日本乳酸菌学会誌, 16, 2, 75, 83, 日本乳酸菌学会誌, 2005年, ［査読有り］
  日本語, 我々は小麦粉を乳酸菌で発酵させた新規発酵食品として発酵即席麺の開発研究を行っている。乳酸菌発酵を利用した小麦粉発酵食品はきわあて少ないが,代表例としてサワーブレッドがあげられる。中華麺製造にはかんすいが用いられ,発酵環境はアルカリ性(pH約8.5)であるため,アルカリ耐性乳酸菌が必要となる。植物性乳酸菌を主体とする12種(亜種を含む)46菌株を対象にスクリーニングを行った結果,<I>Lactobacillus</I>(以下,Lb.)<I>pentosus</I>および<I>Lb.plantarum</I>の2菌種にのみ麺発酵能が認められた。最適株として選択した<I>Lb.plantarum</I> NRIC 0380を用いて調製した発酵即席麺は,麺物性が顕著に向上し,軽い酸味が付与されたこれまでにない良好な特性を示した。発酵培地としての麺生地の食品化学的特徴と乳酸菌の生理的特性の関連性についても考察した。
• The effects of di-D-fructofuranose-1,2 ': 2,3 '-dianhydride (DFA III) administration on human intestinal microbiota
  K Minamida; IN Sujaya; A Tamura; N Shigematsu; T Sone; A Yokota; K Asano; Y Benno; F Tomita
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 98, 4, 244, 250, 2004年10月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Isolation of a cadmium-releasing bacterium and characterization of its novel protease
  S Ren; F Tomita; A Yokota; K Asano
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 68, 8, 1627, 1633, 2004年08月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Effects of indigenous starter cultures on the microbial and physicochemical characteristics of Urutan, a Balinese fermented sausage
  NS Antara; IN Sujaya; A Yokota; K Asano; F Tomita
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 98, 2, 92, 98, 2004年08月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Identification and characterization of yeasts in brem, a traditional Balinese rice wine
  IN Sujaya; NS Antara; T Sone; Y Tamura; WR Aryanta; A Yokota; K Asano; F Tomita
  WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 20, 2, 143, 150, 2004年03月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Physical, chemical and physiological properties of difructose anhydride III produced from inulin by enzymatic reaction
  KIKUCHI H.
  Journal of Applied Glycoscience, 51, 4, 291, 296, 2004年
• Development of internal transcribed spacer regions amplification restriction fragment length polymorphism method and its application in monitoring the population of Zygosaccharomyces rouxii M2 in miso fermentation
  IN Sujaya; Y Tamura; T Tanaka; T Yamaki; T Ikeda; N Kikushima; H Yata; A Yokota; K Asano; F Tomita
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 96, 5, 438, 447, 2003年11月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Cholic acid accumulation and its diminution by short-chain fatty acids in bifidobacteria
  P Kurdi; H Tanaka; HW van Veen; K Asano; F Tomita; A Yokota
  MICROBIOLOGY-SGM, 149, 8, 2031, 2037, 2003年08月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Molecular cloning of the gene encoding the di-D-fructofuranose 1,2 ': 2,3 ' dianhydride hydrolysis enzyme (DFA IIIase) from Arthrobacter sp H65-7
  K Saito; Y Sumita; Y Nagasaka; F Tomita; A Yokota
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 95, 5, 538, 540, 2003年05月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Bacterial adjunct to improve the quality of alkaline noodles
  K Saito; Z Nishio; K Takata; T Kuwabara; A Yokota; H Yamauchi; Y Oda
  FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY RESEARCH, 9, 1, 40, 44, 2003年02月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Lactobacillus thermotolerans sp. nov., a novel thermotolerant species isolated from chicken faeces
  P Niamsup; IN Sujaya; M Tanaka; T Sone; S Hanada; Y Kamagata; S Lumyong; A Assavanig; K Asano; F Tomita; A Yokota
  INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 53, 1, 263, 268, 2003年01月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Molecular cloning of the gene for 2,6-β-D-fructan 6-levanbiohydrolase from Streptomyces exfoliates F3-2
  K Saito; Y Oda; F Tomita; A Yokota
  FEMS Microbiology Letters, 218, 2, 265, 270, 2003年01月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Production of lepidimoide by an endophytic fungus from polysaccharide extracted from Abelmoschus sp.: Identification of the product and the organism producing it
  M Tanaka; M Yoshimura; M Suto; A Yokota; K Asano; E Sukara; F Tomita
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 93, 6, 531, 536, 2002年06月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Specific enumeration of lactic acid bacteria in ragi tape by colony hybridization with specific oligonucleotide probes
  IN Sujaya; S Amachi; K Saito; A Yokota; K Asano; F Tomita
  WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 18, 3, 263, 270, 2002年04月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Identification and succession of lactic acid bacteria during fermentation of 'urutan', a Balinese indigenous fermented sausage
  NS Antara; IN Sujaya; A Yokota; K Asano; WR Aryanta; F Tomita
  WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 18, 3, 255, 262, 2002年04月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Endophytes as producers of xylanase
  M Suto; M Takebayashi; K Saito; M Tanaka; A Yokota; F Tomita
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 93, 1, 88, 90, 2002年01月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• H+-ATPase defect in Corynebacterium glutamicum abolishes glutamic acid production with enhancement of glucose consumption rate
  H Sekine; T Shimada; C Hayashi; A Ishiguro; F Tomita; A Yokota
  APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 57, 4, 534, 540, 2001年11月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Identification and characterization of lactic acid bacteria in ragi tape
  IN Sujaya; S Amachi; A Yokota; K Asano; F Tomita
  WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 17, 4, 349, 357, 2001年06月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Microbial demetallization of crude oil: Nickel protoporphyrin disodium as a model organo-metallic substrate
  GR Dedeles; A Abe; K Saito; K Asano; K Saito; A Yokota; F Tomita
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 90, 5, 515, 521, 2000年11月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Cholic acid is accumulated spontaneously, driven by membrane Delta pH, in many lactobacilli
  P Kurdi; HW van Veen; H Tanaka; Mierau, I; WN Konings; GW Tannock; F Tomita; A Yokota
  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 182, 22, 6525, 6528, 2000年11月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Cholate resistance in Lactococcus lactis is mediated by an ATP-dependent multispecific organic anion transporter
  A Yokota; M Veenstra; P Kurdi; HW van Veen; WN Konings
  JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 182, 18, 5196, 5201, 2000年09月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Molecular cloning and high-level expression in Escherichia coli of fungal alpha-galactosidase from Absidia corymbifera IFO 8084
  SH Baik; K Saito; A Yokota; K Asano; F Tomita
  JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 90, 2, 168, 173, 2000年08月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Purification and characterization of 2,6-β-D-fructan 6-levanbiohydrolase from Streptomyces exfoliatus F3-2
  A Saito; K Kondo; Kojima, I; A Yokota; F Tomita
  Applied and Environmental Microbiology, 66, 1, 252, 256, 2000年01月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• An antifungal compound from roots of Welsh onion
  N Phay; T Higashiyama; M Tsuji; H Matsuura; Y Fukushi; A Yokota; F Tomita
  PHYTOCHEMISTRY, 52, 2, 271, 274, 1999年09月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• A novel screen for the detection of chitin acting antifungal compounds
  T Sakurai; N Cheeptham; T Mikawa; A Yokota; F Tomita
  JOURNAL OF ANTIBIOTICS, 52, 5, 508, 511, 1999年05月
  英語
• Effects of DFA IV in rats: Calcium absorption and metabolism of DFA IV by intestinal microorganisms
  K Saito; T Hira; T Suzuki; H Hara; A Yokota; F Tomita
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 63, 4, 655, 661, 1999年04月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Studies on an antifungi antibiotic from Ellisiodothis inguinans L1588-A8
  NAOWARAT C.
  Thai Journal of Biotechnology, 1, 1, 37, 45, 1999年
• Purification and properties of the raw-starch-digesting glucoamylases from Corticium rolfsii
  Y Nagasaka; K Kurosawa; A Yokota; F Tomita
  APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 50, 3, 323, 330, 1998年09月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Characterization of a mutant of Lactococcus lactis with reduced membrane-bound ATPase activity under acidic conditions
  S Amachi; K Ishikawa; S Toyoda; Y Kagawa; A Yokota; F Tomita
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 62, 8, 1574, 1580, 1998年08月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Molecular cloning of levan fructotransferase gene from Arthrobacter nicotinovorans GS-9 and its expression in Escherichia coli
  K Saito; A Yokota; F Tomita
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 61, 12, 2076, 2079, 1997年12月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Purification of levan fructotransferase from Arthrobacter nicotinovorans GS-9 and production of DFA IV from levan by the enzyme
  K Saito; H Goto; A Yokota; F Tomita
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 61, 10, 1705, 1709, 1997年10月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Metabolism of DFA III by Arthrobacter sp. H65-7: Purification and properties of a DFA III hydrolysis enzyme (DFA IIIase)
  H Sakurai; A Yokota; Y Sumita; Y Mori; H Matsui; F Tomita
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 61, 6, 989, 993, 1997年06月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Breeding of useful microorganisms by mutation in energy metabolism
  Atsushi Yokota
  Nippon Nogeikagaku Kaishi, 71, 1, 9, 14, Japan Society for Bioscience Biotechnology and Agrochemistry, 1997年, ［査読有り］
  日本語, 研究論文（学術雑誌）
• Enhancement of glucose metabolism in a pyruvic acid-hyperproducing Escherichia coli mutant defective in F-1-ATPase activity
  A Yokota; M Henmi; N Takaoka; C Hayashi; Y Takezawa; Y Fukumori; F Tomita
  JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 83, 2, 132, 138, 1997年
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Molecular cloning of an inulin fructotransferase (depolymerizing) gene from Arthrobacter sp H65-7 and its expression in Escherichia coli
  H Sakurai; A Yokota; F Tomita
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 61, 1, 87, 92, 1997年01月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• NP-101A, antifungal antibiotic from Streptomyces aurantiogriseus NPO-101
  N Phay; H Yada; T Higashiyama; A Yokota; A Ichihara; F Tomita
  JOURNAL OF ANTIBIOTICS, 49, 7, 703, 705, 1996年07月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• L-tryptophan production by a pyruvic acid-producing Escherichia coli strain carrying the Enterobacter aerogenes tryptophanase gene
  K Kawasaki; A Yokota; F Tomita
  JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 82, 6, 604, 606, 1996年
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Cloning of Corticium rolfsii glucoamylase cDNA and its expression in Saccharomyces cerevisiae
  Y Nagasaka; N Muraki; A Kimura; M Suto; A Yokota; F Tomita
  APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 44, 3-4, 451, 458, 1995年12月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• PRODUCTION OF INULOTRIOSE FROM INULIN BY INULIN-DEGRADING ENZYME FROM STREPTOMYCES-ROCHEI-E87
  A YOKOTA; O YAMAUCHI; F TOMITA
