Ph. D. (Agriculture), Hokkaido University

Master of Agriculture, Hokkaido University

応用微生物学

植物—微生物相互作用

Molecular Plant Microbe Interactions

ライフサイエンス, 応用微生物学

環境・農学, 植物保護科学

学士課程, 農学部

修士課程, 国際食資源学院

博士課程, 国際食資源学院

2013年11月, 日本農芸化学会北海道支部, 日本農芸化学会北海道支部奨励賞
イネいもち病菌の病原性変異に関する分子遺伝学的研究
曾根 輝雄

Characterization of the redox potential during the fermentation of model wine solutions by Saccharomyces cerevisiae
Kohei Sasaki; Ayumi Abe; Teruo Sone
LETTERS IN APPLIED MICROBIOLOGY, 79, 4, 2026年04月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Geographical, Seasonal, and Growth-Related Dynamics of Gut Microbiota in a Grapevine Pest, Apolygus spinolae (Heteroptera: Miridae)
Hiroyuki Morimura; Kota Ishigami; Tomoyuki Sato; Teruo Sone; Yoshitomo Kikuchi
Microbial Ecology, 87, 1, Springer Science and Business Media LLC, 2024年09月09日
研究論文（学術雑誌）

Rice Blast Field Assessment in Three Regencies Underlies the Importance of Fungicide Resistance Studies in West Java, Indonesia
Hagia Sophia Khairani; Ayumi Abe; Teruo Sone
Jurnal Fitopatologi Indonesia, 20, 4, 165, 173, The Indonesian Phytopathological Society, 2024年07月29日, ［査読有り］
研究論文（学術雑誌）, In recent decades, research about rice blast disease in Indonesia has not been focused on the dynamics of the fungus (Pyricularia oryzae) and fungicide use, which resulted in undiscovered pathogen mutations. Observations in Bogor, Cianjur, and Sukabumi Regencies in West Java reveal a high disease incidence (53%–100%), with severity ranging from 8% to 67%. The highest disease severity was recorded in Cikembar District, which is located at the foothill of Mount Gede Pangrango, Sukabumi Regency. Despite a prolonged drought caused by El Niño in 2023, Cikembar still experienced a relatively high disease severity (36%), confirming that this area remains an endemic blast area. The high disease severity, although fungicides were widely used in Cikembar, raises concerns that P. oryzae resistance to fungicides has developed, mainly to isoprothiolane which has been yearly deployed in this area. Farmers are already confronting extra challenges such as unfavorable acidic soil and differences in fungicide use practices decision-making which complicates their control efforts. Laboratory investigations are needed to validate evidence of the emergence of P. oryzae mutations against isoprothiolane in order to provide long-term recommendations for the most effective fungicide use.

The Effect of Hokkaido Red Wines on Vascular Outcomes in Healthy Adult Men: A Pilot Study.
Prae Charoenwoodhipong; Roberta R Holt; Carl L Keen; Nasim Hedayati; Tomoyuki Sato; Teruo Sone; Robert M Hackman
Nutrients, 15, 18, 2023年09月19日, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Moderate red wine intake has been associated with lower cardiovascular mortality, due in part to the intake of polyphenols and anthocyanins, whose content can vary from varietal and year of harvest. This study assessed the vascular effects in response to a single intake of 2015 and 2018 Zweigelt red wines from Hokkaido, Japan. Healthy men were randomly assigned to consume 240 mL each of a red wine, or a sparkling white grape juice as a control in a randomized three-arm cross-over design with a 7 day washout between arms. The augmentation index (AI; a measure of arterial stiffness) and AI at 75 beats/min (AI75), reactive hyperemia index, systolic and diastolic blood pressure (SBP and DBP, respectively), and platelet reactivity were assessed at baseline and two and four hours after each beverage intake. Changes from the baseline were analyzed using a linear mixed model. Significant treatment effects (p = 0.02) were observed, with AI 13% lower after the intake of the 2015 or 2018 vintages compared to the control. Intake of the 2018 vintage reduced SBP and DBP (-4.1 mmHg and -5.6 mmHg, respectively; p = 0.02) compared to the 2015 wine and the control drink. The amount of hydroxytyrosol in the 2018 wine was almost twice the amount as in the 2015 wine, which may help explain the variable blood pressure results. Future studies exploring the vascular effects of the same red wine from different vintage years and different phenolic profiles are warranted.

PANI sensor for monitoring the oxidative degradation of wine using cyclic voltammetry.
Parvin Begum; Liu Yang; Tatsuya Morozumi; Teruo Sone; Toshikazu Kawaguchi
Food chemistry, 414, 135740, 135740, 2023年07月15日, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Redox species in wine are altered by pH and some wines are easily degraded due to oxidation and sulfur dioxide (SO2) reduction. There is a need for quick, easy, simple, and economical methodologies for pH and wine-oxidized products (acetaldehyde) analysis. This study aimed to measure pH and degradation of wines that were electrochemically analyzed using polyaniline (PANI) sensor. Gas chromatography (GC) and fourier transform infrared spectrometer (FT-IR) were also used. Electrochemical analysis showed that oxidation was accelerated and peak currents (Ip,a) and potentials (Ep,a) shifted to negative direction due to acetaldehyde formation. PANI sensor achieved a limit of detection (LOD) of 7 × 10-1 ppm and a sensitivity of 5.20 µA ppm-1 cm-2. Acetaldehyde formation was confirmed by GC (30%) and FT-IR spectra at 1647 cm-1 to the CO vibration of aldehyde. These results suggested that acetaldehyde degraded the taste of wine after remaining open.

Insight into the population dynamics of pathogenic bacteria causing grapevine crown gall in snowfall areas: snow cover protects the proliferation of pathogenic bacteria.
Akira Kawaguchi; Manabu Nemoto; Sunao Ochi; Yosuke Matsushita; Tomoyuki Sato; Teruo Sone
Frontiers in plant science, 14, 1198710, 1198710, 2023年06月, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Grapevine crown gall (GCG) is a significant bacterial disease caused by tumorigenic Allorhizobium vitis (TAV) and is prevalent worldwide. TAV infects grapevines through wounds such as freezing injuries. Although grapevines typically avoid being wounded under snow cover, GCG occurs in many commercial vineyards in snowy regions. This study investigated the TAV population in GCG gall tissues, grapevine skins, and snow on grapevine skins from six infected vineyards located in Hokkaido, Japan, an area known for heavy snowfall. TAV was isolated not only from gall tissues but also from skins and snow on skins throughout the year. Hierarchical Bayesian model (HBM) analysis revealed that the number of TAV cells in gall tissues was affected by cultivar and low temperature, while those in skins were affected by location and low temperature. Additionally, Bayesian changepoint detection (BCD) showed that the number of TAV cells in gall and skin tissues increased during winter, including the snowfall season. Furthermore, the TAV population in grapevine skins under the snow was significantly higher than those above the snow, indicating that TAV under the snow is protected by the snow and can survive well during the snowfall season. This study highlights the ability of TAV to overwinter on/in galls and skins under the snow and act as inoculum for the next season.

Prevalence and Characterization of Gentamicin Resistance Genes in Escherichia coli Isolates from Beef Cattle Feces in Japan.
Shiori Yamamoto; Wataru Kitagawa; Motoki Nakano; Hiroshi Asakura; Tatsuya Nakayama; Eriko Iwabuchi; Teruo Sone; Kozo Asano
Current microbiology, 79, 8, 217, 217, 2022年06月15日, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Gentamicin is an important antibiotic for the treatment of opportunistic infections in the clinical field. Gentamicin-resistant bacteria have been detected in livestock animals and can be transmitted to humans through the food supply or direct contact. We have previously revealed that gentamicin-resistant Escherichia coli are distributed at a comparatively high rate from beef cattle in Japan, but few studies have focused on the molecular epidemiology of gentamicin-resistant bacteria. To understand these bacteria, this study examined the prevalence of various gentamicin resistance genes in gentamicin-resistant E. coli isolates from beef cattle feces. Of the 239 gentamicin-resistant E. coli isolates, the presence of the aacC2, aadB, or aac(3)-VIa genes was confirmed in 147, 84, and 8 isolates, respectively. All aac(3)-VIa-harboring isolates had an MIC value of 64 μg/mL for gentamicin and exhibited resistance to 11 antibiotic agents. An analysis of the representative aac(3)-VIa-harboring E. coli strain GC1-3-GR-4 revealed that the aac(3)-VIa gene was present on the IncA/C plasmid together with the aadA and blaCMY genes. Furthermore, the upstream region of the aac(3)-VIa gene contained the aadA gene and the class 1 integron-integrase gene (intI1). The aac(3)-VIa gene was detected for the first time in Japan and is expected to be able to transfer between bacteria via the IncA/C plasmid and integron. These results reveal the expansion of the distribution or diversity of gentamicin resistance genes in Japan.

Origin of Pathogens of Grapevine Crown Gall Disease in Hokkaido in Japan as Characterized by Molecular Epidemiology of Allorhizobium vitis Strains.
Akira Kawaguchi; Teruo Sone; Sunao Ochi; Yosuke Matsushita; Yoshiteru Noutoshi; Mizuho Nita
Life (Basel, Switzerland), 11, 11, 2021年11月19日, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Crown gall is a globally distributed and economically important disease of grapevine and other important crop plants. The causal agent of grapevine crown gall is tumorigenic Allorhizobium vitis (Ti) strains that harbor a tumor-inducing plasmid (pTi). The epidemic of grapevine crown gall has not been widely elucidated. In this study, we investigated the genetic diversity of 89 strains of Ti and nonpathogenic A. vitis to clarify their molecular epidemiology. Multi-locus sequence analysis (MLSA) of the partial nucleotide sequences of pyrG, recA, and rpoD was performed for molecular typing of A. vitis strains isolated from grapevines with crown gall symptoms grown in 30 different vineyards, five different countries, mainly in Japan, and seven genomic groups A to F were obtained. The results of MLSA and logistic regression indicated that the population of genetic group A was significantly related to a range of prefectures and that the epidemic of group A strains originated mainly in Hokkaido in Japan through soil infection. Moreover, group E strains could have been transported by infected nursery stocks. In conclusion, this study indicates that both soil infection and transporting of infected nursery stocks are working as infection source in Hokkaido.

Characterization and proposed spontaneous deletion mechanism of AVR-Pik locus in Pyricularia oryzae.
Phyo Han Thwin; Mai Funabiki; Yuki Tomita; Takehiko Yamazaki; Ayumi Abe; Teruo Sone
Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 85, 10, 2217, 2220, 2021年09月22日, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, In phytopathogenic fungi, a mutation in the avirulence gene can lead to the breakdown of resistance in the host plant. The nucleotide sequences of the AVR-Pik locus in the strain Ina168 and its spontaneous mutant Ina168m95-5 of Pyricularia oryzae were determined. An AVR-Pik spontaneous deletion mechanism of Ina168m95-5, including multiple homologous recombination events involving repetitive transposable elements, is proposed.

