研究者基本情報

• 博士 (農学), 東京大学

• https://researchmap.jp/midoriiida

• 30745328

• https://orcid.org/0000-0002-0294-1985

• 201501086959004169

• 回遊
• 通し回遊
• 両側回遊
• 生態
• 島嶼
• 水圏
• 魚類
• ハゼ亜目魚類
• 甲殻類
• プランクトン

• ライフサイエンス, 多様性生物学、分類学
• ライフサイエンス, 水圏生産科学
• ライフサイエンス, 生態学、環境学

• 学士課程, 水産学部
• 修士課程, 環境科学院
• 博士課程, 環境科学院

研究活動情報

• 2016年, 北里大学同窓会, 研究奨励賞
  両側回遊性ハゼ亜目魚類の回遊生態の多様性に関する研究
  飯田 碧
• 2003年03月, 北里大学, 北里賞
  飯田 碧

• Large-scale environmental DNA survey reveals niche axes of a regional coastal fish community
  Yutaka Osada; Masaki Miya; Hitoshi Araki; Hideyuki Doi; Akihide Kasai; Reiji Masuda; Toshifumi Minamoto; Satoquo Seino; Teruhiko Takahara; Satoshi Yamamoto; Hiroki Yamanaka; Mitsuhiro Aizu-Hirano; Keiichi Fukaya; Takehiko Fukuchi; Ryo O. Gotoh; Masakazu Hori; Midori Iida; Tomohito Imaizumi; Tadashi Kajita; Takashi Kanbe; Tanaka Kenta; Yumi Kobayashi; Tomohiko Matsuura; Hiroki Mizumoto; Hiroyuki Motomura; Hiroaki Murakami; Kenji Nohara; Shin-ichiro Oka; Tetsuya Sado; Hiroshi Senou; Koichi Shibukawa; Tomoki Sunobe; Hiroshi Takahashi; Koji Takayama; Katsuhiko Tanaka; Hisashi Yamakawa; Satoru Yokoyama; Seokjin Yoon; Michio Kondoh
  Scientific Reports, 16, 1, Springer Science and Business Media LLC, 2026年02月16日, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Abstract
  