  LETTERS IN APPLIED MICROBIOLOGY, 21, 5, 330, 333, 1995年11月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• ACID SENSITIVITY OF A MUTANT OF LACTOCOCCUS-LACTIS SUBSP LACTIS C2 WITH REDUCED MEMBRANE-BOUND ATPASE ACTIVITY
  A YOKOTA; S AMACHI; S ISHII; F TOMITA
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 59, 10, 2004, 2007, 1995年10月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• ENZYMATIC-SYNTHESIS OF L-TRYPTOPHAN BY ENTEROBACTER-AEROGENES TRYPTOPHANASE HIGHLY EXPRESSED IN ESCHERICHIA-COLI, AND SOME PROPERTIES OF THE PURIFIED ENZYME
  K KAWASAKI; A YOKOTA; F TOMITA
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 59, 10, 1938, 1943, 1995年10月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• 重質油中のキノリンの微生物分解
  Toshiyuki Obara; Atsushi Yokota; Fusao Tomita
  日本エネルギー学会誌, 74, 4, 228, 232, 1995年
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• PYRUVIC-ACID PRODUCTION BY AN F-1-ATPASE-DEFECTIVE MUTANT OF ESCHERICHIA-COLI W1485LIP2
  A YOKOTA; Y TERASAWA; N TAKAOKA; H SHIMIZU; F TOMITA
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 58, 12, 2164, 2167, 1994年12月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• PYRUVIC-ACID PRODUCTION BY A LIPOIC ACID AUXOTROPH OF ESCHERICHIA-COLI W1485
  A YOKOTA; H SHIMIZU; Y TERASAWA; N TAKAOKA; F TOMITA
  APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 41, 6, 638, 643, 1994年08月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• CLONING AND CHARACTERIZATION OF A TRYPTOPHANASE GENE FROM ENTEROBACTER-AEROGENES SM-18
  K KAWASAKI; A YOKOTA; S OITA; C KOBAYASHI; S YOSHIKAWA; SI KAWAMOTO; S TAKAO; F TOMITA
  JOURNAL OF GENERAL MICROBIOLOGY, 139, 12, 3275, 3281, 1993年12月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• PRODUCTION OF LEVANBIOSE BY A LEVAN-DEGRADING ENZYME FROM STREPTOMYCES-EXFOLIATUS F3-2
  A YOKOTA; K KONDO; M NAKAGAWA; KOJIMA, I; F TOMITA
  BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 57, 5, 745, 749, 1993年05月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• MECHANISM OF ACTION OF INHIBITORS FOR BACTERIAL OUTER-MEMBRANE
  F TOMITA; A YOKOTA
  NIPPON NOGEIKAGAKU KAISHI-JOURNAL OF THE JAPAN SOCIETY FOR BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND AGROCHEMISTRY, 65, 6, 998, 1002, 1991年06月, ［査読有り］
  日本語, 研究論文（学術雑誌）
• PRODUCTION OF INULIN FRUCTOTRANSFERASE (DEPOLYMERIZING) BY ARTHROBACTER SP H65-7 AND PREPARATION OF DFA-III FROM INULIN BY THE ENZYME
  A YOKOTA; S HIRAYAMA; K ENOMOTO; Y MIURA; S TAKAO; F TOMITA
  JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 72, 4, 258, 261, 1991年
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• PURIFICATION AND PROPERTIES OF AN INULIN FRUCTOTRANSFERASE (DEPOLYMERIZING) FROM ARTHROBACTER SP H65-7
  A YOKOTA; K ENOMOTO; F TOMITA
  JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 72, 4, 262, 265, 1991年
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• ETHANOL-PRODUCTION FROM RAW STARCH BY SIMULTANEOUS FERMENTATION USING SCHIZOSACCHAROMYCES-POMBE AND A RAW STARCH SACCHARIFYING ENZYME FROM CORTICIUM-ROLFSII
  J HARIANTONO; A YOKOTA; S TAKAO; F TOMITA
  JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 71, 5, 367, 369, 1991年
  英語
• DIHYDRODIPICOLINATE SYNTHASE DEFICIENCY OF BREVIBACTERIUM-FLAVUM STRAIN-BB69, A THREONINE-PRODUCING MUTANT WITH A FEEDBACK-RESISTANT HOMOSERINE DEHYDROGENASE
  A YOKOTA; SHIIO, I
  AGRICULTURAL AND BIOLOGICAL CHEMISTRY, 54, 2, 547, 548, 1990年02月
  英語
• ENZYMATIC PRODUCTION OF TRYPTOPHAN USING A LIPOIC ACID AND THIAMINE DOUBLE AUXOTROPH OF ENTEROBACTER-AEROGENES HAVING BOTH PYRUVIC-ACID PRODUCTIVITY AND HIGH TRYPTOPHANASE ACTIVITY
  S OITA; A YOKOTA; S TAKAO
  JOURNAL OF FERMENTATION AND BIOENGINEERING, 69, 4, 256, 258, 1990年
  英語
• ISOLATION AND PROPERTIES OF DIHYDRODIPICOLINATE SYNTHASE-DEFECTIVE THREONINE-PRODUCING MUTANTS FROM A BREVIBACTERIUM-FLAVUM STRAIN WITH FEEDBACK-SENSITIVE ASPARTOKINASE
  SHIIO, I; A YOKOTA; K KAWAMURA
  AGRICULTURAL AND BIOLOGICAL CHEMISTRY, 53, 8, 2169, 2175, 1989年08月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• TRYPTOPHAN PRODUCTION BY A LIPOIC ACID AUXOTROPH OF ENTEROBACTER-AEROGENES HAVING BOTH PYRUVIC-ACID PRODUCTIVITY AND HIGH TRYPTOPHANASE ACTIVITY
  A YOKOTA; S OITA; S TAKAO
  AGRICULTURAL AND BIOLOGICAL CHEMISTRY, 53, 8, 2037, 2044, 1989年08月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• PYRUVIC-ACID PRODUCTION BY LIPOIC ACID AUXOTROPHS OF ENTEROBACTER-AEROGENES
  A YOKOTA; S TAKAO
  AGRICULTURAL AND BIOLOGICAL CHEMISTRY, 53, 3, 705, 711, 1989年03月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• THREONINE PRODUCTION BY DIHYDRODIPICOLINATE SYNTHASE-DEFECTIVE MUTANTS OF BREVIBACTERIUM-FLAVUM
  SHIIO, I; A YOKOTA; Y TORIDE; SI SUGIMOTO
  AGRICULTURAL AND BIOLOGICAL CHEMISTRY, 53, 1, 41, 48, 1989年01月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• EFFECTS OF REDUCED CITRATE SYNTHASE ACTIVITY AND FEEDBACK-RESISTANT PHOSPHOENOLPYRUVATE CARBOXYLASE ON LYSINE PRODUCTIVITIES OF BREVIBACTERIUM-FLAVUM MUTANTS
  A YOKOTA; SHIIO, I
  AGRICULTURAL AND BIOLOGICAL CHEMISTRY, 52, 2, 455, 463, 1988年02月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• EFFECT OF PYRUVATE-KINASE DEFICIENCY ON L-LYSINE PRODUCTIVITIES OF MUTANTS WITH FEEDBACK-RESISTANT ASPARTOKINASES
  SHIIO, I; A YOKOTA; S SUGIMOTO
  AGRICULTURAL AND BIOLOGICAL CHEMISTRY, 51, 9, 2485, 2493, 1987年09月
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• CONVERSION OF PYRUVIC-ACID FERMENTATION TO TRYPTOPHAN PRODUCTION BY THE COMBINATION OF PYRUVIC ACID-PRODUCING MICROORGANISMS AND ENTEROBACTER-AEROGENES HAVING HIGH TRYPTOPHANASE ACTIVITY
  A YOKOTA; S TAKAO
  AGRICULTURAL AND BIOLOGICAL CHEMISTRY, 48, 11, 2663, 2668, 1984年
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• ENZYMATIC PRODUCTION OF TRYPTOPHAN COUPLED TO PYRUVIC-ACID FERMENTATION
  S TAKAO; A YOKOTA; M TANIDA
  JOURNAL OF FERMENTATION TECHNOLOGY, 62, 4, 329, 334, 1984年
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• L-MALIC ACID FERMENTATION BY A MIXED CULTURE OF RHIZOPUS-ARRHIZUS AND PAECILOMYCES-VARIOTI
  S TAKAO; A YOKOTA; M TANIDA
  JOURNAL OF FERMENTATION TECHNOLOGY, 61, 6, 643, 645, 1983年
  英語

• 8-Prenylnaringenin生産に関する研究(1)ヒト腸内細菌のスクリーニングと共培養による効率的生産
  丹野麻由; 植村圭祐; 大谷彬; 中島賢則; 三橋和也; 山本浩明; 前田智也; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2024, 2024年
• 8-Prenylnaringenin生産に関する研究(2)サポート菌のスクリーニングとその活用による脱メチル化促進法
  大谷彬; 中島賢則; 三橋和也; 丹野麻由; 前田智也; 横田篤; 吹谷智; 山本浩明, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2024, 2024年
• ビフィズス菌を選択的に増殖させるガラクトシル-β-1,4-ラムノースを用いた偽膜性腸炎原因菌の生育抑制効果
  平野里佳; 平野里佳; 阪中幹祥; 吉見一人; 吉見一人; 山内祐子; 山内祐子; 後藤愛那; 片山高嶺; 片山高嶺; 飯田宗穂; 加藤完; 大野博司; 吹谷智; 横田篤; 西本完; 北岡本光; 北岡本光; 中井博之; 栗原新; 栗原新, 日本実験動物学会総会講演要旨集(Web), 70th, 2023年
• 腸内細菌による二次胆汁酸ウルソコール酸の代謝リレーメカニズムの解明
  月舘一瑳; 北川更; 前田智也; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2023, 2023年
• INSeq法を用いて網羅的に同定された遺伝子に基づく通常飼育マウス消化管でのビフィズス菌生存戦略の考察
  山口颯人; 倉持碧海; 後藤恭宏; 小椋義俊; 前田智也; 林哲也; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2023, 2023年
• ビフィズス菌シスタチオニン代謝酵素の大腸菌内発現と機能解析
  和田大; 宮森那知; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2023, 2023年
• 腸内細菌叢からのビフィズス菌の選択的回収系の確立
  宮下聖也; 吉田佳鼓; 嶋田みな; 前田智也; 横田篤; 吹谷智, 日本生物工学会大会講演要旨集, 75th, 2023年
• 高脂肪食摂取ラット盲腸で増加した遊離脂肪酸種が腸内細菌に与える影響の評価
  川上志野; 川上憲太郎; GOWDA Siddabasave Gowda B.; CHEN Zhen; 吹谷智; LIANG Chongsheng; HAI Han; 石塚敏; 小椋義俊; 後藤恭宏; 前田智也; 林哲也; 千葉仁志; 惠淑萍; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部学術講演会講演要旨集(Web), 2023, 2023年
• 腸内細菌叢からのビフィズス菌の選択的回収系の確立
  宮下聖也; 吉田佳鼓; 嶋田みな; 前田智也; 横田篤; 吹谷智, 日本乳酸菌学会誌, 33, 2, 2022年
• Insertion Sequencing解析により同定されたアミノ酸代謝に関わるビフィズス菌遺伝子の通常飼育マウス腸内における定着と生存への寄与の評価
  井上太貴; 前田智也; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2022, 2022年
• 大腸菌呼吸鎖変異株ΔNDH-IΔCytbo₃を用いたグルコースからのGABAの高生産
  若原洋輝; 溝越拓哉; 前田智也; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会東北支部大会プログラム・講演要旨集, 2022, 2022年
• Bifidobacterium longum105-Aのシステイン/メチオニン代謝に関与する酵素遺伝子の同定
  宮森那知; 松本菜々恵; 吹谷智; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2022, 2022年
• 定量PCR解析によるヒト糞便中のデオキシコール酸生成菌の存在量の解明
  原田恕; 前田智也; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会東北支部大会プログラム・講演要旨集, 2022, 2022年
• 常在腸内細菌叢からのビフィズス菌の選択的回収系の確立
  宮下聖也; 吉田佳鼓; 嶋田みな; 前田智也; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会東北支部大会プログラム・講演要旨集, 2022, 2022年
• 腸内細菌叢中に存在するビフィズス菌の選択的回収系の確立
  吉田佳鼓; 嶋田みな; 宮下聖也; 前田智也; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2022, 2022年
• 通常飼育マウス消化管における生存と定着に寄与するビフィズス菌遺伝子のINSeq法による同定
  山口颯人; 倉持碧海; 後藤恭宏; 小椋義俊; 前田智也; 林哲也; 横田篤; 吹谷智, 日本生物工学会大会講演要旨集, 74th, 2022年
• 高脂肪食摂取ラットにおける盲腸内脂肪酸プロファイルの変化が腸内細菌叢構成に与える影響の解明:脂肪酸仮説の検証
  川上憲太郎; GOWDA Siddabasave Gowda B.; CHEN Zhen; 吹谷智; LIANG Chongsheng; HAI Han; 石塚敏; 小椋義俊; 後藤恭宏; 前田智也; 林哲也; 千葉仁志; 惠淑萍; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2022, 2022年
• Bifidobacterium longum subsp.longumにおける1-Kestose代謝メカニズムの解明
  難波有希; 倉持碧海; 山口颯人; 吉田佳鼓; 後藤恭宏; 門田吉弘; 栃尾巧; 小椋義俊; 林哲也; 前田智也; 横田篤; 吹谷智, 日本乳酸菌学会誌, 33, 2, 2022年
• 大腸菌の呼吸鎖変異株ΔNDH-I ΔCytbo₃におけるグルタミン酸代謝系酵素の欠損がグルタミン酸異常蓄積に及ぼす影響
  今壮太; 前田智也; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 73rd, 2021年
• ビフィズス菌が有するフコシルラクトース輸送体の多様性
  OJIMA Miriam N.; 浅尾有哉; 中島有登; 加藤紀彦; 北岡本光; 後藤愛那; 廣瀬潤子; 浦島匡; 吹谷智; 横田篤; HACHEM Maher Abou; 阪中幹祥; 片山高嶺, ミルクサイエンス(Web), 70, 2, 2021年
• Insertion Sequencing解析により網羅的に同定されたビフィズス菌遺伝子の通常飼育マウス腸内における定着と生存への寄与の評価
  井上太貴; 前田智也; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会北海道支部学術講演会講演要旨集(Web), 2021, 2021年
• 高脂肪食摂取ラットにおける盲腸内脂肪酸プロファイルの変化が腸内細菌叢構成に与える影響
  川上憲太郎; GOWDA B. Gowda Siddabasave; CHEN Zhen; 吹谷智; LIANG Chongsheng; HAI Han; 石塚敏; 小椋義俊; 後藤恭宏; 前田智也; 林哲也; 千葉仁志; 惠淑萍; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部学術講演会講演要旨集(Web), 2021, 2021年
• Bifidobacterium longum subsp. longumにおける1-Kestose代謝メカニズムの解明
  難波有希; 山口颯人; 吉田佳鼓; 後藤恭宏; 門田吉弘; 栃尾巧; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤; 吹谷智, 日本生物工学会大会講演要旨集, 73rd, 2021年
• Corynebacterium glutamicumのリジン生産に対するピルビン酸カルボキシラーゼおよびホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ反応の寄与度の比較
  新森彰信; GUO Zhen; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2021, 2021年
• Corynebacterium glutamicumのクエン酸シンターゼ活性低下変異によるリジン生産効率の向上機構の解明
  大塚萌音; GUO Zhen; 佐藤桃梨; 愛甲徹; 柳瀬真紀; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2021, 2021年
• 遺伝子欠損株を用いたBifidobacterium longum105-Aの逆流硫黄経路に関与する酵素遺伝子の同定
  宮森那知; 松本菜々恵; 吹谷智; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2021, 2021年
• Insertion-Sequencing解析により網羅的に同定されたビフィズス菌遺伝子の通常飼育マウス腸内における定着と生存への寄与の評価
  井上太貴; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2021, 2021年
• 通常飼育マウス消化管における生存と定着に寄与するビフィズス菌遺伝子のINSeq法による同定
  山口颯人; 倉持碧海; 後藤恭宏; 小椋義俊; 園山慶; 林哲也; 横田篤; 吹谷智, 日本乳酸菌学会誌, 32, 2, 2021年
• Bifidobacterium属細菌のムチン型糖鎖資化経路の解明
  CHOI Moonhak; 後藤愛那; 阪中幹祥; 加藤紀彦; 西本完; 杉山友太; 栗原新; 吹谷智; 横田篤; 北岡本光; 片山高嶺, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2021, 2021年
• Bifidobacterium longum105-Aが有する逆流硫黄経路を構成する酵素遺伝子の同定と機能検証
  宮森那知; 松本菜々恵; 吹谷智; 横田篤; 和田大, 日本乳酸菌学会誌, 32, 2, 2021年
• 高脂肪食による菌叢崩壊の要因としての胆汁酸:胆汁酸仮説の証明
  横田篤; 渡辺真通; 藤田祐己; 石塚敏; 吹谷智, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2020, 2020年
• 12α水酸化胆汁酸と脂肪肝の関係
  堀将太; 阿部隆行; LEE DongGeun; 吹谷智; 横田篤; 麻生菜央; 城内文吾; 佐藤匡央; 石塚敏, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2020, 2020年
• エクオール産生におよぼす胆汁酸の影響
  吉岡寛子; 渡辺真通; 難波文男; 鈴木利雄; 吹谷智; 横田篤; 戸田登志也, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2019, ROMBUNNO.4C1a11 (WEB ONLY), 2019年03月05日
  日本語
• The membrane phospholipid cardiolipin plays a pivotal role in bile acid adaptation by Lactobacillus gasseri JCM1131 ^T