Biodesulfurization of the mixture of dibenzothiophene and its alkylated derivatives by Sphingomonas subarctica T7b
Ida Bagus Wayan Gunam; Teruo Sone; Kozo Asano
Indonesian Journal of Biotechnology, 26, 3, 122, 127, Universitas Gadjah Mada, Research Center for Biotechnology, 2021年
英語, 研究論文（学術雑誌）

Mitochondrial dynamics in Pyricularia oryzae during conidiation monitored by fluorescent microscopy
Dineesha Nipuni Balagalla; Ayumi Abe; Teruo Sone
Journal of General Plant Pathology, Springer Japan, 2021年
英語, 研究論文（学術雑誌）

Function of PoLAE2, a laeA homolog, in appressorium formation and cAMP signal transduction in Pyricularia oryzae
Pradabrat Prajanket; Kim-Chi Thi Vu; Jun Arai; Worawan Sornkom; Ayumi Abe; Teruo Sone
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 84, 11, 1, 4, Informa UK Limited, 2020年07月30日, ［査読有り］, ［責任著者］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, A novel homolog of laeA, a global regulatory gene in filamentous fungi, was identified from Pyricularia oryzae. A deletion mutant of the homolog (PoLAE2) exhibited lowered intracellular cAMP levels, and decreased appressorium formation on non-host surface; the decrease was recovered using exogenous cAMP and IBMX, indicating that PoLAE2 deletion affected the cAMP signaling pathway.

Three-dimensional visualization of mitochondria in conidia of Pyricularia oryzae using green fluorescent protein (GFP) fused with citrate synthase (CitA)
Muhammad Akhid Syib’li; Aoi Kodama; Ayumi Abe; Teruo Sone
Journal of General Plant Pathology, 86, 4, 250, 256, Springer Science and Business Media LLC, 2020年07月, ［査読有り］, ［責任著者］
研究論文（学術雑誌）

Double-Stranded Structure of the Polyinosinic-Polycytidylic Acid Molecule to Elicit TLR3 Signaling and Adjuvant Activity in Murine Intranasal A(H1N1)pdm09 Influenza Vaccination
Tetsuo Nakano; Yuki Ohara; Hiroshi Fujita; Akira Ainai; Ei-Tora Yamamura; Tadaki Suzuki; Hideki Hasegawa; Teruo Sone; Kozo Asano
DNA and Cell Biology, 39, 9, 1730, 1740, Mary Ann Liebert Inc, 2020年06月22日, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Polyinosinic-polycytidylic acid (PIC) is a potent double-stranded RNA (dsRNA) adjuvant useful in intranasal influenza vaccination. In mice, the intensity and duration of immune responses to PIC correlated with the double-stranded chain length. A rational method to avoid PIC chain extension in PIC production is to use multiple short poly(I) molecules and one long poly(C) molecule for PIC assembly. In this study, we elucidate that a newly developed uPIC100-400 molecule comprising multiple 0.1 kb poly(I) molecules and one 0.4 kb poly(C) molecule effectively enhanced the immune responses in mice, by preventing the challenged viral propagation and inducing hemagglutinin-specific IgA, after intranasal A(H1N1)pdm09 influenza vaccination. Reduced intraperitoneal toxicity of PIC prepared with multiple short poly(I) molecules in mice indicates the widened effective range of uPIC100-400 as an adjuvant. In contrast to uPIC100-400, the PIC molecule comprising multiple 0.05 kb poly(I) molecules failed to elicit mouse mucosal immunity. These results were consistent with TLR3 response but not retinoic acid inducible gene I (RIG-I)-like receptor response in the cell assays, which suggests that the adjuvant effect of PIC in mouse intranasal immunization depends on TLR3 signaling. In conclusion, the double-stranded PIC with reduced toxicity developed in this study would contribute to the development of PIC-adjuvanted vaccines.

Plasmid Sequences of Four Large Plasmids Carrying Antimicrobial Resistance Genes in Escherichia coli Strains Isolated from Beef Cattle in Japan.
Shiori Yamamoto; Wataru Kitagawa; Motoki Nakano; Hiroshi Asakura; Eriko Iwabuchi; Teruo Sone; Kozo Asano
Microbiology resource announcements, 9, 20, 2020年05月14日, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Escherichia coli is a common reservoir for antimicrobial resistance genes that can be easily transformed to possess multidrug resistance through plasmid transfer. To understand multidrug resistance plasmids, we report the plasmid sequences of four large plasmids carrying a number of genes related to antimicrobial resistance that were found in E. coli strains isolated from beef cattle.

A Peptidoglycan Amidase Mutant of Burkholderia insecticola Adapts an L-form-like Shape in the Gut Symbiotic Organ of the Bean Bug Riptortus pedestris
Shiori Goto; Tsubasa Ohbayashi; Kazutaka Takeshita; Teruo Sone; Yu Matsuura; Peter Mergaert; Yoshitomo Kikuchi
Microbes and Environments, 35, 4, n/a, n/a, Japanese Society of Microbial Ecology, 2020年
研究論文（学術雑誌）

A Peptidoglycan Amidase Mutant of Burkholderia insecticola Adapts an L-form-like Shape in the Gut Symbiotic Organ of the Bean Bug Riptortus pedestris
Goto Shiori; Ohbayashi Tsubasa; Takeshita Kazutaka; Sone Teruo; Matsuura Yu; Mergaert Peter; Kikuchi Yoshitomo
Ｍｉｃｒｏｂｅｓ ａｎｄ ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ, 35, 4, n/a, 日本微生物生態学会 / 日本土壌微生物学会 / Taiwan Society of Microbial Ecology / 植物微生物研究会 / 極限環境微生物学会, 2020年, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）,

Bacterial cell shapes may be altered by the cell cycle, nutrient availability, environmental stress, and interactions with other organisms. The bean bug Riptortus pedestris possesses a symbiotic bacterium, Burkholderia insecticola, in its midgut crypts. This symbiont is a typical rod-shaped bacterium under in vitro culture conditions, but changes to a spherical shape inside the gut symbiotic organ of the host insect, suggesting the induction of morphological alterations in B. insecticola by host factors. The present study revealed that a deletion mutant of a peptidoglycan amidase gene (amiC), showing a filamentous chain form in vitro, adapted a swollen L-form-like cell shape in midgut crypts. Spatiotemporal observations of the ΔamiC mutant in midgut crypts revealed the induction of swollen cells, particularly prior to the molting of insects. To elucidate the mechanisms underlying in vivo-specific morphological alterations, the symbiont was cultured under 13 different conditions and its cell shape was examined. Swollen cells, similar to symbiont cells in midgut crypts, were induced when the mutant was treated with fosfomycin, an inhibitor of peptidoglycan precursor biosynthesis. Collectively, these results strongly suggest that the Burkholderia symbiont in midgut crypts is under the control of the host insect via a cell wall-attacking agent.

Comparative cytology, physiology and transcriptomics of Burkholderia insecticola in symbiosis with the bean bug Riptortus pedestris and in culture
Tsubasa Ohbayashi; Ryo Futahashi; Mia Terashima; Quentin Barrière; Florian Lamouche; Kazutaka Takeshita; Xian-Ying Meng; Yasuo Mitani; Teruo Sone; Shuji Shigenobu; Takema Fukatsu; Peter Mergaert; Yoshitomo Kikuchi
The ISME Journal, 13, 6, 1469, 1483, 2019年06月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Conductive Iron Oxides Promote Methanogenic Acetate Degradation by Microbial Communities in a High-Temperature Petroleum Reservoir.
Souichiro Kato; Kaoru Wada; Wataru Kitagawa; Daisuke Mayumi; Masayuki Ikarashi; Teruo Sone; Kozo Asano; Yoichi Kamagata
Microbes and environments, 34, 1, 95, 98, 2019年03月30日, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Supplementation with conductive magnetite particles promoted methanogenic acetate degradation by microbial communities enriched from the production water of a high-temperature petroleum reservoir. A microbial community analysis revealed that Petrothermobacter spp. (phylum Deferribacteres), known as thermophilic Fe(III) reducers, predominated in the magnetite-supplemented enrichment, whereas other types of Fe(III) reducers, such as Thermincola spp. and Thermotoga spp., were dominant under ferrihydrite-reducing conditions. These results suggest that magnetite induced interspecies electron transfer via electric currents through conductive particles between Petrothermobacter spp. and methanogens. This is the first evidence for possible electric syntrophy in high-temperature subsurface environments.

Novel methods for nucleotide length control in double-stranded polyinosinic-polycytidylic acid production using uneven length components
Tetsuo Nakano; Ei-Tora Yamamura; Hiroshi Fujita; Teruo Sone; Kozo Asano
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 82, 11, 1889, 1901, Informa UK Limited, 2018年11月02日, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Polyinosinic-polycytidylic acid (PIC), a double-stranded RNA that induces innate immunity in mammals, is a candidate immunopotentiator for pharmaceuticals. The potency and adverse effects of PIC are strongly correlated with the nucleotide length, and the inability to precisely control the length in PIC production limits its practical use. Length extension during the annealing process is the major factor underlying the lack of control, but tuning the annealing conditions is insufficient to resolve this issue. In this study, we developed a novel method to produce accurate nucleotide length PIC at an industrial scale. The length extension was significantly suppressed by the assembly of multiple short polyinosinic acid molecules with one long polycytidylic acid molecule. A newly developed PIC, uPIC100-400, demonstrated a reproducible length and better storage stability than that of corresponding evenly structured PIC. Human dsRNA receptors exhibited equivalent responsiveness to uPIC100-400 and the evenly structured PIC with the same length.

Isolation of Previously Uncultured Slow-Growing Bacteria by Using a Simple Modification in the Preparation of Agar Media.
Kato S; Yamagishi A; Daimon S; Kawasaki K; Tamaki H; Kitagawa W; Abe A; Tanaka M; Sone T; Asano K; Kamagata Y
Applied and environmental microbiology, 84, 19, 2018年10月01日, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, Most microorganisms living in the environment have yet to be cultured, owing at least in part to their slow and poor propagation properties and susceptibility to oxidative stress. Our previous studies demonstrated that a simple modification in the preparation of agar media, i.e., autoclaving the phosphate and agar separately (termed "PS" medium), can greatly improve the culturability of microorganisms by mitigating oxidative stress compared with the use of "PT" medium (autoclaving the phosphate and agar together). Here, we attempted to isolate phylogenetically novel bacteria by combining PS medium with prolonged cultivation. After inoculation with forest soil or pond sediment samples, significantly more colonies appeared on PS medium than on PT medium. A total of 98 and 74 colonies that emerged after more than 7 days of cultivation were isolated as slow growers from PS and PT media, respectively. Sequencing analysis of their 16S rRNA genes revealed that the slow growers recovered from PS medium included more phylogenetically novel bacteria than those from PT medium, including a strain that could be classified into a novel order in the class Alphaproteobacteria Further physiological analysis of representative strains showed that they were actually slow and poor growers and formed small but visible colonies only on PS medium. This study demonstrates that the culturability of previously uncultured bacteria can be improved by using an isolation strategy that combines a simple modification in medium preparation with an extended incubation time.IMPORTANCE Most microbial species inhabiting natural environments have not yet been isolated. One of the serious issues preventing their isolation is intrinsically slow and/or poor growth. Moreover, these slow and/or poor growers are likely to be highly sensitive to environmental stresses, especially oxidative stress. We reported previously that interaction between agar and phosphate during autoclave sterilization generates hydrogen peroxide, which adversely affects the culturability of environmental microorganisms, in particular, slow-growing organisms vulnerable to oxidative stress. In this study, we successfully isolated many slow-growing bacterial strains with phylogenetic novelty by simply modifying their cultivation on agar plates, i.e., autoclaving the phosphate and agar separately. The current limited repertoire of culture techniques still has room for improvement in the isolation of microorganisms previously considered unculturable.