  The concept of the ecological niche, defined as the basic habitat requirements for a species, is central to understanding species geographic distributions and predicting their responses to environmental change. However, identifying the essential niche for large regional communities remains a challenge because niche axes can be “hidden” by the complexity of the underlying ecological processes. Here, applying advanced species distribution modelling to nationwide environmental DNA survey data, we identified hidden niche axes of the Japanese coastal fish community and investigated the response diversity to these axes. Our survey detected 1,220 coastal fish species. The hidden niche axes collectively explained most of the variation in fish biodiversity and revealed five biogeographic boundaries for the regional community. These niches of the Japanese fish community may primarily relate to several processes due to ocean currents, such as environmental filters, transport from source areas and dispersal barriers. We also found that the response diversity to niche axes was positively correlated with species richness, although local communities with particularly high response diversity were geographically biased. A better understanding of the niche axes of the regional ecological community should help to mitigate the loss of biodiversity and ecosystem services caused by ongoing environmental change.
• Seasonal changes in composition of zooplankton communities along the coast of Sado Island in the Sea of Japan
  Parvez Chowdhury; Midori Iida
  Aquatic Animals, 2025, A2025-14, 2025年04月, ［査読有り］, ［最終著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• アカテガニの造巣地としての生木・枯木の根株周辺の利用
  豊田賢治; 松倉君予; 飯田 碧; 豊田光世; 阿部晴恵
  水生動物, 2025, A2025-5, 2025年02月, ［査読有り］
  日本語, 研究論文（学術雑誌）
• Zooplankton communities in late spring: A case study from Sado Island
  Parvez Chowdhury; Midori Iida
  Aquatic Animals, A2025, 3, 2024年12月, ［査読有り］, ［最終著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Taxonomy of freshwater gobies of the genus Rhinogobius (Oxudercidae, Gobiiformes) from central Vietnam, with descriptions of two new species
  KEN MAEDA; HIROZUMI KOBAYASHI; MIDORI IIDA; HAU DUC TRAN
  Zootaxa, 5493, 5, 507, 541, Magnolia Press, 2024年08月14日, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Taxonomy of the genus Rhinogobius was investigated for the first time in Central Vietnam. Five species occurring in this region can be distinguished by shape of their head, number of pectoral-fin rays, vertebral counts, arrangements of scales and cutaneous sensory papillae, and coloration. Two species are described as new, Rhinogobius rong sp. nov. and R. nami sp. nov., and the remaining three were identified as R. taenigena, R. leavelli, and R. similis. Though the morphology of R. leavelli and R. similis differed slightly between localities, counts and measurements overlapped, and coloration was variable. This study tentatively identifies all of those populations as R. leavelli or R. similis, but further research using additional specimens from a wider geographic range is required to clear the identity of the Rhinogobius occurring in this region. Rhinogobius rong, R. similis, and R. leavelli are distributed in both Da Nang City and Thua Thien Hue Province, with the first two species occurring widely in coastal areas, and R. leavelli restricted to inland areas. On the other hand, Rhinogobius nami and R. taenigena occur only in inland areas of Da Nang City and Thua Thien Hue Province, respectively.
• A key evolutionary step determining osmoregulatory ability for freshwater colonisation in early life stage of fish
  Yumeki Oto; Mari Kuroki; Midori Iida; Ryosuke Ito; Shota Nomura; Katsutoshi Watanabe
  Journal of Experimental Biology, 226, jeb246110, The Company of Biologists, 2023年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Colonisation of freshwater habitats by marine animals is a remarkable evolutionary event that has enriched biodiversity in freshwater ecosystems. The acquisition of the tolerance to hypotonic stress during the early life stages is presumed to be essential for their successful freshwater colonisation, but very little empirical evidence has been obtained to support this idea. This study aimed to comprehend the evolutionary changes of osmoregulatory mechanisms that enhance the larval freshwater tolerance in amphidromous fishes, which typically spend their larval period in marine (ancestral) habitats and the rest of life history stages in freshwater (derived) habitats. We compared the life history patterns and changes in larval survivorship and gene expression depending on salinity among three congeneric marine-originated amphidromous goby species (Gymnogobius), which had been suggested to differ in their larval dependence on freshwater habitats. An otolith microchemical analysis and laboratory-rearing experiment confirmed the presence of freshwater residents only in G. urotaenia and higher larval survivorship of this species in the freshwater condition than the obligate amphidromous G. petschiliensis and G. opperiens. Larval whole-body transcriptome analysis revealed that G. urotaenia from both amphidromous and freshwater-resident populations exhibited the greatest differences in expression levels of several osmoregulatory genes, including aqp3, which is critical for water discharge from their body during early fish development. The present results consistently support the importance of enhanced freshwater tolerance and osmoregulatory plasticity in larval fish to establish freshwater forms, and further identified key candidate genes for larval freshwater adaptation and colonisation in the goby group.