  Shinji Kato; Haruhi Tobe; Hiroki Matsubara; Mariko Sawada; Yasuko Sasaki; Satoru Fukiya; Naoki Morita; Atsushi Yokota, Biochimica et Biophysica Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids, 1864, 403, 412, 2019年03月01日
• ラフィノース摂取によるラット腸内でのデオキシコール酸生成の抑制効果の解明
  小山遥; 佐竹実菜子; 前川顕汰; 吹谷智; 小椋義俊; 林哲也; 石塚敏; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨(Web), 2019, 2019年
• ビフィズス菌のトランスポゾン変異株を用いたα-グルコシダーゼ遺伝子の機能解明
  阪中幹祥; 阪中幹祥; 阪中幹祥; 中川路伸吾; 中島森; 阿部光紗; 佐分利亘; 森春英; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2019, 2019年
• 高脂肪食中に含まれる脂肪酸がラット盲腸内細菌叢構成に与える影響の解明:脂肪酸仮説の検証
  阿部隆行; 渡辺真通; 藤田祐己; 小椋義俊; 吹谷智; 石塚敏; 林哲也; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2019, 2019年
• 高脂肪食またはコール酸摂取マウス腸内における胆汁酸組成および細菌叢構成の動態解析による胆汁酸仮説の検証
  坂本佳奈子; 相磯知里; 松浦史佳; 吹谷智; 園山慶; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2019, 2019年
• 胆汁酸変換菌の共培養によるウルソコール酸からデオキシコール酸への変換機構の検証
  北川更; TAWTHEP Saryinya; 吹谷智; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2019, 2019年
• Bifidobacterium animalis subsp.lactisが有するストレス耐性遺伝子の探索
  齋藤史; 磯奏子; 尾淵駿; 吹谷智; 横田篤; 山本裕司; 向井孝夫, 日本乳酸菌学会誌, 30, 2, 2019年
• 胆汁酸変換菌の相互作用によるウルソコール酸からデオキシコール酸への新たな変換経路の同定とその変換機構の解明
  北川更; TAWTHEP Sarinya; 吹谷智; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 30, 2, 2019年
• イソフラボン代謝におよぼす胆汁酸の影響
  吉岡寛子; 渡辺真通; 難波文男; 鈴木利雄; 吹谷智; 横田篤; 戸田登志也, 日本栄養・食糧学会大会講演要旨集, 73rd, 2019年
• 慢性的な高脂肪食摂取によって腸肝局所で増加する12α水酸化胆汁酸はインスリン感受性を向上させる一方で肝臓脂質蓄積を亢進する
  堀将太; 吉次玲香; 菊池慧大; 阿部隆行; 原博; 吹谷智; 横田篤; 石塚敏, 日本栄養・食糧学会大会講演要旨集, 73rd, 2019年
• ビフィズス菌のフコシルラクトーストランスポーターに見られる適応進化が母乳栄養児腸管でのビフィズスフローラ形成に関与する
  阪中幹祥; 阪中幹祥; 栗原新; 栗原新; 片山高嶺; 片山高嶺; HANSEN Morten Ejby; 後藤愛那; 加藤紀彦; 吉田圭佑; 小田巻俊孝; 杉山友太; 廣瀬潤子; 浦島匡; 清水(肖)金忠; 北岡本光; 吹谷智; 横田篤; LEGGIO Leila Lo; HACHEM Maher Abou, Institute for Fermentation, Osaka. Research Communications, 33, 2019年
• ピルビン酸カルボキシラーゼ遺伝子の欠失がCorynebacterium glutamicumのリジン生産に与える影響
  新森彰信; GUO Zhen; 和田大; 横田篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 71st, 2019年
• ビフィズス菌の含硫アミノ酸代謝に関与するC-Sリアーゼの解析
  黒瀧空; 松本菜々恵; 吹谷智; 横田篤; 和田大, 日本生物工学会大会講演要旨集, 71st, 2019年
• 機能性糖質によるラット盲腸内細菌叢の改変に基づいたデオキシコール酸生成菌と相互作用する腸内細菌種の同定
  吹谷智; 佐竹実菜子; 佐藤昌直; 石塚敏; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 30, 2, 2019年
• Bifidobacterium bifidumの細胞外シアリダーゼの腸粘液との相互作用と糖の資化における役割
  西山啓太; 長井暁; 吹谷智; 横田篤; 山本裕司; 向井孝夫; 岡田信彦, 腸内細菌学雑誌, 32, 2, 102, 2018年04月
  日本語
• ビフィズス菌におけるラクト-N-テトラオース輸送体の同定およびビフィズスフローラ形成への関与
  阪中 幹祥; 砂川 直輝; 佐藤 真与; 吉田 圭佑; 石田 卓也; 後藤 愛那; 加藤 紀彦; 谷内 寛之; 密山 恵梨; 加藤 久美子; 廣瀬 潤子; 阿部 紘一; 前田 信悟; 杉山 友太; 吹谷 智; 横田 篤; 栗原 新; 荒川 孝俊; 小田巻 俊孝; 清水 金忠; 五十嵐 圭日子; 伏信 進矢; 片山 高嶺, 腸内細菌学雑誌, 32, 2, 101, 101, 2018年04月
  (公財)日本ビフィズス菌センター, 日本語
• 大腸菌のNADH脱水素酵素Iとシトクロムbo₃オキシダーゼ両欠損株の糖代謝に与えるグルタミン酸脱炭酸/膜輸送系の影響
  和田浩; 瀬島祐大; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2018, 2018年
• トランスポゾン変異株集団を用いたビフィズス菌の腸内生存戦略の解明手法の確立
  中島森; 久保勇貴; 中川路伸吾; 阪中幹祥; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤; 吹谷智, 日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 12th, 2018年
• 高脂肪食摂取ラットにおける盲腸内細菌叢変動機構の解析:「胆汁酸仮説」の証明に向けて
  横田篤; 渡辺真通; 藤田祐己; 吹谷智, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2018, 2018年
• ビフィズス菌の腸内生存・定着機構の解明に向けたINSeq法の確立とその評価
  中島森; 久保勇貴; 中川路伸吾; 阪中幹祥; 小椋義俊; 吉本真; 吉田圭佑; 清水(肖)金忠; 小田巻俊孝; 林哲也; 横田篤; 吹谷智, 日本乳酸菌学会誌, 29, 2, 2018年
• ビフィズス菌における低温生残性向上機構の解析
  齋藤史; 磯奏子; 小泉亮子; 原翔; 吹谷智; 横田篤; 山本裕司; 向井孝夫, 日本乳酸菌学会誌, 29, 2, 2018年
• ヒト由来ビフィズス菌Bifidobacterium longum105-Aが通常飼育マウス腸内に定着可能な飼育試験系の確立
  嶋田みな; 川瀬陽平; 園山慶; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤; 吹谷智, 日本乳酸菌学会誌, 29, 2, 2018年
• マウス腸内への定着に寄与するビフィズス菌遺伝子の網羅的同定に向けたINSeq法の確立
  久保勇貴; 中島森; 中川路伸吾; 阪中幹祥; 小椋義俊; 吉本真; 吉田圭佑; XIAO Jin-Zhong; 小田巻俊孝; 林哲也; 横田篤; 吹谷智, 日本生物工学会大会講演要旨集, 70th, 2018年
• Lactobacillus gasseriに共通する種特異的なリポテイコ酸の化学構造 【優秀演題賞】
  白石宗; 久富亮佑; 佐藤耶舞羽; 森田直樹; 吹谷智; 佐藤豊孝; 横田篤; 横田伸一, エンドトキシン・自然免疫研究(Web), 21, 2018年
• エネルギー代謝の改変によるCorynebacterium glutamicumでのピルビン酸生産
  片岡尚也; VANGNAI Alisa S.; 藥師寿治; 和田大; 横田篤; 松下一信, 日本農芸化学会中四国支部講演会講演要旨集(Web), 50th, 2018年
• 大腸菌のNADH脱水素酵素Iとシトクロムbo₃オキシダーゼ両欠損株におけるNDH-II過剰発現が中枢代謝に与える影響
  濱田和宏; 瀬島祐大; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 70th, 2018年
• 好気代謝の改変によるCorynebacterium glutamicumでの効率的ピルビン酸生産
  片岡尚也; 片岡尚也; VANGNAI Alisa S.; 藥師寿治; 藥師寿治; 和田大; 横田篤; 松下一信; 松下一信, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2018, 2018年
• ラットへのコール酸および難消化性オリゴ糖の同時投与による腸内細菌叢改変に基づいたデオキシコール酸生成菌と相互作用する腸内細菌種の探索
  佐竹実菜子; 吹谷智; 佐藤昌直; 石塚敏; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2018, 2018年
• ABCトランスポーターを介したビフィズス菌の糖質取込みを包括的に制御するATP加水分解酵素MsiK
  阪中幹祥; 前田信悟; 後藤愛那; 村上隆太; 加藤紀彦; 杉山友太; 谷内寛之; 栗原新; 玉置尚徳; 吹谷智; 横田篤; 片山高嶺; 片山高嶺, 日本乳酸菌学会誌, 29, 2, 2018年
• ビフィズス菌由来ATPase MsiKはABCトランスポーターを介した糖質取込みをグローバルに制御する
  前田信悟; 阪中幹祥; 後藤愛那; 村上隆太; 加藤紀彦; 杉山友太; 谷内寛之; 栗原新; 玉置尚徳; 吹谷智; 横田篤; 片山高嶺; 片山高嶺, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2018, 2018年
• セミナー室 腸内相互作用の理解に基づいた健康の増進・疾患の予防(6)腸内細菌叢の機能理解に向けて : ビフィズス菌における遺伝子操作系の開発
  吹谷 智; 横田 篤, 化学と生物 : 日本農芸化学会会誌 : 生命・食・環境, 55, 9, 637, 643, 2017年09月
  日本農芸化学会 ; 1962-, 日本語
• 大腸菌のNADH脱水素酵素Iとシトクロムbo₃オキシダーゼ両欠損株における異常な糖代謝の解析
  瀬島祐大; 紀平千枝; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 69th, 220, 2017年08月08日
  日本語
• オキサロ酢酸蓄積型リジン生産Corynebacterium glutamicumの代謝プロファイル解析
  佐藤桃梨; 柳瀬真紀; 愛甲徹; 和田大; 横田篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 69th, 218, 2017年08月08日
  日本語
• ビフィズス菌におけるgalacto-N-biose/lacto-N-biose Iトランスポーターの多様性解析 母乳オリゴ糖lacto-N-tetraoseの取込みに寄与するアミノ酸配列の発見
  阪中 幹祥; 石田 卓也; 佐藤 真与; 谷内 寛之; 阿部 紘一; 前田 信悟; 吹谷 智; 横田 篤; 栗原 新; 荒川 孝俊; 五十嵐 圭日子; 伏信 進矢; 片山 高嶺, 日本乳酸菌学会誌, 28, 2, 127, 127, 2017年06月
  日本乳酸菌学会, 日本語
• Bifidobacterium longum105‐Aのメチオニン利用に関与する遺伝子の発現解析および遺伝子破壊による検証
  和田大; 松本菜々恵; 小松一喜; 阪中幹祥; 松尾実紀; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2017, ROMBUNNO.4C24a04 (WEB ONLY), 2017年03月05日
  日本語
• キノール酸化酵素の欠失がCorynebacterium glutamicumのグルタミン酸生産に与える影響
  片岡尚也; 片岡尚也; 片岡尚也; 那須裕介; 藥師寿治; 藥師寿治; 藥師寿治; 和田大; 横田篤; 松下一信; 松下一信; 松下一信, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2017, ROMBUNNO.3C24a01 (WEB ONLY), 2017年03月05日
  日本語
• Bifidobacterium bifidumにおけるシアリダーゼは宿主との相互作用を促進し糖の資化をサポートする
  西山啓太; 山本裕司; 杉山真言; 篠原有香; 浦島匡; 吹谷智; 横田篤; 岡田信彦; 向井孝夫, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2017, ROMBUNNO.3C18p05 (WEB ONLY), 2017年03月05日
  日本語
• 腸内細菌の代謝リレーによるデオキシコール酸生成に関与する7α-ヒドロキシステロイドデヒドロゲナーゼの反応特性の解析
  柴野可菜; TAWTHEP Sarinya; 鳥居剛史; 小椋義俊; 林哲也; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2017, 2017年
• Bifidobacterium animalis subsp.lactisにおけるストレス耐性遺伝子の探索
  磯奏子; 齋藤史; 原翔; 小泉亮子; 大塚雅也; 吹谷智; 横田篤; 山本裕司; 向井孝夫, ミルクサイエンス, 66, 2, 2017年
• 高脂肪食摂取によるマウス腸内の胆汁酸量の増加が腸内細菌叢構成に与える影響
  相磯知里; 松浦史佳; 吹谷智; 渡辺真通; 園山慶; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 28, 2, 2017年
• コール酸・ケノデオキシコール酸・デオキシコール酸各投与マウスにおける盲腸内胆汁酸組成および菌叢構成の変化
  松浦史佳; 相磯知里; 吹谷智; 渡辺真通; 園山慶; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 28, 2, 2017年
• 消化管における生存と定着に寄与するビフィズス菌遺伝子の探索系の構築
  中川路伸吾; 中島森; 阪中幹祥; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2017, 2017年
• 二種の腸内細菌の共培養によって明らかになったデオキシコール酸生成の活性化と新たな生成経路
  TAWTHEP Sarinya; 鳥居剛史; 山崎真侑; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2017, 2017年
• 消化管における生存と定着に寄与するビフィズス菌遺伝子の網羅的同定に向けたINSeq法の確立
  中島森; 中川路伸吾; 阪中幹祥; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤; 吹谷智, 日本生物工学会大会講演要旨集, 69th, 2017年
• Lactobacillus gasseri種に共通するリポテイコ酸の特異的構造
  久富亮佑; 白石宗; 佐藤耶舞羽; 森田直樹; 吹谷智; 佐藤豊孝; 横田篤; 横田伸一, 日本細菌学雑誌(Web), 72, 1, 2017年
• コリネ型細菌のグルタミン酸発酵におけるキノール酸化酵素の役割
  那須裕介; 片岡尚也; 片岡尚也; 片岡尚也; 薬師寿治; 薬師寿治; 薬師寿治; 和田大; 横田篤; 松下一信; 松下一信; 松下一信, 日本農芸化学会中四国支部講演会講演要旨集(Web), 47th, ROMBUNNO.F‐2 (WEB ONLY), 2017年
  日本語
• 特集：乳酸菌が持つ新たな微生物機構の解明とその利用 リポテイコ酸の構造多様性から見える乳酸菌の特徴
  白石宗; 横田伸一; 吹谷智; 横田篤, JATAFFジャーナル, 5, 3, 26, 32, 2017年
  農林水産・食品産業技術振興協会, 日本語, 記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）
• 中枢代謝活性化によるアミノ酸発酵の効率化
  和田大; 横田篤, 電子情報通信学会大会講演論文集(CD-ROM), 2016, ROMBUNNO.BI‐8‐2, 2016年09月06日
  日本語
• D‐erythro‐3‐ヒドロキシアスパラギン酸デヒドラターゼの機能解析および光学分割への応用
  柴野可菜; 長野弘幸; 横田篤; 和田大, 日本生物工学会大会講演要旨集, 68th, 290, 2016年08月25日
  日本語
• リンゴ酸デヒドロゲナーゼ欠失がCorynebacterium glutamicumのリジン生産に与える影響
  佐藤桃梨; 柳瀬真紀; 愛甲徹; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2016, 2F151 (WEB ONLY), 2016年03月05日
  日本語
• 大腸菌の1,3‐ブタンジオール高生産に向けた代謝改変
  片岡尚也; VANGNAI Alisa S; 藥師寿治; 加藤純一; 和田大; 横田篤; 松下一信, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2016, 3A044 (WEB ONLY), 2016年03月05日
  日本語
• Bifidobacterium longum105‐Aのメチオニン利用性に関与するS‐アデノシルメチオニン回路の解析
  松本菜々恵; 小松一喜; 阪中幹祥; 鈴木梓; 吹谷智; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2016, 2F138 (WEB ONLY), 2016年03月05日
  日本語
• クエン酸シンターゼの活性低下がCorynebacterium glutamicumのリジン生産に与える影響
  愛甲徹; 柳瀬真紀; 佐藤桃梨; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2016, 2F150 (WEB ONLY), 2016年03月05日
  日本語
• 呼吸鎖改変大腸菌ΔNDH‐IΔCyt boの酸素制限による糖代謝の変化
  杉本諒; 加藤竜一; 荒井博紀; 紀平知枝; 吹谷智; 和田大; 片岡尚也; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2016, 3F144 (WEB ONLY), 2016年03月05日
  日本語
• 高脂肪食摂取がマウスの胆汁酸組成と腸内細菌叢構成に与える影響
  相磯知里; 松浦史佳; 吹谷智; 渡辺真通; 園山慶; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2016, 2016年
• 胆汁酸摂取マウスの腸内における胆汁酸組成および菌叢の動態解析
  松浦史佳; 相磯知里; 吹谷智; 渡辺真通; 園山慶; 小椋義俊; 林哲也; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2016, 2016年
• 高脂肪食摂取ラットの盲腸内菌叢の変化における胆汁酸の寄与:「胆汁酸仮説」の証明にむけて
  渡辺真通; 萩尾真人; 李慈英; 小椋義俊; 林哲也; 清水英寿; 石塚敏; 吹谷智; 横田篤, 腸内細菌学雑誌, 30, 2, 2016年
• 高脂肪食摂取ラットの盲腸内菌叢の変化における腸内細菌の胆汁酸耐性の寄与
  渡辺真通; 萩尾真人; LEE Ja-Young; 小椋義俊; 林哲也; 清水英寿; 石塚敏; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2016, 2016年
• 対数期におけるLactobacillus gasseri JCM1131^Tのリポテイコ酸の局在
  白石宗; 横田伸一; 佐藤耶舞羽; 伊藤利章; 吹谷智; 山本聡; 小笠原徳子; 佐藤豊孝; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2016, 2016年
• 腸内生存に寄与するビフィズス菌遺伝子の探索系の構築
  中川路伸吾; 阪中幹祥; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2016, 2016年
• R-IVET法によるマウス消化管特異的に発現するビフィズス菌遺伝子の同定
  石神夏実; 河口礼佳; 平等清夏; 阪中幹祥; 横田篤; 吹谷智, 日本生物工学会大会講演要旨集, 68th, 2016年
• マウス消化管内で特異的に発現するビフィズス菌遺伝子の同定法の確立
  河口礼佳; 平等清夏; 石神夏実; 阪中幹祥; 横田篤; 吹谷智, 日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 10th, 2016年
• トランスポゾン変異導入系を用いたビフィズス菌の腸内生存に寄与する遺伝子の探索系の構築
  中川路伸吾; 阪中幹祥; 横田篤; 吹谷智, 日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 10th, 2016年
• 食品タンパク質由来腸内細菌代謝産物スカトールが糞中胆汁酸組成および肝臓に与える影響
  清水英寿; 清水英寿; 田中愛建; 野勢琢馬; 吹谷智; 横田篤; 石塚敏, 日本栄養・食糧学会中国・四国支部大会講演要旨集, 49th, 2016年
• 大腸菌でのpdhR欠損およびNADPH供給の強化は1,3‐ブタンジオール生産を向上させる
  片岡尚也; VANGNAI Alisa S; 藥師寿治; 加藤純一; 和田大; 横田篤; 松下一信, 日本農芸化学会中四国支部講演会講演要旨集(Web), 44th, F-7 (WEB ONLY), 2016年
  日本語
• Lactobacillus gasseri JCM 1131Tの対数期におけるリポテイコ酸の局在：Membrane vesicle表層に露出されるリポテイコ酸
  白石宗; 佐藤耶舞羽; 横田伸一; 伊藤利章; 吹谷智; 横田篤, エンドトキシン・自然免疫研究19－新たなる基礎と臨床の架け橋－, 19, 15, 17, 2016年
  日本語, 記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）
• Corynebacterium glutamicumピルビン酸キナーゼ欠失株における代謝変化とそのメカニズム
  横田篤; 澤田和典; 萩原拓也; 今井恵太; 禅院進; 和田大, 日本生物工学会大会講演要旨集, 67th, 116, 2015年09月25日
  日本語
• 大腸菌のピルビン酸脱水素酵素複合体制御因子PdhR欠損変異株での1,3‐ブタンジオール生産
  片岡尚也; VANGNAI Alisa S; 藥師寿治; 加藤純一; 和田大; 横田篤; 松下一信, 日本生物工学会大会講演要旨集, 67th, 115, 2015年09月25日
  日本語
• Bifidobacterium longum 105‐Aのメチオニン利用性に関与するC‐Sリアーゼの解析
  松本菜々恵; 鈴木梓; 小松一喜; 吹谷智; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2015, 17, 2015年08月08日
  日本語
• ピルビン酸キナーゼ欠失がCorynebacterium glutamicumのリジン生産に与える影響
  横田篤; 柳瀬真紀; 愛甲徹; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2015, 2A37P10 (WEB ONLY), 2015年03月05日
  日本語
• Bifidobacterium longum105‐Aのメチオニン利用においてS‐リボシルホモシステインリアーゼが重要な役割を果たす
  和田大; 小松一喜; 松本菜々恵; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2015, 2A37P11 (WEB ONLY), 2015年03月05日
  日本語
• 高脂肪食摂取がラット盲腸内容物の胆汁酸分泌および菌叢変化に与える影響
  渡辺真通; 萩尾真人; 藤田祐己; LEE Ja-Young; 馬場菜那子; 小椋義俊; 小椋義俊; 林哲也; 林哲也; 清水英寿; 石塚敏; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2015, 2015年