Burkholderia insecticola sp nov., a gut symbiotic bacterium of the bean bug Riptortus pedestris
Takeshita Kazutaka; Tamaki Hideyuki; Ohbayashi Tsubasa; Meng Xian-Ying; Sone Teruo; Mitani Yasuo; Peeters Charlotte; Kikuchi Yoshitomo; Vandamme Peter
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 68, 7, 2370, 2374, 2018年07月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

The DNA damage signal transducer ortholog Mop53BP1 is required for proper appressorium differentiation and pathogenicity in Pyricularia oryzae
Andre Ohara; Yui Tashika; Ayumi Abe; Teruo Sone
Journal of General Plant Pathology, 84, 3, 176, 188, Springer Tokyo, 2018年05月01日, ［査読有り］, ［責任著者］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Fluorescent reporter analysis revealed the timing and localization of AVR-Pia expression, an avirulence effector of Magnaporthe oryzae
Worawan Sornkom; Shinsuke Miki; Saori Takeuchi; Ayumi Abe; Kozo Asano; Teruo Sone
MOLECULAR PLANT PATHOLOGY, 18, 8, 1138, 1149, 2017年10月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Diversity of lactic acid bacteria from Miang, a traditional fermented tea leaf in northern Thailand and their tannin-tolerant ability in tea extract
Siriporn Chaikaew; Sasitorn Baipong; Teruo Sone; Apinun Kanpiengjai; Naradorn Chui-chai; Kozo Asano; Chartchai Khanongnuch
JOURNAL OF MICROBIOLOGY, 55, 9, 720, 729, 2017年09月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Restoration of the growth of Escherichia coli under K+-deficient conditions by Cs+ incorporation via the K+ transporter Kup.
Souichiro Kato; Yoshiki Kanata; Wataru Kitagawa; Teruo Sone; Kozo Asano; Yoichi Kamagata
Scientific reports, 7, 1, 1965, 1965, 2017年05月16日, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Burkholderia of plant-beneficial group are symbiotically associated with bordered plant bugs (Heteroptera: Pyrrhocoroidea: Largidae)
Kazutaka Takeshita; Yu Matsuura; Hideomi Itoh; Ronald Navarro; Tomoyuki Hori; Teruo Sone; Yoichi Kamagata; Peter Mergaert; Yoshitomo Kikuchi
Microbes and Environments, 30, 4, 321, 329, 2015年12月22日, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Solution structure of an avirulence protein, AVR-Pia, from Magnaporthe oryzae
Toyoyuki Ose; Azusa Oikawa; Yukiko Nakamura; Katsumi Maenaka; Yuya Higuchi; Yuki Satoh; Shiho Fujiwara; Makoto Demura; Teruo Sone; Masakatsu Kamiya
JOURNAL OF BIOMOLECULAR NMR, 63, 2, 229, 235, 2015年10月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Use of native promoter-eGFP as a gene reporter on onion epidermis to analyze gene expression of AVR-Pia, an avirulence effector of rice blast pathogen
Worawan Sornkom; Kozo Asano; Teruo Sone
Engineering Journal, 19, 3, 85, 93, Chulalongkorn University, 2015年06月05日, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Structural characterization reveals the keratinolytic activity of an arthrobacter nicotinovorans protease
Teruo Sone; Yumiko Haraguchi; Aki Kuwahara; Toyoyuki Ose; Megumi Takano; Ayumi Abe; Michiko Tanaka; Isao Tanaka; Kozo Asano
Protein and Peptide Letters, 22, 1, 63, 72, Bentham Science Publishers B.V., 2015年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Characterization of Multi-antibiotic-resistant Escherichia coli Isolated from Beef Cattle in Japan
Shiori Yamamoto; Motoki Nakano; Wataru Kitagawa; Michiko Tanaka; Teruo Sone; Katsuya Hirai; Kozo Asano
MICROBES AND ENVIRONMENTS, 29, 2, 136, 144, 2014年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Heterologous production, purification, and immunodetection of Magnaporthe oryzae avirulence protein AVR-Pia
Yuki Satoh; Shinsuke Miki; Toyoyuki Ose; Azusa Oikawa; Katsumi Maenaka; Ryouhei Terauchi; Kozo Asano; Teruo Sone
BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 78, 4, 680, 686, 2014年04月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Nonomuraea sp ID06-A0189 inulin fructotransferase (DFA III-forming): gene cloning, characterization and conservation among other Nonomuraea species
Sri Pudjiraharti; Midori Ohtani; Nanami Takano; Ayumi Abe; Puspita Lisdiyanti; Michiko Tanaka; Teruo Sone; Kozo Asano
JOURNAL OF ANTIBIOTICS, 67, 2, 137, 141, 2014年02月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Draft genome sequence of Tomitella biformata AHU 1821T, isolated from a permafrost ice wedge in Alaska
Kentaro Funo; Wataru Kitagawa; Michiko Tanaka; Teruo Sone; Kozo Asano; Yoichi Kamagata
Genome Announcements, 2, 1, American Society for Microbiology, 2014年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Draft genome sequence of methanol-utilizing Methylophilus sp. strain OH31, isolated from pond sediment in Hokkaido, Japan
Takahiro Kugo; Wataru Kitagawa; Yoshinori Shimomura; Takuya Yamagishi; Michiko Tanaka; Teruo Sone; Kozo Asano; Yoichi Kamagata
Genome Announcements, 2, 2, American Society for Microbiology, 2014年, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Raffinose production using alpha-galactosidase from Paraphaeosphaeria sp.
Hiroaki Nakata; Hiroaki Sakurai; Taizo Nagura; Michiko Tanaka; Teruo Sone; Kozo Asano
MYCOSCIENCE, 54, 4, 247, 251, 2013年07月, ［査読有り］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Biodesulfurization of dibenzothiophene and its derivatives using resting and immobilized cells of Sphingomonas subarctica T7b.
Ida Bagus Wayan Gunam; Kenta Yamamura; I Nengah Sujaya; Nyoman Semadi Antara; Wayan Redi Aryanta; Michiko Tanaka; Fusao Tomita; Teruo Sone; Kozo Asano
Journal of microbiology and biotechnology, 23, 4, 473, 82, 2013年04月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Homologous recombination causes the spontaneous deletion of AVR-Pia in Magnaporthe oryzae.
Teruo Sone; Saori Takeuchi; Shinsuke Miki; Yuki Satoh; Keisuke Ohtsuka; Ayumi Abe; Kozo Asano
FEMS microbiology letters, 339, 2, 102, 9, 2013年02月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, AVR-Pia, an avirulence gene in the genome of the rice blast fungus Magnaporthe oryzae, triggers a hypersensitive reaction in rice cultivars harbouring the resistance gene Pia. The copy number of AVR-Pia was revealed to vary from one to three among M. oryzae isolates avirulent to Pia rice, and three copies of the gene were located on a single chromosome in strain Ina168, from which the gene was originally cloned. The spontaneous avr-Pia mutant originated from Ina168, named Ina168m95-1, which lacks the AVR-Pia gene, and was therefore used to elucidate the molecular mechanism of the deletion of all three copies of AVR-Pia. Screening and analysis of cosmid clones indicated that two copies of the DNA-type transposon Occan (Occan(9E12) and Occan(3A3) ) were located on the same chromosome, and three copies of AVR-Pia were located in between the two Occan elements. Ina168m95-1 contains a conserved Occan element, named Occan(m95-1) , between sequences homologous to the 5'-flanking region of Occan(3A3) and the 3'-flanking region of Occan(9E12) . In addition, sequence polymorphisms indicated a homologous recombination between Occan(3A3) and Occan(9E12) , which resulted in Occan(m95-1) . Based on these observations, we propose the hypothesis that homologous recombination in the two Occan elements leads to the deletion of AVR-Pia in Ina168m95-1.

Comparison of Yacon (Smallanthus sonchifolius) Tuber with Commercialized Fructo-oligosaccharides (FOS) in Terms of Physiology, Fermentation Products and Intestinal Microbial Communities in Rats.
Ni Wayan Arya Utami; Teruo Sone; Michiko Tanaka; Cindy H Nakatsu; Akihiko Saito; Kozo Asano
Bioscience of microbiota, food and health, 32, 4, 167, 78, 2013年, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, The yacon (Smallanthus sonchifolius) tuber was examined with regard to its prebiotic effects compared with commercialized fructo-oligosaccharides (FOS). A feed containing 10% yacon tuber, which is equivalent to 5% commercialized FOS in terms of the amount of fructo-oligosaccharides (GF2, GF3 and GF4), was administrated to rats for 28 days. The yacon diet changed the intestinal microbial communities beginning in the first week, resulting in a twofold greater concentration of cecal short-chain fatty acids (SCFAs). The SCFA composition differed, but the cecal pH in rats fed yacon tuber was equal to that in rats fed FOS. Serum triglycerides were lower in rats fed yacon compared with rats fed FOS and the control diet. Cecal size was greater with the yacon tuber diet compared with the control diet. The abundant fermentation in the intestines created a selective environment for the intestinal microbiota, which included Lactobacillus acidophilus, Bifidobacterium pseudolongum, Bifidobacterium animalis and Barnesiella spp. according to identification with culture-independent analysis, 16S rRNA gene PCR-DGGE combined with cloning and sequencing. Barnesiella spp. and B. pseudolongum were only found in the rats fed the yacon diet, while L. acidophilus and B. animalis were found in abundance in rats fed both the yacon and FOS diets. The genus Barnesiella has not previously been reported to be associated with yacon or FOS fermentation. We concluded that the physiological and microbiological effects of the yacon tuber were different from those of FOS. Differences in cecal size, blood triglycerides and microbial community profiles including their metabolites (SCFAs) between the yacon tuber and FOS were shown to be more greatly affected by the yacon tuber rather than FOS.