• New distributional records of four amphidromous gobies (Gobioidei: Sicydiinae) in continental Vietnam
  James Donaldson; Ken Maeda; Midori Iida; Hirozumi Kobayashi; Brendan C. Ebner; Hau Duc Tran
  Cybium, 47, 4, 467, 472, 2023年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Migratory pattern and larval duration of an amphidromous goby, Rhinogobius nagoyae, at Sado Island, in northern Japan
  IIDA, M; K. KIDO; K. SHIRAI
  Marine and Freshwater Research, 72, 8, 1243, 1249, 2021年, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• A record of Tetraroge nigra (Tetrarogidae) from Iriomote Island, southern Japan, with notes on its ecological aspects
  SATO, M; H. KOBAYASHI; M. IIDA; K. SHIRAI; K. SASAKI
  Ichthyological Research, 68, 1, 207, 213, Springer Science and Business Media {LLC}, 2021年01月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Reproductive seasonality and the gonadal maturation of silver pomfret Pampus argenteus in the Bay of Bengal, Bangladesh
  Fatema Akhter; Md. Moudud Islam; Midori Iida; Md. Mahiuddin Zahangir
  Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom, 100, 7, 1155, 1161, Cambridge University Press (CUP), 2020年11月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, The silver pomfret (Pampus argenteus) is one of the most commercially important marine fish species in the Bay of Bengal, Indian Ocean. However, detailed information on the reproductive biology of silver pomfret is limited for the Bay of Bengal, Bangladesh. To understand their reproductive biology, especially the gonadal developmental cycle and spawning season, a total of 373 individuals were collected monthly from February 2016 to January 2018 and examined. The total length (TL) and weight (TW) of P. argenteus ranged from 18.82–35.73 cm and 89.26–617.60 g, respectively. The highest gonadosomatic index (GSI) values were observed from April–June with a second (smaller) peak in October. The highest oocyte diameter was observed in May (630.50 ± 96.70 μm), when the fish reached full maturity, and the lowest was observed in July (35.10 ± 7.12 μm), when new eggs began their development for the next spawning season. The maximum number of eggs in the ovary were found in the yolk granule stage in May with a number of post-ovulatory follicles, which indicated that the ovaries developed to a peak leading up to the spawning season. A number of spermatids were also seen in males in April–June along with females. From these detailed observations, it may be concluded that P. argenteus shows two spawning peaks, in May–June and October. This observation will be helpful for the artificial breeding, sustainable management and conservation of this species in the study area.
• Life history and instream distribution of the endangered goby Acanthogobius insularis from Okinawa-jima Island, Japan
  KUNISHIMA Taiga; IWAMOTO Risa; IIDA Midori; TACHIHARA Katsunori
  Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom, 99, 1, 229, 237, Cambridge University Press ({CUP}), 2019年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, The genus Acanthogobius of gobiioid fish has been reported for six species from East Asia, and inhabits estuarine and coastal waters. Within this genus, Acanthogobius insularis is an endangered and endemic goby in the Amami-oshima and Okinawa-jima Islands, southern Japan, and its range is restricted to the lowermost course of a few river basins. Basic knowledge on this species is scarce in spite of its vulnerable conservation status. The purpose of this study was to elucidate the life history of A. insularis. Monthly sampling was conducted at five stations in the Taiho River, Okinawa-jima Island, from November 2014 to November 2015. Monthly standard length (SL) distributions were unimodal except in April during the recruiting period, suggesting that A. insularis is an annual species. Analysis of the gonadosomatic index and histological observations of the ovaries revealed that this species spawns from January to May. The beginning of the spawning season seems to be related to a decline in water temperature in December. Growth rates appeared to be lower from April to December and higher in winter months. From monthly collections, A. insularis was found to move upstream with growth, and gather at spawning grounds during the reproductive season. Acanthogobius insularis might be threatened by increasing water temperature due to climate change, since low water temperatures appear to be important for their reproduction and growth. Moreover, habitat diversity, from tidal flats for recruiting grounds to upstream sites with cobbles for spawning, is needed to complete their life cycle, and should be conserved.
• Fate of Worn-Out Functional Teeth in the Upper Jaw Dentition of Sicyopterus japonicus (Gobioidei: Sicydiinae) During Tooth Replacement
  Noriyuki Sahara; Keita Moriyama; Midori Iida; Shun Watanabe