• INSeq法を用いた腸内生存に寄与するビフィズス菌遺伝子の探索系の構築
  中川路伸吾; 阪中幹祥; 横田篤; 吹谷智, 日本乳酸菌学会誌, 26, 2, 2015年
• コール酸長期摂取ラットにおける腸内細菌叢変動を介した非肥満性脂肪肝の発症
  横田篤; 李慈英; 清水英寿; 萩尾真人; 吹谷智; 大岡唯祐; 小椋義俊; 林哲也; 石塚敏, 日本未病システム学会学術総会抄録集, 22nd, 2015年
• IS3 family挿入配列ISBlo11を用いたビフィズス菌のトランスポゾン変異導入系の確立
  阪中幹祥; 横田篤; 吹谷智, 日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 9th, 2015年
• Bifidobacterium breve JCM 1192^Tを指標菌としたラット腸内に存在する胆汁酸分子種の細胞毒性評価
  渡辺真通; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2015, 2015年
• マウス腸内で特異的に発現するビフィズス菌遺伝子の探索
  河口礼佳; 石神夏実; 平等清夏; 阪中幹祥; 横田篤; 吹谷智, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2015, 2015年
• ビフィズス菌におけるシアリダーゼのムチン付着因子としての新たな役割
  西山啓太; 西山啓太; 篠原有香; 浦島匡; 吹谷智; 横田篤; 山本裕司; 向井孝夫, 日本乳酸菌学会誌, 26, 2, 2015年
• 腸内乳酸菌 Lactobacillus gasseri JCM 1131T のリポテイコ酸に認められた新奇構造
  白石宗; 横田伸一; 吹谷智; 横田篤, エンドトキシン・自然免疫研究18－自然免疫における生体防御ペプチドの多様性－, 18, 79, 81, 2015年
  日本語, 記事・総説・解説・論説等（その他）
• Delftia sp. HT23株由来D‐threo‐3‐ヒドロキシアスパラギン酸デヒドラターゼへの低活性変異導入による酵素‐基質複合体構造解析
  松本悠; 安武義晃; 田村具博; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2014, 29, 2014年09月22日
  日本語
• ビフィズス菌のメチオニン資化性に関与するS‐アデノシルメチオニン回路の解析
  小松一喜; 鈴木梓; 阪中幹祥; 吹谷智; 横田篤; 和田大, 日本生物工学会大会講演要旨集, 66th, 46, 2014年08月05日
  日本語
• 代謝トグルスイッチを用いた細胞内代謝流束制御によるIPA生産効率の向上
  相馬悠希; 鶴野圭悟; 和田大; 横田篤; 花井泰三, 日本生物工学会大会講演要旨集, 66th, 246, 2014年08月05日
  日本語
• 大腸菌によるものつくりをめざした中枢代謝と電子伝達系のエンジニアリング
  横田篤; 和田大, 日本生物工学会大会講演要旨集, 66th, 7, 2014年08月05日
  日本語
• 1P-115 大腸菌の呼吸鎖改変による糖代謝への影響(発酵生理学,発酵工学,一般講演)
  加藤 竜一; 荒井 博紀; 紀平 知枝; 吹谷 智; 和田 大; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 66, 46, 46, 2014年08月05日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• ビフィズス菌の逆流硫黄経路の同定と活性染色法によるC‐Sリアーゼの解析
  鈴木梓; 和田大; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2014, 3A15P17 (WEB ONLY), 2014年03月05日
  日本語
• Lactobacillus gasseriにおける生育段階によるリポテイコ酸の局在変化
  白石宗; 横田伸一; 佐藤耶舞羽; 伊藤利章; 吹谷智; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 25, 2, 2014年
• 微生物のストレス応答 腸管内での胆汁酸ストレスと腸内乳酸菌の生残戦略
  白石宗; 横田伸一; 吹谷智; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 25, 1, 2014年
• 大腸菌低活性型のビフィズス菌プロモーターの同定およびトランスポゾン変異導入系への応用
  阪中幹祥; 玉井早紀; 平山洋佑; 横田篤; 吹谷智, 日本乳酸菌学会誌, 25, 2, 2014年
• 大腸菌およびBifidobacterium longumにおけるビフィズス菌プロモーターの機能解析
  阪中幹祥; 玉井早紀; 平山洋佑; 横田篤; 吹谷智, 日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 8th, 2014年
• コール酸経口負荷による肝脂質蓄積
  辻美咲; 吉次玲香; 菊地慧大; 野勢琢馬; 清水英寿; 李慈英; 馬場菜那子; 萩尾真人; 吹谷智; 横田篤; 原博; 石塚敏, 肥満研究, 20, Supplement, 2014年
• コール酸長期摂取ラットにおける糞便中胆汁酸組成の変化と腸内細菌叢との関係
  馬場菜那子; 萩尾真人; LEE Ja-Young; 吹谷智; 小椋義俊; 小椋義俊; 清水英寿; 大岡唯祐; 林哲也; 林哲也; 石塚敏; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2014, 2014年
• 胆汁酸と腸内フローラ:メタボリックシンドローム発症との関連性
  横田篤; 吹谷智; ISLAM K.B.M. Saiful; 大岡唯祐; 小椋義俊; 小椋義俊; 林哲也; 林哲也; 萩尾真人; 石塚敏, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2014, 2014年
• 消化管内で発現するビフィズス菌遺伝子の探索系の構築
  河口礼佳; 平等清夏; 阪中幹祥; 平山洋佑; 横田篤; 吹谷智, 日本乳酸菌学会誌, 25, 2, 2014年
• 消化管内特異的に発現するビフィズス菌遺伝子の探索系の構築
  平等清夏; 河口礼佳; 阪中幹祥; 平山洋佑; 横田篤; 吹谷智, 日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 8th, 2014年
• ビフィズス菌由来シアリダーゼのムチン付着因子としての評価
  西山啓太; 吹谷智; 横田篤; 山本裕司; 向井孝夫, 日本畜産学会大会講演要旨, 118th, 2014年
• Skatoleの経口負荷が肝Cyp7a1発現と二次胆汁酸排泄の亢進を誘導する
  野勢琢馬; 清水英寿; 萩尾真人; 吹谷智; 横田篤; 原博; 石塚敏, 肥満研究, 20, Supplement, 2014年
• 腸内細菌代謝物スカトールは肝臓でのCyp7a1の発現と糞中二次胆汁酸増加を誘導する
  野勢琢馬; 清水英寿; 萩尾真人; 吹谷智; 横田篤; 原博; 石塚敏, 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 37th, 2014年
• 2P-023 in vivo特異的に発現するビフィズス菌遺伝子の同定法の確立(遺伝子工学,一般講演)
  河口 礼佳; 平等 清夏; 阪中 幹祥; 横田 篤; 吹谷 智, 日本生物工学会大会講演要旨集, 66, 112, 112, 2014年
  日本生物工学会, 日本語
• 1P-117 Clostridium hiranonisにおけるコール酸の代謝に対するフマル酸の影響(発酵生理学,発酵工学,一般講演)
  鳥居 剛史; 本田 希未; 萩尾 真人; 吹谷 智; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 66, 46, 46, 2014年
  日本生物工学会, 日本語
• ビフィズス菌のシアリダーゼは付着因子として機能する
  西山啓太; 吹谷智; 横田篤; 山本裕司; 向井孝夫, ミルクサイエンス, 63, 2, 2014年
• Characterization of a Lactobacillus gasseri JCM 1131(T) Lipoteichoic Acid with a Novel Glycolipid Anchor Structure (vol 79, pg 3315, 2013)
  Tsukasa Shiraishi; Shin-ichi Yokota; Naoki Morita; Satoru Fukiya; Satoru Tomita; Naoto Tanaka; Sanae Okada; Atsushi Yokota, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 79, 24, 7931, 7931, 2013年12月
  英語, その他
• Corynebacterium glutamicumのリンゴ酸‐キノン酸化還元酵素は中枢代謝におけるストレス応答時の制御点として機能する
  萩原拓也; 澤田和典; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2013, 16, 2013年11月27日
  日本語
• 1P-114 Corynebacterium glutamicumにおけるピルビン酸キナーゼ欠失およびホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼフィードバック阻害解除がリジン生産に与える影響(一般講演(発酵生理学,発酵工学))
  柳瀬 真紀; 萩原 拓也; 小倉 紘太郎; 和田 大; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 65, 2013年08月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• 2P-093 大腸菌におけるpdhR欠失変異が糖代謝に及ぼす影響について(発酵生理学,発酵工学,一般講演)
  岩部 有起; 紀平 知枝; 前田 壮矢; 吹谷 智; 和田 大; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 65, 127, 127, 2013年08月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• Oral administration of cholic acid modulates the gut microbiota and epithelial proliferation
  Satoshi Ishizuka; Manami Takatsuki; Maiko Shiwaku; Masahito Hagio; Reika Yoshitsugu; Keidai Kikuchi; Nobuyuki Fujii; Ga-Hyun Joe; Hidehisa Shimizu; Hiroshi Hara; Satoru Fukiya; Atsushi Yokota, FASEB JOURNAL, 27, 2013年04月
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
• 微生物の共存・共生と相互作用 遺伝子変異導入法の確立により見えてきたビフィズス菌の腸管定着因子
  阪中幹祥; 吹谷智; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 24, 1, 36, 2013年03月15日
  日本語
• 新規D‐erythro‐3‐hydroxyaspartate分解酵素の探索及び一次構造解析
  和田大; 長野弘幸; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2013, 2C15P05 (WEB ONLY), 2013年03月05日
  日本語
• D‐threo‐3‐ヒドロキシアスパラギン酸デヒドラターゼの立体構造解析
  松本悠; 安武義晃; 武田由希; 田村具博; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2013, 2C15A15 (WEB ONLY), 2013年03月05日
  日本語
• 乳酸菌のリポテイコ酸のイムノブロットによる検出方法の確立
  佐藤耶舞羽; 白石宗; 横田伸一; 吹谷智; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 24, 2, 2013年
• 二重相同組換え法を用いたBifidobacterium longumの染色体上遺伝子への欠失変異導入技術の開発
  吹谷智; 平山洋佑; 阪中幹祥; 福間英訓; 村山寛樹; 加納康正; 横田篤, 日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 7th, 2013年
• 腸内特異的に発現するビフィズス菌遺伝子の探索系の構築
  平等清夏; 河口礼佳; 阪中幹祥; 平山洋佑; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2013, 2013年
• 異種遺伝子発現への応用を目的としたビフィズス菌のプロモーターの評価
  玉井早紀; 阪中幹祥; 平山洋佑; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2013, 2013年
• Lactobacillus gasseri JCM1131^Tに見出された新規なリポテイコ酸の構造
  白石宗; 横田伸一; 森田直樹; 吹谷智; 冨田理; 田中尚人; 岡田早苗; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2013, 2013年
• プロバイオティクス機能の分子機構解明に向けたビフィズス菌の遺伝子欠損導入系の開発
  吹谷智; 平山洋佑; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2013, 2013年
• 有用物質生産菌の中枢代謝強化に関する基盤研究(2012年度生物工学功績賞受賞)
  横田 篤, 生物工学会誌 : seibutsu-kogaku kaishi, 91, 6, 294, 300, 2013年
  日本生物工学会, 日本語
• Corynebacterium glutamicumのオキサロ酢酸供給強化に向けた代謝改変
  萩原拓也; 下野雄太; 澤田和典; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2013, 2013年
• COMPARISON OF FERMENTATION LEVELS IN LARGE INTESTINE OF RATS FED DIFFERENT CARBOHYDRATE-SOURCE DIETS BY ANALYZING FECES USING LC/MS
  M. Hagio; M. Matsumoto; A. Shinoki; A. Yokota; S. Ishizuka, ANNALS OF NUTRITION AND METABOLISM, 63, 362, 363, 2013年
  英語, 研究発表ペーパー・要旨（国際会議）
• Bifidobacterium longum105‐Aにおけるシステイン/メチオニン代謝の解析
  鈴木梓; 吹谷智; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2012, 20, 2012年11月01日
  日本語
• 大腸菌とコリネ型グルタミン酸生産菌のエネルギー代謝工学(代謝工学,<特集>バイオ技術10年の軌跡,創立90周年記念特別企画)
  横田 篤; 和田 大, 生物工学会誌 : seibutsu-kogaku kaishi, 90, 10, 621, 622, 2012年10月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• 呼吸鎖酵素およびPdhRの欠失による大腸菌の糖代謝活性の変化
  荒井博紀; 紀平知枝; 前田壮矢; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 64th, 204, 2012年09月25日
  日本語
• 4Dp01 Corynebacterium glutamicumのオキサロ酢酸供給強化に向けた代謝改変(発酵生理学,発酵工学,一般講演)
  小倉 紘太郎; 澤田 和典; 萩原 拓也; 柳瀬 真紀; 和田 大; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 64, 2012年09月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• 2Cp18 土壌細菌由来3-ヒドロキシアスパラギン酸分解酵素の多様性(酵素学,酵素工学,一般講演)
  長野 弘幸; 横田 篤; 和田 大, 日本生物工学会大会講演要旨集, 64, 43, 43, 2012年09月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• 新規ウルソデオキシコール酸生成腸内細菌Ruminococcus gnavus N53由来の7β‐hydroxysteroid dehydrogenaseの発現と機能解析
  李慈英; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 23, 2, 124, 2012年07月01日
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのピルビン酸キナーゼ欠失およびクエン酸シンターゼ変異がアミノ酸生産に与える影響
  澤田和典; 下野雄太; 小倉紘太郎; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2012, 3C20P17 (WEB ONLY), 2012年03月05日
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのピルビン酸キナーゼ欠失およびアナプレロティック経路変異がアミノ酸生産に与える影響
  下野雄太; 澤田和典; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2012, 3C20P18 (WEB ONLY), 2012年03月05日
  日本語
• pdhR欠失変異が大腸菌の糖代謝に与える影響
  前田壮矢; 紀平知枝; 清水久美子; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2012, 3C20P14 (WEB ONLY), 2012年03月05日
  日本語
• NADH dehydrogenase II過剰発現による大腸菌の糖代謝特性の変動
  紀平知枝; 林由香里; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2012, 3C20P15 (WEB ONLY), 2012年03月05日
  日本語
• 酵素法による光学活性3‐ヒドロキシアスパラギン酸異性体の調製
  武田由希; 田中修; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2012, 3C23P11 (WEB ONLY), 2012年03月05日
  日本語
• 新規ウルソデオキシコール酸生成腸内細菌Ruminococcus gnavus N53由来の7β‐hydroxysteroid dehydrogenaseの発現と機能解析
  LEE JaYoung; 荒井尚志; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2012, 3C09A11 (WEB ONLY), 2012年03月05日
  日本語
• 腸内乳酸菌Lactobacillus gasseri JCM1131^Tのリポテイコ酸の構造とコール酸適応への関与
  白石宗; 冨田理; 田中尚人; 吹谷智; 森田直樹; 横田伸一; 岡田早苗; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 23, 2, 2012年
• ビフィズス菌由来挿入配列TLS143の転移機能の解析
  阪中幹祥; 阿部光紗; 平山洋佑; 吹谷智; 加納康正; 横田篤, 腸内細菌学雑誌, 26, 2, 2012年
• ランダム変異導入法への応用を目指したビフィズス菌由来挿入配列TLS143の機能解析
  阪中幹祥; 阿部光紗; 平山洋佑; 吹谷智; 加納康正; 横田篤, 日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 6th, 2012年
• 新規大腸菌-ビフィズス菌シャトルベクターの構築
  小野寺愛; 平山洋佑; 阪中幹祥; 吹谷智; 片山高嶺; 加納康正; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2012, 2012年
• Lactobacillus gasseri JCM1131^Tのリポテイコ酸:胆汁酸適応への関与
  白石宗; 冨田理; 田中尚人; 吹谷智; 森田直樹; 横田伸一; 岡田早苗; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2012, 2012年
• 4Fp27 ラット盲腸内細菌叢を制御する宿主因子としての胆汁酸の機能(生体情報工学,バイオインフォマティックス/システムバイオロジー/遺伝子工学,一般講演)
  吹谷 智; Islam K.B.M. Saiful; 萩尾 真人; 藤井 暢之; 石塚 敏; 大岡 唯祐; 小椋 義俊; 林 哲也; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 64, 219, 219, 2012年
  日本生物工学会, 日本語
• 4Dp11 フマル酸添加が腸内細菌による胆汁酸変換に及ぼす影響(発酵生理学,発酵工学,一般講演)
  本田 希未; 張 心〓; 吹谷 智; 石塚 敏; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 64, 208, 208, 2012年
  日本生物工学会, 日本語
• 大腸菌の呼吸鎖改変による糖代謝変化に関する研究
  荒井博紀; 紀平知枝; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集, 38th, 21, 22, 2012年
  日本語
• 2Ha09 大腸菌の糖代謝におけるpdhR欠失の有効性について(発酵生理学・発酵工学,一般講演)
  前田 壮矢; 紀平 知枝; 清水 久美子; 吹谷 智; 和田 大; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 0, 63, 168, 168, 2011年08月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• Delftia sp.HT23株由来のD‐スレオ‐3‐ヒドロキシアスパラギン酸デヒドラターゼの機能解析と発現量増大
  武田由希; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011, 197, 2011年03月05日
  日本語
• 大腸菌のpdhR欠失変異株の培養特性解析
  前田壮矢; 紀平知枝; 清水久美子; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011, 90, 2011年03月05日
  日本語
• 酵素的不斉還元反応を用いた光学活性フェニルセリンの合成
  井村友哉; 川端潤; 安田磨理; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011, 118, 2011年03月05日
  日本語
• 新規ウルソデオキシコール酸生成腸内細菌の反応特性の解析
  荒井尚志; 李慈英; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011, 274, 2011年03月05日
  日本語
• 呼吸鎖欠損が大腸菌の糖代謝に与える影響
  紀平知枝; 前田壮矢; 吹谷智; 和田大; 松下一信; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011, 90, 2011年03月05日
  日本語
• コール酸添加食摂取がラット盲腸内の細菌叢及び胆汁酸代謝に与える影響
  SAIFUL Islam K. B. M.; 吹谷智; 萩尾真人; 石塚敏; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011, 2011年
• Lactobacillus gasseri JCM1131における推定カルジオリピンシンターゼ遺伝子欠失がコール酸適応現象に与える影響