Localization of resistance genes on the multiple-drug resistance plasmids in Escherichia coli isolated from beef cattle
Yamamoto S; Nakano M; Tanaka M; Kitagawa W; Sone T; Asano K
International Journal of Antimicrobial Agents, 42, S84, 2013年, ［査読有り］

Purification and characterization of phytase from Klebsiella pneumoniae 9-3B.
Lotis Escobin-Mopera; Midori Ohtani; Sachie Sekiguchi; Teruo Sone; Ayumi Abe; Michiko Tanaka; Vithaya Meevootisom; Kozo Asano
Journal of bioscience and bioengineering, 113, 5, 562, 7, 2012年05月, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

O-405 アルカリ前処理稲わらの効率的糖化を行う新規酵素の探索(セッション4:技術3:バイオリファイナリー・生物化学的変換,研究発表,(口頭発表))
岩井 崇郎; 伊藤 由美; 工藤 綾子; 田中 みち子; 阿部 歩; 曾根 輝雄; 城間 力; 徳安 健; 矢部 希見子; 長島 實; 浅野 行蔵
バイオマス科学会議発表論文集, 7, 46, 47, 一般社団法人日本エネルギー学会, 2012年
日本語, Rice straw is a new resource of second-generation bioethanol. We estimated that endophyte (microorganisms living in plant without sympton) secrete cell wall degrading enzyme when invade into host plant and they may be useful enzyme resources. Result of screening of endophytes, extracellular enzyme from 4 strains increased xylan saccharification. Especially, enzymes cocktail of commercial enzymes and enzymes from Fusarium sp. E12-4CA can degrade xylan more than 90%. Crude enzymes from 4 endophytes indicated high hemicellulase activities, so the possibility of synergistic saccharification of commercial enzymes and the crude enzymes.

Characterization of Inago1 and Inago2 retrotransposons in Magnaporthe oryzae
Edmundo Sanchez; Kozo Asano; Teruo Sone
JOURNAL OF GENERAL PLANT PATHOLOGY, 77, 4, 239, 242, 2011年07月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Actinomycete Nonomuraea sp. isolated from Indonesian soil is a new producer of inulin fructotransferase.
Sri Pudjiraharti; Nobuchika Takesue; Taiki Katayama; Puspita Lisdiyanti; Muhamad Hanafi; Michiko Tanaka; Teruo Sone; Kozo Asano
Journal of bioscience and bioengineering, 111, 6, 671, 4, 2011年06月, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A multifaceted genomics approach allows the isolation of the rice Pia-blast resistance gene consisting of two adjacent NBS-LRR protein genes.
Yudai Okuyama; Hiroyuki Kanzaki; Akira Abe; Kentaro Yoshida; Muluneh Tamiru; Hiromasa Saitoh; Takahiro Fujibe; Hideo Matsumura; Matt Shenton; Dominique Clark Galam; Jerwin Undan; Akiko Ito; Teruo Sone; Ryohei Terauchi
The Plant journal : for cell and molecular biology, 66, 3, 467, 79, 2011年05月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

EGFP-Rhm51 foci enable the visualization and enumeration of DNA double-strand breaks in Magnaporthe oryzae
Sali Atanga Ndindeng; Shinsuke Miki; Ayumi Abe; Kozo Asano; Teruo Sone
JOURNAL OF GENERAL PLANT PATHOLOGY, 76, 6, 377, 381, 2010年12月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Tomitella biformata gen. nov., sp. nov., a new member of the suborder Corynebacterineae isolated from a permafrost ice wedge.
Taiki Katayama; Tomoko Kato; Michiko Tanaka; Thomas A Douglas; Anatoli Brouchkov; Ayumi Abe; Teruo Sone; Masami Fukuda; Kozo Asano
International journal of systematic and evolutionary microbiology, 60, Pt 12, 2803, 7, 2010年12月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

One of two major paralogs of AVR-Pita1 is functional in Japanese rice blast isolates.
Mami Takahashi; Taketo Ashizawa; Kazuyuki Hirayae; Jouji Moriwaki; Teruo Sone; Ryoichi Sonoda; Masako Tsujimoto Noguchi; Susumu Nagashima; Kouji Ishikawa; Michiyoshi Arai
Phytopathology, 100, 6, 612, 8, 2010年06月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Enzymatic synthesis of Mycoplasma fermentans specific glycoglycerophospholipid from 1,2-dipalmitoylglycerol.
Noriko Ishida; Daisuke Irikura; Kazuhiro Matsuda; Seiji Sato; Teruo Sone; Michiko Tanaka; Kozo Asano
Journal of bioscience and bioengineering, 109, 4, 341, 5, 2010年04月, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A molecular phylogeny-based taxonomy of the genus Rhizopus.
Ayumi Abe; Kozo Asano; Teruo Sone
Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 74, 7, 1325, 31, 2010年, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

A real-time PCR method targeting a gene sequence encoding 16S rRNA processing protein, rimM, for detection and enumeration of Streptococcus thermophilus in dairy products
Martin Patrick Ongol; Michiko Tanaka; Teruo Sone; Kozo Asano
FOOD RESEARCH INTERNATIONAL, 42, 8, 893, 898, 2009年10月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Identification and characterization of Rhizot, a novel LTR retrotransposon of Rhizopus oryzae and R. delemar.
Ayumi Abe; Kozo Asano; Teruo Sone
Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 73, 8, 1860, 2, 2009年08月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Genomic analysis of the basal lineage fungus Rhizopus oryzae reveals a whole-genome duplication.
Li-Jun Ma; Ashraf S Ibrahim; Christopher Skory; Manfred G Grabherr; Gertraud Burger; Margi Butler; Marek Elias; Alexander Idnurm; B Franz Lang; Teruo Sone; Ayumi Abe; Sarah E Calvo; Luis M Corrochano; Reinhard Engels; Jianmin Fu; Wilhelm Hansberg; Jung-Mi Kim; Chinnappa D Kodira; Michael J Koehrsen; Bo Liu; Diego Miranda-Saavedra; Sinead O'Leary; Lucila Ortiz-Castellanos; Russell Poulter; Julio Rodriguez-Romero; José Ruiz-Herrera; Yao-Qing Shen; Qiandong Zeng; James Galagan; Bruce W Birren; Christina A Cuomo; Brian L Wickes
PLoS genetics, 5, 7, e1000549, 2009年07月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Biotransformation of daidzein to equol by crude enzyme from Asaccharobacter celatus AHU1763 required an anaerobic environment.
Charin Thawornkuno; Michiko Tanaka; Teruo Sone; Kozo Asano
Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 73, 6, 1435, 8, 2009年06月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular cloning and expression of a novel cholinephosphotransferase involved in glycoglycerophospholipid biosynthesis of Mycoplasma fermentans.
Noriko Ishida; Daisuke Irikura; Kazuhiro Matsuda; Seiji Sato; Teruo Sone; Michiko Tanaka; Kozo Asano
Current microbiology, 58, 6, 535, 40, 2009年06月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Effect of an additionally introduced degQ gene on di-D-fructofuranosyl 2,6’:2’,6 anhydride (DFA IV) production by recombinant Bacillus subtilis in a single culture production system
TAKESUE Nobuchika; SONE Teruo; TANAKA Michiko; TOMITA Fusao; ASANO Kozo
Journal of Bioscience and Bioengineering, 107, 6, 623, 9, 2009年06月, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular cloning and characterization of the AVR-Pia locus from a Japanese field isolate of Magnaporthe oryzae.
Shinsuke Miki; Kotaro Matsui; Hideki Kito; Keisuke Otsuka; Taketo Ashizawa; Nobuko Yasuda; Satoru Fukiya; Junko Sato; Kazuyuki Hirayae; Yoshikatsu Fujita; Toshihiko Nakajima; Fusao Tomita; Teruo Sone
Molecular plant pathology, 10, 3, 361, 74, 2009年05月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular characterization of the relationships among Amylomyces rouxii, Rhizopus oryzae, and Rhizopus delemar.
Hideki Kito; Ayumi Abe; I-Nengah Sujaya; Yuji Oda; Kozo Asano; Teruo Sone
Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 73, 4, 861, 4, 2009年04月23日, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Potential of selected strains of lactic acid bacteria to induce a Th1 immune profile.
Martin Patrick Ongol; Takeshi Iguchi; Michiko Tanaka; Teruo Sone; Hiroaki Ikeda; Kozo Asano; Takashi Nishimura
Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 72, 11, 2847, 57, 2008年11月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

1Dp18 組換え大腸菌による大豆由来生理活性ペプチドの大量生産系構築(生体情報工学,遺伝子工学,核酸工学,一般講演)
加藤 里佳; 白鳥 優子; 曾根 輝雄; 比良 徹; 原 博; 浅野 行蔵
日本生物工学会大会講演要旨集, 20, 0, 117, 117, 公益社団法人日本生物工学会, 2008年07月11日
日本語

Asaccharobacter celatus gen. nov., sp. nov., isolated from rat caecum.
Kimiko Minamida; Kyohei Ota; Megumi Nishimukai; Michiko Tanaka; Ayumi Abe; Teruo Sone; Fusao Tomita; Hiroshi Hara; Kozo Asano
International journal of systematic and evolutionary microbiology, 58, Pt 5, 1238, 40, 2008年05月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）, An obligately anaerobic and equol-producing bacterium, designated strain do03T, was isolated from the caecal content of a rat. Cells were Gram-positive, non-spore-forming rods. The results from a phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences showed that strain do03T formed a separate line of descent in the phylogenetic cluster of the family Coriobacteriaceae. The strain was unable to metabolize glucose or other carbohydrates as sole carbon sources; growth was enhanced in the presence of arginine. The cell wall contained meso-diaminopimelic acid. The major fatty acid was C18 : 1cis9 (54.0 %). The strain had one unidentified predominant (91.9 %) quinone that was not menaquinone, methylmenaquinone, demethylmenaquinone, ubiquinone or rhodoquinone. The DNA G+C content was 63 mol%. The data presented in this work show that strain do03T differs from members of the related recognized genera Eggerthella and Denitrobacterium at both the phylogenetic and phenotypic level. Therefore, the strain constitutes a novel genus and species, for which the name Asaccharobacter celatus gen. nov., sp. nov. is proposed. The type strain of the type species is do03T (=JCM 14811T=DSM 18785T=AHU 1763T).

Production of di-S-fructofranosil-2,6’: 2’,6-anhydride (DFA IV) by recombinant Bacillus subtilis carrying heterogeneous levan frucctotransferase from Arthrobacter nicotinovorans GS-9
TAKESUE Nobuchika; SONE Teruo; TANAKA Michiko; TOMITA Fusao; ASANO Kozo
Enzyme and Microbial Technology, 41, 6-7, 673, 676, 2007年11月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Rhizopus delemar is the proper name for Rhizopus oryzae fumaric-malic acid producers
Ayumi Abe; Yuji Oda; Kozo Asano; Teruo Sone
MYCOLOGIA, 99, 5, 714, 722, 2007年09月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Yoghurt fermented by Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus H+ -ATPase-defective mutants exhibits enhanced viability of Bifidobacterium breve during storage.
Martin Patrick Ongol; Yuki Sawatari; Yoshiko Ebina; Teruo Sone; Michiko Tanaka; Fusao Tomita; Atsushi Yokota; Kozo Asano
International journal of food microbiology, 116, 3, 358, 66, 2007年05月30日, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Determination of enzymes from Colletotrichum sp. AHU9748 essential for lepidimoide production from okra polysaccharide.
Chayaporn Saranpuetti; Michiko Tanaka; Teruo Sone; Kozo Asano; Fusao Tomita
Journal of bioscience and bioengineering, 102, 5, 452, 6, 2006年11月, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