  ANATOMICAL RECORD-ADVANCES IN INTEGRATIVE ANATOMY AND EVOLUTIONARY BIOLOGY, 301, 1, 111, 124, 2018年01月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Downstream migration of newly-hatched ayu (Plecoglossus altivelis) in the Tien Yen River of northern Vietnam
  Hau Duc Tran; Midori Iida; Ken Maeda
  ENVIRONMENTAL BIOLOGY OF FISHES, 100, 10, 1329, 1341, 2017年10月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Swimming depth and behaviour of newly recruiting post-larvae of Sicyopterus japonicus (Gobioidei: Sicydiinae) in the estuary of the Ota River, Wakayama, Japan
  Midori Iida; Shun Watanabe; Katsumi Tsukamoto
  CYBIUM, 41, 2, 101, 105, 2017年06月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Specific gravity and migratory patterns of amphidromous gobioid fish from Okinawa Island, Japan
  Midori Iida; Masashi Kondo; Helene Taboure; Ken Maeda; Christophe Pecheyran; Atsushi Hagiwara; Philippe Keith; Katsunori Tachihara
  JOURNAL OF EXPERIMENTAL MARINE BIOLOGY AND ECOLOGY, 486, 160, 169, 2017年01月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• ボウズハゼの生態
  飯田 碧
  海洋と生物, 38, 4, 370, 378, 生物研究社, 2016年08月, ［招待有り］
  日本語
• Time and order of eruption of first functional teeth in the upper jaw of post-larval life of Sicyopterus japonicus (Gobiidiae: Sicydiinae) during cranial metamorphosis at the time of river recruitment
  Noriyuki Sahara; Keita Moriyama; Midori Iida; Shun Watanabe
  ARCHIVES OF ORAL BIOLOGY, 66, 8, 14, 2016年06月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Oceanic larval duration and recruitment mechanism of the amphidromous fish Sicyopterus japonicus (Gobioidei: Sicydiinae)
  Midori Iida; Shun Watanabe; Katsumi Tsukamoto
  REGIONAL STUDIES IN MARINE SCIENCE, 1, 25, 33, 2015年03月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Effect of waterfalls on fluvial fish distribution and landlocked Rhinogobius brunneus populations on Yakushima Island, Japan
  Yuichi Kano; Midori Iida; Kenshi Tetsuka; Toshihiro Saitoh; Fumihiro Kato; Tatsuro Sato; Shin Nishida
  Ichthyological Research, 61, 4, 305, 316, 2014年11月07日, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Tropical and temperate freshwater amphidromy: a comparison between life history characteristics of Sicydiinae, ayu, sculpins and galaxiids
  Shun Watanabe; Midori Iida; Clara Lord; Philippe Keith; Katsumi Tsukamoto
  REVIEWS IN FISH BIOLOGY AND FISHERIES, 24, 1, 1, 14, 2014年03月, ［査読有り］
  英語
• Amphidromy and marine larval phase of ancestral gobioids Rhyacichthys guilberti and Protogobius attiti (Teleostei: Rhyacichthyidae)
  H. Tabouret; M. Tomadin; L. Taillebois; M. Iida; C. Lord; C. Pecheyran; P. Keith
  MARINE AND FRESHWATER RESEARCH, 65, 9, 776, 783, 2014年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Riverine life history of the amphidromous goby Sicyopterus japonicus (Gobiidae: Sicydiinae) in the Ota River, Wakayama, Japan
  Midori Iida; Shun Watanabe; Katsumi Tsukamoto
  ENVIRONMENTAL BIOLOGY OF FISHES, 96, 5, 645, 660, 2013年05月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Unique features of pedicellate attachment of the upper jaw teeth in the adult gobiid fish Sicyopterus japonicus (Teleostei, Gobiidiae): Morphological and structural characteristics and development
  Noriyuki Sahara; Keita Moriyama; Midori Iida; Shun Watanabe
  JOURNAL OF MORPHOLOGY, 274, 5, 512, 524, 2013年05月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• First collection of amphidromous goby post-larvae of Sicyopterus japonicus in the ocean off Shikoku, Japan
  Shun Watanabe; Midori Iida; Seishi Hagihara; Hiromitsu Endo; Keiichi Matsuura; Katsumi Tsukamoto
  CYBIUM, 35, 4, 371, 379, 2011年12月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Reproductive biology of the amphidromous goby Sicyopterus japonicus (Gobiidae: Sicydiinae)
  Midori Iida; Shun Watanabe; Katsumi Tsukamoto
  CYBIUM, 35, 4, 329, 336, 2011年12月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Plate-like permanent dental laminae of upper jaw dentition in adult gobiid fish, Sicyopterus japonicus
  Keita Moriyama; Shun Watanabe; Midori Iida; Noriyuki Sahara
  CELL AND TISSUE RESEARCH, 340, 1, 189, 200, 2010年04月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Validation of otolith daily increments in the amphidromous goby Sicyopterus japonicus
  Iida Midori; Watanabe Shun; Tsukamoto Katsumi
  Coastal Marine Science, 34, 1, 39, 41, International Coastal Research Center Ocean Research Institute, the University of Tokyo, 2010年03月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, To determine the periodicity of growth increment deposition in the otoliths of newly recruited larvae of the amphidromous goby Sicyopterus japonicus, an otolith validation experiment was performed. Larval gobies collected at the river mouth of the Ota River, Wakayama, Japan were immersed in an alizarin complexone (ALC) solution to mark the timing in their otoliths. After being held under natural light conditions for 15 days, they were treated with ALC again to make the second time mark. The number of growth increments between two ALC marks in the otoliths was 14.1 on average, which roughly coincided with the number of days between two ALC treatments. This experiment validated the daily periodicity of otolith growth increment deposition in S. japonicus showing that the otolith increments of the species can be used for age determination with daily precision.