  戸部はるひ; 澤田真理子; 加藤慎二; 森田直樹; 佐々木泰子; 扇谷悟; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011, 2011年
• ビフィズス菌の挿入配列を利用したランダム変異導入系の確立
  阿部光紗; 阪中幹祥; 小林諒子; 平山洋佑; 吹谷智; 加納康正; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011, 2011年
• Bifidobacterium longum105-Aのα-ガラクトシダーゼ遺伝子破壊株の性状解析とレポーターアッセイ系への応用
  平山洋佑; 福間英訓; 村山寛樹; 吹谷智; 加納康正; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 22, 2, 2011年
• Bifidobacterium longum105-A由来挿入配列TLS143の挿入特異性および転移活性の解析
  阪中幹祥; 阿部光紗; 平山洋佑; 吹谷智; 加納康正; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 22, 2, 2011年
• NADH dehydrogenase IIの過剰発現による大腸菌の糖代謝活性の増大および呼吸鎖欠損株への導入による糖代謝改善効果
  紀平知枝; 林由香里; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集, 37th, 96, 97, 2011年
  日本語
• 新規D‐erythro‐3‐ヒドロキシアスパラギン酸変換酵素の探索
  長野弘幸; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会北海道支部講演会講演要旨, 2011, 7, 2011年
  日本語
• 2P-1109 大腸菌の発酵生理学的解析に適した最少培地および培養条件の検討(3a発酵生理学,発酵工学,一般講演,代謝生理学・発酵生産,伝統の技と先端科学技術の融合)
  紀平 知枝; 前田 壮矢; 吹谷 智; 和田 大; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 22, 0, 2010年09月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• 乳酸菌・ビフィズス菌における胆汁酸ストレス応答
  横田 篤, 日本乳酸菌学会誌 = Journal of Japan Society for Lactic Acid Bacteria, 21, 2, 87, 94, 2010年07月01日
  日本語
• 呼吸鎖欠損変異による大腸菌の糖代謝特性の変化
  紀平知枝; 吹谷智; 和田大; 松下一信; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2010, 205, 2010年03月05日
  日本語
• H⁺‐ATPase欠損がCorynebacterium glutamicumの呼吸関連酵素活性へ与える影響
  嘉藤由衣; 今井恵太; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2010, 206, 2010年03月05日
  日本語
• Delftia sp.HT23株に見出されたD‐threo‐3‐ヒドロキシアスパラギン酸デヒドラターゼの機能解析
  武田由希; 井村友哉; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2010, 19, 2010年03月05日
  日本語
• Corynebacterium glutamicumピルビン酸キナーゼ欠失株における菌体収率の向上
  澤田和典; 今井恵太; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2010, 206, 2010年03月05日
  日本語
• 嫌気呼吸の促進によるラット腸管における発癌二次胆汁酸生成抑制の試み
  張シンユ; 萩尾真人; 吹谷智; 石塚敏; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2010, 2010年
• 16S rRNA遺伝子クローンライブラリー法による胆汁酸添加食摂取ラット腸内細菌叢の解析
  SAIFUL ISLAM K. B. M.; 萩尾真人; 石塚敏; 吹谷智; 横田篤, 腸内細菌学雑誌, 24, 2, 2010年
• 腸内乳酸菌Lactobacillus gasseri JCM1131^Tにおけるコール酸適応機構と細胞膜脂質組成変化の関連性
  加藤慎二; 森田直樹; 佐々木泰子; 扇谷悟; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2010, 2010年
• 胆汁酸代謝を介した生理作用評価のための実験系構築の試み
  藤井暢之; 萩尾真人; 安藤翠; ISLAM K. B. M. Saiful; 吹谷智; 横田篤; 原博; 石塚敏, 日本食物繊維学会誌, 14, 2, 2010年
• Bifidobacterium longum105-A株における染色体遺伝子破壊技術の構築
  平山洋佑; 福間英訓; 村山寛樹; 吹谷智; 加納康正; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2010, 2010年
• Bifidobacterium longum105-A株における染色体上の標的遺伝子破壊技術の構築
  平山洋佑; 福間英訓; 村山寛樹; 吹谷智; 加納康正; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 21, 2, 2010年
• Corynebacterium glutamicum ATCC 13032のピルビン酸キナーゼ欠失株における代謝変化
  澤田和典; 和田大; 横田篤, 日本生物工学会シンポジウム講演要旨集, 2010, 20, 2010年
  日本語
• 1Dp18 酵素的光学分割による3-ヒドロキシアスパラギン酸異性体の調製(酵素学・酵素工学,一般講演)
  和田 大; 田中 修; 篠原 茂樹; 武田 由希; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 21, 0, 2009年08月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• 2Fa15 pdhR欠損変異が大腸菌の糖代謝活性に与える影響(発酵生理学・発酵工学,一般講演)
  紀平 知枝; 清水 久美子; 吹谷 智; 和田 大; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 21, 0, 77, 77, 2009年08月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• Corynebacterium glutamicumのピルビン酸キナーゼ欠失株における代謝変化
  澤田和典; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2009, 260, 2009年03月05日
  日本語
• 新規二次胆汁酸生成菌Bacteroides intestinalis AM‐1の7‐oxo胆汁酸の生成特性について
  川嶋紘子; 荒田美紀; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2009, 124, 2009年03月05日
  日本語
• Pseudomonas sp.T62由来L‐threo‐3‐hydroxyaspartate dehydrataseへの変異導入による機能改変
  和田大; 村上知子; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2009, 37, 2009年03月05日
  日本語
• 新規ウルソデオキシコール酸生成腸内細菌Ruminococcus gnavus N53の分離および本株の胆汁酸変換反応の解析
  中村勇介; 荒田美紀; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2009, 123, 2009年03月05日
  日本語
• 呼吸鎖欠損変異による大腸菌の糖代謝活性の向上
  紀平知枝; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2009, 261, 2009年03月05日
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのH⁺‐ATPase欠損による呼吸関連酵素活性の変化
  嘉藤由衣; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2009, 261, 2009年03月05日
  日本語
• 腸内乳酸菌Lactobacillus gasseri JCM1131^Tにおけるコール酸適応機構の解明
  加藤慎二; 澤田真理子; 松原裕樹; 森田直樹; 佐々木泰子; 扇谷悟; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2009, 2009年
• 腸内乳酸菌Lactobacillus gasseri JCM1131^Tにおけるコール酸適応機構と細胞膜脂質組成変化の関連性
  加藤慎二; 澤田真理子; 松原裕樹; 森田直樹; 佐々木泰子; 扇谷悟; 吹谷智; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 20, 2, 2009年
• Corynebacterium glutamicumのピルビン酸キナーゼ欠失株の代謝変化とその利用
  今井恵太; 澤田和典; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部・日本土壌肥料学会北海道支部・日本生物工学会北日本支部・日本応用糖質科学会北海道支部・北海道農芸化学協会合同学術講演会講演要旨, 2009, 15, 2009年
  日本語
• 呼吸鎖欠損変異が大腸菌の糖代謝に与える影響
  紀平知枝; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集, 35th, 33, 34, 2009年
  日本語
• 急展開を見せる腸内細菌研究 : 大規模シークエンス解析により明らかになってきた腸内細菌叢の構造と機能
  吹谷 智; 横田 篤, 化学と生物, 47, 1, 11, 13, 2009年01月01日
  社団法人 日本農芸化学会, 日本語
• Defective F1-ATPase
  John Wiley & Sons, Inc. USA, 2009年
• 2Fa10 Delftia sp. HT23由来の新規酵素D-threo-3-ヒドロキシアスパラギン酸デヒドラターゼの利用(酵素学,酵素工学,タンパク質工学,一般講演)
  和田 大; 篠原 茂樹; 前田 隆行; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 20, 0, 160, 160, 2008年07月11日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• 3S2a03 H^+-ATPアーゼ欠損変異による中枢代謝の活性化 : 大腸菌とCorynebacterium glutamicumの比較(発酵研究のフロンティア,シンポジウム)
  横田 篤; 和田 大, 日本生物工学会大会講演要旨集, 20, 0, 23, 23, 2008年07月11日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• Pseudomonas sp.T62由来のL‐threo‐3‐ヒドロキシアスパラギン酸デヒドラターゼの機能解析
  村上知子; 前田隆行; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008, 26, 2008年03月05日
  日本語
• Delftia sp.HT23由来のD‐threo‐3‐ヒドロキシアスパラギン酸デヒドラターゼのクローニングと発現
  前田隆行; 村上知子; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008, 26, 2008年03月05日
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのピルビン酸キナーゼ欠損株の解析
  禅院進; 嘉藤由衣; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008, 104, 2008年03月05日
  日本語
• 呼吸鎖欠損変異が大腸菌の糖代謝活性に与える影響
  紀平知枝; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008, 86, 2008年03月05日
  日本語
• 腸内乳酸菌Lactobacillus gasseri JCM1131^Tにおけるコール酸適応機構の解明
  松原裕樹; 森田直樹; 佐々木泰子; 扇谷悟; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008, 2008年
• 新たな腸内細菌叢解析手法としてのFISH-フローサイトメトリー法
  吹谷智; 横田篤, 生化学, 80, 5, 2008年
• Bifidobacterium longumからの転位活性を持つ挿入配列の単離
  吹谷智; 小林諒子; 加納康正; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 19, 2, 2008年
• ヒト腸内フローラの迅速・網羅的解析法の開発
  辻浩和; 松田一乗; 朝原崇; 松本一政; 松木隆広; 野本康二; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008, 2008年
• ビフィズス菌からの転位能をもつ挿入配列の単離と同定
  小林諒子; 吹谷智; 加納康正; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008, 2008年
• プロテオーム解析によるLactobacillus gasseri JCM 1131^Tのコール酸適応機構の解明
  平野友美; 加藤慎二; 佐々木泰子; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008, 2008年
• Oenococcus oeni由来プラスミドpOM1に存在するORF3は酸耐性に関与するレギュレーター様タンパク質をコードする
  小田美也子; 澤渡優喜; 吹谷智; 横田篤; 池田隆幸, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008, 2008年
• 01-014 メタゲノム法を用いた新規リパーゼ遺伝子の探索(土壌生態系,研究発表)
  鈴木 綾; 成廣 隆; 木村 信忠; 湯本 勲; 横田 篤; 鎌形 洋一, 日本微生物生態学会講演要旨集, 24, 65, 65, 2008年
  日本微生物生態学会, 日本語
• S-B1 FISH-フローサイトメトリー法によるヒト腸管内ビフィズス菌動態のモニタリング(シンポジウムB「嫌気性微生物の応用に関する最近の話題」,第24回大会シンポジウム)
  横田 篤; 吹谷 智, 日本微生物生態学会講演要旨集, 24, 183, 183, 2008年
  日本微生物生態学会, 日本語
• Pseudomonas sp.T62由来のL‐threo‐3‐hydroxyaspartate dehydrataseの機能解析と分子モデリング
  村上知子; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会北海道支部・日本土壌肥料学会北海道支部・日本生物工学会北日本支部・日本応用糖質科学会北海道支部・北海道農芸化学協会合同学術講演会講演要旨, 2008, 30, 2008年
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのH⁺‐ATPase欠損が呼吸関連酵素活性に与える影響
  嘉藤由衣; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部・日本土壌肥料学会北海道支部・日本生物工学会北日本支部・日本応用糖質科学会北海道支部・北海道農芸化学協会合同学術講演会講演要旨, 2008, 19, 2008年
  日本語
• 2C11-3 3-ヒドロキシアスパラギン酸デヒドラターゼの1次構造解析(酵素学・酵素工学・タンパク質工学,一般講演)
  和田 大; 村上 知子; 前田 隆行; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 19, 0, 83, 83, 2007年08月02日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• Diversity and mechanisms of alkali tolerance in Lactobacilli (vol 73, pg 3909, 2007)
  Yuki Sawatari; Atsushi Yokota, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 73, 16, 5385, 5385, 2007年08月
  英語, その他
• エネルギー代謝の改変による中枢代謝の活性化と有用物質発酵生産菌育種への応用
  横田 篤, バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry, 65, 6, 276, 281, 2007年06月01日
  バイオインダストリー協会, 日本語
• 新規二次胆汁酸生成菌Bacteroides intestinalis AM‐1の二次胆汁酸生成能について
  荒田美紀; 吹谷智; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2007, 165, 2007年03月05日
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのピルビン酸キナーゼ欠損株の解析
  禅院進; 椎名春樹; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2007, 186, 2007年03月05日
  日本語
• D‐threo‐3‐ヒドロキシアスパラギン酸デヒドラターゼの探索と精製
  前田隆行; 村上知子; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2007, 202, 2007年03月05日
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのH⁺‐ATPase欠損変異株における新奇な中枢代謝活性化機構
  横田篤; 李立源; 和田大; 松下一信, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2007, 41, 2007年03月05日
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのH⁺‐ATPase活性低下変異株によるバリン発酵
  土方野分; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2007, 186, 2007年03月05日
  日本語
• 大腸菌のH⁺‐ATPase欠損変異株を利用したアラニン発酵~LDH欠損の効果
  成田琴美; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2007, 186, 2007年03月05日
  日本語
• 腸内乳酸菌Lactobacillus gasseri JCM1131^Tにおけるコール酸適応機構の解明
  松原裕樹; 森田直樹; 佐々木泰子; 扇谷悟; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部・日本土壌肥料学会北海道支部・日本生物工学会北日本支部・日本応用糖質科学会北海道支部・北海道農芸化学協会合同学術講演会講演要旨, 2007, 2007年
• ビフィズス菌Bifidobacterium longum内在性プラスミドからの挿入配列の同定と塩基配列解析
  吹谷智; 杉山友彦; 加納康正; 横田篤, 日本乳酸菌学会誌, 18, 2, 2007年
• FISH-フローサイトメトリー法によるラフィノース摂取ヒト糞便における種レベルでのビフィズス菌動態解析
  吹谷智; DINOTO Achmad; TATIANA Marques; 渡辺純; 伊藤進; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2007, 2007年
• 2E11-3 Bifidobacterium longum内在性プラスミドからの挿入配列の同定と塩基配列解析(遺伝子工学・核酸工学,一般講演)
  吹谷 智; 杉山 友彦; 加納 康正; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 19, 119, 119, 2007年
  日本生物工学会, 日本語
• Pseudomonas sp.T62由来L‐threo‐3‐hydroxyaspartate dehydratase遺伝子のクローニングと大腸菌での発現
  村上知子; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会北海道支部・日本土壌肥料学会北海道支部・日本生物工学会北日本支部・日本応用糖質科学会北海道支部・北海道農芸化学協会合同学術講演会講演要旨, 2007, 12, 2007年
  日本語
• ヒト糞便から新規二次胆汁酸生成菌の分離と同定
  荒田美紀; 南田公子; 吹谷智; 和田大; 小倉嘉夫; 伊藤喜久治; 内田清久; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2006, 244, 2006年03月05日
  日本語
• 酵母におけるL‐アゼチジン‐2‐カルボン酸アセチルトランスフェラーゼの分布
  岡部佳恵; 高木博史; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2006, 250, 2006年03月05日
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのH⁺‐ATPase活性低下変異株によるパリン発酵
  土方野分; 青木亮; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2006, 237, 2006年03月05日
  日本語
• 大腸菌のH⁺‐ATPase欠損変異株を利用したアラニン発酵
  成田琴美; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2006, 237, 2006年03月05日
  日本語
• Lactobacillus gasseri JCM1131^Tにおけるコール酸適応現象
  松原裕樹; 水谷佳奈子; 森田直樹; 佐々木泰子; 扇谷悟; 吹谷智; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2006, 2006年
• FISH-フローサイトメトリー法を用いたラフィノース摂取ヒト糞便におけるビフィズス菌の動態解析
  ACHMAD Dinoto; Marques Tatiana; 吹谷智; 渡辺純; 伊藤進; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2006, 2006年
• 1E-PM1 ポストゲノム時代の乳酸菌研究 : 欧州と日本の比較(ポストゲノム時代の機能性乳酸菌の新展開,シンポジウム)
  横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 18, 75, 75, 2006年
  日本生物工学会, 日本語
• 1D10-2 Proteome analysis of a H^+-ATPase-defective mutant of Corynebacterium glutamicum cultured under biotin-sufficient conditions :
  LI Liyuan; WADA Masaru; YOKOTA Atsushi, 日本生物工学会大会講演要旨集, 18, 60, 60, 2006年
  日本生物工学会, 英語
• Corynebacterium glutamicum H⁺-ATPase活性不変異株の代謝変化とそのグルタミン酸生産への影響
  竹末信親; 青木亮; LI Liyuan; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2006, 2006年