The molecular phylogeny of the genus Rhizopus based on rDNA sequences.
Ayumi Abe; Yuji Oda; Kozo Asano; Teruo Sone
Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 70, 10, 2387, 93, 2006年10月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Production of equol from daidzein by gram-positive rod-shaped bacterium isolated from rat intestine.
Kimiko Minamida; Michiko Tanaka; Ayumi Abe; Teruo Sone; Fusao Tomita; Hiroshi Hara; Kozo Asano
Journal of bioscience and bioengineering, 102, 3, 247, 50, 2006年09月, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Biodesulfurization of alkylated forms of dibenzothiophene and benzothiophene by Sphingomonas subarctica T7b.
Ida Bagus Wayan Gunam; Yosuke Yaku; Makoto Hirano; Kenta Yamamura; Fusao Tomita; Teruo Sone; Kozo Asano
Journal of bioscience and bioengineering, 101, 4, 322, 7, 2006年04月, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Construction of pDESTR, a GATEWAY vector for gene disruption in filamentous fungi.
Ayumi Abe; Evelyn B Elegado; Teruo Sone
Current microbiology, 52, 3, 210, 5, 2006年03月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Effects of long-term ingestion of difructose anhydride III (DFA III) on intestinal bacteria and bile acid metabolism in humans.
Kimiko Minamida; Chikako Asakawa; I Nengah Sujaya; Maki Kaneko; Ayumi Abe; Teruo Sone; Hiroshi Hara; Kozo Asano; Fusao Tomita
Journal of bioscience and bioengineering, 101, 2, 149, 56, 2006年02月, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Oxidative stress induces high transcription of Rhm52 and Rhm54, novel genes identified as being involved in recombinational repair in Magnaporthe grisea
Evelyn Elegado; Asumi Iwasaki; Marites Sales; Chizu Ishii; Fusao Tomita; Teruo Sone
Journal of General Plant Pathology, 72, 1, 16, 19, 2006年02月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Development and assessment of a real-time pcr assay for rapid and sensitive detection of a novel thermotolerant bacterium, Lactobacillus thermotolerans, in chicken feces.
Abu Sadeque Md Selim; Piyanuch Boonkumklao; Teruo Sone; Apinya Assavanig; Masaru Wada; Atsushi Yokota
Applied and environmental microbiology, 71, 8, 4214, 9, 2005年08月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Effects of difructose anhydride III (DFA III) administration on bile acids and growth of DFA III-assimilating bacterium Ruminococcus productus on rat intestine.
Kimiko Minamida; Maki Kaneko; Midori Ohashi; I Nengah Sujaya; Teruo Sone; Masaru Wada; Atsushi Yokota; Hiroshi Hara; Kozo Asano; Fusao Tomita
Journal of bioscience and bioengineering, 99, 6, 548, 54, 2005年06月, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Effects of difructose anhydride III (DFA III) administration on rat intestinal microbiota.
Kimiko Minamida; Kazuki Shiga; I Nengah Sujaya; Teruo Sone; Atsushi Yokota; Hiroshi Hara; Kozo Asano; Fusao Tomita
Journal of bioscience and bioengineering, 99, 3, 230, 6, 2005年03月, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Scalusamides A-C, new pyrrolidine alkaloids from the marine-derived fungus Penicillium citrinum.
Masashi Tsuda; Mai Sasaki; Takao Mugishima; Kazusei Komatsu; Teruo Sone; Michiko Tanaka; Yuzuru Mikami; Jun'ichi Kobayashi
Journal of natural products, 68, 2, 273, 6, 2005年02月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Citrinadin A, a novel pentacyclic alkaloid from marine-derived fungus Penicillium citrinum.
Masashi Tsuda; Yuu Kasai; Kazusei Komatsu; Teruo Sone; Michiko Tanaka; Yuzuru Mikami; Jun'ichi Kobayashi
Organic letters, 6, 18, 3087, 9, 2004年09月02日, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Microflora and selected metabolites of potato pulp fermented with an Indonesian starter Ragi tape
A Abe; IN Sujaya; T Sone; K Asano; Y Oda
FOOD TECHNOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 42, 3, 169, 173, 2004年07月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Comparison of Amylomyces rouxii and Rhizopus oryzae in lactic acid fermentation of potato pulp
K Saito; A Abe; IN Sujaya; T Sone; Y Oda
FOOD SCIENCE AND TECHNOLOGY RESEARCH, 10, 2, 224, 226, 2004年05月
英語, 研究論文（学術雑誌）

DFA III(Difructose anhydride III)投与における効果
南田公子; 金子真紀; 天野みどり; イヌガ スジャーヤ; 曽根輝雄; 和田大; 横田篤; 原博; 浅野行蔵
日本農芸化学会大会講演要旨集, 2004, 36, 2004年03月05日
日本語

Identification and characterization of yeasts in brem, a traditional Balinese rice wine
IN Sujaya; NS Antara; T Sone; Y Tamura; WR Aryanta; A Yokota; K Asano; F Tomita
WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 20, 2, 143, 150, 2004年03月
英語, 研究論文（学術雑誌）

The effects of Di-D-Fructofuranose-1, 2’:2, 3’-Dianhydride (DFA III) administration on human intestinal microbiota
MINAMIDA K; SUJAYA I N; TAMURA A; SHIGEMATSU N; SONE T; YOKOTA A; ASANO K; BENNO Y; TOMITA F
Journal of Bioscience and Bioengineering, 98, 4, 244, 50, 2004年, ［査読有り］, ［国内誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

rDNA ITS sequence of Rhizopus oryzae: its application to classification and identification of lactic acid producers.
Ayumi Abe; Teruo Sone; I Nengah Sujaya; Katsuichi Saito; Yuji Oda; Kozo Asano; Fusao Tomita
Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 67, 8, 1725, 31, 2003年08月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Speradine A, a new pentacyclic oxindole alkaloid from a marine-derived fungus Aspergillus tamarii
M Tsuda; T Mugishima; K Komatsu; T Sone; M Tanaka; Y Mikami; M Shiro; M Hirai; Y Ohizumi; J Kobayashi
TETRAHEDRON, 59, 18, 3227, 3230, 2003年04月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Occan, a novel transposon in the Fot1 family, is ubiquitously found in several Magnaporthe grisea isolates.
Hideki Kito; Yosuke Takahashi; Junko Sato; Satoru Fukiya; Teruo Sone; Fusao Tomita
Current genetics, 42, 6, 322, 31, 2003年03月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Modiolides A and B, two new 10-membered macrolides from a marine-derived fungus.
Masashi Tsuda; Takao Mugishima; Kazusei Komatsu; Teruo Sone; Michiko Tanaka; Yuzuru Mikami; Jun'ichi Kobayashi
Journal of natural products, 66, 3, 412, 5, 2003年03月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Lactobacillus thermotolerans sp. nov., a novel thermotolerant species isolated from chicken faeces.
Piyanuch Niamsup; I Nengah Sujaya; Michiko Tanaka; Teruo Sone; Satoshi Hanada; Yoichi Kamagata; Saisamorn Lumyong; Apinya Assavanig; Kozo Asano; Fusao Tomita; Atsushi Yokota
International journal of systematic and evolutionary microbiology, 53, Pt 1, 263, 268, 2003年01月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Casein digestion by Debaryomyces hansenii isolated from cheese.
Haruto Kumura; Kentaro Takagaki; Teruo Sone; Maki Tsukahara; Tetsuya Tanaka; Kei-ichi Shimazaki
Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 66, 6, 1370, 3, 2002年06月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

Identification of a putative vacuolar serine protease gene in the rice blast fungus, Magnaporthe grisea.
Satoru Fukiya; Takao Kuge; Tomomi Tanishima; Teruo Sone; Takashi Kamakura; Isamu Yamaguchi; Fusao Tomita
Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 66, 3, 663, 6, 2002年03月, ［査読有り］, ［国際誌］
英語, 研究論文（学術雑誌）

The production of lepidimoide by endophytic fungus from polysaccharide extracted from Abelmoshus sp. – Identification of the product and the producing organism
Biotechnology for Sustainable Utilization of Biological Resources in the Tropics, 15, 82, 87, 2002年

Endophytic fungi isolated from Ulmus davidiana and their association with the host plant
Biotechnology for Sustainable Utilization of Biological Resources in the Tropics, 15, 72, 76, 2002年

Establishment of a new cross of the rice blast fungus derived from Japanese differential strain Ina168 and hermaphroditic rice pathogen Guy11
S Fukiya; M Kodama; H Kito; T Sone; F Tomita
BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 65, 7, 1464, 1473, 2001年07月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Structure and function analysis of the calcium-related gene spray in Neurospora crassa
JW Bok; T Sone; LB Silverman-Gavrila; RR Lew; FJ Bowring; DEA Catcheside; AJF Griffiths
FUNGAL GENETICS AND BIOLOGY, 32, 3, 145, 158, 2001年04月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Sequence analysis of porcine polymeric immunoglobulin receptor from mammary epithelial cells present in colostrum
H Kumura; T Sone; K Shimazaki; E Kobayashi
JOURNAL OF DAIRY RESEARCH, 67, 4, 631, 636, 2000年11月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Molecular structure of rDNA repeat unit in Magnaporthe grisea
T Sone; S Fukiya; M Kodama; F Tomita
BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 64, 8, 1733, 1736, 2000年08月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Clonal lineages of Japanese blast fungus population - Variation of pathogenicity and karyotype
T Sone; F Tomita
ADVANCES IN RICE BLAST RESEARCH, 15, 221, 233, 2000年
英語, 研究論文（国際会議プロシーディングス）

The frost gene of Neurospora crassa is a homolog of yeast cdc1 and affects hyphal branching via manganese homeostasis
T Sone; AJF Griffiths
FUNGAL GENETICS AND BIOLOGY, 28, 3, 227, 237, 1999年12月
英語, 研究論文（学術雑誌）

Identification and characterization of a karyotypic mutation in Magnaporthe grisea
T Sone; T Abe; M Suto; F Tomita
BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 61, 1, 81, 86, 1997年01月
英語, 研究論文（学術雑誌）

DNA fingerprinting and electrophoretic karyotyping of Japanese isolates of rice blast fungus
SONE T; ABE T; YOSHIDA N; SUTO M; TOMITA F
Annals of the Phytopathological Society of Japan, 63, 3, 155, 163, 1997年

いもち病菌の生物学的多様性
曽根 輝雄; 冨田 房男
化学と生物, 34, 10, 676, 682, Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry, 1996年10月25日
日本語

HOST SPECIES-SPECIFIC REPETITIVE DNA-SEQUENCE IN THE GENOME OF MAGNAPORTHE-GRISEA, THE RICE BLAST FUNGUS
T SONE; M SUTO; F TOMITA
BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 57, 7, 1228, 1230, 1993年07月
英語

ホエイ固形培地上における食用Penicillium属由来のリパーゼ産生
佐藤恵実; 町谷泰紀; 早川徹; 曾根輝雄; 若松純一; 木村彰; 玖村朗人, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2017, ROMBUNNO.3A05p10 (WEB ONLY), 2017年03月05日
日本語

イネいもち病菌のQoI耐性変異ミトコンドリア定量系の構築
児玉葵; 阿部歩; 内橋嘉一; 鬼頭英樹; 曾根輝雄, 日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集, 2017, 2017年