• Larval transport of the amphidromous goby Sicyopterus japonicus by the Kuroshio Current
  Iida Midori; Zenimoto Kei; Watanabe Shun; Kimura Shingo; Tsukamoto Katsumi
  Coastal Marine Science, 34, 1, 42, 46, International Coastal Research Center Ocean Research Institute, the University of Tokyo, 2010年03月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, Oceanic larval transport of an amphidromous goby, Sicyopterus japonicus, was simulated using a Lagrangian modeling approach to validate the hypothesis that the Kuroshio Current could transport their larvae from Taiwan to northern Japan, which is the geographic range of this species. Simulated particles released at a 50 m depth from the off southernmost part of Taiwan reached Japan from southern Kyushu to northern Japan after 180 days. In contrast, many particles released at 120 m were trapped in eddies in the northwestern part of the subtropical gyre for 90 to 120 days and never reached the southern Japanese coast. These simulations showed that transport at a 50 m depth would enable many larvae to distribute over their entire species range after being transported away from Taiwan. The otolith growth increments of 30 larvae from Wakayama in April to August 2007 showed their oceanic larval duration ranged from 185 to 270 days, suggesting they have sufficient time as larvae for their transport from Taiwan to northern Japan. These results supported the hypothesis of larval transport described above and suggested a possibility that the Kuroshio would play an important role to maintain the apparent lack of population structure of S. japonicus from Taiwan to northern Japan.
• 台湾から採集されたボウズハゼ (Sicyopterus japonicus) のアルビノ個体
  渡邊 俊; 張廖年鴻; 陳 靜怡; 葉 信明; 阿井文瓶; 大竹二雄; 飯田 碧; 塚本勝巳
  南紀生物, 52, 1, 33, 36, 南紀生物同好会, 2010年
  日本語
• Survival and behavioral characteristics of amphidromous goby larvae of Sicyopterus japonicus (Tanaka, 1909) during their downstream migration
  Midori Iida; Shun Watanabe; Yoshiaki Yamada; Clara Lord; Philippe Keith; Katsumi Tsukamoto
  JOURNAL OF EXPERIMENTAL MARINE BIOLOGY AND ECOLOGY, 383, 1, 17, 22, 2010年01月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Early life history and description of larval stages of an amphidromous goby, Sicyopterus lagocephalus (Gobioidei: Sicydiinae)
  Pierre Valade; Clara Lord; Henri Grondin; Pierre Bosc; Laura Taillebois; Midori Iida; Katsumi Tsukamoto; Philippe Keith
  CYBIUM, 33, 4, 309, 319, 2009年12月, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• Life History Characteristics of a Sicydiinae Goby in Japan, Compared with Its Relatives and Other Amphidromous Fishes
  Midori Iida; Shun Watanabe; Katsumi Tsukamoto
  CHALLENGES FOR DIADROMOUS FISHES IN A DYNAMIC GLOBAL ENVIRONMENT, 69, 355, 373, 2009年, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語, 研究論文（国際会議プロシーディングス）
• Morphological characteristics of upper jaw dentition in a gobiid fish (Sicyop- Terus japonicus) A micro-computed tomography study
  Keita Moriyama; Shun Watanabe; Midori Iida; Shojiro Fukui; Noriyuki Sahara
  Journal of Oral Biosciences, 51, 2, 81, 90, Japanese Association for Oral Biology, 2009年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• ボウズハゼ(Sicyopterus japonicus)の海洋分散に関する一考察--集団構造と浮遊仔魚期間に着目して
  渡邊 俊; 飯田 碧; 福井 正二郎; 瀧野 秀二; 塚本 勝巳
  南紀生物, 50, 2, 213, 221, 南紀生物同好会, 2008年12月
  日本語
• Recruitment of the amphidromous goby Sicyopterus japonicus to the estuary of the Ota River, Wakayama, Japan
  Midori Iida; Shun Watanabe; Akira Shinoda; Katsumi Tsukamoto
  ENVIRONMENTAL BIOLOGY OF FISHES, 83, 3, 331, 341, 2008年11月, ［査読有り］, ［筆頭著者, 責任著者］
  英語, 研究論文（学術雑誌）
• 「【紀州・熊野採集】日本魚類図譜」から考察される当地域の稀種と魚類相
  福井 正二郎; 渡邊 俊; 飯田 碧
  南紀生物, 50, 1, 108, 113, 南紀生物同好会, 2008年06月
  日本語
• 南紀3河川におけるボウズハゼ(Sicyopterus japonicus)の生活史に関する一考察
  渡邊 俊; 飯田 碧; 福井 正二郎; 瀧野 秀二; 塚本 勝巳
  南紀生物, 49, 2, 125, 130, 南紀生物同好会, 2007年12月
  日本語
• Genetic diversity of Sicyopterus japonicus as revealed by mitochondrial DNA sequencing
  Watanabe Shun; Iida Midori; Kimura Yobuo; Feunteun Eric; Tsukamoto Katsumi
  Coastal Marine Science, 30, 2, 473, 479, 東京大学, 2006年, ［査読有り］
  英語, 研究論文（学術雑誌）, To examine the genetic diversity of Sicyopterus japonicus, 448 sites of the control region of the mitochondrial DNA were analyzed in 77 specimens from the four localities of Okinawa, Kochi, Wakayama, and Shizuoka in Japan. A total of 74 haplotypes were found in the individuals examined. The same haplotypes occurred in Okinawa and Kochi, Kochi and Wakayama, and two specimens in Wakayama. The average sequence in genetic characteristics within localities varied from 1.7% in Kochi, 1.6% in Wakayama to 1.4% in Okinawa. There was no significant difference in genetic characteristics among the three locations of Wakayama, Kochi, and Okinawa (10,000 times permutation test, P>0.05). The number of specimens from Shizuoka was too small to compare to the other three locations. The neighbor-joining tree of the mitochondrial DNA haplotypes for all specimens constructed from the Kimura's two-parameter distances suggested no evidence of genetic subdivision of S. japonicus. These results suggested that this species has a single panmictic population and their larvae probably have a high dispersal ability during their oceanic stage.