• 2F11-2 大腸菌K-12株の呼吸鎖改変株のトランスクリプトーム解析(代謝工学・メタボローム,一般講演)
  野田 咲子; 東 直樹; 松下 一信; 和田 大; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 17, 0, 2005年09月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• 呼吸鎖改変による大腸菌の糖代謝活性の向上
  東直樹; 野田咲子; 林由香里; 松下一信; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2005, 81, 2005年03月05日
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのH¹‐ATPase変異株によるバリン発酵
  青木亮; 土方野分; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2005, 82, 2005年03月05日
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのエネルギー代謝変異株を用いたアミノ酸生産
  和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2005, 475, 2005年03月05日
  日本語
• 酵母におけるL‐アゼチジン‐2‐カルボン酸アセチルトランスフェラーゼの分布
  岡部佳恵; 高木博史; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2005, 221, 2005年03月05日
  日本語
• 発酵性糖による二次胆汁酸生成抑制機構の解明
  金子真紀; 結城敏文; 池田満雄; 冨田房男; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2005, 76, 2005年03月05日
  日本語
• 北海道産小麦粉を用いた乳酸菌発酵即席麺の開発
  花岡彰宏; 杉山久; 山内宏昭; 横田篤; 澤渡優喜, グリーンテクノ情報, 1, 1, 13, 16, 2005年03月
  日本語
• 1G14-2 FISH-フローサイトメトリー法を用いたヒト糞便bifidobacteriaの迅速定量法の開発(分類・系統・遺伝学,発酵生物学・発酵工学,一般講演)
  DINOTO Achmad; 渡辺 純; 伊藤 進; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 17, 192, 192, 2005年
  日本生物工学会, 日本語
• Corynebacterium glutamicumのH⁺-ATPase欠損変異株のグルタミン酸生産時におけるプロテオーム解析
  Li Liyuan; 青木亮; 竹末信親; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2005, 2005年
• 酵母におけるL‐アゼチジン‐2‐カルボン酸アセチルトランスフェラーゼの分布
  岡部佳恵; 高木博史; 横田篤; 和田大, 日本農芸化学会北海道支部・日本土壌肥料学会北海道支部・日本生物工学会北日本支部・日本応用糖質科学会北海道支部・北海道農芸化学協会合同学術講演会講演要旨, 2005, 10, 2005年
  日本語
• Corynebacterium glutamicumのH⁺‐ATPase活性低下変異株によるバリン発酵
  土方野分; 青木亮; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部・日本土壌肥料学会北海道支部・日本生物工学会北日本支部・日本応用糖質科学会北海道支部・北海道農芸化学協会合同学術講演会講演要旨, 2005, 11, 2005年
  日本語
• 2K15-2 Corynebacterium glutamicumのH^+-ATPase活性低下変異によるバリン生産能の向上(代謝工学・メタボローム・生体情報工学,一般講演)
  青木 亮; 和田 大; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 16, 0, 251, 251, 2004年08月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• 腸内乳酸菌の胆汁酸取込み能とプロバイオティクス機能
  横田 篤, バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry, 62, 8, 517, 520, 2004年08月01日
  バイオインダストリー協会, 日本語
• DFA III(Difructose anhydride III)投与における効果
  南田公子; 金子真紀; 天野みどり; イヌガ スジャーヤ; 曽根輝雄; 和田大; 横田篤; 原博; 浅野行蔵, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2004, 36, 2004年03月05日
  日本語
• Levodione reductaseのCorynebacterium glutamicum中での発現と立体選択性
  和田大; 片岡道彦; 清水昌; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2004, 182, 2004年03月05日
  日本語
• Corynebacterium glutamicum ATCC13032へのH⁺‐ATPase活性低下変異の導入
  竹末信親; 青木亮; 和田大; 横田篤, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2004, 11, 2004年03月05日
  日本語
• 1H13-5 Corynebacterium glutamicum の H^+-ATPase 活性低下変異によるグルタミン酸生産能の向上
  青木 亮; 和田 大; 冨田 房男; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 15, 0, 2003年08月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• 1H14-1 大腸菌 K-12 株の F_1-ATPase 欠損変異株の定量的プロテオーム解析
  尾上 和則; 和田 大; 冨田 房男; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 15, 0, 2003年08月25日
  公益社団法人日本生物工学会, 日本語
• リモニウムペレジー(Limonium perezii)の発根を促進する微生物
  イ・ヌガ スジャーヤ; 田中みち子; 曽根輝雄; 和田大; 浅野行蔵; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部・北海道農芸化学協会シンポジウム及び合同学術講演会講演要旨, 2003, 2003年
• 2A09-3 絶対好アルカリ細菌 Bacillus clarkii K24-1U 株の呼吸鎖蛋白質膜結合性シトクロム c-551 の精製及び特性解析
  土方 祥一; 松野 敏英; 原 功; 星野 保; 松山 英俊; 横田 篤; 湯本 勲, 日本生物工学会大会講演要旨集, 15, 50, 50, 2003年
  日本生物工学会, 日本語
• エネルギーが欠乏しても糖代謝活性は亢進するメカニズムとは? : 大腸菌から明らかになった呼吸鎖酵素活性の上昇による細胞の「質的変化」
  横田 篤; 冨田 房男, 化学と生物, 40, 12, 772, 774, 2002年12月25日
  学会出版センタ-, 日本語
• 411 味噌モロミ由来の耐塩性酵母の分類学的多様性(分類・系統・遺伝学,一般講演)
  田中 隆志; スジャーヤ イヌガ; 田村 吉史; 山木 携; 曽根 輝雄; 横田 篤; 浅野 行蔵; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 14, 53, 53, 2002年
  日本生物工学会, 日本語
• 402 DFA3 (Difructose anhydride 3)摂取におけるヒト腸内細菌叢のモニタリング(分類・系統・遺伝学,一般講演)
  南田 公子; イヌガ スジャーヤ; 曾根 輝雄; 浅野 行蔵; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 14, 51, 51, 2002年
  日本生物工学会, 日本語
• 366 Corynebacterium glutamicumのH^+-ATPase活性低下変異株のエナジェティクス解析とグルタミン酸生産能(代謝工学,一般講演)
  青木 亮; 田中 健児; 冨田 房男; 横田 篤, 日本生物工学会大会講演要旨集, 14, 43, 43, 2002年
  日本生物工学会, 日本語
• 腸内細菌の新機能 : Lactobacillus属乳酸菌による胆汁酸輸送とプロビオティックメカニズム(<特集>現代の乳酸菌研究を斬る)
  横田 篤; KURDI Peter; VAN VEEN Hedrik W.; 田中 博; MIERAU Igor; KONINGS Wil N.; TANNOCK Gerald W.; 冨田 房男, 生物工学会誌 : seibutsu-kogaku kaishi, 79, 6, 176, 177, 2001年
  日本生物工学会, 日本語
• Absidia corymbiferaのα-ガラクトシダーゼ遺伝子のクローニングおよび大腸菌での発現
  白 桑好; 斉藤 勝一; Sakurai Hiroaki; Sayama Koji; 横田 篤; 浅野 行蔵; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 12, 180, 180, 2000年
  日本生物工学会, 英語
• 348 Corynebacterium ammoniagenesのH^+-ATPase遺伝子のクローニングと解析
  関根 寛直; 石黒 敦子; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 12, 80, 80, 2000年
  日本生物工学会, 日本語
• 943 糸状菌12-3株によるオクラ多糖からのレピヂモイド生産
  吉村 真; 斎藤 勝一; 田中 みち子; 広瀬 克利; 浅野 行蔵; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 12, 226, 226, 2000年
  日本生物工学会, 日本語
• 1053 嫌気性ジャーファーメンターを用いた腸内細菌の培養条件の検討
  上條 万二郎; Kurdi Peter; 浅野 行蔵; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 12, 259, 259, 2000年
  日本生物工学会, 日本語
• 543 原油中難分解成分の低温分解菌の探索
  瀧田 佳樹; 横川 泰樹; 倉根 隆一郎; 浅野 行蔵; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 12, 132, 132, 2000年
  日本生物工学会, 日本語
• Pseudomonas azelaica YA-1が生産するニッケルプロトポルフィリン分解酵素の精製と性質
  Dedeles Gina Rio; 阿部 歩; 斎藤 勝一; 須藤 学; 浅野 行蔵; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 12, 131, 131, 2000年
  日本生物工学会, 英語
• 4S43 腸内細菌の胆汁酸輸送とプロビオティックメカニズムの解析
  横田 篤; Kurdi Peter; van Veen Hendrik W.; 田中 博; Mierau Igor; Konings Wil N.; Tannock Gerald W.; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 12, 373, 373, 2000年
  日本生物工学会, 日本語
• 251 微生物による砂糖からのDFA IV生産 : その1 製造法
  櫻井 博章; 菊地 裕人; 佐山 晃司; 浅野 行蔵; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 12, 54, 54, 2000年
  日本生物工学会, 日本語
• 252 微生物による砂糖からのDFA IV生産 : その2 精製・物性
  菊地 裕人; 櫻井 博章; 佐山 晃司; 浅野 行蔵; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 12, 54, 54, 2000年
  日本生物工学会, 日本語
• 306 Characterization of Yeast Strains in Alcoholic Fermentation of Brem :
  Sujaya I. Nengah; Sone T.; Yokota A.; Asano K.; Tomita F., 日本生物工学会大会講演要旨集, 12, 59, 59, 2000年
  日本生物工学会, 英語
• A novel screen for the detection of chitin acting antifungal compounds (vol 52, pg 508, 1999)
  T Sakurai; N Cheeptham; T Mikawa; A Yokota; F Tomita, JOURNAL OF ANTIBIOTICS, 52, 10, C4, C4, 1999年10月
  英語, その他
• Membrane-bound ATPase Mutation in Lactococcus lactis and its potential uses as a starter strain
  冨田 房男; 横田 篤; 天知 誠吾, 日本農芸化学会誌, 73, 519, 519, 1999年03月05日
  英語
• 1340 ニッケルプロトポルフィリンジナトリウムの微生物分解
  Dedeles Gina Rio; 阿部 歩; 住田 容子; 斎藤 勝一; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 11, 314, 314, 1999年
  日本生物工学会, 英語
• The Encyclopedia of Bioprocess Technology: Fermentation, Biocatalysis and Bioseparation (eds. M. C. Flickinger and S. W. Drew)
  John Wiley & Sons, 1999年
• 乳酸菌のATPase欠損変異株の解析 : 酸性条件におけるATPase遺伝子の発現調節
  天知 誠吾; 石川 浩平; 豊田 修次; 香川 靖雄; 横田 篤; 冨田 房男, 日本乳酸菌学会誌 = Journal of Japan Society for Lactic Acid Bacteria, 9, 1, 19, 19, 1998年09月30日
  日本語
• 乳酸菌 Lactococcus lactis subsp. lactisのH^+-ATPase遺伝子のクローニング
  石川 浩平; 天知 誠吾; 櫻井 博章; 豊田 修次; 横田 篤; 冨田 房男, 日本乳酸菌学会誌 = Journal of Japan Society for Lactic Acid Bacteria, 9, 1, 20, 20, 1998年09月30日
  日本語
• エネルギー代謝変異と中枢代謝の変化
  横田 篤; 関根 寛直; 冨田 房男, バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry, 56, 3, 29, 31, 1998年03月01日
  バイオインダストリ-協会, 日本語
• 3.乳酸菌のATPase欠損変異株の解析 : 酸性条件におけるATPase遺伝子の発現調節(乳酸菌の総合的産業利用に関する研究 : 平成9年度乳酸菌工学研究部会報告)
  天知 誠吾; 石川 浩平; 横田 篤; 冨田 房男, 生物工学会誌 : seibutsu-kogaku kaishi, 76, 11, 454, 455, 1998年
  日本生物工学会, 日本語
• 1118 Arthrobacter sp. H65-7のDFAIII分解酵素(DFAIIIase)の遺伝子クローニング
  住田 容子; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 10, 275, 275, 1998年
  日本生物工学会, 日本語
• Strategy for diversification of industrial application of lactic acid microorganism
  A Ishizaki; K Sonomoto; S Okada; S Amachi; K Ishikawa; A Yokota; F Tomita; K Doi; S Eguchi; N Akiyoshi; F Inagaki; Y Fujio; O Tanaka; S Ohmomo; S Ogata; O Kobayashi; K Hiyama; S Etoh; T Kato; S Shioya; H Shimizu; K Uchiyama; M Morita; K Shimizu; T Suzuki; R Ohashi; T Yamamoto; PM Yin; Y Park; M Okabe; H Ohara, SEIBUTSU-KOGAKU KAISHI, 76, 11, 451, 468, 1998年
  日本語, 書評論文,書評,文献紹介等
• 乳酸菌の膜結合型ATPase欠損変異株に関する研究
  天知 誠吾; 横田 篤; 豊田 修次; 冨田 房男, 日本乳酸菌学会誌 = Journal of Japan Society for Lactic Acid Bacteria, 8, 1, 30, 30, 1997年09月30日
  日本語
• Lactobacillus helveticus に対するlactoperoxidase の影響
  河村 泰代; 平野 まゆみ; 天知 誠吾; 横田 篤; 冨田 房男, 日本乳酸菌学会誌 = Journal of Japan Society for Lactic Acid Bacteria, 8, 1, 32, 32, 1997年09月30日
  日本語
• 乳酸菌の総合的産業利用に関する研究--平成8年度乳酸菌工学研究部会報告
  天知 誠吾; 横田 篤; 富田 房男, 生物工学会誌, 75, 5, 359, 384, 1997年09月
  日本生物工学会, 日本語
• イヌリン - 新糖質資源としての展望
  櫻井 博章; 横田 篤; 冨田 房男, バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry, 55, 1, 25, 29, 1997年01月01日
  バイオインダストリ-協会, 日本語
• 1.乳酸菌の膜結合型ATPase欠損変異株に関する研究(乳酸菌の総合的産業利用に関する研究 : 平成8年度乳酸菌工学研究部会報告
  天知 誠吾; 横田 篤; 冨田 房男, 生物工学会誌 : seibutsu-kogaku kaishi, 75, 5, 360, 361, 1997年
  日本生物工学会, 日本語
• S61 乳酸菌の酸性耐性とproton ATPase
  天知 誠吾; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 9, 274, 274, 1997年
  日本生物工学会, 日本語
• 375 Studies on Antifungal Antibiotics from Ellisiodothis inquinans L1588-A8 :
  Cheeptham Naowarat; 東山 耕子; 三川 隆; Phay Nyunt; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 9, 123, 123, 1997年
  日本生物工学会, 英語
• 乳酸菌の膜結合型ATPase欠損変異株に関する研究
  天知 誠吾; 横田 篤; 冨田 房男, 乳酸菌研究集談会誌, 7, 1, 12, 12, 1996年11月30日
  日本語
• Arthrobacter sp. H65-7株のInulin fructotransferase (DFA III生産型)遺伝子のクローニング : 酵素
  櫻井 博章; 横田 篤; 冨田 房男, 日本農藝化學會誌, 70, 297, 297, 1996年03月05日
  社団法人日本農芸化学会, 日本語
• Arthrobacter nicotinovorans GS-9株のlevan fructotransferaseの精製と性質 : 酵素
  斎藤 勝一; 横田 篤; 冨田 房男, 日本農藝化學會誌, 70, 297, 297, 1996年03月05日
  社団法人日本農芸化学会, 日本語
• 乳酸菌の膜結合型ATPase欠損変異株に関する研究(乳酸菌の総合的産業利用に関する研究 : 平成7年度乳酸菌工学研究部会報告)
  冨田 房勇; 天知 誠吾; 横田 篤, 生物工学会誌 : seibutsu-kogaku kaishi, 74, 4, 291, 294, 1996年
  日本生物工学会, 日本語
• 634 Arthrobacter sp. H65-7株のDFA III分解酵素の精製と詣性質
  櫻井 博章; 横田 篤; 松井 博和; 住田 容子; 森 夕美子; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 8, 183, 183, 1996年
  日本生物工学会, 日本語
• 微好気条件下における含窒素化合物の微生物分解 : 環境科学
  山本 千勢子; 我部 政晴; 小原 寿幸; 横田 篤; 冨田 房男, 日本農藝化學會誌, 69, 371, 371, 1995年07月05日
  社団法人日本農芸化学会, 日本語
• 大腸菌K-12株のF_1-ATPアーゼ欠損変異株によるピルビン酸発酵 : エネルギー代謝変異株による発酵生産の効率化 : メタボリックエンジニアリング : 有用微生物創製の新展開 : シンポジウム(S-11)
  横田 篤; 冨田 房男, 日本農藝化學會誌, 69, 439, 439, 1995年07月05日
  社団法人日本農芸化学会, 日本語
• Arthrobacter nicotinovorans GS-9株によるレバンからのDFAIVの生産 : 微生物
  横田 篤; 斎藤 勝一; 後藤 敬子; 冨田 房男, 日本農藝化學會誌, 69, 306, 306, 1995年07月05日
  社団法人日本農芸化学会, 日本語
• 大腸菌K-12株のF_1-ATPase欠損変異株のグルコース代謝促進機構の解析 : 微生物
  横田 篤; 逸見 将; 冨田 房男, 日本農藝化學會誌, 69, 75, 75, 1995年07月05日
  社団法人日本農芸化学会, 日本語
• 乳酸菌のH^+-ATPase欠損変異株に関する研究 : 微生物
  横田 篤; 天知 誠吾; 石井 哲; 冨田 房男, 日本農藝化學會誌, 69, 74, 74, 1995年07月05日
  社団法人日本農芸化学会, 日本語
• Leptosphaeria sp.の生産する抗真菌剤 : 有機化学・天然物化学
  東山 耕子; Phay Nyunt; 渡部 賢二; 三川 隆; 横田 篤; 冨田 房男, 日本農藝化學會誌, 69, 1, 1, 1995年07月05日
  社団法人日本農芸化学会, 日本語
• ニッケルプロトポルフィリンの微生物分解 : 環境科学
  阿部 歩; 山本 千勢子; 斎藤 紘一; 横田 篤; 冨田 房男, 日本農藝化學會誌, 69, 175, 175, 1995年07月05日
  社団法人日本農芸化学会, 日本語
• エネルギー代謝変異株によるピルビン酸発酵の効率化
  横田 篤; 冨田 房男, バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry, 53, 5, 24, 26, 1995年05月01日
  バイオインダストリ-協会, 日本語
• オリゴ糖の機能と生産に関する研究の最近の潮流
  横田 篤; 富田 房男, 日本醸造協会誌, 89, 8, p626, 633, 1994年08月
  日本醸造協会, 日本語
• CLONING AND CHARACTERIZATION OF A TRYPTOPHANASE GENE FROM ENTEROBACTER-AEROGENES SM-18 (VOL 139, PG 3275, 1993)
  K KAWASAKI; A YOKOTA; S OITA; C KOBAYASHI; S YOSHIKAWA; SI KAWAMOTO; S TAKAO; F TOMITA, MICROBIOLOGY-UK, 140, 999, 999, 1994年04月
  英語, その他
• 659 トリプトファナーゼの部位特異的変異導入による機能解析.