アーバスキュラー菌根菌から宿主へのリン酸供給機構:PHO1リン酸排出輸送体の機能
丸山隼人; 横山楓; 菊池裕介; 中西夏輝; 阿部歩; 曾根輝雄; 斎藤勝春; 増田税; 江沢辰広, 日本土壌肥料学会講演要旨集, 62, 30, 30, 2016年09月20日
一般社団法人 日本土壌肥料学会, 日本語

2P-038 A histidine acid phytase homodimer from Klebsiella pneumoniae 9-3B that liberates myo-inositol from phytic acid :
Kevin Sherman; Teruo Sone; Kozo Asano, 日本生物工学会大会講演要旨集, 66, 116, 116, 2014年
日本生物工学会, 英語

OK-007 メタン酸化菌とメタノール資化性菌の共生系におけるC1代謝遺伝子発現解析(共生・相互作用,口頭発表)
久後 貴寛; 下村 義典; 山岸 卓弥; 田中 みち子; 曾根 輝雄; 浅野 行蔵; 鎌形 洋一; 北川 航, 日本微生物生態学会講演要旨集, 29, 95, 95, 2013年
日本微生物生態学会, 日本語

2P-006 薬剤耐性Escherichia coliが持つプラスミド及び耐性遺伝子の関連性と多剤耐性プラスミドライブラリーの作製(分類,系統,遺伝学,一般講演)
山本 詩織; 中野 源紀; 田中 みち子; 北川 航; 曾根 輝雄; 浅野 行蔵, 日本生物工学会大会講演要旨集, 65, 105, 105, 2013年
日本生物工学会, 日本語

3P-065 DFAIIIとRuminococcus productus AHU1760の投与による腸内環境への影響
高野 七海; 藤井 早苗; 鳫 諒介; 曾根 輝雄; 田中 みち子; 浅野 行蔵, 日本生物工学会大会講演要旨集, 65, 204, 204, 2013年
日本生物工学会, 日本語

植物内生菌由来酵素を利用したアルカリ前処理稲わらの効率的糖化
岩井崇郎; 伊藤由美; 工藤綾子; 田中みち子; 阿部歩; 曾根輝雄; 城間力; 徳安健; 矢部希見子; 長島實; 浅野行蔵, 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2012, 2012年

2Ha10 枯草菌によるショ糖からのDFA IV単一発酵法の開発(発酵生理学・発酵工学,一般講演)
越本 詠美; 曾根 輝雄; 田中 みち子; 浅野 行蔵, 日本生物工学会大会講演要旨集, 63, 168, 168, 2011年
日本生物工学会, 日本語

イネいもち病抵抗性遺伝子Piaの単離・同定
神崎洋之; 奥山雄大; 阿部陽; 吉田健太郎; 松村英生; 斉藤宏昌; 伊東明子; 曾根輝雄; 寺内良平, 育種学研究, 13, 2011年

2種のNBS-LRRからなるイネいもち病抵抗性遺伝子Piaの単離・同定
神崎洋之; 奥山雄大; 阿部陽; 吉田健太郎; 松村英生; 斉藤宏昌; 伊東明子; 曾根輝雄; 寺内良平, 日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集, 2011, 2011年

イネいもち病菌の非病原性タンパク質AVR-Piaの分子間相互作用の解析
佐藤佑樹; 三木慎介; 尾瀬農之; 奥山雄大; 神崎洋之; 寺内良平; 曾根輝雄, 日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集, 2011, 2011年

Yeast Two Hybrid assayによるイネいもち病菌の非病原性遺伝子AVR-Piaのタンパク質相互作用の解析
佐藤佑樹; 三木慎介; 尾瀬農之; 奥山雄大; 神崎洋之; 寺内良平; 曾根輝雄, 日本植物病理学会報, 77, 1, 2011年

Yeast Two Hybrid assayによるイネいもち病菌の非病原性遺伝子AVR-Piaのタンパク質相互作用の解析
佐藤佑樹; 三木慎介; 尾瀬農之; 奥山雄大; 神崎洋之; 寺内良平; 曾根輝雄, 日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集, 2010, 2010年

イネいもち病菌の非病原性遺伝子AVR-Pia産物の調製と分析
尾瀬農之; 笹崎容子; 三木慎介; 奥山雄大; 神崎洋之; 寺内良平; 曾根輝雄, 日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集, 2010, 2010年

イネいもち病抵抗性遺伝子Pi-aの単離とその相同遺伝子の集団遺伝学的解析
奥山雄大; 吉田健太郎; 神崎洋之; 斉藤宏昌; 阿部陽; 藤部貴宏; OLI Muluneh; 松村英生; 曾根輝雄; 寺内良平, 日本植物病理学会報, 75, 3, 2009年

プロトプラスト一過的発現解析によるイネいもち病抵抗性遺伝子Pi-aの同定
神崎洋之; 奥山雄大; 吉田健太郎; 阿部陽; 松村英生; 斉藤宏昌; 曾根輝雄; 寺内良平, 育種学研究, 11, 2009年

(96) イネいもち病菌の非病原性遺伝子AVR-Piaのクローニング(平成20年度日本植物病理学会大会講演要旨)
三木 慎介; 芦澤 武人; 平八重 一之; 冨田 房男; 曾根 輝雄, 日本植物病理學會報, 74, 3, 192, 192, 2008年08月25日
日本植物病理学会, 日本語

アミドトランスフェラーゼGatCAB阻害剤のin vivoスクリーニング系の構築
茶谷美穂; 中村彰良; 田中みち子; 曾根輝雄; 浅野行蔵, 日本生物工学会大会講演要旨集, 60th, 2008年

2Ep16 高発現変異型DegQ遺伝子の導入による組換えBacillus subtilisを用いたDFA IV直接生産法の改善(発酵生理学,発酵工学,一般講演)
竹末 信親; 曾根 輝雄; 田中 みち子; 冨田 房男; 浅野 行蔵, 日本生物工学会大会講演要旨集, 20, 144, 144, 2008年
日本生物工学会, 日本語

(106) 日本産イネいもち病菌株におけるAvr-Pitaホモログの解析(平成19年度日本植物病理学会大会講演要旨)
高橋 真実; 芦澤 武人; 平八重 一之; 森脇 丈治; 曾根 輝雄, 日本植物病理學會報, 73, 3, 202, 203, 2007年08月25日
日本植物病理学会, 日本語

(107) イネいもち病菌の非病原性遺伝子Avr-Piaのクローニング(平成19年度日本植物病理学会大会講演要旨)
三木 慎介; 芦澤 武人; 平八重 一之; 冨田 房男; 曾根 輝雄, 日本植物病理學會報, 73, 3, 203, 203, 2007年08月25日
日本植物病理学会, 日本語

2D17-4 Levan fructotransferaseのBacillus subtilis 168 における発現と単一培養系によるスクロースからのDFA IV生産(発酵生理学・発酵工学,一般講演)
竹末 信親; 曾根 輝雄; 田中 みち子; 冨田 房男; 浅野 行蔵, 日本生物工学会大会講演要旨集, 19, 107, 107, 2007年
日本生物工学会, 日本語

イネいもち病菌の非病原性遺伝子Avr-piaのクローニング
曾根輝雄; 三木慎介; 松井幸太郎; 芹澤武人; 鬼頭英樹; 平八重一之; 中島敏彦; 冨田房男, 植物微生物研究会研究交流会講演要旨集, 16th, 2007年

(61) イネいもち病菌株OS99-G-7aの病原性獲得に関わるAvr-Pitaの遺伝子変異(平成18年度日本植物病理学会大会講演要旨)
高橋 真実; 平八重 一之; 芦澤 武人; 森脇 丈治; 曾根 輝雄; 園田 亮一; 野口(辻本) 雅子, 日本植物病理學會報, 72, 4, 218, 218, 2006年11月25日
日本植物病理学会, 日本語

(60) イネいもち病菌の非病原性遺伝子Avr-Piaのクローニング(平成18年度日本植物病理学会大会講演要旨)
三木 慎介; 松井 幸太郎; 芦澤 武人; 鬼頭 英樹; 平八重 一之; 中島 敏彦; 冨田 房男; 曾根 輝雄, 日本植物病理學會報, 72, 4, 218, 218, 2006年11月25日
日本植物病理学会, 日本語

イネいもち病菌の非病原性遺伝子Avr-Piaのクローニング
三木慎介; 松井幸太郎; 鬼頭英樹; 吹谷智; 佐藤順子; 平八重一之; 中島敏彦; 冨田房男; 曾根輝雄, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2006, 2006年

3G13-5 タイ産及び韓国産発酵食品スターターからの糸状菌の分離と解析(醸造学・醸造工学,一般講演)
阿部 歩; 小田 有二; 曾根 輝雄; 浅野 行蔵, 日本生物工学会大会講演要旨集, 17, 210, 210, 2005年
日本生物工学会, 日本語

(2)イネいもち病菌ミニクロモソームの解析 : (1)反復配列の解析(平成16年度日本植物病理学会大会講演要旨)
曾根 輝雄; 小口 晃央; 菊池 久; 妹尾 彰宏; 中川 智; 冨田 房男, 日本植物病理學會報, 70, 3, 190, 190, 2004年08月25日
日本植物病理学会, 日本語

アジア発酵食品由来のRhizopus oryzaeとAmylomyces rouxiiの有機酸生成能と乳酸脱水素酵素(ldh)遺伝子による特徴づけ
鬼頭英樹; 斎藤勝一; 阿部歩; 曾根輝雄; 浅野行蔵; 小田有二, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2004, 2004年

(16)イネいもち病菌のDNA型トランスポゾンOccanの解析(平成15年度日本植物病理学会大会講演要旨)
高橋 洋介; 鬼頭 秀樹; 曾根 輝雄; 冨田 房男, 日本植物病理學會報, 69, 3, 237, 237, 2003年08月25日
日本植物病理学会, 日本語

2E15-3 AFLP 法を用いた Rhizopus oryzae 及び Amylomyces rouxii の分類学的解析
曾根 輝雄; 阿部 歩; Nengah Sujaya; 斎藤 勝一; 小田 有二; 浅野 行蔵, 日本生物工学会大会講演要旨集, 15, 132, 132, 2003年
日本生物工学会, 日本語

3D10-4 ラギタペをスターターとしたポテトパルプ発酵物の菌そう解析
阿部 歩; 曾根 輝雄; Sujaya I Nengah; 斎藤 勝一; 小田 有二; 浅野 行蔵, 日本生物工学会大会講演要旨集, 15, 117, 117, 2003年
日本生物工学会, 日本語

イネいもち病菌の新規トランスポゾンOccanの特徴
曾根輝雄; 鬼頭英樹; 高橋洋介; 佐藤順子; 冨田房男, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2003, 2003年

リモニウムペレジー(Limonium perezii)の発根を促進する微生物
イ・ヌガ スジャーヤ; 田中みち子; 曽根輝雄; 和田大; 浅野行蔵; 横田篤, 日本農芸化学会北海道支部・北海道農芸化学協会シンポジウム及び合同学術講演会講演要旨, 2003, 2003年

(74)いもち病菌日本産菌株における非病原性遺伝子Avr-pitaの変異の解析(平成14年度 日本植物病理学会大会講演要旨)
曾根 輝雄; 冨田 房男, 日本植物病理學會報, 68, 2, 176, 176, 2002年08月25日
日本植物病理学会, 日本語