• III-3. 両側回遊性ハゼ類仔稚魚の海洋分散戦略
  飯田 碧; 近藤 正; 前田 健; 立原 一憲, 日水誌, 81, 3, 482, 482, 2015年05月
  日本語, その他

• 稚魚学のすすめ
  飯田 碧; 斉藤真美, 耳石から誕生日や成長を探る
  生物研究社, 2025年04月, 4909119434, 161–167, 日本語, 学術書, ［分担執筆］
• アクアライフ6月号
  飯田碧, ボウズハゼは海を渡る？〜ボウズハゼ類の生態と生活史の特性〜
  アクアライフ, 2023年06月, 64-65, 日本語, 一般書・啓蒙書, ［分担執筆］
• 魚類学の百科事典
  飯田 碧, 初期生残
  丸善出版, 2018年10月, 9784621303177, 日本語, 事典・辞書, ［分担執筆］
• Indo-Pacific Sicydiine Gobies: Biodiversity, life traits and conservation
  飯田 碧, Sicyopterus japonicus
  Societe Francaise d Ichtyologie, 2015年, ［分担執筆］
• 〔主要な業績〕水産学シリーズ182 魚類の初期生活史研究
  前田 健; 飯田 碧; 近藤 正, 川に住むハゼ類の多様な分散戦略
  恒星社厚生閣, 2015年, 9784769915706, ［分担執筆］
• 〔主要な業績〕Challenges for Diadromous Fishes in a Dynamic Global Environment
  Midori IIDA; Shun WATANABE; Katsumi TSUKAMOTO, Life History Characteristics of a Sicydiinae Goby in Japan, Compared with Its Relatives and Other Amphidromous Fishes
  American Fisheries Society, 2009年08月, 9781934874080, 943, 355–373, 英語, 学術書, ［分担執筆］