  川崎 公誠; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 6, 238, 238, 1994年
  日本生物工学会, 日本語
• 336 レバン分解酵素の糖転移作用による新規オリゴ糖の合成
  櫻井 政昭; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 6, 86, 86, 1994年
  日本生物工学会, 日本語
• 399 異種トリプトファナーゼ組換え大腸菌によるトリプトファン生産
  川崎 公誠; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 5, 135, 135, 1993年
  日本生物工学会, 日本語
• 微生物による天然多糖からの有用オリゴ糖の生産
  富田 房男; 横田 篤, 化学と生物, 30, 3, p170, 175, 1992年03月
  学会出版センタ-, 日本語
• 136. Enterobacter aerogenesトリプトファナーゼの大腸菌内での過剰生産とトリプトファン生産への応用
  川崎 公誠; 横田 篤; 富田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 4, 21, 21, 1992年
  日本生物工学会, 日本語
• 339 Enterobacter aerogenesトリプトファナーゼ遺伝子の解析とtrpプロモーターでの発現.
  川崎 公誠; 吉川 修司; 高岡 直央; 横田 篤; 冨田 房男, 日本醗酵工学会大会講演要旨集, 3, 104, 104, 1991年
  日本醗酵工学会, 日本語
• 838 Arthrobacter sp. H65-7株によるジフラクトースアンハイドライドIII (DFAIII) の生産
  平山 哲; 横田 篤; 三浦 夕美子; 榎本 光一; 冨田 房男; 高尾 彰一, 日本醗酵工学会大会講演要旨集, 234, 234, 1989年
  日本醗酵工学会, 日本語

• Amino acid fermentation
  Atsushi Yokota; Masato Ikeda
  Springer, 2017年, 9784431565185, 英語, ［編者(編著者)］
• 応用微生物学 第３版
  横田篤; 大西康夫; 小川順
  文永堂出版, 2016年07月, 4830041315, 327, ［編者(編著者)］

  
• Lactic Acid Bacteria and Bifidobacteria: Current Progress in Advanced Research
  Kenji Sonomoto; Atsushi Yokota
  Caister Academic Press, Norfolk, UK, 2011年, 9781904455820, 英語, ［編者(編著者)］
• 乳酸菌とビフィズス菌のサイエンス
  京都大学出版会, 2010年, ［共編者(共編著者)］
• Handbook of Corynebacterium glutamicum (eds. L. Eggeling and M. Bott)
  CRC Press, 2005年, ［分担執筆］
• 「微生物利用の大展開」今中忠行 監修
  株式会社エヌ・ティー・エス, 2002年
• 「食による生体機能調節の新展開」栄養・食糧科学セレクション3 <安本教傳，葛西隆則 編集>
  日本食品出版, 2002年
• Food for Health in the Pacific Rim (eds. J. R. Whitaker, N. F. Haard, C. F. Shoemaker and R. P. Singh)
  Food & Nutrition Press, Inc., 1999年

• （財）日本ビフィズス菌センター
• （財）バイオインダストリー協会
• 日本応用糖質科学会
• American Society for Microbiology
• 日本乳酸菌学会
• 日本生物工学会
• 日本農芸化学会
• Japan Bifidus Foundation
• Japan Bioindustry Association (JBA)
• The Japanese Society of Applied Glycoscience
• Japan Society for Lactic Acid Bacteria (JSLAB)
• The Society for Biotechnology, Japan
• and Agrochemistry
• Biotechnology
• Japan Society for Bioscience

• 適応的実験室進化による産業微生物のエネルギー欠乏への潜在的な適応能力の解明
  科学研究費助成事業
  2021年04月01日 - 2024年03月31日
  前田 智也; 横田 篤
  本研究では、発酵産業に重要な大腸菌やコリネ型細菌の発酵生産効率の向上を目的として、中枢代謝が活性化している様々な呼吸鎖酵素欠損株の適応的実験室進化を行うことで、産業微生物の細胞増殖と目的物質生産のバランスを最適化させる方法を明らかにすることを最終目的としている。
  大腸菌やコリネ型細菌において、酸化的リン酸化の阻害によるエネルギー欠乏の誘導が糖代謝などの中枢代謝を活性化させる一方、著しい増殖悪化を引き起こすことが先行研究から明らかにされている。申請者は、本研究において、エネルギー欠乏株の多くが酢酸を単一炭素源として生育できない、または著しく生育が阻害されることを見出した。酢酸を単一炭素源とした場合、取り込んだ酢酸をまず活性化してアセチルリン酸へ変換する過程で1分子のATPを消費し、その後基質レベルのリン酸化では1分子のATPしか合成できないため、ATP合成は酸化的リン酸化に依存していると考えられる。そのため、酢酸を単一炭素源とする選択圧をかける実験室進化を行うことで、酸化的リン酸化が阻害されているエネルギー欠乏株において、エネルギー欠乏への潜在的な適応能力が活性化された進化株が出現し得るのではないかと考えた。そこで今年度は、まず大腸菌の様々な呼吸鎖酵素を欠損したエネルギー欠乏株6株を親株として、酢酸最少培地を用いた適応的実験室進化を行った。適応的実験室進化は、コントロールとして呼吸鎖を欠損していない野生株を用い、また同一培養条件における反復数4として合計28系列行った。このような適応的実験室進化により、酢酸最少培地における生育が回復または、増殖速度が向上した進化株を取得することに成功した。
  日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 21K06142
• 大腸菌の呼吸鎖欠損株が示す異常な糖代謝の機構解明と発酵生産ロバスト化への応用
  科学研究費助成事業
  2019年04月01日 - 2022年03月31日
  横田 篤; 前田 智也; 片岡 尚也; 和田 大
  本研究では、野生株W1485から取得したΔΔ株(NDH-IとCytbo3を共に欠損)が糖消費活性と呼吸活性の著しい上昇、酢酸の生成、NADHの滞留、グルタミン酸(Glu)の著量蓄積などの異常な糖代謝を示すことを発見した。さらにメタボローム解析、RNA-Seqにより、ペントースリン酸経路、酢酸生成経路に加えて、Gluをγ-アミノ酪酸(GABA)に変換するグルタミン酸脱炭酸酵素遺伝子gadABなどの発現上昇が認められた。また、ΔΔ株を用いた発酵生産の効率化について、1,3-ブタンジオールとGABAの高生産化を目指し、どちらの物質に対してもΔΔ変異が生産性向上に寄与することを実証した。
  日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 19H02863
• 食事と腸内細菌叢：西欧食による腸内細菌叢崩壊機構の解明
  科学研究費助成事業
  2013年04月01日 - 2014年03月31日
  横田 篤
  日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 25292042
• 革新的な腸管発酵制御法:腸内細菌の嫌気呼吸の促進による発癌性二次胆汁酸生成の抑制
  科学研究費助成事業
  2011年 - 2012年
  横田 篤; 石塚 敏
  大腸癌のリスク因子として大腸内に生成される発がん性二次胆汁酸が知られている.本研究では,腸内細菌による胆汁酸の還元的代謝により生成される発がん性二次胆汁酸を低減させる新しい手法として,腸内細菌の嫌気呼吸を促進させ,胆汁酸の酸化的代謝を活性化させることを試みた.そこでラットにフマル酸を添加した飼料を摂取させ,盲腸内の嫌気呼吸の誘導を試みたところ,代表的な発がん性二次胆汁酸であるデオキシコール酸の低減可能性は示された.しかし,5~10%と高濃度のフマル酸添加必要であり,この濃度ではラットが下痢を起こすことから、実用的な抑制にはフマル酸のカプセル化等,添加方法の検討が必要である.
  日本学術振興会, 挑戦的萌芽研究, 北海道大学, 23658064
• 腸内乳酸菌の消化管内生き残り戦略:胆汁酸適応に関わる細胞表層機能の解析
  科学研究費助成事業
  2009年 - 2011年
  横田 篤; 吹谷 智; 森田 直樹; 横田 伸一
  遊離胆汁酸はその細胞膜損傷作用により腸内細菌にとって最も過酷な環境ストレス因子になっている.これまでの研究で,研究代表者らはLactobacillus gasseri JCM1131Tにヒトの主要な胆汁酸であるコール酸に対する適応現象を見出している.これは,対数増殖期の細胞を非致死濃度である4mMのコール酸に30分間暴露した後,致死濃度の15mMのコール酸で処理したところ,7時間後でも生残率がほぼ100%であったのに対し,何も処理しない細胞は生残率が千分の一あるいは一万分の一に急速に低下したというものである.この際の適応細胞では,致死濃度のコール酸による細胞膜の損傷が軽減されていて,適応に伴う細胞膜脂質組成の変化が示唆された.
  そこで適応細胞と非適応細胞から全脂質を抽出し,それらを中性脂質,糖脂質,リン脂質の3区分に分画した.それぞれの画分の比率は適応前後で変化なく,それぞれの画分の脂肪酸組成についても変化がなかった.しかし,糖脂質とリン脂質の組成に有意な変動があった.糖脂質では糖鎖の鎖長が長くなった.またリン脂質ではカルジオリピンの比率が有意に増大した.
  コール酸適応におけるカルジオリピンの役割について調べるため,ベシクル実験を行った.その結果,カルジオリピンはコール酸による攻撃に対してベシクルに抵抗性を付与することが分かり,カルジオリピンが適応機構に深く関わっていることが示唆された.
  本菌のゲノム上には,カルジオリピンの合成に作用すると考えられる2つのカルジオリピン合成酵素遺伝子が存在する.この遺伝子を単独又は両方欠損させた変異株を構築し,それらの株のコール酸適応能を調べた.単独欠損株ではいずれの株でもリン脂質画分におけるカルジオリピンの存在比が低下したが,コール酸適応により野生株並みに増大し,野生株と変わらないコール酸適応を示した.二重変異株ではカルジオリピンが殆ど検出されなかったが,それにも拘わらず,コール酸適応を示した.したがって,カルジオリピンはコール酸適応に必須ではないことが分かった.しかしこの二重変異株では,糖脂質含量の有意な減少とリン脂質含量の有意な増大が見られ,その変化は適応後により顕著になった.このことはカルジオリピンが細胞膜の脂質組成を決定する重要な役割を担っていることを示している.
  日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 21380053
• 新規二次胆汁酸生成腸内細菌の探索と大腸ガン発症プロモーター生成機構の解明
  科学研究費助成事業
  2004年 - 2006年
  横田 篤; 吹谷 智; 湯本 勳; 和田 大
  糞便サンプルから,一次胆汁酸であるコール酸(CA)とケノデオキシコール酸(CDCA)をそれぞれ大腸ガンのプロモーター活性を持つ二次胆汁酸,デオキシコール酸(DCA)とリトコール酸(LCA),に変換する7α-脱水酸化活性を持つ未知の腸内細菌の分離を目的として研究を行った.
  嫌気チャンバー内で糞便サンプルから合計619株の腸内細菌を分離し,これらのCAあるいはCDCAからの二次胆汁酸生成活性をTLC,HPLC,GC-MS分析により検出した.その結果,8株の二次胆汁酸生成菌を取得した.16SrRNA遺伝子の塩基配列の決定により,DCAやLCA生成菌株としてClostridum scindensとC.leptumを得たが,これらは既知の変換菌であった。他の6株はCDCAからLCAとは異なる代謝産物として7-オキソリトコール酸(3α-hydroxy-7-oxo-5β-cholanoic acid,7-keto-LCA)を生成していた.これら6株は7-keto-LCA生成菌としては既知のEscherichia coli(3株)やBacteroides fragilis(2株)に加えて,今まで報告のなかったBeacteroides intestinalsを含むことが判明した.本株をB.intestinalis AM-1と命名した.AM-1株はCAからは7-keto-DCAを生成した.基準株JCM13265^Tでも同様の活性が確認された.