(75)変異株を利用したいもち病菌非病原性遺伝子のクローニング(平成14年度 日本植物病理学会大会講演要旨)
鬼頭 英樹; 高橋 洋介; 吹谷 智; 佐藤 順子; 曾根 輝雄; 岩野 正敬; 中島 敏彦; 冨田 房男, 日本植物病理學會報, 68, 2, 176, 176, 2002年08月25日
日本植物病理学会, 日本語

(76)いもち病菌(Magnaporthe grisea)の新規DNA型トランスポゾンOccan(平成14年度 日本植物病理学会大会講演要旨)
高橋 洋介; 鬼頭 英樹; 佐藤 順子; 吹谷 智; 曾根 輝雄; 冨田 房男, 日本植物病理學會報, 68, 2, 176, 176, 2002年08月25日
日本植物病理学会, 日本語

711 Phytase生産量の高いAspergillus niger M3株の生育能力を高める研究(生物情報工学,発酵・発酵工学,一般講演)
Qi Wang; 曽根 輝雄; 浅野 行蔵; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 14, 121, 121, 2002年
日本生物工学会, 日本語

411 味噌モロミ由来の耐塩性酵母の分類学的多様性(分類・系統・遺伝学,一般講演)
田中 隆志; スジャーヤ イヌガ; 田村 吉史; 山木 携; 曽根 輝雄; 横田 篤; 浅野 行蔵; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 14, 53, 53, 2002年
日本生物工学会, 日本語

402 DFA3 (Difructose anhydride 3)摂取におけるヒト腸内細菌叢のモニタリング(分類・系統・遺伝学,一般講演)
南田 公子; イヌガ スジャーヤ; 曾根 輝雄; 浅野 行蔵; 横田 篤; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 14, 51, 51, 2002年
日本生物工学会, 日本語

406 乳酸生成型Rhizopus oryzaeの選択的PCRによる迅速選抜法(分類・系統・遺伝学,一般講演)
阿部 歩; 曾根 輝雄; Sujaya I Nengrah; 斎藤 勝一; 小田 有二; 浅野 行蔵; 冨田 房男, 日本生物工学会大会講演要旨集, 14, 52, 52, 2002年
日本生物工学会, 日本語

変異株を利用したいもち病菌非病原性遺伝子の取得
鬼頭英樹; 高橋洋介; 吹谷智; 佐藤順子; 岩野正敬; 曽根輝雄; 冨田房男, 日本農芸化学会大会講演要旨集, 2002, 2002年

(48)イネいもち病菌Magnaporthe griseaのセリンプロテアーゼ遺伝子の取得
吹谷 智; 久下 高生; 谷島 智美; 曽根 輝雄; 鎌倉 高志; 山口 勇; 冨田 房男, 日本植物病理學會報, 67, 2, 131, 132, 2001年08月25日
日本植物病理学会, 日本語

変異株を利用したいもち病菌非病原性遺伝子連鎖マーカーの取得
鬼頭英樹; 吹谷智; 佐藤順子; 谷島智美; 岩野正敬; 曽根輝雄; 冨田房男, 日本農芸化学会誌, 75, 2001年

306 Characterization of Yeast Strains in Alcoholic Fermentation of Brem :
Sujaya I. Nengah; Sone T.; Yokota A.; Asano K.; Tomita F., 日本生物工学会大会講演要旨集, 12, 59, 59, 2000年
日本生物工学会, 英語

(175) イネいもち病菌宿主特異性変異株における欠失領域の解析
佐藤 順子; 吹谷 智; 曽根 輝雄; 岩野 正敬; 冨田 房男, 日本植物病理學會報, 64, 4, 370, 370, 1998年08月25日
日本植物病理学会, 日本語

(173) 日本産イネいもち病菌のDNAフィンガープリンティング解析
曽根 輝雄; 吹谷 智; 岩野 正敬; 小泉 信三; 藤田 佳克; 冨田 房男, 日本植物病理學會報, 64, 4, 370, 370, 1998年08月25日
日本植物病理学会, 日本語

(215)日本産イネいもち病菌を用いた交配系の確立(平成9年度日本植物病理学会大会講演要旨)
吹谷 智; 曽根 輝雄; 阿部 卓巳; 児玉 恵; 須藤 学; 冨田 房男, 日本植物病理學會報, 63, 3, 244, 245, 1997年06月25日
日本植物病理学会, 日本語

(137) いもち病菌のレース変異機構に関する分子遺伝学的研究 (日本植物病理大会)
曽根 輝雄; 阿部 卓巳; 吹谷 智; 児玉 恵; 岩野 正敬; 小泉 信三; 藤田 佳克; 冨田 房男, 日本植物病理學會報, 62, 3, 294, 294, 1996年06月25日
日本植物病理学会, 日本語

いもち病菌の遺伝子解析法の確立と日本菌系への応用
曽根 輝雄; 冨田 房男, バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry, 54, 5, 11, 16, 1996年05月01日
バイオインダストリ-協会, 日本語

いもち病菌の高稔性交配系を用いた遺伝子解析 : 微生物
曽根 輝雄; 吹谷 智; 阿部 卓巳; 児玉 恵; 須藤 学; 冨田 房男, 日本農藝化學會誌, 70, 117, 117, 1996年03月05日
社団法人日本農芸化学会, 日本語

イネいもち病菌による交配実験系の確立 : 微生物
曽根 輝雄; 吹谷 智; 阿部 卓巳; 吉田 奈美; 児玉 恵; 須藤 学; 富田 房男, 日本農藝化學會誌, 69, 273, 273, 1995年07月05日
社団法人日本農芸化学会, 日本語

ワンダーフォーゲル実習Ⅵ, 2024年, 博士後期課程, 国際食資源学院

人口・食料・環境学総論, 2024年, 修士課程, 農学院

食資源特別演習, 2024年, 修士課程, 国際食資源学院

大学院共通授業科目（一般科目）：複合領域, 2024年, 修士課程, 大学院共通科目

食資源生産論, 2024年, 修士課程, 国際食資源学院

持続的生物生産技術特論, 2024年, 修士課程, 国際食資源学院

大学院共通授業科目（一般科目）：自然科学・応用科学, 2024年, 修士課程, 大学院共通科目

食資源特別講義, 2024年, 修士課程, 国際食資源学院

大学院共通授業科目（教育プログラム）：教養深化プログラム, 2024年, 修士課程, 大学院共通科目

環境と人間, 2024年, 学士課程, 全学教育

HSI extension/professional program, 2024年, 学士課程, HSI

生物学実験Ⅰ, 2024年, 学士課程, 農学部

応用菌学, 2024年, 学士課程, 農学部

一般教育演習(ﾌﾚｯｼｭﾏﾝｾﾐﾅｰ), 2024年, 学士課程, 全学教育

イネいもち病菌におけるQoI剤耐性変異メカニズムの解明～いたちごっこからの脱却～
科学研究費助成事業 基盤研究(C)
2018年04月01日 - 2021年03月31日
曾根 輝雄; 阿部 歩
本研究では，イネいもち病菌におけるストロビルリン系殺菌剤（QoI剤）耐性変異の発生，遺伝，蔓延のメカニズムを明らかにすることで，薬剤の導入→耐性菌の発生→新薬剤の導入の「いたちごっこ」からの脱却を目指すことを目的としている．
まず，mtDNA cytbコドン143変異の発生とDNA損傷乗り越え合成の関係の解析のため，いもち病菌のオルタナティブオキシダーゼの欠損株の作成を行った．2回相同組換えにより遺伝子の破壊を試みているが，破壊候補株の生育が芳しくなく，取得に至っていない．CRISPR-Cas9など，ゲノム編集を用いることでより効率的に得ることを検討したい．
一方で，プロトプラスト融合により得られた野生型ミトコンドリアと変異型ミトコンドリアの混在株は，分生子形成によりホモプラスミー化し，一方のミトコンドリアに大きく偏る傾向があることが明らかとなった．こちらに関しては，融合株をそのまま使用して数の変化が起こるかを検討したい．
また，ミトコンドリアの可視化のため，蛍光タンパク質による可視化を行った．ミトコンドリアに局在するタンパク質として，クエン酸シンターゼを用い，eGFP蛍光タンパク質をC末端に融合させたタンパク質をイネいもち病菌Ina86-137株にに発現させた．形質転換株のGFP蛍光とmitotrackerによるミトコンドリアの蛍光染色との比較により，GFPによりいもち病菌のミトコンドリアが可視化できたことがわかった．一方，分生子形成過程におけるミトコンドリアの定量のため，分生子形成初期のタイミングを検討し，培地上での分生子形成誘導処理後6時間後に初期分生子形成が見られることがわかった．今後は，分生子形成初期のミトコンドリアの定量を行い，どのようにミトコンドリアが伝播するかを明らかにしたい．
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 18K05640

植物耐酸性研究の新展開：菌根形成による耐酸性獲得の生理・分子機構
科学研究費助成事業 基盤研究(B)
2017年04月01日 - 2020年03月31日
江澤 辰広; 曾根 輝雄; 増田 税
II. 菌根菌耐酸性遺伝子のスクリーニング
昨年度と同様の実験系---酸性硫酸塩土壌のpHを3.5-4.9の範囲で４段階に調整した土壌を用いたナイロンメッシュ区画ポットを利用して栽培---において新規に入手したR. clarus RF1株の同種地理的隔離株であるCK001株を接種したミヤコグサを７週間栽培した。その後、それぞれのpH区から採取したAM菌の外生菌糸からRNAを抽出し、比較トランスクリプトーム解析に供試した。RF1株の際と同様の手法でpHの低下に伴って直線的に発現上昇する48個の遺伝子群を抽出したが、RF1株と共通の遺伝子はそのうちのわずか14個であった。RF1株において耐酸性に関わる重要遺伝子として抽出された原形質膜型マグネシウム輸送体遺伝子は土壌pHには反応せず、代わりにオルガネラ局在が予想されるマグネシウム輸送体遺伝子の発現がpHの低下に伴って発現上昇していた。RF1株は強酸性を示す酸性硫酸塩土壌から分離された株であるのに対し、CK001株は熱帯泥炭土壌から分離された株であり、土壌酸性への応答の相違は、両株の生育環境の相違と関係しているものと推定された。
III. 共生ウイルスの耐酸性における役割
前項と同様の実験系を用いてCK001株を接種したミヤコグサを栽培し、その外生菌糸からRNAを抽出した。一本鎖RNAウイルスを標的にRNA-Seqを行った。これまの予備的な試験においてCK001株で見つかっていたR. clarus Mitovirus 4およびR. clarus Mitovirus 5は今回も検出されたものの、前回同定され、他の地理的隔離株からも検出されているR. clarus Mitovirus 3は検出されなかった。
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 17H03779