• Migratory patterns of freshwater gobies in Palawan, Philippines
  IIDA, M.; H. KOBAYASHI; K. SHIRAI; H. P. Palla; K. MAEDA
  12th Indo-Pacific Fish Conference, 2025年06月11日, 英語, ポスター発表
  2025年06月09日 - 2025年06月13日, 49812601
• 佐渡島の河川におけるエビ類の分布と生息環境
  小早川莉穂; 飯田 碧
  第73回日本生態学会大会, 2025年03月, 日本語, ポスター発表
• Phytoplankton and zooplankton community composition along the western coast of Sado Island, Sea of Japan: Insight from seasonality
  CHOWDHURY, P.; M. IIDA
  第73回日本生態学会大会, 2025年03月, 英語, ポスター発表
• 島の淡水性回遊魚の分散と生態：佐渡と沖縄の例から
  飯田 碧
  第55回種生物学シンポジウム 和文誌シンポジウム 古くて新しい島の生物学：島に生きる動植物の織りなす物語を読み解く, 2023年12月, 日本語, 口頭発表（招待・特別）
  ［招待講演］
• Life history traits of the migratory river sculpin in small streams on Sado Island, northern Japan
  IIDA, M.; K. SHIRAI; K. NATSUKAWA
  11th Indo-Pacific Fish Conference and the Australian Society for Fish Biology 2023, 2023年11月, 英語, 口頭発表（一般）
• Habit utilisation of small migratory gobioid fish in relation to microhabitat use and benthic communities in small streams on Sado Island, northern Japan
  IIDA, M; K. SHIMADA; S. NAKAJIMA; K. TOYOTA; R. ASADA
  Freshwater Sciences 2023, 2023年06月, 英語, 口頭発表（一般）
  Brisbane, オーストラリア連邦, ［国際会議］
• 佐渡島と新潟市の沿岸における環境と季節によるプランクトン動態の変化
  松谷朱莉; 飯田 碧
  第70回日本生態学会大会, 2023年03月, 日本語, ポスター発表
• Seasonal abundance and distribution of zooplankton in northwestern coast of Sado Island, Sea of Japan
  CHOWDHURY, P; M. IIDA
  第70回日本生態学会大会, 2023年03月, 英語, ポスター発表
• 島嶼の河川におけるハゼ科ウキゴリ属魚類の食性
  島田健太郎; 夏川高輔; 浅田稜二; 満尾世志人; 豊田賢治; 飯田 碧
  第70回日本生態学会大会, 2023年03月, 日本語, 口頭発表（一般）
• 佐渡島の淡水で採集された魚類の回遊パタン
  飯田 碧; 安房田智司; 小黒 環; 木戸杏香; 白井厚太朗; 満尾世志人
  第65回日本生態学会大会, 2018年03月, 日本語, 口頭発表（一般）
  ［国内会議］
• Diadromous migratory pattern of freshwater fish on Sado Island, northern Japan
  IIDA, M; S. AWATA; T. OGURO; K. SHIRAI; Y. MITSUO
  10th Indo-Pacific Fish Conference, 2017年10月, 英語, 口頭発表（一般）
  ［国際会議］
• ボウズハゼの回遊生態と熱帯における両側回遊
  飯田 碧
  2014年度日本魚類学会シンポジウム 魚類における両側回遊：その生活史多様性と進化, 2014年11月17日, 日本語, 口頭発表（招待・特別）
  ［招待講演］, ［国内会議］
• 両側回遊性ハゼ類仔稚魚の海洋分散戦略
  飯田 碧; 近藤 正; 前田 健; 立原一憲
  平成26年度日本水産学会秋季大会シンポジウム 魚類の初期生活史研究の最前線, 2014年09月22日, 日本語, 口頭発表（招待・特別）
  ［招待講演］, ［国内会議］
• Specific gravity and migratory pattern of two types of amphidromous gobies on Okinawa Island, Japan
  IIDA, M; M. KONDO; H. TABOURET; K. MAEDA; K. TACHIHARA
  9th Indo-Pacific Fish Conference, 2013年06月, 英語, 口頭発表（一般）
  ［国際会議］
• Recruitment of an amphidromous goby Sicyopterus japonicus in Japan: season, timing and behavior
  IIDA, M; S. WATANABE; K. TSUKAMOTO
  5th World Fisheries Congress: Fisheries for Global Welfare and Environmental Conservation, 2009年10月, 英語, ポスター発表
  ［国際会議］
• Seasonal growth patterns of an amphidromous goby Sicyopterus japonicus in the Ota River of Wakayama, Japan
  IIDA, M; S. WATANABE; T. ROBINET; D. BEVACQUA; K. TSUKAMOTO
  8th Indo Pacific Fish Conference, 2009年06月, 英語, ポスター発表
  ［国際会議］
• Migration strategy of Sicyopterus japonicus (Gobiidae: Sicydiinae) in Japan
  IIDA, M; S. WATANABE; K. TSUKAMOTO
  Challenges for Diadromous Fishes in a Dynamic Global Environment: 2nd International Scientific Symposium on Diadromous Fishes, 2007年06月, 英語, 口頭発表（招待・特別）
  ［国際会議］