  変換反応を既知の変換株E.coli HB101およびB.fragilis JCM11019^Tと比較したところ,AM-1株は変換反応培養時の生育量は他株に比べて低いが,変換率は90%以上であり,菌体当たりの変換活性が格段に高いことが分かった.本反応を触媒する酵素7α-hydroxysteroid dehydrogenase活性はこれら3株間に大差を認めなかった.
  日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 16380054
• 大腸菌の酸化的リン酸化欠損株のプロテオーム解析と遺伝子発現のマクロアレイ解析
  科学研究費助成事業
  2001年 - 2002年
  横田 篤; 冨田 房男
  酸化的リン酸化欠損変異(F_1-ATPase欠損変異)に伴うエネルギー代謝の撹乱が大腸菌細胞におよぼす影響を,プロテオーム変動解析とDNAマクロアレイ法によるトランスクリプトーム解析により検討した。
  [方法]
  (1)サンプル調製:大腸菌K-12野生株W1485と,そのF_1-ATPase欠損変異株をグルコース最少培地でケモスタット培養し,解析の試料とした.
  (2)プロテオーム解析:両株の全発現タンパク質を2次元電気泳動によって分離し,両株で差異の認められるタンパク質のスポットを飛行時間型質量分析計を用いて同定した.
  (3)DNAアレイ法による遺伝子発現解析:両株の細胞より全RNAを抽出し,33PラベルcDNAを合成した.これをDNAマクロアレイとハイブリダイゼーションさせ,アレイ画像読み取りと画像解析を行い,野生株と変異株の遺伝子発現の差を解析した.
  [結果]
  解糖系諸酵素ではプロテオーム解析と活性測定により変異株での発現上昇が認められたものがいくつかあったが(phosphoglycerate kinase, enolase, pyruvate kinase I, pyruvate dehydrogenase), DNAアレイでの発現上昇はPyruvate dehydrogenaseのみであった.TCAサイクルの多くの酵素では発現低下が認められ,上記3項目全てにおいて一致したのはcitrate synthase, succinyl-coA syntehtase, malate dehydrogenase, isocitrate lyase, malate synthaseであった.一方succinate dehydrogenase, fumarate hydrataseでは活性とプロテオームにおいてのみ発現低下が確認された.呼吸鎖ではNADH dehydrogenase-2とcytochrome bdの活性上昇がDNAアレイにおいても確認された.
  日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 13660072
• エネルギー代謝変異による有用微生物の育種と解析
  科学研究費助成事業
  1998年 - 2000年
  横田 篤; 富田 房男
  産業上重要な次の3種類の菌株について,エネルギー代謝に関わるH^+-ATPaseに着目した微生物機能の解析と応用について検討し,以下の結果を得た.以下の一連の検討は,エネルギー代謝の操作が微生物機能の新しい改変を可能にすることを示している.
  1.大腸菌:野生株から取得したF_1-ATPase活性欠損株を最少培地で連続培養して調製した生理学的に均一な細胞について,中枢代謝を検討した.欠損株では解糖系酵素活性は上昇,TCAサイクル関連酵素活性は低下し,呼吸鎖の成分であるNADHデヒドロゲナーゼの活性は増大した.大腸菌のゲノム情報に基づき,2次元電気泳動により発現タンパク質のプロテオーム変動解析を行い,F_1-ATPase欠損変異株においては細胞成分が質的に作り変えられていることを明らかにした.
  2.コリネ型グルタミン酸生産菌:Corynebacterium glutamicumのH^+-ATPase活性低下変異株の発酵経過を調べた.変異株では菌体当たりの糖消費量が増大していること,また,グルタミン酸はほとんど生産されなくなり,代わりにピルビン酸,アラニン,乳酸の生成量が増加することを見出した.H^+-ATPase遺伝子のクローニングを行い,完全長の遺伝子を得た.本遣伝子を大腸菌-コリネバクテリウムシャトルベクターに連結し,C.glutamicum野生株の形質転換を行った.その結果,形質転換体のH^+-ATPase活性は野生株の約2.7倍に上昇した.
  3.乳酸菌:チーズスターター乳酸菌Lactococcus lactisにおいて,H^+-ATPase活性の低下は酸性感受性を与え,細胞内pHの恒常性維持にH^+-ATPaseが深く関わることが明らかになった.本菌のH^+-ATPaseオペロン全遺伝子をクローニングした.
  日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 10460033
• 変異株を用いる抗真菌剤の探索
  科学研究費助成事業
  1998年 - 1999年
  冨田 房男; 横田 篤
  先に得られた物質AM-1及びNCA-D6関連物質の単離精製、を行った。
  AM-1関連物質と想定されるAM-2を単離した。
  AM-2はキチン合成酵素の一部を欠損した株にのみ生育阻害をもたらし、同時に行った野生株には生育阻害は見られなかった。また、その他の糸状菌Aiternaria sp.、Fusarium oxysporum、細菌Salmonella typhymurium、Bacillus subtillisにも生育阻害は見られなかった。AM-2の機器分析の結果分子量が303、分子式がC_<21>H_<37>Nであることがわかった。AM-2は、野生株の粗精製キチン合成酵素反応を阻害することが確認された。また、^3H-uracil、^3H-thymidine、^3H-leucineを用いた取り込み実験の結果、AM-2が3H-uracilと^3H-leucineの取り組みを阻害しており、AM-2によるRNAおよびタンパク合成が影響を受けていると示唆された。
  NCA-D6関連の少なくとも4つの物質が確認された。NCA-D6も、キチン合成酵素の一部欠損株にのみ生育阻害をもたらし、同時に行った野生株には生育阻害は見られなかった。また、その他の糸状菌Aiternaria sp.、Fusarium oxysporum、細菌Salmomella typhymurium、Bacillus subtillisにも生育阻害は見られなかった。分子量646、分子式C_<37>H_<58>O_9であり、その構造を明らかにした。NCA-D6は野生株の粗精製キチン合成酵素反応を阻害し また、^3H-uracil、^3H-thymidine、^3H-leucineを用いた取り込み実験の結果、3H-leucineの取り込みを阻害しており、タンパク合成が影響を受けていると示唆された。既知の物質ではあったものの、キチン合成を阻害するという報告は本研究が初めてである。関連物質について単離精製を進め、機器分析にかける段階である。
  日本学術振興会, 萌芽的研究, 北海道大学, 10876015
• 微生物による新規オリゴ糖の生産及び機能評価に関する研究
  科学研究費助成事業
  1995年 - 1997年
  冨田 房男; 佐山 晃司; 原 博; 葛西 隆則; 横田 篤
  1.製造原料の供給:チコリよりイヌリンを抽出精製するプロセスをビ-トからの蔗糖精製と同様の工程で検討し、イヌリン調製法を確立した。レバンについてもレバン生産菌のジャー培養法の確立を行い、その培養液からの回収、精製プロセスを確立した。また、粗抽出液や培養液中にオリゴ糖生産酵素を添加するなどの方法で原料精製プロセスの省略化を図ったオリゴ糖生産についても検討している。2.オリゴ糖生産菌の探索、生産菌の育種改良:オリゴ糖生産菌の探索を土壌微生物に加え植物内生菌より行い、その中からオリゴ糖生産株としてキシロビオースを生産する糸状菌を新たに単離した。また、DFAIII、DFAIVの生成酵素遺伝子(ift、lft)のクローニングと塩基配列の決定を行い、大腸菌での高発現系を構築し、それぞれ共に元株より高活性のオリゴ糖生成酵素の調製に成功した。3.オリゴ糖生産プロセスの構築:オリゴ糖生産菌株の培養法またはクローン化し高発現し生産された酵素の諸性質をそれぞれ決定し、DFAIII、DFAIV,イヌロトリオース、レバンビオースの生成酵素生産条件、酵素反応条件を確立した。DFAIII、DFAIVについては酵素反応液中からの精製方法を確立し、酵母による発酵、イオン交換カラム、結晶化することにより精製オリゴ糖標品を大量に調製した。4.オリゴ糖の栄養・機能性評価:3により大量調製したDFAIIIの加工特性や腸内細菌による利用性ラットや人での栄養評価を行った。そのうちラットを用いたカルシウム吸収促進効果を調べたところ、DFAIIIはラフィノースやフラクトオリゴ糖以上のカルシウム吸収促進を有することがわかり、その促進部位・作用は大腸部位での腸内細菌による発酵基質としての他、小腸部位でも濃度依存的にカルシウム吸収を促進することがわかった。DFAIIIについてもDFAIIIと同様の評価を検討している。
  日本学術振興会, 基盤研究(A), 北海道大学, 07556087
• 大腸菌及びコリネ型細菌のエネルギー代謝変異株の解析と発酵生産
  科学研究費助成事業
  1996年 - 1996年
  横田 篤; 須藤 学; 冨田 房男
  大腸菌及びコリネ型細菌のH^+-ATPアーゼの活性低下変異株について研究を進め下に示す結果を得た。
  1)これまでに当研究室で得られていた大腸菌のH^+-ATPアーゼ欠損株の炭素の流れを解糖系の酸素及び糖の取込み系について解析した。ピルビン酸キナーゼ-1とホスホグリセリン酸キナーゼの活性が元株の約1.5倍、グルコース取込み系(ホスホトランスフェラーゼ系)が約2.1倍、チトクロームb含有量が約1.4倍(呼吸が約1.7倍)に上昇しており、これらの共同作用で炭素の流れ(フラックス)に変化がでたものと結論した。中でもグルコース取込み系の増大は、ピルビン酸の生産向上と協同してフラックスの変化に最も大きな寄与があるものと考えられる。
  2)コリネ型細菌のH^+-ATPアーゼの活性が元株の約30%にまで低下した変異株を得てその解析を試みた。本変異株は生育初期には元株よりも生育が遅いが最終的な生育量はほとんど同じであった。本菌においても大腸菌と同様にピルビン酸の生産が増大し、オキソグルタール酸の生産はなくなり、クエン酸サイクルが動いていないことが示された。その結果グルタミン酸の生産はほとんどなくなり、アラニンの生産が増大した。また本菌でも糖消費が増大していたがこれもグルコース取込み系(ホスホトランスフェラーゼ系)の増大が大きく寄与していることが示された。
  日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 08660083
• 2. 腸内細菌と胆汁酸の相互作用に関する総合的研究
  1996年
  競争的資金
• 大腸菌のエネルギー代謝変異株の解析-糖代謝の新規制御機構と発酵生産の効率化-
  科学研究費助成事業
  1995年 - 1995年
  横田 篤; 冨田 房男
  大腸菌K-12株由来のリボ酸要求性ピルビン酸生産菌を新株として、形質導入法によりF_1-ATPaseの欠損変異遺伝子atpA401を導入して得られたTBLA-1株では、生育は親株の70%に低下したが、菌体当りのグルコース消費速度及びピルビン酸生産速度が親株の2倍及び2.5倍に増大し、その結果ピルビン酸の生産効率が大幅に向上した。平成7年度はTBLA-1株の性質解明とともに、新たに大腸菌K-12株野生株からも同様なF_1-ATPaseの欠損変異株を導き、この株についての性質も検討し、以下の結果を得た。
  1.TBLA-1株における解糖系諸酵素活性の変化:グルコースの取込みにかかわるホスホトランスフェラーゼ系を除く解糖系の全ての酵素活性の測定を行い、ホスホグリセリン酸キナーゼ及びピルビン酸キナーゼIの活性が対数増殖期において親株の最大1.5倍に増大していることを認めた。この二つの酵素は共に基質レベルのリン酸化を触媒するものであり、F_1-ATPaseの欠損変異におけるエネルギー(ATP)欠乏を補うレスポンスとして合目的的と考えられた。その他の酵素については両株間で有意な差が認められなかった。
  2.大腸菌K-12株野生株からのF_1-ATPase欠損変異株の取得:大腸菌K-12株野生株W1485に、形質導入法によりF_1-ATPaseの欠損変異遺伝子atpA401を導入しHBA-1株を取得した。
  3.培養条件の検討:TBLA-1、HBA-1両株の培養条件を検討し、鉄イオンの添加と、有機窒素源としてポリペプトンの添加が有効であることを認めた。
  4.HBA-1の糖代謝:3の条件でTBLA-1、HBA-1両株を培養した結果、HBA-1株の培養では著量のピルビン酸が生成した。ピルビン酸生産株でない野生株由来のF_1-ATPaseの欠損株でもピルビン酸が蓄積することから、F_1-ATPaseの欠損株では解糖系が強く活性化されていることが示唆された。
  日本学術振興会, 一般研究(C), 北海道大学, 07806010
• 大腸菌のピルビン酸発酵をモデルとしたエネルギー代謝変異株による発酵生産の効率化
  科学研究費助成事業
  1994年 - 1994年
  横田 篤; 富田 房男
  大腸菌K-12株由来のリポ酸要求性ピルビン酸生産菌を親株として、形質導入法によりF_1-ATPaseの欠損変異遺伝子atpA401を導入して得られたTBLA-1株では、生育は親株の70%に低下したが、菌体当たりのグルコース消費速度およびピルビン酸生産速度が親株の2倍および2.5倍に増大し、その結果ピルビン酸生産効率が大幅に向上した。平成6年度はTBLA-1株の性質を解明することを目的として検討し、次に示す成果を得た。
  1.F_1-ATPaseレベルとピルビン酸生産効率との関連性の検討:TBLA-1株から親株の10%の活性を持つF_1-ATPaseの部分復帰変異株を取得した。この株のピルビン酸生産能は親株と同じであった。従って、ピルビン酸生産の効率化のためには、F_1-ATPaseがさらに低下する必要があることが分かった。
  2.TBLA-1株における酸素消費量の変化:ピルビン酸生産培養時のTBLA-1株の酸素消費量は親株の1.7倍に増大していた。
  3.電子伝達系のチトクロムb含有量の測定:分光学的な測定の結果、TBLA-1株では含有量が親株の3倍に増大していた。2.の結果と合わせて考えると、TBLA-1株では糖消費の増大の結果過剰に生成されるNADHを再酸化するために、これらの変化が起こったと考察された。
  4.TBLA-1株における解糖系諸酵素活性の変化:glucose phosphate isomerase,phosphofructokinase,fructose bisphosphate aldolase,phosphoglycerate mutase,pyruvate kinaseの5種類の酵素活性について測定したところ、pyruvate kinaseの活性がTBLA-1において約50%増大しており、解糖系が活性化されていることが見出された。
  日本学術振興会, 一般研究(C), 北海道大学, 06806009
• 微生物酵素を用いた未利用多糖類からの有用オリゴ糖の生産
  科学研究費助成事業
  1992年 - 1994年
  富田 房男; 須藤 学; 横田 篤
  オリゴ糖は抗う蝕作用、便秘改善、血清脂質改善などの生理作用や、低カロリー甘味物質として注目を集めている。またオリゴ糖は植物や微生物の健康に対しても有効であることが示されてきた。このようにオリゴ糖の重要性が認識されるにつれて、その効率的な生産手段が求められるようになってきた。そこで我々はイヌリンやレバンなどの未利用多糖類から微生物によってオリゴ糖を生産することとし、土壌サンプルからこれらの多糖分解菌を分離し、オリゴ糖生産菌をスクリーニングした。
  1.イヌリンからのオリゴ糖生産:イヌリンからDFAIIIを生産するArthrobacter sp.H65‐7は菌体内DFAIII分解酵素によってDFAIIIをイヌロビオースに変換することが分かった。菌体反応をにより、DFAIIIからイヌロビオース生産が可能であることを示した。Streptomyces rocheiE87はイヌリンからイヌロトリオースを生産するエキソ型酵素を生産することが分かった。本酵素の精製を行い、酵素化学的性質を解明した。
  2.レバンからのオリゴ糖生産:土壌から分離されたレバン分解菌Streptomyces exfoliatus F3‐2とArthrobacter nicotinovorans SG9は、レバンからレバンビオースとDFAIVをそれぞれ効率よく生産することが分かった。レバンビオース生成酵素を精製し、性質を解明した。
  3.糖転移反応を用いるオリゴ糖生産:Arthrobacter sp.MS9と同定された土壌分離菌のレバンビオース生成酵素を高濃度のイヌロビオースに作用させたところ、糖転移生成物と思われる3糖が生成された。構造解析の結果、このオリゴ糖はイヌロビオースの還元末端側のフラクトース残基にβ2‐6結合でフラクトースが1残基結合した新規3糖であった。
  日本学術振興会, 一般研究(B), 北海道大学, 04454074
• 1. エネルギー代謝に着目した有用微生物の機能解析と産業利用
  1988年
  競争的資金

• 新規二次胆汁酸生成抑制剤（もしくは方法）
  特許権
  2010-048241
• 乳酸菌利用による発酵即席麺の物性改良法
  特許権
  3873129
• 乳酸菌利用による発酵即席麺
  特許権
  3769616