TALENにより異なるゲノム環境に導入されたいもち病菌AVR遺伝子の変異頻度比較
科学研究費助成事業 基盤研究(C)
2016年04月01日 - 2019年03月31日
中馬 いづみ; 荒添 貴之; 曾根 輝雄; レ ディン・ドン; グエン ティ・タィン・ガ; クマグン クリスチャン; スリーウォンチャイ タニー; スプリング オトマー
イネいもち病菌非病原力遺伝子AVR-Piaの変異頻度比較実験を行った。イネ菌野生株（AVR-Pia非保有）に対し、AVR-Piaを転移因子の多い領域に導入したta#126と転移因子の少ない領域に導入したzt#1を作出し、Pia保有抵抗性イネ品種に対する接種試験を行った。抵抗性品種の葉上に形成された病原性獲得変異菌由来の病斑数より変異頻度を比較したところ、ta#126の方がzt#1より頻度が高かった。分離した変異菌における変異機構は、いずれも導入したAVR-Piaの欠失変異で、欠失領域の両端には転移因子が存在していた。欠失領域の大きさは転移因子間の距離が一因となっていることが示唆された。
日本学術振興会, 基盤研究(C), 16K07615

イネのいもち病抵抗性の分子メカニズム～２つの生物間で何が起こっているのか～
科学研究費助成事業 基盤研究(B)
2011年04月01日 - 2014年03月31日
曾根 輝雄; 寺内 良平; 尾瀬 農之; 尾瀬 農之
いもち病はイネの最重要病害である．いもち病の防除は主に農薬と抵抗性品種を使って行われている．しかし，抵抗性品種がどのようにしてその抵抗性を発揮するかについて，まだ完全に理解されていない．本研究はイネのいもち病抵抗性遺伝子Piaの抵抗性発現のメカニズムについて，いもち病菌のAVR-Pia遺伝子との相互作用を詳細に明らかにしようとしたものである．本研究の結果，いもち病菌はイネに侵入する前からAVR-Pia遺伝子を発現しはじめること，分泌後AVR-Piaタンパクは二量体を形成し，イネのPiaタンパク質と相互作用することがわかった．これらの知見は，いもち病抵抗性を理解するのに役立つものと期待される．
日本学術振興会, 基盤研究(B), 北海道大学, 23380024

突然変異抑制型イネいもち病防除技術の開発～組換え修復をターゲットとして～
科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究
2011年 - 2013年
曾根 輝雄
いもち病はイネの最重要病害である．いもち病防除の重要な問題はイネ品種の抵抗性を打破するいもち病菌の突然変異である．いもち病の突然変異は主にDNAの組換えを介する．本研究の目的はいもち病菌のDNA組換えを担う遺伝子の働きを解明し，突然変異を抑えながら防除する方法を開発することである．本研究の結果，イネいもち病菌が病原性を発揮するためにはDNA修復タンパク複合体が重要な役割を果たしていることが明らかとなった．その複合体形成を阻害する薬剤をスクリーニングする系を構築することが出来た．本研究は突然変異も抑えられるいもち病の新たな防除法につながるものとなるだろう．
日本学術振興会, 挑戦的萌芽研究, 北海道大学, 23658038

イネいもち病菌のAVR-Pia遺伝子の解析と病原性判別システムの構築
科学研究費助成事業 基盤研究(C)
2008年 - 2010年
曾根 輝雄
イネいもち病菌の非病原性遺伝子AVR-Piaの単離と同定に成功した.AVR-Pia遺伝子は中国産菌株を使って解析されたものと同じ遺伝子であった.AVR-Pia遺伝子はイネいもち病菌のイネ感染時にのみ発現し,親和性相互作用ではその産物はイネ細胞内の侵入菌糸のBICから宿主細胞へと分泌されていることが示唆された.また,Ina168m95-1におけるAVR-Pia遺伝子の欠失は,2コピーのトランスポゾンOccan間の相同組換えであることが示唆された.日本菌株においては,AVR-Piaの有無をPCRで調べることにより病原性の判定が可能であることがわかった.
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 20580043

フィターゼとその遺伝子に関する研究
その他の研究制度
2008年
競争的資金

Studies on phytases and their genes
The Other Research Programs
2008年
競争的資金

メタロチオネイン分解酵素による水産廃棄物からの脱カドミウム技術の開発
科学研究費助成事業 基盤研究(C)
2004年 - 2005年
浅野 行蔵; 曾根 輝雄
生体内でカドミウムはメタロチオネイン(重金属結合低分子量蛋白質)と結合している。これを特異的に分解すれば水産廃棄物中のカドミウムをイオン化し分離できる。酵素分解を用いれば環境にやさしい水産廃棄物の脱カドミウム処理が可能になる。
システイン・リッチなタンパク質であるメタロチオネインを特異的・積極的に分解する酵素は新規性が高く、今までにない性質が期待できる。我々の探索によって細菌Arthrobacter nicotnovorans 23-0-11株がカドミウム遊離能を持つ菌体外プロテアーゼを生成することを発見した。
目的のプロテアーゼを単離するためA.nicotinovorans 23-0-11株の培養上清を2種類のイオン交換カラムクロマトグラフィーにかけて酵素を精製した。精製酵素の分子量は27kDaで、市販のプロテアーゼと比較して、ホタテ貝ウロからカドミウムを効率的に遊離させる特徴を示した。
精製酵素の至適pHは7.0で至適温度は50℃であり、pH3.0-9.0、60℃以下で安定であった。阻害剤の影響から本酵素は中性セリンプロテアーゼに分類される酵素であると推定した。
遺伝子のクローニングを行うために精製酵素をプロテアーゼで断片化して4ヶ所の内部アミノ酸配列を得た。N末端を含めた5ヶ所にプライマーを設計してPCRを行い、部分配列を増幅した。それをもとに全長の遺伝子とアミノ酸配列を決定した。アミノ酸配列にはセリンプロテアーゼで保存されているモチーフが含まれていた。アミノ酸配列の相同性を検索したところArthrobacter sp.FB24の未同定タンパク質と69%の相同性を示した。既知プロテアーゼとの相同性は30%未満であり、新規プロテアーゼと考えられる。
クローニングした酵素遺伝子を大腸菌に導入し、複合タンパク質として発現させた。複合タンパク質は封入体になって不溶化したため、現在ベクターと発現条件の検討をし直して活性のある形での大量発現を行っている。
日本学術振興会, 基盤研究(C), 北海道大学, 16580049

イネいもち病菌はいつどこで変異するのか
科学研究費助成事業 若手研究(B)
2004年 - 2005年
曾根 輝雄
1.新たな遺伝子のクローニング
新たに非相同末端再結合に関わる遺伝子であるKu70,Ku80のいもち病菌ホモログ,Khm70,Khm80をPCRにより,日本産イネいもち病菌Ina168株より取得した.これらはこれまでにクローニングしていた遺伝子と同様,アカパンカビ(Neurospora crassa)のホモログと最も高い相同性を示した.
2.N.crassa変異株の相補による機能の確認
これまでにクローニングしたRhm52,Rhm54,Mhm11,Khm70,Khm80をハイグロマイシン耐性プラスミドベクターpCSN43-DESTに連結し,それぞれN.crassaの変異株mus-11,mus-25,mus-23,mus-51,mus-52に導入し,変異の相補により遺伝子の機能を確認した.その結果,Rhm52,Rhm54,Khm80は相補が確認され,機能を持った遺伝子であることが示唆された.Mhm11,Rhm70は相補が見られなかったが,これらは複合体を形成し機能する遺伝子であり,その複合体の形成に問題があることが考えられた.
3.欠損変異株の作成
昨年度開発したベクターをpDESTRと命名し,さらに同様の,ビアラフォス耐性遺伝子を選択マーカーとして持ったベクター,pBARSTを作成した.これらのベクターを使用し,Inverse PCR法によりRhm54,Rhm52,Khm70,Khm80破壊コンストラクトを作成した.10株の形質転換体から,欠損変異株を得ることができ,ベクターの有効性が証明された.
日本学術振興会, 若手研究(B), 北海道大学, 16780029

赤カビ毒（DON, NIV）のアセチル化酵素の特性の解明とその応用
2005年
競争的資金

Studies on trichothecene acetyl transferases
2005年
競争的資金

いもち病菌の病原性レース変異機構に関する研究〜非病原性遺伝子と遺伝的組換え〜
科学研究費助成事業 基盤研究(A)
1999年 - 2001年
冨田 房男; 安田 伸子; 中島 敏彦; 石井 千津; 曾根 輝雄; 辻本 雅子; 犬飼 剛
1.非病原性遺伝子の解析
K59に対する病原性変異株が取得できなかったため,既存の愛知旭に対する病原性変異株Ina168m95-1を用い,親株Ina168r95-1とのゲノムDNA多型を検索した.その結果変異株Ina168m95-1に特異的に欠失したDNA断片PM01を得た.PM01と非病原性遺伝子Avr-piaは強く連鎖していることが示された.PM01の周辺領域を含む,3つのコスミドクローンを用いて変異株を形質転換したところ1つのクローンでその変異が相補され,Avr-piaが含まれていることが示唆された.
一方,交配可能な2つのイネ菌株を用い交配後代菌の病原性の分離を調べた.その結果,イネ品種「石狩白毛」に対して非病原性を示す菌株と病原性を示す菌株の比は1:1に適合し,「石狩白毛」に対する非病原性は1個の遺伝子により支配されていることが明らかとなった。同様にして,イネ品種「八反3号」に対する非病原性遺伝子も同定した.RFLP解析、RAPD分析をすることにより、イネ品種分子マーカーを選抜し,染色体地図上にマッピングした.イネ品種「八反3号」に対する非病原性遺伝子Avr-Hattan3近傍の物理地図を作製するため,Avr-Hattan3と密接に連鎖するマーカーを用いて,いもち病菌のBACライブラリーを選抜し,約600kbにわたるBACコンティグを作成した.
2.組換えに関する遺伝子の解析
Degenerate PCR法を用いて,いもち病菌のRad50,Rad52,Rad54,mre11のいもち病菌ホモログのクローニングを行い,さらに上記のゲノムライブラリーより,全長のRad52,Rad54,Mre11遺伝子を含むクローンを得た.これらの塩基配列を解析したところ,アカパンカビの相同遺伝子と高い相同性を示した.これらの遺伝子をそれぞれRhm52,Rhm54,Mhm11と命名した.これらのクローンを用いてアカパンカビの相同遺伝子の変異株を形質転換したところ,Rhm52,Rhm54遺伝子はその変異を相補し,ホモログであることが確認された.このうちRhm54遺伝子については,MMS処理によりその転写が誘導されることが確認された.
日本学術振興会, 基盤研究(A), 北海道大学, 11306007

Rhizopus属菌の分子系統解析とその応用
2001年
競争的資金

Molcular taxonomy of the genus Rhizopus and its application
2001年
競争的資金

いもち病菌の染色体再編成による病原性レース変異機構の解析
科学研究費助成事業 特別研究員奨励費
1998年 - 2000年
曽根 輝雄
日本学術振興会, 特別研究員奨励費, 北海道大学, 98J02369

いもち病菌の分子遺伝学的解析による病原性レース変異機構の解明
1991年
競争的資金

Molecular genetic analysis of Magnaporthe grisea host specificity and mutations
1991年
競争的資金

アルカリジェネス属の微生物の生菌を主成分とする植物発根促進剤
特許権
特許出願２００４−１１７３０３