• 日本動物学会
• 日本生態学会
• 日本魚類学会
• 日本水産学会

• 卵サイズから探る通し回遊の多様性
  科学研究費補助金
  2025年04月 - 2029年03月
  飯田 碧
  日本学術振興会, 基盤研究C, 研究代表者
• フィリピンの河川産魚類相とその生活史：特に黒潮流域を中心とした周辺国への通し回遊魚の仔魚の供給源の解明に向けて
  自然環境保全事業
  2025年05月 - 2028年04月
  前田健; 飯田碧; 小林大純; 平瀬祥太朗; 國島大河; Herminie P. Palla; Rodulf Anthony Balisco; Emma L. Ballad; Jemimah Ziegler; Glysinea M. de Peralta; Ernesto S. Del Rosario Jr
  公益財団法人 長尾自然環境財団, 研究分担者
• 回遊パタンの進化の過程を探る：初期生活史と内分泌系からのアプローチ
  科学研究費助成事業
  2021年04月 - 2024年03月
  前田 健; 飯田 碧; 山崎 曜
  2021年度は、沖縄島の河川および河口周辺の海域において、河川性（一生を川で過ごす）のアオバラヨシノボリとキバラヨシノボリおよび両側回遊性（仔魚期を海で過ごす）のヨシノボリ属複数種の仔稚魚を採集した。採集された仔稚魚サンプルの形態観察を行い、孵化直後から着底後までさまざまな発育段階の仔稚魚が含まれることを確認した。両側回遊性の種の多くは形態による種同定が困難であったため、RNAを抽出しRAG2遺伝子の配列により種同定を行い、当初目的のアヤヨシノボリとクロヨシノボリに加え、シマヨシノボリも多く含まれていることを確認した。これら5種の仔稚魚サンプルをできる限り多くの発育過程が含まれるように選定し、RNAシーケンシングを行った。
  フィリピンのパラワン島で採集されたヨシノボリ属2種の分類と系統の研究を進め、11月に新種Rhinogobius estrellaeとRhinogobius tandikanとして記載した論文を公表した。また同じ論文の中で、ミトコンドリアゲノムの解析により、これら2種がゴクラクハゼとともに本属中最も古い系統に含まれることを示した。ヨシノボリ属は温帯と亜熱帯の大陸や島嶼を中心に分布し、パラワン島はこれまで知られていたヨシノボリ属の分布域のはるか南に位置する。新種の発見により、ヨシノボリ属の分布の南限が更新された。異なる環境間で回遊パタンや卵サイズを比較し、回遊パタン進化の適応的意義を解明することが本研究の目的の１つであり、本研究において両種は、熱帯島嶼に住むヨシノボリ属として非常に興味深い対象となる。新種記載され系統関係が示されたことにより、これらの種の回遊パタンや生活史の研究を進め、公表する道筋をつけることができた。
  また、2021年度は、回遊パタンを調べるための耳石サンプルの選定、準備を進め、2月からは、卵サイズの研究のための成熟雌の採集を進めている。
  日本学術振興会, 基盤研究(C), 沖縄科学技術大学院大学, 研究分担者, 21K06296
• 多様な河川環境での稀少な甲殻類の生息環境の理解と保全への提言
  環境問題研究助成
  2023年 - 2024年
  飯田碧
  公益財団法人 日本生命財団, 研究代表者
• 佐渡島周辺海域の環境とプランクトン動態の解明
  試験研究費助成
  2022年 - 2024年
  飯田碧
  公益財団法人 内田エネルギー科学振興財団
• 佐渡島における稀少な通し回遊性魚類カンキョウカジカの河川内分布と生態
  国際会議助成
  2023年
  公益財団法人 クリタ水・環境科学振興財団, 研究代表者, 23X006
• 森・里・川・海連関の評価手法構築に向けた小型通し回遊魚の生態解明
  環境研究総合推進費
  2019年04月 - 2022年03月
  満尾 世志人; 飯田 碧
  独立行政法人 環境再生保全機構, 研究分担者, 競争的資金
• 離島の河川における稀少な魚類の生態：微小生息環境から保全策を探る (継続助成)
  国内研究助成 (継続助成)
  2021年 - 2022年
  飯田碧
  公益財団法人 クリタ水・環境科学振興財団, 研究代表者
• 佐渡島の河川に生息する稀少な魚類の生態と生息環境の解明
  試験研究費助成
  2020年 - 2022年
  飯田碧
  公益財団法人 内田エネルギー科学振興財団, 研究代表者
• 島に生息する魚類の分散能力の退化の検証
  科学研究費補助金 (基盤研究C)
  2018年04月 - 2021年03月
  飯田 碧
  日本学術振興会, 研究代表者, 競争的資金
• 離島の河川における稀少な魚類の生態：微小生息環境から保全策を探る
  国内研究助成
  2020年 - 2021年
  飯田碧
  公益財団法人 クリタ水・環境科学振興財団, 研究代表者
• 水生生物にみられる通し回遊現象の成立・維持メカニズム
  稲森財団研究助成
  2017年 - 2019年
  飯田 碧
  公益財団法人 稲森財団, 研究代表者, 競争的資金
• 佐渡島の沿岸から淡水域に出現する魚類と環境との関わり
  試験研究費助成
  2017年07月 - 2018年03月
  飯田 碧
  公益財団法人 内田エネルギー科学振興財団, 研究代表者, 競争的資金
• 佐渡島の多様な河川環境と魚類相の関係：通し回遊魚を指標として
  河川基金助成
  2016年 - 2018年
  飯田 碧
  公益財団法人 河川財団, 研究代表者, 競争的資金
• 佐渡島における魚類の水域利用形態の解明
  試験研究費助成
  2016年 - 2017年
  飯田 碧
  一般財団法人 佐々木環境技術振興財団, 研究代表者, 競争的資金
• 佐渡島の淡水域と沿岸域における魚類相：水環境と生物相との関わり
  エネルギー資源および自然・地球環境の保護並びに災害防止等に関する科学技術の試験研究を行う者に対する助成
  2015年07月 - 2016年03月
  飯田 碧
  公益財団法人 内田エネルギー科学振興財団, 研究代表者, 競争的資金
• 沿岸域における浮遊幼生の分散・滞留機構の解明：両側回遊性ハゼを例として
  公益信託 ミキモト海洋生態研究助成基金
  2014年 - 2016年
  飯田 碧
  研究代表者, 競争的資金
• 両側回遊性ハゼ亜目仔魚の滞留と分散に関わる特徴
  海外発表促進助成
  2015年07月 - 2015年07月
  飯田 碧
  公益財団法人 日本科学協会, 研究代表者, 競争的資金
• ハゼ科魚類における通し回遊現象の起源と進化
  科学研究費補助金 (特別研究員奨励費)
  2011年04月 - 2014年03月
  飯田 碧
  琉球列島に生息する両側回遊魚の大規模回遊種と局地的回遊種のそれぞれ複数種をモデルとして, 仔魚の行動特性, 流下と加入の生態特性, 海洋における分散過程について比較研究を行い, ハゼ科における両側回遊生態を明らかにし, その進化の過程を考察することを目的とした。
  2011年からの継続として, 両側回遊魚のボウズハゼとヨシノボリ属仔魚の海から河川への加入生態を明らかにするため, 毎月1,2回, 沖縄島の有津川で潜水調査を行った。仔魚の加入は1月から観察され, 4月から6月がピークであった。ボウズハゼの加人期間は本州よりも長く, 本種の回遊生態が緯度により変動することを明らかにした。ボウズハゼ仔魚について耳石による日齢査定を行ったところ, 仔魚は聯化直後から約200日間を海で過ごすことが分かった。
  大規模回遊種ルリボウズハゼとナンヨウボウズハゼの産着卵から艀化仔魚を得て, 超小型ワムシ(プロアレス), SS型ワムシを給餌し, 飼育を行った。艀化後0,1,2,3,5,7日後の昼と夜の仔魚の比重を測定した結果, 比重は, 艀化直後には大きな値を示すものの, 発育とともに急減し, さらに昼夜で変化することがわかった。
  沖縄島において, 通し回遊性ハゼ亜目魚類のうち大規模回遊種ナンヨウボウズハゼと局所的回遊種ナガノゴリ, ゴクラクハゼを採集した。フランス国立自然史博物館において, レーザーアブレーションICP-MS(誘導結合プラズマ質量分析装置)を用いて, これらの耳石に含まれるSr, Ca, Mg, Baの各元素量を測定し, 回遊履歴を分析した結果, 3種はいずれも両側回遊型の回遊パタンを示すものの, 河川への加入生態を反映して, 異なる移動形態を持つことが明らかとなった。
  以上の結果より, ハゼ亜目魚類の通し回遊は, 回遊規模に加えて, 海洋での生態, 河川と海との回遊パタンなど様々な要因により形成, 維持されてきたと推察された。
  日本学術振興会, 特別研究員奨励費, 琉球大学, 研究代表者, 競争的資金, 11J03315
• ボウズハゼの両側回遊生態に関する研究
  学術研究助成金 (魚類)
  2009年 - 2010年
  飯田 碧
  藤原ナチュラルヒストリー財団, 研究代表者, 競争的資金
• ボウズハゼの産卵、流下および接岸回遊に関する研究
  笹川科学研究助成
  2006年 - 2007年
  飯田 碧
  日本科学協会, 研究代表者, 競争的資金

• 佐渡市こども環境学習会「磯の生き物調査」
  2017年07月30日
  学術調査
  佐渡市

• 海洋STEAM学習 体験学習
  2025年07月10日
  講師
  函館市立南茅部小学校
• 海洋生物教室 海府の魚
  2017年11月13日
  講師
  佐渡市立内海府中学校
• 佐渡市理科教育センター「野外（磯の生物）研修会」
  2017年08月04日
  講師
  佐渡市理科教育センター